ecidn a ta bioguimica Sinopsis eer oe {CUANTO HAN AVANZADO LAS CIENCIAS BIOLOGICASH EN POCO MAS DE UN SIGLO NUESTRO CONOCIMIENTO DE LOS PROCESOS VITALES SE HA TRANSFORMADO Dt radical, Desde ss modestos in ese siglo xt a biog ha de sarrollado herramientas intelectuales y experimentates euda vez, mi form celnboradas para investigacidn de los procesos vitales, Actualmente, en los primetos altos del sige « hallamos inniers0s en una revolucidn biotecnolsgiew que nadie imayinabs a forense icncias biolsgieas tan diversas como ta medicina, ka ngsicuttura y hi hhan generado eantidades inmensas de inforn (én, Entender y apreeiar ta importan- cia de este fendmeno requiere un conocimiento exhaust ro de los principios biogt- imicos subyacentes. En este capttlo se presenta tn sinopsis de tales principios. Los capftulos posteriores se centran en ta estructura y las funciones de las biomoléculas ins impor tes y los principales proceso s bioquimicos que sustentan In vid ste libro esti disefiaco para proporeionar una introuccién a los prineipios bi Fee bbioqutmien, El capftulo inicial presenta las generalidades de los p pales componentes de los organismos vivos y los procesos biol6gicos. Despugs de na breve descripcién de la naturaleza del estado vital, se presenta wna introdue~ cidn a las estructuras y funciones de las principales biomolécutas, Esta inform va seguida por una revisién general de los procesos bioqu{micos mds importante: El capftulo concluye con una breve revisién de los conceptos de In biogufmnien perimental moderna y una introduecién a In biologta de sistema steategi de investigaci i integradas y no como conjuntos de componentes aislados y reaeciones quimicas, 1.1 GQUE ES LA VIDA? {Qué es ta vida? A pesar del trabajo de los biGlogos durante varios siglos, sin no hay una respuesta defintiva a esta pregunta, engaiiosamente sencilla, Gran parte de Ja dificultad para delinear la naturaleza precisa de los seres vivos recae en ta abruma dora diversidad del mundo biolSgico y el solapani algunas pro- piedades de ka materia viva y In inanimada, Como consecuencia, se ha considerado a Ja vida una propiedad intangible que desaffa cualquier explicacién, lo que hin llevado a describirla en términos operativos, como movimiento, reproduecién, autaptacién y reactividad a estimulos externos, Gracias biogui- rigen por las mismas leyes quimicas y fisieas que el resto del univers 1. La vida es compleja y dindmiea, Todos los organismios se encuentran consti- tuidos por el mismo conjunto de elementos quimicos, principalmente carbono, nitrégeno, oxigeno, hidrgeno, wzufre y fsforo, Las biomoléculas, es decir, las molécula por losseres vivos, son orgdnicas (basadas en el carbono). s, como el crecimiento y el desarrollo, utilizan miles de rea as vibran y gira, interaceionan, colisionan y se reorganizan en moléculas mievas, 2. La vida es organizada y se sustenta a sf misma, Los seres vivos son sistev organizados jerfrquicamente, es decir, constan de niveles de organizacién que van desde lo més pequefo (atomos) a lo mAs grande (organismos) (fig, 1.1), Ba los sistemas biol6gicos, las capacidades funcionales dentio de cada nivel de or ganizacin provienen de las propiedacles estructurales y quimicas del nivel sub-Sistema orgainico (digestivo) ‘rgano (igado) (hepatocito) Orgénulo {nicleo) Molécula (NA) ‘Atomo (carbone) yacente. Las biomoléculas estén formadas por étomos, que a su vez constan de articulas subatémicas. Algunas biomoléculas se unen para formar polimeros, denominados macromoléculas. Algunos ejemplos son los écidos nucleicos, las Proteinas y los polisacéridos, que estan constituidos respectivamente por nucles- tidos, aminodcidos y azticares. Las células estén compuestas por diversas bio- moléculas y macromoléculas, dispuestas en estructuras supramoleculares més complejas. En el plano molecular, existen cientos de reacciones bioquimicas que en conjunto mantienen la vida. Estas reacciones estén catalizadas por enzimas y se organizan en rutas. (Una ruta bioquimica consta de una serie de reacciones en Jas que una molécula especifica se convierte en un producto final.) Se denomina 1.1 {Quéesta vida? a FIGURA 1.1 Organizacién jerérquica de un organismo multicelular: elser humano Los organismos multicelulares tienen varios niveles de organizaci6n: siste- ‘mas orgénicos, érganos, tejidos, células, orgénulos, moléculas y étomos. Se ruestran el sistema digestivo y uno de ‘us 6rganos componentes (1 hfgado). EL higado es un 6rgano multifuncional ‘que posee varias funciones digestivas.. Por ejemplo, produce bilis, que facilita la digestin de las grasas y procesa y distribuye las moléculas de alimento absorbidas en el intestino delgado a otras partes del cuerpo. EIDNA, una molécula que se encuentra en las célu las, contiene la informacién genética ue controla el funcionamiento celular.eapiruio1 Introduccién a la bioquimica cmos: | Qian + Todos los organismos vivos obedecen alas mismas leyes fisicas y quimicas, + La vida es compleja, dindmica, orga- nizada y automentenible. + La vida es celular y se basa en la informacién, + La vida se adapta y evoluciona. ‘metabolismo a la suma total de todas las reacciones que ocurren en un ser vivo. La capacidad de los seres vivos para regular los procesos metabslicos, a pesar de Ja variabilidad de sus ambientes interno y extemo, se denomina homeostasis. En Jos organismos multicelulares existen otros niveles de organizaci6n que incluyen tejidos, érganos y sistemas orgénicos. . . La vida es celular. Las células, las unidades bésicas de los seres vivos, se di- ferencian mucho en su estructura y funci6n, si bien todas estén rodeadas por una membrana que controla el intercambio de numerosas sustancias qufmicas con el entorno. La membrana también participa en la respuesta de la eélula al ambiente extracclular. Si se separan los componentes de una célula, se detiene el funcionamiento vital. Las células s6lo pueden originarse mediante la division de células existentes. La vida se fundamenta en la informaci6n. La organizaci6n requiere informa cidn, Los seres vivos son sistemas que procesan informaci6n, porque el mante- nimiento de su integridad estructural y sus procesos metab6licos requiere inter- acciones entre un conjunto enorme de moléculas dentro de las células y entre ellas. La informacién biol6gica se expresa en forma de mensajes codificados, incluidos en la estructura tridimensional caracteristica de las biomoléculas. La informacién genética, que se almacena en las secuencias lineales de nucleétidos del écido desoxirribonucleico (DNA) denominadas genes, especifica a su vez la secuencia lineal de aminodcidos de las protefnas y de qué forma y cuando se sin- tetizan esas protefnas. Las protefnas realizan su funcién al interactuar con otras moléculas. La estructura tridimensional tinica de cada proteina le permite unirse e interactuar con una molécula espectfica que tiene una estructura complemen- taria, La informacién se transfiere durante el proceso de unién. Por ejemplo, la unin de la insulina, una proteina sintetizada en el péncreas de los vertebrados, a receptores especificos de insulina en la superficie de determinadas células, es ‘una sefial que desencadena la captacién de la molécula nutriente glucosa, 5, La vida se adapta y evoluciona. Todas las formas de vida en la Tierra tienen un origen comiin y las nuevas formas surgen a partir de otras precedentes. Cada vez {que se reproduce un individuo de una poblaci6n, las modificaciones del DNA. ccausadas por el estrés ambiental y los errores del proceso de replicacién pueden dar lugar a mutaciones o cambios en la secuencia. La mayoria de las mutaciones son silenciosas; es decir, las repara la célula o no tienen efectos sobre el funcio- namiento del organismo. Sin embargo, algunas son nocivas y limitan el éxito reproductor de los descendientes. En ocasiones poco frecuentes, las mutaciones pueden contribuir a aumentar la capacidad del organismo para sobrevivir, adap- tarse a circunstancias nuevas y reproducirse. La principal fuerza impulsora de este proceso es la capacidad de explotar fuentes de energia. Los individuos cuyas caracterfsticas les permiten explotar mejor una determinada fuente energética en su hébitat, tendrén una ventaja competitiva cuando los recursos sean limitados. ‘Alo largo de muchas generaciones, la interdependencia de los cambios ambien- tales y la variaci6n genética origina la acumulacién de caracterfsticas favorables y, finalmente, formas de vida cada vez més divergentes 1.2 BIOMOLECULAS Los seres vivos estén formados por miles de moléculas diferentes, inorgénicas y or- génicas. El agua, una molécula inorgénica, supone entre el 50 y el 95% del peso de tuna célula, y ines como el sodio (Na), potasio (K+), magnesio (Mg™) y calcio (Ca?) pueden representar otro 1%, Casi todas las demas clases de moléculas de los seres vivos son orgénicas. Las moléculas orgénicas estén formadas principalmente por seis elementos: carbono, hidrégeno, oxfgeno, nitrégeno, fésforo y azufre, y contienen cantidades minimas (traza) de determinados elementos metélicos y no metalicos. Los étomos de los elementos mas comunes en los seres vivos pueden formar con facilidad enlaces covalentes estables, el tipo de enlace que permite la construccién de moléculas tan importantes como las proteinas,‘La gran diversidad y complejidad estructural de las moléculas orgénicas se debe a Jacapacidad de los étomos de carbono para formar cuatro enlaces covalentes simples, bien entre étomos de carbono o bien con otros elementos. Las moléculas orgénicas que contienen muchos dtomos de carbono son capaces de adquirir formas complica- das, como estructuras lineales alargadas o cadenas ramificadas y anillos Grupos funcionales de las biomoléculas organicas ‘Se puede considerar que la mayoria de las biomoléculas deriva de la clase més sim- ple de moléculas orgénicas, los hidrocarburos. Estos (fig. 1.2) son moléculas que contienen carbono e hidrégeno y son hidréfobas, es detir, insolubles en agua, To- das las dems moléculas orgénicas se forman mediante la unién de otros étomos © gmupos de étomos al esqueleto hidrocarbonado. Las propiedades quimicas de las rmoléculas asf construidas vienen determinadas por ciertos conjuntos especificos de ‘Somos, denominados grupos funcionales (cuadro 1.1). Por ejemplo, los alcoholes se producen cuando los Stomos de hidrégeno son reemplazados por grupos hidroxi- Jo (—OH). Asi, el metano (CHL), un componente del gas natural, puede convertirse en metanol (CH,OH), un liquido téxico que se utiliza como disolvente en muchos pprocesos industriales. ‘La mayorfa de las biomoléculas contiene més de un grupo funcional. Por ejem- plo, muchos azticares tienen numerosos grupos hidroxilo y un grupo aldehido. Los aminodcidos, que son los elementos fundamentales de las proteinas, tienen un grupo amino y un grupo carboxilo. Las distintas propiedades quimicas de cada grupo fun- ional contribuyen al comportamiento de las moléculas que lo contienen. Clases principales de biomoléculas pequefias ‘Muchos de los compuestos orgénicos que se encuentran en las eélulas son relativa- ‘mente pequefios, con pesos moleculares inferiores a 1 000 daltons (Da). (Un dalton, ‘ounidad de masa atémica, equivale a 1/12 de la masa de un étomo de "C.) Las eélu- las contienen cuatro familias de moléculas pequefias: aminodcidos, monosacéridos, fcidos grasos y nuclestidos (cuadro 1.2). Los miembros de cada grupo desempefian CUADRO 1.1. Grupos funcionales importantes de las biomoléculas Nombre dela familia ‘Estructura del grupo __ Nombre del grupo Se encuentra en determinadas moléculas lipidicas 1.2 Biomoléculas 5 H I HCH a i i ai pales a Hexano . an wk Hd FIGURA 1.2 Formulas estructurales de cuantiosos hidrocarburos6 cariTuLot 8 «a I Hi fae 0H R FIGURA 1.3 ‘Formula general para aminoscidos-c. En 19 de los 20 aminodcidos estindar, el carbono a se une con un étemo de hidrégeno, un grupo carboxilo, un ‘grupo amino y un grupo R. FIGURA 1.4 Formulas estructurales de numerosos aminoScidos « Un grupo R (destacado en amarillo) en Inestructura de un aminofcido puede ser un é1omo de hidr6geno (p.e)., en la slicina), un grupo hidrocarbonado (p-€)..€1 grupo isopropilo en la valina) ‘un derivado del anterior (p. ej, el grupo hidroximetilo en la serina). Introduccién a la bioquimica CUADRO 1.2 Clases principales de biomoléculas Molécula pequefia__Polimero Funciones generales Proteinas is y elementos estructurales Carbohidratos Fuentes energéticas y elementos estructurales OMA. Fuentes energéticas y elementos estructurales “de las moléculas lipfdicas complejas ‘eis eratos DNA Nucle6tidos Tnformaci6n genética Sintesis de prot varias funciones, En primer lugar, se utilizan en la s{ntesis de moléculas més grandes, muchas de las cuales son polimeros. Por ejemplo, las proteinas, los polisacdridos y los dcidos mucleicos son polimeros formados, respectivamente, por aminodcidos, mo- nosacéridos y nuclestidos. Los dcidos grasos forman parte de varias clases de Iipidos (moléculas insolubles en agua). En segundo lugar, algunas moléculas tienen funciones bioldgicas especiales. Por ejemplo, el nucle6tido trifosfato de adenosina (ATP) opera como reserva celular de energfa quimica. Por tltimo, muchas moléculas orgénicas pequeiias participan en rutas bioguimicas complejas. A continuacién se describen ejemplos de cada clase. AMINOACIDOS Y PROTEINAS Hay cientos de aminodcidos naturales, cada uno de los cuales contiene un grupo amino y un grupo carboxilo. Los aminodcidos se clasi- fican como a, f 0 7, de acuerdo con Ia posicién del grapo amino respecto al grupo carboxilo. En los aminodcidos a, la clase més frecuente, el grupo amino estd unido al étomo de carbono (carbono @) adyacente al grupo carboxilo (fig. 1.3). En los aminodcidos fy +, el grupo amino esté unido a los carbonos segundo y tercero, res- pectivamente, a partir del grupo carboxilo. Otro grupo quimico, denominado cadena lateral o grupo R, se une también al carbono a. Una vez incorporados a las protefnas, las propiedades quimicas de cada aminogcido vienen determinadas en gran medida por las propiedades de su cadena lateral. Por ejemplo, algunas cadenas laterales son. hidréfobas (p. ¢j., baja solubilidad en el agua), mientras que otras son hidréfilas (p. ej. se disuelven con facilidad en agua). La figura 1.4 presenta varios ejemplos de aminbicidos a. Hji—cH—C—oH ° ; ° Hide ° Glutamina Valina Lisina ° “ Il H,N—cH—C—oH CH, Hoon H Glicina Fenilalanina SerinaExisten 20 aminoScidos « esténdar en las proteinas, Algunos de ellos tienen fun- ciones tnicas en los seres vivos. Por ejemplo, la glicina y el dcido glutsmico actan cen los animales como neurotransmisores, moléculas sefializadoras liberadas por las células nerviosas. Las protefnas contienen también aminodcidos no esténdar, que son versiones modificadas de los aminodcidos convencionales. La estructura y la funcién de las proteinas se alteran con frecuencia por la modificacién de determinados resi ‘duos aminoacidicos mediante fosforilacién, hidroxilacién u otros cambios quimicos. (El término “residuo” se refiere a una biomolécula pequefia que se incorpora a una macromolécula, p. e., los residuos de aminodcidos en una proteina,) En el caso del coldgeno, la proteina mayoritaria del tejido conjuntivo, un porcentaje elevado de los residuos de prolina est hidroxilado. Muchos de los aminodcidos naturales no son aminofcidos a. Entre los ejemplos més notables se encuentran la B-alanina, precursor de la vitamina cido pantoténico, y el dcido 7-aminobutirico (GABA), un neurotransmisor que se encuentra en el cerebro (fig. 1.5). Las moléculas de aminoacido se utilizan principalmente para la s{ntesis de poli- rmeros largos y complejos denominados polipéptidos. Las moléculas cortas, con una longitud inferior a 50 aminodcidos, se denominan péptidos u oligopéptidos. Las protefnas estin formadas por uno o més polipéptidos. Estos desempefian una gran vvariedad de funciones en los seres vivos. Entre los ejemplos se encuentran las protet- nas transportadoras, las proteinas estructurales y las enzimas (protefnas cataliticas). Los aminodcidos individuales forman péptidos (fig. 1.6) y polipéptidos al wi se mediante enlaces peptidicos. Estos enlaces amida resultan de una sustitucién nucleofilica en que el nitrégeno del grupo amino de un aminodcido ataca al grupo carboxilo de otro a través de su carbono carbonilico. La estructura tridimensional final de los polipéptidos, y por lo tanto su funcicn biolégica, se debe en gran medida. a las interacciones entre ios grupos R (fig. 1.7). YPROBLEMA 1.1 2 H a “Los ‘seres vivos generan una enorme cantidad de biopolimetos distintds al en- saimblar monémeros segiin secuencias especificas. Un conjunto de tripéptidos, formado cada uno por tres residuos de aminodcidos, contiene sélo dos tipos distintos de aminodcidos: A y B, Cudntos tripéptidos son posibles en este con junto? \ Solucién El nero de tripéptidos posibles se obtiene con la férmula X*, donde X es el nimero de aminofcidos constituyentes, y ‘nes Ja longitud del péptido. Si se sustituyen los valores en Ia férmula, se obtiene 2°= 8, Los ocho wipéptidos ‘son los siguientes: AAA, AB, ABA, BAA, ABB, BAB, BBAY BBB. 1.2 Biomoléculas 7 ion, — cH — B-Alanina ° * I H,N-—CH, — CH, — CH, —C — OH GABA FIGURA 1.5 Ejemplos seleccionados de ‘aminoficidos naturales que no son a-aminofcidos: B-alanina y acide ‘-aminobutirico (GABA) FIGURA 1.6 Estructura de la met-encefalina, un pentapéptido La metencefalina pertenece a una cla- se de moléculas que poseen actividad de tipo opiicea, La met-encefalina se encuentra en el cerebro einibe Ja percepei6n del dolor. (Los enlaces peptidicos estén sombreados en color azul. Los grupos R estén destacados en color amarillo.) /Introduccién a la bioquimica Desplegada Plegada FIGURA 1.7 Estructura polipeptidica ‘Al adquicir un polipéptido su estructura tridimensional caracteristica, al menos el 50% de los ‘grupos R més hidrdfobos (esferas amarillas) quedan escondidos en el interior, alejados del agua. Los grupos hidrofilos se encuentran generalmente en la superficie. AZUCARES Y CARBOHIDRATOS Los azticares, los carbohidratos més pequefios, contienen grupos funcionales alcohol y carbonilo. Se describen normalmente segiin el nimero de carbonos y el tipo de grupo carbonilo que contienen. Los azticares que Posen un grupo aldehfdo se denominan aldosas y aquellos que poseen un grupo cetona se denominan cetosas. Por ejemplo, el azsicar de seis carbonos denominado glucosa (una fuente de energfa importante para la mayoria de seres vivos) es una aldohexosa; la fructosa (aaticar de las frutas) es una cetohexosa (fig. 1.8) Los aziicares son las unidades bdsicas de los carbohidratos, las moléculas orgéni- cas més abundantes de la naturaleza. Los carbohidratos van desde los azifcares sen. cillos 0 monosacéridos, como la glucosa y Ia fructosa, hasta los polisacdridas, po- Jimeros que contienen miles de unidades aziicar. Entre estos tltimos se encuentran el almidén y lacelulosa de las plantas y el glucégeno de los animales, Los carbohidratos desempefian funciones muy diversas en los seres vivos. Determinados aaticares alma. A—E—OH + ROH ° La digestién de muchos nutrientes implica reacciones de hidr6lisis. Por ejemplo, las protefnas se degradan en el est6mago en tina reacci6n catalizada en condiciones Acidas. Otro ejemplo importante es la rotura de enlaces fosfato del ATP (fig. 1.15). La energfa que se obtiene de esta reaccién se utiliza para impulsar muchos procesos celulares, .1 capirvior —Introduccién a ta bioquimica FIGURA 1.14 Ejemplo de sustiu iim nucleoiea En la reaccsn de la glucosa con el ATR, el oxigeno det hidroxilo de la glu= cosa es el nucesfilo, El dtome de f6t- foro (el electsfile es polarizado por el ‘oxigeno enlazado, de forma que porta | ‘una carga posiiva parcial Al producie- rm se la reacein, el par de eleeiones sin compartir del CH,OH del aca atace al fésforo, ando lugar ala expulsién del ADR, el grupo salient, cHoroe 0 ° I on + -o—P—o— Ho) OH 7 on Glucosa-6-ostato Ditostato de adenosina FIGURA 1.15 Reaceién de hidrdlisis La hidrélisis del ATP se utiliza para irm- pulsar una sorprendentediversidad de teassons begun ue ein Tilfostato de adenosina te . c ; HON WO i 0. I 1 | on OH ‘Titostato de adenosina OH on hi N + OH OH1.3 gE la eélula viva una fabrica de productos quimicos? REACCIONES DE ELIMINACION En Ios reacciones de eliminacién se forma un doble enlace cuando se eliminan &tomos de una molécul. ii ti - H—C—C—H ——h H-C=C—H + At + B AB . Una reaccién frecuente que afecta a las moléculas con grupos funcionales de alcohol es la eliminacién de agua (H,0). Un ejemplo destacado es la deshidratacién {el 2-fosfoglicerato, un paso importante en el metabolismo de los carbohidratos (fig. 1.16). Otros productos de las reacciones de eliminacién son el amoniaco (NH,), las aminas (RNH,) y 10s aleoholes (ROH). REACCIONES DE ADICION En las reacciones de adicién se combinan dos molécu- Jas para formar un solo producto. 4 How ell Ho + Ae em en A 8 La hidratacién es una de las reacciones de adicién mas comunes. Cuando se afiade agua a un alqueno se produce un alcohol. Un ejemplo bien estudiado es la bhidrataci6n del intermediario metabslico fumarato para formar malato (fg. 1.17). REACCIONES DE ISOMERIZACION En las reacciones de isomerizacién los étomos los grupos experimentan cambios intramoleculares. Una de las somerizaciones bio ‘quimicas més comunes es la conversién recfproca entre aldosas y cetosas (ig. 1.18). REACCIONES DE OXIDACION-REDUCCION Las reacciones de oxidacién-reduc- cién (también denominadas reacciones redox) ocurren cuando hay una transferencia de electrones desde un donador (denominado agente reductor) a un aceptor (deno- ‘minado agente oxidante). Cuando los agentes reductores ceden electrones quedan oxidados. Al aceptar electrones, los agentes oxidantes quedan reducidos. Los dos procesos suceden forzosamente de forma simulténea. ei. @ ro. T 1” ay H—G—oH O- mo 2-Fostoglicerato 6 FIGURA 1.16 Reaccién de eliminacién (Cuando se deshidrata el 2-fosfoglicera- tose forma un dable enlace. FIGURA 1.17 Reaceién de adi Cuando se afiade agua a una molécula {ue contiene un dable enlace, como el fumarato, se produce un alcohol,46 cariruio1 Introduccién ala bioqutmica FIGURA 1.18 ' ReacciGn de isomerizacién noon Una clase de reaccién bioguimien que i] se observa con frecuencia es la inter 00 conversion reversible de los isémeros 1 de aldosa y cetasa. 4 Aldosa Cotosa No siempre es facil determinar si las biomoléculas han ganado o perdido elec- trones. Sin embargo, pueden utilizarse dos reglas sencillas para averiguar si una ‘molécula se ha oxidado o reducido: 1, Se produce una oxidacién cuando un étomo de carbono gana oxigeno o pierde hidrégeno: CH oH oy — oH Alcohol etico 2. Se produce una reduccién cuando un étomo de carbono pierde oxigeno o gana hidrégeno: CHC—oH ee CHCH ON concerrociat | Qian 1 Las clases de eaciones més communes Acid acético Alcohol tte aque Se encuentran en los proceso bio. Ghimicos son lasustiucion nucloflt.. En las reacciones redox biol6giess, los electrones se transfieren a aceptores como el ca, la eliminacién, la adicién, la isome- nucleétido NAD*/NADH (dinucleétido de nicotinamida y adenina en forma oxidada/ rizacién y la oxidacién-reduccién. reducida). Energia La energia se define como la capacidad para realizar un trabajo, es decir, mover materia, A diferencia de nuestras méquinas, que transforman y utilizan la energia en condiciones inhéspites en cuanto a temperatura, presién y cortiente eléctrica, las frigiles maquinas moleculares de los seres vivos deben operar en condiciones mucho ns suiles. Las células generan la mayorfe de su energfa mediante reacciones redox en las que se transfieren electrones desde una molécula oxidable hasta una molécula con déficit electr6nico. En estas teacciones, los clectrones se eliminan o afiaden con frecuencia en forma de Stomos de hidrégeno (H+) 0 iones hidruro (H:"). Cuanto més reducida esté una molécula (es decir, cuantos més étomos de hidrégeno pose), més energia contiene. Por ejemplo, los Acidos grasos contienen en proporcién més étomos de hidrégeno que los azicares y por tanto producen mAs energia durante su oxida- in, Cuando se oxidan los écidos grasos y los azsicares, sus &tomos de hidrégeno se corporan a las coenzimas redox FAD (dinuclestido de flavina y adenina) o NAD’ respectivamente. (Las coenzimas son moléculas pequefias que operan junto con al- ‘gunas enzimas y sitven como transportadores de grupos moleculares pequefios 0, en este caso, electrones.) Los productos reducidos de este proceso (FADH, 0 NADH, respectivamente) transfieren posteriormente sus electrones a otro aceptor. Siempre que se transfiere un electrén se libera energia. Las células poseen meca- nismos complejos para explotar este fendmeno, de tal forma que parte de la energia Iiberada pueda ser aprovechada para las necesidades celulares. La caracteristica mas destacada de Ia obtencién de energia en la mayoria de las células es la de un flujo electrénico a través de moléculas transportadoras conectadas ¢ inmersas en una mem brana. Mediante un proceso regulado, se libera energfa y se transfieren electrones entre las moléculas transportadoras. Algunas de estas reacciones redox disipan suf iente energia para promover la sintesis de ATP, 1a molécula que suministra energi de forma directa para mantener organizadas las funciones y estructuras celulares..1. hs la cdlula vive una fétvica de productos qulinicos? 97 fen sus estateiay pana ag reugia det sol (fotostitess) ode alunos compuesto ppata creat enlaces aqutinicgss se les donor, tesy qulusloautsteatas, Los heterditeofus ol vento previamente Formats por ott0s 0 lay molécutas de bos alimentos como tinea t ppoeatiotay y un pequenio mimero de Vegetales (pe). Sarracenia fata, te explana J algieve insectos) son fotohetersiteatos, es decir, utiliza come fuentes de ene fa tanto la luz solar como biomolgeulas onpanivas, La fuente principal de eneyta para la miayoria de xctes vivas es el sol, Oyganisinas fotosinteticos como plantas, leteriinaas praca y Las alps, cnptan eh enengia hinainica y 1a mtiizan pata iia didxilo de catbono (CO) en anicates y UWiomoléewlas. Las especies quimionutstiotas abticnen la encypl eee fijacidn de CO, ovidando sustancias inorgnieas come sulfate de hide nitito (NO, Je hidtsgeno gaseose (1,), Labionasa prot beso consti a 9H Ver por Hetenstrtas i ecurores estiuctutales, E wanonte, futawntitrofos y iv alegandanito moléculas de al sts, Lavy quit votes atidizan ante le enicygin, Aline any in pa wo (ILS), sen ambos tipos de po san coma fuente de enya y cca pase, al woremuse Tos entaces muleculates, ate de In energia se caplura y utiliza para sustentar las conplejas estncturas y actividades del onganismo, En tina instancia tla la enerpa se lesorganiaa y se ibera al entorne en forma de calor, Las rutas metabsticas que permiten a bos setes vivos obtener y ath lizar enengia se describen brevemente en la siguiente seceién, Despuds se revisin los :mecanismos fundamentales mediante los cuales se mnantiene el arden celutar, Generalidades del metabolismo Son todas las reacciones eatatizadas por enzimas dle un ser vivo, Mi reacciones estin organizadas en vias metabélicas (Hig. 1,19), en las que tna moléeuta inicial se va teansformando de forma geadual en un proxlucto que la eéluka utiliza para un fin especifico, Por ejemplo, la gluedtisis, lu ruta xenerudora de eneypla que de} waicar glucosa, esti constituida por 10 reuceiones quimicns, ‘Titas los proceso, metabdlicos de un organismo determinado conforman un vasto patrdn reticular de reacciones bioqutmicas interconectudas, reguladas de tal manera que se conserven los recursos y se optimice la energfa, Existen tres clases de ruts bioqutai metab6licas, Jas de transferencin de energta y las de transduccién de sefal VIAS METABOLICAS Existen dos tipos de vias metalviticas; lus anabiiticns y tas catabélicas, En las vias anabéle 8, se proxhicen moldeulas complejas ‘partir de precursores més pequefios, Lats unidaues estructurales Isiens (p. tos, aminofcidos, los wzticares y los Acidlos grasos), proxluctlas por ef organism o al de Los alimentos, se integean en moléeulas nfs geaniles y complejas, Dao ‘que la biosfntesis aumenta el orden y la complejidid, ls vias anabotiens requieren un aporte de energta, Entre los procesos anayslicos se ur In sfutesis de polisned- ridos y de protefnas, a partir de wateares y uminode mente, Hit Ins vias eatabélicus moléculas grandes y conplejas se de productos nif pequetlos y sencillos. Algunas rutas eatabdlicas liberan enemgfa iil, Una fracelén dle esta ener se cuptura y se uiliza para evar a eabo reaeciones nnabsiicns, En a figura 1.20 se explica In relaci6n entre tos procesos anabsilicos y catubys- Js. Al dextadatse lis moléculas de los nutrientes, la energfa y el povler reductor (os electrones de alta enenpfa) se conservan en lis miokéeulas de ATP y de NADI, respectivamente, Los procesos de biosfutesis utilizan: metabolites del catubolisine, asf como ATP y NADPH (fostato de dinucledtide de nicotinnd y adeninn ved- ido, una fuente de poster reduector) pura generar estructura y funciones conplejas, hi VIAS DE TRANSFERENCIA DE ENERGIA [stas rutas cupturnu energy tn convier ten en utilizable por los organisms pari evar a cubo process blomoleeulares, Un ejemplo to constituye In absorvin de energfa hunfnica por lus moléculas de cloroli ¥ Ins renceiones redox aubsiguientes, que Hiberan la energtn qufmien necesatin de aztcwr concerro cave |= Qn Tn kn sete vis ene udp te se genera mediante mover ha materia Horn weelones tedon, <— 04 > D FIOURA 1.19 Unw Mow 1 esta ruta biogutinien la biontalgeua ‘Ase convlette ew tn bioolseula D ‘meaiaute tes teneviones consecutiv, Cala reaeeion esta eaalizada por a ceurina expeettien (1,18 capiruLot FIGURA 1.20 Anabolismo y eatabolismo En los organismos que utlizan oxigeno para generar energfa, las vias eata- ‘olicas transforman los mutrientes en moléculas pequetas, que sirven como materiales de partida. La energia (ATP) yy el poder reductor (NADPH) que imputsan las reacciones de biosfnte- sis se generan durante los procesos catabélicos al convertirse determinadas rmotéculas nutrientes en productos de desecho, como diéxido de carbono y TONCEPTOS CLAVE Qos + El metabolismo es la suma de todas las reacciones catalizadas por enzi- ‘mas en un ser vivo. «+ Existen tres clases de rutas bioguimi- tabélicas (anabélica y catab6- ica), de transferencia de energia y de transduccién de sefiales. Introduccién a ta bioquimica Nutiontes Productos de desecho ‘Sustratos de biosintesis| Mantenimiento yeerecimiento as vias de transduccién de sefiales permiten a su entorno y responder a ella. El mecanismo de s: recepcién, transduceién y respuesta. En la seffalizadora como una hormona o un TRANSDUCCION DE SENALES L: las células recibir informacién de transduccién de sefiales consta de tres fases Ia fase inicial o de recepcién, una molécul utriente se une a una proteina receptora, Esta unién inicia Ia fase de transduccién, dina easeada de reacciones intracelulares que desencadena Ta respuesta celular a Ia Sefial original, Por ejemplo, la glucosa se une a suxeceptor en las eélulas pancrediticas Seoretoras de insulina, con 1o cual ésta se libera en el torrente sangufneo. En general Jas respuestas se traducen en un aumento o disminucién de Ia actividad de enzimas ya existentes 0 en la sintesis de nuevas moléculas enziméticas. Orden biolégico Launidad coherente que se observa en todos los seres vivos implica Ia integracién fun- ‘ional de millones de moléculas. En otras palabras, la vida muestra una complejided muy organizada. A pesar de la gran disparidad de procesos vitales que contribuyen a {generar y mantener el orden biol6gico, la mayoria de éstos puede clasificarse dentro de aoade las siguientes categoria: (1) sintesis y degradaciGn de biomoléculss, (2) trans- porte deiones y moléculas através de membranas celulares, (3) producci6n de fuerza J movimiento (4) eliminaci6n de desechos metab6licos y de otras sustancias txieas ULAS Los componentes celulares se sintetizan a través un jntrincado conjunto de reacciones quimicas, muchas de las cuales requieren energia sta es aportada de manera directa 0 indirecta por moléculas de ATP. Las moléculas {que se forman en las reacciones de biosftesisrealizan numerosas funciones. Pueden Gsamblarse en estructuras supramoleculares (p. ¢j.. las proteinas y los lipides que Sonstituyen las membranas), funcionar como portadoras de informacién (p. ¢}~ et DNA y el RNA), 0 catalizar reacciones quimicas (p. ej. las enzimas) SiNTESIS DE BIOMOLEC| TRANSPORTE A TRAVES DE MEMBRANAS Las membranas celulares regulan el paso de iones y moléeulas de un compartimento a oto, Por ejemplo, ln membrana plasmética (Ia membrana extema de las eélola) es una barreraselectiva. Bs respon” Pidie del transporte de determinadas sustancias, como los nutrientes que proceden SF um entomo relativamente desorganizado al interior celular, més ordenado. Del ‘nigmo modo, hay un transporte bidireccional de jones y moléculas en los organclos. Por ejemplo, los dcidos grasos se transportan al interior de un organelo denominado mitocondria para que puedan degradarse y generar energia. MOVIMIENTO CELULAR Una de las caractersticas ms destacadas de los seres vivOs sel movimiento organizado, Las actividades complejas y coosdinadas que se Hy fen para mantener Ia vida necesitan de Ia movilidad de los componentes celulares. AAlgunos ejemplos en eucariotas son Ia divisién celular y el movimiento organulaAmos procesos dependen en gran medida de la estructura y el funcionamiento di- xndmico de una red compleja de filamentos proteinicos conocida como citoesqueleto. Las formas de movimiento celular influyen sobremanera en la capacidad de los or- ‘ganismos para crecer, reproducirse y competir por unos recursos limitados, Como ejemplo, considérese el movimiento de los protistas en su biisqueda de alimento en tuna charca, o la migracién de los Jeucocitos humanos en sti persecucién de eélulas extraiias durante una infeccién, Otros ejemplos més sutiles son el movimiento de enzimas especificas a lo largo de una molécula de DNA durante la replicacién cromo- sémica que precede a la divisién celular o la secrecién de insulina por determinadas células pancredticas. ELIMINACION DE RESIDUOS Todas las células vivas producen compuestos de de- secho. Por ejemplo, las células animales transforman en éltima instancia nutrien- tes como azticares y aminofcidos en CO,, H,O y NH,, Estas moléculas pueden ser t6xicas si no se eliminan adecuadamente, Dicha eliminacién es sencilla en algunos casos. Asi, el CO,difunde en los animales al espacio extracelular y desde allf, tas una conversi6n breve y reversible a bicarbonato por los eritrocitos, se exhala ripidamente a través del sistema respiratorio, El exceso de H,O se excreta a través de los rifiones, Otras moléculas son tan téxicas, sin embargo, que los seres vivos han desarrollado mecanismos complejos para llevar a cabo su eliminaci6n. El ciclo de la urea (que se describe en el capitulo 15) es un mecanismo para transformar el amoniaco libre y el exceso de nitrégeno de los grupos amino en urea, una molécula menos t6xica, Esta molécula se elimina del organismo a través de los rifiones, como un componente importante de la orina. Las células contienen también una gran variedad de moléculas potencialmente t6xicas que deben eliminarse, Las células vegetales resuelven este problema trans- portando dichas moléculas a la vacuola, donde se degradan o se almacenan. Sin embargo, los animales deben utilizar mecanismos de elimninacién que dependen de su solubilidad en agua (p. ¢j., la formacién de orina en el rifién). Las sustancias hidr6- fobas que no pueden fragmentarse en moléculas més sencillas, como las hormonas esteroideas, se transforman en derivados hidrosolubles mediante reacciones especi- ficas. Este mecanismo también se utiliza para solubilizar otras moléculas orgénicas, como farmacos y contaminantes ambientales. 1.4 BIOLOGIA DE SISTEMAS Los conocimientos generales que se han presentado en este capitulo proceden de la aplicacién de herramientas de investigacién basadas en el reduccionismo. Esta poderosa estrategia, mecanicista en su concepciGn, estudia el “todo” biol6gico me- diante su “reducci6n” a las partes que lo componen. A su vez cada parte individual se subdivide, de modo que sea posible determinar las propiedades fisico-quimicas de sus moléculas y las conexiones entre ellas. El gran avance experimentado por las, iencias biolégicas modemnas no hubiera sido posible sin la filosofia reduccionista. Pero ésta presenta limitaciones relevantes, puesto que asume que un conocimiento suficientemente detallado de las partes conduce a una comprensi6n completa del fe- némeno. A pesar de los intensos esfuerzos dedicados a esta tarea, todavia esta lejos Ja comprensién plena de los procesos dinémicos de la vida En las tltimas décadas ha suscitado gran interés un nuevo enfoque, denominado biologia de sistemas, que pretende lograr un entendimiento més profundo de los seres vivos. A partir de algunos principios de ingenieria desarrollados inicialmente para construir reactores de propulsiGn a chorro, la biologfa de sistemas considera a los organismos vivos como sistemas integrados. Cada sistema permite realizar deter- minadas funciones. En un animal, uno de estos sistemas es el aparato digestivo, que consiste en un conjunto de 6rganos cuya misién es descomponer los ali moléculas que puedan ser absorbidas por las células intestinales. Aunque los sistemas disefiados por el ser humano y los seres vivos presentan similitudes notables en algunos aspectos, son significativamente La diferencia més importante esté.en el disefio. Cuando los ingenieros planifican yentos en 1.4 Biologia de sie CONCEPTO CLAVE Qo En los seres vivos, los procesos de ‘complejidad altamente ordenada son ‘mantenidos por un aporte constante de energia,