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Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de La Resistencia A Los Antimicrobianos Vol 1 Herramientas y Objetivos
Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de La Resistencia A Los Antimicrobianos Vol 1 Herramientas y Objetivos
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Panwar dura
Chetan Sharma
Editores de Eric Lichtfouse
Sostenible
Agricultura
Reseñas 46
Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos
Vol 1 Herramientas y objetivos
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Volumen 46
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Editor de series
Eric Lichtfouse
CNRS, IRD, INRAE, Coll Francia, CEREGE
Universidad de Aix-Marsella
Aix-en-Provence, Francia
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Libros
Redacción científica para revistas de factores de impacto
https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=42242
Química ambiental
http://www.springer.com/978-3-540-22860-8
Agricultura sostenible
Volumen 1: http://www.springer.com/978-90-481-2665-1
Volumen 2: http://www.springer.com/978-94-007-0393-3
Serie de libros
Química ambiental para un mundo sostenible
http://www.springer.com/series/11480
diario
Letras de química ambiental
http://www.springer.com/10311
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ecología, economía y ciencias sociales. De hecho, los mecanismos de descifrado de la agricultura sostenible
de procesos que ocurren desde el nivel molecular hasta el sistema agrícola y el nivel global en
escalas de tiempo que van desde segundos hasta siglos. Para eso, los científicos usan el enfoque del sistema
que implica estudiar los componentes y las interacciones de un sistema completo para abordar las cuestiones científicas,
cuestiones económicas y sociales. En ese sentido, la agricultura sostenible no es un clásico, estrecho
Ciencias. En lugar de resolver problemas utilizando el enfoque clásico de analgésicos que solo trata
impactos negativos, la agricultura sostenible trata las fuentes del problema.
Debido a que la mayoría de los problemas actuales de la sociedad ahora están entrelazados, son globales y se desarrollan rápidamente,
la agricultura sostenible traerá soluciones para construir un mundo más seguro. Esta serie de libros reúne
revisar artículos que analicen los problemas y conocimientos agrícolas actuales, y luego proponer
soluciones alternativas. Por lo tanto, ayudará a todos los científicos, tomadores de decisiones, profesores, agricultores.
y políticos que deseen construir un sistema agrícola, energético y alimentario seguro para el futuro.
generaciones.
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Agricultura sostenible
Reseñas 46
Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos
Vol 1 Herramientas y objetivos
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Editores
Panwar dura Chetan Sharma
Departamento de Microbiología Láctea Alpine Biomedicals Pvt. Limitado.
Guru Angad Dev Veterinario y Animal Haryana, India
Universidad de Ciencias
Ludhiana, India
Eric Lichtfouse
Universidad de Aix-Marsella, CNRS, IRD,
INRAE, Coll Francia, CEREGE
Aix-en-Provence, Francia
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva de Springer Nature
Suiza AG 2020
Esta obra está sujeta a derechos de autor. Todos los derechos tienen licencia única y exclusiva del Editor, ya sea
todo o parte del material se refiere, específicamente los derechos de traducción, reimpresión, reutilización de
ilustraciones, recitación, difusión, reproducción en microfilms o de cualquier otra forma física, y
transmisión o almacenamiento y recuperación de información, adaptación electrónica, software de computadora o similares
o metodología diferente ahora conocida o desarrollada en el futuro.
El uso de nombres descriptivos generales, nombres registrados, marcas comerciales, marcas de servicio, etc. en esta publicación
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leyes y reglamentos de protección y, por lo tanto, gratis para uso general.
El editor, los autores y los editores pueden asumir con seguridad que los consejos y la información de este libro
se cree que son verdaderas y precisas en la fecha de publicación. Ni el editor ni los autores ni el
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reclamaciones en mapas publicados y afiliaciones institucionales.
Esta impresión de Springer es publicada por la empresa registrada Springer Nature Switzerland AG
La dirección registrada de la empresa es: Gewerbestrasse 11, 6330 Cham, Suiza
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Prefacio
La persona irreflexiva que juega con el tratamiento con penicilina es moralmente responsable de la
muerte del hombre que sucumbe a la infección con el organismo resistente a la penicilina
Sir Alexander Fleming
La Organización Mundial de la Salud ha incluido la resistencia a los antimicrobianos como uno de los
las diez principales amenazas para la salud mundial en 2019. La resistencia a los antimicrobianos es una
proceso evolutivo del cable, que ha sido acelerado por la actividad humana en los sectores
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como
dictadolaelsalud humana,
aumento de laelresistencia
medio ambiente y la agricultura.
a los antibióticos en su Sir Alexander
discurso Fleming
del Premio pre de 1945, donde
Nobel
hizo hincapié en los riesgos asociados con la administración de dosis no letales de
penicilina y su disponibilidad no regulada. Actualmente, varios antibióticos se están extendiendo
Empleado sivamente en la agricultura, el medio ambiente, la veterinaria y la medicina humana. Vencer
a su amplia aplicación y uso no controlado, los antibióticos y sus residuos han
se ha encontrado en casi todos los productos alimenticios, por ejemplo, lácteos, carne y verduras, y
en aguas residuales, suelos y aguas. Con frecuencia se asocia una alta concentración de antibióticos
atado con mayor resistencia a los antimicrobianos. Por lo tanto, las pautas y políticas son
necesario para reducir el consumo de antibióticos y prevenir el uso indiscriminado.
A pesar de los esfuerzos mundiales, la resistencia a los antimicrobianos se está acelerando y, si las tendencias actuales
continúan sin cesar, podría haber hasta 10 millones de resistencias antimicrobianas anuales
muertes relacionadas con la mortalidad por una amplia gama de infecciones para el año 2050.
Por lo tanto, se necesita un enfoque general de "Una sola salud" para combatir la resistencia a los antimicrobianos.
y, a su vez, salvar vidas (Fig. 1 ).
Este libro revisa los impulsores, el impacto, la evaluación y la mitigación de
resistencia microbiana. Capítulo1 de Singh et al. explica cómo las prácticas de "Una sola salud"
podría mitigar eficazmente la aparición y propagación de la resistencia a los antimicrobianos. Esto
requiere vigilancia eficaz, regulaciones estrictas, uso regulado y nuevos antimicrobianos
crobials. Capítulo 2 de Kumar et al. presenta programas globales de vigilancia de
resistencia a los antimicrobianos en humanos, animales y el medio ambiente, con especial atención
Monitorear la idoneidad de las pautas terapéuticas, las intervenciones de salud pública y las políticas.
para controlar la infección. Capítulo 3 de Mohsin et al. analiza la resistencia a los antimicrobianos
tancia en relación con el cambio climático y la seguridad alimentaria. Capítulo 4 de Santana et al.
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vi Prefacio
Fig. 1 El paradigma ONE-HEALTH y las partes interesadas. "Una salud" se refiere a la estrategia integradora
gias en el diseño e implementación de legislación, políticas e investigación, lo que facilita la comunicación
comunicación entre múltiples sectores para lograr mejores soluciones para la salud pública. Este holístico
El enfoque ayuda a la integración de información de diferentes partes interesadas, como las agencias reguladoras.
cias, economistas, consumidores y otros contribuyentes, para proporcionar soluciones sostenibles contra
resistencia microbiana. En el Cap. 1 de Singh, KS et al.
describe estrategias bioinformáticas para priorizar los objetivos de los fármacos en los patógenos.
La genómica comparada se asocia con pangenómica, genómica sustractiva,
bioinformática estructural y análisis de vías metabólicas para diseñar nuevos antibióticos
ics. Capítulo 5 de Duan et al. resume los enfoques para analizar persister nativo
células dentro de una población. Los enfoques incluyen la etiqueta fluorescente única basada en
enfoque celular, enfoques de cribado de alto rendimiento que incluyen mutante de transposón
cribado de la biblioteca, cribado de la biblioteca de knockout y sobreexpresión, y omic
enfoques para comprender la formación de fenotipos persistentes.
Capítulo 6 de Sarma et al. presenta el sistema CRISPR-Cas como una herramienta prometedora
para abordar la resistencia a los antimicrobianos. La maquinaria CRISPR-Cas es un adaptativo
sistema inmunológico que se encuentra en las bacterias y las arqueas y es utilizado por el organismo para eliminar
nate material genético invasor extranjero. Capítulo7 de Singh et al. explica cómo las bacterias
Las biopelículas riales contribuyen a aumentar la resistencia a los antibióticos. De hecho, las bacterias se vuelven
más resistentes a los antimicrobianos cuando están incrustados en viscosos extracelulares
sustancias poliméricas. El capítulo presenta estrategias innovadoras para controlar bacterias
biopelículas y revisa los mecanismos moleculares de comunicación bacteriana con el
entorno, como la detección de quórum. La comunicación por detección de quórum también se difunde
maldecido en el Cap. 8 de Kumar et al. con especial atención al uso de la detección de quórum
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Prefacio vii
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Contenido
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X Contenido
Índice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 229
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xii Sobre los editores
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Chetan Sharma trabaja como asesor de investigación en Alpine Biomedicals Pvt. Limitado.,
Haryana, India. Ha completado su M.Sc. y Ph.D. en Microbiología en el
Departamento de Microbiología de la Universidad de Kurukshetra, Kurukshetra. Dr. Sharma
ha publicado varios artículos de investigación de renombre internacional y se desempeña como revisor
para diferentes revistas. También ha editado y publicado un libro de Nova Science.
Publishers, EE. UU. Y dos libros de Springer Nature. Su interés de investigación actual
cubre el aislamiento de compuestos bioactivos de fuentes naturales (plantas), médicos
microbiología, resistencia a los antimicrobianos y probióticos.
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Colaboradores
xiii
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xiv Colaboradores
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Colaboradores xv
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Capítulo 1
Paradigma de resistencia a los antimicrobianos
y enfoque de una sola salud
Resumen Las muertes causadas por microbios farmacorresistentes superan las 50.000 al año
mundial y la resistencia a los antimicrobianos se considera ahora como una de las mayores
amenaza para la salud humana. La aparición y propagación de la resistencia a los antimicrobianos.
merece la atención inmediata tanto de los profesionales de la salud como de los dirigentes políticos.
La naturaleza compleja y multifactorial de la resistencia a los antimicrobianos no se comprende bien
se mantuvo, especialmente en términos de interacción de los seres humanos, los animales y el medio ambiente. La
falta de información confiable, desarrollo lento de nuevos antimicrobianos y alta incidencia
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Las denuncias de la transferencia horizontal de genes han empeorado aún más la situación.
El tema de la resistencia a los antimicrobianos exige una mayor conciencia entre el público
Esfuerzos lícitos y coordinados de los profesionales de la salud para regular el uso y el consumo.
patrón de acción de los antibióticos. Políticas que mejoran la higiene comunitaria, la vida
Es necesario fortalecer las condiciones y la cobertura de vacunación en la población, para
mize la incidencia de infecciones. El uso indiscriminado a nivel de masa de potentes
Los antibióticos en la agricultura deben regularse y su fuga al medio ambiente.
debe comprobarse. También se justifica una vigilancia eficaz en el medio ambiente para
comprender la realidad del terreno y desarrollar estrategias y políticas para proteger al público
KS Singh ( ✉ )
Centro Nacional de Recursos Microbianos - Centro Nacional de Ciencia Celular,
Pune, Maharashtra, India
S. Anand
Departamento de Microbiología Lechera, Facultad de Tecnología Lechera Hansdiha,
Dumka, Jharkhand, India
S. Dholpuria
Departamento de Ciencias de la Vida, Universidad de Sharda, Greater Noida, Uttar Pradesh, India
JK Sharma
Universidad Maharshi Dayanand, Rohtak, Haryana, India
Y. Shouche
Centro Nacional de Recursos Microbianos - Centro Nacional de Ciencia Celular,
Pune, Maharashtra, India
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 1
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
Opiniones sobre agricultura 46, https://doi.org/10.1007/978-3-030-53024-2_1
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2 KS Singh y col.
salud. Todos estos esfuerzos realizados por el gobierno, el público en general y otras partes interesadas
puede integrarse de manera eficiente y englobarse en un sistema holístico cada vez más aceptado
enfoque denominado "Una sola salud". En este capítulo, nos enfocamos en diferentes facetas del
la amenaza de la resistencia a los antimicrobianos y cómo las prácticas de 'Una sola salud' podrían
mitigar la aparición y propagación de la resistencia a los antimicrobianos.
Palabras clave Resistencia a los antimicrobianos · Contaminación por antibióticos · Una sola salud ·
Antibióticos y agricultura · Transferencia horizontal de genes · Cooperación internacional ·
Vigilancia ambiental · Plan de acción global · Higiene comunitaria · Buena
Prácticas microbiológicas
1.1 Introducción
El uso de antibióticos y el problema de la resistencia a los antimicrobianos han pasado por muchas etapas
de desarrollo y actualizaciones. Los antibióticos se descubrieron en 1928 y el intenso
La investigación durante el período 1950-1970 ha dado lugar a muchos antibióticos en la actualidad.
ics. Sin embargo, debido a los enormes insumos financieros, las restricciones regulatorias y el largo desarrollo
duraciones de los opment, la investigación farmacéutica en nuevos antibióticos amortiguó y
comparativamente, se desarrollaron menos antibióticos después de mediados de la década de 1980 (Spellberg y
Gilbert 2014 ). Hoy en día, se encuentran antibióticos y / o sus residuos en
casi todos los nichos que van desde la alimentación (lácteos, carnes, verduras, etc.) hasta las aguas residuales,
suelos y masas de agua acuáticas. El alto nivel de antibióticos se ha asociado con frecuencia
ciado con mayor resistencia a los antimicrobianos (Llor y Bjerrum 2014 ), por lo tanto, los principales
se está prestando especial atención a reducir el consumo de antibióticos y prevenir
uso indiscriminado. Se ha demostrado que el uso elevado de antibióticos acelera la tasa de
Transferencia horizontal de genes y fijación de resistencia a antibióticos en especies microbianas.
que conduce a la aparición de islas genómicas específicas de la resistencia a los antibióticos (Gillings
y Stokes 2012 ). Un ejemplo sorprendente es Acinetobacter baumannii que evolucionó
(en un lapso de 30 años) de un fenotipo susceptible a antibióticos a tener resistencia
tancia contra múltiples antibióticos, mediante la adquisición de diferentes islas genómicas y 45
genes de resistencia a antibióticos a través de la transferencia de genes horizontal (Fournier et al. 2006).
Las fuentes de estos antibióticos provienen del uso humano y veterinario, la producción
unidades y uso de antibióticos como promotores del crecimiento en la agricultura. Muchos puntos calientes de
Se han identificado resistencias a los antimicrobianos como hospitales,
residuos, explotaciones ganaderas y establecimientos agrícolas, etc.que culminan en la superposición
ping dominios ecológicos. Estos dominios ecológicos son testigos del intercambio frecuente de
microbios entre ellos. Esto conduce a la aparición incluso rápida de microbios resistentes.
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a través de estos nichos. La investigación en muestras clínicas humanas ha mostrado diversas y
tendencia creciente de la resistencia a los antimicrobianos. La resistencia a los antimicrobianos se ha convertido
importante problema de salud pública y de acuerdo con una predicción de la organización para
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Fig. 1.1 Paradigma de ONE-HEALTH y partes interesadas. 'Una salud' se refiere a estrategias integradoras
en el diseño e implementación de legislación, políticas e investigación, lo que facilita la comunicación
ción entre múltiples sectores para lograr mejores soluciones para la salud pública. Este enfoque holístico
puede ayudar en la integración de información de diferentes partes interesadas, como agencias reguladoras,
omistas, consumidores y otros contribuyentes para proporcionar soluciones sostenibles contra los antimicrobianos
resistencia
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1 Paradigma de resistencia a los antimicrobianos y enfoque de una sola salud 5
animales porque están expuestos con frecuencia a antibióticos a través del agua y / o el alimento, por
prevenir la infección. Se ha estimado que el ganado consume casi entre el 50% y el 80%
del total de antibióticos utilizados y se estimó en alrededor de 63,151 ± 1560 toneladas en 2010
(Muchacho 2014 ; Van Boeckel y col.2015). Esto es, en esencia, profilaxis, y contribuye
a una gran proporción de fugas de antibióticos debido a la escorrentía superficial, al medio ambiente
ment. Incluso durante la infección individual en animales destinados al consumo, todo el grupo / lote
antibióticos administrados, para prevenir cualquier posible diseminación de la infección. Grupo
El tratamiento nivelado de antibióticos se administra por la lógica de que los animales
(como aves de corral, ganado, etc.) tienen un alto riesgo de infección bacteriana debido a
higiene, compartimentos superpoblados y alta exposición a agentes infecciosos durante
transporte y mezcla de animales de diferentes orígenes. Otro uso desafortunado de
nivel de masa (alrededor de 26,4 millones de libras cada año solo en EE. UU.), dosis bajas de antibióticos
ics en los animales destinados al consumo humano es promover el crecimiento (Mellon et al. 2001; Oliver y col. 2010). Su
uso para la promoción del crecimiento en animales, depende del uso a largo plazo de antibióticos en
niveles subterapéuticos de dosis (5-110 partes por millón), y se denomina
laxis '(Butaye et al. 2003 ).
La metafilaxis podría durar más de 2 semanas o toda la vida del animal y podría
generar hasta un 10% de aumento en la producción (Organización Mundial de la Salud 2003 ). La mayoría
Un hecho alarmante es que la mayoría de los antibióticos (fluoroquinolonas, colistina y macro-
tapas) utilizados en animales se reservan para el tratamiento de seres humanos con niveles terminales de
infección o más simplemente infecciones debidas a patógenos resistentes a múltiples fármacos (OMS
Grupo Asesor 2016). Estas condiciones pueden favorecer la aparición de múltiples fármacos.
microbios resistentes, fácilmente transferibles a los seres humanos o al medio ambiente (FAO / OIE /
OMS 2003 ). Un claro ejemplo de tal caso son las enfermedades zoonóticas que rara vez son
transmitida a través de humanos, como Campylobacter spp. resistente a fluoroquinolonas .
en pollo. Se estima que alrededor de 8 a 10,000 personas solo en EE. UU. Adquieren fluoroqui-
infecciones por Campylobacter resistentes a nolonas a través del pollo (Alimentos y Medicamentos)
Administración 2000). Pero muchos estudios (por ejemplo, en Dinamarca, Suecia, etc.), han
demostrado que criar animales en condiciones más limpias, vacunación adecuada y buenas
La higiene tiene un efecto económico similar y es posible que no se requieran antibióticos (Mundial
Organización de la Salud 2003 ; Tang y col. 2019). Pero estos protocolos de la industria prevalecen
en 58 países que suministran animales destinados al consumo humano y normativas gubernamentales más estrictas
deben aplicarse para detener esta práctica (Organización Mundial de la Salud 2003). Es
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Es bien sabido que el uso de antibióticos en animales destinados a la alimentación es en gran parte para compensar
las malas condiciones de manejo animal que prevalecen (Health Canada 2014 ; europeo
Unión 2015). Teniendo en cuenta muchos factores, la OMS ha recomendado y muchos
otros países han prohibido o están eliminando gradualmente el uso de antibióticos en animales de granja.
mals (Administración de Drogas y Alimentos 2013a , b; Health Canada 2014 ; europeo
Unión 2015 ).
Hay pocos ejemplos sorprendentes que resalten los peligros de usar la misma clase de
antibióticos en humanos y animales. Las cefalosporinas de tercera generación son críticamente
importante para la salud humana y tiene una amplia aplicabilidad a enfermedades e infecciones
tanto en humanos como en animales (Grupo Asesor de la OMS 2016 ). Algunos antibióticos de este
clase se utilizan principalmente para el tratamiento de enfermedades en animales, pero a veces incluso en
metafilaxis. El consumo de cefalosporinas en Europa, EE. UU. Y otros
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6 KS Singh y col.
países ha aumentado constantemente a lo largo de los años, y es más en humanos que en animales.
mals (Administración de Alimentos y Medicamentos de 2012 ). La resistencia a estos antibióticos
fermentado por una clase especializada de enzimas beta-lactámicas que escinden el anillo llamadas
betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y AmpC. Ambos genes son
ahora se encuentra presente en plásmidos y son altamente móviles a través de genes horizontales
transferencia (Agencia Europea de Medicamentos 2009). Debido a su uso excesivo, la resistencia a estos
Los antibióticos se observan a menudo en infecciones humanas causadas por patógenos comunes.
como E. coli, Salmonella spp. y K. pneumoniae .
Otra consecuencia alarmante es la co-transferencia (debido a la proximidad en la genética
loci) de otros genes de resistencia a antibióticos (para tetraciclina, sulfonamidas, aminoglu-
cosides, etc.) con las BLEE o AmpC. Esto conduce a la correspondiente co-selección
y enriquecimiento de patógenos resistentes a múltiples fármacos en los nichos afectados, que son incluso
más difícil de tratar. Esto ha llevado a una disminución drástica en la elección de antibióticos para
terapia en estas infecciones y muchas veces los carbapenémicos se dejan como última opción
(Nordmann 2014 ). Muchos estudios han encontrado parentesco en BLEE que contienen E. coli
cepas aisladas de alimentos, animal y la muestra humana (Jakobsen et al. 2009; Rizzo
et al. 2019; Tadesse y col. 2017; Odsbu y col. 2018 ). Además, el modo de difusión
de genes de resistencia a cefalosporinas entre patógenos humanos y animales ha
ha encontrado que a través de plásmidos (de Has et al. 2014). El uso masivo de estos
antibiótico para la metafilaxis con frecuencia termina en el medio ambiente y directamente
a través de los alimentos, exponiendo aún más a los seres humanos a microbios resistentes a los antibióticos (Canadá
Programa integrado de resistencia a los antimicrobianos 2009). Detención voluntaria del uso
de las cefalosporinas en los criaderos ha demostrado traer una disminución drástica en la prevalencia
presencia de microbios resistentes a las cefalosporinas en los animales destinados a la alimentación, en Japón, Dinamarca
y Canadá (Bager et al. 2015 ; Hiki y col. 2015). Se ha observado la misma tendencia
con respecto al uso de fluoroquinolonas y bacterias resistentes a fluoroquinolonas en
los animales de consumo siguen siendo raros en países como Australia, donde su uso en alimentos
animales nunca fue aprobado (Nelson et al. 2007).
Debido a la aparición de muchos patógenos resistentes a múltiples fármacos y al tratamiento limitado
opciones, la colistina se considera hoy en día como uno de los tratamientos de último recurso para
humanos infectados con patógenos resistentes a múltiples fármacos. Entre otros, estos patógenos
gens incluyen P. aeruginosa resistente a carbapenémicos , A. baumannii y
Enterobacteriaceae que figuran en la lista de prioridades de la OMS de patógenos para los que
Se requieren antibióticos con urgencia (Tacconelli et al. 2018 ). Debido a su toxicidad, la colistina
no se prefirió antes para la administración humana. Pero un número limitado de antibióticos
ics y su alta potencia contra patógenos resistentes a múltiples fármacos lo ha hecho incluso
más importante en la época contemporánea, como antibiótico de último recurso. Sin embargo, esto
El antibiótico también está aprobado para su uso en animales destinados a la alimentación
laxis y también se utiliza para promover el crecimiento. Vigilancia reciente de la resistencia a la colistina
tancia en animales comestibles como pavos, pollos de engorde, aves de corral, etc.en Europa mostró la
presencia de un porcentaje variable de patógenos resistentes a la colistina y resistentes a múltiples fármacos
genes como Salmonella enterica . Aunque, esto podría ser una resistencia intrínseca en el
población microbiana, pero la presencia de estos patógenos resistentes en los alimentos
nítidamente un peligro potencial para los seres humanos. Otra gran preocupación fue la observación de
la movilización de un gen de resistencia a la colistina (mcr-1) a través del gen horizontal
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1 Paradigma de resistencia a los antimicrobianos y enfoque de una sola salud 7
transferencia por plásmidos (Liu et al. 2016). Uso de colistina y antibiótico asociado
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La resistencia es distinta de la de las cefalosporinas porque en muchos países, la resistencia
El consumo de este antibiótico en animales destinados al consumo excede varias veces su consumo.
succión en humanos (Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades 2015).
Muchos países y agencias reguladoras como la Agencia Europea de Medicamentos han recomendado
Se recomendó una reducción drástica en el uso de colistina en los animales destinados a la alimentación para guardarla para su uso.
Inhumanos.
Problemas similares se han enfrentado anteriormente con los antimicrobianos glicopéptidos que
también se utilizaron como promotores del crecimiento y no se consideraron fármacos relevantes para los seres humanos.
Un ejemplo de ello es el glicopéptido 'avoparcina', que se utilizó ampliamente en
animales comestibles (Aarestrup et al. 1996 ). Esto condujo al desarrollo de resistencia contra
clase de antibióticos glucopéptidos. Ahora, la vancomicina (también un antibiótico glicopéptido),
que es un antibiótico importante contra patógenos resistentes a múltiples fármacos (especialmente
Staphylococcus aureus resistente a la meticilina ) también se enfrenta a la resistencia de muchos
patógenos resistentes a múltiples fármacos de los alimentos, los seres humanos y el medio ambiente (Tang et al.
2014). Indiscutiblemente, se deben aprender lecciones de estos errores previos relacionados con
Aumento y propagación de cierta resistencia a clases de antibióticos y se debe tener precaución.
ejercido en el uso de antibióticos, para prevenir un mayor desarrollo de resistencia a los antibióticos
debido a la metafilaxis.
El problema predominante de la resistencia a los antibióticos está relacionado en gran medida con la irresponsabilidad.
uso de antibióticos y rápido intercambio de genes de resistencia a antibióticos entre
microbios. La interrelación y el rápido intercambio de genes de resistencia a los antibióticos.
entre patógenos, que pueden colonizar e infectar tanto a animales como a seres humanos, ha
agravó aún más el problema de la resistencia a los antimicrobianos (Fig. 1.2). La causa principal
de uso indiscriminado surge del ímpetu para obtener el máximo beneficio económico
egresos de los recursos disponibles (incluido el ganado) y la eliminación irresponsable de
residuos generados. Un ejemplo es el uso de antibióticos de amplio espectro como
promotores, en el ganado para aumentar la cantidad de carne y el tamaño total. El mecha-
El nismo detrás de esto no está claro, pero se han propuesto varias hipótesis. En una de
ellos, se ha dicho que los antibióticos ayudan a una mejor digestión de los alimentos a través de
presionando las bacterias sensibles del intestino que podrían resultar en una pérdida de energía debido a
fermentación bacteriana. En otra hipótesis, se ha propuesto que el cito-
kines liberados durante la infección bacteriana reduce la masa muscular y por lo tanto el uso de
antibióticos ayuda a superar ese efecto (Hughes et al. 2004). En los paises
como en EE. UU., la mitad de los antibióticos que se administran a los animales están destinados a promover el crecimiento
ción. Esta práctica se aplica a menudo en cerdos y en los principales países productores de carne de cerdo.
como China y EE. UU. El uso de antibióticos en China es cuatro veces mayor que eso
de EE. UU. con el fin de aumentar la producción de carne de cerdo (Cully 2014). Estos son los datos que
está siendo monitoreado y en comparación con eso, hay muy poca o ninguna información
con respecto a los antibióticos utilizados en las pequeñas explotaciones. La mayoría de estos antibióticos, utilizados en
Página 23
8 KS Singh y col.
Fig. 1.2 Interconexión y transferibilidad entre los diferentes nichos. Muchas rutas de
existen transmisiones para el intercambio de determinantes de la resistencia a los antimicrobianos, como la resistencia a los antibióticos
genes tancia (ARG) entre animales, seres humanos y el medio ambiente. Actividades antropogénicas
permanecer en el centro de todas las actividades principales relacionadas con la resistencia a los antimicrobianos
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genes de resistencia ( sul A y sul III) (Ji et al. 2012). Por supuesto, estos datos solo representan
envió la población microbiana cultivable resistente a los antibióticos y una gran cantidad de
Los genes de resistencia a los antibióticos y las bacterias de resistencia a los antibióticos deben ser potencialmente
presente en la porción no cultivable del microbioma de estos nichos (Enne et al.
2008; Zhu y col. 2013).
Muchos especulan que esta porción no cultivable del microbioma actúa como sumidero de
muchos genes de resistencia a los antibióticos y necesitan atención para mitigar adecuadamente los antimicro-
amenaza de resistencia bial. En general, estos factores conducen a un aumento de los residuos de antibióticos.
en los residuos que finalmente terminan en el medio ambiente. Se ha encontrado que
el estiércol y el suelo de las granjas porcinas chinas tienen una concentración 28.000 veces mayor de
genes de resistencia a los antibióticos en comparación con los de los suelos agrícolas en China (Zhu
et al. 2013 ). Esto podría deberse a que los desechos humanos se han dedicado a ser tratados en
plantas de tratamiento de aguas residuales capaces de mitigar la diseminación de antibióticos
bacterias de resistencia de las aguas residuales al medio ambiente. Pero no es el caso que
El tratamiento de aguas residuales no causa ninguna resistencia a los antibióticos, aunque la frecuencia de
La resistencia a los antimicrobianos de los residuos tratados es menor en comparación con los no tratados.
los residuos (Di Cesare et al. 2016). En comparación con esto, no se está prestando mucha atención
por la industria animal hacia la eliminación cuidadosa y regulada de los desechos de las granjas de animales y
abonos.
Otro aspecto de la exposición indirecta de antibióticos a humanos a través de animales
El origen radica en su uso excesivo en la comida callejera (Campos et al. 2015 ). La comida callejera es enorme
fenómeno en los países en desarrollo y desarrollados por igual, pero vienen con preguntas
preocupaciones razonables sobre su preparación e ingredientes crudos en países sin
regulación o control. Dados los costos económicos, los vendedores ambulantes de alimentos generalmente ignoran
higiene, las materias primas no se almacenan adecuadamente y el paquete preparado no se
servido en vajilla limpia / paquetes de entrega. Para compensar la cantidad de proteína (o
más dinero por kilogramo), se utiliza una proporción excesiva de carne, que (dada la
limitaciones económicas) podrían obtenerse fácilmente de granjas que utilizan prácticas agrícolas más baratas
ticos, incluido el uso no regulado de antibióticos, malas condiciones de crianza para los
transporte de animales y antihigiénicos y almacenamiento de productos cárnicos. Muchas veces, estos
los vendedores tienden a comprar animales enfermos que no reciben tratamiento y que se venden a
Precios más baratos y tienen altos niveles de antibióticos y agentes potencialmente peligrosos.
(Kim et al. 2013). En Sudáfrica, la arena para aves de corral se utiliza con frecuencia como alto contenido de proteínas.
suplemento para animales de granja, que es definitivamente un peligro para la salud, dependiendo de
los niveles de antibióticos a los que estuvieron expuestas las aves de corral (Soto 2013 ).
Se han reportado muchas bacterias resistentes a los antibióticos a partir de alimentos derivados de animales.
como el 47% de los resistentes en el total de aislados de Salmonella de la carne y la leche en
Etiopía (Comité Mixto de Expertos Asesores sobre Resistencia a los Antibióticos 1999 ) mientras
14% de resistentes en el total de aislamientos de E. coli de pollo, leche y huevo en la India
(Agencia Europea de Medicamentos 2012). Estas bacterias tienen resistencia contra uno o
más de los antibióticos de uso común en humanos, como penicilina, cefalosporina,
carbapenem, tetraciclina, ampicilina, sulfametoxaxol, trimetoprima y cloruro
anfenicol. Si el uso de antibióticos no está regulado en el ganado, conduce a la aparición de
muchos patógenos animales resistentes a los antibióticos como Salmonella spp., Enterococcus
spp., Yersinia enterocolitica, Listeria monocytogenes, Staphylococcus spp .,
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Escherichia coli, Campylobacter jejuni , etc., que pueden causar infección en humanos.
(Phillips y col. 2004 ). Muchos de estos patógenos también indican contaminación fecal en
agua o suelo, y se utilizan como medida de aptitud para el consumo humano. Esto
es importante porque estos patógenos también tienen una alta frecuencia de recombinación y
propensión al intercambio de genes de resistencia a antibióticos a través de genes horizontales
transferir. La relación filogenética de estas bacterias facilita aún más la trans-
fer e intercambio de genes de resistencia a antibióticos entre ellos. Estas situaciones
potenciar el desarrollo de resistencia a los antibióticos aún más rápidamente entre los
microbios que comparten el mismo nicho. Los riesgos para la salud pública derivados de estos antibióticos
Los microbios resistentes a los óticos no pueden estimarse fácilmente debido a su compleja distribución.
patrón de acción entre los animales comestibles y los seres humanos. Faltan sistemas rápidos y fiables.
técnicas de detección para la manifestación de resistencia a los antibióticos, patrón complejo de
intercambio de genes de resistencia a antibióticos, herramientas de predicción poco fiables para comprender
Implicaciones en la mortalidad y morbilidad de los seres humanos y fluctuaciones en el costo del tratamiento.
asociadas con infecciones causadas por tales patógenos (Wegener 2012 ). Esencialmente,
Estos patógenos zoonóticos resistentes a los antibióticos pueden actuar como vectores de resistencia a los antibióticos.
tancia en humanos. Por tanto, la resistencia a los antibióticos en los patógenos comunes a ambos
mals y humanos es preocupante y ciertamente indica el origen de muchos antibióticos
patógenos resistentes de granjas de animales o actividades relacionadas.
La mayoría de los antibióticos de uso veterinario tienen similitud estructural con el uso humano.
antibióticos y podría impulsar directamente a los microbios dentro de los humanos hacia la resistencia.
Otro peligro del uso de antibióticos en animales es la acumulación de residuos de antibióticos.
cuotas en tejidos y órganos comestibles de animales en concentraciones variables. Algunos informes
han demostrado la presencia directa de residuos de tetraciclina y cloranfenicol
(Camerún, Irán, Egipto) por encima de su límite máximo de residuos (norma de la Unión Europea
dards) en músculo, corazón, hígado y riñón de pollos de granja (Tavakoli et al. 2015 ;
Guetiya Wadoum y col. 2016 ). Informes similares para la presencia de diferentes antibióticos.
Se han reportado tales como ciprofloxacina se ha encontrado dentro de los huevos de terminales terminales.
aves enfermas que reciben tratamiento con antibióticos (Billah et al. 2015 ), quinolonas dentro de pollo
y carne de vaca (Er et al. 2013) en Turquía, amoxicilina en la leche y los huevos en Bangladesh
(Chowdhury et al. 2015), sulfonamidas y quinolonas en la leche en China, Malasia
y la India (Cheong et al. 2010 ;. Zheng et al 2013; Nirala y col. 2017 ). Exposición a
los antibióticos de los alimentos derivados de animales pueden crear múltiples complicaciones en los seres humanos,
tales como neuropatía, hipersensibilidad a fármacos, anemia aplásica, mutagénesis, alteraciones
presencia de flora intestinal normal, hepatotoxicidad, trastornos reproductivos y, por supuesto, del desarrollo
Opción de la resistencia a los antibióticos en las bacterias colonizadoras del intestino (Lee et al. 2001; Nisha
2008; Beyene 2015 ). Estas manifestaciones en humanos pueden ser el resultado de exposiciones.
tanto agudos como de periodos prolongados a través de la comida. Idealmente hablando, sin antibióticos o su
Los residuos deben estar presentes en los alimentos derivados directa o indirectamente de los animales.
Sin embargo, por razones prácticas, es difícil de manejar y determinar la caja fuerte.
niveles de antibióticos en alimentos de origen animal y un límite máximo de residuos de antibióticos
en alimentos de origen animal ha sido recomendado por la Unión Europea y otros
autoridades (Alimentarius 2012 ). El nivel de antibióticos excretados por los animales es diferente.
dramáticamente dependiendo de la metabolización del antibiótico, la edad, la dieta y
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Cuadro 1.1 Recomendaciones de la OMS sobre el uso de antimicrobianos de importancia médica en los alimentos
animales productores
1 El GDG (Grupo de Desarrollo de Directrices) recomienda una reducción general en el uso de todos
clases de antimicrobianos de importancia médica en animales destinados a la producción de alimentos.
2 El GDG recomienda la restricción completa del uso de todas las clases de medicamentos de importancia médica.
antimicrobianos en animales destinados a la producción de alimentos para promover el crecimiento.
3 a El GDG recomienda la restricción completa del uso de todas las clases de medicamentos
antimicrobianos en animales productores de alimentos para la prevención de enfermedades infecciosas que han
aún no ha sido diagnosticado clínicamente.
4a bEl GDG sugiere que los antimicrobianos clasificados como de importancia crítica para los
El medicamento no debe utilizarse para el control de la diseminación de una enfermedad diagnosticada clínicamente.
enfermedad infecciosa identificada dentro de un grupo de animales productores de alimentos.
4b bEl GDG sugiere que los antimicrobianos clasificados como de importancia crítica para los
El medicamento no debe utilizarse para el tratamiento de animales productores de alimentos con un efecto clínico.
enfermedad infecciosa diagnosticada.
a Consideraciones específicas: cuando un profesional veterinario juzga que existe un alto riesgo de propagación
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de juicio
El una enfermedad infecciosa
se realiza sobre particular,
la base el uso derecientes
de los resultados antimicrobianos para la de
de las pruebas prevención
cultivo y de enfermedades está justificado, si tal
sensibilidad.
b Para prevenir daños a la salud y el bienestar de los animales, se pueden establecer excepciones a las recomendaciones 4a y 4b.
cuando, a juicio de los profesionales veterinarios, el cultivo bacteriano y los resultados de sensibilidad
demostrar que el fármaco seleccionado es la única opción de tratamiento
estado de enfermedad de los animales. Por lo tanto, para calificar estos límites máximos de residuos,
Se debe proporcionar una formación adecuada a los agricultores para facilitar el uso cuidadoso de antibióticos.
ics y seguimiento de la recuperación animal. También necesitan ser sensibilizados sobre la
período de retiro del antibiótico para asegurar su excreción y eliminación de los tejidos
dentro de niveles seguros para el consumo humano, antes de su venta al cliente. Esta var-
ies ampliamente dependiendo del tipo de fármaco, los animales y la forma de dosificación, por lo que debería
ser debidamente explicados y supervisados a los ganaderos por los veterinarios. En
En relación con esto, el GDG (Grupo de Desarrollo de Directrices) de la OMS en 2017 ha
recomendó cuatro pautas, que deben seguirse, sobre el uso de medicamentos
antimicrobianos importantes en animales destinados a la producción de alimentos (Cuadro 1.1 ) (Aidara-Kane
et al. 2018).
Se han informado con frecuencia altos niveles de antibióticos por causas ambientales.
Muestras como suelo, estiércol y cuerpos de agua, especialmente aquellos que reciben insumos.
de explotaciones ganaderas y / u otros nichos donde los antibióticos se utilizan de forma intensiva. La
La interconexión y las interacciones mutuas entre estas dos entidades han sido
discutido en las siguientes secciones.
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El suelo es un eje central y sirve como fuente / sumidero para el intercambio de material entre animales
mamas, plantas, aire, rocas, agua, etc. y fue identificado como un enorme reservorio de antibióticos
genes de resistencia ótica que se originan en hongos, plantas, bacterias y otros organismos
(Figs. 1.1 y 1.2 ) (Monier et al.2011 ). Muchas resistencias a antibióticos previamente desconocidas
genes tancia de estudios metagenómicos en bacterias no cultivadas del suelo ha sido
informó y numerosos aún no se han explorado (Riesenfeld et al. 2004). Aunque el
Se informa que los vegetales cultivados en suelos no complementados albergan resistencia a los antibióticos.
genes tancia y, por lo tanto, microbios resistentes a los antibióticos están presentes de forma natural en los suelos. Esto
puede entenderse por el hecho de que la mayoría de los antibióticos son producidos por
hongos o bacterias. Por lo tanto, estas especies también portan los genes que proporcionan resistencia.
contra los antibióticos producidos por ellos (Allen et al. 2010 ). Sin embargo, pero la carga
de microbios resistentes a los antibióticos en el suelo suplementado con estiércol suele ser mayor y
depende en gran medida de la clase de antibióticos que se utilizan en las granjas de animales de
donde se obtuvo el estiércol (Marti et al. 2013 ).
Muchos estudios han demostrado que las verduras absorben los antibióticos contenidos en la
estiércol / suelo y muchas veces también durante los procesos de transporte y distribución,
exponiendo así a los seres humanos a los peligros de transmisión de la resistencia a los antimicrobianos
(Beuchat 2002 ). También puede verse afectado por las aguas residuales que se utilizan para el riego.
ción, equipos de cosecha contaminados, la capacidad de absorción del suelo, el suelo
microbioma y los genes de resistencia a antibióticos y elementos genéticos móviles inter-
actuando entre microbios en el suelo (Chee-Sanford et al. 2009; Oluyege y col. 2015).
Un grupo de investigadores encontró altos niveles de tetraciclina en muestras de estiércol y suelo
de granjas comerciales porcinas en China. También informaron la presencia de aproximadamente
149 genes únicos de resistencia a los antibióticos y hasta un 43% de abundancia de aph A (antibiótico
gen de resistencia al antibiótico aminoglucósido) en esas muestras (Zhu et al.
2013). Otro grupo informó la presencia del gen bla CTX-M (resistencia a antibióticos
gen contra cefotaxima) como el gen de resistencia a antibióticos más abundante que proporciona
resistencia a múltiples fármacos en los aislamientos de la granja porcina y muestras de suelo cercanas
ples. Un estudio muestra que muchos arrozales en China han sido contaminados (presumiblemente
hábilmente a través de abonos a base de desechos animales o de otro modo) con numerosos antibióticos
genes de resistencia que muestran más del 38% de resistencia a múltiples fármacos (Xiao et al. 2016).
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Estar activamente involucrado en las actividades diarias de casi todas las formas de vida,
gran dependencia de la vida de los cuerpos acuáticos y, con frecuencia, es el punto final de
la mayoría de las actividades de la vida y los ciclos de nutrientes. Naturalmente, los cuerpos acuáticos sirven como
fregaderos naturales, puntos calientes y depósitos para los antibióticos, bacterias resistentes a los antibióticos,
y genes de resistencia a antibióticos. Estos cuerpos de agua pueden ser marinos o de agua dulce.
y constituyen agua de mar, agua del grifo, agua potable, agua subterránea y aguas residuales.
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Estos cuerpos de agua albergan muchas bacterias que causan enfermedades transmitidas por el agua, como
E. coli, Salmonella spp. , Shigella spp. , Vibrio spp., Etc., muchas de las cuales podrían ser
resistente a los antibióticos. La situación de la resistencia a los antimicrobianos en estos cuerpos de agua es
como resultado de muchos factores que incluyen edáficos, niveles de antibióticos, niveles de nutrientes, bioac-
acumulación, ambiental y la frecuencia de interacciones con formas de vida, incluyendo
ing animales, plantas y microbios (Ding y He 2010 ).
Los niveles de antibióticos, bacterias resistentes a los antibióticos y resistencia a los antibióticos.
genes en los cuerpos de agua se ven drásticamente afectados por la agricultura suplementada con estiércol.
escorrentía rural, contaminación fecal de vida silvestre, descargas accidentales de industrias y /
o plantas de tratamiento de aguas residuales (Oluyege et al. 2015 ). Hay muchos desafíos enfrentados
por los países en desarrollo en la eliminación segura de sus aguas residuales y el mantenimiento del agua
Tuberías de distribución. Esto conduce con frecuencia a la mezcla de aguas residuales y potable.
agua, exponiendo así a los humanos directamente a coliformes fecales y causando infecciones,
muchos de los cuales pueden ser resistentes a los antibióticos. En los países en desarrollo, muchas regiones
no tienen un sistema de eliminación de aguas residuales adecuado y las aguas residuales / aguas residuales se
desechados en los ríos. Esto aumenta los coliformes fecales y la carga de antibiótico.
bacterias resistentes en los 'ríos', que debido a la escasez de agua también se utilizan para beber
ing, y por lo tanto afecta directamente a la población en general con infecciones y enfermedades
(Normark y Normark 2002). Muchos determinantes genéticos de la resistencia, como
BLEE ( bla CTX-M-15 , bla CTX-M-15 bla OXA-58 ) se encontraron en estudios similares que significan
el papel de los ríos como posible portador o sumidero de estos genes. Independientemente, siendo
involucrado en la vida diaria de una gran población, representa un riesgo para la salud de los seres humanos y
animales en proximidad de los ríos (Adelowo et al. 2018; Cacace y col. 2019).
Los eventos de reunión masiva (especialmente congregaciones religiosas, eventos deportivos) han
importantes implicaciones epidemiológicas y se ha encontrado que aumentan el número
de coliformes (indicador de la calidad del agua) y otros microbios en los cuerpos acuáticos
incluyendo muchas cepas resistentes y genes de resistencia a antibióticos (Khan et al. 2010a,
b ; Jani y col. 2018). Se ha informado de un deterioro similar en la calidad del agua en caso de
de actividades recreativas también, por ejemplo, bacterias resistentes a múltiples fármacos pertenecientes a
Enterobacter spp. , Serratia spp. , Klebsiella spp. , Citrobacter spp. y Pantoea spp.
se encontraron en muestras tomadas de un centro turístico en Malasia (Lihan et al. 2016 ). Similar
informes de presencia de bacterias marinas heterótrofas resistentes a los antibióticos,
observados desde nichos donde existen actividades humanas intensivas como la pesca, alta
población, deportes acuáticos, playas, etc.en Irán, Sudáfrica y Brasil (Mundo
Organización de la Salud 2003 ; De Oliveira y col. 2010 ; Leonard y col. 2015 ). Estas
Los eventos también requieren el movimiento masivo de animales para la alimentación y los rituales, muchos de los cuales
puede provenir de países donde las regulaciones no son estrictas y de buen manejo
no se cumplen las prácticas de fabricación. Estos sitios se convierten en importantes puntos de acceso para
movimiento de agentes infecciosos e intercambio de determi-
nants (Memish 2001 ).
Otra gran preocupación es la contaminación del agua subterránea con antibióticos y / o
patógenos resistentes a los antibióticos y se sabe que causan brotes en diferentes
partes del mundo (Lihan et al. 2016). Dado que esta es la principal fuente de agua potable
para la población urbana y generalmente se considera libre de patógenos dañinos. Pero
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vecindad de granjas de animales, sitios de almacenamiento de estiércol, lixiviados de vertederos, tratamiento de aguas residuales
plantas de cultivo, tanques sépticos, plantas de fabricación de medicamentos, etc.pueden aumentar los coliformes
contar y también conducir la microflora del agua subterránea hacia la resistencia a los antibióticos
(Kümmerer 2009 ). Muchos informes han demostrado la presencia de
bacterias resistentes a los antibióticos como Vibrio cholerae, Shigella sonnei, Salmonella
enterica, etc. de los grifos, pozos y corrientes de agua fresca (Akoachere et al. 2013; Mamá
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et al. 2017). La mayoría (75%) de las bacterias entéricas aisladas de un río en el sur
África ha sido reportado para mostrar múltiples resistencia a los medicamentos (Mulamattathil et al. 2014).
Este estudio también mostró una tendencia de menor resistencia en las regiones aguas arriba del
ciudad y mayor resistencia dentro y aguas abajo de la ciudad (Lin et al. 2004 ). En
Kenia, se encontró que el agua subterránea estaba contaminada con patógenos entéricos como
E. coli, P. aeruginosa, Salmonella , etc., que también mostraron alta resistencia a antibióticos.
tancia en el rango de 87 a 98% del total de aislamientos (Wahome 2013).
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(especialmente aves de corral) y suelo / estiércol animal, mientras que la protección personal es limitada
Se les proporcionan equipos. En estos sitios, la cría intensiva de animales es
hecho, las instalaciones de bioseguridad, higiene, seguridad alimentaria y biocontención rara vez se
monitoreado o disponible, y por lo tanto, la aparición de microbios resistentes a los antibióticos es
más acelerado. Un estudio informó que tanto los humanos como las aves de corral albergaban
mismas cepas de Salmonella typhimurium mostradas por tipificación de fagos (fagos basados en DT56
similitud) y también la resistencia contra mismos antibióticos (Kagambega et al. 2013).
Los seres humanos pueden verse afectados por microbios resistentes a los antibióticos a través de tres mecanismos principales.
anismos. Primero, los humanos pueden consumir accidentalmente alimentos o agua contaminados con
microbios resistentes a los antibióticos y no se transmite a otros seres humanos. Millones de
casos de infección por Salmonella spp. y Camplylobacter spp. se informan cada
año en los Estados Unidos y tales peligros para los humanos son susceptibles de modelos matemáticos-
ling para la evaluación de riesgos (McEwen 2012 ). Tales predicciones de evaluación de riesgos y su
fuerte correlación con la incidencia real de enfermedades, llevó a las autoridades reguladoras a
prohibir el uso de fluoroquinolonas en aves de corral en EE. UU.
En segundo lugar, el ser humano infectado puede transmitirlo a otros humanos, ya sea de forma directa o indirecta.
correctamente, y esto también constituye la ruptura de la "barrera de especies" para los patógenos.
Muchas de estas transmisiones de infecciones patógenas entre humanos se han
reportado en Europa y Países Bajos (Armand-Lefevre et al. 2005 ; Spoor et al.
2013). En el caso de enterococos resistentes a la vancomicina, se ha propuesto que el
El uso generalizado de avoparcina (un glicopéptido) condujo a la aparición de muchos
cepas en animales y su transferencia a través del mecanismo 1 debe haber proporcionado la
semilla inicial en humanos. Estos microbios normalmente colonizan el intestino humano y
Hay resistencia adquirida a múltiples antibióticos por exposiciones repetidas durante su
residencia en el intestino humano (Bonten et al. 2001). Sin embargo, hay más información
necesario a este respecto para identificar la fuente de bacterias resistentes y su transferencia
entre humanos. En tercer lugar, los genes de resistencia a los antibióticos se transfieren a patógenos humanos.
genes a través de la transferencia horizontal de genes y estos patógenos infectan a los humanos
(Lipsitch et al. 2002 ). Existen muchos ejemplos de transferencia de genes de resistencia a antibióticos.
de un comensal inofensivo de una especie animal a microbios patógenos para
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humanos (Dowson et al. 1993; Bowler y col. 1994). Un ejemplo reciente es el de van A y
van B, que brindan resistencia contra un antibiótico avanzado: la vancomicina. Tiene
Se ha encontrado que se transmite fácilmente entre Enterococcus spp., debido a la alta recombinación
Frecuencias de acción en este grupo de microbios y la capacidad de este gen de resistencia
para la transferencia génica horizontal (Willems et al. 2011). Esto sugiere claramente a otro
La aterradora dependencia de los genes de resistencia a los antibióticos que se originan en microbios inofensivos.
debido a las diferentes actividades agrícolas / ganaderas podrían estar siendo transferidas a la
patógenos humanos.
Muy correctamente, se razona que el nivel de resistencia en microbios asociado
con los seres humanos depende de la cantidad de antibiótico que se consuma. Este dos-
La edad depende además de la respuesta de la comunidad a los antibióticos,
condiciones geográficas, densidad de población, condiciones socioeconómicas, consumo de drogas
patrón de prescripción de los profesionales de la salud y dinámica del mercado de incentivos
entre los proveedores y prescriptores de antibióticos (Sahoo et al. 2012).
Indiscutiblemente, la resistencia a los antibióticos en los seres humanos es adversa, pero incluso la infección general
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Los bacteriófagos son virus que infectan a las bacterias y las matan. Ellos han estado
Recientemente se ha revisado y propuesto como una alternativa a la terapia con antibióticos y para
combatir infecciones contra patógenos resistentes a los antibióticos. Sin embargo, nos centraremos
aquí sobre su papel potencial en la resistencia a los antimicrobianos como reservorios y / o para trans-
fer de genes de resistencia a antibióticos entre diferentes microbios. Muchos estudios han
encontró que los bacteriófagos son portadores de muchos genes de resistencia a los antibióticos y podrían
estar involucrado en la transferencia horizontal de genes, similar al papel que juegan los plásmidos y
integrones (Brabban et al. 2005). Estudios metagenómicos y genómicos completos sobre micro-
bioma de pacientes con fibrosis quística ha mostrado alteraciones drásticas en microbios
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Hay muchas formas en que los antibióticos pueden terminar en el medio ambiente. Éstas incluyen
(y no se limitan a) aguas residuales humanas, residuos veterinarios y ganaderos y
escorrentía superficial de cualquier otra fuente (Gillings 2013) (Figura 1.2). Esto es en gran parte
debido a que una gran parte de los antibióticos administrados no es completamente metabólico
lized y excretado de humanos / animales. Esto se rige por varios factores,
incluyendo el tipo de antibiótico, dosis, edad y especie del animal que se está administrando
istered. El material de desecho de estas fuentes contiene inevitablemente antibióticos y
genes de resistencia a antibióticos (Martinez 2009). La fuga de antibióticos puede ocurrir.
durante el riego, polvo contaminado con antibióticos, liberación del producto antibiótico
unidades farmacéuticas, e incluso durante el transporte y almacenamiento de los animales
estiércol derivado. Esta condición puede surgir debido a condiciones de manipulación inadecuadas.
para los residuos antes mencionados al aire libre, donde con frecuencia se mezcla con el agua de lluvia
ter. Además de estos, derrames accidentales de unidades de almacenamiento de antibióticos agrícolas
y eliminación directa de antibióticos vencidos de hogares / pequeños vendedores también
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culminar en el medio ambiente. Esto se debe especialmente a que no hay pautas establecidas.
y sistemas para recolectar antibióticos vencidos y la mayoría de los trabajadores que manipulan
los antibióticos en la agricultura no están debidamente capacitados y desconocen el problema.
Al ser altamente solubles en agua, estos antibióticos pueden propagarse rápidamente en el medio ambiente,
a las aguas superficiales y subterráneas y al suelo (Du y Liu 2012).
Los antibióticos en el medio ambiente tienen destinos diferentes dependiendo de su
naturaleza química y degradabilidad. Sufren sorción, biodegradación, foto-
Procesos de degradación y oxidación durante su eliminación del medio ambiente.
(Li y col. 2014). Algunos métodos artificiales como sedimentación, adsorción, coagulación
También se pueden aplicar procesos avanzados de oxidación, filtración y
degradación de los antibióticos, pero no se utilizan con tanta frecuencia (Homem y Santos 2011).
Dependiendo de su tipo, los diferentes antibióticos responden de manera variable a la degradación por
métodos de digestión aeróbica / anaeróbica y compostaje en aguas residuales, lodos usados
y estiércol. Por supuesto, estos procesos dependen en gran medida de la temperatura,
la humedad y condiciones de compostaje y el animal fuente (Bao et al. 2009).
Independientemente de su origen o destino final, su presencia en el medio ambiente es frecuente.
asociado con un alto número de bacterias resistentes a los antibióticos en ese nicho.
Aproximadamente el 33% de los aislamientos bacterianos Gram negativos totales resultaron resistentes a
antibióticos de uso común como tetraciclina, cloranfenicol, ampicilina, nali-
ácido dixic y sulfametoxazol de las granjas de ganado en España (Carballo et al. 2013).
Hay datos limitados disponibles sobre el uso de antibióticos y resistencias antimicrobianas.
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tancia en los sistemas agrícolas. Esto se debe en gran parte a que ningún sistema de este tipo ha estado en
lugar y dada su conexión con los animales, el registro de datos y seguimiento de
regulaciones estrictas, se ignoran en gran medida. Además, no hay control de antimicro-
resistencia biológica y su propagación desde plantas de tratamiento de estiércol, aguas residuales y aguas residuales,
todos los cuales se conocen como reservorios de resistencia a los antimicrobianos (Michael et al. 2013).
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gestión (solución más práctica) es cobrar una tarifa al usuario por los antibióticos destinados a
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et al. 2013 ). Estos fragmentos de datos pueden utilizarse en estadísticas avanzadas.
software y lenguajes de programación de computadoras, para proporcionar información significativa.
La información significativa incluye (1) la abundancia relativa y el movimiento
de genes de resistencia a los antibióticos, (2) probabilidad de propagación de la resistencia a los antibióticos
genes entre nichos, (3) predicciones para el desarrollo de resistencia debido a mutaciones
en genes conocidos de resistencia a antibióticos, (4) prevalencia de elementos genéticos móviles
mentos como integrones, plásmidos, etc. y (5) la interrelación entre el relativo
proporción de MGE y los genes de resistencia a los antibióticos en la conducción de los antimicrobianos
resistencia. Todos estos estudios pueden complementarse bien con metagenoma-
ics en los que se pueden identificar nuevos genes de resistencia a antibióticos de diferentes nichos.
Sin embargo, estas técnicas son limitadas debido a los altos costos y la necesidad de datos complejos.
análisis. Los avances futuros en el análisis de secuencias de próxima generación y más inter-
est en muestras ambientales podría hacer que estas tecnologías sean aún más baratas para el futuro
uso (Munk et al. 2017 ; Hendriksen y col. 2019).
Página 37
22 KS Singh y col.
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 26/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
plantean riesgos frecuentes para los seres humanos y exige una cooperación interdisciplinaria. Estas
El problema llevó a la OMS (programa sobre enfermedades tropicales desatendidas) a adoptar One Health
Modelar y fomentar colaboraciones con Naciones Unidas para la Agricultura y la Alimentación.
Organización (ONU-FAO), para publicar recomendaciones para estrategias integradoras y
políticas para hacer frente a las enfermedades endémicas de África como la equinococosis, la rabia, la
tuberculosis y brucelosis (Aidara-Kane et al. 2018). Médico-veterinario similar
Se han iniciado esfuerzos de colaboración entre la ONU-FAO y la OMS para abordar
con amenaza de variantes de influenza aviar (virus de influenza A) para humanos (http: // www.
offlu.net/ ). Los efectos económicos de regular el uso de antimicrobianos preventivos
en la agricultura debido a una amenaza percibida para los seres humanos pueden evaluarse erróneamente.
Página 38
1 Paradigma de resistencia a los antimicrobianos y enfoque de una sola salud 23
Por lo tanto, se justifica una visión holística que solo es posible trabajando dentro de 'One
Marco de la salud. La falta de información confiable y coordinación entre
estas partes interesadas aumentan aún más la brecha de conocimientos (Fisman y Laupland
2010). Sería útil para disminuir la confusión entre la relevancia y el límite
de estándares para la resistencia a antibióticos en microbios aislados del medio ambiente y su
comparabilidad con cepas clínicas humanas (McLain et al. 2016). One Health se basa
en el enfoque de políticas de gestión de riesgos con base científica, funciona a través de
disciplinas y sectores administrativos y se centra en el fortalecimiento de
infraestructura y mano de obra en países de bajos recursos. Eficacia del enfoque de Una sola salud
cierra de manera efectiva estas brechas y proporciona una superposición confiable entre las partes interesadas y
asegura el intercambio de información creíble (Gebreyes et al. 2014).
1.5 Conclusión
Página 39
24 KS Singh y col.
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Capitulo 2
Programas de vigilancia global
sobre la resistencia a los antimicrobianos
Resumen La resistencia a los antimicrobianos es una gran preocupación para la salud humana y animal
y el medio ambiente. Todos estos tres sectores están interconectados e influenciados por
la participación de una red de factores complejos que interactúan. La falta de datos sobre
Los mecanismos que causan la aparición y propagación de la resistencia a los antimicrobianos obstaculizan
esfuerzos globales para gestionar eficazmente los riesgos. Vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos
tance proporciona detalles del escenario actual de resistencia a los antimicrobianos junto con
otra información relevante para monitorear la idoneidad de las guías de terapia, público
intervenciones sanitarias y políticas para el control de la infección.
Varios programas de vigilancia están funcionando en la dirección de reunir el
datos mundiales sobre la resistencia a los antimicrobianos. La vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos
sistema de lanza (GLASS) fue lanzado por la Organización Mundial de la Salud (OMS) en
2015. El programa de vigilancia de la Unión Europea incluye actualmente diferentes
aspectos como; especies animales con mayor producción de carne y los alimentos derivados
a partir de ellos, explorando la resistencia a los antimicrobianos de las bacterias zoonóticas e indicadoras.
El campo de los sistemas de monitoreo de salud pública está comenzando a explotar el poder de
secuenciación del genoma y metagenoma mejorando nuestra capacidad para predecir con precisión
y cribado para una vigilancia eficaz y precisa de los genes de resistencia a los antibióticos
dentro de entornos ambientales, agrícolas y clínicos. Asimismo, Nacional
El Sistema de Monitoreo de la Resistencia a los Antimicrobianos (NARMS) se estableció alrededor de
hace dos décadas para ayudar a evaluar las consecuencias para la salud humana derivadas de la
uso de fármacos antimicrobianos en la producción de alimentos para animales en los Estados Unidos. Uno
El enfoque sanitario de la vigilancia puede aumentar el rendimiento de los antimicrobianos.
vigilancia de la resistencia y, en última instancia, mejorar los resultados de salud. Este capítulo presenta
presenta una descripción general de los programas de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos adoptados a nivel mundial
centrado en los seres humanos, los animales y el medio ambiente.
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 33
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
2.1 Introducción
La resistencia a los antimicrobianos es la capacidad adquirida de un microbio para resistir los efectos de
antimicrobianos que alguna vez pudieron tratar con éxito el microbio (Ferri et al.2017).
La resistencia se adquiere horizontalmente por uno de los siguientes mecanismos: (i) fármaco
bombas de eflujo, (ii) modificación enzimática del sitio de unión, (iii) modificación o inactividad
activación de un fármaco enzimático, adquisición de un nuevo objetivo resistente al fármaco, (v) objetivo
protección por el desplazamiento de drogas (Barlam et al. 2016). Una vez que el microbio se vuelve
resistente, más difícil es tratar la infección causada por ella. Microbios resistentes a
más de una clase de antimicrobianos se denominan resistentes a múltiples fármacos (Arzanlou et al.
2017). Muy resistentes a los medicamentos son aquellos que son resistentes a más de dos
clases de antimicrobianos. Infecciones asociadas a la atención médica y resistencia a los antimicrobianos
son amenazas crecientes para la salud pública y los sistemas mundiales de atención de la salud.
(MacVane 2017). La resistencia a los antimicrobianos en los seres humanos está bien relacionada con los
resistencia microbiana en otras poblaciones, particularmente animales de granja, y en las grandes
medio ambiente (Arzanlou et al. 2017 ). La resistencia a los antimicrobianos se debe al uso excesivo
de antibióticos, que fue predicho por Alexander Fleming; quien dijo 'el tiempo puede
vienen cuando cualquiera puede comprar penicilina en las tiendas ”. La falta de información
prohíbe sustancialmente la coordinación de enfoques y la evaluación de la
eficacia de las intervenciones. La marea persistente de amenazas que muestra la asistencia sanitaria
Las infecciones asociadas y la resistencia a los antimicrobianos no se pueden frenar sin
mejora de los sistemas de vigilancia mundial. Deben iniciarse programas específicos
y apoyado financieramente en todas las regiones sobre la base de las estructuras de red existentes.
Una plataforma sólida de seguimiento y evaluación ahora contribuye a la
intervenciones (Tacconelli et al. 2018 ). Un sistema incorporado para la vigilancia
aún debe establecerse la resistencia a los antimicrobianos. Este capítulo se centra en
sistemas de vigilancia global para definir el estado, los avances recientes, las principales limitaciones
y necesidades insatisfechas de programas mejorados de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos
en todo el mundo (Simjee et al. 2018).
Página 50
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 35
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 35/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Los países de ingresos bajos y medianos investigaron la carga mundial de antimicrobianos
resistencia y enfermedades infecciosas. Para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos, 72
Los programas de redes supranacionales se han formado desde 2000 en bacterias, tubérculos
bacilos, hongos, virus de inmunodeficiencia humana y malaria que han incluido baja
y países de ingresos medios. Las redes se agrupan como OMS / gubernamentales
(n = 26), iniciados en la industria farmacéutica (n = 22) o académicos (n = 24) (Ashley et al.2018).
Los organismos de financiación difieren, con 30 redes que reciben financiación pública o de la OMS, 13
fundación o fideicomiso, 25 corporativos y 4 cuentan con el respaldo de más de una agencia.
Los principales programas mundiales para la vigilancia de la resistencia en el bacilo tuberculoso,
El VIH y la malaria recopilan datos en países de ingresos bajos y medianos a través de
tienda de programas de vigilancia activa o enfoques combinados. El principal desafío
encontrado por estas redes ha obtenido una alta cobertura en los niveles bajo y medio
países de ingresos y cumpliendo con la frecuencia recomendada de presentación de informes (Amos
et al. 2009). Para obtener datos de alta calidad, vigilancia representativa en baja y media
los países de ingresos es exigente. La vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos requiere un conjunto
nivel de capacitación e infraestructura de laboratorio que generalmente no está disponible en
y países de ingresos medios (Talisuna et al. 2012 ). La naciente resistencia global
El sistema de vigilancia tiene como objetivo desarrollar la vigilancia pasiva en todos los estados miembros.
La experiencia previa sugiere que la armonización de enfoques activos puede ser necesaria en
muchos países de ingresos bajos y medianos; si es representativo, significativo, clínicamente
se deben adquirir datos relevantes (OMS 2015 ). Mantener un registro actualizado de
las redes apoyarían un enfoque más coordinado de la vigilancia.
Página 51
36 S. Kumar y col.
1. Para rastrear la resistencia a los antimicrobianos en las bacterias entéricas de los seres humanos,
mals y carnes al por menor.
2. Comprender la propagación, aparición y persistencia de la resistencia a los antimicrobianos.
realizando investigaciones.
3. Publicar información adecuada sobre la resistencia a los antimicrobianos en patógenos y compuestos
organismos mensuales y proporcionar lo mismo a las partes interesadas de los Estados Unidos y a
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 36/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
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2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 37
Fomentar intervenciones para reducir la escalada de resistencia entre los alimentos transmitidos
patógenos
4. Para ayudar a la FDA a emitir juicios relacionados con la aprobación de medidas seguras y eficaces.
antimicrobianos para animales proporcionando datos.
Página 53
38 S. Kumar y col.
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Antibióticos (ONERBA)
Finlandia Grupo de estudio finlandés de resistencia a los antimicrobianos (FIRE)
Alemania Sistema de vigilancia hospitalaria de infecciones nosocomiales (KISS)
Alemania Seguimiento de la resistencia a los antibióticos en Niedersachsen (ARMIN)
Alemania Vigilancia del uso de antibióticos y resistencia bacteriana en unidades de cuidados intensivos
(SARI)
Alemania Vigilancia de la resistencia a los antibióticos (ARS)
Grecia Sistema griego de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos (GSSAR)
Irlanda Centro de Vigilancia de Protección de la Salud (HPSC)
Hungría Sistema Nacional de Vigilancia Nosocomial (NNSR)
Italia Sistema de vigilancia regional para unidades de cuidados intensivos (SITIER)
Italia Vigilancia de la resistencia a los antibióticos - Instituto Nacional de Salud (AR-ISS)
Italia Vigilancia prospectiva de infecciones nosocomiales en unidades de cuidados intensivos
(SPIN-UTI)
Italia Sistemas nacionales de vigilancia de infecciones posquirúrgicas (SNICh)
Lituania Vigilancia de la resistencia a los antibióticos - Instituto de Vilnius
Noruega Sistema de vigilancia noruego: módulo de infecciones asociadas a la atención sanitaria para
infecciones del sitio quirúrgico; módulo de resistencia a fármacos antimicrobianos; comunicable
enfermedades (FHI)
Sistema de Información y Vigilancia de Enfermedades Infecciosas de los Países Bajos para antibióticos
Resistencia (ISIS-AR)
Portugal Programa de vigilancia de la resistencia a los antibióticos en Portugal (ARSIP)
Rumania Sistema de vigilancia centinela de infecciones nosocomiales y antimicrobianos
resistencia
España EstudioNacional de Vigilancia de Infección Nososcomial en Servicios de
MedicinaIntensiva (ENVIN-UCI)
Eslovaquia Sistema Nacional Eslovaco de Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos (SNARS)
Suecia Vigilancia sueca de resistencia a los antimicrobianos (Svebar)
Suecia Programa anual de monitoreo de resistencia y control de calidad (ResNet)
Suiza Sistema de vigilancia CA-MRSA (CA-MRSA)
Suiza Centro Suizo de Resistencia a los Antibióticos (ANRESIS)
(continuado)
Página 54
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 39
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 38/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
indicaciones de muestreo de sangre). En lugar de la aparición de resistencia a los antimicrobianos como
amenaza sustancial, Europa también ha implementado muchos sistemas nacionales de vigilancia.
Debido a la presión de la creciente resistencia a los antimicrobianos, varias iniciativas
han entrado en acción en los últimos años para abordar las limitaciones de los
programas de vigilancia. La vigilancia europea de antimicrobianos veterinarios
El proyecto de consumo (ESVAC) de la Agencia Europea de Medicamentos ha recogido
e informó datos sobre las ventas de antimicrobianos utilizados en veterinaria desde 2009 y ha
Página 55
40 S. Kumar y col.
La carga de enfermedades infecciosas y la resistencia a los antimicrobianos son motivo de gran preocupación para
fraternidad sanitaria mundial y nacional. Esta resistencia es más significativa en
relación con los patógenos Gram negativos en comparación con los organismos Gram positivos. No
un programa de vigilancia sistémica o nacional está presente en la India, lo que
informes multicéntricos de unidades individuales sobre la resistencia a los antimicrobianos. En consideración
al respecto, el Consejo Indio de Investigaciones Médicas, Nueva Delhi, desarrolló un
red de vigilancia de la resistencia microbiana en 2014 en colaboración con la atención terciaria
hospitales en toda la India (Veeraraghavan et al. 2018; Wattal y Goel 2014 ). Esto
El sistema de captura de datos sistémicos da como resultado la generación de datos confiables con mayor
precisión. La red fue desarrollada para estudiar los mecanismos moleculares y
anti-biograma acumulativo implicado en el desarrollo de resistencia a los antimicrobianos para
Patógenos de máxima prioridad del Sistema Mundial de Vigilancia de la Resistencia a los Antimicrobianos
(Organismos Gram negativos y Gram positivos). Los patógenos prioritarios incluyen
Streptococcus pneumoniae, Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella
Página 56
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 41
One Health es el esfuerzo combinado de varios profesionales de las ciencias de la salud para conquistar
salud óptima para las personas, las plantas, la vida silvestre, los animales domésticos y el medio ambiente ( Fig.
2.1) . Los elementos impulsores de la resistencia a los antimicrobianos incluyen el uso de antimicrobianos y
mal uso en animales, seres humanos y el medio ambiente y la amplia propagación de insectos resistentes
y factores que confieren resistencia dentro y entre dichos segmentos y alrededor de la
mundo (McEwen y Collignon 2018 ). La investigación y la vigilancia son fundamentales
porque detectan la amenaza de la resistencia a los antimicrobianos y cómo lidiar con ellos
(OMS 2014 ,2015 ). Hay varias lagunas en nuestra comprensión de los múltiples
biología que caracteriza la resistencia asociada a las dimensiones de Una Salud,
pero en los últimos años se han utilizado muchos programas de innovación que mantienen
Página 57
42 S. Kumar y col.
Fig.2.1 Transmisión de
resistencia entre finca
animales, el más ancho
medio ambiente y seres humanos.
Surgen bacterias resistentes
en humanos, animales o el
el medio ambiente puede extenderse Humanos
De uno a otro
Uno
Salud
Granja Reinar
Animales ment
intervenciones basadas en la evidencia para abordar el aumento de la resistencia a los antimicrobianos (Aarestrup
et al. 2008; O'Neill 2016 ; Perry y Wright 2014).
Vigilancia de la resistencia y consumo de antimicrobianos tanto en humanos como en
áreas no humanas requieren investigación para estimar los patrones, la extensión y la magnitud
de la resistencia a los antimicrobianos a nivel regional, nacional e internacional
(Collignon y Voss 2015; OMS 2017). Estos programas de vigilancia deben
capaz de identificar tendencias emergentes en la resistencia a los antimicrobianos de importancia clínica
a los animales y los seres humanos (ECDC 2017 ). Dicha vigilancia debe notificar
esfuerzos para reducir la resistencia a los antimicrobianos, así como el uso de políticas antimicrobianas
y programas de administración de antimicrobianos (Aarestrup et al. 2008; O'Neill 2016 ;
OMS 2015 ). También se requiere una vigilancia frecuente para estimar el éxito de
Ventilaciones y otros parámetros que se toman para frenar la resistencia a los antimicrobianos.
(Torren-Edo et al. 2015). La vigilancia de la resistencia de los programas de Una sola salud debe
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Consistir en el muestreo de bacterias objetivo de especímenes recolectados de diferentes seres humanos,
entornos animales y ambientales, incluidos entornos comunitarios, hospitales, granjas,
clínicas veterinarias, alimentos y el medio ambiente (Torren-Edo et al. 2015; OMS 2017).
La vigilancia del uso de antimicrobianos también debe realizarse en humanos, agricultura
entornos turales y veterinarios y deben poner a disposición las estimaciones de antibióticos
ingesta en humanos y animales en el punto nacional junto con denominadores adecuados
para facilitar las comparaciones nacionales (OMS 2017 ). Para suministrar información que sea
valioso para evaluar y orientar las prácticas de prescripción y el uso de antimicrobianos
comportamientos, el seguimiento del uso de antimicrobianos también debe realizarse a nivel de
prescripción (por ejemplo, hospitales, clínica veterinaria, comunidad y granja) (DANMAP
2015; Speksnijder y col. 2015 ; OMS 2017 ). Los datos de vigilancia deben
preado y analizado de manera organizada en todos los sectores, junto con los informes
disponible bien a tiempo. La OMS ha publicado orientaciones sobre integradas y armonizadas
vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos y uso de antimicrobianos para ayudar al desarrollo
ing y países desarrollados en la ejecución de sus programas de vigilancia individuales
mejorar las actividades de vigilancia en todo el mundo, que son cruciales para mejorar
Página 58
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 43
2.8.1 Ganadería
La resistencia a los antimicrobianos es una amenaza mundial para la salud humana y animal. El carnero-
El uso de antibióticos en la producción animal es de particular preocupación, ya que esto puede conducir
a la resistencia escalada de patógenos animales y humanos (Schrijver et al.2018 ; Van
De Sande-Bruinsma 2008). La Autoridad Europea de Medicamentos prepara anualmente
informes sobre las ventas de productos veterinarios antimicrobianos para 29 UE / Europa
Países del Espacio Económico. Un informe de 2016 de 25 países observó un aumento
en ventas superiores al 5% en seis países. La asociación entre el uso de anti-
biótico en animales y el desarrollo de resistencia en bacterias comensales ha sido
descrito en E. coli (Chantziaras et al.2014 ). La transmisión de bacterias resistentes.
desde animales productores de alimentos hasta humanos es aún más preocupante. Otro estudio
mostró muchas semejanzas genéticas entre beta lactamasa de espectro extendido
(BLEE) aislados de E. coli de humanos y aves de corral (Leverstein-van et al.
2011). Además, el hecho de que la resistencia pueda transmitirse horizontalmente entre dis-
bacterias similares mediante el intercambio de genes de resistencia a los antimicrobianos en forma de plas-
mids crea una amenaza aún mayor para la salud pública (Carattoli 2013).
Debido al alto uso de antibióticos en animales y la cría intensiva, la transferencia de antimicrobianos
La resistencia a los microorganismos del ganado hacia los seres humanos es hoy un riesgo importante. Por lo tanto, global
Las redes de investigación y vigilancia de laboratorio son cruciales para la detección temprana de
patrones de resistencia creciente para la detección continua de resistencia a los antimicrobianos en
bacterias que representan riesgos para los seres humanos y los animales en todo el mundo. Varios países
han establecido sistemas nacionales de seguimiento, la mayoría de ellos están dirigidos a zoonóticos y
bacterias indicadoras (Directiva 2003/99 / CE; Decisión de la UE 2013/652 / UE). Un privado
organización financiada por la industria, el Centre Europeen d'Etudes pour la Sante Animale
(CEESA), implementa programas de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en el
animales productores de alimentos de la Unión Europea (De Jong et al. 2013 , 2014 ). Sin embargo,
Los antibióticos y bacterias de interés veterinario y humano varían, y dependiendo de la
propósito, los programas de vigilancia veterinaria no pueden incluir esencialmente bacterias de
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Página 59
44 S. Kumar y col.
interés humano, aunque puede ser información valiosa. En la actualidad, parece que
el concepto de Una sola salud, que involucra particularmente la detección de resistencia a los antimicrobianos en
humanos y animales, no está bien revelado en la vigilancia humana o veterinaria actual-
sistemas de lanza (Tabla 2.2).
Animales
y
derivado Susceptibilidad
Origen Bacterias carne Origen de las muestras prueba Leer
UE (UE • Campylobacter Aves de corral Matadero, Difusión Epidemiológico
miembro jejuni y (pollos de engorde,
Granja, Minorista pruebas, dilución valores de corte
estados) Campylobacter coli tendido pruebas
• Salmonella spp. gallinas
• Escherichia coli engordante
• Enterococcus pavos),
faecium y E. Bóvidos,
faecalis Cerdos
• BLEE o AmpC
o carbapenemasa
produciendo E. coli
y Salmonella
spp.
EASSA • E. coli Cerdos Muestras intestinales Micro- CLSI y
(industria) • Salmonella spp . Parrilla recogido en dilución EUCAST /
• Enterococcus pollos sacrificio EFSA Clínica
• Campylobacter Carne de vaca puntos de ruptura
ganado,
Sacrificio
VetPath • E. coli Cerdos Nasofaríngeo / Micro- CLSI
(industria) • Staphylococcus Ganado hisopos nasales o dilución puntos de ruptura
aureus Muestras de pulmón;
• Histophilus somni muestras de mastitis
• Mannheimia
hemolítica
• Pasteurella
multocida
• P. multocida
• Bordetella
bronquiseptica
• Haemophilus
parasuis
• Actinobacillus
pleuropneumoniae
• Estreptococo
uberis
• Estreptococo
suis
Página 60
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 45
Página 61
46 S. Kumar y col.
esting
T protocolo
CLSI CLSI CLSI CLSI CLSI CLSI SRGA JSC hasta 2000,
Sistema
CLSI
automatizado
después de 2000
basado en MIC
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Enlace
www http: // wwwhttp: // vhttp:Especializaciones
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http://195.45.99.82:800/pdf/itav
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// www
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de vigilancia
BRAZO.)
Sistema de vigilancia para
ANMAP)
antimicrobiano
antimicrobiano eterinario eterinario
antimicrobiano eterinario
Programas de vigilancia y seguimiento BRAZO)
V
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Medicina eterinaria (GERM-V
Organismo
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Nacional/ de
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danés
Monitoreo
Monitoreo
integrado
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V
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los antimicrobianos
(MARAN)
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
capaz 2.3País Estados Dinamarca
Unidos alemán Países Bajos Italia Canadá Suecia Japón Norw
T
Página 62
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 47
esting
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CLSI CLSI CLSI CLSI CLSI CLSI CLSI
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vigilancia
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Programa de vigilancia
cadena de agua
antimicrobiano eterinario
; Sharma y col.
2016
aria)
ounou y col.
Página 63
48 S. Kumar y col.
El sistema de tecnología aún no está claro. Barreras más importantes para mejorar la
calidad son los costos asociados con el software, el hardware, el empleo de personal y
mantenimiento de sistemas. Una infraestructura insuficiente también puede resultar en limitaciones / lentitud
acceso a Internet (Natale et al. 2017 ; Stelling 2016; Stelling y O'Brien 1997 ).
La vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en Suecia fue reforzada en 2012 por el
inicio de Svebar, un sistema nacional automatizado para la recolección y adquisición de cultivos
sición de los resultados de las pruebas de sensibilidad a los antibióticos del laboratorio clínico sueco
Ries (Söderblom et al. 2014; Swedres y Svarm 2013 ). Salud pública sueca
La agencia es propietaria del sistema, produce alertas tempranas inmediatas de críticamente importantes
resistencia a los antimicrobianos (resistencia a múltiples fármacos y resistencia extensa a los fármacos) y
posee una base de datos de microorganismos ya caracterizados con todos los antimicrobianos
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
perfiles de susceptibilidad de laboratorios colaboradores. Los informes de alerta rápida se
producido de forma matemática y devuelto instantáneamente al laboratorio. Dichos informes se basan en
señal de advertencia rápida (disparadores). Los ejemplos clásicos de "desencadenantes" son los carbapenémicos
resistente K. pneumoniae y resistentes colistina E. coli en diferentes muestras clínicas. En
Por el contrario, la base de datos propiedad de los laboratorios colaboradores se utiliza para investigar
Puerta de las tendencias geográficas y longitudinales en la resistencia a los antimicrobianos. Creación de Svebar
ates informes nacionales y locales estandarizados, generando tablas de datos de
resistencia para cada antibiótico y especie. Para obtener datos de buena calidad en un
sistema de tecnología de la información, se necesita la validación de datos que sincronice la rutina
nomenclatura y cooperación de todos los laboratorios para corregir los errores e inconsistencias
tency de los datos. Estándares comunes de susceptibilidad a los antimicrobianos como; el Europeo
Comité de pruebas de susceptibilidad a los antimicrobianos, que autentican la referencia
métodos genotípicos y fenotípicos para la susceptibilidad antimicrobiana que también son
importante al comparar datos de varias fuentes. Mayor validación del sueco
los datos están en progreso a través de la vigilancia antimicrobiana mundial y la
Red de resistencia microbiana (ECDC 2013a; OMS 2015 ). Aunque conectando
con Svebar es voluntario, el sistema ha registrado la mayor parte de la microbiología clínica
laboratorios de gía de diferentes países. Expertos de la Agencia de Salud Pública de Suecia
describió que las continuas conversaciones entre la Agencia de Salud Pública de Suecia y el
laboratorios asociados explica la enorme participación. Por ejemplo, una conferencia anual
se lleva a cabo en la Agencia de Salud Pública de Suecia, fomento de los representantes de laboratorio
tativas se lleva a cabo para hablar sobre todas las facetas del sistema, desde las alertas tempranas, la calidad
de los datos subyacentes a los informes producidos. Sensibilización profesional y pública
Los programas sobre la resistencia a los antimicrobianos también han fomentado el compromiso político.
y lo hizo conveniente para el establecimiento del sistema. En el futuro, Svebar tiene como objetivo
agregar los datos de la secuenciación del genoma completo en la vigilancia de antimicrobianos
resistencia; y asimilar la ingesta de antibióticos y los datos de vigilancia veterinaria para
facilitar la modificación adicional de la política.
La Vigilancia de Infecciones Nosocomiales de Japón (JANIS) es un sistema automatizado y centralizado.
izado programa de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos para compilar, analizar y
publicar los datos a intervalos regulares. Agrupación de informes resumidos confidenciales de
se lleva a cabo cada hospital participante; los datos resultantes se comparan de todas las colaboraciones
calificación de hospitales. Muchos países también son contactados por Japón en la región (India
Página 64
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 49
e Indonesia) al compartir el software JANIS para mantener los productos antimicrobianos nacionales.
vigilancia de la resistencia (JANIS 2000 ; Morikane2012 ; Tanihara y Suzuki 2016).
Los avances recientes en la secuenciación del ADN han revolucionado la vigilancia microbiana.
lanza y microbiología de diagnóstico ( Fig. 2.2) . Un requisito previo para esto es la disponibilidad de
herramientas bioinformáticas y fácil acceso a bases de datos en línea (Hendriksen et al.2019a).
La secuenciación del genoma completo ha traído cambios rápidos en la ciencia de las enfermedades infecciosas.
aliviar y otras especialidades (Didelot et al. 2012; Fricke y Rasko 2014). Ganancia rápida
de aceptación de estas tecnologías nuevas y avanzadas está transformando el labora-
procedimientos históricos que dan como resultado una inmensa cantidad de datos sobre el genoma bacteriano. Alrededor
1.90.000 genomas de Salmonella ya son de dominio público y varios
incluido de forma rutinaria. La secuencia de ADN genómico representa la más alta posible
nivel de detalle estructural en la caracterización de rasgos de un organismo o población. Puede
también proporcionan información más confiable sobre identificación microbiana, filogenética
Base de datos de
Genes AMR
Bio-
informática
Herramientas
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Leer
Fig. 2.2 En silico proceso de detección de la resistencia antimicrobiana determinante (AMR) utilizando una
algoritmo para consultar el ADN de entrada. Se prepara una base de datos completa de genes AMR utilizando
herramientas bioinformáticas. Los datos brutos se recopilan de la secuencia de nucleótidos de cada gen que codifica un
proteína específica responsable de la resistencia a los antimicrobianos. Las visualizaciones gráficas de genotipos son
investigado con cambios en los patrones de resistencia a lo largo del tiempo
Página 65
50 S. Kumar y col.
relaciones, y actúan como un catálogo de rasgos relevantes para la investigación basada en la epidemiología.
gations. Esto ha creado un gran impacto en las investigaciones de brotes junto con el diagnóstico.
sis y tratamiento de enfermedades infecciosas. También ha impactado la práctica de
microbiología y epidemiología (Allard et al.2019). Teóricamente, cualquier biológico
La característica se puede deducir de las secuencias de ADN que pueden incluir la capacidad de detectar
Resistencia a los antimicrobianos como aplicación clínica. Puede proporcionar más información
con respecto a la evolución y propagación de bacterias resistentes en el hospital o entre las comunidades
nity. La resistencia a los antimicrobianos es un tema de preocupación mundial que provoca la mortalidad en
enormes números (O'Neill 2016 ). La resistencia a los antimicrobianos se ha considerado un
parámetro de medición para estudiar los efectos inhibidores del crecimiento de un quimioterápico
agente en población bacteriana cultivada. A pesar de algunas mejoras adicionales,
Los laboratorios clínicos consideran los métodos de difusión y dilución como herramienta principal para
orientar la terapia clínica y monitorear la resistencia a los antimicrobianos a lo largo del tiempo. Ensamblado
Los datos han demostrado una predicción precisa de la resistencia a los antimicrobianos utilizando
secuencia. El enfoque basado en la secuencia de la detección de la resistencia a los antimicrobianos requiere
herramientas bioinformáticas robustas para la visualización y el análisis de "resistoma" microbiano
que comprende genes de resistencia a los antimicrobianos y sus precursores (Cartwright
et al. 2013).
La secuenciación del genoma completo es un método completo para analizar el genoma completo
de un organismo. La secuenciación del genoma completo es una herramienta poderosa para la investigación genómica,
lo que lo hace útil para secuenciar cualquier especie, como las de importancia agrícola
ganado, plantas o microbios relacionados con enfermedades. La secuenciación del genoma completo enriquece
nuestro conocimiento de la propagación y evolución de la resistencia a los antimicrobianos y contribuye
información práctica para el control de infecciones local, nacional y mundial y
Guia. Estados Unidos está ampliando sus dimensiones para monitorear antimicro-
resistencia biológica a través de la secuenciación del genoma completo. Se compone de coordinación
entre los laboratorios estatales de salud pública y las universidades. Centro para el Control de Enfermedades
y Prevención (CDC) se coordinan con la red de laboratorios de resistencia a los antibióticos para
Detección rápida de amenazas emergentes de resistencia. Esta red integral per-
forma la secuenciación del genoma completo además de otras actividades para numerosos patógenos
gens, incluidos todos los aislados de Mycobacterium tuberculosis . Genoma completo
La secuenciación también se utiliza habitualmente para la caracterización de Neisseria gonorrhoeae y
otros patógenos implicados en los brotes. La resistencia nacional a los antimicrobianos
El Sistema de Monitoreo (NARMS) se enfoca en la transmisión bacteriana a través de los alimentos.
(Karp et al. 2017 ). NARMS comenzó con la secuenciación sistemática del genoma completo de
Salmonella en 2013 y posteriormente incluyó Campylobacter en 2014. Tendencias de resistencia
puede ser examinado a nivel genético por los usuarios utilizando filtros de consulta proporcionados por
herramientas. Visualizaciones gráficas de genotipos con cambios en los patrones de resistencia durante
El tiempo lo proporcionan estas herramientas.
Página 66
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 51
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Network (Vet-LIRN) están
datos de secuenciación iniciandocompleto
del genoma la recopilación de información
de patógenos sobrefuentes.
de diferentes resistencia y
Los Estados Unidos
La Agencia de Protección Ambiental realiza encuestas de agua repetidamente para su detección
de genes de resistencia. Las etapas iniciales comprenden la expansión de la salud pública nacional
programas de vigilancia basados en la información de secuenciación del ADN y la concesión de nuevas licencias
asociaciones de análisis resistoma de los datos (Hendriksen et al. 2019a ).
2.10.2 Metagenómica
Los sistemas de vigilancia actuales solo atacan a unos pocos patógenos, principalmente
basado en informes pasivos de resultados fenotípicos como en el DANMAP (monitoreo danés
sistema toring), lo que resulta en una gama estrecha de patógenos, que no cubre todos los
genes resistentes relevantes. La mayoría de los genes de resistencia a los antimicrobianos podrían ser
presente en la flora de bacterias comensales de animales, seres humanos sanos o el medio ambiente
ambiente. Las técnicas de metagenómica benefician la capacidad de cuantificar miles de
genes que confieren resistencia en una sola muestra utilizando NGS de lectura corta (Siguiente
Generation Sequencing) sin selección previa de genes diana. Metagenómica
puede secuenciar todo el ADN de la muestra, incluido el ADN del huésped y los alimentos, lo que
a baja sensibilidad. procedimientos de qPCR (reacción cuantitativa en cadena de la polimerasa) y
Ya se han desarrollado metodologías de PCR de captura a gran escala, que
vides mayor sensibilidad (Aarestrup et al. 1998 ; Lanza y col.2018 ).
Recientemente se informó que la metagenómica tiene más méritos que las convenciones.
métodos tradicionales para la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en piaras de cerdos (Munk et al.
2017), que es bastante beneficioso para comparar la resistencia a los antimicrobianos en
stock (Munk et al. 2018), así como investigaciones relacionadas con datos epidemiológicos (Van
Gompel y col. 2019). El uso para la vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos
diseminación genética por vuelos internacionales (Nordahl Petersen et al. 2015 ) e inversiones
La limpieza de las aguas residuales urbanas para determinar la resistencia doméstica y global también ha
ha demostrado (Hendriksen et al. 2019b ;. Pehrsson et al 2016).
Página 67
52 S. Kumar y col.
A. Problemas estructurales
B. Problema de vigilancia basada en laboratorio
C. Falta de coordinación entre los sistemas de vigilancia animal y alimentaria
Existe una amplia gama de problemas estructurales. Los esfuerzos de vigilancia nacional
nivel de lanza son heterogéneos y fragmentados. Sistemas de recopilación de datos en funcionamiento
La resistencia a los antimicrobianos y las infecciones relacionadas con la atención de la salud tienen diferentes objetivos con
poca o ausencia de coordinación e intercambio de información con
Página 68
2 Programas de vigilancia mundial de la resistencia a los antimicrobianos 53
2.13 Conclusión
Esta era de creciente resistencia a los antimicrobianos presenta una necesidad urgente de mejorar
mentos en el sistema de vigilancia para optimizar la terapia empírica, impulsar los antimicrobianos
medidas de administración y control de infecciones, y desarrollo de nuevos medicamentos y
vacunas. Sin tales desarrollos, será difícil reducir sustancialmente la
las cargas económicas y médicas impuestas por la resistencia a los antimicrobianos. Nuevas iniciativas
(incluyendo ESVAC, CAESAR, Encuesta europea sobre producción de carbapenemasas
Proyecto Enterobacteriaceae, Centro de Dinámica, Economía y Políticas de Enfermedades
Mapa de resistencia, sistema global de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos y EPI-
Net) puede mejorar la fragmentación, el desfase temporal, la heterogeneidad y otras
cias de las estrategias de vigilancia existentes, pero no puede lograr los avances obligatorios
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 48/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
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Página 74
Capítulo 3
Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios
y cambio climático
Resumen La resistencia a los antimicrobianos es una de las mayores amenazas para la salud mundial,
seguridad alimentaria y desarrollo hoy. Cada año, las infecciones resistentes a los antimicrobianos
matar a 700.000 personas en todo el mundo. Si no se toman pronto acciones dramáticas, esto
número podría dispararse, llegando a diez millones de muertes anuales para 2050. El rápido
la aparición de infecciones resistentes a los antimicrobianos se ve agravada por el uso irracional
de antimicrobianos en medicina humana y veterinaria y en la industria agrícola.
Se considera que el uso de antimicrobianos es el factor más importante que conduce a
resistencia. La demanda de carne está aumentando con el aumento de la población mundial, lo que
la expansión de la ganadería y la avicultura comerciales grandes donde los antibióticos
se utilizan con frecuencia para el tratamiento, la profilaxis y la promoción del crecimiento para garantizar
comida segura y suficiente. Una población mundial en crecimiento, la temperatura y el aumento
La demanda de alimentos ha ejercido una inmensa presión sobre nuestras cadenas de suministro de alimentos y
sistemas. En parte impulsado por las preocupaciones del público sobre la resistencia a los antimicrobianos, los alimentos
La industria se está alejando lentamente de la carne criada con antibióticos. Recientemente, cli-
factor matemático como un aumento de la temperatura global también se ha atribuido a ser
contribuyendo a la aparición de resistencia a los antimicrobianos.
Aquí revisamos, el tema de la resistencia a los antimicrobianos en relación al antibiótico
uso en animales destinados a la alimentación, cambio climático y seguridad alimentaria. En primer lugar, discutimos la con-
ceptos y consecuencias de la resistencia a los antimicrobianos, la seguridad alimentaria y el clima
cambio. Más tarde, abordamos las conexiones y la interacción entre los antimicrobianos
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
microorganismos resistentes y cambios climáticos antropogénicos en relación con los alimentos
seguridad y proteccion. Descubrimos que la incorporación de la resistencia a los antimicrobianos en
cobertura sanitaria universal más amplia, desarrollo sostenible, sistema alimentario y medio ambiente
Las agendas ambientales es clave, tanto para escalar como para sostener los esfuerzos para abordar las
resistencia a los microorganismos. Una correlación positiva entre un aumento de temperatura con un
Se ha encontrado un aumento de la resistencia a los antimicrobianos. Estos desafíos continuos sugieren
sugiere que la carga de la resistencia a los antimicrobianos podría subestimarse significativamente
apareados ante una población en crecimiento y el cambio climático.
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 59
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
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60 M. Mohsin y col.
Palabras clave Resistencia a los antimicrobianos · Cambio climático · Sistema alimentario · Seguridad alimentaria
· Seguridad alimentaria
3.1 Introducción
Dado que se espera que la población mundial alcance los 9 mil millones para 2050, la demanda global
para alimentos también se espera que aumente en muchos pliegues (Guillou y Matheron 2014). La
La biodiversidad en este planeta ha cambiado constantemente debido a la antropogenicidad.
actividades, más evidente desde la revolución industrial. Para conocer el crecimiento
demanda de alimentos, se ha introducido la ganadería intensiva donde se
crobials se utilizan para tres propósitos principales: uso terapéutico para tratar, profiláctico
uso para prevenir un brote de enfermedad y uso de promoción del crecimiento (Van Boeckel et al.
2019). La introducción de antimicrobianos en la producción de alimentos para animales ha contribuido
uted a la mejora de la salud y la productividad de los animales y garantizó la alimentación mundial
seguridad. Sin embargo, el uso excesivo de antimicrobianos en la ganadería intensiva
ha dado lugar a la aparición de resistencia a los antimicrobianos (Van Boeckel et al. 2019).
Es imperativo considerar el impacto de los antibióticos y la resistencia a los antibióticos en la seguridad.
comida. La seguridad alimentaria también está vinculada a los objetivos de desarrollo sostenible, en particular
Objetivo de desarrollo sostenible 2: Hambre cero y objetivos de desarrollo sostenible.
3 - Salud y bienestar (OMS 2019). Productos alimenticios de origen animal, incluidos
La carne, la leche y los huevos a menudo están contaminados con bacterias y, por lo tanto, es probable que constituyan
tute la ruta principal de transmisión de bacterias resistentes y genes de resistencia de los alimentos
animales a personas. El contacto directo con los animales o el entorno de la granja también podría
implicar en la propagación de la resistencia a los antimicrobianos. Contaminación de frutas y hortalizas
Los desechos animales o el agua contaminada también pueden constituir una transmisión.
ruta. Por lo tanto, la resistencia a los antibióticos es un desafío para la seguridad alimentaria (Founou et al. 2016 ;
Fanzo y col. 2018 ).
El cambio climático, la resistencia a los antimicrobianos y la seguridad alimentaria mundial se han convertido
las cuestiones definitorias en los tiempos actuales. Estas amenazas exigen acciones urgentes para evitar
crisis de salud pública. El cambio climático puede derivar en varios vectores, agua y alimentos.
enfermedades transmitidas, por ejemplo, el cólera y los brotes del virus del Zika. Además de estos, Nipah
y la aparición de hantavirus se ha relacionado estrechamente con condiciones climáticas extremas.
Para el año 2030, las enfermedades debidas al cambio climático se traducirán en más de 250.000
muertes (Chan 2017). La resistencia a los antimicrobianos y las infecciones asociadas al cambio climático
enfermedades graves pueden conducir a una crisis financiera mundial (Grupo del Banco Mundial 2017 ). Sobre el
Por otro lado, la amenaza a la seguridad alimentaria mundial se agrava ante los crecientes desafíos
de la resistencia a los antimicrobianos y el cambio climático (Fig. 3.1). La demanda global de
la comida ha aumentado (FAO 2009a ) a lo largo del tiempo y debido al aumento de la población, especialmente
principalmente en los países de ingresos bajos y medianos donde el suministro de alimentos básicos
a menudo se ve comprometida (Popkin 2014 ). Es necesaria la coherencia entre
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3 Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios y cambio climático 61
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Fig. 3.1 Resistencia a los antimicrobianos, cambio climático y sistema alimentario: La resistencia a los antimicrobianos ha
una fuerte relación con factores climáticos como la temperatura, el calor, el viento, la lluvia, etc. A la inversa,
La biomasa microbiana tiene una fuerte tendencia a cambiar el destino de los componentes climáticos. La
El efecto sinérgico de la resistencia a los antimicrobianos y el cambio climático hacen que el sistema alimentario
comprometido tanto cualitativa como cuantitativamente
sectores gubernamentales, privados y de otro tipo con respecto al abordaje de los antimicrobianos
problema de resistencia.
Este capítulo tiene como objetivo abordar la interconexión, la armonía y la coherencia de las
Desafíos actuales sobre la resistencia a los antimicrobianos y el cambio climático en los alimentos
seguridad e inocuidad alimentaria. Partiendo de una breve revisión de la literatura sobre la definición
conceptos y conceptos relacionados con la resistencia a los antimicrobianos, el cambio climático y la alimentación
sistema para criticar la evaluación de cómo la resistencia a los antimicrobianos y el clima
El cambio podría interactuar entre sí y desempeñar su papel en el mantenimiento de una
ecosistema saludable. Además, nuestro objetivo es proporcionar a los responsables de la formulación de políticas una mejor manera de
Tomando decisiones en el comercio de productos alimenticios de origen animal a nivel nacional e internacional.
a nivel nacional, abordando las preocupaciones globales y públicas sobre los anti-
resistencia microbiana. Los trabajadores sanitarios y otros profesionales también pueden jugar
su papel en la minimización de los desafíos asociados con la amenaza a los
seguridad alimentaria y seguridad alimentaria adaptando y considerando las recomendaciones
recomendaciones.
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62 M. Mohsin y col.
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
icos a las bacterias, que a su vez, imponen una presión selectiva sobre las comunidades microbianas
lazos para sostener su población (Fig. 3.2). El consumo de antibióticos es uno de los
factores clave que contribuyen al desarrollo de resistencia entre las bacterias debido
a la presión selectiva (Baym et al. 2016; Pouwels y col. 2018). El problema oculto
de la presión selectiva de antibióticos es que las especies bacterianas comensales son innecesariamente
estar expuesto a antibióticos que promueven la resistencia incluso en compuestos no patógenos /
bacterias mensuales. Además, el intercambio entre especies e intraespecies de genes
Además, la transmisión conduce a enfermedades infecciosas graves y más difíciles de tratar (Naylor
et al. 2018). Los mecanismos de transferencia horizontal de genes se consideran uno de los más
mecanismos comunes de transferencia de genes de antibióticos, además del gen vertical
transferir. La presión selectiva de antibióticos puede seleccionar mutaciones cromosómicas que confieren
resistencia del anillo a los antibióticos, que se puede transferir verticalmente a los siguientes
generaciones microbianas. Alternativamente, muchos genes responsables de la resistencia a los medicamentos son
que se encuentran en plásmidos o en transposones que se pueden transferir entre especies y
intra-especies a través de la transferencia horizontal de genes (Holmes et al. 2016; O'Neill 2016b).
Sin embargo, esto es importante para reconocer que además del uso excesivo de antimicrobianos, otros
existen elementos naturales y ambientales; como el cambio climático también es silenciosamente
impulsando un cambio en la aparición de resistencia a los antibióticos (Wellington et al. 2013). Para
Por ejemplo, un estudio reciente mostró una mayor tasa de resistencia a los antibióticos con el aumento
ing temperatura local en los EE. UU. Un porcentaje creciente de resistencia a los antibióticos
se encontró en tres patógenos comunes Escherichia coli (4.2%), Klebsiella pneu-
moniae (2,2%) y Staphylococcus aureus (2,7%). Además, este aumento en
Página 78
3 Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios y cambio climático 63
Luz de sol
Calor
Lluvia
Viento
Dióxido de carbono
Fotosíntesis
Respiración Dióxido de carbono
Interacción
Agricultura
Fig. 3.2 Medio ambiente marino y terrestre: el secuestro y liberación de carbono es el principal
impulsor del cambio climático; que están en fuerte relación con otros ambientales y antropo-
actividades genéticas como agricultura, industria, deforestación, etc. Antibióticos, uso extensivo en humanos,
Las tierras agrícolas y animales causan una presión selectiva sobre los microbios humanos, del suelo y del medio ambiente.
nicho. Los factores climáticos como la luz solar, el calor, la lluvia y el viento juegan un papel importante en el equilibrio.
de todos los ciclos de mineralización y biogeoquímicos de la tierra. Cualquier desequilibrio de los ciclos naturales debido a
actividades humanas o por el cambio climático tiene efectos significativos en la aparición y transmisión de
Resistencia a los antimicrobianos, que a su vez amenaza el sistema alimentario saludable.
Se encontró que la tasa de resistencia a los antibióticos era consistente con la mayoría de los antibióticos.
clases que incluyen fluoroquinolonas, betalactámicos, sulfamidas, tetraciclinas, aminoglu-
cosidos, hidantoínas y carbapenémicos. Por tanto, el cambio climático también debería
considerado como un factor que contribuye al aumento de la resistencia a los antimicrobianos
(MacFadden et al. 2018). Otro estudio reciente identificó una relación novedosa
entre la resistencia a los antimicrobianos y el cambio climático y reveló dos aspectos: que
la predicción de la resistencia a los antimicrobianos en diferentes sociedades y el sistema de salud
tem se atribuye significativamente a factores climáticos. Además, el cambio climático podría
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Página 79
64 M. Mohsin y col.
Cuadro 3.1 Muertes relacionadas con la resistencia a los antimicrobianos y consecuencias previstas
Antimicrobiano
resistencia Referencias
Escenario actual 700.000 infecciones anuales resistentes a los antibióticos O'Neill (2016b)
muertes a nivel mundial
5,7 millones de muertes anuales tratables con antibióticos Daulaire y col. ( 2015 )
ocurren, y la mayoría de las muertes ocurren en bajas y
países de ingresos medios debido a la falta de acceso
a los antibióticos
23.000 muertes debido a multirresistente OMS (2018 )
tuberculosis y medio millón de casos nuevos cada uno
año
2,8 millones de infecciones por resistencia a los antibióticos y Redfield (2019)
35.000 mueren cada año en EE. UU.
Futuro 10 millones de muertes estimadas para 2050 debido a Grupo del Banco Mundial (2017)
estimaciones resistencia antimicrobiana
24 millones de personas pronosticadas en condiciones extremas Coordinación interagencial
pobreza para 2030 debido a la resistencia a los antimicrobianos Grupo IACG (2019)
2.4 millones de personas podrían morir con ingresos altos Organización para la Economía
países entre 2015-2050 cooperación y
Desarrollo OCDE (2018)
2 millones de muertes proyectadas en India Dixit y col. (2019)
Página 80
3 Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios y cambio climático sesenta y cinco
Página 81
66 M. Mohsin y col.
La comida es una necesidad para un organismo vivo, ya que es la fuente más común de producción.
Transmitir energía a humanos y animales. Diferentes componentes, tipos e ingre-
Los pacientes ayudan a realizar reacciones metabólicas naturales. Por tanto, el sistema alimentario es un
sistema que integra varios sistemas naturales y ambientales, desde un simple alimento
cadena de suministro a las múltiples redes interconectadas (Hospes y Brons 2016 ;
Béné et al. 2019 ). El sistema alimentario tiene interconexión con otros actualmente en curso
desafíos que pueden afectar directa o indirectamente al desarrollo agrícola sostenible
y seguridad alimentaria. Figura 3.3 ofrece una imagen más amplia del sistema alimentario y sus
relaciones con el medio ambiente, la salud, la economía, la política y la sociedad.
El sistema alimentario es en sí mismo responsable del desperdicio, descomposición, emisión de
gases de efecto invernadero, agotamiento de los recursos naturales y pérdida de biodiversidad. Comida
Los sistemas tienen el potencial de nutrir la salud humana y apoyar la sustentabilidad ambiental.
sostenibilidad. Brindar dietas saludables a una población mundial en crecimiento que incluya
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Fig. 3.3 El sistema alimentario tiene fuertes asociaciones con otras dimensiones como el medio ambiente,
la sociedad, la salud (Singer et al. 2016 ), la economía y la política (Collignon et al.2015). Todas estas dimensiones
siones tienen un papel influyente en el desarrollo y progresión de la resistencia a los antimicrobianos, por lo que
comprometiendo el sistema alimentario
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3 Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios y cambio climático 67
Los alimentos sin antibióticos procedentes de sistemas alimentarios sostenibles constituyen un desafío inmediato (Frank
et al. 2019 ; Willett y col. 2019 ). El camino hacia el destino de la sostenibilidad
enfoque en el sistema alimentario está mejor orientado a las Naciones Unidas
Desarrollo de metas". Los principales sellos distintivos de los Objetivos de Desarrollo Sostenible se desarrollan
optando por la paz, la prosperidad en el mundo desde los individuos hasta el nivel nacional para vivir una
vida mejor y saludable (Naciones Unidas 2019 ). El sistema alimentario se ha visto comprometido
a lo largo de los años debido a las amenazas de patógenos resistentes a los antimicrobianos en el
cadena de comida. En particular, los sistemas de ganadería intensiva se han basado en antibióticos
uso ótico (Antonelli et al. 2019 ). Los antibióticos se utilizaron sustancialmente para tratar, curar y
prevenir las infecciones animales y humanas. Sin embargo, el uso de antibióticos para el crecimiento ha
empeoró el escenario ya que los antimicrobianos se utilizan en un nivel subterapéutico
(Kirchhelle 2018).
La inocuidad alimentaria, la seguridad alimentaria y la salud nutricional son tres características clave de una
sistema alimentario (Cuadro 3.2). Todas estas tres características funcionan de manera coordinada teóricamente.
reticamente, pero la influencia prctica de cada componente es distinta. Estos encontraron ser
menos compatible cuando se observa a través de una visión más amplia de los responsables políticos y los comerciantes
(Walls et al. 2019 ). La seguridad alimentaria abarca la producción, manipulación y preparación de alimentos.
almacenamiento y almacenamiento; también abordan peligros como las enfermedades transmitidas por los alimentos.
La salud nutricional se ocupa de la calidad y cantidad de los alimentos y sus ingredientes.
Si bien la seguridad alimentaria es un círculo extenso y más amplio, que incluye tanto la seguridad alimentaria
y salud nutricional. La seguridad alimentaria garantiza todos los principios, ocupándose de los principales
mantenimiento de la calidad y cantidad del sistema alimentario de una manera más integral comprendiendo
teniendo cada elemento de la red de alimentación (Paredes et al. 2016 ; HLPE 2017). Comida
la disponibilidad, el acceso a los alimentos y la utilización de los alimentos son tres pilares básicos de la seguridad alimentaria
declarada por la OMS, mientras que la estabilidad (Tabla 3.2 ) ya que se agregó el cuarto pilar en
2009 por la Cumbre Mundial sobre Seguridad Alimentaria (FAO 2009b ).
Aspectos clave del sistema alimentario Walls et al. Seguridad alimentaria: cuatro pilares Schmidhuber y Tubiello
(2019) (2007)
1. Seguridad alimentaria 1. Disponibilidad
2. Seguridad alimentaria 2. Estabilidad
3. Nutrición saludable 3. Acceso
4. Utilización
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peratura y resistencia a los antimicrobianos pueden dañar significativamente el intercambio o
comercio a nivel nacional e internacional (FAO 2017). Los formuladores de políticas presen-
Necesito pensar en un arreglo alternativo de políticas, financieras y excepcionales.
Sistema de comercio tradicionalmente seguro para manejar la resistencia a los antimicrobianos en la cadena alimentaria.
(Jorge 2019 ).
El segundo pilar es el acceso a los alimentos; Significa alimentos que se pueden asignar a un lugar determinado.
y al alcance de la gente común. Este pilar se ha encontrado en una fuerte asociación
ción con el hambre y la desnutrición como la incapacidad de acceso a los alimentos en una población es
debido a la pobreza, comúnmente, no a la escasez o escasez de alimentos (FAO 2017).
El acceso a los alimentos se ha clasificado en dos tipos. El primero es el acceso directo; la
capacidad humana para producir alimentos por sí misma utilizando diferentes enfoques, agricultura, agricultura
etc. y el segundo es el acceso económico, en el que se depende de la finalidad
persiguiendo desde el primer lugar o fuente primaria de producción. Ambos tipos de accesos
son diferentes en su naturaleza y dependen de las tendencias demográficas y regionales de
un área (Egal 2019).
La utilización de los alimentos es el tercer pilar de la seguridad alimentaria asociado con el metabolismo de los alimentos.
La inseguridad alimentaria pone en riesgo la utilización de los alimentos. Todo el proceso de producción de alimentos para
el consumo de alimentos y los pasos subyacentes de purificación, cocción y almacenamiento
decide la vía de utilización de los alimentos. La utilización de los alimentos también depende de la
preferencia cultural, elección de alimentos, bienestar emocional y psicológico como
la alteración del metabolismo crea una falta de utilización adecuada de los alimentos. Además, el
la presencia de microbios, especialmente parásitos, reduce la utilización de alimentos. Para hacer frente a
Esto, una educación y un saneamiento adecuados pueden limitar la propagación de enfermedades (FAO 2017 ).
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3 Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios y cambio climático 69
La estabilidad alimentaria es el cuarto pilar que habla del sostenimiento de los alimentos en el tiempo.
Mientras desequilibra la producción, el consumo, el intercambio, el comercio y la exportación de alimentos
las roturas provocan desastres en las comunidades. Las enfermedades transmitidas por alimentos son comunes entre
ellos. La resistencia a los antimicrobianos y el cambio climático se han asociado con la
inestabilidad de los alimentos transitoria (durante ciertos períodos), estacional (un patrón regular
del cambio climático) y crónico (a largo plazo) debido a desastres naturales.
(FAO 2017; Egal 2019).
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tributos al sabor de la cerveza, vino, vinagre, encurtidos, etc. Especies bacterianas ( Lactobacillus,
Lactococcus, Bifidobacterium) producen productos lácteos fermentados (Húngaro et al.
2014). Los distintos tipos de mohos como Penicillium roqueforti y Penicillium
camemberti producen queso a una temperatura óptima de 15 ° C, mientras que a 25 ° C
Estos mohos producen micotoxinas que son muy dañinas y resistentes.
tanto al calor y los productos químicos (Húngaro et al. 2014).
El papel de los microorganismos se ha pasado por alto en el desafiante tema del clima.
cambio de pareja. Aunque los microorganismos son cruciales para regular el cambio climático,
a menudo no son el foco de los estudios de cambio climático y no se consideran en
desarrollo de políticas. Debido a la inmensa diversidad microbiana y la respuesta al medio ambiente
cambio mental es difícil determinar el papel microbiano en el ecosistema. Su
La inmensa diversidad y las diversas respuestas al cambio ambiental hacen determinantes
su papel en el ecosistema es desconcertante (Cavicchioli et al. 2019 ). El microbiano
comunidades y el cambio climático actúan juntos sobre el bioma marino, terrestre
bioma y bioma agrícola.
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El bioma marino es uno de los mayores biomas existentes en la superficie de la Tierra, que comprende
ing casi el 70%. El "Censo de vida marina" estimó que el 90% de la masa microbiana
está ocupada en biomasa marina. Tanto en la superficie como en las profundidades del océano, la foto-
Los microorganismos tróficos dependen de la energía. El primero absorbe la luz solar mientras que el otro
uno tiene la energía de materias orgánicas e inorgánicas enterradas (Jørgensen y Boetius
2007 ). Además de estos, la mitad de la fijación de CO 2 y la mitad de la producción de oxígeno (O 2 )
globalmente son realizadas por el fitoplancton marino. Esto resalta la importancia
tancia de las comunidades microbianas en la absorción y el reciclaje de elementos importantes en
la atmósfera como carbono (C), nitrógeno (N) y el mantenimiento del clima. En cambio,
si se produce algún cambio significativo en el clima, ya sea debido a las actividades humanas o por
el ciclo natural del clima, afectará al microbioma marino y, por tanto, al clima.
Por otro lado, la biomasa terrestre es más de 100 veces mayor que la biológica marina.
masa. Entre ellos, las plantas ocupan una gran proporción y realizan la mitad de los procesos primarios.
producción neta a nivel mundial (Bar-On et al. 2018 ). Curiosamente, 1.2 × 10 30 bacterianos y
Las células arqueológicas existen en la tierra (Flemming y Wuertz 2019), destacando su vital
papel en el mantenimiento del equilibrio de la vida. Los microbios del medio terrestre.
También regulan el carbono almacenado en el suelo y las rocas. Las plantas también absorben CO 2 durante
fotosíntesis. Alternativamente, durante la respiración autótrofa de plantas y hetero-
respiración trófica, el CO 2 se revierte a la atmósfera. Otros factores climáticos
influyen directamente en el equilibrio como la tasa de calentamiento y aridez, mientras que los efectos indirectos
como el cambio en la proporción de microbiota del suelo y el aumento de CO 2 , de nuevo crean un riesgo
templado del clima al intensificar el calentamiento global (Singh et al. 2010 ; Ballantyne y col.
2017). El efecto del cambio climático en la tierra a menudo conducirá a la pérdida de hábitats naturales.
junto con la reducción de la biodiversidad (Lanz et al.2018 ), principalmente de la micro-
organismos (Dai et al.2018). El equilibrio microbiano alterado en la tierra finalmente
ralentiza la eficiencia de los procesos naturales necesarios que originalmente se
planteado para sostener el sistema ambiental saludable y conduce al cambio climático.
Nos enfrentamos no solo al cambio climático, sino también a la disminución de la biodiversidad, la escasez de
tierras fértiles, humedales y contaminación. La biodiversidad de los organismos macroscópicos se
ociosamente disminuyendo debido a actividades antropogénicas, lo que sugiere que la biodiversidad
También disminuirá la cantidad de microorganismos específicos del hospedador de especies animales y vegetales.
Por el contrario, existe una falta de conocimiento sobre las conexiones entre microorganismos
ismos y cambio climático antropogénico.
Aunque los microorganismos son cruciales para regular el cambio climático, son
rara vez es el foco de los estudios sobre el cambio climático (Cavicchioli et al. 2019). Somos dramati-
afectando de manera importante a nuestro sistema mundial de producción de alimentos, la calidad del aire y de la
agua y nuestra exposición a enfermedades infecciosas causadas por patógenos resistentes a los medicamentos.
Los cambios en los sistemas de soporte vital natural ya están afectando nuestra salud y son
proyectado para impulsar gran parte de la carga mundial de enfermedades infecciosas (Robinson et al.
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"Resiliencia". La resiliencia, sin embargo, es un término que se toma prestado desde 1973 del
sistema ecológico, que significa la tendencia o capacidad de un sistema de volver a su
estado original después de haber sido perturbado. Asimismo, el concepto de resiliencia en la alimentación
El sistema y la cadena alimentaria se denomina resiliencia del sistema alimentario (Tendall et al. 2015 ). En
Por otro lado, ya existen ciertos conceptos conocidos relacionados con la resistencia a los antibióticos.
y la “resiliencia a los antibióticos” es apenas el comienzo de un nuevo concepto (Carvalho et al.
2019). Los eventos de enfriamiento (La Niña) y calentamiento (El Niño) en el Océano Pacífico
crear alternativamente efectos más cálidos y más fríos; que tienen un impacto de gran alcance en
el equilibrio natural del clima global y el tiempo en todo el mundo. Recientemente
observado en China, ambos ciclos tienen un efecto notable en la producción de cultivos
rendimiento (Li et al. 2019 ). Los cambios estacionales a corto plazo afectan localmente en el tiempo.
nivel, mientras que un cambio silencioso a largo plazo crea una amenaza eterna a nivel mundial.
Desafortunadamente, la adición de actividades antropogénicas, emisión de dióxido de carbono
y la emisión de metano de los animales en pastoreo representa más (Van Zanten et al. 2019 )
y uso de antibióticos en el sector humano y veterinario (Nelson et al. 2019 ) da
aceleración al cambio climático.
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Tabla 3.3 Patógenos y Virus del Nilo Occidental transmitido por vectores , malaria, dengue,
enfermedades en relación con enfermedad de Lyme
cambio climático
Llevado por barco Vibrio spp. No cólera ,
Cryptosporidium spp., Virus de la rota
Aerotransportado Virus de la influenza, virus Hanta,
Coccidioidomicosis
Transmitidos por los
Salmonella
alimentosspp., Campylobacter spp.
Fuente: Adaptado de Cavicchioli et al. ( 2019)
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bacterias que pueden entrar
La cadena de comida
Resistente a los antibióticos
Genes
Por lo tanto, en el orden de ciertos desafíos que atraviesan el sistema alimentario, el clima
cambio, y la resistencia a los antimicrobianos, existe una necesidad urgente de establecer políticas y
metas. Sin duda, algunas organizaciones regionales y globales ya están trabajando para
abordar los problemas respectivos. Darle una mirada despejará el borroso escenario de
sus objetivos y metas. Para garantizar la seguridad alimentaria mundial, el sistema alimentario ha priorizado
diferentes tareas, como lograr el objetivo de desarrollo sostenible (objetivo 2) por año
2030. El objetivo de desarrollo sostenible 2 se centra en su compromiso de poner fin
hambre, lograr la seguridad alimentaria, mejorar la nutrición y promover
agricultura para el año 2030 (Byerlee y Fanzo 2019 ). Interesante saber aquí,
que hay algún eslabón perdido en los objetivos de desarrollo sostenible que se ha
destacado con posibles recomendaciones (Veldhuizen et al. 2020 ), por ejemplo
las diferencias en la cadena alimentaria de productores y consumidores, la cooperación entre los
ya nivel mundial, brecha de comunicación de investigación y políticas que construyen diferencias.
Los programas de administración de antimicrobianos y el trabajo de la OMS / FAO, como el “Plan de acción sobre
Resistencia a los antimicrobianos 2016-2020 ”juega un papel ofensivo para los antimicrobianos
resistencia. Según un informe reciente, la resistencia a los antimicrobianos podría conducir a 24 millones de
pueblo león a la pobreza extrema, para el año 2030 (IACG 2019), mientras que en el otro
mano objetivo de desarrollo sostenible 2 destinado a acabar con el hambre para el año 2030. Pobreza
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no puede acabar con el hambre, por lo que para limitar la resistencia a los antimicrobianos y evitar la pobreza
con un sistema alimentario saludable al mismo tiempo; necesitamos medidas especiales de adaptación y
enfoques coordinados. Además, la implementación de sistemas cohesivos e integrados
Los enfoques para mitigar los problemas relacionados con la salud, la alimentación y el medio ambiente son
muy necesario.
Propusimos algunos desafíos más detallados y holísticos, que se enumeran a continuación y
sible recomendación al final para superar estos:
3.8 Conclusión
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El suministro y el sistema de alimentos son vulnerables al problema de la resistencia a los antimicrobianos
y el cambio climático puede exacerbar la resistencia a los antimicrobianos que, en última instancia, es
una amenaza para la calidad y la seguridad alimentaria. Tanto la resistencia a los antimicrobianos como el clima
el cambio debe ser monitoreado de cerca. La interacción de las comunidades microbianas con
El clima, especialmente en los ecosistemas marinos, terrestres y agrícolas, tiene un importante
papel en el sostenimiento del equilibrio ecológico. Sin embargo, actividades antropogénicas como
la agricultura, la industria y los sistemas de producción intensiva de alimentos han
aumentó la emisión de gases de efecto invernadero, mientras que al mismo tiempo, los antibióticos
el uso excesivo en el sector humano y veterinario se ha añadido como característica complementaria. Debajo
el doble desafío de la resistencia a los antimicrobianos y el cambio climático, el sistema alimentario
se ha visto comprometida cualitativa o cuantitativamente, y la alimentación mundial
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3 Resistencia a los antimicrobianos, sistemas alimentarios y cambio climático 77
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Capítulo 4
Enfoques In Silico para la priorización de fármacos
Objetivos en patógenos
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medicamentos, como antibióticos, antifúngicos, antivirales, antipalúdicos y antihelmínticos,
que implica cambios genéticos. Las infecciones por patógenos resistentes también provocan una
mayor costo de atención médica (presupuesto estimado de $ 20 mil millones anuales en los Estados Unidos)
Mariana Santana y Stephane Fraga de Oliveira Tosta contribuyeron igualmente con todos los demás
contribuyentes.
AK Jaiswal
Instituto de Ciencias Biológicas, Universidad Federal de Minas Gerais (UFMG),
Belo Horizonte, MG, Brasil
LCJ Alcantara
Laboratório de Flavivírus, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, Rio de Janeiro, Brasil
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 83
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
Opiniones sobre agricultura 46, https://doi.org/10.1007/978-3-030-53024-2_4
Página 98
84 M. Santana y col.
Estados) en comparación con las infecciones no resistentes debido a una mayor duración de la enfermedad / hospitalización
Talización, pruebas adicionales y uso de medicamentos más costosos.
La genómica comparada asociada con Pangenómica, genómica sustractiva,
La bioinformática estructural y los enfoques de análisis de las vías metabólicas son actualmente
aplicado para alcanzar el desarrollo de nuevos antibióticos y combatir las resistencias antimicrobianas
tance. El desarrollo de fármacos dirigidos retiene los principales desafíos de la selección de candidatos
a experimentos y ensayos clínicos in vitro e in vivo . Sin embargo, los avances en ciencia
conocimiento e investigación y desarrollo, el advenimiento de enfoques ómicos para
Por ejemplo, avances en genómica, transcriptómica, proteómica y bioinformática.
conducir a una 'era de big data' que mejoró la identificación de objetivos putativos a través de la
aplicación de herramientas in silico que acortaron el cronograma de manera rentable.
En este capítulo, nos centramos en diferentes estrategias bioinformáticas para priorizar
dianas farmacológicas en patógenos.
4.1 Introducción
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
El conocimiento de los rasgos antimicrobianos es esencial para comprender la ganancia de resistencias.
tancia y cómo superarla. Otros factores relevantes que influyen en la prevalencia de
resistencia son las interacciones entre el fármaco patógeno y el huésped patógeno, la tasa de
mutación de microorganismos, información de resistencia cruzada, selección de co-resistencia a
medicamentos no relacionados, y las tasas de transmisión entre humanos, animales y el medio ambiente
ambiente. Por lo tanto, la educación de los profesionales de la salud y los
Página 99
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 85
población es un paso clave para prevenir la resistencia a los antimicrobianos, y junto con la
La implementación de programas de administración de antimicrobianos en entornos de atención de salud podría
mejorar la prescripción de antimicrobianos (Marston et al. 2016 ). De hecho, el 50% de los prescritos
Los antimicrobianos se consideran innecesarios y, a menudo, los medicamentos se administran sin
supervisión profesional (Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades 2013).
Asimismo, el uso de antimicrobianos como promotores del crecimiento animal y en rutina
La prevención de infecciones en el ganado ayuda aún más a la diseminación de la resistencia a los medicamentos, y
El uso de antimicrobianos en la producción de alimentos es en realidad mayor que en el entorno clínico.
(80% del consumo total de antibióticos en los Estados Unidos) (Van Boeckel et al.
2015). Estos complican el escenario de resistencia general, ya que la mayoría de los medicamentos
considerados "médicamente importantes" para los seres humanos también se aplican a los animales. Es más,
esta práctica comprende el 62% de los antibióticos utilizados actualmente y el resto
El porcentaje también puede tener un papel (directo o indirecto) (Marston et al. 2016 ).
Página 100
86 M. Santana y col.
y prevención contra enfermedades infecciosas con resultados prometedores (Hauser et al. 2016 ;
Marston y col. 2016 ).
Sin embargo, las mitigaciones por sí solas no son suficientes para superar la amenaza de los antimicro-
siendo necesaria la resistencia bial un compromiso internacional. La implementación
de las prácticas mundiales para prevenir la propagación de la resistencia es urgente y requiere
medidas. La Organización Mundial de la Salud estableció un plan de acción global sobre
resistencia microbiana en 2015 para presentar el enfoque de 'una sola salud' para combatir los antimicrobianos
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
resistencia a losabarca
Esta propuesta cultivos y alcanzar
varios una
sectores nueva era de desarrollo
internacionales, sostenible
incluidas las (OMS
principales 2015).
partes interesadas:
ers por ejemplo; industria alimentaria y farmacéutica, finanzas, medio ambiente, academia,
y el gobierno, la medicina humana y veterinaria, la agricultura y los
consumidores, todos juntos para lograr un objetivo común. El plan de acción se estableció con cinco
objetivos principales:
Página 101
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 87
Cuadro 4.1 Lista de la OMS de antimicrobianos de importancia crítica para la medicina humana de 2019 (OMS
Lista de la CIA). Lista y clasificación de antimicrobianos importantes para la medicina humana. Algunos
Los antimicrobianos se usan solo en personas, algunos tanto en personas como en animales (p. ej., eritromicina,
ampicilina, colistina)
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Penicilinas (amidinopenicilinas) Mecilinam
Penicilinas (espectro estrecho) Benzatina-bencilpenicilina,
Fenoximetilpenicilina
Penicilinas (antiestafilocócicas) Flucloxacilina
Ácidos pseudomónicos Mupirocina
Riminofenazinas Clofazimina
Antibacterianos esteroides Acido fusidico
Estreptograminas Quinupristina / Dalfopristina
Sulfonamidas, inhibidores de la dihidrofolato reductasa Sulfametoxazol, trimetoprima
y combinaciones
Sulfonas Dapsona
Tetraciclinas Clortetraciclina
(continuado)
Página 102
88 M. Santana y col.
Página 103
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 89
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Cuadro 4.2 Prioridad de la OMS para 2017: lista de patógenos para la investigación y el desarrollo de nuevos antibióticos.
Se seleccionaron doce familias bacterianas y se dividieron en tres categorías según su prioridad.
estado. La lista destaca la necesidad de investigación y el desarrollo de nuevos medicamentos para estos
bacterias. Tabla adquirida de https://www.who.int/news-room/detail/27-02-2017-who-publishes-list-of -
bacterias-para-las-cuales-se-necesitan-con-urgencia-nuevos-antibióticos
Los hongos patógenos causan muchas enfermedades potencialmente mortales (p. Ej., Fungemia, meningitis).
tis, neumonía) y enfermedades crónicas graves (p. ej., aspergilo-
sis, aspergilosis broncopulmonar alérgica y pulmonar obstructiva crónica
enfermedad). Las infecciones por hongos se asocian normalmente con condiciones de salud subyacentes.
(por ejemplo, inmunosupresión) y el resultado favorable está relacionado con
el diagnóstico y la terapia antifúngica eficaz (Brown et al. 2012). Fármaco antifúngico
la resistencia ocurre con todas las clases de fármacos y la ganancia de resistencia a una clase o más
complica, ya que las opciones antimicóticas son limitadas (p. ej., azoles, equinocandinas, poli-
enes y flucitosina) (Odds et al. 2003 ; Perlin y col. 2017). El uso de fungicidas en
La agricultura aumenta aún más la resistencia a los medicamentos y da como resultado reservorios para
patógenos y pueden excluir a la mayoría de todas las opciones de tratamiento / (Perlin et al. 2017).
Además, la formación de biopelículas está asociada con la resistencia a la mayoría de los fármacos.
clases (Ramage et al. 2012). Para superar la diseminación de la resistencia, los antimi-
Programas de administración de cultivos, que son distintivos para cada institución / atención médica.
Los enfoques basados en el centro y el diagnóstico son esenciales y pueden reducir el
sin disminuir el costo de la salud (Andes et al. 2009; Barnes y col. 2009 ; Perlin
et al. 2017).
Los patógenos resistentes a los medicamentos más preocupantes son Aspergillus spe-
cies y de Candida glabrata y C. auris resistentes a múltiples fármacos . Algunos síntomas
causadas por esos y otros hongos a menudo se confunden con infecciones provocadas por bacterias (p. ej.
Página 104
90 M. Santana y col.
Los virus tienen una capacidad innata para evadir los medicamentos antivirales, ya que su replicación es propensa a
una alta tasa de error (Sanjuán et al. 2010 ). Por tanto, la ganancia de resistencia, que normalmente
implica algún tipo de interferencia en la interacción proteína-proteína (PPI) o una mutación
en el sitio de unión del fármaco, implica un equilibrio entre la capacidad de evadir la selección
presión positiva sin afectar la aptitud del patógeno (Götte 2012; Wensing y col.
2017). Muchos factores contribuyen a la capacidad del virus para vencer a los medicamentos antivirales, como
su tasa de replicación y mutación, aptitud viral y carga, siendo específica para cada fármaco /
microorganismo (Mason et al.2018). Una replicación rápida / una carga viral más alta conducen a una
mayor frecuencia de mutación, mientras que la aptitud viral determina si el patógeno
puede competir y sobrevivir en el medio ambiente (bajo presión antiviral) después de la
mutación. Los virus que denotan las principales preocupaciones para la salud humana son los
virus de inmunodeficiencia (VIH), hepatitis B (VHB) y C (VHC) e Influenza.
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
El VIH es un problema global que hoy en día afecta especialmente a los países en vías de desarrollo
y actualmente tiene una variedad de opciones de tratamiento (por ejemplo, más de 30 antivirales, nucleósidos
inhibidores de la transcriptasa inversa, inhibidores de la proteasa y transcriptasa inversa no nucleósida
inhibidores de la scriptasa) (Larder y Kemp 1989; De Clercq y Li 2016; Mason y col.
2018). La recomendación de la OMS es que todas las personas infectadas tomen medidas antirretrovirales.
tratamiento viral, que aumenta la probabilidad de desarrollar resistencia antiviral y
esta perspectiva exige un seguimiento constante para prevenir la propagación del VIH. Virus de la gripe
causa infecciones respiratorias graves con epidemias anuales, pandemias y endémicas
infecciones debido a su rápida y constante evolución (Lee e Ison 2012 ). Antivirus
están asociados con la mejora general y la eliminación de la enfermedad; sin embargo,
La resistencia representa un problema de salud importante. Las cepas resistentes a los antivirales no son
afectados por la terapia con medicamentos y conservan la capacidad de replicación y transmisión, siendo
responsable de los brotes graves (Li et al. 2015).
Los parásitos causan numerosas enfermedades graves que normalmente dependen por completo de
medicamentos antiparasitarios, debido a la falta de incentivos económicos para la investigación y el desarrollo
ment (Elsheikha et al. 2011 ; Secor et al. 2015). La resistencia a los antiparasitarios está vinculada
con características biológicas del patógeno que les permite escapar de la droga
efecto, que es un vínculo directo con las interacciones del huésped patógeno. Además,
Página 105
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 91
Las enfermedades parasitarias son frecuentes en los países en desarrollo donde la población sufre
de la desnutrición y tienen un acceso deficiente a agua potable y un saneamiento adecuado, factores
que dan como resultado un sistema inmunológico debilitado (Secor et al. 2015 ).
La malaria es una enfermedad parasitaria causada principalmente por Plasmodium falciparum y
P. vivax. El parásito es transmitido por el mosquito Anopheles e inicialmente infecta
eritrocitos y una vez en el torrente sanguíneo, en casos graves puede llegar al cerebro
ing a la malaria cerebral. El tratamiento se centra en una combinación a base de artemisinina.
terapias con una tasa de eficacia global del 95% con resistencia a múltiples fármacos descrita
parásitos observados en la frontera entre Camboya y Tailandia (Secor et al. 2015 ). La propagación
de cepas resistentes a otras partes del mundo podría plantear un importante desafío para la salud pública
poner en peligro y poner en peligro importantes avances recientes en el control del paludismo. En 2017, 219 millones
Se notificaron casos de malaria con 435.000 muertes en todo el mundo (OMS, 2018b).
Aproximadamente el 70% de los casos notificados se concentraron en África e India. A
nueva vacuna experimental mostró protección parcial contra P. falciparum en niños
dren y fue recomendado por la OMS para una introducción piloto en Ghana, Malawi y
Kenia. Esta nueva estrategia puede disminuir el problema de resistencia antiparasitaria y la
carga global de la enfermedad.
Soportando los obstáculos generados por el uso de antimicrobianos, la prevención de
una mayor propagación de la comunidad resistente a los antimicrobianos, y la inhibición de la propagación
Los patógenos son de suma importancia y requieren sinergias, superposiciones,
y enfoques complementarios. No existe una solución única y multidisciplinar
táctica es el mejor camino para garantizar y soportar el acceso a antimicrobianos eficaces
terapias.
La búsqueda de tratamientos alternativos (por ejemplo, compuestos antimicrobianos, bacterio-
fagos y enzimas asociadas a fagos, y dianas farmacológicas alternativas) denota una viabilidad
opción para reemplazar los antimicrobianos como la principal fuente de tratamiento (Bragg et al.2018).
El desarrollo de fármacos dirigidos retiene grandes retos de la selección de candidatos a en
experimentos y ensayos clínicos in vitro e in vivo . Sin embargo, los avances en ciencia
conocimiento (es decir, enfermedades y patógenos) e investigación y desarrollo, el advenimiento de
enfoques ómicos (por ejemplo, genómica, transcriptómica y proteómica), y bioinfor-
Los avances de las matemáticas conducen a una 'era de big data' que mejoró la identificación de
objetivos putativos a través de la aplicación de herramientas in silico que acortaron la línea de tiempo en un
de manera rentable (Bruno et al.2017). En este capítulo, nos enfocamos en diferentes
ent estrategias bioinformáticas para priorizar los objetivos de los fármacos en los patógenos.
Las técnicas de alto rendimiento en la secuenciación del genoma han proporcionado un aumento
número de objetivos farmacológicos putativos a microbianos, dirigiendo los esfuerzos sobre cómo disminuir
ish objetivos moleculares que deben probarse experimentalmente. Actualmente, comparativo
genómica asociada con pangenómica, genómica sustractiva, bioinfor-
Se aplican enfoques de análisis de vías metabólicas y matemáticas para alcanzar el desarrollo
Opción de nuevos antibióticos y lucha contra la resistencia a los antimicrobianos.
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4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 93
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Fig. 4.1 Una descripción general simple del enfoque basado en la genómica sustractiva para la identificación de objetivos.
La figura representa una descripción general simple del enfoque basado en la genómica sustractiva para objetivos
identificación. Cada nivel representa una regla diferente en el proceso hasta que el número reducido
de objetivos
et al. 2017 ), Haemophilus ducreyi (de Sarom et al. 2018), Corynebacterium diph-
theriae (Jamal et al. 2017), Corynebacterium pseudotuberculosis (Hassan et al.
2014), Salmonella enterica subsp. (Hossain et al. 2017 ), Brucella melitensis
(Pradeepkiran et al. 2015 ). Shigella flexneri (Oany et al.2018 ), Streptococcus pneu-
Monia (Wadood et al. 2018), Escherichia coli O157: H7 (Mondal et al. 2015),
Fusobacterium nucleatum (Kumar et al. 2016), Bacillus anthracis (Rahman et al.
2014), Salmonella typhi (Mukherjee et al.2019), Mycobacterium tuberculosis
(Hosen et al. 2014; Waman y col. 2019 ) y muchos otros patógenos.
Se pueden aplicar múltiples reglas en el ámbito del enfoque de la genómica sustractiva.
Según el número de genomas secuenciados, se dispone de estudios in silico e in vitro
bases de datos específicas para cada microorganismo y el orden de aplicación del
Página 108
94 M. Santana y col.
Tabla 4.3 La lista de algunas bases de datos de identificación y priorización de objetivos, herramientas web,
y software
Una aplicación útil para priorizar los objetivos farmacológicos en patógenos es la predicción de
interdependencia de moléculas en reacciones bioquímicas. Estas interacciones bioquímicas
ciones pueden involucrar cientos a miles de metabolitos y reacciones enzimáticas,
que participan en diferentes subconjuntos en el metabolismo microbiano. Aunque diferente
tipos de biomoléculas (nucleótidos, carbohidratos, lípidos y aminoácidos) constituyen
la complejidad del metabolismo microbiano, interacción proteína-proteína o proteína-ADN
Actualmente, las ciones son el foco de estudio.
La predicción de interacciones de metabolitos puede proporcionar información clave sobre supuestos
objetivos implicados en el proceso patógeno y de virulencia, adaptación y respuesta a
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estrés. Las redes biológicas siguen una arquitectura estándar, donde genes, proteínas,
y los compuestos están representados por nodos, que están conectados por aristas que representan
enviado a través de interacciones proteína-compuesto, proteína-gen, proteína-proteína y
reacciones metabólicas (Nikolsky et al. 2005).
Después de secuenciar o recuperar datos de bases de datos en línea, un genoma completo o
Se puede aplicar una red metabólica parcial (Fig. 4.2). El proceso de filtrado puede con-
bibliografía, tamaño y ubicación celular de la proteína, calidad de la estructura terciaria,
capacidad farmacológica de las proteínas modeladas y homología con el hospedador. Diversas herramientas online
se puede utilizar para generar redes.
Página 109
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 95
Fig. 4.2 El flujo de trabajo del análisis de redes metabólicas. La figura representa una descripción general de meta-
Reconstrucción y análisis de redes bolic para la identificación de objetivos.
Página 110
96 M. Santana y col.
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Los análisis de robustez de las enzimas evalúan las fracciones susceptibles de una red metabólica
que se pueden utilizar para la selección de fármacos (Chavali et al. 2012 ). Restringir el metabolismo
flujo a través de la inhibición parcial o completa de una reacción catalizada por enzima de un
La red metabólica permite la identificación de la robustez de la enzima (Chavali et al.
2012). Los efectos producidos sobre el flujo objetivo (por ejemplo, producción de biomasa, carga,
masa y energía equilibrada) revelan el impacto de la inhibición y, por lo tanto, la puta-
relevancia tiva de la diana (Chavali et al. 2012).
Por ejemplo, el aumento de Mycobacterium tuberculosis multirresistente (Koch y
Mizrahi 2018 ) motivó el modelado del metabolismo de las micobacterias. Elevado
datos de rendimiento asociados con la reconstrucción de la red a escala del genoma con
La matemática basada en cepas (CB) genera el fenotipo de la droga, la tasa de crecimiento específica,
y predicciones del estado metabólico (Rienksma et al. 2014). Aunque la enzima robusta
Los análisis de sensibilidad pueden proporcionar descripciones precisas del metabolismo (Schilling y
Palsson 2000 ; Jamshidi y Palsson 2007 ; Fang y col. 2010 ; Raghunathan y col.
2010 ), la escasez de parámetros cinéticos de cada enzima complica el genoma
modelado a escala. Más recientemente, Chichonska y sus colaboradores desarrollaron un
enfoque basado en experimentos putacionales para el mapeo de interacciones de drogas-objetivo en
inhibidores de quinasa (Cichonska et al. 2017 ). Usando el algoritmo de regresión basado en kernel
como modelo de predicción, proporcionaron un modelo para la identificación de nuevos objetivos
selectividad para aplicaciones de reutilización de fármacos (Cichonska et al. 2017 ). Aunque
Este enfoque no fue desarrollado para medicamentos contra microbios, la misma estrategia puede
se aplicado.
En cuanto a los virus, debido al reducido número de proteínas, la investigación es
se centró en la interacción del virus huésped y la perturbación de subconjuntos metabólicos durante
la infección. Conjuntos de datos PPI (interacciones proteína-proteína) como VirHostNet
(Guirimand et al. 2015 ), VirusMentha (Calderone et al. 2015), HCVpro (Kwofie
et al. 2011 ) y HHID6 (Ptak et al.2008 ) permite aprovechar las infecciones virales como
redes. Otras bases de datos y herramientas de interacción del patógeno del huésped se muestran en
Mesa 4.4 .
Un estudio que investiga las interacciones del virus huésped reguladas en la reproducción del VIH-1 en etapa temprana.
ciclo de licación reveló 213 factores celulares del huésped, 40 factores novedosos que influyen en la
iniciación de la síntesis de ADN del VIH-1 y 5 proteínas con influencia diversa a nivel nuclear
importación de la integración del ADN viral (Konig et al. 2008 ). La identificación del objetivo en
Las primeras etapas en las fases iniciales de la infección por virus se han utilizado como objetivo terapéutico.
obtiene. Se pueden desarrollar pequeñas moléculas para bloquear el proceso de la etapa temprana en el
interacciones del virus del hospedador, como la adhesión, la penetración y la eliminación de la capa (Konig
et al. 2008).
Además de las bacterias, los virus son el segundo foco principal de interacción entre el huésped y el patógeno.
estudios de investigación (Zhou et al. 2013 ), pero también se han realizado enfoques de redes metabólicas
aplicado a la identificación de objetivos de fármacos antifúngicos (Remmele et al. 2015 ;
Kaltdorf y col. 2016 ). Kaltdorf y col. ( 2016) aplicó la combinación de diferentes
Página 111
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 97
)
ekir
) ) 2013 ) ) ) ) ) ) ) ) (continuación)
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2017 2016 2014 2007 2015 2015 2011 2018 2012 2008
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pmc// https:
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elopment
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,
S. cerevisiae
interacciones de la proteína irus (VHC) y
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M. musculus
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ork y pathw
reconstrucción de ork - bases de datos y herramientas
H. Sapiens,
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biológica
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Interacción con el hospedador y red metabólica
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Interacción atógena
athogen y coxiella atw
aCI-db) eMe
4.4 Interacción
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Interacción
hospedadoratógeno-huésped
athogen
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de interacción irusMentha
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Página 112
98 M. Santana y col.
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Página 113
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 99
Cuadro 4.5 Diferentes métodos in silico orientados a los estudios de dianas farmacológicas
Métodos solicitados
Organismo Enfermedad análisis Salir Referencia
Entamoeba Amebiasis MOLREP; REFMAC Identificado el activo Malik y col.
histolytica 5,5; FOCHA; PyMOL; sitio de Entamoeba (2019)
MOLPROBIDAD; DS histolytica arginasa
suite 4.0; AutoDock (EhArg); novela
Vina Tools; Gromacs drogas de la droga
5.1.4 suite; PRODRG; Biblioteca
MM –PBSA
Candida albicans Hongos MODELO SUIZO Modelo 3D del C. Semenyuta
infecciones servidor; ERRAT; albicans FBA-II como et al. (2019)
PROCHECK; el objetivo contra
Herramientas de AutoDock; resistente a los azol
Accelrys DS (ver. patógenos fúngicos
2.5.5); Chem- Axon
Bosquejo de Marvin
5.3.735; Avogadro
v1.1.1; Accelrys DS
Mycobacterium Tuberculosis Vías metabólicas 5 proteínas como Uddin y col.
tuberculosis (KEGG; Clustal droga potencial (2019)
Omega; Blastp; objetivo
DEG); AutoDock v
4.2.6; Herramientas de AutoDock
Estafilococo Infeccioso Modelado molecular, Nanoplexes como Hassan
aureus enfermedades Malla Ewald (PME) entrega prometedora et al. (2019)
causado por método; GROMACS; sistema para combatir
meticilina Infecciones por MRSA
resistente
(continuado)
Página 114
100 M. Santana y col.
Métodos solicitados
Organismo Enfermedad análisis Salir Referencia
Disentería de Shigella flexneri 2a KEGG; BLASTp; 6 objetivos únicos Molina
CUERDA; ExPASy; et al. (2018)
MODELLER v9;
PROCHECK;
SUIZO- MODELO
Espacio de trabajo; APBS
servidor; PyMOL;
Servidor CASTp;
BindingDB; Zinc
base de datos; PubChem;
Molinspiration;
Buscar; Droga-
herramienta de semejanza; OSIRIS
Explorador de propiedades;
ADME SARfari;
admet-SAR; suizo
base de datos; QikProp
Corynebacterium Linfa- Patosistemas Nuevo putativo Parise y col.
pseudotuberculosis adenitis Integración de recursos objetivo, el gen (2018)
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
son Centro (PATRIC) nrdF2 - descrito
como un objetivo potencial
de M. tuberculosis
Virus del zika Zika viral Software Protparam; Algunos compuestos Chellasamy
infección, Índice alifático mostró un mejor y
dengue, método; Kyte- afinidad de unión Devarajan
chikungunya Método Doolittle; con sobre de Zika (2019)
Kyte-Doolittle proteína comparada
gráfico de hidropatía; al virus del dengue
Clúster Omega
software;
MODELO SUIZO
servidor; ALBOROTO
y PROSA (Proteína
Análisis de estructura)
software; ChemAxon;
AutoDock
Trypanosoma cruzi Chagas BLASTp; Aspártico del VIH Castilho
CL-Brener MODELLER 9v16; inhibidores de la peptidasa et al. (2018)
UCSF CHIMERA; unirse a lo activo
ERRAR y VERIFICAR sitio de la enzima
3D (servidor SAVES (ritonavir y
y MOLPROBIDAD); lopinavir tiene el
ClustalW; Pymol mayor afinidad); T.
v1.8.2.1; Alinear TM aspartilo cruzi
algoritmo; PubChem; la peptidasa puede ser
Maestro; PROPKA; el intracelular
GlideXP; objetivo
(continuado)
Página 115
4 Enfoques In Silico para priorizar los objetivos de los fármacos en patógenos 101
Métodos solicitados
Organismo Enfermedad análisis Salir Referencia
Haemophilus Chancroide software ortoMCL; 3 dianas farmacológicas de Sarom
ducreyi Gitano; BLASTp; albergado por et al. (2018)
SurfG +; SignalP y patogenicidad
Transmembrana islas
Predicción de hélice
servidor; InterProScan;
Herramienta MHOLline;
DEG; Autodock vina;
OpenBabel; Quimera;
PoseView; KEGG;
Treponema Sífilis software ortoMCL; Seis medicamentos identificados
Kumar
pallidum Herramienta MHOLline; objetivos Jaiswal
DEG; Molegro Virtual et al. (2017)
Estibador; KEEG
Gitano; BLASTp;
SurfG +
Plasmodium Malaria MODELADOR; Identificado un Vydyam
falciparum I-TASSER; PyMOL; compuesto, B02 et al. (2019)
MolProbity; YASARA que inhibió un
Servidor de minimización; sensible a los fármacos P.
PubChem; PRODRG cepa falciparum
servidor; Autodock y multidrogas
Vina; MGLTools; parásito resistente
Puntaje AMBER
Software Toxoplasma gondii Toxoplasmosis Gaussian 09; Compuestos de Molina
Web de SWISS-Model la et al. (2018)
servidor; UCSF tiazolidinediona
Quimera 1,12; núcleo tiene un
Servidor web ProFunc; preferencia por
Herramientas de AutoDock proteína quinasas de
v1.5.6; BIOVIA T. gondii , siendo
Estudio Discovery prometedor
Visualizador compuestos para
v16.1.0.15350; UCSF anti-toxoplasmosis
Chimera v1.12; actividad
MCPB.py; Gaussiano
09; Malla de partículas
Método de Ewald;
Algoritmo SHAKE;
AMBER16;
AmberTools18 y
software escrito por uno mismo
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
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Capítulo 5
Biología molecular y de sistemas
Enfoques para analizar la tolerancia a las drogas
Células persistentes bacterianas
X. Duan · Y. Fu · L. Yang ( ✉ )
Facultad de Medicina, Universidad de Ciencia y Tecnología del Sur,
Shenzhen, Guangdong, República Popular China
correo electrónico: yangl@sustech.edu.cn
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 109
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
Opiniones sobre agricultura 46, https://doi.org/10.1007/978-3-030-53024-2_5
Página 124
110 X. Duan y col.
Abreviaturas
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LC-MS / MS Cromatografía líquida - espectrometría de masas / espectrometría de masas
LPS Lipopolisacáridos
NGS Secuenciación de próxima generación
PÁGINA Electroforesis en gel de poliacrilamida
SILAC pulsado Marcado de isótopos estables pulsados con aminoácidos
QS La detección de quórum
REINA Evaluador cuantitativo de energía celular
Secuencia de ARN Secuenciación de ARN
sfGFP Proteína verde fluorescente de supercarpeta de maduración más rápida
TA Sistemas de toxina-antitoxina
TCA Ciclo del ácido tricarboxílico
YFP Proteína amarilla fluorescente
Tn-seq Secuenciación del sitio de inserción del transposón
5.1 Introducción
Las persistentes son una subpoblación de bacterias isogénicas que pueden sobrevivir incluso después de la exposición.
seguro a dosis altas de antibióticos (Lewis 2010). A diferencia de las bacterias, obtienen antibióticos.
resistencia mutando los genes diana o adquiriendo los genes de resistencia (Blair et al.
2015), la tolerancia de los persistentes a los antibióticos se debe al hecho de que las células bacterianas
entrar en estado no replicativo bajo la presión de la droga donde pueden reanudar el crecimiento después
retirada de antibióticos del medio (Keren et al. 2004a ). La tolerancia y
Se ha demostrado que la persistencia facilita la evolución de la resistencia y conduce a la
aparición de resistencia a los antibióticos (Levin-Reisman et al. 2017). Este fenómeno
se observó hace más de 70 años (Hobby et al. 1942). Muchas tensiones ambientales
como la exposición a antibióticos, la presión inmunitaria y la inanición pueden reducir el crecimiento
tasa de bacterias y detener la división celular directa o indirectamente (Eng et al. 1991). La
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5 enfoques de biología molecular y de sistemas para analizar bacterias tolerantes a fármacos ... 111
El recuento de unidades formadoras de colonias (UFC) es uno de los métodos más básicos para cuantificar
bacterias en una muestra. En 1944, Joseph Bigger trató Staphylococcus patógeno
aureus con penicilina que resultó en lisis. Él plateó este líquido transparente y
encontró una en un millón de células persistentes de S. aureus dentro del cultivo celular por medio de
Recuento de UFC (más grande 1944). Este método simple y útil proporciona un método muy directo.
resultado para que analicemos la proporción de células persistentes dentro de la población
ción. Sin embargo, el ensayo de CFU no pudo medir las bacterias latentes profundas que no
comienzan a volver a crecer en poco tiempo (Pu et al.2019).
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112 X. Duan y col.
Los estudios anteriores se han centrado en las células persistentes en toda la población, que
solo proporcionan la medición de promedios y no pueden analizar los sub-
población. Para resolver este problema, algunos estudios comienzan a observar las células persistentes en
nivel de celda única (Tabla 5.1), desde el desarrollo de microfluidos transparentes
dispositivos (Unger et al. 2000). Balaban y sus compañeros de trabajo etiquetaron la alta persistencia
( hip ) mutante hipA7 y hipQ con proteína fluorescente amarilla y registró el
crecimiento de células bacterianas individuales dentro de los dispositivos de microfluidos mientras se tratan
con diferentes condiciones (Balaban et al. 2004). Con este dispositivo, tienen características
terizan dos tipos de persistentes que existen en toda la población. El tipo I persiste
generado en respuesta a un entorno hostil como el hambre, que activa la
persiste la vía de formación. Los persistentes de tipo II son generados continuamente por un
No hay mecanismo de cambio de tipo en ausencia de desencadenantes externos (Balaban et al.
2004). Cuando se inoculó la bacteria hipA7 en el dispositivo de microfluidos y se cultivó
en medio Luria-Bertani Lennox, la mayoría de las células tienen la misma tasa de crecimiento que
cultivos por lotes. Los persistentes, sin embargo, no se dividen bajo esta condición. Esto
estudio utilizó una proteína fluorescente amarilla expresada constitutivamente (YFP) bajo λP R ,
que puede distinguir las células en división y las células que no se dividen, pero no puede reflejar
el estado fisiológico de las bacterias (Fig. 5.1a ). Se espera que las células persistentes tengan un
baja tasa de síntesis de proteínas y el promotor ribosómico muestra una extremadamente baja
actividad. El grupo de Lewis puso una proteína verde fluorescente degradable (GFP) bajo
control del promotor ribosómico rrnB P1 y encontró un pequeño número de
existían células fluorescentes en toda la población (Fig. 5.1b ). Ellos ordenaron el
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Fig. 5.1 Representación esquemática del indicador basado en etiquetas fluorescentes para el estudio persistente. ( a )
Que expresa constitutivamente YFP bajo el control de? P R . ( b ) Expresión de GFP degradable bajo el
control de un promotor ribosómico, rrnB P1. ( c ) La inserción gfp y dsRed2 en M. tuberculosis
genoma. ( d ) El temporizador fluorescente en tándem que codifica sfGFP y Tdimer2 con un enlazador. ( e ) Estructura
de plásmidos pDiGc y pDiGi y esquema del principio FD. ( f ) Ilustración esquemática del
estructura genética de QUEEN. ( g ) Dibujo esquemático de la sonda de ATP basada en FRET
células fluorescentes tenues y brillantes y descubrió que las células tenues eran más tolerantes a
ofloxacina en comparación con las células brillantes (Shah et al. 2006 ). Este único fluorescente
El indicador basado en proteínas permitió la identificación de células persistentes dentro de todo el
población y aislamiento por clasificación de células activadas por fluorescencia (FACS). El destabi
La proteína fluorescente verde lizada puede diferenciar eficazmente las células individuales con
diferentes tasas de crecimiento cuando la expresión de GFP des está bajo el control de rrnB P1
promotor. Sin embargo, este indicador no puede distinguir las células persistentes y
células muertas si se quiere rastrear al persistente en diferentes condiciones, especialmente dentro de
células huésped. Combine rRNA-GFP des reporter con un rojo estable expresado constitutivamente
proteína fluorescente (DsRed2) que permite identificar las células que no crecen y
células en crecimiento de M. tuberculosis durante la infección (Fig. 5.1d ) (Manina et al.2015).
Otro indicador fluorescente de células de crecimiento lento es la proteína temporizadora. El temporizador es el
Variante DsRed S197T que cambia el color de la fluorescencia de verde a rojo con el tiempo
(Terskikh et al. 2000). El temporizador verde tiene una vía de maduración ramificada y
Emite fluorescencia verde rápidamente en células de división rápida, mientras que en crecimiento lento o no
células en crecimiento, el fluoróforo rojo se acumuló y maduró debido a la
tasas de síntesis de proteínas y emite una señal fluorescente roja (Strack et al. 2010).
El temporizador fluorescente podría usarse para identificar poblaciones de crecimiento lento según
la relación de fluorescencia rojo / verde. Con este sistema, los subconjuntos de crecimiento lento también
como subconjuntos de rápido crecimiento de la población de Salmonella en los tejidos del huésped fueron separados por
citometría de flujo basado en la señal fluorescente (Claudi et al. 2014). Un tipo similar de
El indicador de tasa de crecimiento celular basado en el tiempo de maduración es un temporizador fluorescente de dos colores (Xia
Página 128
114 X. Duan y col.
et al. 2018), que es una fusión de una proteína roja fluorescente de maduración más lenta (Tdimer2)
(Vrzheshch et al. 2000) y una proteína fluorescente verde súper carpeta de maduración más rápida
(sfGFP) (Pedelacq et al. 2006 ). Este temporizador fluorescente se expresa mediante una constitución
promotor activo, que puede marcar el crecimiento lento y el crecimiento detenido P. aeruginosa
células a nivel de una sola célula (Fig. 5.1c).
Los sistemas discutidos anteriormente se basan en el fluorescente expresado constitutivo
proteínas. A continuación, nos centraremos en los sistemas informadores que se basan en el inductor y el
mina la dinámica de replicación basada en la dilución de fluorescencia. En este sistema, un fluo-
La proteína rescente se expresa bajo el control de un promotor inducible estrictamente regulado.
Después de la inducción, la división de células individuales en condición libre de inductor puede ser
controlada por la medición de la concentración de GFP (Roostalu et al. 2008). En el
cultivos de crecimiento exponencial, la gran mayoría de las células de E. coli se dividieron
formalmente. Sin embargo, se observaron subpoblaciones divididas y no crecientes cuando
cultivo en fase estacionaria se diluyó en medio fresco (Roostalu et al. 2008).
Helaine y colaboradores modificaron este sistema de dilución de fluorescencia colocando un
proteína roja fluorescente inducible (DsRed o mCherry) y otra constitutiva
proteína fluorescente verde mejorada (EGFP) en un plásmido (Fig. 5.1e ). Usando esto
enfoque, demostraron que muchas células de Salmonella no se replican sino que parecen
entrar en un estado latente y, por lo tanto, sobrevivir al tratamiento con antibióticos in vivo en el
modelo de infección por macrófagos (Figueira et al. 2013; Helaine y col. 2010, 2014 ; Saliba
et al. 2016; Stapels y col. 2018).
Una característica común de las células persistentes es el bajo nivel de ATP intracelular (Conlon
et al. 2016; Dorr y col. 2010 ; Pu y col. 2019; Shan y col. 2017). Codificado genéticamente
Se han desarrollado sensores fluorescentes para la medición de ATP intracelular de bacterias.
oped, incluido QUEEN (evaluador cuantitativo de energía celular) (Yaginuma et al.
2014) y ATeam (indicador de adenosina 5′-trifosfato basado en la subunidad Epsilon
para Analytical Mediciones) (Maglica et al. 2015 ). QUEEN es ATP radiométrico
indicador que consta de una sola GFP y una proteína de unión a ATP bacteriana (Fig. 5.1f).
ATeam es un sensor de transferencia de energía por resonancia de fluorescencia (FRET), que
planteado de una proteína fluorescente cian (CFP) y YFP que estaban conectados por el ε
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subunidad de Bacillus subtilis FoF1-ATP sintasa (Fig. 5.1g) (Imamura et al. 2009).
Sin embargo, no hay ningún estudio que aplique sensores de ATP para estudiar las células persistentes en un solo
nivel celular.
Los reporteros fluorescentes son una herramienta muy poderosa para detectar heterogeneidad dentro de las bacterias.
poblaciones riales. Combinando estos reporteros con microscopio avanzado, citometría de flujo
La plataforma de etry y microfluídica puede ayudar a aislar las células persistentes dentro del
toda la población.
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5 enfoques de biología molecular y de sistemas para analizar bacterias tolerantes a fármacos ... 115
Biblioteca Número
Organismos Herramientas escala de genes Antibiótico Referencia
Detección de mutantes de transposón
P. aeruginosa pTn Mod -OGm 5000 9 Ofloxacina De Groote y col.
PA14 plasposón (2009)
E. coli mini-Tn 10 11,748 1 Ampicilina Li y Zhang
(2007)
P. aeruginosa ISphoA / ja 5000 1 Carbenicilina Manuel y col.
PAO1 (2010)
S. aureus pBTn 9120 13 Levofloxacina Wang y col.
USA500 (2015)
M. tuberculosis ES 1096 basado 576 1 Isoniazida Camacho y col.
plásmido pCG113 ratones tratados (1999) y Dhar
y McKinney
(2010)
Mycobacterium Tn phoA 125 1 Infección de ratones Parti y col. (2008)
fortuitum modelo
M. bovis BCG Tn5370 3500 1 Deficiente en Glickman y col.
formación del cordón (2000)
E. coli K12 Mini-Tn 10 5000 2 Kanamicina Hu y Coates
(2005)
S. aureus pTM239- 2 Ciprofloxacina Wang y col.
Hombre nuevo pTM244 (2018)
Secuenciación de transposones
E. coli MG1655 mini-Tn 10 200.000 Gentamicina Shan y col. ( 2015 )
Uropatógeno EZ-Tn5 360.000 Ampicilina Molina-Quiroz
E. coli et al. (2016)
P. aeruginosa pIT2-Tn5 100.000 Ciprofloxacina Cameron y col.
PAO1 (2018)
Cribado de la biblioteca de mutantes por deleción
E. coli K-12 Knockear 3985 2 Ampicilina Ma et al. (2010)
E. coli K-12 Knockear 3985 37 Ofloxacina Cui y col. ( 2018 )
Cribado de la biblioteca de sobreexpresión
E. coli K-12 Sobreexpresión 4500 2 Ampicilina Spoering y col.
(2006)
Los transposones son elementos genéticos que pueden saltar de una ubicación genómica a
otro, que puede influir profundamente en la expresión génica. Mutagénesis de transposones
es un enfoque poderoso para generar mutaciones genéticas aleatorias entre bacterias
genomas. Esta técnica ha sido ampliamente utilizada para identificar genes individuales involucrados.
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en resistencia a los antibióticos (Gallagher et al. 2011 ), la virulencia (Fu et al. 2013) y per-
formación de células hermanas (Molina-Quiroz et al. 2016; Shan y col. 2015).
Las bibliotecas de mutantes de transposones de varias especies bacterianas (Tabla 5.2 ) han sido
construido y examinado para persistencia de genes relacionados con la formación de células en ciertas condiciones
ción. Se seleccionaron un total de 5000 mutantes de inserto de transposón PA14 de P. aeruginosa
para mutantes persistentes bajo la presión del tratamiento con ofloxacina. Este estudio tiene
identificó 9 genes relacionados con la formación persistente (De Groote et al. 2009 ). Proyección de
La biblioteca mutante de E. coli con ofloxacina encontró que la inactivación de phoU causa pan-
susceptibilidad a varios antibióticos y disminuyó la persistencia (Li y Zhang
2007). PhoU es un regulador negativo del regulón Pho e implicado en el fosfato
metabolismo (Wanner 1990). Inactivación del homólogo de PhoU en M. tuberculosis
también resultó en un defecto en la persistencia (Shi y Zhang 2010). Detección de S. aureus
La biblioteca de mutantes de inserción de transposones ha identificado 13 genes que contribuyen a
formación de células hermanas, que participan en la fosforilación oxidativa, tricarboxílico
ciclo del ácido (TCA), glucólisis, ciclo celular y transportadores ABC (Wang et al.
2015). Mediante el cribado de 576 mutantes de inserción de M. tuberculosis en pacientes tratados con isoniazida
modelo de persistencia de ratones, se encontró que la interrupción de cydC disminuye la persistencia
tence en ratones tratados con isoniazida (Dhar y McKinney 2010 ). MT13, codificando una trans-
factor regulador scriptional en M. fortuitum (Parti et al. 2008) y codificación pcaA
una sintasa de ácidos micólicos en M. bovis BCG (Glickman et al. 2000) fueron identificados como
genes determinantes de persistencia mediante selección de bibliotecas de inserción.
El cribado de alto rendimiento basado en la biblioteca de mutantes de transposón ha contribuido significativamente
significativamente al descubrimiento de genes de persistencia. Sin embargo, necesita una cantidad considerable de
trabajo y tiempo para evaluar el fenotipo de cada mutante en toda la biblioteca. En lugar de,
secuenciación del sitio de inserción del transposón (Tn-seq), que combina el transposón
mutagénesis y secuenciación de próxima generación (NGS), proporciona una potente y compleja
enfoque exhaustivas de los estudios del genoma de ancho (Mazurkiewicz et al. 2006; camioneta
Opijnen y Camilli 2013 ). Generando la biblioteca y el cultivo de mutantes de transposones
bajo diferentes condiciones de estrés, se puede rastrear la abundancia relativa de mutantes
mediante secuenciación. El cambio en la abundancia relativa de una determinada mutación refleja que
el gen es crítico (disminución de la abundancia relativa) o deletéreo (aumento de la relación
abundancia tivo) bajo que condición específica (Goodman et al. 2011; van Opijnen
et al. 2009). Tales estudios llevaron a la identificación de miles de genes persistentes en
diferentes microorganismos, entre ellos E. coli (Molina-Quiroz et al.2016 ; Moyed y
Bertrand 1983 ) y P. aeruginosa (Cameron et al.2018)).
La biblioteca de mutantes por deleción de Keio consta de 3985 deleciones de un solo gen definidas de todos
genes no esenciales en E. coli K-12 (Baba et al. 2006 ; Yamamoto et al. 2009 ). Dos
genes de producción de energía, sucB (que codifica la subunidad E2 del 2-oxoglutarato deshidratado
drogenasa) y ubiF (que codifica 2-octaprenil-3-metil-6-metoxi
1,4-benzoquinol oxigenasa implicada en la biosíntesis de ubiquinona) se identificaron como
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5 enfoques de biología molecular y de sistemas para analizar bacterias tolerantes a fármacos ... 117
persiste genes relacionados mediante el cribado de la biblioteca de mutantes por deleción de Keio (Ma et al.
2010). Los antibióticos bacteriostáticos podrían inducir el cambio de bacterias a persistentes.
Mediante el cribado de la biblioteca de mutantes por deleción de Keio, se encontró que 37 y 9 genes tenían
la deficiencia de rifampicina y tetraciclina induce la formación de persistentes, respectivamente.
Esos genes se mapearon en reparación de ADN, transcripción, transportadores, lipopolisacáridos.
biosíntesis de carides (LPS), biosíntesis de flagelos, metabolismo y traducción
vía (Cui et al.2018 ). Excepto la biblioteca de mutantes de inactivación y deleción, la
La biblioteca de expresión también se ha utilizado para la identificación de genes relacionados con persistentes.
(Spoering et al. 2006). Al seleccionar la biblioteca de expresión, el grupo de Lewis encontró glpD
(que codifica una sn-glicerol-3-fosfato deshidrogenasa anaeróbica ) y plsB (codificado
ing una sn-glicerol-3-fosfato aciltransferasa) participan en la formación de células persistentes
ción en E. coli (Spoering et al.2006 ).
El cribado o secuenciación de alto rendimiento basado en transposones tiene el potencial de
revelan funciones putativas para la mayoría de los genes no esenciales dentro de un organismo. Sin embargo,
esta tecnología omitió los genes esenciales que pueden desempeñar un papel importante en
persistir la formación.
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5.5.1 Enfoques genómicos para estudios de Persister
Las tecnologías de secuenciación de próxima generación (NGS) hoy en día pueden generar grandes
cantidades de secuencias del genoma completo rápidamente. El programa de evolución experimental
ha permitido a los investigadores obtener mutantes de alta persistencia. Combinación de exper-
La evolución mental con NGS es capaz de identificar las mutaciones que resultan en altos
fenotipo de persistencia. El primer estudio en genética persistente fue realizado por
Moyed y Bertrand. En este estudio, identificaron el primer gen de alta persistencia
hipA por concepto de mutagénesis y selección (Moyed y Bertrand1983 ). El patógeno
gens en un huésped generalmente se enfrenta a muchas tensiones, como antibióticos, inanición y
sistema inmunológico, y estas tensiones pueden facilitar que los patógenos adquieran alta persistencia
Tence mutaciones in vivo (Didelot et al. 2016 ). Las cepas de alta persistencia han sido
informado en Candida albicans clínicamente aislada (LaFleur et al.2010), P. aeruginosa
(Mojsoska et al. 2019), S. aureus (McAdam et al.2011), S. epidermidis (Haunreiter
et al. 2019 ) y M. tuberculosis (Muller et al. 2013 ). Los enfoques genómicos tienen
también permitió la identificación de los sitios de mutación asociados de alta persistencia de la
aislados clínicos. Mutaciones puntuales de relA (que codifica una pirofosfocinasa GTP) y
rlmN (que codifica una metiltransferasa ribosómica) promueve la infección persistente por S. aureus
en el hospedador (Gao et al. 2010 ). Mojsoska y su colega proyectaron 467 longitudinales
aislados clínicos de P. aeruginosa de 40 pacientes con fibrosis quística y clasificados
25,7% de ellos como variantes de alta persistencia. Se utilizó la secuenciación del genoma completo para
identificar 9 genes candidatos de 'cadera' entre esas variantes y el factor sigma que codifica
Se descubrió que el gen rpoN es el gen de 'cadera' superior (Mojsoska et al. 2019 ). Análisis de
Página 132
118 X. Duan y col.
Fig. 5.2 Enriquecimiento persistente para estudios ómicos. ( a ) Cultivo de bacterias de exposición cíclica a antibióticos
ics para enriquecer los mutantes de alta persistencia para el análisis genómico. ( b ) Aislar el desencadenado o nativo
persistentes para análisis transcriptómico, proteómico y metabolómico
Las secuencias del genoma de los aislados clínicos de S. epidermidis evolucionados dentro del hospedador han
reveló muchas mutaciones en genes reguladores y metabólicos que pueden resultar en
aumento de la tolerancia a los antibióticos (Haunreiter et al. 2019 ).
En los experimentos de evolución in vitro , los investigadores simulan el tratamiento clínico
mentos al exponer la población bacteriana a las altas concentraciones de antibióticos
intermitentemente. Usando esta estrategia, los mutantes de alta persistencia de M. tuberculosis han
enriquecido con el tratamiento con estreptomicina y rifampicina (Torrey et al. 2016 ). Diez
Los ciclos de tratamiento con ampicilina dieron como resultado la selección de mutantes de E. coli con alta
nivel de tolerancia a los antibióticos aumentando el tiempo de demora tras la dilución en medio fresco
(Figura 5.2a ) (Fridman et al. 2014 ). Dosificación una vez al día de tratamientos con aminoglucósidos
demostraron desarrollar niveles extremadamente altos de mutantes de E. coli tolerantes a múltiples fármacos
(Van den Bergh y col. 2016 ). Las mutaciones acumuladas se pueden detectar comparando
las secuencias del genoma entre mutantes ancestrales y evolucionados y se observa
que a menudo se requieren múltiples mutaciones para los fenotipos evolucionados.
¿Qué hace que las células persistentes sean diferentes de las células normales? Por qué las células persistentes son
¿Más tolerante a los antibióticos en comparación con las células normales? Los investigadores han preguntado
esas preguntas durante muchos años. Ambos enfoques genómico y metagenómico son
herramientas muy poderosas para estudiar los mutantes de alta persistencia. Sin embargo, el genoma
La secuencia de células persistentes es idéntica a la de las células de crecimiento normales de la población.
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5 enfoques de biología molecular y de sistemas para analizar bacterias tolerantes a fármacos ... 119
lo que significa que el enfoque genómico no es adecuado para el estudio de persistentes ingenuos. Uno
El enfoque para abordar estas preguntas es analizar y comparar la expresión global
perfiles de las células persistentes y células regulares. Este enfoque se ha aplicado
exclusivamente para estudiar E. coli , Acinetobacter baumannii , M. tuberculosis y
Salmonella . Los estudios transcriptómicos se han basado anteriormente principalmente en microarrays
tecnología. Hasta la fecha, con el desarrollo de la tecnología de secuenciación de próxima generación
gies, la secuenciación de ARN (RNA-seq) es ahora la tecnología principal para analizar la
transcriptoma completo de persistentes.
El primer estudio transcriptómico de persistentes fue realizado por el grupo de Lewis.
Trataron el cultivo de E. coli con alta concentración de ampicilina, lo que provocó
lisis de células regulares, y recogió los persistentes supervivientes por centrifugación
(Figura 5.2b). Los perfiles de expresión de las células persistentes se determinaron utilizando un
microarray. Alrededor de 300 genes se sobreexpresaron en las células persistentes, incluyendo
módulos de toxina-antitoxina (TA) y otros genes que pueden bloquear importantes
funciones como la traducción y la replicación (Keren et al. 2004b). Comparando el
Perfiles de expresión de persistentes inducidos por el tratamiento con ampicilina con isofloxacina
persistentes persistentes, 22 genes comunes fueron inducidos y 139 genes comunes fueron
reprimido en ambos grupos. Los genes activados transcripcionalmente en ambos antibióticos
tratamiento inducido persiste que codifica ribosomal, respuesta al estrés y regulador
proteínas, la mayoría de los genes reprimidos están involucrados en el metabolismo energético, proteínas
síntesis y transporte de pequeñas moléculas. Los genes cambian comúnmente en diferentes
Los persistentes aislados de antibióticos entrantes pueden estar involucrados en los persistentes conservados para
vías de formación (Kaldalu et al. 2004 ). Mediante el uso de RNA-seq, se identificaron 943 genes
con una expresión dos veces mayor en la ceftazidima aislada A. baumannii persister
las células en comparación con las células normales (Alkasir et al. 2018). La D-cicloserina es un anti
Medicamento contra la tuberculosis, que puede lisar M. tuberculosis de manera eficaz. El transcriptoma
análisis de M. tuberculosis inducido por tratamiento con D-cicloserina persiste el carácter
izado 282 genes regulados positivamente y 1408 genes regulados negativamente durante al menos el doble
(Keren et al. 2011).
Uso de antibióticos bactericidas para matar las células regulares dentro de la población que representa.
Resiente un método muy sencillo para aislar las células persistentes. sin embargo, el
La presencia de antibióticos podría inducir el cambio de genes no relacionados con persistentes.
formación. Además, los enfoques transcriptómicos globales proporcionan un promedio
valor de la expresión génica sobre la población sobreviviente, que no puede proporcionar información
mación sobre persistentes preexistentes. Un enfoque para aislar persistentes preexistentes es
la combinación de clasificación de células activadas por fluorescencia (FACS) con la clasificación de células fluorescentes
persistir a los reporteros. Usando este enfoque, persistentes preexistentes de E. coli
Se aislaron cultivos planctónicos para el análisis transcriptómico (Henry y
Brynildsen 2016; Jain y col. 2016; Matsumoto y col. 2018 ; Shah y col. 2006). La
El análisis del perfil de expresión génica mediante este enfoque tiene el potencial de ampliar nuestra
comprensión de los mecanismos implicados en la formación de persistentes.
Recientemente, repeticiones palindrómicas cortas agrupadas regularmente interespaciadas (CRISPR)
También se han aplicado enfoques para estudiar las persistentes bacterianas (Leung et al.
2015). Otra perspectiva con respecto a abordar más a fondo la transcripción y la postranscripción
La regulación descriptiva incluye el uso de CRISPRi (interferencia CRISPR) (Lee et al.
Página 134
120 X. Duan y col.
2019a ) para investigar los mecanismos de las persistentes dentro del ciclo de vida de las bacterias.
celda rial dinámicamente.
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 94/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
hermana (Lilley y Friedman 2004). PÁGINA 2D se ha utilizado en varios estudios de per-
proteomas hermanas. Por ejemplo, Starck et al. utilizó PÁGINA 2D para caracterizar el
no replicante M. tuberculosis en condiciones anaeróbicas (Starck et al. 2004). 2D
PAGE también se ha utilizado para caracterizar los cambios en los patrones de proteoma de la
M. tuberculosis inducida por la infección persiste con el tiempo (Betts et al. 2002 ). Uno de los
El gen altamente regulado al alza Rv3290c (que codifica una lisina-e aminotransferasa) ha sido
demostró estar involucrado en la formación de persistentes de micobacterias (Duan et al. 2016 ;
Lee y col. 2019b ). Albrethsen y col. LC-MS / MS sin etiqueta usada (líquido
cromatografía-espectrometría de masas / espectrometría de masas) y bidimensional
DIGE (electroforesis diferencial en gel) y observó que la mayoría de las toxinas-anti-
Los sistemas de toxinas (TA) se regularon positivamente en el estado de no replicación (Albrethsen et al.
2013). PÁGINA 2D todavía tiene limitaciones en la medición global de proteínas debido a la
baja cobertura de proteínas, sensibilidad, rango dinámico y precisión (Gygi et al. 2000).
Para el análisis proteómico de escopeta, se digirieron proteínas complejas con
proteasa, como tripsina, la mezcla de péptidos resultante luego analizada por LC-MS
(Wolters et al. 2001). Enfoques sin etiquetas, incluida la etiqueta de afinidad codificada por isótopos
Se han desarrollado y desarrollado métodos basados en espectrometría de masas SWATH y
aplicado a muestras de M. tuberculosis no replicadas y reactivadas (Cho et al.2006 ;
Gopinath y col. 2015; Schubert y col. 2015 ). Muestras de proteína de antibióticos iso-
Lated E. coli (Sulaiman et al.2018) y Porphyromonas gingivalis (Li et al.2018 )
persistentes han sido analizados por LC-MS que reveló que la integridad de la membrana
La ridad y el estado redox celular son importantes para la formación de persistentes.
La proteómica también se ha aplicado para estudiar la población bacteriana tolerante a los antibióticos.
en biopelículas de P. aeruginosa . Se ha informado previamente que el antibiótico
Las poblaciones bacterianas tolerantes en las biopelículas de P. aeruginosa son células persistentes (Brooun
et al. 2000 ; Spoering y Lewis 2001). Por medio de bio-ortogonal no canónico
método de análisis proteómico de marcado de aminoácidos (BONCAT), Babin et al. ilustrado
que la motilidad flagelar y la síntesis de purinas son críticas para la persistencia de la tolerancia a los antibióticos
formación ERS (Babin et al. 2017). En el otro estudio, Chua et al. tratado P. aerugi-
biopelículas de nosa con colistina durante 48 h, se lavan las células, se recogen las fracciones persistentes
e investigó su perfil proteómico mediante marcaje de isótopos estables pulsados con
Método de aminoácidos (pulsado-SILAC). Las biopelículas de P. aeruginosa se cultivaron en
Página 135
5 enfoques de biología molecular y de sistemas para analizar bacterias tolerantes a fármacos ... 121
medio mínimo suplementado con L-lisina C12 utilizando cámaras de flujo. Después de matar
ing la población sensible a los antibióticos, medio fresco que contiene colistina y C13
Se utilizó L-lisina para marcar las proteínas recién sintetizadas de las células persistentes. La
La investigación anterior concluyó que los sistemas de detección de quórum y pili de tipo IV (QS) son
importante para el desarrollo de tolerancia a antibióticos en biopelículas (Chua et al. 2016). Pulsado
El enfoque SILAC también se ha utilizado para estudiar las proteínas que son importantes para
E. coli persisters reactivación (Spanka et al. 2019).
La formación de persistentes se asocia con una actividad metabólica reducida (Prax y
Bertram 2014 ). Se ha demostrado que la respuesta estricta inducida por inanición es
implicados en la formación de persistentes (Germain et al. 2013; Kaspy y col. 2013; Khakimova
et al. 2013). Se encontró que muchos genes asociados con el metabolismo afectan las bacterias
persistencia (Amato et al. 2014 ). Además, la metabolómica también se ha utilizado para pro-
archivar los cambios metabólicos de las bacterias desafiadas con antibióticos (Campos y
Zampieri 2019 ; Nandakumar y col. 2014; Zampieri y col. 2017 ). Este enfoque tiene
ha aplicado al estudio persisters en los años más recientes (Schubert et al. 2015).
Se ha identificado que el ácido aspártico y el glutamato son críticos para la persistencia de S. aureus .
ers metabolismo mediante perfiles de isotopólogos de glucosa completamente marcados con 13C, un conocido
enfoque de la metabolómica (Lechner et al. 2014 ). Proteómica y metabolómica
Los enfoques proporcionan información global al mecanismo de formación de persistentes desde
nivel de expresión de proteínas, lo que nos ayudó a desarrollar estrategias efectivas para erradicar
persiste durante la infección.
5.6 Conclusión
Página 136
122 X. Duan y col.
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Página 143
Capítulo 6
Papel de la herramienta de edición de genes CRISPR-Cas
en el manejo de antimicrobianos
Resistencia
Palabras clave CRISPR · Cas · Resistencia a los antimicrobianos · Transferencia de genes · ARN guía
· Binatos de ARN · ARN CRISPR · Anti-CRISPRs · ARN CRISPR precursor ·
Motivo adyacente al protospacer
R. Ghangal
Departamento de Biotecnología, Complejo CGO, Lodhi Road, Nueva Delhi, India
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 129
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
Opiniones sobre agricultura 46, https://doi.org/10.1007/978-3-030-53024-2_6
Página 144
130 AP Sarma y col.
Abreviaturas
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
dsRNA ARN de doble hebra
PAM Motivo adyacente al protospacer
6.1 Introducción
Página 145
6 Papel de la herramienta de edición genética CRISPR-Cas en la gestión de antimicrobianos ... 131
Las repeticiones palindrómicas cortas agrupadas regularmente interespaciadas sirven como sistema inmunológico.
tem de muchas arqueas y bacterias. Es un ejemplo de sistema inmunológico adaptativo y
implica una longitud corta de nucleótidos (elementos de ARN o ADN) obtenidos de
de bacteriófagos u otros elementos genéticos móviles extraños que invaden la bacteria
anfitriones riales o arqueales (Zhang et al. 2014b; Adli 2018). En 1987, Yoshizumi y su
colegas mientras realizaban un estudio sobre el gen "iap" observaron secuencias repetidas en
el gen. Esto se atribuyó a la clonación accidental de CRISPR junto con iap
gen (Ishino et al. 1987). Estas repeticiones contenían muchas secuencias intercaladas
cuya función era entonces desconocida. Posteriormente, en 1993, la diversidad de estas secuencias
se observó y esta propiedad se utilizó para diseñar un método llamado spoligotyping
(análisis de polimorfismo y unidades repetidas). En 2001, estos intercalados
Las secuencias se denominaron CRISPR (Mojica y Montoliu 2016; Horvath y
Barrangou 2010 ). Se ha encontrado que estas repeticiones van seguidas de un conjunto de
genes homólogos denominados genes asociados a CRISPR (Cas). Motivos de helicasas
y nucleasas se encontraron en estas proteínas Cas abogando por su participación en la
esqueleto de loci CRISPR. El locus CRISPR se compone de tres partes principales, a saber,
Genes Cas, secuencias líder y matrices espaciadoras (Horvath y Barrangou 2010 ;
Marraffini y Sontheimer 2010 ). La red CRISPR-Cas es un potencial robusto
sistema inmunológico que se produce en bacterias y arqueas que proporciona inmunidad a la
bacterias contra los invasores. La red comprende no solo bacteriófagos sino
también elementos genéticos móviles (Hale et al. 2009 ).
Las redes CRISPR-Cas se clasifican en dos clases sobre la base de
módulos efectores. El sistema CRISPR-Cas de clase 1 forma múltiples complejos debido a
moléculas efectoras de múltiples proteínas, mientras que en la categoría de clase 2 CRISPR-Cas utiliza
molécula efectora de proteína única. CRISPR-Cas se subdivide en tipos
(I-VI) y subtipos basados en genes distintivos y sus arreglos característicos.
El sistema CRISPR-Cas de clase 1 representa la mayoría (~ 90%) de los loci CRISPR-Cas
y comprende de tipo I, III y IV. Cas3 es el gen característico presente en los loci de
todos los sistemas CRISPR-Cas tipo I. Cas10 y Csf1 son genes característicos del tipo III y
IV, respectivamente. La segunda clase de red CRISPR-Cas incluye el tipo II, tipo V
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
y tipo VI con el gen característico Cas9, Cas12 (Cpf1) y Cas13 respectivamente
(McDonald et al.2019). Los tipos de sistemas CRISPR-Cas se clasifican además
en los siguientes subtipos: subtipos de tipo I (IA, IB, IC, IU, ID, IE, IF), tipo
Subtipos II (II-A, II-B, II-C), subtipos de tipo III (III-A, III-B, III-C, III-D), tipo V
subtipos (VA, VB, VC, VD, VE, VU) y tres subtipos de tipo VI (VI-A, VI-B,
VI-C) (Makarova et al. 2015 ; Koonin y col.2017). Se encuentran proteínas Cas1 y Cas2
en casi todos los sistemas CRISPR-Cas que juegan un papel significativo en la adquisición de espaciadores
ción en el mecanismo CRISPR (Nuñez et al. 2014). La clase divergente y el gran número
de proteínas Cas hacen que la clasificación de la red CRISPR-Cas sea un desafío
(Makarova y Koonin 2015; Makarova y col. 2015; Koonin y col. 2017 ). El personaje
Las características de los subconjuntos de CRISPR-Cas se mencionan en la Tabla 6.1.
En 2005, una investigación sugirió que los espaciadores se derivan de cromatografía extra
ADN somal o invasores extraños como bacteriófagos. La matriz espaciadora fue el indicador
que CRISPR era parte del sistema inmunológico adaptativo de bacterias (Pourcel et al.
Página 146
132 AP Sarma y col.
2005; Mojica y col. 2005; Bolotin y col. 2005 ). Posteriormente, primera evidencia experimental
Se publicó la afirmación de CRISPR como inmunidad adaptativa ( Hsu et al. 2014 ). Era
encontró que el locus CRISPR compuesto por secuencias de ADN obtenidas de la anterior
virus invasores en Streptococcus thermophilus (Hsu et al. 2014; Pennisi 2013).
El mecanismo CRISPR de degradación del genoma extraño implica principalmente tres pasos, como
mostrado en la Fig. 6.1 .
Página 147
,
,
es
, , uccae
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eyellazoohelcum
N/A
VI 2 Cas13 La proteína
R codificada
VI-A, VI-B1,
se une
Leptotrichia
VI-B2,
y Ruminococcus
escinde
VI-C,
Fusobacterium
shahii
VI-D
Prevotellab
bicirculans
Iceberg
perfoetens ), y
2018
-U1,
-U5 M567,
-U, V vicida
ariant
-U4, V , Bacilo
Cyanothece
, HD-771,
-B v-E, V
CG09_39_24,
-U3, V ), Karimi et al. (
-B, -D,
V V
Aliciclobacilo
, PCC 8801, 2017
-A, -CV
V -U2,rancisella
V cf. No
V 2 Cas12a (Cpf1)
Combina el módulo
V Vde Vinterferencia
F FX1acidoterrestris
con
Bacteria
el módulo
planctomicetos
Gordonia
adaptador
sp. thuringiensis
sp.
Rothiadentocariosa
RBG_13_48_10, Bacteria
A
A; oonin y col. (
-B ), K
2016
N/A -A, IV
IV 1 csf1 Utilice
generación
crRN
directamente
de
IV crRN
del alienígena
Thioalkalivibrio
R sp. K90mix, Rhodococcus jostii RHA1
,
, udayyeh y col. (
6803,
), Ab
2015
a et al. (
III 1 Cas10 Papel en la interferencia
III-A, III-B,
delStaphylococcus
III-C,
ácido
Synechocystis
III-D
nucleico
Methanothermobacter
Pyrococcusfuriosus
(diana)
epidermidis
sp. v
thermautotrophicus
), Makaro
ader DN L. NORTE.
, , 2015
,
oonin
Unaedad
biogénesis;
de inv
ardiente
II 2 Cas9 crRN
escote II-A, II-B, II-C,
Streptococcus
II-Cpneumophila
v lactamica
thermophilus
Micrarchaeumacidiphilum
ayARMAN-1
K
, v
,
, , MI.
ader ,
), Makaro
8802,
ardiente
nosotros fulgidus 2014
Yersinia
, SI v )
K12,
2019
N/A
I 1 Cas3 Actividad de
D helicasa;
IA, IB, actividad
IC, IU,
Archaeglob
ID,
Clostridium
nucleasa;
IE,
Bacilo
IF
Geobactersulfurreducens
halodurans
Cyanothecesp
degradación
kluyveri
colipseudotuberculosis
Shewanella
de inv putrefaciens CN-32
Subconjuntos del sistema CRISPR-Cas
capazypes
6.1
T T ClaseGen característico
Funciones de los
Subtipos
genes característicos
Especies bacterianas Referencias
McDonald Nuñez
y col.et(al. (
Página 148
134 AP Sarma y col.
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Fig. 6.1 Mecanismo del sistema CRISPR-Cas dentro de una bacteria. Adquisición del espaciador Step1:
El ADN espaciador del fago se integra con el locus CRISPR, el locus CRISPR comprende el espaciador
secuencias de invasores anteriores y en precrRNA. Este pre-crRNA y trac RNA forman una larga
Binato de ARN. Paso 2 El binato de ARN es cortado por la ARNasa III en pequeñas unidades. Step3 binatos de ARN
forma un multiplex con la proteína Cas9. Paso 4 El ARN guía identifica la secuencia PAM presente cerca
secuencia diana (ADN del fago). La maquinaria CRISPR-Cas9 corta el ADN en el sitio objetivo
Página 149
6 Papel de la herramienta de edición genética CRISPR-Cas en la gestión de antimicrobianos ... 135
ARN codificante que tiene secuencias homólogas a las secuencias repetidas (Jinek et al.
2012). El tracto-ARN se transcribe por separado y luego se reasocia al pre
crRNA y da como resultado la formación de binato de RNA.
• Corte de binatos de ARN (ARNr emparejado con ARN del tracto) por ARNasa III: En
sistema CRISPR tipo II, RNase III corta el dsRNA en pequeños segmentos de maduros
crRNA que posee voladizos o flancos de repeticiones. Finalmente una guía de ARN de 20
los nucleótidos se producen por escisión con nucleasas (Deltcheva et al. 2011 ;
Marraffini y Sontheimer 2010 ; Charranes y charranes 2011; Chylinski y col. 2011 ;
Karvelis y col. 2013 ; Carte y col.2008 ).
• Escisión del complejo de ácido nucleico de crRNA por Cas9: el crRNA maduro forma una
tiplex con proteína Cas9. Cuando un fago infecta una bacteria, el multiplex de crRNA
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fragmentos y Cas9 escinde el ADN del fago. Cas9 reconoce solo esas secuencias
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136 AP Sarma y col.
La resistencia a los antimicrobianos es una condición en la que los microbios (como bacterias, hongos,
virus y parásitos) desarrollan resistencia / inmunidad contra los agentes antimicrobianos.
Una de las causas de la resistencia a los antimicrobianos son las mutaciones. Las secuencias que causan
La resistencia a los antimicrobianos en las bacterias se puede editar para volver a sensibilizar a las bacterias.
hacia los antibióticos. Hay muchas nucleasas que se utilizan para la edición de genes como
endonucleasa homing (meganucleasa), activador de la transcripción como efector (TAE)
y nucleasas de dedos de zinc (ZNF). Sin embargo, existen ciertas limitaciones asociadas
con estas técnicas que se enumeran en la Tabla 6.2 .
La maquinaria CRISPR-Cas9 puede ser una herramienta de edición genética interesante y prometedora
para superar la resistencia a los antimicrobianos, como se muestra en la Fig. 6.2 . CRISPR-Cas9 es simple
y único entre los sistemas CRISPR ya que solo una proteína es suficiente para causar
el silenciamiento de genes (Shabbir et al. 2019 ; Kim et al. 2015 ;. Fernandes et al 2019). Como un
Como resultado, CRISPR-Cas9 ha sido la herramienta elegida para la edición de genes. Este potencial
fue informado por primera vez por los grupos de investigación de Doudna y Charpentier (Jinek et al. 2012 ). A
El equipo de investigadores dirigido por Zhang estuvo entre los primeros en utilizar el sistema CRISPR Cas9.
tem para la edición de genes en células eucariotas (Cong et al. 2013 ) . En CRISPR tipo II
mecanismo, guía de ADN facilita la maquinaria Cas9 para identificar el objetivo
Página 151
6 Papel de la herramienta de edición genética CRISPR-Cas en la gestión de antimicrobianos ... 137
Tabla 6.2 Limitaciones de las nucleasas comúnmente utilizadas para la edición de genes
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Fig. 6.2 CRISPR-Cas9 para superar la resistencia a los antimicrobianos en bacterias. El CRISPR-Cas9
El sistema se puede administrar en bacterias utilizando nanopartículas o bacteriófagos. El rediseñado
guía de ARN facilita el sistema CRISPR-Cas al gen responsable de la resistencia a los antimicrobianos.
El complejo de nucleasa CRISPR interrumpe el gen y da como resultado la reensibilización de las bacterias hacia
agente antimicrobiano
ADN. El ARN guía se puede rediseñar de tal manera que reconozca el gen de
interés (genes que causan resistencia a los antimicrobianos) y facilitar la nucleasa Cas9
complejo para alcanzar el objetivo. En un experimento, los investigadores transformaron el plásmido
codificación para CRISPR-Cas9 guía ARN en E. coli y Staphylococcus que resultó
en el cese del crecimiento bacteriano que posee resistencia antimicrobiana causando
gen en presencia de antibióticos. Los resultados abogan por la presencia de transformados
plásmido que facilita la degradación del gen de resistencia a los antimicrobianos (Jinek et al. 2012 ;
Citorik y col. 2014; Shabbir y col. 2019). Orientado al objetivo (gen resistente a antibióticos)
El ensamblaje Cas9 tiene una mejor toxicidad hacia la célula bacteriana. Nucleasa CRISPR-Cas9
El ensamblaje se puede utilizar para apuntar a los genes de resistencia a los antimicrobianos y ayudar a
la sensibilización de las bacterias hacia el agente antimicrobiano (Bikard et al. 2014 ; Diep
y otros J 2006). En un estudio reciente, la reensibilización de las algas Shewanella al carbapenem
Se informó el uso de la edición del gen CRISPR-Cas9 (Wu et al. 2019 ).
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138 AP Sarma y col.
La entrega del sistema CRISPR-Cas in vivo es uno de los parámetros clave necesarios para ser
evaluado para la aplicación exitosa de CRISPR en la mitigación de la resistencia a los antimicrobianos
tance. El sistema CRISPR-Cas9 se puede entregar en la celda objetivo usando varios
métodos. Pocas estrategias coherentes para transportar el sistema CRISPR-Cas9 están utilizando un
vector que se puede entregar con la ayuda de un virus o perspectivas no virales como
transformación por electroporación o microinyección, entrega por liposomas y
nanopartículas.
6.5.1 Vectores
Un vector puede ser un plásmido con genes que codifican la proteína Cas9 y guía
ARN. Ventaja de usar solo un vector que codifica tanto la nucleasa como el ARN guía
es eliminar la realización de la transformación de vectores que contienen estos genes múltiples
veces. La alta estabilidad de este vector lo convierte en un enfoque eficiente pero simple. La
Los desafíos o obstáculos con el uso de plásmidos son:
• Consume mucho tiempo: el plásmido tiene que codificar la proteína Cas9 y guiar el ARN, siguiendo
reducido por la acción de CRISPR (Liu et al. 2017 )
• Aumento fuera de lugar y efectos indeseables (Fu et al. 2013; Cradick y col. 2013 )
• Se vuelve imperativo entregar el plásmido al núcleo, lo cual es un desafío.
Una solución a los problemas anteriores puede ser el uso de ARNm que se traduce en Cas9
nucleasa y ARN guía. Esto permitirá la formación de conjuntos CRISPR-Cas9.
bly en un tiempo comparativamente más corto con pocos efectos fuera del objetivo. Además, como el ARN es
destinados al citoplasma, se mitiga la necesidad de apuntar al núcleo. Sin embargo, el bajo
la estabilidad del ARNm es un desafío (Liu et al.2017; Fang y col. 2014).
La entrega de nucleasa Cas9 y el complejo de ARN guía utilizando un vehículo de entrega trajo un nuevo
dimensión en los sistemas de entrega de CRISPR-Cas9. El modelo del complejo de ribonucleoproteína es
un enfoque ampliamente utilizado. Las ventajas de utilizar este complejo requieren menos tiempo, son más rápidas
actuación, actuación con muy alta precisión, disminución de reacciones secundarias / indeseables.
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Además, no hay obligación de optimizar el codón. El complejo se puede entregar
utilizando liposomas, nanopartículas a base de polímeros, nanopartículas metálicas, etc. (Liu et al. 2017 ).
Página 153
6 Papel de la herramienta de edición genética CRISPR-Cas en la gestión de antimicrobianos ... 139
La aplicación de la red CRISPR como herramienta de edición de genes ha cautivado a los científicos.
comunidad debido a sus aplicaciones potenciales. Con la llegada de esta herramienta, la superación
La resistencia a los antimicrobianos utilizando CRSIPR ha abierto nuevas perspectivas, aunque con su
cuota de desafíos.
A pesar de las colosales perspectivas de futuro de la red CRISPR, actualmente el sistema Cas9
para el manejo de la resistencia a los antimicrobianos generalmente se estudia en pequeñas bacterias
población. Pero en tiempo real, las bacterias son omnipresentes y bastante diversas. Esto
La diversidad de la comunidad microbiana puede ser un obstáculo para usar el sistema Cas9 para antimicrobianos.
Manejo de la resistencia a los microorganismos. Por ejemplo, incluso un gramo de matriz que contiene
células en millones tiene más de mil especies. Variedad de plásmidos y genética.
Se pueden encontrar elementos que poseen diferentes genes que causan resistencia a los antimicrobianos.
en un solo linaje. Impredecibilidad de la respuesta de rango extenso hacia el estrés por
La comunidad microbiana es el segundo desafío. Eliminación de cierto plásmido o eliminación
La nación de una cepa en particular puede resultar en el crecimiento de especies más patógenas.
Las repercusiones de eliminar el gen causante de la resistencia a los antimicrobianos mediante CRISPR-
El sistema Cas9 hasta la fecha todavía se está evaluando y necesita resultados positivos más sustanciales.
resultados para convertirla en una técnica preferida para superar la resistencia a los antimicrobianos
(Pursey et al. 2018; Thomas y Nielsen 2005; Spencer y col. 2016; Marbouty y col.
2017; Theriot y col. 2014 ; Jorth y col. 2014).
Debido al gran tamaño del complejo CRISPR-Cas9 (160 KDa), la transferencia de este conjunto
entrar en la celda es un desafío. Hay muchas formas de entregar esta maquinaria.
en la celda objetivo. Los bacteriófagos, nanocajas y ensamblajes Cas9 nanométricos son
algunos métodos para el mismo. Un informe de 2014 sugirió el uso de cápsides para administrar
el complejo de nucleasa CRISPR-Cas9 en la bacteria (Citorik et al. 2014). En orden
para encajar en la cápside, se diseñan plásmidos especiales. Estos plásmidos se denominan fagos.
medios. Transducción de estos plásmidos para facilitar el transporte de la eficacia del sistema Cas9.
cientemente degrada las bacterias de resistencia antimicrobiana (Citorik et al. 2014; Euler
et al. 2014 ). Dado que la mayoría de los genes de resistencia a los antimicrobianos se encuentran en el
plásmidos, su propagación a través de la transferencia horizontal de genes entre las bacterias que pueblan
un nicho común no es un evento de ocurrencia rara y por lo tanto estos antimicrobianos
la resistencia que causa la dispersión de genes en una amplia gama de especies bacterianas. La especificidad
Página 154
140 AP Sarma y col.
de fago contra una cepa específica de huésped (bacteria) restringe la amplia aplicación de
fagémidos para entregar maquinaria CRISPR-cas (Pires et al. 2016). CRISPR-Cas puede
También se entregará con plásmidos conjugativos. Sin embargo, una gama limitada de hosts,
diferencias en la ingesta de plásmidos y la eficiencia de la conjugación restringe su generalización
solicitud. Uno de los principales obstáculos en el uso de Cas9 es su toxicidad inherente como
evidente en Corynebacterium glutamicum y Synechococcus elongatus (Naduthodi
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et al. 2018 ; Jiang y col. 2017 ). Una alternativa a esto podría ser el uso de Cas12 en
lugar de Cas9 que dio resultados prometedores (Hatoum-Aslan et al. 2011; Yosef y col.
2012; Swarts y col. 2012). El campo de la nanotecnología trajo una nueva dimensión en
mecanismo de entrega del sistema Cas9. Se han diseñado una gran cantidad de nano sistemas
para ayudar a entregar el ensamblaje CRISPR-Cas9 (Deng et al.2019).
Mutación puntual en el gen que causa la resistencia a los antimicrobianos o la secuencia que
Las escisiones del sistema CRISPR-Cas pueden obstaculizar la gestión de la resistencia a los antimicrobianos
en bacterias. Aparte de la mutación puntual, la inserción y deleción del gen Cas también pueden
afectan la resistencia a los antimicrobianos en especies bacterianas. Los obstáculos para cumplir
CRISPR-Cas se debe más al desarrollo de resistencia hacia él. Otro que
resistencia causada por mutaciones, la resistencia también puede ocurrir debido a la selección de
genes anti-CRISPR que codifican una pequeña molécula de proteína que se adhiere a la clave
secuencias de la red CRISPR-Cas y desactiva todo el sistema (Vercoe et al.
2013). Especificidad escalada y diversidad intrincada de secuencia para anti CRISPR
(Acrs) muestra que los Acrs son omnipresentes y pueden ser transferidos por elementos genéticos móviles.
mentos como bacteriófagos y determinantes extracromosómicos para prevenir la selección
por CRISPR-cas (Pawluk et al. 2018; Borges y col. 2017 ; Houte y col. 2016; Jiang
et al. 2013; Pawluk y col. 2016; Harrington y col. 2017 ).
Para degradar y eliminar la resistencia a los antimicrobianos que causa el gen de la población bacteriana.
ulación que se encuentra en la naturaleza, el uso de la red CRISPR-Cas puede tener que pasar por
desafíos legislativos y judiciales. Evaluación de riesgos para el uso de la edición de genes
herramientas en microbios que se encuentran naturalmente es crucial. El apoyo de las partes interesadas se vuelve necesario
Es necesario utilizar herramientas de edición de genes como CRISPR para superar el problema de los antimicro-
resistencia bial (Carter y Friedman 2016; Adelman y col. 2017).
Página 155
6 Papel de la herramienta de edición genética CRISPR-Cas en la gestión de antimicrobianos ... 141
6.7 Conclusión
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Capítulo 7
Control de biopelículas bacterianas para mitigar
Resistencia antimicrobiana
Resumen La resistencia a los antimicrobianos es un problema mundial importante en todos los países
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
independientemente
carga. Naturalmente,dellosnivel de ingresos ese
microorganismos impone una
vuelven importante
resistentes salud se
cuando y financiera
exponen a agentes antimicrobianos.
drogas, y el uso excesivo de antibióticos es un factor principal que contribuye a su aumento
predominio. Pero cuando las bacterias se adhieren a una superficie y se expanden como una biopelícula,
se vuelven más resistentes a los antimicrobianos ya que están incrustados en un
sustancia polimérica celular como una única o múltiples especies bacterianas. Por lo tanto, las bacterias
dentro de una biopelícula están protegidos contra la muerte por antibióticos, biocidas y otros químicos
desafíos físicos o físicos. Las biopelículas a menudo contaminan los dispositivos médicos y los alimentos.
equipos industriales que provocan infecciones asociadas y deterioro de los alimentos, respectivamente
tivamente. Por lo tanto, justifica la necesidad de agentes novedosos y un enfoque eficaz contra
biopelículas resistentes a fármacos.
A continuación presentamos estrategias innovadoras para controlar y erradicar las biopelículas bacterianas.
a diferencia de las terapias antibióticas convencionales. La revisión presenta los conceptos básicos de bio-
desarrollo de película de una bacteria planctónica, el papel de la motilidad bacteriana, estructura
componentes y exopolisacáridos. Además, la señalización en biofilm, su asociación
con la resistencia a los antimicrobianos y cómo la inhibición de la señalización del biofilm, utilizando
moléculas inhibidoras de detección de ron como fitocompuestos, molécula de señalización
Se discuten los análogos y el péptido inhibidor del ARN III que pueden explotarse. Regalo
revisión también deliberó sobre el papel del ultrasonido y el agua electrolizada ácida para interrumpir
biopelículas de dispositivos médicos y equipos de la industria alimentaria. Además también revisamos
los enfoques de eliminación enzimáticos y combinados utilizados para eliminar las biopelículas. En el
Al final, algunos enfoques emergentes, como la interrupción de biopelículas mediada por bacteriófagos
y se discute el papel de la nanomedicina para controlar las biopelículas bacterianas.
BP Singh ( ✉ )
Departamento de Microbiología, Facultad de Ciencias, Universidad RK, Rajkot, Gujarat, India
S. Ghosh
Departamento de Microbiología, Facultad de Ciencias, Universidad RK, Rajkot, Gujarat, India
A. Chauhan
Departamento de Microbiología, Universidad de Tripura, Suryamaninagar, Tripura, India
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 147
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
Opiniones sobre agricultura 46, https://doi.org/10.1007/978-3-030-53024-2_7
Página 162
148 BP Singh y col.
Abreviaturas
7.1 Introducción
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Las enfermedades infecciosas siguen siendo la principal causa de morbilidad y mortalidad en todo el mundo.
La resistencia a los antibióticos en patógenos causantes de enfermedades mejora continuamente la
complejidad y gravedad del problema. La evolución de las cepas resistentes a los antimicrobianos
es un fenómeno natural que ocurre cuando los microorganismos se exponen a antimicrobianos
medicamentos microbianos, y los rasgos resistentes pueden intercambiarse entre ciertos tipos de bacterias
ria (Sharma et al. 2018 ). Además de la salud y la vida humanas; también hay una economía
alto costo de la resistencia a los antibióticos. Ya, 700.000 pacientes mueren a causa de los antimicrobianos.
resistencia en todo el mundo cada año (Ghosh et al. 2018). La última OCDE (Organización
Página 163
7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 149
Página 164
150 BP Singh y col.
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 115/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Tanto las superficies bióticas como las abióticas son susceptibles a la formación de biopelículas que progresa
a través de diferentes etapas que pueden clasificarse ampliamente en una etapa de adhesión, que es
reversible, seguida de una etapa de coagulación / maduración irreversible. Durante el pro-
gresión a través de diferentes etapas del desarrollo de la biopelícula, las células microbianas expresan
o reprime los genes necesarios para las diferentes etapas: (i) unión a una superficie, (ii) no
crecimiento móvil, (iii) formación de colonias y (iv) dispersión. El diferencialmente
El conjunto único de genes expresado permite la producción de matriz extracelular que consta de
de polisacáridos, péptidos de glicol, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos.
Las fuerzas hidrodinámicas y las fuerzas electrostáticas actúan como fuerzas repulsivas que una bacteria
rio al que se somete en un ambiente líquido, especialmente cuando se acerca a un
superficie. Para superar estas fuerzas inhibidoras, las bacterias se han desarrollado
mecanismos de motilidad activa, lo que aumenta sus posibilidades de adherirse a una superficie
(Donlan 2002 ). Aunque el desarrollo de biopelículas es diferente para dos tipos de vida unicelulares
estilos: móviles y no móviles, el modelo de biopelícula generalizado construido a partir del
Los resultados del trabajo anterior se ajusta a muchas especies bacterianas.
En condiciones ventajosas para la formación de biopelículas, las bacterias individuales inmóviles
teria aumenta su pegajosidad a través de una mayor expresión de adhesinas en su exterior
superficie. Esta pegajosidad de las bacterias avanza cohesivamente: célula-célula, así como
adhesivo: adherencia de la superficie celular al encontrar una superficie (Götz 2002 ). Para
Por ejemplo, ciertas cepas de especies estafilocócicas expresan proteínas de superficie que incluyen
ing Bap que promueve la unión a las superficies de poliestireno, así como la interacción célula-célula
y forman parte de la matriz extracelular (Lasa y Penadés 2006). Por otra parte,
cuando las condiciones son propicias para la formación de biopelículas, las bacterias móviles individuales
como E. coli y Salmonella se limitan a una superficie y desencadenan un estilo de vida sorprendente
cambiar. Las bacterias pierden su motilidad al perder sus flagelos y comienzan a producir una
matriz celular que encapsula y mantiene unidas las células. Fue un demonio anterior
estratificado utilizando flagelos defectuosos o flagelos y / o motilidad menos mutantes (fliC, flhD,
motA y motB) que dichas bacterias son comparativamente defectuosas en la formación de
biopelículas debido a la falta de adhesión inicial de las células a la superficie (Pratt y Kolter
1998). Se postula que la motilidad ayuda a superar las fuerzas repulsivas que
se generan entre las células y las superficies abióticas, lo que permite
Página 165
7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 151
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 116/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Las etapas de adhesión reversibles incluyen agregación suelta de bacterias que pueden disociarse
comió y volvió a formas de flotación libre. Interacciones electrostáticas entre el
sustrato, las bacterias y la topografía de la superficie son las fuerzas impulsoras, durante el
etapas iniciales de formación de biopelículas en superficies abióticas que son facilitadas por la punta
adhesinas en pili bacterianos. Fuerzas hidrodinámicas derivadas de la viscosidad de
El medio influye en la probabilidad de realizar una interacción inicial dentro del sustrato.
tum. Además, la presencia o ausencia de moléculas quimiotácticas afecta en gran medida la
interacciones iniciales entre el sustrato y las proteínas microbianas. Bacterias con
mayor hidrofobicidad han reducido la repulsión entre el sustrato y el
bacteria (Zobell 1943 ; van Loosdrecht y col. 1990).
Tanto la naturaleza de la superficie como las condiciones ambientales influyen en la
Accesorio reversible. Las condiciones ambientales como el pH y la fuerza iónica.
del medio o la temperatura son actores importantes en la formación de biopelículas
(Donlan 2002). Las superficies hidrófobas como el teflón o el plástico son más propensas a
colonización por bacterias en comparación con superficies hidrófilas como vidrio y metal.
Además, la adsorción y desorción de nutrientes en la superficie hace que una condición
película que puede influir en la adhesión inicial bacteriana dependiendo de las propiedades
de las moléculas orgánicas (Olsen et al. 1989).
Página 166
152 BP Singh y col.
En el caso de superficies bióticas, la unión bacteriana a la superficie del huésped está mediada por la
reconocimiento específico de las proteínas de la superficie bacteriana por las proteínas extracelulares o
restos de carbohidratos expresados en la superficie de las células / tejidos. En E. coli , tres
las categorías de fimbrias refuerzan las interacciones entre las bacterias y la superficie; tipo 1 fim-
briae, curli y pili conjugativo. Las fimbrias (o pili) de tipo 1 son adhesinas filamentosas
producido por cepas de E. coli tanto comensales como patógenas . Los pili de tipo 1 pueden adherirse
a una amplia gama de receptores de superficie eucariotas en forma dependiente de manosa. Tipo
1 adhesina de punta de pili, Fim H, se une a oligosacáridos de manosa eucariotas y es
implicado en la patogenia causada por E. coli uropatógena . Además, las fimbrias curli,
también llamadas fimbrias agregantes delgadas, fueron inicialmente identificadas en E. coli , también son
producido por otras enterobacterias como Shigella , Citrobacter y
Enterobacter . Curli se une a proteínas eucariotas como fibronectina, laminina y
plasminógenos, para promover la adhesión al huésped eucariota. La producción de curli está codificada
por dos conjuntos de operones transcritos de forma divergente: csgBA (componentes estructurales de
curli fimbriea) y csgDEFG (maquinaria reguladora y de exportación de curli) (Ben Nasr
et al. 1996). Los investigadores demostraron que el pilus conjugativo F podría sustituir funcionalmente
tute para Ag43, curli o tipo 1 fimbriea. En Pseudomonas aeruginosa , el apego y
el movimiento a través de la superficie celular viscosa es ayudado por pili tipo IV (Reisner et al.
2003). Una molécula de adhesión a la superficie de unión al colágeno, Sag, se informó en
Enterococcus spp. proporciona puntos focales para la adherencia y la agregación en eucariotas
células óticas, lo que lleva a la formación de biopelículas. Staphylococcus epidermidis y
Staphylococcus aureus expresa varios tipos diferentes de componentes de superficie microbiana.
nents que reconocen la molécula de matriz adhesiva (MSCRAMM: ~ 12 en S. epidermidis
y ~ 20 en S. aureus ) que tienen la capacidad de unirse a proteínas de la matriz del huésped, incluidas
fibronectina y fibrinógeno (Fey y Olson 2010 ).
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
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7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 153
Una de las características más llamativas de las biopelículas que las diferencia de las planchas
contraparte tónica es la presencia de matriz extracelular que encapsula la bio-
bacterias de la película y determina la arquitectura de la biopelícula madura. La matriz extracelular
La producción es una característica esencial para la maduración de la estructura de la biopelícula. La matriz es una
estructura compleja compuesta principalmente de agua (97%), el resto consiste en exopolisa-
polímero de charide, lípidos / fosfolípidos, ácidos nucleicos, proteínas, metabolitos absorbidos
y nutrientes (Ghannoum y O'Toole 2001). Composición de la matriz extracelular
producido por diferentes bacterias se presenta en la Tabla 7.1.
Aunque la matriz extracelular es un rasgo característico de las biopelículas, su función es
no entendido completamente. Algunas de las funciones designadas para la matriz extracelular son (i)
actúa como una capa viscosa hidratada que protege a las bacterias incrustadas de la desecación; (ii)
proporciona una capa protectora que evita que las bacterias sean reconocidas por el
sistema inmune; (iii) actúa como una barrera de difusión, por lo que protege de los antimicro-
bials; (iv) actuar como sumidero de moléculas tóxicas (antimicrobianos, radicales hidroxilo y
aniones superóxido); y (v) contribuir al desarrollo de la resistencia fenotípica de
Página 168
154 BP Singh y col.
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
estabiliza
moniae y A. lasactinomycetemcomitans
biopelículas de E. coli y(Kaplan
otras bacterias como. Actinobacillus pleuropneu-
et al. 2004)
P. aeruginosa produce 3 tipos de polisacáridos, a saber, alginato, pel y psl.
Anteriormente se demostró que los polisacáridos pel y psl son producidos principalmente por el medio ambiente.
cepas ronmentales. Aunque el alginato se conserva ampliamente entre P. aeruginosa
cepas, no es importante para la formación de biopelículas en variantes no mucoides. Sin embargo,
el alginato afecta gravemente la estructura de la biopelícula y el fenotipo de resistencia (Franklin
et al. 2011; da Silva y col. 2019).
La celulosa, un polímero de glucosa, es producida solo por unas pocas especies bacterianas como
el organismo modelo Gluconacetobacter xylinum . Usando tinte de calcofluor se demostró
que la producción de celulosa es común en Enterobacteriaceae, incluida Enterica
serovar enteritidis, Salmonella enterica serovar typhimurium, S. enterica subsp. y
cepas comensales y patógenas de E. coli , Citrobacter spp. y Enterobacter
spp. La producción de celulosa está claramente relacionada con la formación de biopelículas rígidas en el
interfaz líquido-aire; Sin embargo, estas características son altamente dependientes de cepas / serovariedades.
abollad además de las condiciones ambientales. Los genes productores de celulosa están constituidos
expresado y organizado como dos operones divergentemente transcritos, bcsABZC
y bcsEFG . Estos genes están presentes en la mayoría de los genomas de enterobacterias, incluidos
Salmonella, E. coli , Shigella , Enterobacter y Citrobacter . Además, la celulosa
La síntesis está controlada alostéricamente por un mensajero secundario bien conocido llamado
cíclico-di-GMP (c-di-GMP). Síntesis de dos componentes de la biopelícula, curli fimbrias
y celulosa en Salmonella typhimurium mostró un fenotipo característico en
Placas de agar rojo congo, el morfotipo rojo seco y rugoso (rdar). Tal morfotipo
también se informa en E. coli , donde el tratamiento con celulasa conduce a la dispersión de la biopelícula
(Zogaj et al. 2003 ; Da Re y Ghigo 2006).
El ácido colánico, un polímero complejo cargado negativamente que consta de glucosa, galacta
tose, fucosa y ácido glucurónico. En un entorno específico de crecimiento y medio ambiente
tics, el ácido colánico forma una cápsula protectora alrededor de la célula bacteriana (por ejemplo,
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7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 155
La comunicación mediante señales químicas es una característica intrigante del crecimiento de microbios.
en biopelículas. Estos productos químicos atraviesan las membranas y son detectados no solo por
miembros de la misma especie, sino también por microbios de otras especies (Fig. 7.1).
Las células de la población planctónica también producen estas señales químicas, pero debido a
condiciones de flotación libre, no están lo suficientemente concentradas como para afectar la genética
expresión. Por otro lado, en el modo de crecimiento de biopelículas, el exopolisacárido ayuda
las células están muy cerca, lo que les permite detectar las señales químicas
de manera más eficiente para efectuar cambios en el comportamiento celular. Una vez que la bacteria
Fig. 7.1 Biofilm bacteriano formado en una superficie coordinada por señales químicas. En el pictórico
En la representación de arriba, las estructuras de hongos de diferentes colores representan biopelículas formadas por varias especies
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de bacterias. Los círculos azul, verde y rojo representan señales químicas (conversación) producidas por bacterias que
puede ser percibido por diferentes especies de bacterias (escuchar) como lo indican las flechas grandes O por la misma
especies de bacterias como lo indican las flechas pequeñas. Este proceso comúnmente llamado como comunidad célula-célula
La comunicación o la señalización célula-célula ayudan a los microbios a llevar a cabo cierto comportamiento coordinado, como
formación de película
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156 BP Singh y col.
Numerosos estudios de investigación han informado de la alta tolerancia a los fármacos de las bacterias en
Película (s. La multicelularidad de las biopelículas confiere protección a estas células. Esta tolerancia
se debe a la deriva genética intrínseca del estilo de vida de flotación libre a la superficie adherida
formas (Romeo 2008; Sánchez et al. 2019). Hay varias hipótesis dadas para
explicar la alta recalcitrancia en las bacterias del biofilm, como el desarrollo de concentraciones
El gradiente de acción de los sustratos crea microambientes localizados, una gestión eficaz
ment de respuesta de la tensión dentro de los biofilms en ciertas células bacterianas, s lowed o bloqueado
penetración de antimicrobianos en biopelículas debido a la matriz extracelular, las biopelículas actúan como
un reservorio de persistentes. En estado planctónico, hay un exceso de nutrientes que las bacterias
puede utilizar pero no puede agotar los sustratos de las celdas vecinas debido a que no
suficiente actividad metabólica (Donlan 2002). Por otro lado, coordinado y
Página 171
7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 157
Las bacterias estrechamente asociadas con las biopelículas exhiben una mayor tolerancia a los antimicro-
agentes biológicos en comparación con las bacterias planctónicas de vida libre. Por lo tanto, la tolerancia física
puede volver a inducirse mediante la alteración eficaz de las biopelículas bacterianas. Para prevenir bio-
La comunicación célula-célula del desarrollo de la película puede ser un objetivo eficaz que las bacterias
utilizado con frecuencia para alcanzar una concentración umbral. Además, la poliuretano extracelular
La matriz merica que estabiliza las biopelículas puede ser dirigida, lo que puede conducir a la
debilitamiento de la biopelícula que eventualmente puede conducir a la interrupción. Tal bio-
La arquitectura de la película puede permitir una penetración eficaz y una infiltración de fármacos en el interior.
del biofilm mejorando la eficacia de los antibióticos. Asimismo, podría causar
localización mejorada de leucocitos polimorfonucleares responsables de la fagocito-
sis mediada por la eliminación de bacterias patógenas. Tales bacterias de liberación de biopelícula debilitadas
ria, que son más susceptibles a los antibióticos y la respuesta inmunológica.
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158 BP Singh y col.
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monia
También(Taseyha
Arnason 2016).
encontrado queDel
el mismo
extractomodo, el yextracto
de raíz éter de metanólico
petróleo de de Albiza schimperiana
la semilla de Justicia schimperiana
interferir con la comunicación de célula a célula de las biopelículas bacterianas (Bacha et al. 2016).
La quercetina, un flavonoide vegetal, inhibió la formación de biopelículas y la regulación de detección de quórum.
características tales como la inhibición de la violaceína, la producción de EPS y la pro-
eficiencias de producción en determinados patógenos transmitidos por los alimentos, como K.pneumoniae,
P. aeruginosa e Y. enterocolitica (Gopu et al. 2015 ). Zingerone, un potente anti-
compuesto inflamatorio que se encuentra en Zingiber officinale (jengibre), también posee potentes
efecto sobre las moléculas de señal de detección de quórum en aislados clínicos de P. aeruginosa
(Kumar et al. 2015) (Tabla 7.2 ).
Además de los fitocompuestos, el péptido inhibidor de RNAIII (RIP) ha demostrado
fuerte actividad en la prevención de la infección del injerto de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina
ciones in vivo. En realidad, Staphylococcus aureus regula su virulencia mediante el uso de
Página 173
7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 159
Tabla 7.2 Fitocompuestos como inhibidores de detección de quórum (QSI) para atacar la biopelícula bacteriana
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160 BP Singh y col.
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Tabla 7.2 (continuación)
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7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 161
Se ha demostrado que la eliminación mecánica de biopelículas es la más eficaz; el examen más básico
ple ser cepillado de dientes. Sin embargo, la principal limitación es que su eficacia es
limitado a solo superficies accesibles. El tratamiento ultrasónico es el más preferido para
eliminación de biopelículas asociadas a implantes. Varios dispositivos médicos como catéteres, arti
Las válvulas cardíacas, los marcapasos y las prótesis articulares son más propensos a las infecciones.
y formación de biopelículas. La sonicación de tales implantes ayuda a la eliminación efectiva de
Células bacterianas y dispersión que pueden ser sometidas además a polietileno multiplex.
Reacción en cadena de merasa (PCR) para rastrear ADN derivado de patógenos microbianos con el fin de
para identificar los patógenos infecciosos como Propionibacterium acnes y
Especies de Corynebacterium , Finegoldia magna y especies de Peptostreptococcus
(Achermann et al. 2010). Biofilms de Staphylococcus aureus, Enterococcus faeca-
lis, y P. acnes pueden desprenderse significativamente de las superficies de titanio y acero
utilizando sonicación a 30 kHz con una potencia de salida de 300 W a 37 ° C durante 5 min. Esto
La capacidad de alteración de la biopelícula mediada por sonicación depende del tipo de equipo,
la potencia de salida, frecuencia de oscilación, volumen de reacción, temperatura del fluido y
tiempo de sonicación (Bjerkan et al. 2009 ). Los dispositivos cardíacos electrofisiológicos también son
susceptible a las biopelículas que pueden conducir a complicaciones potencialmente mortales
ciones. Formación de biopelículas por P. acnes, S. aureus , Streptococcus mitis y coagulasa
los estafilococos negativos pueden afectar el bolsillo del generador, los cables o ambos cuando
Los marcapasos cardíacos se utilizan en pacientes con bloqueo de la conducción auriculoventricular, enfermos
síndrome sinusal y bradicardia sinusal. Desfibriladores / cardioversores implantables
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(DAI) se utilizan para pacientes con insuficiencia cardíaca después de un infarto de miocardio y ven-
arritmia tricular (Rohacek et al. 2010). Un proceso similar también es aplicable para
implantes de columna. Las biopelículas bacterianas están estrechamente asociadas con la rinosina crónica.
es. Se informa una mejora notable en los síntomas de la rinosinusitis crónica debido a
disrupción eficiente de la biopelícula empleando terapia de ultrasonido pulsado. Altos niveles de
El tratamiento ultrasónico mata eficazmente las bacterias debido a la formación de cavidades en / sobre bacterias.
Superficies de células riales con generación simultánea de peróxidos. Además, los niveles más bajos de
La energía ultrasónica revierte las bacterias asociadas a la biopelícula al estado planctónico que son
altamente susceptible tanto a los antibióticos como a los antibacterianos innatos y adaptativos
inmunidad. Por lo tanto, la co-aplicación de ultrasonido y antibióticos (gentamicina) significa
mata con frecuencia sésiles vivos Pseudomonas aeruginosa , que se conoce como bioacousti-
efecto cal (Fig. 7.2). La terapia ultrasónica coadministrada con antibióticos puede ser
significativa contra varias infecciones biofilm asociado (Young et al. 2010).
La alteración del biofilm mediada por enzimas debido a la degradación de la matriz del biofilm también es
considerada como una poderosa estrategia para hacer frente a las enfermedades asociadas a las biopelículas.
Aunque el objetivo de las enzimas que alteran la biopelícula es principalmente extracelular
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162 BP Singh y col.
Fig. 7.2 Alteración de la biopelícula asistida por ultrasonido. ( a ) Pre y ( b ) postratamiento calculado tomog-
radiografías de un hombre de 50 años con una historia de 9 meses de sinusitis maxilar izquierda refractaria a
tratamiento médico agresivo. Fue tratado con cuatro sesiones de ultrasonido combinado con
250 mg de ciprofloxacina dos veces al día durante 2 semanas, con resolución clínica completa de los síntomas. Él
permaneció bien 6 meses después. L = izquierda; R = derecha. (Young et al. 2010 )
sustancia polimérica (EPS) o matriz que rodea las células, puede tener diversos
modo de acción que son los siguientes: (i) ataque directo contra los componentes de la biopelícula
y degradación; (ii) inducción de lisis celular; (iii) interferencia con el quórum
sintiendo (iv) catálisis de la formación de sustancias antimicrobianas (Lequette et al. 2010 ;
Augustin y col. 2004 ; Simões y col. 2010; Thallinger y col. 2013 ). Integridad física
de las biopelículas bacterianas puede verse comprometido por la conversión de la extracelular
componentes de la matriz de sustancias poliméricas como carbohidratos, polisacáridos, pro
teínas (que exhiben frecuentemente propiedades similares a las amiloides), glicoproteínas, lípidos, fosfatos
folípidos, glicolípidos y ácidos nucleicos a sus monómeros que son más
metabolizado (Molobela et al. 2010 ; Hobley et al. 2015; Johansen y col. 1997 ;
Thallinger y col. 2013 ). Cepas de Pseudomonas productoras de mucoides y alginatos
aeruginosa se relacionan principalmente con la enfermedad y la muerte en la fibrosis quística (FQ) de
el tracto respiratorio. La coadministración de alginato liasa con antibióticos como genta-
Se ha descubierto que la micina y la ceftazidima son disruptores de biopelícula más eficaces. Alginato
liasa, degrada el exopolisacárido producido por cepas mucoides de P. aeruginosa ,
y aumentar la eficacia de los antibióticos en las infecciones del tracto respiratorio (Alkawash
et al. 2006). De manera similar, la dornasa alfa (Pulmozyme; Genentech) es una DNasa inhalable
que puede degradar el ADN extracelular y se utiliza en la fibrosis quística (Frederiksen
et al. 2006 ). Interrupción de biopelículas en E. coli, S. epidermidis y Pseudomonas fluore-
Las escenas se pueden lograr utilizando glucósido hidrolasa dispersina B que se dirige específicamente
polisacárido extracelular poli- N -acetilglucosamina . Dispersina B (DspB)
degrada la poli- (β-1,6) - N -acetilglucosamina (PNAG), una polisaca-
paseo que funciona como una matriz adhesina de biopelícula en numerosos patógenos como
Staphylococcus epidermidis y S. aureus . La dispersina B puede desprenderse y
interrumpir las biopelículas bacterianas en S. epidermidis, Actinobacillus pleuropneumoniae,
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7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 163
Más recientemente, se ha demostrado que el agua ácida electrolizada (AEW) es eficaz para
erradicar las biopelículas asociadas con patógenos transmitidos por los alimentos que fue experimentalmente
confirmado empleando E. coli marcada con proteína verde fluorescente . Reducción de fluorescencia
centavo de la señal de las células asociadas a la biopelícula debido al tratamiento confirmó la superior
eficiencia del agua ácida electrolizada. Se confirmó el mecanismo subyacente
para desencadenar la interrupción de la sustancia polimérica extracelular como se revela por
ción del enlace COC carbohidrato y deformación de los anillos aromáticos en el
aminoácidos tirosina y fenilalanina. Además, microscopía electrónica de barrido
(SEM) confirmaron la arquitectura de biopelícula alterada caracterizada por roturas
y biopelículas bacterianas no uniformes desprendidas. El agua ácida electrolizada también era
Cate biopelículas formadas por ambas bacterias Gram negativas ( Vibrio parahaemolyticus )
y bacterias Gram positivas ( Listeria monocytogenes ) combinadas con inac-
tivación de las células desprendidas (Fig. 7.3 ). Sin embargo, se cree que la eficacia es
dependiente de la especie bacteriana particular (Han et al.2017 ). Patogenicidad de
Biofilm asociado a S. aureus en la superficie de la fase sólida, particularmente para la permanencia
dispositivos y equipos médicos en las industrias de procesamiento de alimentos. Agua electrolizada
puede matar eficazmente S. aureus , eliminando así la biopelícula bacteriana, que es otra
También es difícil de eliminar para una fuerte adherencia a la superficie de la fase sólida. Electro básico
agua lisada (BEW) que tiene más eficiencia de eliminación de biopelículas indican que el pH de
El agua electrolizada juega un papel importante en el control de la biopelícula. Además, ácido
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164 BP Singh y col.
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Fig. 7.3 Imágenes representativas de microscopía electrónica de barrido (SEM) de biopelícula formada por
V. parahaemolyticus ( a ) y L. monocytogenes ( b ) después de sin tratar (I), tratados con desionizado estéril
agua (II) y agua ácida electrolizada (AEW-3) durante 5 min (III). Las imágenes eran representativas de
tres experimentos independientes con tres réplicas cada uno. La barra de escala representó 5 mm. (Han
et al. 2017 )
El agua electrolizada muestra una eficiencia bactericida mejorada que se puede atribuir a
al cloro (Sun et al. 2012 ).
7.5.5 Dispersión
Las bacterias planctónicas son pequeños grupos de bacterias que se liberan de las bacterias maduras.
biopelículas debidas al tratamiento con agentes causantes de la dispersión. Estas células planctónicas son
más susceptibles a los antibióticos en comparación con sus homólogos asociados con biopelículas.
Ciertas condiciones y agentes son responsables de desencadenar la dispersión que conduce a
ruptura de la biopelícula. Condiciones limitantes de nutrientes como la disponibilidad de carbono agotado
capacidad de inducir a P. aeruginosa a sembrar una nueva población para escapar de la inanición.
ción. Durante este proceso de dispersión, las biopelículas maduras se liberan como antibióticos.
bacterias planctónicas susceptibles. Varios compuestos como oligómero de alginato oligoG,
compuesto por bloques de ácido alfa-l-gulurónico puede dañar significativamente las bacterias
biopelículas dirigidas a exopolisacáridos. De manera similar, el ácido graso insaturado cis -2-
El ácido decenoico y el óxido nítrico también pueden causar la dispersión de biopelículas en varios patógenos.
gens como P. aeruginosa (Bjarnsholt et al. 2013). La dispersión efectiva de biopelículas también es
provocada por la disminución de los niveles de ácido 3,5-cíclico diguanílico (c-di-GMP) utilizando
proteínas que se unen y bloquean eficazmente el ácido diguanílico 3,5-cíclico. Medios de dispersión
La proteína tor BdcA es muy eficaz contra E. coli (Fig. 7.4) . Además antimi-
agentes crobianos como el sulfatiazol pueden inhibir significativamente el 3,5-diguanylic cíclico
Página 179
7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 165
Fig. 7.4 La proteína mediadora de la dispersión (BdcA) aumenta la dispersión de la biopelícula. A. Estructura química de
Ácido 3,5-diguanílico cíclico (c-di-GMP); B. Dispersión relativa normalizada de biopelícula después de 42 h con
biopelículas estáticas formadas en placas de poliestireno de 96 pocillos. Las biopelículas se formaron con Luria-Bertani
(LB) medio y 30 mg ml -1 de cloranfenicol a 37 ° C usando BW25113 / pCA24N, bdcA / pCA24N
y bdcA / pCA24N_ bdcA . Se añadió isopropil β-d-1-tiogalactopiranósido (0,1 mM) a cada
cepa después de 19 h de incubación. Formación de biopelícula después de 23 h de isopropil β-d-1-tiogalactopiranósido
(IPTG) (42 h en total) se compara con la formación de biopelícula después de 12 h de isopropil β-d-1-
inducción de tiogalactopiranósido (31 h en total) para obtener la dispersión de la biopelícula. Los datos son el promedio de 12
replicar los pocillos de dos cultivos independientes y se muestra una desviación estándar;
C. Imágenes representativas imágenes de biopelículas de células de flujo después de 42,5 hy 64,5 h de incubación con
Medio Luria-Bertani. Cada cepa tiene pCM18 para producir proteína de fluorescencia verde (GFP) para
visualizar las biopelículas y se añadió eritromicina (300 mg ml -1 ) para retener pCM18. (Mamá
et al. 2011 )
Los antibióticos, cuando se usan solos, se requieren en concentraciones muy altas durante más tiempo.
duración del tratamiento para matar las bacterias asociadas a la biopelícula en comparación con las bacterias planctónicas
teria; aunque el modo / mecanismo de acción sigue siendo el mismo. Es importante
tenga en cuenta que la exposición de la biopelícula bacteriana a concentraciones sub-inhibitorias de antibióticos
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conduce al riesgo de no erradicar el biofilm además de la promoción de anti-
Resistencia microbiana y mejora de la formación de biopelículas. Aplicación tópica como
la administración por inhalación resulta eficaz para antibióticos como la colistina,
tobramicina o aztreonam que puede conducir a la supresión crónica de la bio-
película, pero no la erradicación del biofilm de P. aeruginosa en pacientes con fibrosis quística. En
caso de tratamiento de biopelículas asociadas a catéteres intravenosos, agentes como etanol o
se utilizan ácido clorhídrico (Heijerman et al. 2009 ). Del mismo modo, el nitrato de galio
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166 BP Singh y col.
Mata directamente las bacterias, interrumpiendo así la biopelícula y ahora está aprobado por los EE. UU.
Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA) para escanear en diagnósticos médicos durante
tratamiento de la hipercalcemia (Bjarnsholt et al. 2013 ). Además, la estrategia de combinación
Los tratamientos han demostrado ser fructíferos cuando se utilizan altas dosis de antibióticos junto con
medicamentos que se dirigen a la biopelícula que conducen a una erradicación eficaz. Fármacos candidatos de elección
que se pueden utilizar en estrategias de combinación son meropenem, colistina y azitromía
cin, que son activos bajo tensión de oxígeno reducida y baja actividad metabólica, un
condición que es más específica de las capas más profundas de biopelículas. Metabólico externo
y estímulos químicos combinados con el uso de antibióticos o bacterio-
Los fagos también se pueden utilizar como una nueva estrategia para alterar las biopelículas bacterianas.
Se informa que la β-lactamasa está atrapada en la matriz de la biopelícula y puede afectar la
penetración de β-lactámicos en capas más profundas de biopelículas gruesas, lo que indica
Los antibióticos estables a la β-lactamasa como el meropenem o los inhibidores de la β-lactamasa pueden
ser más eficaces en estrategias de combinación (Hengzhuang et al. 2012 ). Adicionalmente,
uso de inhibidores de la bomba de eflujo como tioridazina, 1- (1-naftilmetil) -piperazina
y Phe-Arg-naftilamida también pueden ayudar a hacer frente a la tolerancia a los antibióticos
ics en la P. aeruginosa, E. coli y S. aureus asociada biofilms (Liu et al. 2010).
Otro aspecto importante es la mutación mediada por estrés oxidativo en la asociación de biopelículas.
bacterias infectadas que conducen al desarrollo de resistencia a los antibióticos. Por tanto, los antioxidantes
tales como l-prolina, N- acetilcisteína, β-caroteno o l-cisteína se pueden usar en combinación
con antibióticos para disminuir la resistencia de las bacterias, como se desprende de los informes
contra P. aeruginosa (Boles y Singh2008 ). N- acetilcisteína, un potente mucolítico
agente utilizado para el tratamiento de la fibrosis quística, también se considera como un potenciador de
actividad biótica.
7.5.7 Bacteriófagos
Los bacteriófagos son virus que infectan bacterias, descubiertos de forma independiente por
Frederick Twort y Felix d'Hérelle y ahora se consideran como potentes biológicos
agentes de control contra las biopelículas bacterianas (Motlagh et al. 2016). Entre varios ben-
efectos de los fagos líticos, considerable especificidad del huésped, autopropagación en el sitio de
infección, eliminación rápida, gran diversidad, aislamiento relativamente fácil para una variedad de
patógenos, y la oportunidad de realizar modificaciones genéticas son más notables
(Nobrega et al. 2015 ). A diferencia de la lisogenia, durante los ciclos líticos los bacteriófagos se replican
en el interior de la célula huésped bacteriana produciendo un gran número de fagos de la progenie que
son una función del tipo de fago y de la cepa huésped. Degradación de la matriz de exopolisacáridos
enzimas como las depolimerasas codificadas por fagos pueden conducir a la facilitación de la interrupción de la biopelícula
fagocitosis por leucocitos polimorfonucleares y efectos mejorados de los antimicrobianos
Drogas crobiales (Fig. 7.5). El fago T4 puede infectar y replicarse dentro de las biopelículas de E. coli
matando células bacterianas y alterando la morfología de la biopelícula. T7 de ingeniería racional
Se informa que el fago que codifica una despolimerasa que degrada la matriz tiene tanto
actividad potencial y enzimática que se explotó debido a su mayor eficacia
eficiencia de la erradicación de células bacterianas mediada por fagos, así como de la matriz de biopelícula (Lu
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Fig. 7.5 Mecanismos de terapia de fagos para controlar la biopelícula bacteriana a través de disrupción mediada por fagos.
ción. Como se indica en la figura, los pasos del biocontrol del biofilm utilizando bacteriófagos incluyen: 1.
aplicación de fagos, 2. iniciación de la alteración de la sustancia polimérica extracelularmente (EPS) de la biopelícula
a través de enzimas asociadas a viriones como la dispersina B (DspB) o las depolimerasas de EPS, 3. biopelícula
disrupción a través de la desintegración de las redes de sustancias poliméricas extracelulares y exponiendo el
infección por bacteriófagos, y 4. desintegración completa de la biopelícula y lisis de células bacterianas. ABX
es sinónimo de antibióticos (Motlagh et al. 2016 )
y Collins 2007 ). Ciertas enzimas como las endolisinas son péptidos codificados por bacteriófagos.
hidrolasas de tidoglicano que degrada la pared celular de la bacteria huésped, que es un
sello distintivo del ciclo de multiplicación lítica del fago. Las endolisinas obtienen acceso a
su sustrato de peptidoglicano desde el interior de la célula bacteriana con la ayuda de cito-
proteínas holinas perforantes de la membrana plasmática. Ambos fagos codificaron polisacárido
despolimerasa DA7 y la endolisina LysK purificada pueden interrumpir y sinérgicamente
erradicar una amplia gama de biopelículas formadas por diversas cepas de S. aureus (Olsen et al.
2018). Los fagos que se dirigen a los sitios receptores de la bomba de salida aumentan la sensibilidad hacia
Varias clases de antibióticos que ayudan a reducir la resistencia a múltiples fármacos. Un lítico
Se informa que el bacteriófago OMKO1 (familia Myoviridae) de P. aeruginosa utiliza
la membrana externa porina M (OprM) de los sistemas de eflujo de múltiples fármacos MexAB y
MexXY como un sitio de unión al receptor (Chan et al. 2016). Una estrategia alternativa usando
cócteles de distintos fagos debido a la estrecha gama de huéspedes se utilizan a menudo para minimizar
ing laboriosa identificación y evasión en patógeno. Tal cóctel de fagos compuesto
de una cantidad igual de miovirus ( ϕ NH-4) y un podovirus ( ϕ MR299-2) puede erradicar
cate biopelículas de P. aeruginosa NH57388A (mucoide) y P. aeruginosa MR299
(no mucoides) mientras crecen en el epitelio bronquial de fibrosis quística humana
línea celular (CFBE41o). La eficiencia de tal alteración de la biopelícula depende de la
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168 BP Singh y col.
mayor poder de penetración de los fagos mixtos a través del alginato, que es un importante con-
componente de la matriz del biofilm de P. aeruginosa. Esta mezcla de fagos también se informó
para ser eficaz en la eliminación de P. aeruginosa en la infección pulmonar murina en 6 h que sub-
racionalizar sustancialmente las promesas de la terapia con fagos para el control y el tratamiento de
Infecciones pulmonares por Pseudomonas resistentes a múltiples fármacos en pacientes con fibrosis quística (FQ)
(Alemayehu et al. 2012 ). Sin embargo, la terapia con bacteriófagos o la terapia que implica
Los compuestos activos de los bacteriófagos pueden posiblemente inducir reacciones inmunológicas adversas.
respuestas dependiendo de la duración del tratamiento, la dosis (dependiendo del sitio
de infección) y la composición de la formulación del bacteriófago (único versus
múltiples cepas) que se deben considerar cuidadosamente durante los ensayos clínicos.
7.5.8 Nanomedicina
Página 183
7 Control de biopelículas bacterianas para mitigar la resistencia a los antimicrobianos 169
Las nanopartículas paramagnéticas de óxido de hierro (SPION) pueden prevenir la formación de biopelículas.
contra S. epidermidis, cuando se trata a una concentración de 100 μg / mL de 12 a
48 horas indicando sus promesas en el desarrollo de aparatos ortopédicos resistentes a biofilm.
implantes (Taylor y Webster 2009 ; Ghosh y col.2018). Nanopar de sílice mesoporosa
tículos con una capacidad de carga de fármaco superior, facilita la liberación sostenida de antimicro-
agentes biales. Además, estos tipos de portadores de fármacos aumentan la concentración del fármaco en
el sitio de la infección o la patogenia, evita las dosis frecuentes, reduce los efectos secundarios,
y mejora la farmacocinética. Además, estos sistemas de administración de fármacos reducen
resistencia a los antimicrobianos, mejorar la solubilidad de ciertos antibióticos y ampliar
el índice terapéutico (Ghosh 2019 ; Ghosh y col. 2019 ). Diolato de diazenio modificado
nanopartículas de sílice (100 nm) entregan grandes cargas útiles de óxido nítrico (NO) para
erradicación de biopelículas de P. aeruginosa , E. coli , S. aureus y S. epidermidis . Nítrico
El óxido liberado de las partículas (61 μmol / mL) puede erradicar> 99% de la biopelícula.
bacterias incrustadas. Un tamaño más pequeño de partículas de sílice (50 nm) puede conducir a una mejora
ment de la actividad de alteración biofilm contra P. aeruginosa (Slomberg et al. 2013).
Nanomateriales orgánicos como poli (ácido láctico-co-glicólico) cargado con ciprofloxacina
nanopartículas funcionalizadas con desoxirribonucleasa I, liberan ciprofloxacina en un
de manera controlada, apuntar y desmontar la biopelícula degradando el extracelular
ADN que estabiliza la matriz del biofilm. Estas nanoestructuras híbridas no solo previenen
formación de biopelículas a partir de bacterias planctónicas, pero también reducen con éxito el establecimiento
masa, tamaño y densidad de células viables recogidas del biofilm. Administración repetida de
Las nanopartículas recubiertas de desoxirribonucleasa I que encapsulan ciprofloxacina pueden reducir
formación de biopelículas en un 95% y erradicar más del 99,8% de las biopelículas establecidas
(Baelo et al. 2015 ).
7.6 Conclusión
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Referencias
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Capítulo 8
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Intrusión de detección
para la mitigación de laderesistencia
quórum bacteriano
a los antimicrobianos:
Una perspectiva farmacéutica
Resumen Las bacterias emplean muchos mecanismos moleculares para comunicarse y adaptarse
el comportamiento de acuerdo con su entorno circundante. Ellos producen y sienten
pequeñas moléculas de señalización difusibles llamadas autoinductores que regulan los genes
expresión implicada en la virulencia, la formación de biopelículas, la producción de sideróforos y
proteasa. Este mecanismo de comunicación se conoce como detección de quórum. La
Los autoinductores son específicos de cepas y especies, es decir, Gram positivos y Gram negativos.
Las bacterias activas utilizan las diferentes moléculas de señalización para regular su comportamiento. Además de-
ción, las bacterias también producen inhibidores de detección de quórum y enzimas para degradar la
moléculas de señalización. En estudios anteriores, el quórum detecta mutantes de patógenos
Se encontró que las bacterias se atenúan por su virulencia y patogenicidad.
Estas estrategias que ocurren naturalmente para interferir con la detección de quórum llevaron a la
concepto de extinción de quórum que se empleará en terapéutica para controlar el
enfermedades biales. Los inhibidores y / o extintores de detección de quórum se utilizan como
arsenal terapéutico para tratar bacterias resistentes a los antibióticos y en el desarrollo de nuevas
dispositivos médicos de generación para prevenir la formación de biopelículas en ellos. Este capítulo
destaca el tipo de mecanismos empleados por las bacterias para la detección de quórum y la
uso potencial de inhibidores de detección de quórum como una estrategia exitosa en la mitigación
de resistencia a los antimicrobianos.
S. Kumar ( ✉ )
ICAR-Instituto Nacional de Investigación Láctea, Karnal, Haryana, India
S. Shandilya
Hospital Universitario Carl Gustav Carus, Technische Universität Dresden, Dresden, Alemania
KS Singh
Centro Nacional de Recursos Microbianos - Centro Nacional de Ciencia Celular,
Pune, Maharashtra, India
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 177
Springer Nature Suiza AG 2020
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Página 192
178 S. Kumar y col.
8.1 Introducción
La detección de quórum (QS) es un término general para un sistema bacteriano que ayuda a
comunicación entre células bacterianas. Este proceso implica la producción de extra-
moléculas de señalización celular llamadas autoinductores (AI). Estas moléculas son
producido por bacterias en respuesta a cambios en su población en un nicho particular.
Después de la acumulación de autoinductores en el entorno local, las bacterias detectan y
responder a las IA para activar la transcripción de genes específicos para regular la fisio-
actividades lógicas como la simbiosis, la reproducción, la competencia, la producción de antibióticos
resistencia a los antibióticos, formación de biopelículas, motilidad, esporulación, bioluminiscencia,
etc. (Miller y Bassler 2001; Rutherford y Bassler 2012 ). A pesar de lo diferente
sistemas de señalización de detección de quórum, a saber, lactonas de homoserina aciladas (AHL),
autoinductor-2 (AI-2), factores de señal difusible (DSF), dicetopiperazinas (DKP),
4-hidroxi-2-alquilquinolinas (HAQ) y otros, todos los sistemas QS conocidos siguen el
tres principios básicos: (1) los miembros de la comunidad producen la mole-
cules. Cuando la población es menor, la concentración de autoinductor está por debajo del
umbral requerido para la detección. Cuando la población es alta, la concentración de
El autoinductor es alto en el entorno circundante para su detección y respuesta.
(2) Los receptores de autoinductores están presentes en la membrana o en el citoplasma. (3)
Junto con la activación de genes específicos, la detección del propio autoinductor
inducir la producción de autoinductores (Kaplan y Greenberg 1985 ; Seed
et al. 1995).
Las bacterias Gram positivas y Gram negativas utilizan diferentes señales de detección de quórum.
sistemas de ing ( Fig. 8.1) . Los péptidos señal autoinductores son producidos y secretados por
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Fig. 8.1 Sistema de señalización de detección de quórum bacteriano (QS). En bacterias Gram positivas, quórum
detección por el sistema de dos componentes ( a ) y unión del péptido autoinductor (AIP) a la transcripción
factor de ción ( b ). En bacterias Gram negativas, detección de quórum mediante el sistema de tipo LuxI / LuxR ( c ) y dos
sistema de componentes ( d )
Página 193
8 Intrusión de detección de quórum bacteriano para mitigar la resistencia a los antimicrobianos ... 179
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Página 194
180 S. Kumar y col.
Familia Acyl-HSL
H H
norte CH 3 norte CH 3
(R) (R)
O O O O O
O O
C4-HSL 3OC6-HSL
OH H
H norte CH 3
norte
(R)
(R)
O O O CH 3
O
O O
p-Coumaroil-HSL Isovalery-HSL
Familia AI-2
OH O HO
OH (S)
(S) O
) O
(S) 3
(R)
(R (S)
CH 3 HO OH OH CH
OH O OH CH 3 O O
-
DPD R-THMF B
HO HO
S-THMF
Fig. 8.2 Estructuras representativas de moléculas de señalización de detección de quórum. AHL N-acil-
homoserina lactona, AI-2 Autoinducer-2, Péptidos autoinductores de AIP . Las estructuras se dibujan usando
Software Marvin Sketch
miembros de la familia de proteínas LuxI usando una proteína portadora de acil-acilo apropiada
(acil-ACP) como donante de acilo y S-adenosilmetionina (SAM) como donante de amino.
La primera señalización de acil-HSL se observó en una fotobacteria Vibrio fischeri ,
que producen luz a alta densidad celular, pero no a baja densidad celular. El acil-HSL
El circuito QS está compuesto por un autoinductor ( N -3-oxohexanoilhomoserinalactona
[OHHL] en Vibrio fischeri ), proteínas LuxI y LuxR. El autoinductor es producido por
Proteína LuxI que puede difundirse libremente dentro y fuera de las células. Con el aumento de celular
densidad, la concentración de autoinductores también aumenta. Los autoinductores son pro
durante todo el crecimiento en una cantidad limitada, por lo que se requiere una alta densidad celular para
alcanzar la concentración umbral de autoinductores. El receptor de autoinductores es
Proteína LuxR. La proteína LuxR es inestable en estado libre y forma una estructura estable.
tura cuando se limita a las IA. Este complejo estable (LuxR-AI) actúa como un transcripcional
activador de genes específicos para regular la fisiología bacteriana. Este complejo también
induce la expresión de LuxI ( Fig. 8.3) (Parsek et al. 1999; Swift y col. 2001).
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Fig. 8.3 La regulación de la detección de quórum basada en acil-HSL. Cuando la densidad celular es baja, la
La concentración de OHHL no alcanza un nivel de umbral crítico que conduce a una débil e insuficiente
transcripción de los genes de bioluminiscencia ( luxICDABEG ) para la emisión de luz ( a ). mientras que en
alta densidad celular, la concentración de OHHL alcanza un nivel crítico para unirse a LuxR con el fin de estimular
transcripción tardía de luxICDABEG , que conduce a la emisión de luz ( b )
y el sistema de detección de quórum basado DSF son dos ejemplos mejor caracterizados de no
sistemas de detección de quórum acyl HSL empleados por bacterias patógenas de plantas.
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182 S. Kumar y col.
éster metílico de ácido (3OH PAME) codificado por un gen phcB (Flavier et al. 1997a).
Cuando la concentración de 3OH PAME es baja a baja densidad celular, PhcR (respuesta
regulador) es fosforilado por PhcS (histidina quinasa) y reprime la expresión
de PhcA. A alta densidad celular, el 3OH PAME alcanza la concentración umbral
y reduce la capacidad de fosforilación de PhcR de PhcS para aumentar la expresión de
PhcA para la producción de factores de patogenicidad regulados por PhcA. Recientemente, ha
Se ha informado que las cepas de quimiolitoautótrofos R. eutropha también utilizan
sistema de señalización de quórum para controlar la síntesis y la motilidad del sideróforo (Garg
et al. 2000 ). Además del sistema de detección de quórum de Phc, R. solanacearum también
emplea un sistema de detección de quórum mediado por acyl HSL, homólogo a solI y solR a
sistema luxI y luxR (Flavier et al. 1997b ). El 3OH PAME regula la expresión
sión de solR y solI a través de PhcA. Además de 3OH PAME, el RpoS (sigmaS) es
También se requiere para la detección de quórum mediada por acyl HSL en R. solanacearum (Flavier
et al. 1998) como se muestra en la Fig. 8.4.
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Fig. 8.4 Detección de quórum basada en Phc. A baja concentración de 3OH PAME debido a la baja densidad celular,
PhcS transfiere el grupo fosfato a PhcR dando como resultado la regulación transcripcional de PhcA. En lo alto
concentración de 3OH PAME a alta densidad celular disminuye la actividad quinasa de PhcS. Cuando el
El grupo fosfato se elimina de PhcR induce la expresión de PhcA que regula aún más
un sistema de detección de quórum solI / solR para modular la expresión del gen de función desconocida
ción ( aidA )
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8 Intrusión de detección de quórum bacteriano para mitigar la resistencia a los antimicrobianos ... 183
Fig. 8.5 Un modelo para el sistema de detección de quórum basado en DSF. DSF estimula la autofosforilación
de RpfC y posteriormente al RpfG. El grupo fosfato portador de RpfG regula positivamente la
transcripción de genes de patogenicidad y regula negativamente rpfF y rpfB
Las moléculas de señalización para la detección de quórum son diferentes tanto en Gram negativos
bacterias y bacterias Gram positivas. Las bacterias grampositivas no producen acil-
HSL. En las bacterias Gram positivas, las moléculas de señalización son péptidos autoinductores,
péptidos pequeños postraduccionalmente modificados ( Fig. 8.2) . Estas moléculas de señal
interactuar con la histidina quinasa de una señal mediadora del sistema de dos componentes
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184 S. Kumar y col.
transducción. En ciertos casos, los péptidos autoinductores inmaduros son secretados por el
bacterias. Estos péptidos autoinductores precursores secretados son procesados por
proteasas celulares en péptidos autoinductores maduros. Después de la maduración, estos pep-
Las mareas regresan a las células para regular la actividad de los factores de transcripción (Kievit
e Iglewski 2000). En las bacterias Gram positivas, hay dos vías principales de
la detección de quórum.
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En la vía del sistema de dos componentes, los péptidos autoinductores son sin-
testado y secretado a través de transportadores de péptidos ABC. La pepita autoinductora secretada
Las mareas son modificadas post-traduccionalmente y procesadas por proteasas para formar maduras
péptidos autoinductores. Después de alcanzar un cierto umbral de concentración, inter-
actúan con las histidina quinasas, receptores específicos en la superficie celular. Esta interacción
activa la quinasa al fosforilarla en el residuo de histidina conservado que subsecuentemente
activa el regulador de respuesta afín transfiriendo este fosfato a
residuo de aspartato conservado para regular la secreción de péptidos autoinductores y
transcripción de genes diana (Bhatt 2018 ).
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8 Intrusión de detección de quórum bacteriano para mitigar la resistencia a los antimicrobianos ... 185
regulador (AgrA) mediante relé de fosforilación. A su vez, el AgrA activado regula al alza
la expresión de genes RNAIII y agr . Además de eso, el ARN regulado por AgrA
III también regula la transcripción de la toxina δ y varios factores implicados en la viru
lence (Mayville et al. 1999 ).
En la vía RNPP ( R ap , N prR , P rgX y P lcR), los péptidos autoinductores son ribo-
somalmente sintetizado. Los péptidos autoinductores se modifican postraduccionalmente
y secretada a través del sistema dependiente de SecA. La principal diferencia entre dos componentes
sistema de componente y sistema RNPP es que después de alcanzar un cierto umbral de concentración
tración, estos péptidos autoinductores son transportados dentro de las células por protones dependientes
transportadores de oligopéptidos (POT); mientras que, en un sistema de dos componentes, la autoinducción
péptidos (AIP) activan el sensor quinasa. El regulador de fosfato, Phr-AIPs fueron
descrito por primera vez en esta clase. Los Phr-AIP activados desactivan los Rap-fosfatos
y juega un papel clave en la esporulación y la competencia (McQuade et al. 2001 ).
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Los péptidos pro-autoinductores de Phr se sintetizan ribosómicamente llevando la señal
en el terminal N para la secreción. Estos péptidos pro-autoinductores se escinden por secreción
proteasas para formar un péptido señal maduro. Se devuelve el péptido señal de Phr maduro.
de vuelta a la célula a través de la permeasa de oligopéptidos (Opp), un casete de unión de ATP (ABC)
transportador (Gardan et al. 2009 ). Phr regula la expresión génica inhibiendo la
regulador de aspartato fosfatasas (Raps). Los raps son parte de una compleja variación del
sistema regulador de dos componentes, es decir, sistema de fosforilacion y regular la
descripción de varios genes, como la secreción de proteasa en Bacillus subtilis (Koetje
et al. 2003 ) . Losgenes rap y phr se cotranscriben. Las proteínas de la familia Rap
desfosforilar la Spo0F, P (0F, P) para controlar la esporulación de B. subtilis. Además de-
ción, las proteínas Rap también inhiben la actividad de ComA, un regulador de respuesta
involucrado en el desarrollo de competencias y / o del regulador de respuesta DegU para el
producción de proteasas secretadas. Las proteínas kin pertenecen a la quinasa sensor de histidina
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186 S. Kumar y col.
Fig. 8.6 Sistema de detección de quórum Phr-Rap. Los genes phr y rap a menudo se cotranscriben. Su
producto desfosforilar la Spo0F ∼ P (0F ∼ P) involucrada en la esporulación o inhibir la trans-
factores de descripción de la competencia
(ii) PrgX-CF10
Enterococcus tiene una alta capacidad intrínseca para la captación de anti-
genes de resistencia biótica. Los péptidos de señalización son las feromonas e inducen la
captación de plásmidos conjugativos. En E. faecalis, PrgX actúa como represor. PrgX es un
317- proteína de aminoácidos que actúa como un interruptor molecular de cCF10 en respuesta a
unión de feromonas. CF10 es el plásmido inducible por feromonas que codifica tetracy-
resistencia a la clina en E. faecalis (Buttaro et al.2000). PrgX se une a cCF10 y pCF10
ubicados en el cromosoma y el plásmido, respectivamente. cCF10 junto con un co-
represor pCF10 reprime PRGX para inducir la conjugación (Yin et al. 2011).
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son capaces de escindir los fosfolípidos para romper la membrana eucariota para invadir
sion. El péptido PapR se une a PlcR que, a su vez, cambia la conformación de PlcR
para activarlo. El PlcR activado se une a la caja PlcR que se encuentra en el ADN para regular la
transcripción. Un péptido pro-autoinductor de 48 aminoácidos de largo es sintetizado por
papR y exportado fuera de la célula. Luego, este péptido se devuelve a la
celular a través de un transportador de oligopéptidos, sistema OppABCDF. El propéptido es
procesado para formar un oligopéptido activo (Gominet et al. 2001 ; Bouillaut et al.
2008). CodY actúa como un regulador sensible a los nutrientes común en PlcR-Pap y
Spo0A-AbrB y participa en la activación de genes en el regulón PlcR-Pap (Frenzel
et al. 2012).
8.4 Autoinductor-2
Con el tiempo, los nuevos mecanismos y moléculas que participan en la detección de quórum se
inventado. Para almacenar la información de las vías y moléculas de detección de quórum, dos
Se desarrollaron bases de datos.
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188 S. Kumar y col.
base de datos, hay 1382 entradas de 182 QSSM únicos de 215 organismos. Eso
incluye la información biológica como genes, ensayos de identificación, preliminares
bioensayos y aplicaciones, así como detalles químicos de QSSM como SMILES,
Nombres y estructuras de la IUPAC. La base de datos proporciona una fácil recuperación de datos y
parison de diferentes moléculas de señalización debido a la interfaz gráfica de usuario fácil de usar
cara. SigMol es útil para la comunidad científica asociada al campo de
detección de quórum y sus aplicaciones farmacológicas (Rajput et al. 2016 ).
Debido a los avances en este campo y a numerosos informes exitosos para el quórum
El uso de sensores, una base de datos pública como Quorumpeps, se necesitaba con urgencia.
Quórumpeps (http://quorumpeps.ugent.be ) es una base de datos probada experimentalmente
péptidos de señalización de detección de quórum. El navegador de la base de datos es fácil de usar.
con varias opciones de campo de búsqueda que incluyen secuencia, nombre trivial, sonrisas, molecular
fórmula, receptor, método, origen, literatura, etc. La base de datos de Quorumpeps proporciona la
información química de los QSSM como nombres, estructuras, formas moleculares de la IUPAC
mulas, nombres triviales y sonrisas. Además de eso, también proporciona los
información de QSSM como el origen de especies microbianas, funcionalidad relacionada con
método, resultado y receptor, enlaces peptídicos y características químicas (estructura 3D
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
propiedades
Las moléculasfisicoquímicas
de sellado sederivadas). La diversidad
pueden utilizar química
para desarrollar de lasmoléculas
nuevas señales deterapéuticamente
detección de quórum
significativas.
moléculas. La base de datos de Quorumpeps puede ser una herramienta valiosa para estudiar la
Relaciones estructura-propiedad de moléculas de señalización de detección de quórum. Estos datos-
La base es actualizada trimestralmente por los autores para asegurar información actualizada al
investigadores (Wynendaele et al. 2013).
Página 203
8 Intrusión de detección de quórum bacteriano para mitigar la resistencia a los antimicrobianos ... 189
(Tiaden y Hilbi 2012 ), los ácidos grasos son utilizados por Burkholderia spp., Xanthomonas
spp., Xylella spp. (Zhou et al.2017), las quinolonas son utilizadas por Pseudomonas aerugi-
nosa (Heeb y col. 2011 ) y la epinefrina, la norepinefrina, y AI-3 son utilizados por
bacterias enterohemorrágicas (Kendall y Sperandio 2007). El borato de furanosilo
diéster, un péptido autoinductor (AI-2) es utilizado tanto por Gram positivos como por Gram
bacterias negativas (Chen et al. 2002 ). Vibrio harveyi , un bioluminiscente de vida libre
La bacteria marina utiliza el diéster de borato de furanosilo como molécula de señalización para
luminiscencia (Skandamis y Nychas 2012). Algunas bacterias Gram negativas se integran
rallar los diferentes sistemas de detección de quórum para que actúen en una red como P. aeruginosa
utiliza cuatro sistemas de detección de quórum, a saber, las, rhl, iqs y pqs . Estos cuatro sistemas
están interconectados entre sí para regular la patogenicidad de P. aeruginosa .
Los sistemas de detección de quórum, a saber, las, iqs y pqs, invocan la expresión rhl que
permite que la bacteria sobreviva en condiciones adversas (Lee y Zhang 2015 ).
La extinción de quórum es la interrupción del sistema de detección de quórum bacteriano.
La extinción del quórum es un fenómeno natural utilizado por las bacterias para degradar el quórum
detección de moléculas de señalización y se describió por primera vez en Erwinia carotovora (Rémy
et al. 2018). Los inhibidores de la detección de quórum son producidos por bacterias para
inhiben la acción de los péptidos autoinductores y las enzimas que apagan el quórum dan como resultado
ing en la interferencia con el mecanismo de detección de quórum. Inhibidores del quórum sens-
ing se enumeran en la Tabla 8.1. El uso de estos inhibidores como agentes terapéuticos podría ser
una estrategia prometedora para reducir la patogenicidad bacteriana. Estas estrategias pueden usarse
para mejorar la susceptibilidad bacteriana a los antibióticos y para disminuir la formación de biopelículas.
La comunicación entre bacterias puede verse interrumpida por varios mecanismos como
como: (i) por la producción de inhibidores de detección de quórum que intervienen con la
producción de autoinductores (Tang y Zhang 2014), (ii) Utilizar extinción de quórum
anticuerpos (Park et al. 2007) y macromoléculas como ciclodextrinas para eliminar IA
(Morohoshi et al. 2013), o (iii) mediante la desintegración de IA utilizando el quórum hidrolizante
extinción de enzimas (Fetzner 2015a). Un gran número de moléculas pequeñas y antagonistas
Se ha descubierto que los péptidos onistas inhiben o apagan la molécula de detección de quórum.
cules (Tang y Zhang 2014 ).
Existen múltiples métodos para identificar nuevos inhibidores y extintores como
detección de drogas asistida por computadora, detección de alto rendimiento, detección aleatoria y
purificación a partir de extractos crudos, etc. Además de muchos modificados genéticamente
cepas que expresan genes informadores, se utilizan como biosensores de detección de quórum para
identificar inhibidores. Los inhibidores y las moléculas extintoras pueden ser naturales
productos como ajoeno de ajo, polifenoles de té y miel, eugenol de
clavo y productos de organismos marinos o productos sintéticos como azitromía
cin y 5-fluorouracilo (5-FU) (Swatton et al. 2016; Delago y col. 2016 ). junto al
moléculas pequeñas, se han identificado algunas enzimas de extinción de quórum para apuntar
las moléculas AI-2 y AHL involucradas en la detección de quórum. Las principales enzimas son
lactonasas, acilasas y oxidorreductasas que degradan la señalización de AI-2 y AHL
moléculas (Fetzner 2015b; Bzdrenga y col. 2017a). Las enzimas que apagan el quórum
se clasifican en dos grupos: Las enzimas de clase I son AHL-lactonasa, AHL-
acilasa y paraoxonasa, que degradan las moléculas de AHL y las enzimas de clase II
son oxidorreductasas, que reducen el carbonilo a hidroxilo. La interrupción de
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derivados (1993) y
Rice y col.
(2002)
Ciclodepsipéptidos Sistema agr Marina Fotobacteria Mansson
(solonomide a, b) bacterias et al. (2011)
Benzopirano Planta CviR, LuxR y LasR Baccharis Dobretsov
cassinaefolia et al. (2011)
Eugenol CviR, LasR y PQS Planta Syzygium Zhou y col.
aromaticum (2013)
Cinamaldehído LuxR y AI-2 Planta Algunas plantas Niu y col.
y sus derivados (2006),
Brackman
et al. (2008)
y
Brackman
et al.
(2011a )
Quercetina AI-2 y AI-3 Planta Brócoli Lee y col.
(2011)
Limonoides EHEC Planta Toronja Vikram y col.
(obacunona) (2010)
L-Canavanine CviR y ExpR Planta: Alfalfa Medicago sativa Keshavan
et al. (2005)
Catachin y CviR y RhlR Planta: Combretum Vandeputte
naringenin Combretaceae Albiflorum et al. (2010)
y
Vandeputte
et al. (2011)
Sesquiterpeno Pseudomonas Planta: Centratherum Amaya y col.
lactonas aeruginosa Compositae punctatum (2012)
Ajoene Familia LuxR Planta: ajo Allium sativum Jakobsen
et al.
(2012b )
(continuado)
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192 S. Kumar y col.
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sistema de detección de quórum podría ser una idea prometedora para prevenir el comportamiento virulento
ior de bacterias (Bzdrenga et al. 2017a ).
Con cada año que pasa, la resistencia a los antibióticos está emergiendo como un importante problema de salud pública.
preocupación que requiere la necesidad de desarrollar nuevos enfoques terapéuticos
oped. Existe una asociación multifacética entre la resistencia a los antibióticos y el quórum
sintiendo. La extinción / inhibición del quórum de microbios patógenos también se denomina anti
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8 Intrusión de detección de quórum bacteriano para mitigar la resistencia a los antimicrobianos ... 193
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194 S. Kumar y col.
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8 Intrusión de detección de quórum bacteriano para mitigar la resistencia a los antimicrobianos ... 195
Las propiedades de extinción del quórum inhiben la formación de biopelículas, la producción de factores de virulencia.
ción y resistencia a los antimicrobianos en bacterias patógenas (Rasmussen et al. 2005 ;
Harjai y col. 2010 ). Un análogo de pirimidina, el 5-fluorouracilo (5-FU) inhibe el quórum
detectar la expresión regulada de genes implicados en la virulencia de P. aeru-
ginosa. Actualmente, el 5-FU se utiliza en el revestimiento de catéteres (Ueda et al.2009).
En los ensayos clínicos, los resultados de los catéteres recubiertos demostraron ser significativos en términos
de biofilm interrupción formada por bacterias resistentes a los antibióticos (Walz et al. 2010).
Molécula ET37, conjugación de N- (3-oxododecanoil) homoserina lactona (3O-C12-HSL)
administrado con ciprofloxacina resultó ser significativo para reducir la formación de biopelículas
y mejorar la susceptibilidad a los antibióticos en P. aeruginosa (Bortolotti et al.2019) . En
Los estudios in vitro sobre Sinefungin también mostraron un crecimiento reducido de la biopelícula neumocócica.
Se ha demostrado que la sinfungina inhibe la síntesis de AI-2 mediante la regulación a la baja de la
expresión de luxS, pfs y speE (Yadav et al. 2014 ). En un estudio reciente, los resultados
mostró que la curcumina en combinación con tobramicina, gentamicina y azitromía
cin muestra efectos sinérgicos contra P. aeruginosa . Esta combinación reduce la
quórum detecta los factores de virulencia asociados mediante la regulación a la baja de la sensibilidad del quórum
genes ING (Bahari et al. 2017). Otro agente de detección de quórum anti-administración de Farnesol
administrado en combinación con antibióticos β-lactámicos atenuó la tasa de crecimiento de
Staphylococcus aureus resistente a la meticilina . Esta combinación inhibe la lipasa.
actividad y alterar la membrana citoplasmática a través de la fuga de iones de potasio
(Kim y col. 2018 ).
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
y la resistencia a los antibióticos llevó al concepto de extinción de quórum o quórum sens-
ing inhibidores para su uso en productos farmacéuticos para el control de enfermedades. La detección de quórum
Se encontró que los mutantes de bacterias patógenas estaban atenuados por su virulencia. Una amplia
Se han descubierto varias moléculas inhibidoras y enzimas extintoras como un
alternativa a los antibióticos debido a la aparición de resistencias. Sin embargo, todavía nos enfrentamos
el obstáculo en su uso clínico. Los mayores obstáculos para usarlos en la clínica son sus
toxicidad, liberación, estabilidad, potencia y espectro de actividad estrecho. Además de
que, algunas preguntas aún están sin respuesta y abiertas. En que etapa de la infección
¿Será valiosa la inhibición de la detección de quórum? ¿Qué patógeno debería ser el objetivo? Es
¿Existe alguna resistencia a los inhibidores de detección de quórum? ¿Cuáles son los mecanismos de
extinción del quórum? ¿Solo los inhibidores de detección de quórum son suficientes para controlar la
enfermedad / infecciones causadas por bacterias resistentes o deben usarse en combinación
con otros antimicrobianos para efectos sinérgicos? Se requieren investigaciones futuras
para determinar la amplitud del mecanismo de acción del inhibidor de extinción de quórum
moléculas y su potencial para ser utilizadas como una alternativa para la mitigación de
Resistencia antibiótica.
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196 S. Kumar y col.
8.9 Conclusión
El estudio de los sistemas de detección de quórum bacteriano tiene como objetivo explotar la
vías y mecanismos implicados en la comunicación célula-célula. En bacterias, quo-
La detección de ron es un mecanismo de comunicación universal para regular los rasgos a través de
intercambiar las moléculas de señalización extracelulares llamadas autoinductores de acuerdo con
condiciones circundantes. Los cambios en el comportamiento dependen del tipo y con-
centración de moléculas de señalización. Una nueva investigación muestra que estas moléculas de señalización
Los cules son extremadamente específicos de especies y géneros. Basado en la información obtenida
de los estudios de detección de quórum, ahora se ven la manipulación de las moléculas de señalización
como estrategias prometedoras en diversas aplicaciones prácticas. La continua investigación
dirigido a encontrar los inhibidores naturales de detección de quórum y sus análogos sintéticos
para los usos clínicos ha desarrollado las terapias avanzadas para el tratamiento de resistencias
bacterias tant. Presumiblemente, estas terapias no serán tan propensas a la resistencia como lo son
los antibióticos tradicionales. El uso de inhibidores de detección de quórum en la clínica
Los enfoques podrían tener mejores funciones que los antibióticos de próxima generación y
juegan un papel importante en la mitigación de la resistencia a los antimicrobianos.
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Capítulo 9
Descubrimiento de fármacos para la selección de fármacos
Bacterias resistentes
Resumen Los enfoques alternativos para el descubrimiento de fármacos antibacterianos tienen un enorme
potencial para desarrollar nuevos agentes antibacterianos contra humanos resistentes a múltiples fármacos
bacterias patógenas que son muy necesarias para hacer frente a las amenazas urgentes de múltiples fármacos
bacterias patógenas humanas resistentes. Es posible que podamos desarrollar una novela mucho más rápido.
antibióticos contra bacterias patógenas humanas resistentes a múltiples fármacos utilizando estas alternativas
métodos nativos que el basado en el descubrimiento de fármacos de moléculas pequeñas. La alternativa
Los métodos para el descubrimiento de fármacos antibacterianos se pueden utilizar para apuntar a nuevas moléculas en
bacterias patógenas como los riboswitch bacterianos. La combinación de nuevos mecanismos
anismos de acción de fármacos antibacterianos, con nuevas moléculas dianas, pueden resultar en la
desarrollo de nuevos antibióticos contra los cuales las bacterias aún no han desarrollado ningún
tipo de resistencia.
En este capítulo del libro, presentamos métodos novedosos para el descubrimiento de fármacos antibacterianos.
contra bacterias resistentes a los antimicrobianos basadas en estrategias alternativas para
descubrimiento de fármacos riales. Estos incluyen la aplicación de oligonucleótidos antisentido como
agentes antibacterianos, trasplante de microbiota fecal y péptidos antimicrobianos
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
y péptidos penetrantes de células con actividad antibacteriana. También presentamos los principales
formas de uso indebido de antibióticos que conducen al desarrollo de resistencia a los antimicrobianos.
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou y Katya B. Popova contribuyeron igualmente con todos los demás
contribuyentes.
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 205
Springer Nature Suiza AG 2020
H. Panwar y col. (eds.), Sustainable Agriculture Reviews 46 , Sustainable
Opiniones sobre agricultura 46, https://doi.org/10.1007/978-3-030-53024-2_9
Página 220
206 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
9.1 Introducción
El uso excesivo junto con el uso indebido de antibióticos en la medicina humana y veterinaria,
agricultura y acuicultura son algunas de las razones consideradas para la resistencia a los antimicrobianos
desarrollo tance. Los antibióticos son una categoría de fármacos que se utilizan en la práctica diaria.
En ocasiones, por la ausencia de herramientas de diagnóstico o por el tiempo necesario para la
confirmación de un patógeno, los médicos inician el tratamiento con el uso de métodos empíricos
terapias basadas en los síntomas clínicos y las características individuales de un paciente.
Esto puede llevar a la prescripción de antibióticos no solo contra agentes bacterianos sino
a veces erróneamente contra agentes no bacterianos. Sin embargo, en pacientes críticamente enfermos
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Página 221
9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 207
Página 222
208 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
centros de atención, que pueden estar ubicados lejos de sus hogares. Esto no es un asunto
de cumplimiento, sino una cuestión de capacidad. Esa es la razón por la que existe una gran necesidad de
que los antibióticos estén disponibles más fácilmente y en una cantidad adecuada para cubrir las necesidades
de todos los países del mundo (de With et al. 2016).
Un fenómeno que se observa principalmente en los países en desarrollo es el
compra de venta libre o uso indebido de antibióticos, que se atribuye principalmente a la mala educación
ción de la población. Sin embargo, el uso inadecuado de antibióticos y la automedicación son
problemas que también preocupan a los países desarrollados. Especialmente, en los países desarrollados,
Se observa el uso de los sobrantes de las drogas de cursos de tratamiento anteriores.
que pueden estar vencidos o no ser adecuados para el estado de salud actual de un paciente
sin seguir ningún consejo de un médico. Este fenómeno se llama "auto
medicación '' y es otro factor que promueve el desarrollo de antimicrobianos
resistencia a nivel comunitario. El peor escenario es la prescripción de la izquierda
excesos de drogas de padres a hijos o entre miembros de la familia (Selgelid
2007; OMS 2002, 2015 ).
Las condiciones higiénicas, el saneamiento adecuado y la buena preparación de los alimentos juegan un papel
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 156/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
papel importante en la prevención de la propagación de infecciones tanto en unidades hospitalarias como
así como a nivel comunitario. Los trabajadores sanitarios están obligados a utilizar barreras
precauciones para protegerse y prevenir la propagación de infecciones entre diferentes
diferentes pacientes y otros miembros del personal sanitario de las unidades sanitarias.
El uso de guantes, mascarillas, una adecuada higiene y desinfección de las manos constituyen algunos de los
los principales métodos, que tienen como objetivo proteger la propagación de infecciones en las unidades de salud.
La presencia de un consultor especializado en enfermedades infecciosas en las unidades de salud.
es vital y contribuye a la mejora de la gestión de enfermedades infecciosas y
control (Allcock et al. 2017 ; Okeke y col. 2005; Dik y col. 2016).
Aunque existe una necesidad urgente de desarrollar nuevos antibióticos debido
a la alta tasa de aparición y propagación de la resistencia a los antimicrobianos y de múltiples fármacos
patógenos bacterianos resistentes, el interés de las empresas farmacéuticas en invertir en
el descubrimiento de nuevos antibióticos durante las últimas décadas disminuyó drásticamente.
Este es uno de los factores que contribuyó a la presencia de bacterias difíciles de tratar.
Infecciones. Hay una variedad de razones que se atribuyen a la disminución de la preferencia de
industrias farmacéuticas para invertir dinero en la investigación y el desarrollo de nuevos
antibióticos. El hecho de que los antibióticos sean fármacos que se utilizan durante períodos breves contra
las infecciones las hace menos rentables para las empresas farmacéuticas en comparación
a los medicamentos que se utilizan para el tratamiento de enfermedades crónicas. Por ejemplo, la duracin
ción del tratamiento con medicamentos utilizados para el tratamiento de la diabetes mellitus, arterial
La hipertensión y el cáncer duran mucho más tiempo o incluso toda la vida y
esas enfermedades afectan a una mayor cantidad de población. Estas son algunas de las razones
que hacen que los medicamentos que se utilizan para la terapia de enfermedades crónicas sean más rentables
capaz para las empresas farmacéuticas en comparación con los medicamentos antimicrobianos.
Para retrasar la aparición de resistencia a los antimicrobianos, los médicos intentan contener
reservar algunos antibióticos y prescribirlos en los casos en que sean realmente necesarios y
si al principio se usaron antibióticos más establecidos y actualmente no pueden tratar una
infección (Fishman 2006 ). Esto contrasta con los fármacos utilizados para enfermedades crónicas.
alivios que son recetados inmediatamente por los médicos si es necesario y sin
Página 223
9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 209
La resistencia a los antimicrobianos se puede propagar de múltiples formas. Uno de los más comunes es
a través de la cadena alimentaria. Los antibióticos se utilizaron masivamente como profilaxis y control
de enfermedades en animales domésticos, lo que condujo al desarrollo de fármacos resistentes
bacterias en el tracto gastrointestinal de los animales. Las bacterias resistentes terminan en
cultivos ya sea a través de la defecación de animales infectados con bacterias o riego de cultivos
con agua contaminada. Por lo tanto, las bacterias resistentes atraviesan los órganos gastrointestinales del ser humano.
tracto testinal a través del consumo de alimentos contaminados (Verraes et al. 2013).
Aparte de eso, las unidades de salud se encuentran entre los entornos más favorables
para la propagación de infecciones bacterianas. Especialmente, parece que factores como la insuficiencia
control de infecciones oportuno, falta de educación adecuada y ausencia de vigilancia
Los programas contribuyen al desarrollo de la resistencia a los antimicrobianos. Los caminos por
qué infecciones pueden propagarse son directas de un ser humano a otro o a través de
superficies tamizadas (Penchovsky y Traykovska 2015). Todos estos indican que no
es una gran necesidad de estrategias para la prevención y contención de antimicrobianos
resistencia a nivel mundial y se considera que su ausencia juega un papel importante en la
aparición y propagación de la resistencia a los antimicrobianos (Levy y Marshall 2004 ).
Existe una variedad de mecanismos a través de los cuales la resistencia a los antimicrobianos
emerge en bacterias. Se utilizan múltiples rutas bioquímicas para la clasificación de
los mecanismos de desarrollo de la resistencia a los antimicrobianos. Es necesario comprender
soportar la base genética del desarrollo de la resistencia a los antimicrobianos para fabricar nuevos
ods y drogas para abordarlo. La resistencia a los antimicrobianos puede ser intrínseca en la que
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
una resistencia
bacterias antimicrobiana
extremadamente específica
sensibles se hereda
se volvieron o se adquiere
resistentes en los
(Munita casos2016
y Arias en que una
; Tenover 2006 ;
Blair y col. 2015). Durante las últimas décadas, la comprensión de los mecanismos de
El desarrollo de resistencia a los antimicrobianos fue un tema central debido a la salud y
pérdidas económicas en todo el mundo (Hayes y Wolf 1990 ). El tratamiento de infecciones para
A qué bacterias resistentes a los antimicrobianos se les culpa se está volviendo cada vez más difícil. La
Página 224
210 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
El fracaso de los métodos tradicionales de descubrimiento de antibióticos para seguir el ritmo de la evolución.
ción de la resistencia a los antimicrobianos destaca la necesidad urgente de implementar
estrategias para la prevención y contención de la resistencia a los antimicrobianos junto con la
descubrimiento de nuevos fármacos (Smith y Romesberg 2007).
Por ejemplo, en el último año, solo unas pocas clases nuevas de antibióticos se han
aprobado en contraste con el pasado donde el desarrollo de nuevos antibióticos fue uno
paso por delante de la aparición de resistencia a los antimicrobianos (Soothill et al. 2013).
Esto constituye una gran amenaza para el bienestar de las personas en todo el mundo. Por lo tanto,
Existe una necesidad urgente de realizar investigaciones más innovadoras para centrarse en el descubrimiento.
de nuevos fármacos antibacterianos. Para hacer frente a la amenaza impuesta por la resistencia a múltiples fármacos.
bacterias, existe una gran necesidad de la aplicación de tuberías más rápidas y adaptables
líneas para que se puedan desarrollar nuevos fármacos antibacterianos en un período más corto
con menos dinero. También se necesitan nuevas dianas de fármacos antibacterianos para desarrollar nuevos
clases de fármacos antibacterianos, que no tendrán ninguna cepa antibacteriana resistente en
el comienzo de su aplicación. Las nuevas estrategias deberían ser más adaptables a
la aparición continua de mutantes de resistencia a los antimicrobianos y simultáneamente
menos tiempo. Esto se puede lograr con la ayuda de los avances en
tecnología científica durante las últimas décadas y mediante la aplicación de
nuevos mecanismos moleculares para las acciones de los fármacos junto con el uso de nuevos fármacos
obtiene. Algunos de los agentes más prometedores que pueden usarse contra las bacterias son
oligonucleótidos antisentido, terapias con fagos, trasplante de microbiota fecal (FMT)
y péptidos antimicrobianos y algunos nuevos objetivos como los riboswitch bacterianos
(Penchovsky y Traykovska 2015 ; Feria y Tor2014 ).
Página 225
9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 211
bacterias resistentes a múltiples fármacos debido al mal uso de los antibióticos actuales llevaron a la
actual necesidad urgente de desarrollar nuevos antibióticos. De hecho, el primer antibiótico fue purificado
fied de microorganismos. Por ejemplo, en el laboratorio de Selman Waksman
Se aislaron una docena de antibióticos de microorganismos del suelo, incluido un muy potente
antibiótico conocido como estreptomicina (Waksman 1973). Por el descubrimiento de
Streptomycin, Waksman recibió el Premio Nobel de Fisiología o Medicina
en 1952.
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Este enfoque de descubrimiento de fármacos antimicrobianos se basa en el cribado bioactivo en
célula completa, conocida como farmacología clásica. Habiendo sido identificado una sustancia química
con propiedades antibacterianas, se ha intentado descifrar su objetivo molecular. La mayoría de
los antibióticos se descubrieron aplicando este enfoque durante la "era dorada"
(Waksman y Flynn 1973 ). Este enfoque también es aplicable a la actualidad.
Otro método para el descubrimiento de fármacos antibacterianos se basa en el alto rendimiento
cribado de bibliotecas químicas para la unión a una diana molecular específica. Un adicional
enfoque nacional para el desarrollo de fármacos antibacterianos se basa en el diseño racional de
moléculas que se unen específicamente a un objetivo molecular predefinido.
Hay varias tendencias recientes para desarrollar enfoques no convencionales de antibacterianos.
descubrimiento de fármacos teriales, que debería ser mucho más eficiente que el actual
enfoques aplicados. Incluyen la búsqueda en todo el genoma de nuevos antibacterianos.
objetivos y la aplicación de nuevos mecanismos de acción de fármacos antibacterianos como
oligonucleótidos de sentido, antibacterianos basados en fagos y otros.
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212 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
con moléculas pequeñas como metabolitos secundarios pero también con oligo-
nucleótidos. Tenga en cuenta que en los últimos años, varios tipos de ARN se están ampliando
objetivos utilizados para el desarrollo de fármacos antibacterianos. Además, la búsqueda de naturalmente
La aparición de péptidos cortos con propiedades antibacterianas también es una vía prometedora para
descubrimiento de fármacos antibacterianos no convencionales (Penchovsky y Traykovska 2015).
A continuación, en este capítulo, discutiremos todos estos enfoques no convencionales de antibacterianos.
descubrimiento de fármacos en detalle.
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(Penchovsky y Traykovska
En la última 2015
década, varios ).
oligonucleótidos antisentido están en desarrollo clínico.
ment (Rinaldi y Wood 2018; Geary 2009 ; Meng y col. 2015 ; Singh y col. 2007 ;
Wright 2009 ; Sully y Geller 2016; Stein y Castanotto 2017) que demuestra
la aplicabilidad general de varios tipos de oligonucleótidos antisentido como fármaco
didates. Hay una gran cantidad de genes esenciales en bacterias con diferentes
secuencia a seres humanos que se pueden utilizar como dianas potenciales de oligonucleótidos antisentido
ótidos para el desarrollo de fármacos antibacterianos. Una ventaja específica que las bacterias
que poseen los genomas en comparación con los genomas humanos es que los genomas bacterianos son
más pequeño y relativamente simple organizado. Por lo tanto, es fácil considerarlo adecuado
ARN bacterianos como un objetivo potencial para los oligonucleótidos antisentido. Tal ARN objetivo
Las bacterias deben estar presentes únicamente en las bacterias y no en los seres humanos. Por ejemplo, el objetivo
El ARN puede codificar una enzima para la síntesis de un metabolito esencial. Para asegurar
que las bacterias no van a sobrevivir incluso si un metabolito esencial está presente en el
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9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 213
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214 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
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9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 215
o los síntomas se manifiestan más tarde durante su vida neonatal. Manifiestos de AME de tipo II
más tarde en la vida infantil y los niños pequeños. Algunos de los síntomas más comunes de la enfermedad.
son debilidad muscular generalizada, dificultad para respirar, dificultad para tragar.
Algunos de ellos pueden ser incapaces de alcanzar los hitos del desarrollo cuando están sentados.
vertical.
El pronóstico de la enfermedad depende del tipo. Especialmente, en pacientes que
sufre de AME tipo I, la enfermedad se deteriora gradualmente desde el período neonatal
y la principal causa de muerte suele ser insuficiencia respiratoria. Debería mencionarse
que un medicamento llamado Exondys 51, fue aprobado por la FDA el 19 de septiembre de 2016,
contra la distrofia muscular de Duchenne, aunque hubo muchos conflictos de
científicos sobre su utilidad. Otro oligonucleótido antisentido está indicado para bebés.
que sufren de atrofia muscular espinal tipos 1, 2 y 3. Se llama Speranza o
Nusinersen y fue aprobado por la FDA el 23 de diciembre de 2016 y se considera
ered como una droga que potencialmente salva vidas. El estudio ENDEAR mostró que con la aplicación
ción de Nusinersen hubo una eficacia terapéutica incluso después de los primeros siete meses
(Traykovska et al. 2018 ). Aunque, es necesario un seguimiento más prolongado para dibujar
más conclusiones. Existe la creencia de que en el futuro se utilizarán oligonucleótidos antisentido
tendrá efectos prometedores en el tratamiento de enfermedades neurológicas. Defitelio o
La defibrotida es un fármaco oligonucleotídico que se aprobó el 1 de abril de 2016 y se utiliza
en los casos en que después de la aplicación de quimioterapia de dosis alta o después de un autólogo
trasplante de células madre hay enfermedad venooclusiva hepática grave (sVOD)
(Rinaldi y Wood 2018 ; Geary 2009 ; Stein y Castanotto 2017; Kolb y Kissel
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2011, 2015 ; Pane y col. 2018; Yiu y Kornberg 2015; Tsoumpra y col. 2019).
Encontrar estrategias novedosas para el tratamiento de la aterosclerosis mediante la reducción de los triglicéridos.
ide, un oligonucleótido antisentido de segunda generación, Volanesorsen fue desarrollado
oped. Su mecanismo de acción tiene como objetivo la reducción de la apolipoproteína C-III (Apo
C-III) ARN mensajero. Polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en la Apo C-II
El gen está relacionado con triglicéridos muy elevados. Después de la implementación de algunos
estudios como APPROACH y COMPASS, el fármaco fue aprobado en mayo de 2019 para el
tratamiento del síndrome de quilomicronemia familiar (FCS) en adultos. Algún otro semental
están en un proceso para identificar la utilidad de Volanesorsen en otras condiciones como hipertri-
gliceridemia, lipodistrofia parcial familiar (FPL) y lipodistrofia parcial (Reiner
2018; Paik y Duggan 2019 ; Stein y Castanotto2017 ).
Hoy en día, las tecnologías de oligonucleótidos antisentido se aplican en diferentes
organismos y parecen ser muy prometedores y populares para el tratamiento de
infecciones bacterianas. La idea de su uso contra bacterias se basa en la presencia
de algunas proteínas en bacterias, que son esenciales para su supervivencia y no pueden ser
encontrado en humanos. Por lo tanto, el uso de oligonucleótidos antisentido, que se dirigen a la
expresión de proteínas a nivel de ARNm, es una estrategia prometedora para el desarrollo
mento de nuevos antibióticos. Es necesario realizar más investigaciones en este campo, debido a la
necesidad urgente de descubrir nuevos fármacos antibacterianos que sean capaces de combatir
contra la creciente amenaza de bacterias patógenas resistentes a los antimicrobianos (Rinaldi
y madera 2018 ; Penchovsky y Traykovska 2015). El uso de oligonucleótidos antisentido
cleotides no se limita solo a la identificación y validación de la proteína diana.
Los oligonucleótidos antisentido también se pueden usar para el tratamiento de enfermedades en las que
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9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 217
afectar las terapias de fagos porque los bacteriófagos más nuevos serán capaces de destruir la
cepas bacterianas, que desarrollaron resistencia contra los fagos utilizados anteriormente.
Otra ventaja de los fagos es que si se purifican adecuadamente, son inofensivos.
para los seres humanos y se pueden utilizar como autodosis en el lugar de la infección. Están seguros
para uso incluso por pacientes inmunodeprimidos porque no causan una toxicidad
efecto sobre el hígado y los riñones. Hay dos opciones para las terapias con fagos. Ellos pueden
ser "personalizado" que tiene como objetivo apuntar a un patógeno causante que está causando un
infección en un paciente individual o una combinación de varias cepas de fagos que
se puede utilizar para apuntar a más de una especie bacteriana patógena (Penchovsky y
Traykovska 2015 ; Jonczyk-Matysiak y col. 2019; Duckworth 1976; Pelfrene y col.
2016; Sharma y col. 2017; Domingo-Calap y col. 2016; Borysowski y Gorski 2008).
Después de inyectar el genoma de un fago en el citoplasma bacteriano, la replicación
dentro del hospedador sigue el uso de modo lítico o lisogénico. Los fagos usan el
maquinaria celular de la bacteria que infectan para algunos procedimientos como la sín-
tesis de proteínas y como sistemas generadores de energía. De hecho, pocos virus pueden utilizar
modo lítico y lisogénico (Sharma et al.2017). Cuando se utilizan fagos líticos,
pueden lisar y destruir las bacterias. Por tanto, se liberan virus de la progenie. Luego
los fagos se vuelven capaces de ser usados nuevamente e infectar otras bacterias. A diferencia de,
Los fagos lisogénicos deben primero integrar su información genética en el genoma de
el host y replicar junto con el host. Mediante este proceso, las bacterias huésped se convierten en
TIENE PROPIEDADES NUEVAS. Los fagos líticos se consideran más adecuados como par-
tículos en comparación con los fagos lisogénicos (Penchovsky y Traykovska 2015 ;
Domingo-Calap y col. 2016 ).
Desafortunadamente, hay casos en los que el fracaso del tratamiento con el uso de
se observan fagos. Algunas de las razones que pueden estar relacionadas con la terapia con fagos
Se considera que las fallas son la forma de reparación de los fagos, las condiciones en las que
que almacenaron, la forma de su aplicación, la farmacocinética, diferentes estados inmunológicos
de los pacientes, otros fármacos que se utilizan en combinación con los fagos y los hábitos alimentarios
(Jonczyk-Matysiak et al. 2019 ). Durante la última década, un campo donde más
Se investiga el uso de fagos en infecciones del tracto urinario. Infección del tracto urinario
son la segunda causa más común de enfermedades infecciosas después de la neumopatía.
nia. Es bien sabido que las infecciones del tracto urinario afectan predominantemente a la mujer.
población debido a algunas características específicas de las hembras como la anatomía de la
sistema genitourinario, así como los ancianos cuyo sistema inmunológico y microbiota
cambiar durante los años. El agente más común, al que se atribuye el tracto urinario.
infecciones es Escherichia coli , una bacteria anaerobia facultativa gramnegativa
perteneciente a la familia Enterobacteriaceae. Una bacteria se encuentra normalmente en los intestinos.
dientes como parte de la flora gastrointestinal normal aunque, en algunas condiciones,
puede volverse patógeno y causar infecciones. E. coli está incluida en una lista que fue
publicado por la Organización Mundial de la Salud (OMS 2015 ). Esta lista incluye el
patógenos prioritarios para los que se deben descubrir con urgencia antibióticos. E. coli
pertenece a la categoría de bacterias críticas. Las opciones de tratamiento para el tracto urinario.
Las infecciones generalmente implican el uso de antibióticos.
Sin embargo, el desarrollo de la resistencia es rápido y durante la última década, la
La situación empeoró debido a la presencia de betalactamasa de espectro extendido.
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218 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
producir E. coli (BLEE-CE) que hace que el tratamiento de la infección del tracto urinario
ciones con el patógeno E. coli más difíciles (Pena et al. 1997). El peor escenario es
observado en los casos en que los patógenos son resistentes a todas las recomendaciones
antibióticos para el tratamiento de la infección. La presencia de multirresistente
cepas junto con cepas extensivamente resistentes a los medicamentos (XDR) conducen a la necesidad urgente
por el descubrimiento de nuevos fármacos capaces de combatir las infecciones del tracto urinario.
El uso de fagos como alternativa parece ser muy prometedor y, en comparación,
al uso de antibióticos, parecen tener muchas ventajas. Las formas en que los fagos pueden ser
se utilizan terapias con monófagos en las que solo se utiliza un tipo de fago y
terapias en las que se utilizan más tipos de fagos o un cóctel de fagos. Cuando poli
se utilizan terapias de fagos, se evita el aumento de bacterias patógenas, la gama de huéspedes
aumenta y son eficaces contra las infecciones que forman biopelículas. Genéticamente
Los fagos diseñados son un gran avance y son un campo de interés emergente para la ciencia.
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la investigación de los entistas en la actualidad. Con su uso, pueden obtener las características deseables.
isticos que los fagos deben tener para ser utilizados eficazmente contra los antibioticos resistentes
bacterias. Enzimas o proteínas fago-líticas, que son endolisinas y asociaciones de viriones.
Las lisinas agitadas (VAL), son moléculas que tienen propiedades antibacterianas. Son pro
derivado de fagos y mediante algunos mecanismos; provocan la rotura del
pared celular bacteriana. Otra opción terapéutica es el uso de fagos en combinación.
con antibióticos, que actúan en sinergia. Esta combinación tiene como objetivo luchar contra los resistentes
cepas bacterianas (Malik et al.2019; Goodridge 2010; Lehman y Donlan 2015 ;
Moller-Olsen y col. 2018; Fischetti 2005 ; Rodríguez y col.2011 ).
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con la capacidad de ingresar directamente a las celdas y entregar su carga dentro de ellas (Kauffman
et al. 2015 ). La mayoría de los péptidos que penetran en las células son anfipáticos, tienen una
carga neta positiva y no muestran ninguna especificidad celular (Rodríguez et al. 2014 ). La
El tamaño de un péptido que penetra en las células varía generalmente entre 6 y 30 residuos (Nakase
et al. 2012 ). Ha sido discutible si los péptidos antimicrobianos y la penetración celular
Los péptidos ing deben separarse en diferentes categorías o si uno de ellos debe ser
una categoría subordinada a la otra (Langel 2019). Aquí describimos brevemente algunos
péptidos antimicrobianos y péptidos penetrantes de células divididos en 2 categorías a saber.
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MIC Referencia
Péptido Secuencia (μM) No
Bac7 (1-35) RIRPRPPRLPRPRPRPLPFPRPGPRPIPRPLPFP 0,5-1 Benincasa
et al. ( 2009 )
Pirrocoricina VDKGSYLPRPTPPRPIYNRN 5 Narayanan
et al. ( 2014 )
Hc-CATH KFFKRLLKSVRRAVKKFRKKPRLIGLSTLL 0,16– Wei y col.
20,67 ( 2015 )
LL-37 LLGDFFRKSKEKIGKEFKRIVQRIKDFLRNLVPRTES 5 Narayanan
et al. ( 2014 )
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9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 221
MIC
Secuencia de péptidos (μM) No de referencia
pVec LLIILRRRIRKQAHAHSK 4-16, 25 Alaybeyoglu et al. ( 2018 ), Akdag
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y Ozkirimli (2013), Palm y col.
( 2006 )
Pep-1 KETWWETWWTEWSQPKKKRKV 8–32 Splith y Neundorf (2011)
Energía- KKTWWKTWWTKWSQPKKKRKV 1–8 Zhu y col. ( 2006 )
1- k
Tat 49–57 RKKRRQRRR 2-4, una Splith y Neundorf (2011) a , Lv
8-16 et al. ( 2017 )
a Nota: El valor de MIC es para Tat 48–60
caso de deleción cromosómica espontánea del gen sbmA, las bacterias se vuelven
resistente a pirrocoricina.
Hc-CATH es el primer péptido antimicrobiano catelicidina, que se descubrió en
serpientes marinas (Wei et al. 2015 ). Hc-CATH, así como otros péptidos de la cateli-
familia de las cidinas, tiene un papel fundamental contra las infecciones microbianas en los vertebrados. La
La estructura de Hc-CATH es muy estable y está compuesta por 30 aminoácidos con dos
Regiones de α-hélice (Wang et al. 2018 ). Hc-CATH demuestra baja citotoxicidad en
células mamíferas. Mientras tanto, muestra una alta actividad antibacteriana en varios Gram
bacterias negativas y Gram positivas como Aeromonas salmonicida, Bacillus sub-
tilis, Escherichia coli, Lactococcus garvieae, Klebsiella pneumoniae, Nocardia
asteroides, P. aeruginosa, Staphylococcus aureus, Shigella dysenteriae, Streptococcus
iniae y Vibrio (Vibrio vulnificus, Vibrio fluvialis, Vibrio splendidus).
LL-37 se deriva de la catelicidina humana y tiene una estructura α-helicoidal (Splith
y Neundorf 2011 ; Seil y col. 2010 ). Consta de 37 residuos de aminoácidos y
demuestra una alta actividad antibacteriana hacia bacterias como E. coli, L. monocy-
togenes, P. aeruginosa, S. aureus y S. epidermidis . Sin embargo, LL-37 también muestra
toxicidad en células de mamíferos debido a la interrupción de la integridad de la membrana celular
brana y es quimiotáctico para neutrófilos, monocitos y células T (cuadro 9.2).
Por lo tanto, los derivados de LL-37 o las moléculas que imitan serían más adecuados para
el tratamiento de bacterias resistentes en personas.
Un ejemplo popular de actividad antibacteriana es pVEC (Nan et al. 2011 ). Es
derivada de la proteína cadherina endotelial vascular murina e inhibe Gram
bacterias positivas y Gram negativas a una concentración inhibitoria mínima de
4–16 µM. El N-terminal de pVEC (LLIIL) es hidrofóbico y tiene un significativo
papel en el efecto antibacteriano según investigaciones recientes (Alaybeyoglu et al.
2018). Según lo declarado por el equipo de investigación, el N-terminal contribuye a la formación de bacterias
rotura de la membrana y, si se elimina, pVEC pierde su efecto antibacteriano.
Ejemplos de bacterias inhibidas con pVEC son E. coli y Bacillus megaterium
(Palm et al. 2006 ).
Pep-1 tiene una estructura quimérica, que consiste en la secuencia de localización nuclear de
virus de simio 40 antígeno T grande y de la transcriptasa inversa de la inmunidad humana
virus de la deficiencia de nódulos (Splith y Neundorf 2011). Pep-1 puede afectar a muchos Gram
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222 A. Valsamatzi-Panagiotou y col.
Bacterias positivas y Gram negativas pero aun así, tiene una débil actividad antibacteriana.
Sin embargo, diferentes modificaciones de su estructura demuestran el potencial de este
péptido penetrante celular. Por ejemplo, Pep-1-K ha reemplazado 3 residuos de glutamato
(Glu-2, Glu-6, y Glu-11) con lisina (Zhu et al. 2006). Como resultado, el antibacteriano
La actividad rial aumenta significativamente hacia Gram positivos y Gram negativos.
bacterias, además de los aislados clínicos de Pseudomonas aerugi-
nosa y resistente a la meticilina aureus Staphylococcus (Kauffman et al. 2015). Tat es
el dominio de transducción mínimo derivado del virus de inmunodeficiencia humana-1
(VIH-1) Proteína Tat (Lv et al. 2017). Consta de 9 residuos de aminoácidos y es un
péptido rico en arginina. No muestra toxicidad en eritrocitos humanos. De acuerdo a
Splith et al., Tat demuestra el efecto inhibidor en varios Gram positivos y
Bacterias Gram negativas como S. aureus (Splith y Neundorf2011 ).
De hecho, la incapacidad general para el desarrollo de resistencias frente a los antimicrobianos
péptidos y péptidos penetrantes de células les da una gran ventaja en comparación
a los antibióticos. Las empresas farmacéuticas han invertido en péptidos antimicrobianos
y la investigación de péptidos penetrantes de células como una posible opción terapéutica futura.
Además, muchos péptidos antimicrobianos ya llegaron a los mercados y
Hay muchos en ensayos preclínicos y clínicos que están en proceso en la actualidad.
(Boparai y Sharma 2019 ).
9.10 Conclusión
Eventualmente, las bacterias pueden desarrollar resistencia contra cualquier antibiótico. En años recientes,
la tasa de aparición de resistencia a los antimicrobianos aumenta constantemente debido a la
uso indebido generalizado de antibióticos tanto en la medicina humana como en la veterinaria. Como un
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7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Como resultado,
patógenos más personas
bacterianos. mueren
Necesitamos en todo
abordar el problema
este mundo poraplicando
infecciones
doscausadas porprincipales
estrategias fármacos resistentes
gies. El primero es reducir significativamente el uso indebido de antibióticos en todo el mundo. La
El segundo enfoque general que debemos emplear es desarrollar nuevos métodos mucho más eficientes.
enfoques para el desarrollo de fármacos antimicrobianos. Por ejemplo, podemos aplicar antisentido
tecnología de oligonucleótidos para la inhibición de cualquier ARN bacteriano que sea un
objetivo de la droga. Podemos utilizar varios tipos de oligopéptidos penetrantes de células adheridos a
los oligonucleótidos antisentido para su entrega a la célula bacteriana. Aplicando
Estos enfoques de diseño de fármacos pueden reducir significativamente el tiempo y el costo de los
desarrollo de fármacos microbianos debido a los principios fundamentales de diseño y aplicación
Los oligonucleótidos antisentido son bien conocidos. Incluso cuando se desarrollan bacterias
resistencia contra un oligonucleótido antisentido mediante la mutación de la secuencia diana,
puede abordar fácilmente eso manipulando el diseño de oligonucleótidos antisentido.
Agradecimientos Este trabajo fue financiado por una beca DN / 13/14 / 20.12.2017 otorgada por la
Fondo Nacional de Ciencias de Bulgaria (BNSF).
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9 Descubrimiento de fármacos para atacar bacterias resistentes a los fármacos 223
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Índice
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195, 207–211, 215, 219, 220, 222 de Oliveira Tosta, SF, 84–102
Oligonucleótidos antisentido, vii, 210-216, 222 Dholpuria, S., 2–23
Autoinductores, 196 Descubrimiento de fármacos, vii, 205-222
Azevedo, V., 84–102 Duan, X., vi, 110-121
DuPont, A., 35 años
B
Bacteriófagos, 16, 17, 85, 91, 131, 136, 137, mi
139, 140, 149, 166–168, 216, 217 Vigilancia ambiental, 3
Barh, D., 92 años Exopolisacáridos, 153-155, 162, 164,
Bertrand, KP, 117 166, 182
Más grande, J., 111
© El (los) editor (es) (si corresponde) y el (los) autor (es), bajo licencia exclusiva para 229
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Página 244
230 Índice
GRAMO
Transferencia de genes, 15, 16, 62 O
Genómica, 2, 16, 49–51, 91–102, 115, 117, Una salud, v, vi, 1–23, 36, 41–44, 86
118, 211–212, 216 O'Neill, J. Sir, 65 años
Ghangal, R., 130-141
Ghosh, S., 148–169
Plan de acción mundial, 19, 36, 86 PAG
Programas de vigilancia mundial, 33–54 Pangenómica, vi, 91–94
ARN guía, 134-138, 141 Patnaik, S., 130–141
Penchovsky, R., 206–222
Población bacteriana persistente, 109
H Fitocompuestos, 149, 158–160
Cribado de alto rendimiento, vi, 115-117, Popova, KB, 206–222
189, 211 Precursor CRISPR RNA (pre-crRNA), 132,
Transferencia horizontal de genes, 2, 6–7, 10, 15, 134, 135
16, 62, 139 Priorización de objetivos farmacológicos, vi, 83–102
Proteómica, 91, 118, 120, 121
Motivo adyacente al protospacer (PAM), 134-136
I
Cooperación internacional, 19
Q
Detección de quórum (QS), vi, 111, 121, 156,
J 158–160, 162, 177–196
Jain, C., 130-141
Jaiswal, Alaska, 84–102
R
Remmele, CW, 99
K Resistencia, v, vi, 2–23, 34–43, 45–54, 60,
Kumar, S., v, vi, 34–54, 178–196 62–65, 72, 74, 75, 84–86, 88–91, 102,
Kumar, V., 34–54 110, 116, 130, 136, 140, 141, 148–150,
153, 154, 156-158, 166, 167, 169, 178,
186, 192-196, 209, 213, 214, 216, 217,
L 219, 222
Langel, U., 220 Conmutadores rib, 210, 211, 213
Lennox, L.-B., 112 Binatos de ARN, 134, 135
METRO S
Reconstrucción de la vía metabólica, 95 Sajjad-ur-Rahman, Ali.J., 60–77
Metabolómica, 118, 121 Santana, M., v, 84-102
Página 245
Índice 231
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 172/173
7/7/2021 Harsh Panwar Chetan Sharma Eric Lichtfouse Editores Mitigación de la resistencia a los antimicrobianos Vol 1 Herramientas y objetivos
Shad, AA, 60–77 Tiwari, S., 84–102
Shandilya, S., 178–196 Transcriptómica, 91, 95, 118, 119
Sharma, JK, 2–23
Shouche, Y., 2–23
Singh, BP, vi, 148–169 V
Singh, KS, v, vi, 2–23, 178–196 Valsamatzi-Panagiotou, A., vii, 206–222
Soares, SC, 84-102
Solanki, M., 130-141
Steele, 35 años Y
Genómica sustractiva, vi, 91–94 Yadav, M., 34–54
Vigilancia, v, 3, 6, 18-21, 23, 34-54, 64, 65, Yang, L., 110-121
72, 75, 86, 209
Biología del sistema, 110-121
https://translate.googleusercontent.com/translate_f 173/173