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en organismos acuícolas
John Snow
https://www.youtube.com/watch?v=_d2v42hgne0
Definición de epidemiología,
epidemiología veterinaria
• Palabras griegas epidemia y logos (tratado o estudio)
• Palabras griegas epi (sobre), demos (pueblo) y logos (tratado o estudio)
• Término griego epidemeo (visitar), que hace referencia a la enfermedad
que se introduce (visita) en una comunidad
hacia arriba
Estudio de enfermedades en
poblaciones
Para conocer que sucede y como actuar en el caso de un brote de epidémico en
una población es necesario responder las siguientes preguntas:
Tesis de Maestría,
Gainza 2006
Modelaje - Simulación
Susceptibles Recuperados
Infectados
Tiempo
Transmisión viral (WSSV)
100
Prevalencia de WSSV(%)
80
60
40
20
0
0 7 14 21 28 35 42 49 56 63 70 77 84 91 98 105 112
Tiempo de cultivo (d’as)
No
Incubación Sintomático enfermo
Dinámica de la
enfermedad
Tiempo
Intervenciones tempranas son las más adecuadas porque evitarán más gastos de dinero
Triángulo de Sniezko
Hospedero Agente
patógeno
Enfermedad
Ambiente
Hospedero Agente
• Especie • Clima
• Edad • Localización
• Tamaño • Dieta
• Manejo
Ambiente • Estrés
• Portadores
Enfermedad
Enfermedad de la mancha blanca
• Portal de entrada: región oral, oregano linfoide, epitelios, branquias
• Portal de salida: exuvios, descamasión de epitelios •Carga viral
• Transmisión por contacto con el agua • Patogenicidad,
• Transmisión por canibalismo transmisión y
virulencia
relacionadas con
temperatura
• Cepas más
virulentas
Hospedero Agente
• Bajas temperaturas
•Todas las especies • Estación climática fría
•Juveniles más susceptibles • Variación de temperatura
•Variabilidad en susceptibilidad • Localización geográfica
(resistencia) • Densidad de siembra
•Ciertos estadíos de (mortalidad
en post-muda) Ambiente • Número de animales
• Estrés
• Portadores
• Tiempo de cultivo
Enfermedad
Temperatura (0C)
32
30
31
30
20
29
28
Prevalencia WSSV (%)
Control 10
27
Policultivo baja densidad
26
Policultivo alta densidad
25 0
0 7 14 21 28 35 42 49 56 63 70 77 84
Tiempo de
Tiempo de cultivo
cultivo (d’as)
(días)
Epidemiología y estadística
Población Muestra
Distribuciones de muestreo
Parámetro Estadístico
Inferencia
Libro de estadística para
epidemiología
Medidas de frecuencia de
una enfermedad
Proporciones
Utilizado para:
A1 A2 … An Prob. Marginal
B1 P(A1,B1) P(A2,B1) … P(An,B1) P(B1)
B2 P(A1,B2) P(A2,B2) … P(An,B2) P(B2)
… … … … … …
Bm P(A1,Bm) P(A2,Bm) P(An,Bm) P(Bm)
Prob. Marginal P(A1) P(A2) … P(An) 1
• Prueba de contraste: Estadístico que compara frecuencias observadas y esperadas (esta última
asumiendo que no hay asociación entre las variables)
( O − E − 0.5) 2 En tabla de 2 buscar el P-value asociado al
Pr ueba 2 = E estadístico de la prueba, con 1 grado de
gl = (2 -1) x (2 – 1) = 1 libertad
Ejemplo: Frecuencia de infección en
dos localidades
Hipótesis nula H0: No asociación entre temperatura y enfermedad (independencia) o que
la proporción de enfermos es igual en individuos expuestos a baja que a alta temperatura
Frecuencias observadas Frecuencias esperadas
Temperatura Enfermos No Total marginal de fila Temp Enfermos No enfermos
enfermos
Conclusión: Existe una asociación entre temperatura y enfermedad, es decir hay una dependencia entre
las dos variables, o lo que es lo mismo, la proporción de individuos enfermos es mayor a temperatura baja
que a temperatura alta.
Distribución Chi-cuadrado (2)
Expuestos (Temperatura 26 24 50
baja)
No expuestos (Temperatura 12 38 50
alta)
Total marginal de columna 38 62 100
Expuestos (Temperatura 26 24 50
baja)
No expuestos (Temperatura 12 38 50
alta)
Total marginal de columna 38 62 100
Por tanto, tamaño de muestra (n) depende de: Estas fórmulas son usadas para poblaciones
• Confianza (z) grandes, generalmente cuando N > 1000 y la
fracción de muestreo es pequeña comparada
• Variabilidad (desviación estándar)
con el tamaño de la población (n/N < 10 %)
• Error muestral máximo aceptado
Tamaño de muestra ajustado (na) para estimar
una media, considerando el tamaño de la
población (N)
z / 2 2
2
n= 2
Asíntota = n Error muestral
nN
na =
N+n
z / 2 2
2
( z / 2 ) 2 p q
n= n=
Error muestreal 2 2
Errormuestral
n = tamaño de muestra
z/2 = valor distribución normal, a una determinada confianza
p = proporción aparente de la variable que se quiere evaluar
q=1-p
= pq
70 nN
na =
60
N+n
Tamaño de la muestra n
Tamaño de 50
muestra
(n) 40
30
20
10
0
0 1000 2000 3000 4000 5000 6000 7000 8000 9000 10000
Tamaño de la población N
( z / 2 ) 2 p q
n=
E2
Proporción p
Resumen: tamaño de muestra para estimar
los dos principales casos
5 6 A
4
7 8
Estratos
9
Estrato 10 1 2 3
4 5 6 B
7 8 9
10 11 12
11 C
13 14 15
Muestreo donde la población está compuesta de varios estratos distintos entre sí, con distinto tamaño y
mutuamente exclusivos (localidad, edad, etc.)
• Entre estratos son distintos en la característica de interés
• Dentro de cada estrato, los individuos son muy similares en la característica de interés
• Todos los estratos son muestreados, por lo que se necesita conocer número de individuos de cada
estrato. Conocimiento a priori de estratos
• Dentro de cada estrato, los individuos son seleccionados aleatoriamente utilizando un determinado
criterio (muestreo aleatorio simple, sistemático)
• La distribución del tamaño de muestra a cada estrato es seleccionado por una asignación (afijación )
• Estimaciones más precisas si la población está realmente estratificada y si los individuos dentro de
los estratos son homogéneos, porque se tendrá más información de la característica de interés en las
subpoblaciones
Tamaño de muestra de los estratos en muestreo
estratificado
N = tamaño de la población
n = tamaño de muestra de la población N --------- n
Nh = tamaño de la población en cada estrato Nh ---------- nh
nh = tamaño de muestra de cada estrato
Afijación proporcional: Afijación óptima: Tamaño de Afijación óptima con costo variable:
Tamaño de muestra muestra asignado a los estratos es Tamaño de muestra asignado a los
asignado a los estratos es proporcional a sus tamaños y a las estratos es proporcional a los tamaño
roporcional Costo del muestreo
N k
= nWh C ch nh
proporcional a sus desviacioneshestándar de los estratos y a la variabilidad, pero
tamaños nh = n = c0 +
también es inversamente proporcional
N al costo del muestreo en cada estrato
h =1
ptima con costo
Afijación óptima
variable Nh
sh
Nh N h sh
nh = n =nh nW= hn k ch
nh =
sh
N n k
Nh
= nW h N h sh
Nh
n
N h =1 h =1 ch
Estimadores del valor promedio y error estándar de
la característica Y de la población estratificada
k
Valor promedio de la =
Nh
Y yh
característica Y de la h =1 N
población estratificada
que se está muestreando
N h2 S h2
k
Error estándar de la media SEM = 2 (1− f h )
(standard error of the mean) h =1 N nh
Fracción de muestreo f nh
h =
Nh
A
Estratos
B
C
• Entre grupos, distintos •Entre grupos, parecidos Tamaño de los conglomerados es grande
• Dentro de cada grupo, •Dentro de cada grupo, • Población dividida en conglomerados
individuos similares entre si individuos distintos entre si • Etapa 1: Se selecciona conglomerados
• Etapa 2: Se selecciona individuos
dentro de cada conglomerado
• Identificación, evaluación y
manejo de riesgos
asociados con la
importación de
animales/plantas y
productos derivados de
animales/plantas
Determinación del riesgo por
importación de la mercancía
Identificación de Lista de agentes Programas control
peligros patógenos Exóticas, emergentes
Epidemiología enfermedad
Presencia en país Métodos ausencia de enfermedad
Evaluación de Prevalencia Metodología de muestreos
probabilidad de Características Incubación, propagación
introducción del epidemiológicas de la
peligro desde Portadores, fauna silvestre
enfermedad y agente
origen al punto Morbilidad, Mortalidad
de entrada al Inactivación del agente
país
Pruebas diagnóstico Sensibilidad de diagnóstico
Evaluación de Especies susceptibles Vías de exposición, vectores
exposición de y factores en país Manejo, clima, volumen
especies al importador
patógeno
Evaluación de Consecuencias Especies susceptibles, mortalidad
consecuencias biológicas y Impacto económico directo, indirecto
económicas
Matriz de estimación de riesgo
Alto Despreciable Muy Bajo Bajo Moderado Alto Extremo
Probabilidad de RIESGO
entrada y
exposición
Consecuencias
Vigilancia Epidemiológica y
Planes de Acción