La reacción de Schmidt comienza con un ion acilio obtenido a partir de
la protonación del ácido carboxílico y su posterior pérdida de agua (1). La reacción siguiente con ácido hidrazoico forma el catión 3-aciltriaz-1-in-2-io (2), el cual sufre una reacción de transposición con el grupo alquilo R y la migración en el enlace CN con la expulsión de nitrógeno diatómico (3). Así, se forma un isocianato protonado el cual es atacado por el agua formando el carbamato (4), el cual después de la desprotonación pierde dióxido de carbono y forma una amina primaria. La reacción está relacionada con la transposición de Curtius, excepto que en esta reacción la azida es protonada y por lo tanto presenta con intermediarios diferentes. En el mecanismo de reacción para la reacción de Schmidt a partir de una cetona, el grupo carbonilo es activado por una protonación (1), la cual da el ácido conjugado activo para una adición nucleofílica por la azida(2), formándose un intermediario 3-(1-hidroxi-1- dialquil)triaz-1-in-2-io (3). Este catión pierde agua por eliminación y se forma un 3-(1- alquiliden)triaz-1-in-2-io (4). Uno de los grupos alquilo migra al nitrógeno imínico con la pérdida de nitrógeno diatómico, que se convierte en el intermediario 5. Una migración similar se encuentra en la transposición de Beckmann. La hidrólisis (6) forma un ácido carboximídico, el cual tautomeriza a la amida deada (7).