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5.

ADN         

5.1. Replicación del ADN:

Mecanismo semiconservativo
La replicación del ADN es semiconservativa, Esto significa que cada una de las dos cadenas en
el ADN bicatenario funciona como molde para producir dos cadenas nuevas. Mecanismo de
Replicación semiconservativa, En este modelo, las dos cadenas de ADN se desenrollan y cada
una sirve como molde para la síntesis de una nueva cadena complementaria.

Origen de replicación
Un origen de replicación es el lugar del cromosoma
donde se inicia la replicación de la cadena de ADN.
Se trata, por lo tanto, de una determinada secuencia de
nucleótidos a partir de la cual se desarrolla la
horquilla de replicación que dará lugar a las dos
cadenas idénticas de ADN resultantes. Los orígenes
de la replicación son secuencias mayores, en
levaduras de unos 400 pares de bases, que se presentan en varios puntos de los cromosomas.

Replicón
Un replicón es una molécula circular de ADN, que inicia el ciclo de replicación, controla la
frecuencia de eventos de iniciación de la replicación, segrega el cromosoma replicado a la célula
hija y ordena la producción de componentes estructurales de la célula.

Replicación del DNA en procariotas y eucariotas.


La replicación en las procariotas tiene un único origen, mientras que en las eucariotas tienen
diversos orígenes. En las procariotas hay tres ADN polimerasas, mientras que en
las eucariotas hay cinco. La replicación es mucho más rápida en la procariota que en la eucariota

Los eucariotas tienen varios cromosomas lineales, cada uno con múltiples orígenes de
replicación. Las mayorías de los cromosomas eucariontes son lineales. Debido a la forma en que
se hace la cadena rezagada, en cada ronda de replicación se pierde un poco de ADN en los
extremos de los cromosomas en cada ronda de replicación.

Horquilla de replicación
Zona de la doble hélice de DNA donde se produce el desenrollamiento de las dos cadenas
polinucleotídicas y la síntesis de las nuevas cadenas.
Helicasas, topoisomerasas, primasas, DNA polimerasas y DNA ligasas.
 Helicasas, enzimas que separan las dos cadenas de la molécula de ADN parental.
 Topoisomerasas, enzimas que desenrollan el ADN y lo relajan.
 Primasas, enzimas que sintetizan el cebador, éste suele ser un corto fragmento de ARN,
necesario para que pueda comenzar la ADN polimerasa III, y que posteriormente será
eliminado y sustituido por un fragmento de ADN por la ADN polimerasa I.
 ADN ligasas, enzimas que se encargan de unir trozos formados de cadenas, realizando un
enlace fosfodiéster entre los nucleótidos pertenecientes a dos segmentos de una cadena.
 Las ADN polimerasas son enzimas que catalizan la síntesis de moléculas de ADN a
partir de desoxirribonucleótidos, en el ADN permite el paso de información genética a las
células hijas de generación en generación.

Cadena líder y cadena retardada


La cadena retardada es la hebra de ADN que se hará sintetizando y añadiendo segmentos
pequeños a la vez -los fragmentos de Okazaki- en un proceso más lento durante la replicación de
este ADN.La cadena de ADN 3' también se conoce como la cadena líder o adelantada y es
copiada por la polimerasa del ADN de forma continua.

Fragmentos de Okazaki
Los fragmentos de Okazaki son segmentos de ADN que se sintetizan en la cadena rezagada
durante el proceso de replicación del ADN. Son llamados así en honor a sus descubridores,
Reiji Okazaki y Tsuneko Okazaki, quienes en 1968 estudiaron la replicación del ADN en un
virus que infecta a la bacteria Escherichia coli.

Telómeros y telomerase
 Los telómeros son regiones no codificantes del genoma,
ubicadas en los extremos de los cromosomas, que
consisten en largas series de secuencias cortas y repetidas
formadas por bases nitrogenadas 5’-TTAGGG-3’ y por
proteínas asociadas, que desempeñan un papel importante
en el mantenimiento y la integridad del ADN.
 La telomerasa está activa en las primeras etapas del
desarrollo y, durante toda la vida, en células madre sanguíneas, germinales y de tejidos
adultos en renovación continua, como, por ejemplo, en el tejido endometrial.

Errores introducidos en la secuencia del DNA


Los daños en el ADN pueden generar cambios en la expresión de genes, crecimiento celular e
incluso tumores. Estos daños pueden ser atribuidos a diversos procesos metabólicos endógenos,
que producen radicales libres de oxígeno y nitrógeno altamente reactivos, que alteran bases y
atacan directamente el ADN. Se ha estimado que cada célula puede experimentar hasta 105
lesiones espontáneas en un día, lo cual indica que la molécula de ADN es constantemente
agredida y alterada por distintos factores.

Sistemas de reparación de errores


En las células existen diferentes maneras de reparar el ADN, dependiendo del tipo de daño y de
los componentes que se encuentren cercanos o sean más asequibles. Las vías más importantes
para reparar los daños en una sola cadena del ADN son la reparación por escisión de bases, la
reparación por escisión de nucleótidos y la reparación por mal apareamiento de las bases,
mientras que la reparación por unión de extremos no homólogos y la reparación por
recombinación homóloga son más comunes para los daños en ambas cadenas.

Rol de polimerasas, nucleasas y ligasas


 Las nucleasas son enzimas capaces de hidrolizar los enlaces fosfodiester que se dan
entre los nucleó7dos de los ácidos nucleícos.
 La ADN ligasa es una enzima que une ADN. Si dos fragmentos de ADN tienen extremos
complementarios, la ligasa puede unirlos para formar una molécula única e intacta de
ADN.
 Las ADN polimerasas juegan un papel clave en la replicación del ADN permitiendo el
paso de información genética a las células hijas de generación en generación.

Respuesta SOS en Escherichia coli


La respuesta SOS es una respuesta global al daño del ADN que se produce cuando los daños
acumulados son tantos que impiden el avance de la maquinaria de replicación. La respuesta SOS,
durante la cual se incrementa la expresión de un grupo de genes cuya función es la de reparar el
daño en el DNA y conferir a la célula más oportunidades de sobreponerse y sobrevivir en
condiciones de estrés.

5.2 Organización supramolecular del DNA:

Cromatina y cromosomas
o La cromatina es el material de que están compuestos los
cromosomas, y consiste en ADN y proteínas. Su función
es la de empaquetar el ADN, organizarlo de forma que
quepa dentro del núcleo. Por lo tanto, la cromatina es la
manera en que el ADN se estructura dentro de la célula. 
o Los cromosomas son estructuras que se encuentran en el
centro (núcleo) de las células que transportan fragmentos
largos de ADN. El ADN es el material que contiene los genes y es el pilar fundamental
del cuerpo humano.

Heterocromatina y eucromatina.
 Eucromatina: representa la cromatina descondensada durante la interface.
 Heterocromatina: representa una forma condensada de cromatina que no altera su nivel
de compactación durante el ciclo celular.

Niveles de compactación del DNA


 Primer nivel: nucleosoma, son proteínas básicas de baja masa molecular, está
constituida por fibra de AND de 20 A.
 Segundo nivel: solenoide, se forma enrollando sobre si misma de la fibra de cromatina
de 100 A condensada.
 Tercer nivel: dominios estructúrales en forma de bucle, la fibra de 300 A forma una serie
de bucles, de entre 20000 y 70000 pares de bases de longitud.
 Cuarto nivel: cromosoma metafísico, la fibra de 300 A tan solo consigue reducir la
longitud de la fibra de ADN de 20 A entre una 35 o 40 veces.

Histonas
La histona es un Tipo de proteína que se encuentra en los cromosomas. Las histonas se unen al
ADN, ayudan a dar su forma a los cromosomas y ayudan a controlar la actividad de los genes.
Forman la cromatina, junto con el ADN, sobre la base, entre otras, de unas unidades conocidas
como nucleosomas, la cromatina reduce el tamaño lineal del ADN dentro del núcleo,
compactándolo.

Nucleosomas
El nucleosoma es la unidad básica de repetición de la cromatina eucariótica. En
una célula humana, cerca de dos metros de ADN deben ser empaquetados en un núcleo con un
diámetro inferior a un cabello humano. Un nucleosoma se compone de alrededor de 150 pares de
bases de ADN enrolladas alrededor de un núcleo de histonas.

Proteínas no histónicas asociadas al DNA


Las proteínas no histonas son muy heterogeneas en
su composición. Sus funciones pueden agrpuparse
en dos categorías:

 Algunas son estructurales, e intervieven en la

fijación de la fibra de cormatina de 30


nmm o de la forma de los cormosomas.
Otras tienen funciones relacionadas con
la actividad del DNA e intervienn en
procesos como son la replicación, transcripción y su regulación.
 Proteínas HMG: son proteínas no-histonas asociadas a la cromatina. Estas proteínas de
unión al ADN pueden ayudar a espaciar el plegamiento del nucleofilamento.

Bandeo de cromosomas
 El bandeo cromosómico es una técnica que se utiliza para visualizar los diferentes segmentos, o
bandas, de los cromosomas. Estas bandas se ven cuando los cromosomas se tiñen con productos
químicos y se observa bajo un microscopio.

Hibridización de cromosomas (“FISH”)


La Hibridación fluorescente in situ (FISH) es una técnica de laboratorio para detectar y localizar
una secuencia específica de ADN en un cromosoma. La técnica se basa en exponer los
cromosomas a una pequeña secuencia de ADN llamado sonda que tiene una molécula
fluorescente pegada a ella. La secuencia de la sonda se une a su secuencia correspondiente en el
cromosoma.

Replicación de cromosomas
El mantenimiento de la integridad del genoma durante la replicación cromosómica y la fidelidad
en la síntesis del DNA son esenciales para la correcta transmisión de información genética en
cada ciclo de división celular. Inevitablemente, la replicación cromosómica está amenazada por
la existencia de daño en el material genético, lo que constituye una potencial fuente de errores y
un riesgo para la estabilidad y progresión de las horquillas de replicación.

Origen de replicación, centrómeros y telómeros.


 Un origen de replicación es el lugar del cromosoma donde se inicia la replicación de la
cadena de ADN de una determinada secuencia de nucleótidos a partir de la cual se
desarrolla la horquilla de replicación que dará lugar a las dos cadenas idénticas de ADN
resultantes.
 El centrómero es la región estrecha de un cromosoma que lo separa en un brazo corto
(p) y un brazo largo, a raíz de la replicación del ADN, el cromosoma queda formado por
dos estructuras idénticas llamadas cromátidas hermanas, que están unidas por
el centrómero.
 Los telómeros son secuencias repetitivas de ADN no codificante del cromosoma que
protegen de cualquier daño.

5.3. Estructura molecular del gen y organización del genoma:

Definición molecular del gen


A nivel molecular Un gen es la unidad física y funcional de la herencia heredadas de padres a
hijos. Los genes están compuestos por ADN y prácticamente todos ellos proporcionan la
información para confección una proteína específica.

Organización y estructura molecular de los genes en procariotas y eucariotas


 En las células eucariotas el ADN está contenido dentro del núcleo celular, mientras que en las
células procariotas, que no tienen un núcleo definido, el material genético está disperso en el
citoplasma celular.

Los genes eucariotas poseen segmentos de exones e intrones. Todas las células de un organismo


portan la misma información genética y se diferencian unas de otras por la expresión génica. Los
“genes maestros” son los que regulan la acción de otros genes.

El cromosoma procariota se encuentra en una zona del citoplasma llamada nucleído. Los


procariontes suelen tener un solo cromosoma circular que ocupa una región del citoplasma
llamada nuecleoide.

Unidad de transcripción monocistrónica y policistrónica


Monocistronica: A diferencia de la ARN polimerasa bacteriana, puede formar una conexión
con la plantilla de ADN por sí sola.
Policistronica: a menudo involucra varios genes, lo que da como resultado ARNm
policistrónicos que especifican múltiples proteínas en una sola molécula. Múltiples
transcripciones y procesos de traducción que ocurren al mismo tiempo en la misma plantilla de
ADN pueden elevar rápidamente el nivel intracelular de una proteína bacteriana.

Operone
Es grupo de genes estructurales cuya expresión está regulada por los mismos elementos de
control y genes reguladores. Los principales elementos que constituyen un operón son los
siguientes: Los genes estructurales: llevan información para polipéptidos.

Intrones y exones
Intrones: Secuencia de ADN ubicada entre exones que primero se transcribe en ARN pero que
se elimina del transcrito de ARN final, y por lo tanto no cambia el código de aminoácidos. Se
sabe que algunas secuencias intrónicas afectan la expresión génica.

Un exón: es la porción de gen que codifica aminoácidos. En las células de plantas y animales, la
mayoría de las secuencias de genes son alternadas por una o más secuencias de ADN llamadas
intrones.

Genes de copia única y familias multigénicas


 Genes de copia única;
 representa entre 50-70% del total
de material genético
 El DNA de copia única,
compuesto en pequeña parte de
los genes o secuencias codificantes, y una mayoría de DNA no codificante
 Los genes están compuestos por exones e intrones y una región reguladora
 El DNA no codificante incluye los intrones, los cuales son el DNA que
entrecorta los fragmentos codificantes de los genes
 Familias multigénicas; Las familias multigénicas son aquellas donde las secuencias de
los ADN de sus miembros comparten homología y sus productos están funcionalmente
relacionados. En algunos casos se encuentran juntas en el cromosoma, en otras se
encuentran dispersas en varios cromosomas.

Genes repetidos en tándem


Una repetición en tándem es una secuencia de dos o más pares de bases de ADN que se repite de
tal manera que las repeticiones se encuentran uno al lado del otro en el
cromosoma. Repeticiones en tándem están generalmente asociadas con el ADN no codificante.

Pseudogenes
Un pseudogen es una secuencia de ADN que se asemeja a un gen, que se ha inactivado en el
curso de la evolución al producirse mutaciones en su secuencia. Un pseudogen comparte la
historia evolutiva de un gen funcional y puede proporcionarnos una idea de su ascendencia
común.

DNA no codificante repetitivo y de secuencia única.


DNA no codificante; Son pequeños trozos de ADN que se pueden unir a moléculas específicas
de ARN e impedir que las células usen ARN para elaborar una proteína o funcionar de otras
maneras. El ADN no codificante se puede usar para bloquear la producción de las proteínas que
la célula necesita para crecer.

Las secuencias de ADN altamente repetitivo constan, por lo general, de secuencias cortas


de ADN repetidas muchas miles de veces en el genoma, y que se encuentran dispersas y
dispuestas en tándem formando grandes clusters a lo largo del ADN.

DNA de secuencia única; En el caso del DNA único, este se presenta una o dos veces por
genoma haploide y constituye el componente más abundante del genoma eucarionte.

Transposones
Los transposones o genes saltarines son secuencias de ADN que sólo llevan información
genética para poder moverse dentro de los genomas de los seres vivos.

Secuenciación y análisis de genomas.


La secuenciación de genomas revela la secuencia de los nucleótidos en un gen, al igual que las
letras del alfabeto en las palabras. Los nucleótidos son moléculas orgánicas que forman el bloque
estructural de los ácidos nucleídos, como ARN o ADN. 

El análisis de la fase de la DNA es el paso final en análisis del


genoma. Reúne los descubrimientos a partir de las fases
anteriores del proyecto para formar las conclusiones, que se
pueden ofrecer valor verdadero para fomentar nuestro
conocimiento del genoma y aplicar en situaciones relevantes.

“Chips” de DNA
Un chip de ADN es una superficie sólida a la cual se une una colección de fragmentos de ADN.
Las superficies empleadas para fijar el ADN son muy variables y pueden ser de vidrio, plástico e
incluso de silicona.

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