"INTRODUCCION
ALA
FISICA BIOLOGICA’
1
Leopoldo Garcia-Colin Scherer
Leonardo Dagdug
Michel Picquart
Edgar Vézque:
Coprdinadores
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Ww DE SERVICIOS
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EL COLEGIO NACIONAL
México, 2010
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(Coordinacin Ealtoral: Resa Campos de la Ross
Primera edicign: 2010
D.R ©2010, ELCOLEGIO NACIONAL,
lusis Gonedlez Obregén nim. 23, Centro Histrico
.P 06020, Mexico, D.E
‘Telefonos 87 8948 30,57 02 18 7; Fax 57 02 17 78
ISBN:978.607.7690-777
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Correa electro: colmal@mailintemnet comm mx
gin: hupy//wnv.colegonseionaorg mx
Tides
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WF SERVICIOS
MSE... sii £8 - BIBLIOTECAS
CONTENIDO
Prélogo
carina 1
lementos de termodinamica clasia para bislogos
‘Levpodo Garcia-Colin Scheer
Carrio 2
El origen de Ia vida: ent el determinismo fisico
¥yla contingencia histérica
Antonio La:cano Araujo
Civtrauo 8
ELDNA
Pedio Minamontes, Arturo Boca
ewviruio 4
‘Estructura y funci6n del ARN
Juass Miranda Ris
Cire
La variabilidad genémica y sus implicaciones
cen el cuidado de la salud
Gerardo Jiméne: inches, Enrique Hernéndes Lemus
Aifedo Hidalgo Miranda
carn 6 -
Fstructura y funcién de protesnas
Aifedo Torres Lavos, Maran Tuena de Gémex Puyo,
Amanda’ Gime Pages
37
n
ns
49 cute 7
Las interaeciones fundamentales en la estructura
tridimensional de las proteinas y otras biomoléculas
edgar Véequez Contreras ann
cartrno §
Estudio de las rutas de (des)plegamiento de protefnas
‘usando la computdora como microscopio molecular
‘Nina Pastor Colin, D. Alejandro Fernindex Vlas oon. 209
corinne 9
Bioinformatica
Arturo Rojo Domingure 317
PROLOGO
Ahora que se ha emperado a esnuiar con sriedad
ale mamualera nos damoe cuenta dela ampitad de
Tas preguntas, de la distancia a recoger para tratar
cde contestarls, El gran peligro para la Inumaniad
oes el desuello del conocimiento, es la iguorancia
Francois Jacob
Probablemente la primera evidencia que se tiene de Ia
relaciGn entre la fisica y Ia biologia inici6 con los expe-
rimentos del italiano Luigi Galvani cuando, en 1780, ide6
¥¥ construyé una méquina electrostitica formada por dos
placas de metales y fluidos extraidos de una rana, Mas
adelante él y su ayudante Giovanni Aldini demostraron,
que, aplicando una pequeia comiemte eléctrica ala
médula espinal de una rana descerebrada, se produicfan,
contracciones muscukares en los miembros de la misma.
Estas descargas podian lograr que las ancas, incluso sepa-
radas del cuerpo, se contrajeran de la misma forma que
cuando el animal estaba vivo, A partir de ese momento,
Jos sistemas bioldgicos se han estudiado con mucho
interés desde el punto de vista fisieo.
‘A.mediados del siglo x1x surgieron dos grandes teorias
sobre la evoluci6n de los sistemas naturales en el tiempo.
Por una parte la teoria cinética de los gases (cteada por
Ludwig Bolumann) contempla una naturaleza en cons:
tante degradacién hacia Ia muerte, en forma de desorden.
“a Esta vision de la evoluci6n de los sistemas naturales, inspi-
rada por la segunda ley de Ia termodinimica, contrasta
considerablemente con la segunda teoria basada en el para
‘digma asociado con los sistemas biol6gicos, erecientemente
proteina, que hoy
3 incluido en los flujo cle la informacion genética de Tos
En esa misma década Max Perutz, quien se encontraba
trabajando en el Laboratorio Cavendish bajo la direccién
de Lawrence Bragg aplicando la técnica de difaecién de
rayos Xa una protein, encontré Ja estructura de la hemo-
¢globina, todo un reto experimental para la €poca. De esta
forma y muchos afios después de haber iniciado su
pprocza explicé por primera vez, junto con John Kendtew,
el disefo detallado de una maquina biomolecular. Es
importante mencionar que tanto Kendrew y Peratz como
among mena eax ender cae
aio (aungue en areas diferentes) por dilueidar las mo-
léculas del fenotipo y genotipo, respectivamente.
En la actualidad tenemos un amplio couocimiento del
disefio molecular de las células, incluyendo los detalles
de los procesos moleculares que se encuentran en la base de
las fuiciones celulares o del metabolismo. Por una parte,
tenemos idea de las repercusiones que producen tanto
las perturbaciones, como las averias de tales funciones, 10
‘que se expresa en los mis diversos sindromes clinicos: y
Bor ors el modo en que algunos organismos como vrs
\cterias, protozoarios y hongos parisitos modifican el
‘clo vital de otros organismos. De hecho, hemos podido
ir atin més lejos en el entendimiento de la regularizaci6n
de estos procesos vitales, hasta el punto de alterar per-
manentemente su programa genético y constrair clones,
Ifbridos, transgénicos, etcétera.
Uno de los ejemplos mas claros del éxito de Ta fusion
centre la fisica y la bioquimica lo proporciona la industria
farmacéutica moderna en la que'se explota el conoci
miento detallado de la biologia molecular y de los procesos
ide difusién, en sistemas confinados para el disefio y libe-
racién controlada de drogas.
"En los uitimios veinte afios en México Ja fisica biol6gica
hha tomado un ange de dimensiones impredecibles. Es
debido al gran interés en el estudio de esta disciplina de
vanguardia que ‘se consideré necesaria la edicién de un
libro de texto en espafiol. La tarea se simplificé al exist
investigadores de altisimo nivel dispuestos a contribuir
‘con su conocimiento para realizarlo, Afortunadamente
festos elementos se conjuntaron adecuadamente en tiem
po y forma para dar lugar a esta obra.
“El contenido de los tres tomos que la comprenden pre-
tende abarcar un amplio espectro de los temas de fisica
Diolgiea que se desarrollan en diversas insttuciones
de nuestro pats. Los temas van desde la termodinamica de
sistemas biol6gicos hasta la evolucién, pasando por las mix
dquinas moleculares, el andisisno lineal de series de tiempo,
Ih cristalografia,:el eddigo genético, la estructura y fun
cdén del ADN y de as protefnas. También se incluye
informacién sobre las interacciones entre las biomolécu
Jas, ladifusién, eteétera. Los coordinadoresestamos Seguros
aque este testo sera de gran utilidad para cualquier lector
interesado en alguna de sus-ramas o de Ia biofisica en
‘general. Fsperamos que estos tres tomos contribuyan a con
olidar los cimientos del desarrollo de las biociencias en
‘México. La variedad y profundidad de los capitulos cons
tinyen una clara muestra del grado de experiencia de los
investigadores partieipantes en los diversos temas y son Ta
jusificacion de su publicacion
ke C Los coordinadores y autores participantes en este
proyecto agradecen profundamente a Aline y Cristina
Ortiz Herrera su ayuda en la formacién, redacci6n, ed
én, dibujo y diseio, tanto del texto, como de las ilus
traciones de esta obra, Asimismo expresaunos nuestro
agradecimiento a El Colegio Nacional por el apoyo brine
dado para hacer posible su publicacisn. :
Los CoorpinaborEs
Mésien,D.R, Moyo de 2010
curtreso 1
ELEMENTOS DE TERMODINAMICA CLASICA.
PARA BIGLOGOS:
‘Luopouno GanclAa-Cotin SCHERER”
Miembro de El Galego Nacional
L.IvTRODUCCION
Hace ya setenta y seis afios que en su revohcionario ¥
‘exeitante libro ;Qué es la vida?, el insigne fisico austriaco
Ervin Schradinger plante6 una proguna que hoy en dia
cs la base de lo que podriamos amar la fsica biligicn @
Saber, ze6mo Tos eventos en el espacio y en el tempo, que
tienen lugar dentro de las fronteras espaciales de orga-
nismos vivientes, pueden ser explicados por las leyes de la
fisica yla quimica? No es mi intenci6n disertar aqui sobre
cl magnifico libro de Schrodinger; eso es algo que todo
testudiante realmente interesado en la biologia deberia
hacer por si mismo. Mi propésito es el de proporcionar
los conceptos més funclamentales que se requieren para
abordar la pregunta con toda seriedad.
Tn ser vivo es también un conjunto de atomos que,
obedeciendo las leyesfisicas y quimicas a eravés de mecar
* prtesor Finest Distingie des Universidad Avanos Meteopoians
1 igoxanumuam.so|
1
F |
ntropfa, con el concepto matemt
opt 0 ico de'lo que es una
probabilidad. Para abordar estos temas de manera lore
¥ exhaustiva se requeriria de todo un tratado sobse ia
conn ae in poem
(08 en equilibrio, absolutamente necesarios para com-
{rataremos de manera muy superici i
fuera de equitibrio retain probasi
2. ConcEPTO BiSICOS. SISTEMAS CERRADOS
Un sistema termodindmico es cualquier componente
del mundo macrosedpico, esto es, observable y caracteri
zado por dos componentes: sus atributos y sus restric:
‘ciones. Los primeros son aquellos parametros perceptibles a
rnestros sents y ficiles de medir en el aboratario: pre-
sién, volumen, magnetizacion, indice de refraccién,
polarizacién, eteétera, Las restricciones son geométricas,
mecanicas y térmicas, las primeras definen el “tamaiio”
del sistema; las segundas la influencia de dispositivos que
pueden intercambiar energia mecinica sobre él, tales
‘como pistones, campos eléctricos y magnéticos, tensores,
etcétera, ¥ los térmicos, aquellos que permiten alterar el
grado de calentamicnto (0 enfriamiento) del mismo,
como paredes aislantes 0 conductoras (metilicas). Al elegit
cl sistema, el observador especifica a voluntad cudles son
las restricciones que quiere imponer. Cada restriccién
implica la naturaleza del atributo que se ve afectado por
«lla y el nvimero de restricciones establece el ntimero de
pparémetros asociados a dichos atributos, que son indepen-
dient
m gas en un cilindro con un pistén fijo en cierta
posicién es un sistema tridimensional que ocupa un vo-
lumen dado y, si el recipiente que lo contiene esté fijo en
el espacio y rodeado de un aislante, existen tres restric
siones y los pardimetros asociados «ellos son la presion py,
elvolumnen V ya energia total, que llamaremos E. Si per-
‘itimos que el pistén se desplace, inducimos un inter
‘cambio de enengia mecinica con los alrededores, Io que
Drovoca un proceso.y el atributo p va a quedar determi-
hhado por E y V. En general, la remocién d€ una restric-
‘i6n induce un proceso, se pierde un grado de libertad y
l sistema intercambia trabajo, mecanico en este aso,
3 ‘con sus alrededores. Si, por otra parte, mantenemos los
valores que especifican a los atributos, constantes en el
tiempo y con el mismo valor en cualquier punto del
sistema, decimos que el sistema se encuentra en equilt
brio termodinamico. En sistemas abiertos, para los cuales
las paredes (o fronteras) que los rodean pueden ser per
_meables o semipermeables a la materia, esto es, permiten
transferencia de masa, el estado de equilibrio termo-
dindmico debe involucrar la condicién de que Ia com-
pposicion quimica del sistema sea la misma en cada punto
no varie con el tiempo.
Con este pequefio arsenat de ideas podemos entrar all
aspecto més fundamental de este estudio: discutir las leyes
fandamentales que gobiernan a los sistemas termodinémi-
{cos cuando estén en equilibrio. Fstas leyes tienen un ork
‘gen’ un tanto singular; las Ilamadas primera y segunda se
descubrieron en el siglo nx y la ley cero, que por ligica
debié haber sido la primera, fue formulada con toda pre-
cisién hasta 1930, casi un siglo después que las otras dos.
Laley cero de Ta termodinémica que debe entenderse,
asi como las otras dos, como un hecho empiico, establece
‘que todo sistema termodinsmico en equilibrio, mecsnico
Y-quimico, alcanza siempre su estado de equilibrio térmi-
‘co. Mas atin, dos o mas sistemas en contacto entre si a
través de paredes conductoras o diatérmicas,aleanzan el
‘equilibrio térmico mutuo y se dice entonces que el atribu-
to comitin que los caracteiza es su iemperatura. La tempe-
Fatura, un parémetro de todos conocido, se mide uti
lizando termémetros calibrados por reglas que no discuti-
remos aqui, Las escalas termométricas més conocidas son
Ja Farenheit, la Celsius y la escala Kelvin, La primera le
asigna por convencin 82° al punto de congelacién del
agua y 212" asu punto de ebullicién, La escala Celsius les
asigna valores cero y cien, de manera que un grado.
4
Farenheit corresponde a8 grados.centigrados, y silla-
‘mamos @@ la temperatura
9
Op = 3% +82
5
0. =5(o, -99)
La excala Kelvin tiene una convencién diferente. Se
representa por T; Ia cual se toma de manera que
T= 8+273.15 (K).
ara una discusiGn més detallada del origen y uso’ de
cesiasescalas referimos al lector ala literatura, Baste saber
‘aqui que la temperatura es un parémetr intrinseco a todo
sistema y que especifica su estado de equilibrio térmico.
‘Cuando dos © mds sistemas tienen Ia misma tempetie
tura se dice que eatin en equilbrio térmico entre si. La
ley cero establece adems que, para todo sistema termo-
dinamico, existe una telacién funcional entre su tem
peraturay los parimetros (que a partir de ahora Ilamaremos
ariables termodinémicas) que se hayan elegido como
independientes. Por ejemplo, para un gas encerrado en
tin allindro a presién p y con volumen Y, sin paredes
ddiacérmicas, existe la relacin funcional
T=T(p¥) a
llamada “ecuacién de estado”. Por comodidad usaremos
Ge aqui en adelante la escala Kelvin (Namada también.
escala terinodindmica) y a la temperatura-la designare~
mos como 7. Fs summamente importante entender que la
ley cero establece la exstencia de Ta ecuacion de estado,
5
“a a. Fata iltima se obtiene, 0 bien:
del experimento, bien de teorias microteépicas de la
materia, Asi, por ejemplo para el llamado gas ideal,
representado ent la naturaleza por gases nobles a muy
bajas densidades, se cumple la ecnacién de Boyle Mariotte-
Guy Laussac, para una mol de gas
pV=RT @
donde R= 8315 x 10° julios/kg-mol K, es la Hamada
constante universal de los gases. Para otros sistemas hay
ecuaciones andlogas, pero rara vez aparecen en el estudio de
sistemas quimico-biol6gicas, asi que no las tacaremos aqui.
Es evidente de la discusi6n anterior que cl concepto de
temperatura es igualmente aplicable a sistemas cetrados
‘o-abiertos, el que haya o no transferencia dle masa no afee-
tael concepto de equilibrio térmico, La temperatura Tes
una variable intensiva, esto es, no depende del tamaiio del,
sistema. Esto no siempre ocurre asi con otras variables, de
manera que tenemos que proceder con mucho cuidado.
Por ejemplo, el volumen es una variable extensiva,
Consideremos. primero un. sistema cerrado y aislado
térmicamente de sus alrededores, esto es; sus paredes son
aislamtes perfectos; ahora supongamos que le suministra-
‘mos cierta cantidad de trabajo, mediante el cual cambiar,
de su estado inicial ia un estado final f Podemos pensar
que el trabajo total que se sumistra al sistema se puede
representar por una suma de contribuciones infinitesi-
males (dW)ag, de manera que el trabajo toral suminis-
tiado a dicho sistema se puede representar como
ff ceg
el signo més se introduce simplemente por convencién
(es negativo si el sistema es el que realiza el trabajo). Esta
6
claro que Ia soma constituye cierta enengia suministada
al sistema. Ahora bien, si éste no se mueve, esto ¢5, no
cambia su energia cinética, no se eleva ni desciende,
no cambia su energia potencial, qué le sucede a esta
‘enengia? Si aceptamos como valido el principio de con-
servacion de la energia, ésta tiene que transformarse en
otra forma de la misma. La-primera ley de la termo-
dinamica postula que todo sistema termodinémico posee
un atributo Wamado su energia interna, representada por
Gal que
AU au,
O=HfLUW yet Wye
Es claro que U esté definida hasta una constante aditi-
va arbitraria, pero esto es intrascendente ya que siempre
medimos diferencias de energia. En otras palabras, la
primera ley postula que:
“Todo sistema termodindmico posee un atributo carac-
terizado por la variable U, tal que si se suministra al sis
tema uma cierta cantidad de trabajo en forma adiabética,
AU = 9 (AW)
2Y si el mismo cambio AU se produce, por ejemplo,
calentindolo con un mechero o poniéndolo en contacto
con un cuerpo mas caliente hasta que se Hegue al mismo
‘estado final /? La respuesta es de todos conacida: existe
uuna forma de energfa no mecéinica lamada calor y deno-
tada por Q, tal que (AU) = Q. Asi pues, en general, la
ecuacién (3) se puede escribir como
AU-W=Q=Wya-W. “
“La energfa total se conserva cuando el cor se toma en
cuenta’. Este es el enunciado ms comtin de la primera
ley pero, cnidado, porque para escribir la ecuacion (4) se
requiere primero haber definido AU Finalmente, esta claro que por ser U una variable ter
modindmica extensiva, se garantiza la existencia de las
ecuaciones,
U=UOV), U=U(.p), ecéiera,
con la misma propiedad que la ecuaci6n (1).
Para un gas (o sistema en general) ideal, se sabe que
URG THU, 6)
donde Gy es la llamada capacidad calorifica a volumen
constante, Las ecuaciones (5) y (6) son las llamadas ecua-
ciones de energfa del sistema y, en general, se dice que
lun sistema ¢s ideal siy solamente si = U(F).
Antes de continuar y analizar Ta segunda ley para sie
temas cerrados, conviene hacer un paréntesis. El andlisis
matematico de las ecuaciones de estado y de energia te-
‘quiere de un proceso de transformacién del sistema entre
dos estados. Si ambos estin separados por cantidades
infinitesimales y la funci6n correspondiente es continua
‘entre ambos, podemos hacer uso del céleulo diferencial
para calcular el incremento de la funcién respectiva. Esto
‘ho impone ninguna limitante alos resultados pues, mien-
{tas los estados inicial y final sean de equilibrio, el valor
de la funeién es independiente del proceso. Es por ello
«que considerar en termodinamica procesos infinitesimales
Y euasiestiticos o sea, infinitamente lentos, es extremada-
‘mente iit ya que al estudiar estados independientes del
tiempo, el cémo se llegue a ellos es irrelevante. Veamos
dos ejemplos:
4) Supongmos un fluido de una sola componente para
el cual sabemos que la ecuacién
P= HV,T)
‘existe, Para un proceso infinitesimal y cuasiestitico que
aumente Ia presién de pa p + dp, silos incrementos en V
y Tson dV y dT, respectivamente,
ca)
stidades Fciles de medir en tn fuido son su com
presibilidaduisotérmica ky su coeficiente de expansién
térmica B, definidos como,
Afav) 5 i *) . &
vi ap viar),
Por el teorema o relacign ciclica de efleulo diferencial,
(F135),
y por lo tanto,
(st) Cae) Gy 8
por las ecuaciones (8). La ecuaciGn (7) se reescribe como,
@)
wf a
i B
Si podemos conocer Kpy Ben un cierto intervalo de
vollamenes y temperaturas, Si experimentalmente nos dicen que B= 1/T y «= 1/p,
de Ia ecuacién (10) \
av pa
ite Tie
pV = constunte 1
Identificando la constante con R, obtenemos la ecua-
Gi6n (2),
Para las ecuaciones de Ia energia se puede hacer algo
similar. Para un proceso infinitesimal y cuasiestatico, el,
trabajo realizado por, o sobre, el sistema se puede escribir
aw = Dxay, an
donde, por analogia con la mecénica, X; denota la fuerza
termodindmica que es la variable termodindmica extensiva
‘que produce un desplazamiento generalizado cenotado por
la variable extensiva Y,, Asi, si X;= p, ¥; = V (el signo
menos se debe a que, a mayor presién, el volumen
esmenor); si Xy= H, ¥; = (magnetizacion); X;= t(ten-
sion), ¥; = L (longitud), eteétera. Nétese que todos los
términos que aparecen en (11) deben tener unidades
de energia y, adeinds, ta notacidn ¢ implica que la dlfe-
rencial correspondiente no es exacta, sino que depende
del proceso, Asi, para estos procesos la ecuacién (4)
puede reescribirse como
“dU =4Q4DX¢¥, (1g)
10
La ecnaci6n (12) es la forma diferencial més general para
Ja primera ley de Ta termodindmica. Si nos restringimos a
fluidos inertes, dW = pdV y por lo tanto,
© aU = aQ- pav, «as
una ecuacién que seré de mucha importancia en lo que
sigue. Si U= U(V,T),
au au
2-(20) sel 28) safe
Para un proceso isométrico, esto es V = constante, dV'=0,
y por lo tanto,
(2 (2) =
at}, \ar),
yp Ta llamada capacidad caloriica a volumen constante.
De aqui, si Cyes constante
U=GT + consante,
‘que, como ya vimos, ¢s precisamente la ecuacién para la
‘energia de un sistema ideal. Si et proceso a presién cons-
tante,
(F(a), (35h),
onl) GH
donde G, es la capacidad calorifica a presién constante.
n
A Para un gas ideal, por definicién (@U/V) y= Oy por lo
tanto, usando la ecuacién (8) yel hecho de que B= (1/7)
para un gas ideal, tenemos que
para v moles de gas.
Si llamamos
donde ves el nimero de motes,
G-G
la bien conocida relaci6n entre los calores especificos
Imolares de los gases ideales. Aunque hay maltiples apli-
0 si la reacci6n absorbe calor (es endotérmica).
Ejonplo: El calor de formacién AH» del GO; a 25°C =
— 94.0518 kcal-mol, implica la siguiente reacciéa
(grafito, 298.15 (K), 1 atm) + O, (gas, 298.15 (K), | atm)
> COy (gas, 298.15 (K), 1 atm),
Y por convencién
AHy_ (elemento cualquiera, estado estindar) = 0,
La aplicacién de la ley de Hess es muy vasiada; tanto
que serfa imposible tratarla aqui con detalle. Sélo como
una ilustracin, veamos cémo se calcula e!
macién del alcohol etilico a partir de la reac
Dbustidn, Esto es
2C(s) + SHa(g) + (1/2)Ox(g) = GHsOH(0) AH =?
Sy g denotan sélido y gas, respectivamente. La reaccién
de combustion es:
GHLOH() +80,(g)-» 260,(g)+3H,00) AH =527.0 keal
G(s)+ O5(g) > COs) aH
84.0 keal,
Hin-Loye) 1,00) si e-58.e
Si sumamos el doble de la segunda reaceién con el triple
de Ia tercera obtenemos que,
2C(s)+20,(g) + Fy (g) + fous) 204(g)+3H,0 (1)
AH =-392.9keal
“
Bis em reacib te etamonts primer ote némoe
© 2€(6)+3H(g)+ 3Ole) = GH,OHMAH, = -65.9keal.
Sugerimos al lector que recurra a Ia literatura amplia
y abundante sobre las aplicaciones de esta ley, la cual os
;nuy importante en el estudio de las reacciones quitmicas.
En paiticular-en bioquimica se hacen andlisis muy si
lares, pero en términos de la energia libre de Gibbs, que
vyeremos mis adelante.
Después de esta digresién; langa pero necesaria, regre-
"somos ala segunda ley de la termadindmica par sistemas cervar
dos. Esta ley, lamas sutil y delicada de toda esta materia,
requerirfa de todo um libro para desentrasiar su significa.
do. El autor de este capitulo lo ha intentado en varios
libros yarticulos citados en la bibliografiay escritos desde
‘un nivel elemental, hasta el requerido por los especia-
listas. Aqui voy a presentar una forma mas pragmitica de
su contenido, dejando que el lector profundice, si ast lo
desea, consultando otras obras.
‘Volamos a la-ecuacién (13), 1a forma simplificada de
(12) sélo para sistemas fluids,
aU + pav =2Q, as)
EI miembro izquierdo de la ecuacién contiene tinica-
mente variables termodindmicas; esto ¢s, variables que
‘aracterizan los estados dle um sistema, El lado derecho es,
‘© mejor dicho, representa energia en unsito, calor; por
“lo tanto no es un atributo del sistema, En términos
‘matematicos, la ecuacién (13) no ¢s una diferencial exac-
ta; su evaluacion depende de la trayectoria del proceso a
Jo largo del cual quiera integrarse. Aun tomando, diga-
mos U= U(T,V) la ecuacién se lee como
16 aw av .
& a {(32) «fa =u = ay)
ds posible expresar 7Q.de manera que la ecuaciGn (17)
sélo contenga variables termodindmicas? En un lenguaje
‘matemitico ces posible encontrar el factor integrante
de @Q para que la diferencial se convierta en exacta? La
respuesta es sf la obiuvo por vez primera en 1876 el gran.
fisico alemin Rudolph Clausius ¥, casi treinta afios des-
‘pues, con todo el rigor matemtico deseable, Constantin
Carathéodory. No voy a dar las demostraciones aqui,
primero, por razones de espacio y, segundo, porque para
los propésitos de este trabajo son completamente innece-
sarias. Baste hacer una analogia con la primera ly dela ter
‘modinémica utilizando las ideas propuestas desde 1826
por N. L, Sadi Carnot.
‘Tenemos dos cuerpos: uno caliente a la tempertura Tz
y ou fifo a la temperatura T;. Carnot pens6 en una
‘iquina ideal Hamada de Carnot o reversible tal que, ope-
rando en ciclos, extrajera Qy tinidades de calor, produ-
Jjera un trabajo W y cediera Q; unidades al cuerpo frio.
Al operar en ciclos AU= 0, esto es, el sistema con el cual
‘opera la maquina, sin importar su naturaleza, siempre
regresa a su estado inicial. Entonces, cle acuerdo con la
primera ley,
Wale) as)
Yl etiencia nde dicha mina defn como
(19)
16
* Carnot intuyé que 1, deberti'dependder sélo de la tem
peratura de las fuentes y fue William Thomson, Lord
Kelvin quien, en efecto, mostré que
rt,
=-B
yale 20)
Yy que para cualquiera otra maquina no reversible 0 te, pard ste
suas ilados y cerrado, l entropfa munca puede smi,
Siocurre tun proceso entre dos estadon de equlibo Fy:
Para un gas ideal ya vtnos que (00/9) = 0+ pot lo
tanto, pr lnecuacion (22)
para una mol de gas. Asi,
as G R
a+(28) ave Scare
) 2re(28) are Sears Bav
Y como cont nerd ene ge
SaGinFeRinvesiy
donde /(N) es todavia una funcién desconocida de N, el
18
imimero ‘de moléciilas en’ el gas. "Bsta funcisn sno puede
determinarse para un gis encerrado pues N= constante.
‘Como experimentalmente se sabe que cy (3/2), para los
‘gases monatémicos, la ecuacién (24) puede escribirse como
S=RInVT" + f(N), (25)
Para terminar con Ia segunda ley y la definicigm de la
centropia hay que sefialar que:
a) Las ecuaciones (19) y (21) definen ala fancién entro-
pia pero, de ninguna manera, aclaran o establecen su
fisico.
) La ecuaci6n fundamental para la segunda ley
as=5,-5,20 26)
<3 valida slo para sistemas certedos y los estados iy f
deben ser esiacos de equilibrio, independientemente
del proceso que nos lleve de uno 0 otto, Si éste es
reversible, entonces se cumple la igualdad.
©) Por ser una funcién de estados existen $= S(T.V),
S=S(T.p), eteétera, las Yamadas ecuaciones de en-
tuopia, La ecuacién (22) ¢s un ejemplo de éstas para
‘un gas monatémico ideal. Otros ejemplos importantes
pueden ser encontrados por el lector en la literatura,
3. SISTEMAS ABIERTOS
Para generalizar las leyes dé la termodinémica a sistemas
fabiertos hay que tener en cuenta ciertos puntos impor
tantes El primero es que la ley cero no se modifica de ma-
nera alguna; el oncepto de temperatura no depende de que
sistema sea o no abierto; no asf la ecuacidn de estado,
19 Sea un sistema de composicién variable conteniendo ny
moles de la componente tno, ny de la dos eteétera hasta
dligamos, rcomponentes. La ecuacién (1) toma ahora la
forma
P= PVT MyM)» en
En el caso de un gas ideal
my Jer (8)
‘que 5 la farnosa ley de Dalton.
Las otras dos leyes si requieren de mayor cuidado. Ino-
‘centemente y aludiendo a las ecuaciones de enengia, si-
guiendo el desarrollo de la ecuacién (27) se estarfa tenta-
do a escribir que
U=U(SV.migy.0,)
¥ por lo tanto, para un proceso infinitesimal,
au -(H),, a+ (Fr), + 2(%4) 4 any
9a)
donde en los dos primeros términos el indice 7; implica
1 constante para toda j
Por otra parte, la ecuacién fundamental (12) para flu
dos se generaliza haciendo #Q = TéS por ser el proceso
reversible y proponiendo que,
au =Tas— pave San, (29)
=
‘Comparando las ecuaciones (29a) y (29b), se obtiene que
20
au
SS) wee 0)
\li...
‘Las dos primeras ecuaciones en (30) son la extensi6n direc
ta de las correspondientes relaciones para sistemas cerr-
ddos; no asi la tercera. Las ecuaciones (29a, b) y (80) son
uy objetables:
a) 2Cémo podemos medi la enengia intema pars un sis-
‘tema abiexto? La ecuacién (8) ya no es valida; la masa
‘std cambiando.
) Qué significa dU'sin; aumenta por dn?
©) Qué significa esta generalizacién?
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