El objetivo de la microbiología alimentaria es determinar si los alimentos están
contaminados o libres de agentes patógenos, la microbiología alimentaria es el estudio de la vida microscópica, proviene de tres palabras griegas, que significan micros (pequeño), bios (vida) y logos (ciencia). Los microorganismos relacionados con los alimentos se agrupan en tres clases, en el primer grupo los microorganismos alteradores afectan las características organolépticas de los alimentos, en el segundo grupo los microorganismos indicadores se agrupan al margen de las líneas taxonómicas en función de ciertas características morfológicas, ecológicas y fisiológicas, y en el grupo tres los microorganismos patógenos o toxinas afectan la salud del consumidor y están en relación con la microbiología. Los microorganismos influyen en las características de los productos de consumo alimenticio humano o animal y su estudio es de mayor importancia por la transformación de los alimentos y las alteraciones que causan cuando desembocan en enfermedades que luego se convierten en pandemias. Los microorganismos son importantes para la obtención de un producto ya que son necesarios profundizar en las amenazas para la salud del consumidor, debido al consumo de alimentos y de contaminados los cuales pueden generar graves enfermedades en la población y el consumidor.