WINEPI TASAS 2.

0 El programa WinEpi TASAS constituye la primera versión de una aplicación que tiene como objetivo la medición de la enfermedad en poblaciones animales y en diferentes situaciones que afectan a la población en riesgo. El programa incluye dos idiomas diferentes (castellano e inglés). La realización del programa se enmarca dentro de las actividades de la Red Europea de Epidemiología Veterinaria y Economía (EPIDECON) y de la Red Ibero-Americana de Epidemiología RATIO (financiada por el programa ALFA de la Unión Europea), y forma parte como módulo del macro-proyecto WinEpi Pack, que está siendo desarrollado por la Facultad de Veterinaria de Zaragoza (España) y la Universidad de Agricultura de Wageningen (Holanda) 1. ESTUDIO DE MEDIDIAS DE LA ENFERMEDAD. 1.1. ESTUDIO TRANSVERSAL

Este tipo de estudio es el utilizado cuando interesa medir la enfermedad en un momento concreto del tiempo. Est supone llevar a cabo la medición puntual de la misma, lo que significa que en estudios transversales solamente será posible estimar aquellos parámetros epidemiológicos referidos a un hecho puntual, es decir: -Prevalencia puntual -Mortalidad -Letalidad 1.1.1.- CALCULO DE LA PREVALENCIA PUNTUAL De forma genérica la Prevalencia mide la cantidad de enfermedad que existe en una población sin diferencias entre casos nuevos y casos antiguos. a) Cálculo de la Prevalencia en la Población Total: La Prevalencia Puntual corresponde a la relación existente entre el número de casos de enfermedad existentes en ese momento del tiempo y la población en riesgo de adquirirla en aquel mismo momento del tiempo (incluidos los enfermos) e donde: P= PR P: e: PR: Prevalencia puntual Número de enfermos Población en riesgo

(1-n) n N valor de la t de Student para un nivel de confianza dado Error esperado Prevalencia calculada en la muestra Tamaño de la muestra Tamaño de la población c) Cálculo de la Prevalencia a partir de una Muestra valorando el Test Diagnóstico empleado: Al calcular la Prevalencia Puntual a partir de los datos obtenidos en una muestra se puede calcular un valor teórico de la prevalencia para la población de la que se obtuvo dicha muestra.Ee . En el caso de estudios transversales. Ese Intervalo de Confianza (IC) viene definido por los límites extremos: ( Pe . P + Es –1 . incluyendo dentro de la misma a los animales que en ese momento del tiempo ya la han adquirido. Para hallar el Error esperado usaremos las siguientes fórmulas: a) Para poblaciones muy grandes: E= Z. puesto que en cada situación y en cada enfermedad puede variar. Pe + Ee ) Sin embargo.P+E) siendo P la prevalencia calculada en la muestra y E el error esperado. y que poseerá una sensibilidad y especificidad conocidos.(1-P) n b) Para poblaciones pequeñas: donde: Z: E: P: n: N: E= Z. El valor de la prevalencia en la población estará incluido en el intervalo de confianza calculado. b) Cálculo de la Prevalencia a partir de una Muestra: Si calculamos la Prevalencia Puntual a partir de los datos obtenidos en una muestra obtendremos un valor estimado de la prevalencia. P. Ese Intervalo de Confianza (IC) viene definido por los límites extremos: (P-E. Estos parámetros influyen sobre valor de la prevalencia estimada en la población.(1-P) . se considera como tal a aquella parte de la población total que puede adquirir la enfermedad.El concepto de población en riesgo es complejo de definir. para llevar a cabo esa medición se precisa de un test diagnóstico que determine los animales enfermos. y un Intervalo de Confianza que vendrá condicionado por el tamaño de la muestra y el tamaño de la población. P. y un Intervalo de Confianza que vendrá condicionado por el tamaño de la muestra y el tamaño de la población (como ya se vió en el apartado anterior).

2. El programa no incluye el cálculo del denominado Indice de Mortalidad Proporcional que expresa la importancia de la muerte por la enfermedad en relación con la muerte total existente en la población.. a) Cálculo de la Mortalidad en la Población Total: Su cálculo corresponde a la relación entre el número de animales que han muerto como consecuencia de la enfermedad en ese momento del tiempo y la población en riesgo de morir por la enfermedad en ese mismo momento. 100 PR donde: IMP:Indice de Mortalidad Proporcional . no obstante.CALCULO DE LA MORTALIDAD La Mortalidad mide la cantidad de animales que mueren en la población como consecuencia de la enfermedad.1. 100 donde: M: Mortalidad (en porcentaje) m: Número de muertos PR: Población en riesgo El concepto de mortalidad incluye los animales muertos en ese mismo momento y los que han podido morir en momentos anteriores y que son incluidos en el recuento del momento en que se realiza la medición. M= m PR . la población en riesgo del denominador incluye a los animales sanos en ese momento y que pueden morir a causa de la enfermedad y a los que han muerto a causa de la misma. Como en el caso de la Prevalencia Puntual. su cálculo es sencillo de realizar en el caso de que interese su medición: me IMP = .donde: Prevalencia Estimada : Pe = E Se+Es-1 Error Estimado: donde: P: Es: Se: E: Ee = Se+Es-1 Prevalencia Teórica calculada en el apartado anterior Especificidad del Test Diagnóstico Sensibilidad del Test Diagnóstico Error Teórico calculado en el apartado anterior 1.

Los límites extremos de ese Intervalo de Confianza serán: ( M .1. (1-M) n E = Z . M . (1-M) . M + E ). b) Para poblaciones pequeñas: donde: Z: E: M: n: N: M ..CALCULO DE LA LETALIDAD La Letalidad expresa la probabilidad de morir entre los animales que presentan la enfermedad en la población animal. 100 e donde: L: m: e: Letalidad (en porcentaje) Número de muertos por la enfermedad Número de enfermos en la población Como en los parámetros anteriores. (1 – n) n N valor de la t de Student para un nivel de confianza dado Error esperado Mortalidad calculada en la muestra Tamaño de la muestra Tamaño de la población 1. m L= . esta medida puntual no diferencia entre casos ocurridos en ese exacto momento del tiempo y los que ocurrieron en momentos anteriores y que se contabilizan ahora .3. siendo M la mortalidad calculada en la muestra y E el error esperado.me: mt: Número de muertes debidas a la enfermedad Número de muertes totales en la población b) Cálculo de la Mortalidad a partir de una Muestra: Si calculamos la Mortalidad a partir de los datos obtenidos en una muestra obtendremos un valor estimado de la mortalidad y un Intervalo de Confianza que vendrá condicionado por el tamaño de la muestra y el tamaño de la población. El valor de la mortalidad de la población estará incluido dentro del intervalo de confianza definido.E . Para hallar el Error esperado usaremos las siguientes fórmulas: a) Para poblaciones muy grandes: E = Z . a) Cálculo de la Letalidad en la Población Total: Su cálculo corresponde a la relación entre los animales muertos por la enfermedad y los que presentan la enfermedad en ese momento del tiempo.

el animal que enferma y que por tanto deja de formar parte de la población en riesgo en ese momento. b) Para poblaciones pequeñas: E = Z. 1-(1 – n) n N donde: Z: E: L: n: N: valor de la t de Student para un nivel de confianza dado Error esperado Letalidad calculada en la muestra Tamaño de la muestra Tamaño de la población 1. son enfermedades crónicas o enfermedades agudas en las que los animales que superan la enfermedad persisten inmunizados durante largos periodos de tiempo.E .2. L + E ). y un Intervalo de Confianza determinado por el tamaño de la muestra y el tamaño de la población. Ese Intervalo de Confianza estará definido por los limites extremos: ( L . En estas enfermedades se pueden considerar. L . una situación final (final del periodo de estudio) y unos hechos intermedios.(están enfermos en este momento aunque adquirieran la enfermedad anteriormente). que la población en riesgo es "casi" constante. (1-L) . b) Cálculo de la Letalidad a partir de una Muestra: Si calculamos la Letalidad a partir de los datos obtenidos en una muestra obtendremos un valor estimado de la letalidad. siendo L la letalidad calculada en la muestra y E el error esperado.. nos encontramos con una situación inicial (principio del periodo de tiempo en estudio). tardará mucho tiempo en volver a ser susceptible e . situaciones todas ellas que se reflejarán en la medición de la enfermedad que afecta a la población en ese periodo de tiempo. es decir.ESTUDIO LONGITUDINAL (Enfermedad de Larga Duración) Los Estudios Longitudinales de las medidas de presentación de la enfermedad suponen medir la enfermedad en un periodo de tiempo definido y por tanto. Para hallar el Error esperado usaremos las siguientes fórmulas: a) Para poblaciones muy grandes: E = Z. (1-L) n L . Hablamos de enfermedades de larga duración en aquellos casos de enfermedad en los que ésta se mantiene durante largos periodos de tiempo. El valor de la letalidad de la población estará incluido dentro del intervalo de confianza definido. por tanto.

(es decir... menos la salida de animales (ventas. y que harán que constantemente los animales recuperados vuelvan a a formar parte de la población en riesgo y puedan observarse animales que presenten más de una vez la enfermedad a lo largo del periodo de estudio De todo esto se deduce que en estudios longitudinales un elemento clave a definir es la población en riesgo que se va a considerar.integrarse de nuevo en la población en riesgo. PRn= PRn-1 – MVn= PRn-1 – (In – On – En) donde: PRn: Población en riesgo en el periodo de tiempo n PRn-1: Población en riesgo al final del periodo de tiempo anterior a n. En este tipo de estudio longitudinal la dinámica de la población en riesgo la define casi exclusivamente la introducción de nuevos animales o la eliminación de otros. sino también lo que ha ocurrido a lo largo de ese periodo de tiempo (los nuevos casos del periodo de estudio). siendo el movimiento de animales equivalente a las entradas de nuevos animales. sobreagudas y con inmunidad de corta duración) la población en riesgo tendrá gran variabilidad en función de la duración de la enfermedad y de la duración de la respuesta inmune. ya no sólo los hechos globales. y se pueden estudiar los nuevos . el total de casos existentes). en el momento de comenzar el periodo de tiempo n MVn: Movimiento de animales en el periodo n In: Nuevos animales en el periodo n On: Salida de animales en el periodo n En: Nuevos enfermos durante el periodo n Cuando estudiamos la enfermedad en un periodo de tiempo se puede medir la cantidad total de enfermedad existente. ¿Cómo se estima la población en riesgo en un periodo de tiempo para enfermedades de larga duración? En este caso se considera población en riesgo en cada periodo de tiempo. a los animales susceptibles de adquirir la enfermedad al comienzo del periodo más el movimiento de animales que se produce durante dicho periodo de estudio.) y menos los nuevos enfermos durante ese periodo de tiempo.. o lo que es lo mismo. hablar de un periodo concreto de tiempo permite introducir nuevos parámetros de medida de la enfermedad que indicarán. lo que equivale al cálculo de la prevalencia del periodo. Por otro lado. En el caso de enfermedades de corta duración (enfermedades agudas.

. de manera que durante un periodo determinado de tiempo en el que se está estudiando una enfermedad. a los animales susceptibles de adquirir la enfermedad al comienzo del periodo más el movimiento de animales que se produce durante dicho periodo de estudio. ¿Cómo se estima la población en riesgo en un periodo de tiempo para enfermedades de corta duración? En este caso se deberá tener en cuenta a los animales que habiendo sufrido la enfermedad la superan. se considera población en riesgo en cada periodo de tiempo.) y menos los nuevos enfermos durante ese periodo de tiempo. todo ello dentro del periodo de tiempo en que se está estudiando la enfermedad.. menos la salida de animales (ventas. los animales que quedan inmunizados y los animales que tras superar la enfermedad vuelven a adquirirla. Se considera que las muertes se producen durante el periodo en que los animales enferman (debido a cuadros agudos y sobreagudos) y que los que superan las primeras fases de la enfermedad sanarán al cabo de un tiempo establecido. siendo el movimiento de animales equivalente a las entradas de nuevos animales. pero considerando la duración de la enfermedad y de su inmunidad.. Junto a estos es posible realizar también el cálculo de la mortalidad y de la letalidad. lo que equivale al cálculo de la incidencia acumulada y/o la tasa de incidencia.casos de enfermedad que se producen durante ese periodo de tiempo. más los animales que superan la enfermedad y no quedan inmunizados.ESTUDIO LONGITUDINAL (Enfermedad de Corta Duración) La principal característica que presentan las enfermedades de corta duración de cara a su medición.3. es que los animales que superan la misma rápidamente vuelven a integrarse en la población en riesgo. un animal puede sufrir la misma varias veces. Así pues. Esta situación es todavía más evidente en aquellos casos en los que la inmunidad de los animales una vez superada la enfermedad es nula o muy breve en el tiempo. 1.. En el caso de estas enfermedades las mediciones de la presentación de la enfermedad durante un periodo de tiempo se realizan del mismo modo que las enfermedades de larga duración. lo que supone que habrá formado parte de la población en riesgo varias veces a lo largo del periodo de tiempo en que la enfermedad se está estudiando..

Equivale al número de enfermos del periodo n-t menos el número de muertos en ese mismo periodo.1. Junto a estos es posible realizar también el cálculo de la mortalidad y de la letalidad. lo que equivale al cálculo de la incidencia acumulada y/o la tasa de incidencia.1. de forma que: P= TI . se conoce la duración media de la enfermedad. animal-mes o animal-año . y se pueden estudiar los nuevos casos de enfermedad que se producen durante ese periodo de tiempo. Evn-t) donde: PRn: Población en riesgo en el periodo de tiempo n PRn-1: Población en riesgo al final del periodo de tiempo anterior a n.PRn= PRn-1 – MVn= PRn-1 – (In – On – En + (1-IN) .1. o lo que es lo mismos. 2. lo que equivale al cálculo de la prevalencia del periodo. En estos casos la prevalencia puede calcularse si además. ESTIMACIONES 2.Estimación de la Prevalencia: En ocasiones interesa estimar la Prevalencia de una enfermedad en una población animal de la que solamente se tiene información acerca de la Tasa de Incidencia.. t 1 + TI .. animal-semana. Cuando estudiamos la enfermedad en un periodo de tiempo se puede medir la cantidad total de enfermedad existente. t donde: P: Prevalencia de la enfermedad en el periodo de tiempo estudiado (en tanto por uno) TI: Tasa de Incidencia para un determinado periodo de tiempo estudiado expresada en animal-día.ESTIMACION DE LA PREVALENCIA 2. y que enfermaron t periodos antes. en el momento de comenzar el periodo de tiempo n MVn: Movimiento de animales en el periodo n In: Nuevos animales en el periodo n On: Salida de animales en el periodo n En: Nuevos enfermos durante el periodo n IN: Inmunidad inducida: aquella fracción de animales que una vez superada la enfermedad permanecen inmunes a ella t: Duración de la enfermedad EVn-t: Número de enfermos que sanan durante el periodo n.

1. En este caso. es posible conocer la Duración media de una enfermedad en la que se conocen su Prevalencia y su Tasa de Incidencia en un periodo de tiempo dado: P T= (1-P) .. 2. expresada en días..1. 2.Estimación de la Duración Media de la Enfermedad: Por último. despejando de la fórmula original.ESTIMACION DE LA INCIDENCIA ACUMULADA 2. y donde igualmente es necesario realizar la conversión a unidades equiparables. es posible estimar la Tasa de Incidencia mediante la siguiente fórmula: P.Estimación de la Incidencia Acumulada: Otra posibilidad de estimar las medidas de presentación de la enfermedad en una población animal consiste en determinar la Incidencia Acumulada de una enfermedad en la que se conoce su Tasa de Incidencia a lo largo de los distintos periodos de tiempo estudiados. y del mismo modo es necesario realizar una conversión previa de unidades para equipararlas.Estimación de la Tasa de Incidencia: De la fórmula original se deduce que.2.t . del mismo modo. meses o años Las unidades de tiempo con las que se trabajan deben ser equiparables para cada parámetro para lo cual deberá realizarse una adecuada conversión de los datos (que el programa realiza automáticamente) 2. semanas.. t donde los parámetros son los mismos que en el apartado anterior.t: Duración media de la enfermedad.2. la Incidencia Acumulada se estima utilizando la siguiente fórmula: 1 IA= 1 – e TI. TI donde los parámetros utilizados son los mismos que se han expuesto en el primer apartado..t TI= (1-P) .3.2.1. conocida la Prevalencia de la enfermedad y su duración.

las poblaciones en riesgo.Estimación de la Tasa de Incidencia: A partir de la fórmula enunciada en el apartado anterior es posible estimar la Tasa de Incidencia en un determinado periodo de tiempo cuando el parámetro conocido es la Incidencia Acumulada. 1 . es decir..).donde: IA: TI: t: e: Incidencia Acumulada en un periodo de tiempo determinado Tasa de Incidencia en el periodo de tiempo estudiado Periodo de tiempo estudiado Base del Logaritmo Neperiano (ln) 2.INDICE EPIDEMICO . Periodo de Prevalencia. Para ello es necesario conocer la Población Inicial en la que interesa simular la enfermedad. es posible determinar cuántos animales presentarán la enfermedad. además del cálculo de los parámetros de medida de presentación de la enfermedad.2. Incidencia Acumulada. la Incidencia Acumulada y la Mortalidad para cada periodo y para todo el intervalo. conocidas la Prevalencia y la Letalidad. la Prevalencia y la Letalidad esperadas o estimadas.3.2. Mortalidad. y aplicando las fórmulas utilizadas en los apartados anteriores para determinar los distintos parámetros de medida.. A partir de estos datos. qué evolución tendrá la enfermedad en un periodo de tiempo dado y que valor tendrán el resto de los parámetros de medida (Tasa de Incidencia. 1 Ln .SIMULACION El programa WinEpi TASAS permite.. 2. simular la enfermedad en una hipotética población animal conocidos los parámetros de medida de presentación de la enfermedad. 3... cuántos morirán. la Tasa de Incidencia. NOTA: En ambos apartados el programa incluye como prestación extra la representación gráfica de la evolución de la enfermedad en el intervalo de tiempo estudiado. se puede calcular el número de animales enfermos y muertos esperados. EXTRAS 3.IA TI= t donde los parámetros utilizados en esta fórmula son los mismos que los descritos en el apartado anterior.1..

CURVA DE SUPERVIVENCIA Las Curvas de Supervivencia determinan la probabilidad de sobrevivir a un proceso patológico que poseen los individuos de una población a lo largo del tiempo.. Psai-1 ...).El Indice Epidémico es un indicador de la mayor o menor importancia de un proceso patológico que afecta a una población animal en un periodo determinado de tiempo en relación a un nivel esperado o nivel endémico.75 indican que en ese periodo de tiempo existe menos enfermedad de lo esperado.prevalencia esperada (equivalente al nivel endémico que cabría esperar) c. Los métodos utilizados clásicamente para realizar curvas de supervivencia son el estimador actuarial de Cutler-Edered o el estimador del producto límite de Kaplan-Meier. Utilizando los datos anteriormente citados el programa calcula para cada periodo de tiempo dos valores: -PS: probabilidad de supervivencia del periodo -PSa: probabilidad de supervivencia hasta ese periodo Las fórmulas utilizadas para ambos casos son: Psi= Ni – mti Ni . meses.. años. -Valores entre 0.75 y 1..población en riesgo de sufrir el proceso patológico b.. Los cálculos requieren conocer: a.2.25 indican que existen más casos de lo que cabría esperar en ese periodo de tiempo. 3.25 indican que existe un número de casos próximo al esperado en situación endémica -Valores mayores de 1. Para ello debe considerarse el tiempo en periodos equivalentes (días.número de casos observados en el periodo de tiempo en estudio El Indice Epidémico (IE) se basa en la aplicación de la fórmula: Nº de casos observados IE= Nº de casos esperados Su interpretación es la siguiente: -Valores inferiores a 0. Psai= Psi . A partir de ese momento se considerará la población en riesgo inicial o de partida y el número de animales muertos en cada periodo de tiempo definido.

.donde: Ni: población en riesgo al principio de cada periodo mti: muertos en cada periodo PSi: probabilidad de supervivencia del periodo i PSai: probabilidad de supervivencia acumulada hasta el periodo i y siendo PSa para el periodo 0 igual a 1 La representación gráfica indica la tendencia de la probabilidad de supervivencia acumulada a lo largo de los periodos de tiempo estudiados.

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