Procariotas

Para sintetizar una hebra de ARN complementaria de una de las 2 hebras dobles del ADN en la
doble hélice durante la transcripción, el ADN se desenrolla de forma temporal. La enzima ARN
polimerasa mantiene 17 pares de bases desenrollados. El hibrido de ARN/ADN de 8 pares
están en la región desenrollada. La enlongacion de la información transcrita por la enzima ARN
polimerasa de la E. coli tiene una velocidad de unos 50 a 90 nucleotidos por segundos. La
estructura que tiene el ADN hace que ocurra una rotación en las hebras de las moléculas de
ácidos nucleicos cuando se mueven las “burbujas de transcripción”. La ARN polimerasa y las
burbujas de transcripción unidas se desplazan de izquierda a derecha a lo largo del ADN,
facilitando la biosíntesis del ARN.

EL ADN se desenrolla por delante y se vuelve a enrollar por detrás a medida que ocurre la
transcripción del ARN. A medida que el ADN se vuelve a enrollar, se mueve el hibrido
ADN/ARN y se expulsa la hebra de ARN.

La enzima ARN polimerasa se encuentra en contacto constante con el ADN delante de la

burbuja de transcripción, así como las cadenas de ADN que se encuentran separadas y el ARN
que está dentro e inmediatamente por detrás de la burbuja de transcripción. Un canal de la
proteína dirige nuevos nucleótidos trifosfato (NTP) hacia el sitio activo de la polimerasa. La
huella de la enzima abarca unos 35 pares de bases de ADN durante la elongación. El
mecanismo enzimático de la ARN polimerasa es esencialmente igual al de la ADN polimerasa,
la adición de nucleótidos incluye al ataque del grupo 3′-hidroxilo en el extremo de la cadena
ARN que va creciendo sobre el fosfato alfa del NTP que entra. En la reacción participan dos
iones Mg+2 coordinados con los grupos del NTP entrante con tres residuos de Asp (de la
subunidad β´ de la ARN polimerasa de la E.coli). Uno de los iones Mg+2 facilitan el ataque del
grupo 3ʹ-hidroxilo sobre el fosfato α del NTP, mientras que el otro ion Mg+2 facilita el
desplazamiento de PPi y ambos iones metálicos estabilizan el estado transicional.

El desplazamiento de la ARN polimerasa a lo largo del ADN suelen crear vueltas

superhelicoidales positivas por delante de las burbujas de transcripción y vueltas
superhelicoidales negativas por detrás de las mismas. En la célula las topoisomerasas eliminan
de forma rápida las vueltas superhelicoidales positivas y regulan los niveles de
superenrollamiento negativo.

En el proceso de biosíntesis

La polimerasa se fija a un sitio específico (en el promotor) sobre la cadena molde, dando inicio
a la biosíntesis de ARN. La enzima ARN polimerasa requiere de ADN para su actividad, aquí solo
se usa una hebra de ADN como molde, esta se copia en dirección 3′ → 5′ al igual que en la
replicación del ADN. Cada nucleótido de ARN se elige de modo que los residuos de Uracilo se
insertan al ARN para aparearse con residuos de Adenina en el molde del ADN. Los residuos de
Guanina se aparean con los de Citosina y así de forma continua.

En el primer residuo de una cadena de nueva síntesis el grupo 5′-trifosfato no es cortado para
liberar un PPi se mantiene intacto en el proceso de transcripción. En la elongación el extremo
que va en crecimiento de la nueva cadena de ARN se aparea temporalmente con el ADN molde
formando una hélice hibrido entre ADN/ARN con una longitud de unos 8 pares de bases. En el
ARN hibrido se despliega luego de su función y se establece el dúplex del ADN.
La enzima ARN polimerasa sintetiza una cadena de ARN complementaria a una de las hebras
de ADN, el dúplex de la hebra de ADN se desarolla en una distancia muy corta y forma una
especie de “burbujas” de transcripción