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Química Computacional.

Reporte actividad 1. Optimización de la geometría molecular con un Smartphone.

Docente: Profesor Wilber Silva López.

Estudiante: Nelly Vanessa Caro Lopera.

Procedimiento

• Dibuje una molécula orgánica con un número de átomos de carbono entre 3 y 6 e incluya
mínimo un heteroátomo.

Se seleccionó la Acetona de nombre IUPAC Dimetilcetona,


una molécula con 3 Carbonos, 6 Hidrógenos y 1 Oxígeno.

La figura 1 muestra el modelo de Acetona sin optimización


geométrica.

Figura 1. Acetona, modelo sin


optimizar

• Realice un cálculo de optimización geométrica (consulte el manual). Cuando analice la


optimización, determine las medidas de longitud y ángulos sobre los mismos átomos del
numeral anterior. ¿Qué cambios observa?

Al observar el modelo optimizado observamos que la


molécula presenta cierta tendencia polar, los hidrógenos de
los carbonos de los extremos se encuentran en una posición
que puede interpretarse como eclipsado. Al analizar los
ángulos y longitudes observamos que la molécula presenta
gran simetría angular y longitudinal.

Figura 2. Acetona, modelo


optimizado
• En la estructura, determine las medidas de longitud de enlace y ángulos entre los átomos
vecinos. Dibuje una tabla con las medidas efectuadas.

Distance Bond Angle


A B A Center B
(Ă) Order (°)
Hidrogen Hidrogen Carbon Hidrogen
1.101 0.9548 106.689
1C1 1C1 1 2C1
Hidrogen Hidrogen Carbon Hidrogen
1.099 0.9454 107.814
Carbon 2C1 1C1 1 3C1
1 Hidrogen Hidrogen Carbon Hidrogen
1.095 0.9582 107.731
3C1 2C1 1 3C1
Carbon Hidrogen
Carbon 2 1.501 0.964 Carbon 2 111.123
1 1C1
Carbon Hidrogen
Oxigen 1.205 1.8577 Carbon 2 110.581
Carbon 1 2C1
2 Carbon Hidrogen
Carbon 3 1.501 0.9641 Carbon 2 112.648
1 3C1
Hidrogen Carbon
1.099 0.9471 Oxigen Carbon 1 121.628
1C3 2
Carbon Hidrogen Carbon
1.101 0.956 Oxigen Carbon 3 121.645
3 2C3 2
Hidrogen Hidrogen Carbon Hidrogen
1.096 0.9554 106.949
3C3 1C3 3 2C3
Hidrogen Carbon Hidrogen
107.711
1C3 3 3C3
Hidrogen Carbon Hidrogen
107.692
2C3 3 3C3
Carbon Hidrogen
Carbon 2 110.87
3 1C3
Carbon Hidrogen
Carbon 2 111.21
3 2C3
Carbon Hidrogen
Carbon 2 112.177
3 3C3

• Dibuje los orbitales frontera HOMO y LUMO y explique cuales orbitales atómicos
aportan a la formación de cada orbital frontera.
Figura 3. Orbitales moleculares

o Energia HOMO: -10.239 eV


o Energía LUMO: 0.918 eV

Figura 5. Orbital LUMO Figura 4. Orbital HOMO


Análisis Figura 4, Orbital LUMO.

En los carbonos primarios de los extremos observamos una tendencia en sus hidrógenos, uno
de ellos no interactúa en orbitales (Seguramente por encontrarse alineado con un nodo del
orbital P de su carbono correspondiente. Personalmente interpretaría que los otros dos
hidrógenos interactúan su orbital S con un extremo del orbital P de su carbono, y el otro
extremo interactúa aportando a la nube electrónica principal que se forma en el centro de la
molécula. Aquí podemos ver que el Carbono 2 presenta su orbital P con sus dos extremos
interactuando de forma desenlazante con el orbital P del Oxígeno.

Análisis Figura 5, Orbital HOMO.

Esta figura resulta más sencilla de interpretar dado que en los hidrógenos de los carbonos
primarios podemos ver como los orbitales S interactúan entre si y un extremo del orbital P
del carbono creando una nube electrónica en los extremos de la molécula, en el centro de la
molécula por el contrario vemos como los orbitales P del Carbono interactúan por un lado
con el extremo disponible del orbital P del carbono primario y por el otro con un extremo del
orbital P del Oxígeno (Simulando estar cruzado)

• Repita el procedimiento del punto anterior con un orbital por debajo del HOMO y con
otro por encima del LUMO.
o Energia HOMO-1: -12.642 eV
o Energia LUMO+1: 3.223 eV

Figura 7. Orbital LUMO+1 Figura 6. Orbital HOMO-1


Análisis Figura 6, Orbital LUMO+1.

Esta figura parece presentar comportamientos anti enlazantes dado que podemos ver la
polarización de los orbitales S de los hidrógenos y las fases de los Orbitales P de los Carbonos
y del Oxígeno, da la impresión de que entre extremos de estos se forma una nube electrónica
hueca que posee una fase en el centro y una por fuera del caparazón rojo.

Análisis Figura 7, Orbital HOMO-1.

En esta figura podemos observar comportamientos enlazantes entre el Carbono 2 y el


oxígeno, así mismo en los carbonos primarios se observan dos fases que probablemente se
deben a las interacciones del orbital P del carbono con los orbitales S de los hidrógenos.

• Determine la energía (calor) de formación del compuesto y compárela con el dato


experimental ¿Cuál es el porcentaje de error del cálculo? ¿Por qué? ¿Qué indica la energía
de formación?

La teoría reporta un valor de -216.690000152 kJ/mol para


la entalpia de formación, es decir -51.790153 kcal/mol.
Dejando un error del 6.64% respecto al valor otorgado por
el software de -55.475 kcal/mol.

La entalpía de formación de un compuesto es la energía


necesaria para formar un mol de dicho compuesto a partir
de sus elementos, medida, normalmente, en unas
condiciones de referencia estándar, 1 atm de presión y una
Figura 8. Resumen de molécula
temperatura de 298 K.

La diferencia entre nuestros valores puede radicarse principalmente al hecho de que estamos
simulando la molécula y el software hace este cálculo basado en la programación que tiene,
los datos teóricos son resultado de experimentaciones controladas donde intervienen mucho
otros factores que posiblemente no son considerados en la simulación.

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