Prezi se hace en internet, por la cual cosa no hace falta guardar la presentación en ninguna memoria o subirla a cualquier sito, sólo necesita conexión. Prezi, por eso, puede ser presentado en un ordenador que no tenga Microsoft Office. También pueden ser comparados en cuanto a los método de presentación porque mientras PowerPoint juega con diapositivas, Prezi lo hace con movimientos de pantalla. Igual que en el punto anterior esto puede ser positivo o negativo. Quizás no interese más hacer una presentación algo dinámica en una sola hoja (y eso con PowerPoint resulta muy díficil de hacer) o quizás necesitemos algo más tranquilo y separado (como las diapositivas de PowerPoint). Una cosa muy importante son las opciones que cada uno presta: tales como la formas que cada uno deja insertar. Prezi sólo deja insertar unas pocas formas mientras que PowerPoint viene con una gran variedad de formas. Eso también pasa con otros pequeños elementos como los marcos de la fotografías o vídeos. En estos detalles PowerPoint deja ver una parte muy positiva suya y Prezi muestran grande defectos.