Es obvio que en la sucesión de los hongos que se encuentran sobre la madera
varia considerablemente de acuerdo a la especie de arbóreas. Vemos que estas reacciones de resistencia de las células de las plantas vivas, dependiendo del grado de contacto con el suelo y las interacciones entre la población responsable de la descomposición o putrefacción, a demás si se encuentra presencia de hongos la secuencia que se revela puede estar relacionada mas con la fisiología reproductiva que con la fase de su actividad en la misma madera. Encontramos que las observaciones realizadas en Inglaterra demostraron que el agárico Hypholoma fasiculare puede colonizar los tocones de haya. Esto da para una descomposición aeróbica de los detritus de las plantas terrestres, esto claramente es un complejo proceso sinergistico. En los aspectos bioquímicos podemos ver que muchas bacterias y la mayoría de hongos participantes en la descomposición de los restos de las plantas superiores son quimioorganotrofos, muchos de nuestros conocimientos acerca del ataque de microbiano delas paredes celulares tiene su origen en estudios sobre la descomposición de la madera. Por otra parte en las enzimas degradativas de la pared celular, vemos que cualquier organismo que aproveche eficazmente estas paredes celulares de tipo vegetal como una fuente de carbono y de energía evidentemente debe producir una serie coordinada de enzimas extracelulares capaces de degradar no la mayoría si no su totalidad de polímeros presentes.
En la degradación de la celulosa realizan estudios con especies Trichoderma y
myrothecium esto condujeron a la propuesta del esquema tripartito. También vemos que la enzima relacionada con el primer paso de la degradación de la celulosa actúa hidrolizando los enlaces covalentes de los puentes glicosidicos. Por otro lado no esta claro si el esquema de secuencias propuesto para ciertos hongos, tales como Trichoderma sea extrapolable a otras especies, particularmente a las bacterias, en el mucilago extracelular alrededor de las hifas;estas localizaciones resultan anómalas por que se ve con dificultad de alcanzar los substratos cristalino. Una característica del ataque precoz de la madera por la descomposición es la perdida de su resistencia mecánica pero esta no afecta a su peso. En la degradación de los polisacáridos de hemicelulosa y de pectina se ha idetificado tres tipos de enzimas capaces de alterar la estructura de las cadenas de acidos galacturonico, pero estas se consideran importantes para la separación como para facilitar la penetración directa de los hongos a travez de las paredes celulares de las plantas, estas paredes celulares constituyen una gran parte de la biomasa microbiana de los suelos. ‘la quitina es químicamente un homologo de la celulosa’. También vemos que la lignina en descomposición presetna muchos contrastes con respeto al ataque microbiano de los polisacáridos. Pero hasta el momento no ha podido ser identificadas ninguna de las enzimas implicadas ni sus productoras. En la represión de la descomposición y acumulación de combustibles la mayoría de la flora implicada en la descomposición que se describe esta consituida por quimiorganotrofos aerobicos.
El desarrollo de la turberas las cuales contienen aproximadamente 55% de
carbono, representan un escape del ciclo biológico de este elemento, las turberas desarrolladas retienen con frecuencia restos vegetales macroscópicos reconocibles. En cambio otras moléculas de origen biológico incluyen lípidos y aminoácidos, tanto derivaos de proteína como no proteicos.