Pasos como el dogma de la biologia molecular funciona:
1°. EN LA EXPRESIÓN GENETICA ES LA TRANSCRIPCIÓN DE ADN-ARN.
2°. EL ARN UTILIZA LA INFORMACIÓN DEL ADN PARA TRADUCIR Y SINTETIZAR PROTEÍNAS.
Una de las funciones de la doble cadena del ADN es expresar la
información contenida en el material genético.
Es primer paso en la expresión génica
Concepto: proceso por el cual se sintetiza una cadena de ARN complementaria
y antiparalela a partir de una cadena molde de ADN
Tiene la secuencia de idéntica a la cadena codificadora
La timina se sustituye por uracilo
La síntesis de una cadena de ARN complementaria y antiparalela, a la secuencia de nucleótidos de una de las cadenas de ADN denominada cadena molde, tiene la secuencia de nucleótidos idéntica a la cadena opuesta del ADN llamada cadena codificadora, con la premisa de que la timina se sustituye por uracilo en la molécula de ARN
Es el paso previo y necesario para la generación de proteínas funcionales
que defi nen el metabolismo y la identidad de las células.
Genoma: conjuntos de genes
Gen: segmento corto de ADN - Conjunto de secuencias que codifican para potenciales productos finales que se sobreponen entre si. Locus: ubicación específica de un gen determinado dentro de la cadena de ADN. Lugar especifico del cromosoma donde esta localizado un gen u otra secuencia del ADN, como su dirección genética. Loci: ubicación de varios genes en relación de la cadena de ADN
GENES - secuencias de ADN que se copian en cada proceso de transcripción
Es un segmento de ADN que lleva la información en código para una
determinada característica
Se sitúan a lo largo de cada cromosoma en una posición determinada
llamada locus. Son aproximadamente 23 000
Punto de vista molecular - es una secuencia lineal de nucleótidos en la molécula
de ADN, que contiene la información necesaria para la síntesis de un ARN funcional, que puede ser ARNm, ARNt o ARNr.
Gerstein y colaboradores – un conjunto de secuencias que codifi can para
potenciales productos funcionales que se sobreponen entre sí y que pueden estar localizadas en más de un locus en el ADN. Estructura del gen Genes en procariotes – Operones Genes en eucariotes - unidades transcripcionales monocistrónicas Intrones Exones
1. Genes en procariotes - Operones – un conjunto de genes situados en el
mismo fragmento de ADN que se transcriben como una unidad y que generan varios productos funcionales que participan en una vía metabólica común;
también pueden existir unidades que codifiquen para un solo producto
funcional 2. Genes en eucariotes - unidades transcripcionales monocistrónicas - transcribe generalmente un solo producto génico con mayor complejidad en su regulación.
están constituidos por secuencias regulatorias y codificantes.
Corriente abajo - El inicio del sitio de transcripción se denomina +1, y la
numeración aumenta conforme se dirige al extremo 3’ - donde se encuentran las secuencias codifi cantes del gen
Corriente arriba - Hacia el extremo 5’, en la dirección opuesta - la numeración
se indica como —1, y es allí donde se encuentra la mayoría de regiones regulatorias del gen
3. Intrones - región codifi cadora del gen, son retirados por medio del proceso corte y empalme del ARNm primario o heterogéneo nuclear (ARNhn).
4. Exones - regiones que codifican para el producto génico
Un solo gen puede sintetizar diferentes proteínas mediante el arreglo de los
exones por el proceso de corte y empalme alternativo
CARACTERÍSTICAS DE LA TRANSCRIPICIÓN Los sítios de inicio de donde vá iniciar la transcripción se denomina (+1) En la transcripción solo se transcribe una de las cadenas de ADN El sentido de la transcripción es 5’-------3’ La cadena de ADN que se utiliza para hacer la transcripción es la que tiene sentido 3’------5’ Tránscrito primario o ARNhn - es el producto inmediato de la transcripción y consiste en un ARN que contiene las secuencias intrónicas y exónicas, cuyos extremos 5’ y 3’ no han sufrido ninguna modificación. Producto final, ARN mensajero maduro, ARN ribosomal (ARNr) y ARN transferencia (ARNt) - produce cuando sucede una serie de modifi caciones en el tránscrito primario: modificaciones postranscripcionales. Procariotas - el ARN recién sintetizado no sufre modificaciones postranscripcionales y se utiliza para la traducción de forma inmediata sin sufrir ningún proceso.
Promotores - Un tipo de secuencias de ADN regulatorias que no codifican para
el producto génico, pero regulan su expresión.
promotor mínimo - es la región regulatoria indispensable para la
transcripción del gen. secuencias adyacentes a este promotor mínimo forman parte de él, y pueden modifi car la tasa de transcripción del gen, pero no son imprescindibles para la unión de la ARN polimerasa promotor basal - secuencia mínima requerida para la unión de la maquinaria basal de transcripción y para la ARN pol II (ARN polimerasa II) incluye el Inr y la caja TATA o el DPE. A los promotores se les unen proteínas reguladoras conocidas como factores transcripcionales (transcriptional factors, TF), cuya función es regular (aumentar o disminuir) la tasa de transcripción. Promotores basales fuertes - genes procariotes y virales - a maquinaria de transcripción basal se une de forma eficaz y la tasa de transcripción es elevada Promotores basales débiles - genes eucariotes - con un inicio de la transcripción menos frecuente, por lo que requieren secuencias accesorias contenidas Promotores proximales (cajas GC, CAAT y el octámero - factores transcripcionales específi cos para favorecer la iniciación), localizadas generalmentea menos de 200 pb corriente arriba del sitio de inicio de la transcripción. promotores distales - Otras regiones regulatorias que ayudan a los promotores débiles a iniciar la transcripción - se encuentran a más de 200 pb río arriba (región 5’) del sitio de inicio de la transcripción, aunque también se han localizado hacia el extremo 3’ (corriente abajo). Activar y desactivar genes
Caja TATA - debido a su composición de ocho pb A-T, se encuentra en la
mayoría de los promotores y se localiza a –31 a –25 bp hacia el extremo 5’ del punto de inicio.
Secuencia consenso - s la región conocida como iniciador (Inr) localizada
entre las posiciones –3 y +5 - OCHO PB (A-T) único elemento que se localiza en una dirección relativamente fija con respecto al punto de inicio. Caja TATA menos - promotores que carecen de caja TATA - Cuando existe una mutación en la caja TATA, el sitio de inicio de la transcripción cambia, ya que la ARN pol II al ser activada se sitúa en otro sitio DPR (downstream promoter element) es un elemento común en los promotores TATA menos, se localiza de +28 a +32. Unidad de transcripción - se refiere a la interacción de todas las secuencias funcionales o estructurales posibles, así como el complejo proteico formado de enzimas y TF que se requieran durante el proceso de la transcripción. Las regiones que controlan la transcripción de un gen no necesariamente tienen que estar cerca de la región codificadora.
Potenciadores o secuencias amplificadoras (enhancers) - son secuencias
cortas que potencian o aumentan la transcripción del gen de manera cooperativa con otras secuencias reguladoras y alteran la estructura del ADN, ya que inducen el superenrollamiento en la zona del promotor basal y aumentan la unión de TF, lo que implica una aproximación física entre ambos y una fl exibilidad en la molécula de ADN, y favorece el inicio de la transcripción.
Silenciadores (silencers) - son secuencias cortas de nucleótidos de dos tipos:
A. elementos silenciadores B. elementos de regulación negativa (negative regulation elements, NRE)
Pueden actuar de varias maneras:
1. Modificando la estructura de la cromatina y evitando que los genes sean
activados. 2. Reclutando factores transcripcionales represores y evitando que factores transcripcionales inductores se unan al ADN. 3. Alterando y evitando el proceso de corte y empalme del ARN heterogéneo nuclear y evitando su maduración. 4. Creando señales que bloquean la traducción, e inactivando así la expresión génica.
La acción de un potenciador o un silenciador puede inhibirse por la
presencia de secuencias aisladoras Secuencias aisladoras - función es bloquear la transmisión de la señal de un sitio a otro en el ADN e impedir el silenciamiento
La mayoría de los potenciadores o silenciadores actúan sobre el promotor
que se encuentra vecino, sin ser específicos de un determinado gen.
ARN POLIMERASA
Sintetiza una cadena de ARN en dirección 5’ → 3
Actúa de manera continua durante toda la unidad de transcripción:
1. sobre el sitio de inicio indicado en el promotor basal 2. continúa en la secuencia codifi cadora 3. finaliza en una secuencia de terminación Células eucariotas - los genes nucleares son transcritos por tres tipos de ARN pol: I, lI y III, que transcriben diferentes tipos de genes en lugares específicos del núcleo. ARN POL I - Nucléolo - ARN R ARN POL II - Nucleoplasma - ARN HN; ARN M; ARN SN ARN POL III – Nucleoplasma - ARN T; ARN R 5S; ARN SN ARN pol de mitocôndrias - Se asemejaa laARN POL bacteriana menor complejidad.
Células Procariotas: ARN POL - Esta variante Sintetiza las 3 variantes
funcionalesde ARN.
ARN pol I reside en una zona defi nida del núcleo, el nucleolo, donde transcribe los genes que codifican para los ARNr. sintetiza un único tránscrito, el ARNr 45S, precursor de los ARNr 18S, 28S y 5.8S. ARN pol II se encuentra en el nucleoplasma y sintetiza las moléculas de ARNhn, el precursor del ARNm y algunos ARNsn. ARN pol III se encuentra en el nucleoplasma y es la encargada de la síntesisde los ARNt, el ARNr 5S y otros pequeños ARN (small nuclear, ARNsn).
FACTORES TRANSCRIPCIONALES son proteínas que se unen al ADN en el promotor, potenciador o silenciador para el control de la expresión de los genes. se unen al ADN reconociendo una secuencia específi ca factores transcripcionales generales o basales y factores transcripcionales inducibles el tipo de arn a ser sintetizado va depender del tipo de arn polimeraza
1. Factores transcripcionales (TF) generales o basales
Son los requeridos para el inicio de la transcripción en todos los promotores basales. Se unen a la ARN pol para formar un complejo que rodea el sitio de inicio, determinando la iniciación. toman el nombre de la ARN pol con la que actúan y, junto con ésta, forman el aparato básico de transcripción. los TF que actúan con la ARN pol I se denominan TF I; los que actúan con la ARN pol II, TF II, y los que actúan con la ARN pol III, TF III.
2. Factores transcripcionales inducibles o TF de tejido específico
requeridos para la expresión de un determinado gen en particular para cada promotor su función es más bien reguladora y se unen preferentemente a los promotores distales. Se sintetizan o activan bajo un estímulo y controlan la transcripción en tiempo y espacio. requieren de la formación de un complejo mediador estimulado de forma aleatoria
PROCESO DE TRANSCRIPCIÓN
1. tiene lugar en el núcleo
2. la molécula de ADN se separa de forma transitoria en dos cadenas sencillas y una se utiliza como molde para la síntesis de ARN, formando una burbuja (burbuja de transcripción). 3. Conforme la ARN pol avanza y copia el ADN, el ADN ya copiado se vuelve a unir a sucadena complementaria y forma nuevamente la doble hélice, liberando el ARN como una cadena sencilla de nucleótidos 4. La reacción de transcripción se divide en tres etapas: iniciación, elongación y terminación.
Inicio. El inicio se refi ere a la síntesis de los primeros enlaces nucleotídicos de
ARN. La ARN pol II permanece en el promotor mientras sintetiza los primeros nueve enlaces. La fase de inicio puede retrasarse por la ocurrencia de intentos abortivos, en los que la enzima sintetiza pequeños fragmentos (menos de nueve bases) y los libera, y vuelve a iniciar nuevamente. El inicio termina cuando la enzima comienza a alargar la cadena y abandona el promotor con el complejo de iniciación
Elongación. La fase de elongación requiere de las proteínas TFIIE y TFIIH, que
se unen corriente arriba de la ARN pol II; ambas se requieren para iniciar su movimiento a lo largo del ADN y el abandono del promotor basal.
Terminación. La terminación de la transcripción implica el reconocimiento de
una secuencia que contiene una región rica en GC, en una serie de seis o más adeninas contenidas en el tránscrito de ARN - fi nal de la adición de nucleótidos a la cadena y la desintegración del complejo de transcripción.
PROCESAMIENTO DEL ARN
1. El tránscrito primario, o ARNhn, tiene que procesarse de diversas formas
para su maduración antes de exportarse del núcleo y participar en el proceso de traducción. 2. El proceso de maduración incluye la adición de un capuchón de guanina modifi cada en el extremo 5’, la poliadenilación del extremo 3’, el corte y empalme, además del proceso de edición que sucede sólo en algunos genes 3. La etapa de la terminación de la transcripción y la adición de la cola de poliadenilación (poli-A) en el extremo 3’ están íntimamente ligadas.
CORTE Y EMPALME (SPLICING)
Consiste en la remoción de los intrones (las secuencias intragénicas no
codifi cadoras de la región codifi cadora) y el empalme de los exones (bloques de secuencias codifi cadoras para formar el ARNm maduro). Los exones y los intrones pueden empalmarse en más de una forma y generar variantes del ARNm por corte y empalme alternativo.
Las regiones en el ARNhn reconocidas por la maquinaria de corte y
empalme son secuencias conservadas de nucleótidos específicas que limitan los exones y los intrones, e indican dónde se realizará el corte y el empalme, sitio de empalme 5’ y 3’ (donante y receptor, respectivamente); sitio de ramificación - e encuentra en la secuencia del intrón.
Ayustosoma - median dos reacciones de transesterificación sucesivas donde se
rompen y se forman dos enlaces fosfodiéster nuevos está formado por 150 proteínas y 5 ARN nucleares pequeños (ARNsn), conocidos como U1, U2, U4, U5 y U6; es una riboproteína. Etapas de las reaccines:
1. Identificación de las secuencias donantes 5’ y sitio de ramificación por U1 y
U2 2. Formación de un plegamiento del ARN para acercar los tres sitios de corte y empalme, 3. Liberación de U1. Es remplazado por U6.
EDICIÓN DEL ARN
es una forma de modificación postranscripcional del ARNm.
genera el cambio de un aminoácido importante por otro o codones de paro de la traducción y la generación de una proteína truncada sólo se presenta en ciertos genes, en algunos tejidos o en algunos tipos celulares Mecanismos:
1. desaminación oxidativa de una citosina metilada, que se convierte en
uridina del codón CAA (enzima citidina desaminasa) y genera el codón de paro UAA 2. cambio de aminoácido adenina por inosina, que prefi ere aparearse con citosina (enzima adenosina desaminasa de acción sobre ARN, ADAR)
REGULACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN
expresión diferencial de sus genes.
producto génico que interactúa con otros genes o con el ambiente en tiempo y espacio.
