 Las 

lenguas arawak, como el wayúu de La Guajira y el achagua y el piapoco en el SE del país.

 Las lenguas barbacoanas, en Nariño y el Cauca
 Las lenguas witoto, en el departamento de Putumayo.
 Las lenguas caribes, en Amazonas, Guaviare y Cesar.
 Las lenguas chibchas en la Sierra Nevada de Santa Marta y el Cocuy.
 Las lenguas chocó, como el emberá y el wounaan.
 Las lenguas guahibanas, en Los Llanos del Orinoco.
 Las lenguas makú, en Vaupés y Guaviare.
 Las lenguas quechuas, en el S. del país.
 Las lenguas tucanas, en el SE. y S. del país.
Además existen un número significativo de lenguas aisladas o no clasificadas:

 El andoque en el río Caquetá.

 El camsá en el valle de Sibundoy (Putumayo).
 El nasa yuwe en Cauca.
 El sáliba-piaroa en Vichada.
 El ticuna en el triángulo de Leticia.
También se hablan lenguas barbacoanas junto a la frontera con Ecuador, lenguas caribes en el N. del país, ñe'engatú el extremo SE del país.
Anteriormente se hablaron las lenguas betoi, lenguas aisladas como el andakí y el tinigua y un cierto número de lenguas sin clasificar.
 Clasificación de las lenguas indígenas de Colombia

Familia Grupo Lengua Territorio

Wayuunaiki La Guajira

Achagua Meta

Lenguas arawak Kurripako Río Içana

Se trata de la familia de lenguas amerindias con Arawak septentrional
más lenguas en Sudamérica. Cabiyari Río Mirití-paraná

Maipure (†) Vichada

Piapoco Guainía, Vichada, Meta

Awá pit Nariño

Barbacoa (†) Nariño
Ahuano
Pasto (†) Nariño
Lenguas barbacoanas
La familia barbacoana fue identificada como
Sindagua (†) Nariño
grupo separado de las lenguas chibchas
recientemente.
Coconuco (†) Cauca

Coconucano Guambiano Cauca

Totoró Cauca
 Bora Amazonas

Bora Miraña Amazonas

Lenguas bora-witoto
Algunos autores cuestionan que las lengas bora Muinane Amazonas
y las lenguas huitoto formen una única familia
debido a las grandes divertencias entre los dos Meneca-Murui Amazonas
grupos.

Witoto Nonuya Amazonas

Ocaina Amazonas

Yukpa Cesar
Septentrional Costero
Lenguas caribes
Opón-carare (†) Santander
.

Meridional SE Colombia Carijona Amazonas, Guaviare

Lenguas chibcha. Magdalénico Arhuaco Ika (arhuaco) Cesar, Magdalena

Kankuí Cesar

Kogui Magdalena

Magdalena, La Guajira,
Tayrona
Cesar

Wiwa Cesar
 Duit (†) Boyacá

Muisca (†) Cundinamarca, Boyacá
Cundicocúyico
Guane (†) Santander

Tunebo ARA, BOY, NSA, SAN

Cesar, Norte de
Barí Barí
Santander

Chimila Chimila Magdalena

Ístmico Kuna Kuna Urabá, río Atrato

Lenguas chocó Emberá Emberá Costa del Pacífico

Agrupadas frecuentemente junto con la familia
chibcha y el idioma paez en un grupo macro-
chibcha actualmente no existen argumentos Chocó, Cauca, Valle
Waunana Waunana
sólidos para sostener ese parentesco. del Cauca

Hitnü Arauca
Septentrional
Lenguas guahibanas Hitanü Arauca
Algunos autores integran esta familia de
lenguas junto con las lenguas
maipureanas dentro del filo Meta, Vichada, Arauca,
Sikuani (Guahibo)
macroarahuacano aunque dicha agrupación no Guainía, Guaviare
se acepta universalemnte. Central
Casanare, Vichada,
Cuiba
Arauca
 Meridional Guayabero Meta, Guaviare

Itálico Romance Español Todo el país

Lenguas indo-europeas
Amazonas, Guainía,
Llegaron al territorio colombiano durante y Itálico Romance Portugués
Vaupés
después de la época colonial, desarrollando sus
propios acentos regionales. San Andrés y
Germánico Ánglico Inglés
Providencia
Ciudades
Indo-Iranio Romaní
principales
ríos Papurí y bajo
Kakwa
Kakwa-Nukak Vaupés
Lenguas makú
Septentrional
Algunos autores consideran que el makú Nukak Guaviare
meridional sí forma una familia pero rechaza
Puninave Puinave Guainía
que este grupo esté relacionado con el makú
septentrional. Yujup ríos Japurá y Tiquié
Nadajup Jup
Jupda ríos Papurí y Tiquié
Lenguas quechuas
Estas lenguas constituyen una familia de Cauca, Nariño,
Quechua periférico Chinchay (Q II-B) Quichua norteño
lenguas diferentes ya que no todas las Putumayo
variedades de quechuas son intercomprensibles.

Lenguas salibanas Sáliba Sáliba Arauca, Casanare

. Piaroa Piaroa Vichada
Lenguas tucanas Koreguaje Río Orteguaza
. Occidental Noroccidental
Siona Río Putumayo
Vaupés, Cuduyarí
norte Cubeo
Querarí, Pirabotón
Central
Guacayá, Mirití
sur Tanimuca
Oikayá, Aporis
Oriental norte Piratapuya Papurí
Tucano Papurí, Caño Paca
 Wanano Vaupés
Colorado, Fríjol
Bará
Lobo, Tiquié
Desano Vaupés

centro Siriano Vaupés

Tatuyo Vaupés
tuyuca Tiquié
Yurutí Vaupés
Barasana Vaupés
sur Carapana Vaupés
Macuna Vaupés
Andoque río Caquetá
Ticuna Leticia, Puerto Nariño
Betoi (†) Casanare
Lenguas aisladas
Se ha intentado agrupar estas lenguas en familias más amplias, aunque sin éxito. Camsá Putumayo
Cofán Nariño, Putumayo
Tinigua-pamigua 
Meta, Caquetá
(†)
Lenguas no clasificadas Cauca, Huila, Valle del
Paez
Además existe un conjunto de lenguas con documentación muy escasa y referencias a lenguas de pueblos extinguidos, Cauca
que no han podido ser clasificadas por falta de información. Ver por ejemplo Lenguas no clasificadas de Sudamérica.
Andaquí (†) Caquetá
Colima (†) Cundinamarca
Malibú (†) Tamalameque, Tenerife
Mocana (†) Cartagena de Indias
Muzo (†) Cundinamarca
Panche (†) Cundinamarca
 Pijao (†) Tolima
Yarí Caquetá
Yurí Amazonas
Tomado de: https://es.wikipedia.org/wiki/Lenguas_de_Colombia