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Nombre: José David Sepúlveda Cruz Código: 1950002

Metodología de la investigación

Evaluación por medios computacionales de la degradación de compuestos lignocelulosicos por

medio de la proteína alfa-L-arabinofuranosidasa para la obtención de biocombustibles.

1. Planteamiento del problema “ir de lo general a lo particular”

La creciente demanda de combustibles a nivel global cada vez aumenta más la dependencia

del ser humano hacia el petróleo, carbón y sus derivados; siendo esto un problema para el

medio ambiente ya que durante los procesos de obtención de dichos combustibles, son

producidas grandes cantidades de gases nocivos y de efecto invernadero; es por esto que

diversos países han optado por colocar aranceles, impuestos e imponiendo restricciones a

la comercialización y tratamiento de crudos que no cumplan con los mínimos requisitos

medio ambientales permitidos. A su vez han venido apoyando la obtención de combustibles

por medios ecológicamente amigables, permitiendo una economía circular y un

aprovechamiento optimo de las materias primas, en donde cuyo objetivo es disminuir al

máximo la generación de desechos. Es así como han nacido múltiples iniciativas para la

generación de combustibles primarios partiendo desde la quema de los residuos en

ausencia de oxigeno “pirolisis” y la implementación de microorganismos como agentes

reductores “fermentación y descomposición”. En este ultimo campo las bacterias han

desarrollado un papel fundamental debido a la existencia de diversos tipos de

microorganismos capaces de realizar este proceso y que se encuentran en los lugares y

condiciones mas tradicionales e inhóspitas que se pudiese imaginar. Por lo tanto, al existir
una enorme cantidad de información concerniente a las actividades enzimáticas han surgido

herramientas bioinformáticas que me permiten correlacionar el comportamiento y la

expresión de estas enzimas a diversas condiciones de operación, permitiendo obtener

aproximaciones por medio de simulaciones sin tener que contar con el material biológico en

el momento. Es así como estas herramientas permiten realizar múltiples investigaciones,

variaciones y aproximaciones de fenómenos reales por medio de la computadora y sin

invertir gran capital de dinero.

Actualmente el campo de interés de las familias de enzimas con propiedades

descomponedores de compuestos lignocelulósicos son: celobiosa deshidrogenasa,

peroxidasas de lignina y glucósido hidrolasa.

Es así como la ∝-L-arabinofuranosidasa es una enzima prometedora y de gran relevancia

actual, ya que posee acción directa en la hidrolisis de los enlaces covalentes entre la L-

arabinosa y la D‐xilosa, eliminando los residuos sustituidos en la posición C2 y C3 de los

residuos de xilosa. Dando paso a residuos de menor tamaño que son el material de trabajo

de celulasas, las cuales convierten directamente estos en combustibles de bajos y medianos

pesos moleculares. Por lo tanto, en este trabajo es de vital importancia la identificación de

las condiciones optimas a las cuales esta enzima realiza su mayor actividad catalítica, a su

vez se trabajará con ligandos que posean xilanos en su estructura y se planteará una

posible explicación en los resultados de las interacciones del ligando-enzima; que se

presenten al variar tanto el pH del medio como la temperatura.


2. Justificación

Evaluar la capacidad de degradación en compuestos lignocelulósicos de la enzima ∝-L-

arabinofuranosidasa ya que contribuye en la fabricación de biocombustibles, aprovechando

el material vegetal disponible del entorno. Debido a que la actividad enzimática es tan

variante dependiendo de las condiciones del entorno, es indispensable encontrar el pH y la

temperatura ideal a la cual la tasa de conversión del material vegetal es mayor, ya que

permite optimizar de una forma teórica las eficiencias en los procesos.

No obstante, se conoce que Norte de Santander es un departamento del nororiente de

Colombia, en donde gran parte de la actividad económica de la región se debe a la

agricultura, siendo el sector de la palma de aceite, gran productor de material vegetal de

residuo, ocasionando actualmente sobresaturación de los centros de acopio y contaminando

el suelo circundante por la infiltración de lixiviados. Es por ello por lo que el presente trabajo

desea iniciar la exploración de las capacidades enzimáticas por medio de herramientas

bioinformáticas para en un futuro aportar soluciones a las problemáticas que afectan la

región.