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Comparación 

de arboles filogeneticos empleando el software MEGA 


 
 
1 Descargar el software Mega de: https://www.megasoftware.net/  
 
2 En la pagina de ncbi realizar la busqueda de las secuencias del gen de la hexoquinasa 

HK1 Hexokinase 1, homo sapiens. NCBI

3.Seleccionar una secuencia de hexoquinasa humana y realizar un analisis blast
para ubicar secuencias de proteinas de otras especies 
 
22 secuencias seleccionadas para BLASTp.

4. Genere un archive fastas con
al menos 20 secuencias de hexoquinasas de diversas especies. 
Archivo de las 22 secuencias en formato fasta.

 
5 Abrir el archive fasta usando el software Mega y realizar un alineamiento por Muscle. 

Alineamiento por Muscle.


6. Guardar el archivo en formato Meg 
 
7. Hacer diferentes arboles filogeneticos y comparar arboles basados en distancia y basad
os en caracteres. 

Maximun Likelihood
UPGMA

En el árbol filogenético Maximun Likelihood no se observa una raíz que representa al ancestro en
común, mientras que en UPGMA sí.

Se observan similitudes en alineamientos, que posiciona en igual forma a los individuos.

En el árbol filogenético por Maximun Likelihood, se encuentra a Homo sapiens emparentado con
Pan troglodiytes, mientras en UPGMA lo está con Gorila gorila.

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