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Pontificia Universidad Católica de Chile

Departamento de Ingenierı́a Quı́mica y Bioprocesos


18 de junio de 2016

Preparación Taller R
Felipe Huerta Pérez - fnhuerta@uc.cl

Este documento es una guı́a de preparación de los software necesarios y los temas
que se abordarán en el taller de R. Se requieren aproximadamente 45 minutos para
instalar y configurar los software.

Software y packages
R: Es un software libre de computación estadı́stica y gráfica. El link de descarga
es el siguiente: Descargar R.
En esta página se debe seleccionar el sistema operativo ”Download R for ...”,
luego, hacer click en el link base y finalmente hacer click en el link de la parte
más arriba de la página. Para Windows, el link de descarga directa de R es R
Windows. Luego, R se debe instalar a partir del ejecutable descargado.

RStudio: es un conjunto de herramientas integradas diseñadas para mejorar la


productividad de R. Incluye una consola, un editor que destaca la sintaxis rele-
vante y ejecución de código directa. Además, incluye herramientas para graficar,
llevar un historial, debugging y manejo del espacio de trabajo. Link: Descargar
Rstudio.

Packages: Una vez descargados los software anteriores, se instalarán los packages
rsm,RcmdrPlugin.DoE y DoE.base desde Rstudio. El detalle se explicará en la
siguiente sección.

Instalación
1. Instalar R

2. Instalar Rstudio

3. Abrir Rstudio
En Rstudio, ir a la ventana inferior derecha y seleccionar la pestaña Packa-
ges. Luego, hacer click en el botón Install. En la siguiente imagen se muestra
destacado en amarillo la pestaña Packages y el boton Install.

4. Instalar packages:

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La ventana desplegable permite a Rstudio conectarse con el servidor de R para
descargar los packages. Es necesario estar conectado a internet para descargar los
packages.
En el cuadro de texto para llenar, se debe escribir la secuencia de Packages sepa-
radas por un espacio. Es decir:

rsm RcmdrPlugin.DoE DoE.base

Estos packages requieren otros packages previos (dependencias) para funcionar,


sin embargo, R los descarga automáticamente si la opción Install dependencies
está seleccionada . La siguiente imagen muestra cómo se debiera ver la ventana des-
plegable:

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La descarga demora entre 1 y 10 minutos, dependiendo de la velocidad del internet.
Cargar packages
Una vez descargados los packages necesarios, se deben cargar en la misma pestaña
Packages cada vez que se inicie una sesión de Rstudio. En esta pestaña, se extiende
una lista de verificación. Se debe hacer click en los packages rsm y RcmdrPlugin.DoE.
Esto hará que Rstudio cargue los packages.
Es muy probable que al cargar el package RcmdrPlugin.DoE por primera vez
se despliegue una ventana de error. Esto quiere decir que es necesario instalar más
packages, lo cual se puede hacer de manera sencilla a partir de esta ventana. Se
debe hacer click en la opción instalar packages, y luego seleccionar el servidor
de descarga CRAN. A continuación, comenzará un nuevo proceso de descarga que se
extenderá por algunos minutos. Una vez que termine el proceso, se abrirá la interfaz
R Commander:

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Con esto, se da por finalizada la preparación de los softwares para el taller de R. En
este taller, se utilizarán principalmente los comandos de la pestaña Design. Se sugiere
explorar R Commander y las opciones que entregan las pestañas Design, Graphs y
Models

Preparación teórica
Para este taller, es deseable manejar los conceptos básicos de diseño experimental
y programación en R. A continuación, se muestra una lista de recursos gratuitos:
Programación en R y estadı́stica:

Coursera: John Hopkins University Data Science Program, en particular el pri-


mer capı́tulo segundo curso R Programming.

Packages R:

Tutorial for designing experiments using the R package RcmdrPlugin.DoE: Guı́a


de uso de la interfaz RcmdrPlugin.DoE, creada por Ulrike Grömping.

Bibliografı́a recomendada
Bezerra, M. A., Santelli, R. E., Oliveira, E. P., Villar, L. S., Escaleira, L. A.
(2008).Response surface methodology (RSM) as a tool for optimization in analytical
chemistry. Talanta, 76(5), 965?977. http://doi.org/10.1016/j.talanta.2008.05.019
Dean, A. M., Voss, D. (2000). Design and Analysis of Experiments. Springer New
York.
Jaqaman, K., Danuser, G. (2006). Linking data to models: data regression. Nat
Rev Mol Cell Biol, 7(11), 813?819. Retrieved from http://dx.doi.org/10.1038/nrm2030
Lenth, R. V. (2012). Response-Surface Methods in R , Using rsm.

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