Dogma Central de la Biología Molecular

Las tres direcciones generales son:

de DNA a DNA (Replicación).

de DNA a RNA (Transcripción).
de RNA a AA (Traducción).

* Ocurren de manera normal en la mayoría de las células.

Las tres direcciones especiales son:

de RNA a RNA (Replicación de RNA).

de RNA a DNA (Retro-transcripción).
de DNA a AA (Solo in vitro).

*Ocurren de manera extraordinaria, pero ocurren.

Las tres direcciones desconocidas son:

de AA a DNA (Evolución inteligente).

de AA a RNA (Otra forma de evolución inteligente).
de AA a AA (controversia de priones).

* Actualmente se piensa que no ocurren nunca.

Definición de un gen

Región física localizable de una secuencia genómica (DNA o RNA)

que corresponde a la unidad básica de la herencia, que posee
regiones regulatorias, regiones que serán transcritas y otras
secuencias funcionales.

Gertsein ha expandido definición para incluir a los genes no-

codificantes (de proteínas) de RNA:

“Un gen es la unión de secuencias genómicas que codifican un

conjunto coherente de productos funcionales potencialmente
empalmados”.
Cis- y Trans-
Cis
Gen = Cistrón = Grupo de complementación

Una región de DNA posee efectos cis- cuando

afecta el funcionamiento (expresión, replicación,
etc) de secuencias físicamente contiguas a ella
(sinténicas) sin necesidad de una proteína (o RNA)
intermediario...

p. ej.: sitio de origen de replicación o los

promotores de transcripción.

Opuesto funcional a efecto trans

Cis- y Trans-
Trans

Una secuencia con efectos trans-

corresponde simplemente a un gen
que codifica para una proteína (o
RNA) que ejerce un efecto sobre otra
secuencia de DNA o RNA que no se
encuentran físicamente contiguas a
través de un intermediario (proteina o
RNA).
Mecanismo de la transcripción en procariotas
La transcripción es el paso de una secuencia de ADN a una secuencia de ARN (ya sea ARNm, ARNr
o ARNt).

En el ADN, cuyos genes (información genética) van a transcribirse se diferencian, en principio, dos
regiones con distinta función:

1) Región estructural:
Corresponde al conjunto de genes (cistrones) que determinan el orden de los AA en las proteínas
que codifican (ya sean estructurales o enzimáticas).

2) Región reguladora o promotor:

Esta región controla el ritmo con el que la ARN polimerasa transcribe la región estructural en ARN.
Esta región se encuentra cerca de la anterior (hacia el extremo 3’)
Regiones reguladoras
Todos los genes poseen regiones reguladoras
además de las regiones codificantes para productos
génicos.

Una de estas regiones reguladoras son los

promotores, los cuales sirven para promover la
unión de la maquinaria transcripcional implicada en
la expresión del producto génico.

Los promotores poseen secuencias consenso

relativamente conservadas, algunas de estas
secuencias muestran una gran afinidad por la
maquinaria transcripcional (promotores fuertes) y
otros no (promotores débiles).

La afinidad por la maquinaria transcripcional

determina el número de interacciones que se dan
entre estos dos componentes y por ende el número
de veces que un gen es transcrito.
Regiones reguladoras

La gran mayoría de los genes procariotas

se encuentran organizados en operones o
grupos de genes cuyos productos poseen
funciones relacionadas y por ende, que son
transcritos de manera conjunta como una
unidad.

En contraste, los eucariotas poseen genes

que son transcritos de manera
independiente pero posee una naturaleza
interrumpida (con exones e intrones a
diferencia de los procariotas
monoexónicos).

Así pues, los genes procariotas son

policistrónicos pero monoexónicos,
mientras que los eucariotas son
monocistrónicos pero poliexónicos.
Principales regiones de un gen
Estructura del RNAm en Procariotas

Transcripción

RNAm

Codón inicio
Codón 3´UTR
5´UTR Shine-Dalgarno terminal
(AGGAGG)
 Expresión génica en Procariotas

a) Un operón es un conjunto de genes estructurales (cistrones), cuya expresión genética

depende de otras secuencias de ADN a las que está asociado.

b) Los cistrones corresponden a genes que codifican para distintas enzimas (proteínas) de una
misma vía metabólica.

c) Como consecuencia, se dice que los genes estructurales se expresan de forma coordinada
(porque están funcionalmente relacionados).
Estructura de los Genes Procariotas
Dirección de la transcripción
 Genes procariotas
Un segmento del ADN que codifica para un polipéptido específico se conoce
como un gen estructural. Escherichia coli puede sintetizar 1700 enzimas, por lo
tanto esta pequeña bacteria tiene genes para 1700 mARN.
 Código genético
El código genético está compuesto por codones • 61 codones para aminoácidos
(existen 20 aminoácidos diferentes)
(codon= 3 bases nitrogenadas) que definen el
• 3 codones de terminación
proceso de traducción

El código genético es
universal

El código genético es
redundante (varios
codones para un mismo
aminoácido)

Ejemplo: El aminoácido
glicina está codificado por
GGU, GGC, GGA y GGG
Código genético
Genes eucariotas
Consisten en una secuencia de DNA que contiene un promotor encargado de regular la
actividad (expresión) del gen, al igual que una secuencia que codifica para un producto
determinado (proteína o RNA).

Cuando el gen es activado, la región codificante es transcrita para producir una copia
de RNA que en algunos casos posee actividad per se y en otros es posteriormente
traducida hacia una proteína
Productos génicos

En la mayoría de los casos el RNA transcrito constituye un producto intermediario en el proceso

de manufactura de proteínas, pero en algunos casos el RNA mismo posee actividad funcional
(rRNA o miRNA).

Los rRNA de ribozimas poseen actividad catalítica mientras que los miRNA poseen actividad
reguladora.

A estos genes se les denomina genes de RNA o DNA no-codificante (por carecer de sustrato
protéico).
Naturaleza interrumpida de genes eucariotas
Al principio se pensaba que los eucariotas tendrían organizaciones génicas similares a las de
los procariotas en donde un gen es colinear y directamente proporcional al tamaño de su
proteína codificada.

La secuencia génica del DNA = a la secuencia del transcrito de RNA = secuencia de aa.

Los genes eucariotas (superiores) difieren de los procariotas en que poseen una naturaleza
interrumpida.

La secuencia de DNA poseía fragmentos que no estaban presentes en el RNA maduro ni en

los aminoácidos.

Secuencia de DNA = secuencia de transcrito primario = secuencia de RNA maduro más

intrones = aminoácidos.

Las levaduras suelen poseer genes continuos sin interrupciones.

Los genes de los eucariotas superiores poseen dos tipos de secuencias génicas intrones y
exones.
Naturaleza interrumpida de genes eucariotas
Los exones corresponden a las secuencias de
DNA que son exportadas del núcleo en forma
de RNA para ser traducidas en proteínas

Los intrones corresponden a las secuencias

de DNA que forman parte del transcrito de
RNA primario pero que se quedan “dentro”
del núcleo sin formar parte del mRNA maduro,
sin codificar para proteínas y por ende no son
blancos evolutivos.

Debido a que los intrones no codifican para

proteínas, pueden acumular mutaciones sin
impacto sobre las regiones colindantes
codificantes sin problema (a menos de que
dichas mutaciones caigan en la frontera
exónica en cuyo caso pudieran afectar el
splicing, ver más abajo).
Naturaleza interrumpida de genes eucariotas
Los genes interrumpidos son objeto de un proceso no observado en procariotas, el splicing
nuclear mediante el cual los intrones son identificados y retirados del transcrito de RNA
primario (pre-mRNA) para formar un mRNA maduro (mRNA propiamente).
Naturaleza interrumpida de genes eucariotas
Por ahora consideraremos que tras el splicing nuclear, el
orden de los exones es SIEMPRE el mismo que en la
secuencia de DNA original.

En realidad los exones nunca se separan unos de otro,

el splicing nuclear ocurre como una reacción
intramolecular en la cual los dos extremos de un intrón
se unen formando un “loop o asa intrónica” que
ulteriormente es liberada tras su escisión

Esto evita que se formen recombinantes pos-

transcripcionales en los cuales los exones son
intercambiados con otros transcritos primarios.
Conservación de organización génica
Por norma general, los exones son pequeños (entre 50 y 300 bp) en comparación a los
intrones (1000 bp o mas).

El número y tamaño de los intrones presentes en genes varía enormemente de especie a

especie pero la organización génica suele mantenerse relativamente conservada.
Conservación de organización génica
Usualmente, los intrones poseen codones de terminación en los tres marcos de lectura
disponibles

Un marco de lectura corresponde al tipo de agrupamiento en tripletes que es usado para

traducir la secuencia de RNA a aminoácidos.

Debido a que el código genético se lee en forma de tripletes, existen tres marcos de lectura
distintos para toda secuencia de DNA…
Expresión génica en Eucariotas
Transcripción

La trascripción utiliza una de

las cadenas del DNA como
molde

A lo largo del DNA los genes

utilizan una u otra cadena
para copiarse a RNA.

Un gen específico siempre

usara una cadena y solo
una como molde.
   

 

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