INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL

UNIDAD PROFESIONAL INTERDISCIPLINARIA DE

BIOTECNOLOGÍA

DEPARTAMENTO DE BIOPROCESOS

ACADEMIA DE BIOTECNOLOGÍA

TÓPICOS SELECTOS DE BIOTECNOLOGÍA II

EJERCICIO DISEÑO DE CEBADORES (PRIMERS) PARA PCR. V4

Nombre: Durán Salazar Ángel Emilio Grupo: 6BV4 Fecha: 30 de enero del 2020

De la siguiente secuencia, diseña un par de primers para amplificar una sección de 100 pares de bases (+/- 10
bases). Señale la región a amplificar y en la parte de abajo coloque la secuencia de ambos primers en sentido
5’-3’.

a) Deben tener entre 15 y 20 bases.

b) Contenido de GC entre 40 y 60%
c) Debe contener un GC clamp.
d) Tm entre 50-68ºC y diferencia no mayor a 3ºC entre cada uno. Tm=4(G+C)+2(A+T)

ORIGIN
1 agtctgggac gcgccgccgc catgatcatc cctgtacgct gcttcacttg tggcaagatc
61 gtcggcaaca agtgggaggc ttacctgggg ctgctgcagg ccgagtacac cgagggggat
121 gcgctggatg ccctgggcct gaagcgctac tgctgccgcc ggatgctgct ggcccacgtg
181 gacctgatcg agaagctgct caattatgca cccctggaga agtgaccacg ctggaaccca
241 cccacccgct gtgctgacca tgggccctga gcgtcctgcc ccgaattcac gaggctgagg
301 catccgggag ctggcgtaat gcctggccgc agtgtgtgtg tatccgatac cccactctgg
361 aaggaaccat ccagtaaagg tctttcagaa ccactaaggt cccagccctc actaggatgt
421 caggagccag gtctaggccc agctttcaca ctgtggcagc ccagtgaagc agactgggcc
481 atgaactctc ctagccctgg ggccagcctg ttccacaggc acccctgcag gaggcgctgc
541 caggagagcc ttccatctcg gggctctttg aggttccctc cttctgggtg ttcttcaggc
601 tgagcagaga ggctcctgta ccctctctct cggaatctga agagccagat ttaggccggg
661 caaaggggct cacccctata atcccaggac tttgggaggc caaggcagga ggatcacttg
721 agtccagaaa ttcaagaccc gcctgggcat cataatgaga ccccatctct acaacaaaat
781 ttaataaatt agctgggcac agtgttcaca cctgtagtcc cggccactcg gggctgaggc
841 aggaggatca ctggaacctg ggaggttgcc actgcaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa
901 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaa

PRIMER FORWARD PRIMER BACKWARD

Posición: 340-357 Posición: 433-449
Secuencia: 5’gtatccgataccccactc 3’ Secuencia: 5’ cactttcgacccggatc 3’
%GC: 10 %GC: 10
∗ 100% = 55.55% ∗ 100% = 58.82%
18 17
Tm: 4(10) +2(8) =56°C Tm: 4(10) +2(7) =54°C