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Conceptos básicos de biología molecular, I
Dr. Eduardo A. R ODRÍGUEZ T ELLO
C INVESTAV-Tamaulipas
21 de mayo del 2013
Dr. Eduardo R ODRÍGUEZ T. (C INVESTAV) Conceptos básicos de biología molecular 21 de mayo del 2013 1 / 28
1 Conceptos básicos de biología molecular, I
Introducción
Proteínas
Tarea
Conceptos básicos de biología molecular, I Introducción

Introducción
Proteínas
Tarea
Introducción
En la naturaleza encontramos dos tipos de materia, la viviente y la

no viviente
Ambos tipos de materia están formados por átomos y obedecen

las mismas leyes físicas y químicas
Introducción
La materia viviente:
Puede moverse, reproducirse, crecer, comer, etc.
Interactúa activamente con su ambiente
Los seres vivos actúan de esta forma debido a un complejo

conjunto de reacciones químicas que ocurren en su interior
Introducción
Estas reacciones nunca se detienen
En muchas ocasiones los productos de una reacción son

constantemente consumidos por otra reacción, manteniendo el
sistema en funcionamiento
• Imagen tomada de Wikipedia
Introducción
Los organismos vivos están también constantemente

intercambiando materia y energía con su ambiente
Introducción
En contraste cualquier cosa que esté en equilibrio con su

ambiente puede generalmente ser considerada como muerta
Aunque hay algunas excepciones notables en formas vegetales

como semillas y los virus, los cuales pueden estar inactivos por
largos períodos de tiempo y no están muertos
Introducción
La ciencia moderna ha logrado establecer que la vida en la tierra

comenzó hace aproximadamente 3500 millones de años, poco
después de que ésta se formó
Las primeras formas de vida fueron muy básicas
Millones de años de evolución y diversificación han permitido que

hoy en día existan organismos simples y otros extremadamente
complejos
Ambos tienen una química molecular, o bioquímica, muy similar
Los principales actores de la química de la vida son las moléculas

conocidas como proteínas y ácidos nucleicos
Introducción
Hablando en términos simples, las proteínas son responsables de

lo que es un ser vivo y lo que puede hacer en un sentido físico
Un científico renombrado llamado Russell F. Doolittle alguna vez

dijo “Nosotros somos nuestras proteínas”
Por otra parte, los ácidos nucleicos codifican la información

necesaria para producir proteínas y son responsables de
transmitir esta “receta” a generaciones subsecuentes
Introducción
La biología molecular básicamente está dedicada a entender la

estructura y función de las proteínas y los ácidos nucleicos
Estas moléculas son por lo tanto esenciales en el estudio de la

Bioinformática
A continuación daremos una breve descripción de cada una de

ellas
Conceptos básicos de biología molecular, I Proteínas

Introducción
Proteínas
Tarea
Proteínas
La mayoría de las substancias en nuestros cuerpos son

proteínas, de las cuales hay diferentes tipos
Las proteínas estructurales actúan como bloques de construcción

de tejidos (colágeno y queratina)
Las proteínas enzimáticas actúan como catalizadoras de

reacciones químicas
Un catalizador es una substancia que acelera una reacción

química
Sin las proteínas enzimáticas muchas reacciones bioquímicas no

se llevarían a cabo o tardarían mucho en completarse por lo que
no serían útiles para la vida
Proteínas
Una enzima es capaz de acelerar estos procesos hasta millones

de veces haciendo posible la vida
Las enzimas son muy específicas, usualmente una enzima sólo

puede acelerar un tipo especial de reacción bioquímica
Considerando el gran número de reacciones que deben ocurrir

para sostener la vida, podemos ver que se requieren muchas
enzimas
Proteínas
Otros ejemplos de tipos de proteínas son:

Reguladoras (insulina, hormona del crecimiento)
Transportadoras (hemoglobina)
Defensivas (anticuerpos)
Pero qué son exactamente las proteínas, cómo están formadas y

cómo desarrollan sus funciones
Responderemos estas preguntas a continuación
Proteínas
Una proteína es una cadena de moléculas más simples llamadas

aminoácidos
La siguiente figura presenta la estructura básica de un

aminoácido
Un Carbono alfa (Cα ) unido a un grupo carboxilo (−COOH), a un

grupo amino (−NH2 ), a un hidrógeno y a una cadena lateral
(usualmente denominada R)
Proteínas
La cadena R es de estructura variable, y determina la identidad y

las propiedades de los diferentes aminoácidos
La cadena R puede ser tan simple como un átomo de Hidrógeno

(Glicina) o tan complicado como dos anillos de Carbono
(Triptófano)
Existen cientos de cadenas R por lo que se conocen cientos de

aminoácidos diferentes, pero sólo 20 de entre ellos forman parte
de las proteínas
A continuación se presenta una tabla con sus nombres y códigos
Proteínas
No. Aminoácido Códigos No. Aminoácido Códigos

1 Alanina Ala A 11 Leucina Leu L
2 Arginina Arg R 12 Lisina Lys K
3 Asparagina Asn N 13 Metionina Met M
4 Ácido aspártico Asp D 14 Fenilalanina Phe F
5 Cisteína Cys C 15 Prolina Pro P
6 Glutamina Gln Q 16 Serina Ser S
7 Ácido glutámico Glu E 17 Treonina Thr T
8 Glicina Gly G 18 Triptófano Trp W
9 Histidina His H 19 Tirosina Tyr Y
10 Isoleucina Ile I 20 Valina Val V
Proteínas
En una proteína los aminoácidos están unidos por enlaces

peptídicos
Por esta razón las proteínas son cadenas polipeptídicas
Proteínas
En un enlace peptídico, el átomo de Carbono que pertenece al
grupo carboxilo (−COOH) del aminoácido (1) se enlaza al átomo
de Nitrógeno del grupo amino (−NH2 ) del aminoácido (2),
desprendiendo una molécula de agua (H2 O)
Proteínas
Observemos que lo que encontramos realmente dentro de una

cadena polipeptídica es residuos de los aminoácidos originales
Por lo tanto, generalmente se habla de proteínas que tienen 100

residuos, en vez de 100 aminoácidos
Las proteínas contienen en promedio 300 residuos, pero las hay

con entre 100 y 5000 residuos
Proteínas
Los enlaces peptídicos hacen que cada proteína tenga un

esqueleto formado por repeticiones del bloque básico
−N − Cα − (CO)−
A cada Cα corresponde una cadena lateral
Debido a que hay un grupo amino en un extremo del esqueleto y

un grupo carboxilo en el otro, entonces es posible distinguir
ambos extremos de una cadena polipeptídica
Y por lo tanto también darle una dirección
Por convención, para nombrar el péptido se empieza por el amino

terminal
Si el primer aminoácido de nuestro péptido fuera Alanina y el

segundo Serina tendríamos el péptido Alanil-Serina
Proteínas
Las proteínas no son sólo una secuencia lineal de residuos
Esta secuencia es conocida como su estructura primaria
Las proteínas realmente se pliegan en tres dimensiones,

presentando estructuras secundarias, terciarias y cuaternarias
La estructura secundaria de una proteína está formada sólo por

las interacciones entre los átomos del esqueleto y resulta en
estructuras “locales” en forma de hélices
Proteínas
Tránsito de la estructura primaria a la estructura secundaria de

una proteína, i.e. plegamiento de proteínas (protein folding)
Proteínas
Las estructuras terciarias son el resultado de empacar estructuras

secundarias en un nivel más global
Las estructuras cuaternarias son un grupo de diferentes proteínas

empacadas juntas
Proteínas
¿Cómo se obtienen las proteínas?
Estas se producen en una estructura de la célula llamada

Ribosoma
En un ribosoma los aminoácidos componentes de una proteína

son ensamblados uno a uno gracias a la información contenida en
una molécula importante llamada ácido ribonucleico mensajero
(ARNm)
Para explicar cómo sucede esto es necesario primero explicar

qué son los ácidos nucleicos
Conceptos básicos de biología molecular, I Tarea

Introducción
Proteínas
Tarea
Conceptos básicos de biología molecular, I Tarea
Tarea
Tarea 1:
Leer el siguiente artículo, elegir dos temas de los abordados e
investigar un artículo relacionado con cada tema para preparar
una síntesis (en Latex).
Jacques Cohen, Bioinformatics: An introduction for computer

scientists. ACM Computing Surveys, Volume 36, Issue 2, pages
122-158 (June 2004).
Fecha de entrega: 28 de mayo antes de las 12h00

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Conceptos básicos de biología molecular, I

Dr. Eduardo A. R ODRÍGUEZ T ELLO

21 de mayo del 2013

1 Conceptos básicos de biología molecular, I

En la naturaleza encontramos dos tipos de materia, la viviente y la

Ambos tipos de materia están formados por átomos y obedecen

Los seres vivos actúan de esta forma debido a un complejo

En muchas ocasiones los productos de una reacción son

• Imagen tomada de Wikipedia

Los organismos vivos están también constantemente

En contraste cualquier cosa que esté en equilibrio con su

Aunque hay algunas excepciones notables en formas vegetales

La ciencia moderna ha logrado establecer que la vida en la tierra

Las primeras formas de vida fueron muy básicas

Millones de años de evolución y diversificación han permitido que

Ambos tienen una química molecular, o bioquímica, muy similar

Los principales actores de la química de la vida son las moléculas

Hablando en términos simples, las proteínas son responsables de

Un científico renombrado llamado Russell F. Doolittle alguna vez

Por otra parte, los ácidos nucleicos codifican la información

La biología molecular básicamente está dedicada a entender la

Estas moléculas son por lo tanto esenciales en el estudio de la

A continuación daremos una breve descripción de cada una de

1 Conceptos básicos de biología molecular, I

La mayoría de las substancias en nuestros cuerpos son

Las proteínas estructurales actúan como bloques de construcción

Las proteínas enzimáticas actúan como catalizadoras de

Un catalizador es una substancia que acelera una reacción

Sin las proteínas enzimáticas muchas reacciones bioquímicas no

Una enzima es capaz de acelerar estos procesos hasta millones

Las enzimas son muy específicas, usualmente una enzima sólo

Considerando el gran número de reacciones que deben ocurrir

Otros ejemplos de tipos de proteínas son:

Pero qué son exactamente las proteínas, cómo están formadas y

Responderemos estas preguntas a continuación

Una proteína es una cadena de moléculas más simples llamadas

La siguiente figura presenta la estructura básica de un

Un Carbono alfa (Cα ) unido a un grupo carboxilo (−COOH), a un

La cadena R es de estructura variable, y determina la identidad y

La cadena R puede ser tan simple como un átomo de Hidrógeno

Existen cientos de cadenas R por lo que se conocen cientos de

A continuación se presenta una tabla con sus nombres y códigos

No. Aminoácido Códigos No. Aminoácido Códigos

En una proteína los aminoácidos están unidos por enlaces

Por esta razón las proteínas son cadenas polipeptídicas

Observemos que lo que encontramos realmente dentro de una

Por lo tanto, generalmente se habla de proteínas que tienen 100

Las proteínas contienen en promedio 300 residuos, pero las hay

Los enlaces peptídicos hacen que cada proteína tenga un

A cada Cα corresponde una cadena lateral

Debido a que hay un grupo amino en un extremo del esqueleto y

Y por lo tanto también darle una dirección

Por convención, para nombrar el péptido se empieza por el amino

Si el primer aminoácido de nuestro péptido fuera Alanina y el

Las proteínas no son sólo una secuencia lineal de residuos

Esta secuencia es conocida como su estructura primaria

Las proteínas realmente se pliegan en tres dimensiones,

La estructura secundaria de una proteína está formada sólo por

Tránsito de la estructura primaria a la estructura secundaria de

Las estructuras terciarias son el resultado de empacar estructuras

Las estructuras cuaternarias son un grupo de diferentes proteínas

¿Cómo se obtienen las proteínas?

Estas se producen en una estructura de la célula llamada