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• Miescher mezclaba las células con detergente y se precipitaba una capa granulosa con
grumos (núcleos) y quedaba otra capa completamente transparente.
• Antes se creía que el ADN de las procariotas era solo circular, pero también es lineal.
• Los pili en las procariotas ayudan en la transferencia de ADN por la conjugación y
cumplen función de movimiento.
• Están en la superficie y las proteínas que los conforman se contraen y hacen que la
bacteria se mueve hacia delante.
• Los cilios son estructuras de locomoción en las eucariotas. Cumplen función sensorial.
• Los flagelos tienen función locomotora, pero pueden ser sensores de temperatura y de
concentración de químicos. Se encuentran en procariotas y eucariotas.
• El citoesqueleto de la procariota tiene más proteínas que el de la eucariota.
Composición Química de la Célula
• Las células eucariotas tienen núcleo, citoplasma y citosol, membrana plasmática, pared
celular, citoesqueleto, mitocondrias, cloroplastos, aparato de Golgi, lisosomas, vacuolas,
retículo endoplasmático, ribosomas, cilios y flagelos.
• Las células procariotas tienen membrana plasmática, pared celular (compuesta de
peptidoglicanos), cápsulas, citoplasma y citosol, ribosomas, flagelos y pili.
Biomoléculas
Polímeros
• Homopolímeros: Carbohidratos.
• Heteropolímeros: Proteínas y ácidos nucleicos.
El Agua
• La molécula de agua cambia la distancia de los enlaces cuando cambia de estado y hay
rompimiento de enlaces a temperaturas extremas.
• Los enlaces fosfodiéster son la columna del ADN y se rompen. Unen el OH del carbono 3’
de un nucleótido al carbono 5’ del azúcar de otro nucleótido.
• Cuando se quiere congelar ADN, no se utiliza agua.
• Entre 4 y 10 grados está bien y no pasa nada.
Enlaces Covalentes
Enlaces No Covalentes
Ácidos Nucleicos
• Son polímeros formados por nucleótidos (azúcar, base nitrogenada y grupo fosfato).
• Los nucleótidos del ADN no tienen grupo hidroxilo en el carbono 2, como el ARN.
• El ADN solo se puede unir de una manera, mientras que el ARN de muchas maneras.
• Todos los nucleótidos que entran a la cadena llegan de forma trifosfato.
Enlaces Fosfodiéster
Bases Nitrogenadas
Nucleótidos
Oligonucleótidos
• Conformación ANTI → Base nitrogenada fuera del azúcar (la normal en el ADN).
• Conformación SYN → Base nitrogenada encima del azúcar.
• En el ADN casi todos son de conformación ANTI, pero hay algunas purinas SYN.
• El ADN se puede encontrar en otras formas (A, C, Z, H…) por estas conformaciones.
• En el ARN también predomina el ANTI.
• En los telómeros tenemos moléculas de 4 hebras.
• Para adenina y citosina, la forma más común es la amino. Si se pierde el doble enlace
queda como imino, como resultado de un cambio en el pH.
• Es peligroso porque se pueden adherir grupos a las bases que distorsionan la información
genética.
• Para la guanina y la timina es más común la forma ceto, que cambia a enol cuando el
doble enlace cambia de lugar, dando origen a un grupo hidroxilo.
• Cadenas de ADN se unen mediante puentes de hidrógeno para formar una doble hélice.
• Tiene carga negativa por los grupos fosfato.
• Es ADN supraenrollado.
• A-ADN → Su giro de vuelta es dextrógiro, una vuelta mide 2,8 nm, su plano entre bases
es inclinado y tiene 11 nucleótidos por vuelta.
• B-ADN → Su giro de vuelta es dextrógiro, una vuelta mide 3,4 nm, su plano entre bases
es perpendicular y tiene 10,5 nucleótidos por vuelta.
• Z-ADN → Su giro de vuelta es levógiro, una vuelta mide 4,5 nm, su plano entre bases es
zigzag y tiene 12 nucleótidos por vuelta.
Doble Hélice
El ADN es más fuerte que el ARN porque el ARN tiene un grupo hidroxilo en el carbono 2’
de la ribosa, mientras que al ADN solo tiene un hidrógeno en ese carbono, y el hidrógeno
no es reactivo.
Genoma
Biología Molecular 2
Genoma Humano
Genoma Procariota
Familias de Genes
• Son diferentes genes que han ido evolucionando, y que hoy día tienen funciones muy
similares.
• El gen modelo para las familias de genes es el gen para las globinas, ya que existen
muchos tipos de globinas, pero todas ellas demuestran en su secuencia que provienen de
un gen ancestral.
• Se piensa que el gen ancestral sufrió un tipo de mutación, causando una división en dos
tipos de genes diferentes, con características diferentes, pero funciones semejantes.
• A su vez, uno de esos genes dio origen por división a otros 2 genes, que posteriormente
se siguieron dividiendo, originando todos los tipos de globinas que existen.
• Muchas personas tienen clases de hemoglobina diferentes, que aunque cumplan la
misma función, se asocian al oxígeno de distintas maneras.
• Esto se da porque las globinas de la hemoglobina de estos individuos no son normales
(𝛼 𝑦 𝛽). Sufrieron algún tipo de mutación.
• Los genes ribosomales también hacen parte de familias de genes.
• Los ribosomas están formados por ARN ribosomal, que está codificado en el ADN, que se
llama ADN ribosomal.
• Hay varios tipos de ARN ribosomal, pero todos cumplen la misma función: forman el
ribosoma (función estructural).
• El ARN ribosomal proviene de un gen ancestral, que se fue dividiendo.
• Los genes que codifican para proteínas histonas (H1, H2A, H2B, H3, H3A, H4) también
son una familia de genes.
• Los genes de una familia de genes suelen estar dentro del genoma uno al lado del otro.
• Las regiones en las cuales se ubican los genes con funciones similares reciben el nombre
de clusters de ADN. Por ejemplo: Cluster para las globinas tipo 𝛼 o para globinas tipo 𝛽.
• En los cromosomas, los genes de un cluster de ADN se ubican unos cerca de otros.
• Hay genes que llevaban miles de años sin expresarse, y ahora se están expresando. Esto
se puede dar como resultado de una mutación.
• La mutación puede hacer 2 cosas:
1. Dañar un gen.
2. Dañar el regulador de un gen, que lo mantiene sin expresarse.
Genes
Clusters de ADN
• Son las zonas en las que se ubican los genes con funciones similares.
• Los genes con funciones similares están localizados uno al lado del otro dentro del
genoma humano, formando un cluster de ADN.
• Estos genes en los clusters de ADN se ubican cerca de otros en los cromosomas.
Pseudogenes
ADN Satélite
• La característica del ADN satélite es que son secuencias repetidas en tándem (una al lado
de la otra). Ejemplo: AGCTAGCTAGCTAGCT.
• El ADN satélite no codifica para nada, ni proteínas ni ARN, pero determina muchas
características de las especies.
• Cada secuencia del ADN satélite puede tener hasta más de 100 pares de bases, que se
repiten n cantidad de veces.
• Está asociado a la heterocromatina, que está compacta y es la que menos se expresa.
• La heterocromatina es importante en la transcripción de ADN.
• Las regiones de ADN satélite se encuentran cercanas a los centrómeros.
• Son secuencias repetitivas que reciben su nombre por el número de pares de bases que
contienen (por su tamaño).
• Están asociados a eucromatina, que es el ADN que se expresa.
Minisatélites
Microsatélites
• La mayoría de las repeticiones del genoma humano están formadas por elementos
transponibles, también conocidos como genes saltarines.
• Para poder saltar de una posición a otra, necesitan ser cortados del genoma.
• Para poder hacer ese corte, se necesita de una enzima.
• El 45% del genoma humano está formado por elementos transponibles.
• No codifican para nada, pero cumplen varias funciones dentro del genoma.
• Estos elementos tienen la capacidad de pasar una región del cromosoma a otra región
del cromosoma, y dependen de enzimas de tipo transposasas o endonucleasas.
• Los genes saltarines provienen de virus que infectaron el genoma humano y se quedaron
insertados dentro de él.
• Existen dos tipos de elementos transponibles en humanos:
1. Transposones de ADN
2. Retrotransposones de ADN
• Dentro de aquellas que no hacen parte de las LTR, se encuentran las secuencias
SINE (short interspersed elements) y LINE (long interspersed elements).
• La secuencias más conocida es la secuencia Alu, que hace parte de las SINE.
• Las secuencias SINE son las secuencias pequeñas (100-300 pb). Hay
aproximadamente 1,500,000 copias de estas secuencias. Son el 13%.
• Las secuencias LINE son las secuencias largas (6000-8000 pb). Hay
aproximadamente 850,000 copias de estas secuencias. Son el 21%. Como son la
mayoría, se pueden utilizar para identificar individuos por su ADN.
• Las repeticiones largas en tándem (LTR) son mucho más grandes que las LINE.
Hay aproximadamente 450,000 copias de estas secuencias. Son el 8%.
Ácido Desoxirribonucleico
Topoisomerasas
• Como el ADN está supraenrollado, las secuencias están escondidas. Es necesario que
estén disponibles para que las enzimas las puedan reconocer y comenzar la replicación.
• Para comenzar el proceso, se necesita que la molécula de ADN circular supraenrollada se
desenrolle. Las enzimas encargadas de esto son las topoisomerasas (topo = superficie).
• Las topoisomerasas no son específicas. No reconocen ninguna secuencia.
• Se desplazan por la superficie de la molécula y, cada cierto tiempo, se detienen y cortan
la molécula de ADN, liberando la tensión. La zona que cortan se desenrolla.
• Cuando se desenrolla, si en esa región se encuentra la secuencia necesaria para que se
de el inicio de la replicación, el proceso comienza enseguida.
• Si no se encuentra la secuencia de inicio, la topoisomerasa se encarga de volver a sellar
la ruptura, mediante la formación de enlaces fosfodiéster. Sigue siendo una doble hélice,
pero ya no está supraenrollada, sino laxa.
• Esto permite que más adelante, puedan pasar enzimas por ahí fácilmente.
• Las topoisomerasas son de 2 tipos, dependiendo del tipo de corte que realizan:
Origen de Replicación
• La topoisomerasa necesita hacer fácil la llegada a una zona que se conoce como Ori C.
• El Ori es una secuencia de origen o inicio de la replicación. Existe un solo Ori para cada
cromosoma procariota.
• Ori C → Origen de replicación del cromosoma de E. coli.
• El Ori C de E. coli es una secuencia que tiene 245 pares de bases. Tiene repetido en
tándem una secuencia de 13 pares de bases (GATCTNTTNTTTT).
• Como tiene tanta timina, son regiones que se pueden separar fácilmente, ya que los
enlaces A-T solo tienen 2 puentes de hidrógeno.
• Los Ori son secuencias ricas en T-A (no pares).
• Los procariotas solo tienen un Ori de replicación porque el tamaño del ADN no es lo
suficientemente grande para que se necesite más de uno.
Proteína DnaA
• Las secuencias ricas en A-T son importantes porque son los sitios en los cuales se une la
proteína DnaA. El gen que codifica para esa proteína es el gen dnaA.
• La proteína DnaA es un factor de inicio de la replicación. Evita que la topoisomerasa
vuelva a unir los extremos que ha cortado, mediante la formación de enlaces
fosfodiéster. Se une a ambas hebras de la molécula de ADN.
• La proteína DnaA tiene afinidad por las regiones ricas en secuencia A-T.
• Se unen 10 moléculas de esta proteína a las secuencias. Cada una a una secuencia.
• Hay 5 en la hebra parental y 5 en la complementaria.
• Para que las helicasas se puedan subir a las hebras, necesitan la ayuda de una proteína
que se llama cargador de helicasas, conocida como proteína DnaC.
• Cuando las proteínas DnaA se están localizando sobre las secuencias A-T, la DnaC se pega
en todo el extremo de la molécula, para evitar que las proteínas DnaA tapen el extremo.
• La DnaC deja disponible en la parte superior una secuencia, que es afín a la proteína
DnaB (helicasa). La DnaB reconoce la secuencia y se pega.
• Cuando la DnaB se pega, la DnaC se quita y es degradada por la célula, y la helicasa
queda dentro de la hebra de ADN.
• La función de el cargador de helicasas es ayudar a la DnaB o helicasa a que pueda unirse
a la molécula de ADN.
Helicasa (Proteína DnaB)
Polimerasas
• ADN Polimerasa I
• ADN Polimerasa II
• ADN Polimerasa III
ADN Polimerasa I
• Consiste de solo una subunidad.
• Interviene en la reparación del ADN, corrigiendo las secciones dañadas.
• Elimina los primers de ARN en cada fragmento de Okazaki y los reemplaza con ADN.
• Son capaces de degradar polímeros de ADN o ARN al eliminar nucleótidos de la molécula,
lo que significa que tiene actividad de exonucleasa, en dirección 3’ – 5’ y 5’ – 3’.
• Todas las polimerasas de procariotas tienen actividad de exonucleasa en dirección 3’ – 5’.
• Se pega a la hebra líder con un brazo y a la hebra retrasada con el otro brazo. Es una
enzima tan grande que se pueden encontrar máximo 4 por célula.
• Es la que se encarga de hacer todo el proceso y está formada por varias subunidades.
• Está formada por 2 subunidades α, 2 subunidades ϵ, 2 subunidades θ, 2 subunidades τ y
se une a una pinza 𝛃, que mantiene la polimerasa relacionada con la plantilla de ADN.
• La ADN polimerasa III se une a una sola pinza 𝛃 en la cadena líder, pero en la cadena
retrasada, se une a una distinta por cada fragmento de Okazaki.
• Las subunidades permiten que las hebras pasen a través de ellas.
• Se encarga de sintetizar la cadena líder y la cadena retrasada.
• En la cadena retrasada, además de la ADN polimerasa III, funciona la ADN polimerasa I.
Replicación
Pasos de la Replicación
Orígenes de Replicación
1. Cadena Líder
2. Cadena Retrasada
• Antes de colocar cada nucleótido, las polimerasas siempre se regresan y revisan que
hayan colocado el anterior de manera correcta.
• Esto ayuda a prevenir las mutaciones en la replicación del ADN.
• Cuando la mujer concibe bajo la influencia del alcohol, las polimerasas en el ADN que se
empieza a sintetizar no se regresan a revisar los nucleótidos.
• Los sistemas de reparación en adultos son muy avanzados, pero un cigoto que se está
formando todavía no tiene los sistemas de reparación activados.
• En eucariotas se utilizan dos enzimas. En procariotas solamente existe una.
• Las eucariotas tienen una enzima para la cadena líder y una enzima para la retrasada.
• Las polimerasas de la replicación son ADN polimerasas ADN dependientes.
• Todas las polimerasas de eucariotas y procariotas son ADN dependientes. Los virus son
los únicos con enzimas ARN dependientes.
• El primer siempre va a ser de ARN, a menos que sea in vitro (ADN).
• El primer es importante porque las enzimas de la replicación (ADN polimerasas) no
pueden colocar el primer nucleótido.
• Las polimerasas son enzimas muy grandes, por lo que se pueden despegar fácilmente del
ADN. Para que esto no ocurra, existen cargadores que las meten por la hebra de ADN.
• La polimerasa que trabaja sobre la hebra retrasada no puede ser la misma que trabaja
sobre la hebra líder, por lo que se utilizan dos enzimas diferentes.
Polimerasas
Proteínas RPA
Telómeros
Telomerasa
• La célula ha creado un mecanismo para recuperar parte del telómero, y así mantener el
funcionamiento de la célula por más tiempo.
• Esto se hace a través de una enzima que recibe el nombre de telomerasa.
• Las telomerasas son ADN polimerasas. Son capaces de sintetizar ADN teniendo moldes
de ARN, o lo contrario.
• Las telomerasas alargan nuevamente los telómeros, pero no se recupera toda la región
telomérica. Se recupera parte de la región que se había perdido.
• En los extremos de los cromosomas, queda un brazo sobresaliente. Cuando se estaba
sintetizando complementario al molde, ahí había una molécula de ARN, pero las células
no pueden tener ARN y ADN dentro de una molécula.
• Por lo tanto, el primer de ARN se degrada y queda dentro de la célula una parte de ADN
sobresaliente. Esto es peligroso para la célula.
• En la célula hay exonucleasas. Las exonucleasas degradan las hebras de ADN o ARN. En
cada ciclo de replicación, se perdería gran parte del ADN.
• Para que esto no ocurra, el ARN de la telomerasa forma una estructura en forma de
bucle, a través de la cual se une al extremo 3’ del ADN.
• La telomerasa tiene afinidad por una molécula de ARN. Viene unida con ella. Esta
molécula de ARN es idéntica a la secuencia repetida en tándem que tiene el telómero.
• Esto deja un extremo libre para que la propia telomerasa se una y comience a copiar
complementario al molde, para rellenar el espacio que hace falta.
• De esta manera, el telómero se acorta, pero mucho menos que si no existiera el proceso.
• Cuando las células dejan de producir telomerasa, tienen los telómeros acortados.
Transcripción en Bacterias
• Las bacterias solo tienen una enzima para la transcripción. Se llama ARN polimerasa.
• En las bacterias, la ARN polimerasa es una enzima que tiene 5 subunidades. Por esta
razón, la ARN polimerasa de las bacterias es la más sencilla.
• Tiene 2 subunidades idénticas α, una subunidad β, una subunidad β’ y una subunidad ω.
• Las subunidades β y β’ se encargan de hidrolizar ATP y permitir el movimiento de la
enzima por la hebra de ADN.
• Las otras se encargan de acoplar el proceso para sintetizar las nuevas moléculas.
• Tienen 4 factores de transcripción, que son proteínas. El sigma es el encargado de regular
el inicio de la transcripción. El rho es el encargado de regular la finalización del proceso.
Arqueobacterias
Eucariotas
• Tienen ARN polimerasa I, ARN polimerasa II, ARN polimerasa III, ARN polimerasa IV y
ARN polimerasa V. La IV y la V son solo para plantas.
• Las ARN polimerasas tienen el mismo número de subunidades, pero son diferentes.
• Las 5 ARN polimerasas tienen 5 subunidades en común.
Etapas de la Transcripción
• Pre-inicio
• Inicio
• Alargamiento o Elongación
• Terminación
Transcripción en Procariotas
Genes
• En el proceso de transcripción se transcriben genes. Un gen debe tener mínimo 1000 pb.
• Existen solamente 2 tipos de genes, y son los únicos que se pueden transcribir.
• Los genes pueden codificar para ARN (genes ribosomales) o pueden codificar para
proteínas. No existe ningún gen que codifique para otra cosa.
• La transcripción de los genes que codifican para proteínas da como resultado la
producción de un ARN mensajero.
• La transcripción de los genes ribosomales dan origen al ARN ribosomal. Los ARN de
transferencia están incluidos dentro de los ribosomales.
• Los ARN de transferencia se encuentran en clusters, y algunos de ellos están unidos a
ARN ribosomal.
• Para que se lleve a cabo el proceso de transcripción, deben ser identificados los genes
que se van a utilizar en el proceso.
• Para poder localizar un gen, hay que tener en cuenta 2 regiones:
1. Zona Promotora
• Es una secuencia de ADN que no se transcribe, solo regula la expresión del gen.
• Ningún ARN tiene la secuencia promotora.
• La función del promotor es regular el proceso de transcripción y la expresión del
gen, indicándole a la enzima dónde debe empezar la síntesis de ARN.
• Expresar un gen implica que la información que está en el ADN sea transcrita a
ARN, y este ARN se traduzca en una proteína.
• El promotor puede permitir que se de la transcripción del gen o bloquearla.
• Esto lo logra a través de las enzimas o proteínas que se asocian con él.
• La zona promotora tiene 2 regiones consenso. Son comunes entre todos los
promotores procariotas.
• Casi todos los procariotas tienen las zonas consenso en -10 y en -35.
• Se piensa que la zona promotora se encuentra corriente arriba del gen.
• Existen hipótesis que dicen que existen promotores en regiones diferentes a la
región 5’ del gen. Aún no está comprobado.
• Corriente arriba → En dirección 5’.
• Corriente abajo → En dirección 3’.
• Los promotores se representan con una flecha hacia arriba y hacia un lado. La
flecha indica hacia donde está el gen.
• En los procariotas, entre una región promotora y una región terminadora, se
puede encontrar más de un gen. Un promotor puede regular varios genes.
• El ADN en procariotas es muy pequeño para tener tantos promotores, y los
genes con un mismo promotor y terminador sirven en la misma ruta metabólica.
• Gastan menos energía en sintetizar enzimas porque las sintetizan al tiempo, con
una sola ARN polimerasa, que sintetiza todos los ARN mensajeros.
• En los eucariotas, entre una región promotora y una región terminadora, solo se
puede encontrar un gen. Cada gen está regulado por su propio promotor y su
propio terminador.
2. Zona Terminadora
Cadena Codificante
Cadena Molde
• Es la cadena que realmente usa la enzima como molde para sintetizar el ARN mensajero.
• Es la cadena complementaria a la cadena codificante.
ARN Polimerasa
Transcripción en Procariotas
Inicio de la Transcripción
• La subunidad sigma le indica a la ARN polimerasa el sitio donde está el promotor, que es
el lugar donde se debe unir la enzima.
• La superficie de la subunidad sigma es muy afín a la ARN polimerasa.
• La ARN polimerasa, se pega a la sigma, y juntas empiezan a desplazarse por toda la
cadena molde de ADN hasta localizar el punto +1, donde empiezan a copiar el ARN.
• La molécula de ADN está supraenrollada. Cuando se desenrolla el primer giro, el proceso
es complejo. En la transcripción no existen helicasas ni topoisomerasas.
• La ARN polimerasa separa la zona donde está el punto +1 y va a empezar a copiar
complementario al molde.
• Se va a llevar a cabo una síntesis completa de ARN, pero si durante el proceso logran
desarrollar menos de un giro (menos de 10 nucleótidos) y se detiene el proceso, se llama
transcripción abortiva.
• En la mitad del giro no hay surcos, y la subunidad sigma se desprende del complejo. Al
desprenderse, desprende la ARN polimerasa y se acaba el proceso.
• El pedazo de ARN que lograron sintetizar es degradado por la célula.
• Normalmente, ocurren entre 9 y 10 transcripciones abortivas antes de que se de una
transcripción normal.
• Si logra pasar el primer giro de vuelta, va a terminarse el proceso. Para que se de una
transcripción exitosa, se deben colocar por lo menos 10 nucleótidos.
• Apenas pasa el primer giro de vuelta, la subunidad sigma se desprende del complejo y
quedan solamente las dos α, ϖ, la β y la β’ de la ARN polimerasa haciendo el proceso.
• La subunidad sigma solamente trabaja durante el inicio del proceso de la transcripción.
Elongación o Alargamiento
Terminación
• La ARN polimerasa se encuentra con la secuencia terminadora.
• En la secuencia terminadora, hay muchos pares A-T.
• La ARN polimerasa casi nunca atiende la señal de terminación. A pesar de que haya un
pare, la enzima continúa el proceso.
• Debido a que el proceso es sumamente regulado e importante, existen otros
mecanismos para detener el proceso. Se basan en estructuras secundarias.
• Una de las formas de terminar la síntesis de ARN es mediante la formación de estructuras
secundarias de ARN, que se llaman tallos y bucles.
• Corriente abajo del terminador en los ARN, en el extremo 3’ del ARN, existe una
secuencia palíndroma en tándem, repetida n cantidad de veces.
• Estas secuencias repetidas en tándem no codifican para nada.
• Entre secuencias, se van a encontrar varios nucleótidos diferentes.
• Una secuencia palíndroma se da cuando al leerla en dirección 5’ – 3’, es igual que al leer
su secuencia complementaria en dirección 5’ – 3’.
• Cuando una secuencia es palíndroma, entre nucleótidos de una misma hebra se pueden
formar puentes de hidrógeno, dando origen a tallos y bucles.
• Cuando la ARN polimerasa no pone atención a la secuencia de terminación, sigue
copiando información, pero lo que se está generando es complementario entre sí.
• Se forman enlaces puentes de hidrógeno y se originan las estructuras secundarias, que
interfieren con el desplazamiento de la enzima.
• Al hacer ese tipo de interferencia, la enzima no puede continuar, por lo que se detiene y
se desprende el ARN del complejo ARN-ADN.
• Otra forma de terminar el proceso de transcripción es la terminación por acción de la
proteína rho, que es una proteína grande, formada por 6 subunidades.
• La proteína rho es muy afín al ARN, específicamente a la secuencia que se encuentra en
el extremo 5’ del ARN (Shine-Dalgarno).
• Si la célula tiene la proteína rho sintetizada previamente, ese será el mecanismo que se
va a utilizar para la terminación del proceso de transcripción.
• La proteína rho se monta al extremo 5’ de la molécula de ARN en la fase de elongación y
se desplaza a través del ARN por hidrólisis de ATP.
• Llega un momento en el que debido al peso que tiene rho, se acerca tanto al complejo de
transcripción que desprende el ARN que se está sintetizando.
• Cuando lo desprende, se acaba el proceso de síntesis.
• La proteína rho se va a unir al ARN y va a permitir que el ARN se desprenda del complejo
híbrido ADN-ARN.
• Si el ARN no se sintetiza completamente, no va a llegar al ribosoma.
Procesamiento de la Transcripción
• Antes de llegar al ribosoma, el ARN pasa por otros estadíos. Por lo tanto, si el ARN no
está completo no va a haber síntesis de proteínas.
• La célula degrada el ARN no funcional antes de llegar al ribosoma. Utiliza los
ribonucleótidos para sintetizar otro tipo de ARN.
Pasos de la Transcripción en Procariotas
Fase de Iniciación
1. La subunidad sigma localiza las zonas consenso (-10 y -35) en el promotor y le indica el
sitio a la ARN polimerasa.
2. La ARN polimerasa se pega a la subunidad sigma y juntas se desplazan hasta el sitio de
inicio de la transcripción (TSS), que se encuentra en la posición +1.
3. La ARN polimerasa separa la zona del TSS, que se encontraba enrollada, y a partir de
ahí empieza a sintetizar el ARN complementario a la cadena molde, junto con la
subunidad sigma, en dirección 5’ – 3’.
4. Si no logran colocar más de 10 nucleótidos (un giro de vuelta), el proceso se detiene y el
fragmento de ARN se degrada. Esto se conoce como transcripción abortiva.
5. Si logran colocar más de 10 nucleótidos, en el instante en que terminan de sintetizar el
ARN para el primer giro de vuelta, la subunidad sigma se desprende y queda la ARN
polimerasa sola para terminar el proceso.
Fase de Elongación
Fase de Terminación
Forma 1
Forma 2
Forma 3
• El primer modelo que explica cómo los procariotas regulan la expresión de sus genes es
el operón lac (operón lactosa). El gen se llama lac.
• Solamente en procariotas, existe una estructura genómica que se llama operón.
• Operón → Es un componente del genoma procariota. Está representado por un
promotor, más de un gen y un terminador.
• Los eucariotas solo tienen un gen entre promotor y terminador.
• En bacterias, existen dos tipos de regulación:
Operón Inducible
• El operón lac es un operón inducible. Esto significa que existe una molécula que induce o
que hace posible que se de el proceso.
• Los genes que se encuentran codificados en el operón se van a expresar solamente si esa
molécula induce su expresión.
• El operón lac fue creado por Jacob y Monod.
• La lactosa es la molécula que induce a los genes del operón lac.
• Si la bacteria no está en un medio donde hay lactosa, no sintetiza las enzimas que le
permiten degradar lactosa.
• Si la bacteria está en un medio donde hay lactosa, inmediatamente empieza a sintetizar
las enzimas que le permiten utilizar la lactosa.
• El operador se encuentra entre el promotor y los genes, y es el segundo regulador,
además del promotor.
• Al igual que el promotor, el operador es una secuencia que no codifica para nada, pero
que regula la expresión de un gen.
• El operador sirve como sitio de unión de los represores y de los inductores, que son
proteínas. De esta manera, regulan la expresión de los genes.
• Los genes que se encuentran en el operón lac codifican para tres proteínas distintas, que
son la 𝛃-galactosidasa, una permeasa (proteína transportadora) y una transacetilasa.
• Las 3 proteínas se encargan de dos cosas:
• Cuando la célula está en un medio en el que hay lactosa, debe sintetizar las enzimas, ya
que necesita de ellas para utilizar la lactosa.
• La permeasa es necesaria para introducir la lactosa al interior de la bacteria.
• La transacetilasa trabaja en un proceso de cambio de conformación de la lactosa cuando
está en el interior de la bacteria.
• La 𝛃-galactosidasa va a permitir la degradación de la lactosa a glucosa y galactosa para
que los monosacáridos estén disponibles, y la célula pueda hacer procesos internos con
el fin de obtener energía.
• Corriente arriba del promotor, bien lejano del promotor, se encuentra el represor lac.
• El represor lac o gen lacIq es un gen que codifica para una proteína represora.
• Cuando no hay lactosa en el medio, el represor lac es codificado como si fuera un gen
normal, iniciado por la subunidad 𝛔70.
• Como no hay lactosa, es normal que los genes del operón lac no se expresen.
• Para que no se expresen, el represor lac debe estar expresado.
• El represor lac se codifica para producir el represor, que es una proteína que se tiene la
capacidad de unirse al operador.
• Cuando el represor se une al operador, la subunidad 𝛔70 no se puede unir al promotor y
por lo tanto, la ARN polimerasa no puede transcribir la información que tienen los genes.
• El represor bloquea la expresión de los genes en el operón lac porque está viviendo en
un medio donde no hay lactosa.
• En ausencia de lactosa, el represor se une al operador y bloquea la expresión genómica.
• Cuando hay lactosa en el medio, la bacteria necesita sintetizar las proteínas que le van a
permitir introducir la lactosa para utilizarla como fuente de energía.
• La lactosa que está en el medio es utilizada para inducir la expresión de los genes. Se une
covalentemente al represor y lo bloquea para que no pueda unirse al operador.
• Si el represor no se puede unir al operador, la ARN polimerasa y la subunidad 𝛔70 se
pueden unir al promotor y se pueden expresar los genes.
• La expresión de los genes da como producto las proteínas que permiten introducir la
lactosa al interior de la célula.
• En presencia de lactosa, la lactosa se une al represor, bloqueándolo, y al estar bloqueado
no se puede unir al operador. La ARN polimerasa puede expresar los genes.
Operón Represible
Transcripción en Eucariotas
ARN Polimerasas
• Solamente la unión de los exones va a producir un ARN mensajero estable, que al final
va a ser traducido en una proteína.
• Los intrones no codifican para nada, pero en algunos casos regulan el proceso.
• Cuando se da el proceso de splicing (corte y empalme), el ARN actúa como si fuera una
enzima, que se conoce como ribozima.
• Sin necesidad de ninguna proteína, la ribozima es capaz de catalizar la escisión de esos
fragmentos de ARN (intrones).
Transcripción en Eucariotas
• Cuando se da el proceso de transcripción, se copia en la misma dirección que en los
procariotas, de 5’ a 3’.
• Hay una cadena codificante y una cadena molde. Se produce ARN mensajero.
• En los organismos eucariotas, no existe la secuencia Shine-Dalgarno.
• Después de sintetizar el ARN, se da un proceso adicional que se llama adición de la
estructura cap.
• La estructura cap es la adición de unas guaninas en el extremo 5’ del ARN mensajero que
se acaba de sintetizar.
• A diferencia de las uniones normales, la estructura cap no va en dirección 5’ – 3’, sino en
dirección 5’ – 5’.
• En el extremo 5’ del ARN, se va a unir otro extremo 5’. Esto hace que la estructura
adquiera una forma de gancho.
• Cuando el ARN recibe la estructura cap, inmediatamente se pliega formando un gancho.
• En la subunidad menor del ribosoma, hay un canal. El cap en forma de gancho permite
que el ARN mensajero se enganche en el ribosoma para evitar salirse.
• Cuando el ARN recibe el cap y la cola poli-A, viene a darse el proceso de corte y empalme.
• En este proceso, se cortan los intrones y se pegan los exones, dando como resultado un
ARN mensajero maduro que puede llegar al ribosoma.
• El ARN mensajero viaja al citoplasma para que se lleve a cabo la síntesis de la proteína en
los ribosomas.
• En el caso de la ARN polimerasa II, que es para los ARNm, funciona como la secuencia de
terminación en procariotas. Hay una secuencia que se encuentra corriente abajo de la
cola poli-A que permite que ahí se termine el proceso.
• En el caso de la ARN polimerasa I, que es para los ARNr, termina la transcripción
mediante la unión de una proteína de terminación, que se une al ADN y disocia el
complejo ADN-ARN.
• En el caso de la ARN polimerasa III, que es para los ARNt, forma una secuencia de poly-U
que induce la separación del complejo ADN-ARN.
• Hay varios obstáculos que ayudan a regular la transcripción y están relacionados con la
presencia de los nucleosomas (ADN y proteínas histonas).
• Es un tipo de enrollamiento que también dificulta encontrar la región promotora.
• Participan varias proteínas que se pueden unir a la polimerasa para regular el proceso.
• La regulación en los eucariotas viene dada por el tipo de genes.
• Hay una región promotora. Tanto en procariotas como en eucariotas, existe una zona
consenso, similar en cuanto a secuencias.
• Los eucariotas no tienen región -35. Tienen una región a -60, que también tienen los
procariotas, que se conoce como UAS.
• Corriente abajo del promotor, se encuentra el sitio de inicio de la transcripción.
• No se conoce realmente cómo se regulan los genes, pero hay modelos.
• Las proteínas de cada tipo son diferentes porque los genes que regulan son genes
diferentes. El ser humano es multicelular y tiene tejidos. Debe haber proteínas que
regulen la expresión de genes específicos de un tejido.
• Los modelos de regulación de los genes de mantenimiento celular y de los genes de
tejido específico son muy similares. Comparten ciertas proteínas.
• La regulación de los genes de replicación es completamente diferente.
• En el caso de tejidos que deben cumplir una función específica, van a existir un tipo de
proteínas específicas que van a ayudar o bloquear el proceso de síntesis.
• Si estamos hablando de genes específicos de un tejido, vamos a encontrar:
1. La TATA box. Aquí se van a unir varias proteínas, la mayoría factores de transcripción
(TF). Los números al lado de TF indican con qué ARN polimerasa funcionan.
2. Es importante un enhancer, al cual se van a unir proteínas específicas de ese tejido.
Es el caso de las hormonas, que solo actúan sobre un tejido específico porque es la
secuencia a la cual se pueden unir.
• Los genes que codifican para proteínas que funcionan en el proceso de replicación y
regulación del ciclo celular tienen una manera específica de hacer la regulación.
• Las proteínas que actúan ahí nada mas funcionan para los genes que están implicados en
la replicación del ADN.
• Cuando estas proteínas que regulan la replicación y el ciclo celular no se están
produciendo por alguna mutación, la replicación no es regulada y se da el cáncer.
• La mutación puede alterar las secuencias de regulación del ADN a las cuales se deben
unir las proteínas o alterar la secuencia en la que se producen estas proteínas.
• Por lo tanto, la regulación del proceso de replicación es completamente diferente de la
regulación que se hace para el resto de genes que mantienen un organismo.
Proteína TBP
• La proteína TBP (TATA Binding Protein) hace la función del sigma procariota en
eucariotas. Se une al TATA box.
• Se encuentra en los genes de mantenimiento celular y en los genes de tejido específico.
• En los genes de la replicación, no trabaja la TBP, pero sí una proteína muy semejante que
recibe el nombre de DREF.
Elementos de Respuesta
Traducción
Ribosomas
Ribosomas de Eucariotas
ARN Mensajero
Código Genético
ARN de Transferencia
Pasos de la Traducción
Etapas de la Traducción
Etapa de Iniciación
Elongación
Terminación
Trafico Intracelular
• Las proteínas recién sintetizadas son inmaduras. No pueden cumplir ninguna función.
• Después de que las proteínas son sintetizadas, deben sufrir unas modificaciones para
obtener funcionalidad. La mayoría de las modificaciones son químicas.
• Casi todas las proteínas eucariotas (más del 80%) sufren modificaciones.
Intein Splicing
Secuencias Consenso
Tipos de Modificaciones
• Se da principalmente en humanos.
• Cuando la proteína llega al sitio donde va a cumplir su función, pierde la secuencia señal
por proteólisis.
Proteólisis Intramolecular
Preproinsulina
Glicosilación
Translocación al RER
• Las proteínas recién sintetizadas deben ubicarse en el sitio donde van a hacer su función.
• Deben ser guiadas hacia estos sitios por sus péptidos señales.
• Pueden ingresar al retículo endoplasmático, que las envían, cubiertas de una vesícula
membranosa, afuera de la célula o a otros organelos membranosos.
• Sin importar el tipo de transporte que realice la proteína, siempre va a estar mediado por
un péptido señal.
Proceso de Translocación
2. Las partículas SRP están libres en el citosol. En el momento en el que se está sintetizando
la proteína, la SRP, a través de la P54, se une al péptido señal.
4. El receptor SRP se desplaza hacia una proteína de canal. La interacción entre el receptor
SRP y la proteína de canal causa que se abra el canal. Las proteínas del canal son la Sec61
y la TRAM.
6. La proteína ingresa por el extremo N, donde está el péptido señal. Unas proteasas se
encargan de cortar y degradar el péptido señal.
4. Las proteínas cargo van a transportar a la proteína al sitio en el cual van a realizar su
función. Las llevan desde el lumen a las regiones más cercanas al aparato de Golgi
5. En el RER forman vesículas, se desprenden del RE y el aparato de Golgi las envía a los
lisosomas (proteínas anómalas) o al exterior de la célula para cumplir su función.
Complejo TAT
Tipos de Proteínas
• Tipo I → Las proteínas a nivel de membrana tienen el grupo carboxilo hacia la parte
externa (citosol) y el grupo amino hacia la parte interna (retículo endoplasmático) .
• Tipo II → Pueden tener el grupo amino hacia el citosol y el grupo carboxilo hacia el RE.
• Tipo III → El plegamiento o la parte compleja de la proteína está hacia el citosol.
• Tipo IV → Forman estructuras complejas a través de la membrana. La mayoría de
proteínas de canal son de este tipo.
Glicosilación en el RER
Proteínas Maduras
Polímeros
• Las proteínas son polímeros constituidos por aminoácidos proteicos.
• El polímero común en las proteínas tiene la estructura #3. Son heteropolímeros.
• Heteropolímeros → Están compuestas de monómeros diferentes que se encuentran al
azar a lo largo de toda la cadena.
Aminoácidos
No Polares
Aromáticos
Carga Positiva
Carga Negativa
Las proteínas de medios acuosos sacan hacia el exterior los grupos cargados para que
puedan interaccionar con el medio y esconden hacia el interior los grupos sin carga.
Cambian su estructura dependiendo del medio en el cual se encuentren.
Los aminoácidos se representan con una sola letra.
Enlaces Peptídicos
• Los aminoácidos se unen por enlaces peptídicos, donde se unen el grupo carboxilo de un
aminoácido y el grupo amino de otro aminoácido.
• Para que se de la formación del enlace peptídico, se desprende agua.
Niveles Estructurales
Estructura Primaria
Estructura Secundaria
Estructura Terciaria
• Es la unión de varias hélices alfa, varias hojas plegadas beta o de hélices alfa y hojas
plegadas beta.
• Indica la forma de la proteína en el medio.
• Ya es una proteína funcional.
Estructura Cuaternaria
Enlaces Covalentes
• Puentes Disulfuro → Enlace entre 2 residuos de cisteína. Une las cadenas polipeptídicas
para formar la estructura cuaternaria de una sola proteína. Es un enlace fuerte.
• Enlaces Amida → Es el enlace peptídico entre un carboxilo y un amino de aminoácidos.
Es covalente y planar, por lo que es fuerte y no puede rotar. Le da maleabilidad. Son
responsables de formar la estructura primaria de las proteínas, por lo que es la más difícil
de destruir. Se necesita hacer una hidrólisis a ebullición.
Enlaces No Covalentes
Dominios o Motivos
• El motivo HTH (hélice, giro, hélice) en una proteína indica que la proteína interacciona
con el ADN.
• El motivo de hélices arrolladas o zipper de leucina funciona como una tijera. Las
proteínas con este motivo también interaccionan con el ADN.
• Otro motivo que indica interacción con el ADN es la mano EF. Necesita iones de calcio
para poder estabilizar la estructura.
Funciones
• Las proteínas son necesarias para la vida. Todas las patologías se basan en proteínas.
• Están relacionadas con todos los procesos vitales al interior de la célula.
• Enzimas digestivas → Amilasa, lipasa, pepsina, tripsina. Convierten las moléculas
complejas en monómeros durante la digestión.
• Transporte → Hemoglobina y albumina. Transportan sustancias por el cuerpo, utilizando
la sangre o linfa como canal.
• Estructurales → Actina, tubulina y queratina. Son componentes de soporte.
• Hormonas → Insulina y tiroxina. Coordinan la actividad entre los sistemas en el humano.
• Defensa → Inmunoglobulinas. Protegen al cuerpo de patógenos.
• Contráctiles → Actina y miosina. Funcionan en la contracción muscular.
• Almacenamiento → Proteínas vegetales (fríjoles), albumina. Proveen alimento al
embrión en las primeras etapas y a las semillas.
Priones
Historia
• En los años 70, se encontraron individuos en una misma familia con ataxia (movimientos
descontrolados), temblor y muerte en cuestión de meses.
• Lo denominaron “virus lento” porque las personas se enfermaban y aparecían los
síntomas después de muchos años (15-20).
• Se encontró la enfermedad en los indígenas Fore de Nueva Guinea.
• Los indígenas la denominaron Kuru, que significa “temblor”. Fue una epidemia.
• Daniel Carleton Gadjusek hizo las observaciones en Nueva Guinea. Vio que comían el
cerebro de los guerreros caídos de otras tribus y que se enfermaban primero las mujeres,
ya que eran las primeras que comían, seguidas de los niños y de los hombres.
• La tribu Fore se extinguió por el Kuru.
• En 1980, Gran Bretaña era productor de carne. Se desató una pandemia de la
enfermedad de las vacas locas. Las vacas y las ovejas sufrían temblores y morían.
• Bloquearon la carne de Gran Bretaña y sacrificaron todo el ganado.
• La causa era que alimentaban a las vacas y ovejas con restos concentrados de las mismas
vacas y ovejas que sacrificaban.
• Stanley Prusiner descubrió que en los individuos con Kuru, las proteínas priones eran
proteínas anormales.
Proteína Prion
• El gen PRNP codifica para la proteína prion (PrP). Se encuentra ubicado en el brazo corto
del cromosoma 20 y está compuesto de 2 o 3 exones (depende de la especie).
• El gen se expresa en un marco de lectura simple. Hay un promotor, un primer nucleótido
y un terminador. La zona promotora es rica en guanidinas.
• La proteína prion humana contiene aproximadamente 250 aminoácidos y es semejante a
la de otros mamíferos. Es una proteína pequeña.
• Es una sialoglicoproteína, que significa que está unida a ácido siálico y a un glucósido y
tiene un peso molecular de 33-35 KD.
• Se encuentra anclada a la membrana plasmática a través de una glicoproteína de
fosfatidil inositol (GPI) ligada a su extremo carboxilo terminal. El amino está libre.
• Las 2 formas de la proteína (normal y anormal) son transcritas desde el mismo gen.
• Las modificaciones ligadas a la enfermedad ocurren a nivel post-transcripcional.
• La estructura del gen y la secuencia de la proteína han sido altamente conservadas.
• Diversas mutaciones del gen PRNP son responsables de las EET en humanos:
Nomenclatura
• La proteína prion normal se representa como PrPc (proteína prion celular) o PrPsen
(proteína prion sensible), ya que las proteínas normales son sensibles a la destrucción
por calor, ácidos y proteasas. Es la forma constitutiva del gen PRPN.
• No se conoce la función de la proteína, pero se cree que está relacionada con las
funciones sinápticas de la neurona.
• La forma anómala se representa como PrPsc (proteína prion scrapie) o PrPres (proteína
prion resistente), ya que es altamente resistente a calor, ácidos, proteasas y a la
proteólisis con proteinasa K. Se encuentra en los tejidos de pacientes con EET.
• Como es resistente a ácido, no le pasa nada en el estómago. Se absorbe, pasa al torrente
sanguíneo como proteína prion anormal, se pega a una proteína normal y le cambia la
forma, convirtiéndola en anómala.
Naturaleza de la Proteína
• La PrPc tiene más hélices alfa (4, 40%) que hojas plegadas beta (2, 3%).
• La PrPsc tiene más hojas plegadas beta (43%) que hélices alfa (2, 34%).
• La infección tiene un largo periodo de incubación y es resistente a las radiaciones
ionizantes y ultravioletas que destruyen los virus y ácidos nucleicos.
• Cuando se apilan las proteínas priones anómalas en la membrana, forman estructuras
con espacios amiloides, que hacen que no se transmita bien el impulso nervioso.
• Cuando se apilan las proteínas priones normales, no dejan ningún espacio. Forman
estructuras compactas.
• Las proteínas anormales hacen que las normales se plieguen de manera incorrecta.
Generalidades de la Proteína Prion
Formas de Infección
Hemoglobinopatías
Hemoglobina
Hemoglobina en Humanos
Hemoglobinas Embrionarias
• Hb Gower 1 → 2𝜁2𝜀
• Hb Gower 2 → 2𝛼2𝜀
• Hb de Portland → 2𝜁2𝛽
• Tienen mucho que ver con las características poblacionales.
Hemoglobinas Fetales
• HbF → 2𝛼2𝛾
• HbA1 → 2𝛼2𝛽
• HbA2 → 2𝛼2𝛿
• Los genes que codifican para 𝛼 y 𝜁 son muy similares. Provienen del mismo gen ancestral.
• Los 𝜀, los 𝛾 y los 𝛿 son similares a los 𝛽. Codifican para el mismo tipo de polipéptido.
• Cuando el 𝛼 o el 𝛽 no se pueden expresar en adultos, los suple uno de los parecidos,
pero el individuo va a tener una hemoglobinopatía, ya que no es normal.
• Si el adulto tiene una globina anormal, puede tener problemas de afinidad por el O2, pero
no tiene consecuencias severas. Causa agotamiento y cansancio.
Globinas
Globinas 𝛂
• Existen 4 genes para globinas 𝛼, localizados en el cromosoma 16, al igual que los 𝜁.
• Como hay 2 cromosomas 16, va a haber 2 en uno y 2 en otro.
• Poseen 142 aminoácidos.
• Se encuentran en la HbA1, HbA2, HbF y Gower 2.
• Las mayoría de las mutaciones en los genes de las globinas 𝛼 producen talasemia
(deleción o ausencia del gen que codifica para la globina).
Globinas 𝛃
• Existen 2 genes que codifican para globinas 𝛽, localizados en el brazo corto del
cromosoma 11, al igual que los 𝜀, los 𝛾 y los 𝛿.
• Poseen 147 aminoácidos.
• Se encuentran en la HbA1 y Portland.
• Las mutaciones en los genes de las globinas 𝛽 también producen talasemia y
hemoglobinas anormales, que en la mayoría de los casos no alteran la salud.
• Las hemoglobinas anormales son más letales en los genes para globinas 𝛽 porque solo
hay un gen por cromosoma 11.
Familias de Genes
• Existió un gen ancestral para globinas. Hubo una inserción o mutación a nivel del gen,
originando 2 tipos de globinas diferentes (𝛼 y 𝛽), que a su vez sufrieron modificaciones,
originando todos los tipos de genes que codifican para globinas.
• Cuando hay un grupo de genes en un cluster que codifican para proteínas con una misma
función, reciben el nombre de familias de genes.
• Hay una familia de genes para globinas 𝛼 y otra familia de genes para globinas 𝛽.
Hemoglobina S (HbS)
Hemoglobina C (HbC)
Hemoglobina E (HbE)
Talasemias
Resumen
Introducción
• Algunos agentes inhiben la síntesis del ADN teniendo como blanco enzimas o complejos
ADN-proteína requeridos para la replicación.
• Los antifolatos (metotrexato), fluoropirimidinas (5-fluorouracilo), gemcitabina y
análogos de adenosina bloquean el metabolismo de los nucleótidos, causando así RDCs.
• Los inhibidores de topoisomerasas también bloquean la replicación y la transcripción.
• Evitan que se vuelvan a ligar los extremos después de los cortes del ADN. Causan RDCs y
se usan en el tratamiento de cáncer de pulmón de células pequeñas y de ovarios.
• Antraciclinas → Inhibidores de la topoisomerasa II.
• Camptotecina → Inhibidores de la topoisomerasa I.
• Los agentes alquilantes son la forma de quimioterapia más prescrita en adultos y niños,
en combinación con antraciclinas y esteroides.
• Incluyen la ciclofosfamida, la ifosfamida, el melfalán, el clorambuzil y la descarbizina.
• La temozolida (agente alquilante) cambió la práctica en el tratamiento de gliomas.
• Se combina con pseudosustratos para la O-6-metilguanina-ADN-metiltransferasa
(MGMT), que remueve alquilaciones sobre la posición O6 de la guanina en la vía de
reparación. Estos pseudosustratos no permiten que esto pase y así no se repara el ADN.
• Los compuestos con mejores expectativas son la O6-benzilguanina y lomeguatrib,
también conocido como O6-(4-bromotenil) guanina o PaTrin-2. Son pseudosustratos.
• La resistencia a agentes alquilantes O6 puede ser revertida eliminando la MGMT.
• En un ensayo clínico con O6-benzilguanina en fase I, se determinó la dosis máxima
tolerada de temozolida, así como la dosis efectiva para eliminar la MGMT.
• También se demostró que la mezcla de O6-benzilguanina y lomeguatrib causa
mielosupresión significativa, por lo que se debe reducir la dosis de agentes alquilantes.
• Se está probando la combinación de temozolida con inhibidores de la poli(ADP-ribosa)
polimerasa I (PARP1), que repara el ADN por la vía BER.
• Las lesiones causadas por la temozolida son reparadas por la vía BER. Por esto se inhibe.
• Los inhibidores de la PARP1 son GPI-21016, INO-1001 y AG-014699.
Radiosensibilizadores
• Los inhibidores de la reparación del ADN son tóxicos para las células cancerosas y no
tienen tantos efectos adversos en el paciente. Inhiben la proliferación del cáncer.
• Se usan inhibidores de PARP para tratar pacientes con cáncer de mama y ovarios por
deficiencias en los genes BRCA1 o BRCA2.
• Las células con mutaciones de BRCA1 y BRCA2 tienen defectos en la vía RH. Son más
sensibles a los inhibidores de PARP que las células heterocigotas o silvestres.
• Los inhibidores de PARP inducen RCSs, que pueden convertirse en RDCs.
• Estos serían reparados por la vía RH, pero la vía está bloqueada en células cancerosas
deficientes en BRCA1 o BRCA2. Por esto, son sensibles a los inhibidores de PARP.
• Se ha utilizado el inhibidor de PARP AZD2281 en pacientes con cáncer de mama y ovarios
por mutaciones en los genes BRCA1 o BRCA2.
• Se utiliza el inhibidor del PARP1 AG014699 en pacientes con cáncer de mama y ovarios
avanzado o metastásico por mutaciones en los genes BRCA1 o BRCA2.
• No todos los pacientes responden a estos inhibidores como monoterapia.
• Las células defectuosas en proteínas relacionadas con recombinación son muy sensibles a
la inhibición de reparación del ADN.
• El bloqueo del punto de control en la fase G2 del ciclo celular potencia el efecto de
compuestos que dañan el ADN.
• La cafeína inhibe a la ATM y a la ATR, proteínas fundamentales en la respuesta a RDCs.
• Causa que las células pasen a mitosis sin reparar el ADN, resultando en apoptosis.
• Estudios demostraron radiosensibilización en células con p53 mutado después de la
inhibición del punto del control de G2 con UCN-01 y cafeína.
• La proteína Chk1, importante en la respuesta a RDCs, es uno de los blancos de UCN-01.
• Se utiliza UCN-01 con perifosina para pacientes con recaída y leucemia aguda, con
cisplatino para tumores solidos y con irinotecan para cáncer de mama triple negativo.
• El KU-55933 es un inhibidor específico de ATM. Sensibiliza las células a los tratamientos.
• El complejo MRN es clave en la vía de reparación de RDCs, por lo que es requerido para
activar el punto de control en G2. Es un blanco atractivo para los anticancerígenos.
• NBS1 también puede ser un blanco efectivo en la terapia contra el cáncer.
• Mirin es un inhibidor específico del complejo MRN que inhibe la activación de ATM e
inactiva la actividad de endonucleasa de la MRE11.
Perspectivas
Daños en el ADN
• El daño causa problemas hasta que es reparado. Debe repararse para evitar mutaciones.
• Los mecanismos de reparación son redundantes. Pueden participar varios para una sola
lesión. Esto es un mecanismo de seguridad por si falla algún mecanismo.
• Los mecanismos de reparación no funcionales producen mutaciones. Un exceso de
mutaciones puede llevar a la formación de un tumor.
Mecanismos de Reparación
Reparación Directa
• Se revierte la lesión. La enzima fotoliasa repara los dímeros de timina producidos por la
luz UV. La fotoliasa reconoce la distorsión. La luz UV activa la enzima, que rompe el anillo
de ciclobutano y se libera.
Mecanismos de Escisión
1. Unión de Mut S al error. Mut S recluta a Mut H y Mut L. El ensamblaje del complejo
activa la endonucleasa de Mut H.
2. Mut H introduce una mella en la cadena sintetizada, del lado 5’ del GATC. La metilasa
DAM tarda unos minutos en actuar. Es el tiempo de reconocimiento del error.
3. La degradación de la cadena con el nucleótido errado comienza en la mella y continúa,
mediada por EXO VII hacia el lado 5’ o EXO I hacia el lado 3’ del error.
4. La región de simple cadena expuesta es protegida del error por SSB.
5. El hueco es llenado por Pol III y sellado por la ligasa.
• En humanos, el proceso es similar, pero sin la metilación. Pueden estar implicadas las
discontinuidades en la cadena.
• Los cánceres colorrectales están asociados a mutaciones en genes como los Mut S y L.
• El mecanismo de reconocimiento se basa en la interacción de Mut S con PCNA.
• Hay veces que no se distingue la base dañada y se da la mutación.
• La desaminación de 5-metilcitosina a timina genera un par G-T y el sistema de reparación
lo convierte en G-C. Mut S siempre traslada la T.
• La actividad reparadora por Mut Y traslada la A.
Reparación Inducida
• La respuesta SOS también induce los lisógenos de lambda. El ADN de lambda se integra
con el bacteriano. Para mantenerlo, se requiere el represor del fago lambda.
• RecA degrada el represor del fago y se da la lisis celular y salen los fagos a otra célula.
• Cuando hay muchas lesiones en eucariotas, se activa la proteína p53, que activa a p21.
• P21 para el ciclo celular en G1 y se impide la replicación del ADN para dar tiempo para
reparar los errores.
• P53 activa mecanismos de reparación y causa apoptosis.
• La apoptosis se da en células con muchas lesiones en el ADN, en el desarrollo y en el
proceso de selección de repertorio de los linfocitos.
• Por lo tanto, p53 protege el ADN e impide la proliferación de células defectuosas. Es
conocida como el ángel guardián del genoma.
Agentes Mutagénicos
• Pueden ser agentes físicos, químicos o biológicos que alteran la información genética a
nivel del ADN en un organismo.
• Los agentes mutagénicos causan daños en el ADN en forma de mutaciones.
• Carcinógenos → Causan cáncer.
• Teratógenos → Agentes fisicoquímicos que causan mutaciones en el ADN que se reflejan
en la descendencia. Los niños nacen con defectos porque el material genético de alguno
de los padres tenia una mutación.
• Aunque todos estemos expuestos a estas sustancias, no necesariamente se va a dar la
mutación en todos. Está relacionado con la dieta alimenticia (minerales).
Agentes Físicos
• Las radiaciones pueden venir de distintas fuentes. A la que estamos más expuestos es a
la luz solar (UV). Emite radiaciones que pueden ser potenciadas o disminuidas.
• El vidrio es un potenciador de la radiación, mientras que las nubes la disminuyen.
• Entre más cerca se encuentre la persona de la fuente de radiación, más perjudicial será.
• También puede ser por rayos X, rayos gamma, cambios de temperatura y rayos cósmicos.
• Los cambios drásticos de temperatura suelen hacer rupturas del ADN.
• En los países tropicales, un individuo puede sufrir 65.000 mutaciones en un solo día.
• La radiación ultravioleta causa que se formen dímeros de pirimidinas en el ADN.
Agentes Químicos
Agentes Biológicos
• El Helicobacter pylori es una bacteria del sistema digestivo que tiende a enquistarse y a
alimentarse de las células que se encuentran allí. Se forman úlceras y cáncer gástrico.
• El Virus del Papiloma Humano (HPV) también es un agente mutagénico. Los síntomas se
desarrollan principalmente en los hombres.
• La Hepatitis B puede causar cáncer hepático. El virus de Epstein Barr causa linfomas.
Agentes Teratógenos
Radiaciones
Análogos de Bases
Agentes Alquilantes
• Son capaces de transferir grupos alquilo (metilo, vinilo, etilo) de una molécula orgánica a
las bases nitrogenadas, causando que las bases nitrogenadas cambien su configuración.
• Si a una citosina se le agrega un grupo metilo, funciona como una timina.
• Si la ADN polimerasa cree que la citosina es una timina, la va a aparear con adenina y va a
quedar un par C-A. La célula se va a volver a duplicar, el ADN se va a replicar y, cuando las
hebras se separen, se va a formar un par A-T, en lugar de un par G-C.
• Hay casos en los que se da reparación, pero no en todos.
• De las 65.000 mutaciones que sufre un individuo en un día, 1.100 no son reparadas y
permanecen en el organismo.
• Esto indica que las mutaciones se encuentran en lugares que no son esenciales para el
mantenimiento de la especie humana.
• El etilmetanosulfonato es un agente alquilante monofuncional, mientras que las
mostazas de nitrógeno, la mitomicina y la nitrosoguanidina son bifuncionales.
Colorantes Intercalantes
Agentes Cancerígenos
Pulmón
• Arsénico → Patilla
• Asbesto → Cemento
• Benzopireno → Humo de cigarrillo
• Cromato de zinc → Limpiadores (también en riñón y estómago)
Hígado
• Cloruro de vinilo
• Bebidas alcohólicas
• Bebidas alcohólicas
• Consumo de tabaco
• Tabaco de mascar
Mutaciones
Mutaciones Puntuales
Mutaciones y Herencia
• El humo del cigarrillo tiene un gas que se llama benzopireno, que altera las bases de
guanina en el gen P53. El gen P53 es el gen primordial en la supresión de los tumores.
• Si se altera la información del gen P53, la proteína P53 no funciona. El daño que ocurre
en el ADN no se va a poder reparar y la célula se va a dividir de manera descontrolada.
• Los rayos ultravioleta causan la hidrólisis de la citosina para convertirse en citosina
hidratada, que funciona como si fuera un uracilo.
• Se aparea con adenina en lugar de guanina. En los siguientes rounds de replicación, se va
a tener la mutación del par, que conlleva a cambios en la secuencia de la proteína.
• Las dioxinas de los microondas son los que generan distintos tipos de cáncer. Todos los
recipientes que se usen deben resistir la temperatura (vidrios templados).
• La desaminación de la citosina hace que se convierta en uracilo.
Reparación Directa
Sistemas de Reparación
• Si hay un daño en una sola hebra de ADN, funciona el sistema de reparación BER.
• Si el daño es en las 2 hebras, funcionan los sistemas de recombinación homóloga y NHEJ
(recombinación no homologa).
• Cuando la recombinación es entre homólogos, no hay cambio de la secuencia. Una hebra
sirve de molde para sintetizar la complementaria.
• Cuando es entre no homólogos, hay un cambio de un fragmento grande de ADN porque
se copia la información de otro fragmento de ADN de otro gen. El daño es grave.
• Cuando hay bases mal apareadas, inserciones y deleciones, funciona el sistema de
reparación de apareamiento erróneo, NER y reparación directa reversa.
• Cuando el daño es una mutación puntual o algo no complejo, actúa el sistema de
reparación por escisión de bases (BER).
• Si el daño es complejo, va a actuar el sistema de reparación por escisión de nucleótidos
(NER), la reparación de apareamiento erróneo, inversión (cross-read entre hebras de
ADN), recombinación entre homólogos y por último, reparación cuando los extremos del
ADN buscan formación complementaria en otro lugar de la cadena.
Mutaciones
• Se dan a 3 niveles:
• Existe una gran diferencia entre las alteraciones en las células somáticas y las
alteraciones en los gametos.
• Cuando el daño ocurre en células somáticas, no pasa a la descendencia.
• Cuando ocurre en gametos, toda la descendencia va a estar afectada.
2. Alteraciones a Nivel del ADN
• Define el tipo de ADN que sufre la alteración. Pueden darse a nivel nuclear (ADN
genómico) o a nivel mitocondrial (ADN mitocondrial).
• El ADN mitocondrial codifica para proteínas que funcionan en la mitocondria.
Mutaciones Génicas
Mutaciones Puntuales
Mutaciones Silenciosas
Mutaciones Cromosómicas
Deleción en el Cromosoma
Inserción en el Cromosoma
Inversión en el Cromosoma
Apoptosis
• Existen unas proteínas anti-apoptóticas que bloquean las señales de muerte y unas
proteínas pro-apoptóticas que son inductoras de muerte.
• Son las que van a mantener el equilibrio que va a permitir que la célula actúe normal.
• Los inconvenientes se presentan cuando se alteran estas proteínas porque se pierde el
equilibrio y se dan cambios a nivel celular.
• Todas las proteínas hacen parte de la familia Bcl-2 porque tienen dominios semejantes.
Proteínas Anti-Apoptóticas
• Todas las proteínas anti-apoptóticas hacen parte de una familia de proteínas llamada Bcl-
2. Las Bcl-XL también hacen parte de las bloqueadoras de las señales de muerte.
• Todas tienen las mismas subunidades. Son multidominio.
Proteínas Pro-Apoptóticas
Inducción de Apoptosis
Vía Extrínseca
• Se generan una serie de señales relacionadas con el sistema inmune que van a generar
otras señales extracelulares que van a inducir el proceso apoptótico.
• En las membranas celulares, se encuentran unas proteínas llamadas factores de necrosis
tumoral (TNF). Una de las proteínas de esta familia es la Fas (primera señal apoptótica).
• La Fas se encuentra en toda la superficie de la membrana fluida. Se puede mover.
• Cuando hay un daño a nivel celular y el sistema inmune lo detecta, los linfocitos
citotóxicos envían una señal en forma de ligando (ligando del Fas).
• El ligando del Fas se une a su receptor Fas y hace que todos los receptores de la
membrana se aglutinen, formando trímeros.
• Las proteínas de los trímeros tienen un dominio interno. Atraviesan la membrana.
• En la parte interna de la membrana, la región se llama dominio de muerte porque es la
primera molécula que va a inducir una cascada de señales de muerte.
• Al dominio de muerte, se une una proteína llamada factor asociado al dominio de
muerte, y se forma un complejo entre el dominio de muerte, el factor asociado a
dominio de muerte y una enzima inactiva que se llama procaspasa 8.
• Cuando la procaspasa 8 se une a este complejo, el complejo va a hacer proteólisis de la
procaspasa, generando 2 subunidades, una larga y una corta.
• Para que se pueda formar una caspasa 8 completamente activa, deben unirse 4 de estos
fragmentos, 2 grandes y 2 pequeños, formando un tetrámero.
• Como la caspasa 8 es una caspasa activadora, activa a la procaspasa 3 para convertirla en
caspasa 3 activa. La principal proteína del proceso apoptótico es la caspasa 3.
• Casi todos los procesos que se llevan a cabo a nivel de la degradación del núcleo y del
citoesqueleto tienen que ver con la caspasa 3.
• También es posible que la caspasa 8 recién activada actúe a nivel del retículo
endoplásmico para que se libere la procaspasa 12. La activa a caspasa 12, que a su vez
activa a la procaspasa 3 para convertirla en caspasa 3.
• Otra opción es que la caspasa 8 active a la procaspasa 7 para formar la caspasa 7, que es
otra caspasa efectora de apoptosis. Se encarga de la deshidratación del citoplasma.
• La caspasa 8 también puede activar unas proteínas pro-apoptóticas, como la Bid.
• La proteína Bid va a activar a unas proteínas (Bax, Bak) que se van a anclar a nivel de la
membrana mitocondrial. Se aglutinan y generan orificios o poros.
• A través de los poros, se liberan todos los elementos del periplasma mitocondrial, entre
los que se encuentra el citocromo C.
• Como la mitocondria deja de funcionar, la célula deja de realizar los procesos biológicos y
va a inducir el fenómeno de apoptosis.
• Las proteínas CASPER y FLIP inhiben a la procaspasa 8. Los virus producen estas proteínas
para que la célula no haga apoptosis.
Vía Intrínseca
• Se generan una serie de señales intracelulares que van a inducir el proceso. Estas señales
generalmente vienen dadas por alteraciones a nivel del ADN nuclear.
• Las alteraciones pueden generar oncogenes (oncoproteínas).
• La célula sintetiza una proteína señal llamada Bim, que es pro-apoptótica.
• La proteína Bim inactiva a todas las proteínas anti-apoptóticas Bcl-2, Bcl-XL y activa a las
proteínas pro-apoptóticas Bax y Bac.
• Bax y Bac se anclan en la membrana de la mitocondria, se aglutinan y forman poros.
• A través de los poros, sale todo lo que está acumulado en el espacio periplásmico de la
mitocondria, incluyendo el citocromo C.
• Cuando aumenta la cantidad de citocromo C a nivel del citosol, forma un complejo con
un factor activador de apoptosis (Apaf-1), ATP liberado y la procaspasa 9.
• Este complejo recibe el nombre de apoptosoma y degrada a la procaspasa 9 para
convertirla en caspasa 9. La caspasa 9 activa a la caspasa 3, que induce la apoptosis.
• La proteína Bim mantiene el equilibrio entre los factores de muerte y los inductores de
muerte. Siempre está sintetizada.
• Cuando se forman los poros en la mitocondria, se secreta una proteína llamada Smac o
Diablo. Su función es activar al inhibidor de apoptosis IAP. Induce a que la célula
mantenga el daño, lo que la hace inviable.
• Dependiendo de si hay más concentración de citocromo C o Smac, se regula la apoptosis.
• Existe un factor contrario a IAP que se llama AIF. Induce la apoptosis.
• Caspasa 7 → Hace que las células apoptóticas se deshidraten y se contraigan para que la
señal de muerte no llegue a las células vecinas.
• Caspasa 3 → Voltea la membrana plasmática para que los fosfolípidos miren hacia fuera
y puedan señalizar a los macrófagos. Degrada el citoesqueleto y forma los cuerpos
apoptóticos. Degrada a un inhibidor (ICAD) de DNAsas. Degrada el núcleo y fragmenta el
ADN. Los pedazos de ADN quedan dentro de los cuerpos apoptóticos.
• Caspasa 6 → Puede ser activada por la caspasa 3. Degrada a la proteína NuMa, que se
encarga de mantener unidos a los nucleosomas.
Cáncer
• Se caracteriza por una división descontrolada de las células porque no funcionan los
reguladores del ciclo celular. Las células cancerígenas proliferan de manera permanente.
• Se puede dar tanto por factores internos, como por factores externos.
• Las células cancerígenas pueden inducir a otras células para que cumplan funciones
anómalas, que vienen dadas por la capacidad de generar unas toxinas.
• Inducen a sus células vecinas a que produzcan factores de crecimiento de vasos
sanguíneos para poder irrigar y llevar nutrientes a las células cancerígenas.
• El cáncer es una enfermedad regulada por los propios genes.
• Es la primera causa de muerte en el mundo.
• Virus → Oncovirus
• Bacterias → Helicobacter pylori
• Químicos
• Factores físicos → Radiaciones.
• Herencia → Genes reguladores del ciclo celular mutados.
• Dieta → Azúcar. Se debe ingerir antioxidantes.
• Hormonas → Regulan el ciclo.
Células Cancerígenas
• La mitosis de las células cancerígenas dura menos que la de las células normales. Pasa de
durar horas a durar minutos. Están en división constante.
Ciclo Celular
• Existen unos checkpoints, en los que las ciclinas y las cinasas dependientes de ciclinas van
a controlar todo el ciclo celular.
• Permiten que las células que se encuentran en la fase G1 puedan pasar a la fase S, que es
la de duplicación del ADN.
• El checkpoint de la mitosis puede generar 2 señales:
• En algunos individuos, las proteínas de checkpoint no funcionan y dan vía libre para que
la célula con ADN dañado entre al proceso de mitosis.
• Hay otro checkpoint para pasar a la fase G1 nuevamente. Si la célula tiene un daño, se
envía a la fase G0.
• Cuando estos procesos no se dan correctamente, el niño nace con defectos.
Protooncogenes
Tipos de Protooncogenes
• La mutación hace que el oncogén exprese una proteína que siempre está excitada.
• Una de estas proteínas es la proteína Ras.
• Siempre va a estar enviando señales.
Factores de Transcripción
• Los oncogenes fos, jun y myc codifican para proteínas que regulan la señalización, el
control del ciclo celular y la apoptosis.
Genes Oncosupresores
• En Colombia, el cáncer que más se presenta es el cáncer de próstata, seguido del cáncer
de mama, cáncer cervical, cáncer gástrico, cáncer colorrectal, cáncer de pulmón, etc.
• El cáncer con mayor mortalidad es el de hígado y el de páncreas.
Sistema Inmune
Conceptos
Sistema Inmune
Células Madre
• Células Totipotentes → Pueden dar lugar a todos los tipos celulares. Pueden originar un
organismo completo. Se puede expresar cualquier tipo de gen.
• Células Pluripotentes → Pueden originar distintos tipos de células especializadas por
mitosis. Se encargan de la regeneración y reparación de los tejidos.
• Células Multipotentes → Pueden originar solamente algunos tipos de células
relacionadas entre sí, especialmente si provienen de un mismo tejido embrionario.