PCR REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA

Informe Laboratorio Virtual de Bioquímica

Valentina Gamboa Zapata

Tecnología en Química Industrial y de Laboratorio – Facultad de Ciencias

Básicas, Politécnico Colombiano Jaime Isaza Cadavid
Medellín, Mayo de 2020

RESULTADOS

Imagen 1: parámetros de reacción

Imagen 2: resultados obtenidos

Imagen 3: diagrama de resultados


Imagen 4: tabla de resultados
ANÁLISIS DE RESULTADOS
En esta experiencia se dio a conocer
por métodos analíticos en una
plataforma virtual el funcionamiento
de los procesos que se dan en la
PCR (Polymerase Chain Reaction) él
cuál es un proceso enzimático que
permite la amplificación de una
secuencia específica del ADN, este
se basa en el uso de dos
oligonucleótidos que, luego de
reconocer la secuencia
complementaria en la molécula de
ADN, son alargados cíclicamente
siendo mediado por la acción del
ADN Polimerasa.
Cada ciclo de la técnica
generalmente 20 ó 30 en total,
implica la desnaturalización del ADN,
el apareamiento de los
oligonucleótidos y la síntesis del
nuevo fragmento de ADN a partir del
oligonucleótido, lo que resulta en un
crecimiento exponencial de millones
de copias del fragmento
seleccionado. La reacción de síntesis
ocurrida es catalizada por un ADN
Polimerasa termoestable, obtenida
del Thermus aquaticus, una bacteria
termófila que vive en la proximidad de
manantiales de agua caliente.
En la PCR se separan las cadenas de
la doble hélice del ADN mediante
desnaturalización térmica a
temperaturas en torno a los 95°C, lo
que conduciría a la inactivación de las
DNA polimerasas ordinarias. La
polimerasa Taq, en contraste, tiene
su máxima actividad a 72 °C y su
termo estabilidad es tal que su vida
media a 95°C es de 40 minutos, lo
que la hace idónea para este tipo de
procesos.
En él experimentó virtual realizado se
realizó éste proceso de amplificación
en la secuencia del ADN. En la
ejecución de él experimentó uno, se
utilizaron ciertas cantidades dadas
para llevar a cabo el proceso de
reacción con tanto alta pureza cómo
rendimiento. El proceso se llevó a
cabo durante 30 segundos en él cuál
se completaron ciertamente 30 ciclos
en los cuáles ocurrió la
desnaturalización del ADN.
CONCLUSIONES
● Se dio a conocer los procesos
analíticos por los cuáles se
lleva a cabo la amplificación de
una secuencia de ADN para
generar un crecimiento
exponencial de sus propias
copias.
● Se reconoció el proceso por el
cual los virus actúan de tal
forma para poder esparcir su
capacidad de infección.
 ● Lavarse las manos con jabón
es por el momento la mejor
opción para prevenir el
contagio con el SARS-CoV-2.
● El Coronavirus pudo haber
sido creado en un laboratorio,
pero hasta ahora no se tiene
certeza de eso.
ANEXOS
1. EXPLICA LA FUNCIÓN DE CADA
UNO DE ESTOS REACTIVOS
● 2 primers
● Taq polimerasa
● Desoxinucleótido trifosfato
(dNTPs)
● Solución Buffer
● Agua destilada
● Plantilla de ADN / ARN
PRIMER / CEBADOR
R/ Un iniciador o cebador se refiere a
un número reducido de nucleótidos
del ADN, por lo general de 18 a 24
pares de bases de longitud. Un
cebador puede ser utilizado para
muchos procesos experimentales
diferentes. Se puede utilizar en una
reacción de PCR para llegar a un
locus determinado y así amplificarlo
para su posterior análisis. Es una
manera de seleccionar una secuencia
muy específica del ADN.
TAQ POLIMERASA.
R/ la Taq polimerasa es la principal
enzima que se utiliza para amplificar
secuencias del genoma humano, así
como de genomas de otros reinos,
géneros y especies que existen en la
tierra.
Actualmente es posible retro-
transcribir un RNA mensajero
específico y mediante su
amplificación utilizando la Taq
polimerasa podemos posteriormente
clonar ese DNA amplificado en un
vector de expresión y obtener dicha
proteína,
DEOXINUCLEOSIDO TRIFOSFATO.
R/ Las muestras de DNA se disponen
en 4 tubos de reacción donde se
añade a todos ellos un cebador que
permita la acción de la DNA
polimerasa y desoxinucleótidos
trifosfato para polimerizar la cadena
complementaria de las hebras
disponibles.
Cada vez que la DNA polimerasa use
uno de estos didesoxinucleótidos
trifosfato para incorporarlo a la
cadena, la síntesis de esa hebra se
paralizará por la no disponibilidad de
extremos 3′-OH.
SOLUCIÓN BUFFER
Las soluciones tampón, denominadas
también soluciones buffer, son
aquéllas que ante la adición de un
ácido o base son capaces de
reaccionar oponiendo la parte de
componente básica o ácida para
mantener fijo el pH. Es una o varias
sustancias químicas que afectan a la
concentración de los iones de
hidrógeno (o hidronios) en el agua.
Siendo que pH no significa otra cosa
que potencial de hidrogeniones (o
peso de hidrógeno), un buffer (o
"amortiguador") lo que hace es
regular el pH.
Cuando un buffer es añadido al agua,
el primer cambio que se produce es
que el pH del agua se vuelve
constante. De esta manera, ácidos o
bases (álcalis = bases) adicionales no
podrán tener efecto alguno sobre el
agua, ya que esta siempre
estabilizará de inmediato.
AGUA DESTILADA
Si bien existen quienes alientan su
consumo, amparándose en su
pretendida pureza, el agua destilada
en realidad es un producto de uso
industrial. Se emplea en laboratorios,
para preparar mezclas que exigen
márgenes altísimos de contaminación
en el agua, o que precisan sus
propiedades aislantes
diamagnéticas.
En la fabricación de baterías,
cosméticos y reactivos analíticos se
emplea agua destilada. También se la
usa en la industria del vidrio y el
cristal, e incluso como punto de
partida en la elaboración de
productos comestibles y bebidas.
PLANTILLA ADN/ARN
Una plantilla es un modelo
proporcionado para que otros lo
copien. El proceso de construir una
molécula de ARN a partir de ADN se
denomina transcripción. La doble
hélice de ADN se desenrolla y una
enzima, ARN polimerasa, construye
el ARNm usando el ADN como
plantilla.
¿CUÁL ES LA DIFERENCIA ENTRE
UN VIRUS Y UN VIRIÓN?
R/ Las diferencias entre virus y virión
están relacionadas con el entorno en
el que se encuentran, siendo el virión
la partícula infectante viral que se
encuentra en el medio ambiente.
El virión corresponde a la partícula
viral con capacidad patogénica de
producir enfermedades que se
encuentra libre en el ambiente.
se El virus, por otra parte, se encuentra
dentro de un organismo vivo, del que
requiere sus células para poder
replicarse.
¿QUÉ SON LOS CORONAVIRUS?
R/ Los coronavirus son una extensa
familia de virus que causan
infecciones respiratorias que pueden
ir desde el resfriado común hasta
enfermedades más graves como el
síndrome respiratorio de Oriente
y
Medio (MERS) y el síndrome
respiratorio agudo severo (SRAS). El
coronavirus que se ha descubierto
más recientemente causa la
enfermedad por coronavirus COVID-
19.
¿QUÉ SON LAS ZOONOSIS?
R/ Se considera zoonosis a cualquier
enfermedad y/o infección que es
naturalmente “transmisible desde
animales vertebrados al hombre”, es
clasificada como una zoonosis de
acuerdo a la publicación de la
Organización Panamericana de la
Salud (OPS) “Zoonosis y
enfermedades transmisibles comunes
al hombre y los animales”. Más de
200 zoonosis han sido descritas y son
conocidas desde siglos atrás. Ellas
involucran todo tipo de agentes:
bacteria, parásitos, virus y agentes no
convencionales.
¿QUÉ ES N95 Y KN95?
R/ La mascarilla N95 o cubre bocas
N95 es un tipo de mascarilla filtradora
de partículas que cumple con el
estándar N95 del Instituto Nacional
para la Seguridad y Salud
Ocupacional de los Estados Unidos.
La KN95 es un modelo de China que
están diseñadas para filtrar las
partículas, aerosoles líquidos y
patógenos presentes en el medio
ambiente, impidiendo que sean
inhaladas por la persona.

¿QUÉ EFECTO TIENEN EL GEL

ANTIBACTERIAL Y EL JABÓN EN
EL VIRUS?
R/ Con respecto al gel antibacterial,
las funciones de este producto son
limpiar y desinfectar, actuando ante
diferentes bacterias, hongos y virus.
Sin embargo, la concentración de
alcohol con la que están elaborados
es tan baja que no garantiza la
eliminación de microorganismos
bacterianos.

El doctor e infectólogo Carlos Javier

Sánchez del Hospital General de
México mencionó a la agencia de
noticias Notimex que "el gel
antibacterial con alcohol, en lugar de
proteger, hace que se adhieran más
bacterias". Imagen 5: descripción gráfica de cómo
reacciona el coronavirus ante el jabón
El jabón no solo afloja al virus de la
piel, sino que hace que la envoltura ¿QUÉ OTRAS SUSTANCIAS
viral se disuelva, de manera que las TIENEN CAPACIDAD DE ELIMINAR
proteínas y el ARN se deslíen y el EL VIRUS?
virus metafóricamente muere
realmente se desactiva, pues los R/ Amonio cuaternario, Hipoclorito de
virus no están precisamente vivos. sodio, Timol, Cloruro de sodio,
Peróxido de hidrógeno, Hipoclorito de
sodio, Ácido hipocloroso, etc.

¿PUDO SER EL VIRUS CREADO

EN UN LABORATORIO? EXPLIQUE

R/ Sí, en los laboratorios siempre hay

virus aislados y es posible que, al
estar trabajando con uno de ellos,
este pudo haber mutado y propagado
primero en los animales de prueba
(murciélagos) y por último en los
humanos.