Identification of Drug Resistant Candida auris

Kordalewska M and Perlin DS (2019) Identification of Drug Resistant Candida auris. Front.
Microbiol. 10:1918.

En las últimas décadas, se reconoce cada vez más que las infecciones fúngicas son una
grave preocupación para la salud humana, especialmente para los pacientes
inmunocomprometidos y los hospitalizados con enfermedades subyacentes graves. Se
han notificado casos de colonización persistente y diversos tipos de infecciones invasivas
en muchos países de los seis continentes. Las micosis diseminadas han sido el tipo de
infección invasiva más frecuente, con una mortalidad que oscila entre el 30 y el 60%. La
diversidad genética entre los aislamientos de los mismos pacientes, centros de atención
médica y estados indicó una transmisión local y continua. Recientemente se han discutido
varios factores, incluyendo el uso generalizado de antimicóticos y el cambio climático,
pero las razones exactas por las que este hongo ha empezado a propagarse en los
últimos años siguen sin estar claras.
1.- IDENTIFICACIÓN Y DETECCIÓN EN MUESTRAS CLÍNICAS
Existe una gran variedad de métodos de identificación utilizados por los laboratorios
clínicos y de salud pública de todo el mundo para detectar C. auris. Como discutió
ampliamente Lockhart et al., se deben determinar las especies para los aislamientos
recuperados de los casos de candidiasis invasiva y los aislamientos no invasivos
seleccionados con el fin de mejorar la detección de C. auris. La exactitud de identificación
de la infección de C. auris en el laboratorio clínico puede ser problemática, especialmente
cuando se basa en características fenotípicas. Se recomienda encarecidamente a las
instituciones que no cuenten con una metodología apropiada para la caracterización de
las especies de C. auris o con aislamientos que sean indefinidos o que sean sospechosos
de padecer C. auris que se pongan en contacto con un laboratorio de referencia para
obtener orientación.
2.- PROTOCOLO DE CULTIVO DE ENRIQUECIMIENTO PARA EL CRIBADO DE
COLONIZACIÓN DE C. AURIS
Los laboratorios de salud pública de los CDC, regionales y estatales de los Estados
Unidos utilizan el procedimiento de caldo de enriquecimiento de Dulcitol de Salt
Sabouraud para el aislamiento de C. auris a partir de muestras clínicas de piel y muestras
de vigilancia de esponjas ambientales. Cuando se realiza la prueba de detección de
colonización de C. auris, los laboratorios reciben los hisopos sumergidos en el medio de
Amies. Cada muestra que se enturbia se vierte mediante un lazo en CHROMagar
Candida. En el caso de que una muestra permanezca clara, se esparce una alícuota
sobre CHROMagar Candida.
3.- MÉTODOS FENOTÍPICOS Y BIOQUÍMICOS PARA C. AURIS
Los aislados de Candida auris muestran colonias de color blanco a crema en el agar de
dextrosa Sabouraud y aparecen como colonias de color beige a rosa en el medio de
CHROMagar Candida. Sin embargo, Bentz et al. describieron la presencia de colores
alternos: rosa, blanco y sectorizado de las colonias lisas y brillantes, y el cambio de
fenotipo en los aislados recuperados de los hisopos mediante el procedimiento de caldo
de enriquecimiento. De ninguna manera la recuperación de los tipos de colonia
mencionados anteriormente en el medio de CHROMagar Candida puede considerarse
como identificación de C. auris, ya que otras levaduras, incluyendo C. parapsilosis,
pueden tener un aspecto similar. Kumar et al. propusieron utilizar la tolerancia a la
temperatura y CHROMagar complementado con el medio de Pal para distinguir
morfológicamente a C. auris de C. haemulonii y C. duobushaemulonii. Las cepas de C.
auris mostraron crecimiento de colonias lisas de color blanco a crema a 37 C y 42 C
después de 24 y 48 h de incubación y no produjeron pseudohifas.
4.- IDENTIFICACION DE C. AURIS POR MALDI-TOF MS
MALDI-TOF MS genera espectros de masa característicos, únicos para cada
microorganismo, que pueden ser utilizados como sus huellas digitales. Dado que el
proceso de identificación se basa en la comparación de los espectros adquiridos para una
muestra probada y una base de datos de espectros de especies conocidas, el resultado
exacto depende de la presencia del espectro del organismo de muestra en la base de
datos. La falta de espectros adecuados en las bases de datos ha dado lugar a la falta de
identificación de C. auris como C. haemulonii y C. albicans, entre otros, por MALDI-TOF
MS. Sin embargo, una vez que las bases de datos de investigación-uso solamente o de
fabricantes se actualizan con los espectros de C. auris y especies relacionadas, MALDI-
TOF MS parece ser precisa. Es crucial que los laboratorios revisen la presencia de los
espectros mencionados anteriormente en la base de datos y confirme la capacidad de
detección del laboratorio probando un panel de cepas de referencia. En general,
comparado con los métodos convencionales de identificación, MALDI-TOF MS ha
demostrado conseguir una ganancia de tiempo de trabajo del técnico y de tiempo de
entrega.
5.- DETECCIÓN DE LA RESISTENCIA A LAS DROGAS ANTIFUNGOS DE C. AURIS
Las pruebas de susceptibilidad a los antimicóticos para C. auris se han realizado
utilizando varias pruebas estandarizadas, incluyendo los métodos de microdilución de
caldo del Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio y el Comité Europeo de
Pruebas de Susceptibilidad Antimicrobiana, el método de gradiente de prueba E diffusion
y el sistema de susceptibilidad a los antimicóticos VITEK 2. Sin embargo, los aislamientos
de C. auris se caracterizan a menudo por su reducida susceptibilidad a los azoles,
polienos y equinocandinas. Los resultados de las pruebas de susceptibilidad realizadas en
los aislamientos de la India revelaron su resistencia casi universal a fluconazole. Además,
se informó de la reducción de la susceptibilidad de C. auris a otros medicamentos
antimicóticos triazoles, incluyendo voriconazol, posaconazol, itraconazol e isavuconazol.
6.- MÉTODOS DE BASE MOLECULAR
Es urgente la disponibilidad de métodos para una rápida y precisa identification de la
resistencia a los fármacos antimicóticos de C. auris. Dado que la resistencia al azol y a la
equinocandina en C. auris está estrechamente relacionada con las mutaciones ERG11 y
FKS1 de specific, respectivamente, su análisis puede proporcionar una información
valiosa sobre la resistencia a los fármacos antimicóticos y facilitar la implementación del
tratamiento antimicótico de effective. El papel de las mutaciones no sinónimas en un
factor de transcripción similar al FLO8 o al transportador de membrana descrito por
Escandón et al. debe investigarse más a fondo.