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Acidos Nucleicos PDF
Acidos Nucleicos PDF
Los AN son polímeros lineales en los que la unidad repetitiva, llamada nucleótido, está
constituída por:
La unión de estas bases a una pentosa constituye un nucleósido. La unión de tipo éster
entre un nucleósido y el ácido fosfórico se llama nucleótido (Figuras 1a y 1b).
En ciertos casos aparecen otros tipos de bases nitrogenadas en los AN. En el RNA
transferente (RNAt) se encuentran a menudo bases como la N2-metilguanina, la N6-
metiladenina, la hipoxantina o el dihidroxiuracilo. En el DNA también se puede encontrar
5-metilcitosina o 5-hidroximetilcitosina (Figura 4).
Todas las bases mencionadas contienen la función lactama, que es una amida interna.
Esta función se puede convertir en la función lactima (imida interna) mediante un proceso
de isomería intramolecular denominado tautomería (Figura 5). En las condiciones
fisiológicas, el equilibrio está casi completamente desplazado hacia la forma lactama.
NUCLEÓSIDOS
Los nucleósidos son β-N-glicósidos de ribosa o desoxirribosa, en los que el sustituyente
en posición β del carbono 1 de la pentosa es una base púrica o pirimidínica (Figura 1a).
Los nucleósidos que contienen ribosa se llaman ribonucleósidos y los que contienen
desoxirribosa son los desoxirribonucleósidos. Por convención, la numeración de los
carbonos del anillo de la pentosa incluye un apóstrofo para diferenciarlos de los átomos de
los anillos de la base nitrogenada. Los ribonucleósidos más importantes son la adenosina
(A), guanosina (G), timidina (T), uridina (U) y citidina (C). Los desoxirribonucleósidos
reciben los mismos nombres, pero con el prefijo desoxi: desoxiadenosina (dA),
desoxiguanosina (dG), etc. (Figura 1b).
Los nucleósidos tienen poco interés bioquímico como sustancias libres, salvo en las vías
biosintéticas y degradativas de los AN. Una excepción importante es la S-
adenosilmetionina (SAM), que se forma por condensación de adenosina y metionina y es
un agente metilante muy enérgico (Figura 6).
NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos son ésteres fosfóricos de nucleósidos. El fosfato confiere carácter ácido a
la molécula y normalmente se encuentra esterificado al hidroxilo en posición 5', aunque,
excepcionalmente, también pueden hacerlo en 3' o en 2' (Figura 7). Los nucleótidos se
representan con la letra mayúscula correspondiente al nucleósido del que derivan más la
letra p minúscula, que repesenta al grupo fosfato y se antepone a la letra mayúscula de la
base si el fosfato está esterificado en posición 5' o se pone detrás si el fosfato está
esterificado en posición 3'. Así, el símbolo pA denota la adenosina-5'-fosfato, y el símbolo
Ap a la adenosina-3'-fosfato.
A veces, los nucleótidos contienen más de un grupo fosfato, unidos entre sí mediante un
enlace anhidro. En este caso, cada grupo se representa por una letra p. De esta forma, pAp
representa a la 5',3'-adenosina difosfato, ppA representa a la adenosina-5'-difosfato (ADP)
y pppA a la adenosina -5'-trifosfato (ATP).
Los nucleótidos cíclicos, en los que el ácido ortofosfórico esterifica dos hidroxilos (el 3' y
el 5') de la misma ribosa, actúan como segundos mensajeros en la respuesta hormonal.
Los más comunes son la adenosina-3',5'-monofosfato o AMP cíclico (AMPc) la
guanosina-3',5'-monofosfato o GMP cíclico (GMPc) (Figura 9).
POLINUCLEÓTIDOS
Los polinucleótidos son cadenas lineales de nucleótidos unidas por enlaces fosfodiéster.
En este tipo de enlace, los grupos fosfato están esterificados a los hidroxilos 5' y 3' de dos
nucleótidos consecutivos (Figuras 13a y 13b).Cada polinucleótido contiene un OH libre
en el grupo fosfato en posición 5' (extremo 5') y un OH libre en posición 3' (extremo 3').
En la cadena de un polinucleótido se pueden distinguir dos partes:
Los dos polinucleótidos que se pueden encontrar en los seres vivos son el ácido
ribonucleico (RNA) y el ácido desoxirribonucleico (DNA).
Puede purificarse fácilmente y se distinguen varios tipos de RNA en función, sobre todo,
de sus pesos moleculares:
Es muy probable que el RNA fuese el primer biopolímero que apareció sobre la Tierra.
En un ambiente similar al que debió existir en la Tierra primitiva pudieron formarse
espontáneamente cadenas cortas de RNA, pero no de DNA o proteínas. Además, se
conocen casos en los que las moléculas de RNA se cortan y empalman por sitios
específicos, en ausencia de proteínas. Estas moléculas de RNA con actividad catalítica se
denominan ribozimas. Estos primitivos mecanismos de maduración del RNA
contribuyeron probablemente a que se consiguiera con éxito la primera síntesis de
proteína dirigida por una cadena de polinucleótidos (un gen) (Figura 23). En una etapa
posterior, a partir del RNA se formaría el DNA, que llegaría a convertirse en un depósito
seguro de información genética, ya que se trata de una molécula químicamente más
estable.
El análisis químico del contenido molar de las bases de DNA procedente de diversos
organismos reveló que en todos los casos [A]=[T] y que [G]=[C], o lo que es lo mismo,
[A+G]=[T+C] ([purinas]=[pirimidinas]). Esta es la llamada ley de Chargaff (Figura 25).
En 1953, James Watson y Francis Crick combinaron los datos químicos y físicos del
DNA, y propusieron un modelo en el que las dos hebras están enrolladas una alrededor de
la otra formando una doble hebra helicoidal. Las dos cadenas de polinucleótido se
mantienen equidistantes, al tiempo que se enrollan en torno a un eje imaginario. Cada
hebra tiene una orientación diferente: A cada lado de la doble hélice de DNA, el extremo
3'-OH de una de las hebras se enfrenta al extremo 5' de la otra. En otras palabras, las dos
hebras son antiparalelas. La doble hélice es dextrógira. Esto quiere decir que si alguien
mira a la molécula a lo largo de su eje longitudinal, en cualquier dirección, cada hebra
sigue una trayectoria en el sentido de las agujas del reloj a medida que se aleja del
observador (Figura 26a).
La hélice presenta dos surcos helicoidales externos, uno de ellos ancho y profundo
(surco mayor) y el otro estrecho y poco profundo (surco menor). Las proteínas que
Esta estructura descrita por Watson y Crick es la que adopta el DNA en condiciones de
humedad elevada (92% de humedad relativa) y corresponde al B-DNA. Sin embargo, el
DNA puede adoptar otras estructuras (Figura 28):
Esta estructura de doble hélice del DNA no es la más habitual. En las células eucariotas,
el DNA forma la cromatina. En la cromatina, el DNA se enrolla en torno a unas proteínas
llamadas histonas empaquetándose de forma muy compacta (Figura 29). En procariotas,
así como en las mitocondrias y cloroplastos, el DNA se presenta en forma circular, en la
que la doble hélice se cierra por sus extremos. Este DNA circular puede presentar diversos
grados de superenrrollamiento (Figura 30). En virus, el DNA puede presentarse como una
doble hélice cerrada, como una doble hélice abierta o simplemente como una única hebra
lineal.
Las bases de los ácidos nucleicos absorben fuertemente la luz de 260 nm. La cantidad de
luz absorbida depende de la proximidad entre las bases. Cuando las bases están muy
próximas entre sí (como en el DNA de doble hebra) absorben menos luz que cuando se
encuentran en un DNA de hebra sencilla o que en el caso de las bases nitrogenadas libres
en disolución. Así, si una disolución de DNA de doble hebra tiene una A260 = 1, la misma
concentración de una disolución de DNA de una sola hebra presenta una A260 =1,37, y la
misma concentración de bases nitrogenadas libres tiene una A260 de 1,6.
• La concentración salina debe ser alta ([NaCl] entre 0,15 y 0,5 M) para eliminar la
repulsión entre los grupos fosfato de las dos hebras.
En las células eucariotas, el DNA está presente en el núcleo, así como en mitocondrias y
cloroplastos. Cada cromosoma eucariota contiene una única molécula de DNA cuya masa
molecular es enorme: aproximadamente de 2 × 106 dalton por µm de longitud. En
procariotas, el DNA se encuentra en el citoplasma celular. Tanto en unos como en otros,
la molécula de DNA es el soporte material de los caracteres hereditarios de una
especie y es trasmitida íntegramente a la progenie. El modelo de Watson y Crick explica
las propiedades biológicas del DNA:
La conclusión de Griffith fue que los neumococos de tipo S muertos contenían un "factor
de transformación" que había convertido a los neumococos R vivos en neumococos S
vivos que había provocado la muerte del animal.
Esta serie de experimentos no deja lugar a dudas sobre la naturaleza del factor de
transformación, que es un DNA y no una proteína como se sospechaba en aquella época.
Los bacteriófagos (o fagos) son virus que atacan a las bacterias. Los fagos de la serie T-
par (T2, T4 y T6) atacan a la enterobacteria Escherichi coli. Estos fagos constan de una
cabeza proteica que alberga en su interior una molécula de DNA. De la cabeza surge un
tallo que acaba en una serie de filamentos (Figura 39). Tanto el tallo como los filamentos
están formados por proteínas. Como estos fagos contienen únicamente DNA y proteínas,
el problema de determinar cuál de los dos alberga la información genética se aborda de
forma más directa que en el experimento anterior.
Como los virus de la progenie heredan los caracteres fenotípicos del virus primitivo,
Hershey y Chase diseñaron un sistema para averiguar si la información necesaria para
crear nuevas copias del virus era transmitida por el DNA o por las proteínas. Utilizaron
técnicas de marcaje radioactivo para construir dos poblaciones de bacteriófagos T2
distintas (Figura 40):
• Una población de fagos creció en un medio que contenía 35S. El 35S marca a las
proteínas que contienen residuos de Cys o Met y por lo tanto, esta población
contiene proteínas radioactivas y DNA no radioactivo, ya que el DNA no
contiene S
• La segunda población de virus creció en un medio que contenía 32P. El 32P marca
los ácidos nucleicos, pero no a las proteínas, de forma que esta población contiene
DNA radioactivo y proteínas no radioactivas
Ambos tipos de virus fueron utilizados por separado para infectar a células de E. coli
susceptibles. Después de la infección y antes de que se completara el ciclo lítico