El gen de la APOE se localiza en el cromosoma 19 y tiene varios alelos,

 ApoE2 es una de las isoformas del gen APOE,

La apo E2 tiene menor afinidad por el receptor remanente de LDL B/E comparada
con la apo E3, lo cual puede conducir a acumulación de lipoproteínas conteniendo
apo E en circulación

Las personas que al menos tienen un alelo E2 tienden a tener menores niveles de
apo B-100 y LDL-col que aquellas que son homocigotas para el alelo E3

La homocigosis apo E-2 es característica de hiperlipoproteinemias familiar tipo III

(quilomicronemia, aumento de triglicéridos, colesterol y b-VLDL).
 

La hiperlipoproteinemia tipo III (quilomicronemia, incremento de triglicéridos,

colesterol, b-VLDL y riesgo de enfermedad arterial coronaria y periférica), es un
ejemplo de interacción de homocigosidad apo E-2 con otros factores ambientales
y genéticos conduciendo a una acumulación marcada de remanentes de
lipoproteínas ricas en triglicéridos y ateroesclerosis acelerada.