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Los principios que subyacen a la espectrometría de masas son anteriores a todas las otras técnicas
instrumentales descritas en este libro. Los principios fundamentales datan de fines de la década de
1890, cuando J. J. Thomson determinó la relación masa-carga del electrón, y Wien estudió la
desviación magnética de los rayos anódicos y determinó que los rayos estaban cargados
positivamente. Cada hombre fue honrado con el Premio Nobel (Thomson en 1906 y Wien en 1911)
por sus esfuerzos. En 1912-1913, J. J. Thomson estudió los espectros de masas de los gases
atmosféricos y utilizó un espectro de masas para demostrar la existencia de neón-22 en una
muestra de neón-20, estableciendo así que los elementos podrían tener isótopos. El primer
espectrómetro de masas, tal como lo conocemos hoy, fue construido por A. J. Dempster en 1918.
Sin embargo, el método de la espectrometría de masa no tuvo un uso común hasta hace unos 50
años, cuando se hicieron disponibles instrumentos económicos y confiables.
El desarrollo de técnicas de ionización para compuestos de alto peso molecular (MW) y muestras
biológicas en las décadas de 1980 y 1990 introdujo la espectrometría de masas en una nueva
comunidad de investigadores. La introducción de instrumentos comerciales de menor costo que
proporcionan alta resolución y se mantienen fácilmente ha hecho de la espectrometría de masas
una técnica indispensable en numerosos campos muy alejados de los laboratorios de Thomson y
Wien. Hoy, la industria de la biotecnología utiliza la espectrometría de masas para analizar y
secuenciar proteínas, oligonucleótidos y polisacáridos. La industria farmacéutica utiliza la
espectrometría de masas en todas las fases del proceso de desarrollo de fármacos, desde el
descubrimiento de compuestos de plomo y el análisis estructural, hasta el desarrollo sintético y la
química combinatoria, y hasta la farmacocinética y el metabolismo de los fármacos. En las clínicas
de salud de todo el mundo, la espectrometría de masas se usa para analizar la sangre y la orina en
busca de todo, desde la presencia y los niveles de ciertos compuestos que son "marcadores" de
estados de enfermedad, incluidos muchos tipos de cáncer, hasta la detección de la presencia y el
análisis cuantitativo de ilícito o rendimiento que mejoran las drogas. Los científicos
medioambientales confían en la espectrometría de masas para controlar la calidad del agua y el
aire, y los geólogos utilizan la espectrometría de masas para evaluar la calidad de las reservas de
petróleo. Hasta la fecha, se han otorgado no menos de cinco premios Nobel por trabajos
directamente relacionados con la espectrometría de masas: J. J. Thomson (Física, 1906) por
"investigaciones teóricas y experimentales sobre la conducción de electricidad por gases"; F. W.
Aston (Química, 1922) por "descubrimiento, por medio de un espectrógrafo de masas, de
isótopos, en una gran cantidad de elementos no radiactivos"; W. Paul (Física, 1989) "para el
desarrollo de la técnica de trampa de iones"; y más recientemente J. B. Fenn y K. Tanaka (Química,
2002) "para el desarrollo de métodos de ionización por desorción suave para análisis
espectrométricos de masas de macromoléculas biológicas".
EL ESPECTROMETRO DE MASA: VISIÓN GENERAL
En su forma más simple, el espectrómetro de masas tiene cinco componentes (Fig. 8.1), y cada
uno se discutirá por separado en este capítulo. El primer componente del espectrómetro de masas
es la entrada de muestra (Sección 8.2), que lleva la muestra del entorno del laboratorio (1 atm) a
la presión más baja del espectrómetro de masas. Las presiones dentro del espectrómetro de
masas varían desde unos pocos milímetros de mercurio en una fuente de ionización química hasta
unos pocos micrómetros de mercurio en las regiones del analizador y detector de masas del
instrumento. La entrada de muestra conduce a la fuente de iones (Sección 8.3), donde las
moléculas de muestra se transforman en iones en fase gaseosa. Los iones son acelerados por un
campo electromagnético. A continuación, el analizador de masas (Sección 8.4) separa los iones de
muestra en función de su relación masa-carga (m / z). Luego, el detector cuenta los iones (Sección
8.5), y la señal es registrada y procesada por el sistema de datos, típicamente una computadora
personal (PC). La salida del sistema de datos es el espectro de masas, un gráfico del número de
iones detectados en función de su relación m / z.
Cuando examinamos cada una de estas funciones esenciales del espectrómetro de masas en
detalle, vemos que el espectrómetro de masas es algo más complejo de lo que se acaba de
describir. Antes de que se puedan formar los iones, se debe introducir una corriente de moléculas
en la fuente de iones (cámara de ionización) donde tiene lugar la ionización. Un sistema de
entrada de muestra proporciona esta corriente de moléculas.
Una muestra estudiada por espectrometría de masas puede ser un gas, un líquido o un sólido. Se
debe convertir suficiente cantidad de la muestra al estado de vapor para obtener la corriente de
moléculas que deben fluir hacia la cámara de ionización. Con los gases, por supuesto, la sustancia
ya está vaporizada, por lo que se puede usar un sistema de entrada simple. Este sistema de
entrada se evacua solo parcialmente, de modo que la cámara de ionización en sí está a presión
más baja que el sistema de entrada de muestra. La muestra se introduce en un depósito más
grande, desde el cual las moléculas de vapor pueden extraerse a la cámara de ionización, que está
a baja presión. Para garantizar que una corriente constante de moléculas pase a la cámara de
ionización, el vapor viaja a través de un pequeño orificio, llamado fuga molecular, antes de
ingresar a la cámara. Se puede usar el mismo sistema para líquidos o sólidos volátiles. Para
materiales menos volátiles, el sistema puede diseñarse para caber dentro de un horno, que puede
calentar la muestra para aumentar la presión de vapor de la muestra. Se debe tener cuidado de no
calentar ninguna muestra a una temperatura a la que pueda descomponerse. Con muestras no
volátiles, se deben utilizar otros sistemas de entrada de muestras. Uno común es el método de
sonda directa. La muestra se coloca en un bucle de alambre delgado o pin en la punta de la sonda,
que luego se inserta a través de un bloqueo de vacío en la cámara de ionización. La sonda de
muestra se coloca cerca de la fuente de iones. La sonda se puede calentar, lo que hace que el
vapor de la muestra se desarrolle cerca del haz ionizante de electrones. Un sistema como este
puede usarse para estudiar muestras de moléculas con presiones de vapor inferiores a 10−9
mmHg a temperatura ambiente.
EI-MS tiene distintas ventajas para la espectrometría de masas de rutina de pequeñas moléculas
orgánicas. El hardware de ionización electrónica es económico y robusto. El exceso de energía
cinética impartida a la muestra durante el proceso EI conduce a una fragmentación significativa del
ion molecular (Sección 8.8). El patrón de fragmentación de un compuesto es reproducible, y
muchas bibliotecas de datos EI-MS están disponibles. Esto permite comparar el espectro de masas
de un compuesto de muestra con miles de conjuntos de datos en una biblioteca espectral en
pocos segundos usando una PC, lo que simplifica el proceso de determinar o confirmar la
identidad de un compuesto.
La fragmentación del ion molecular en condiciones de IE también puede considerarse una clara
desventaja. Algunos compuestos se fragmentan tan fácilmente que la vida útil del ion molecular es
demasiado corta para ser detectada por el analizador de masas. Por lo tanto, no se puede
determinar la masa molecular de un compuesto (Sección 8.6) en tales casos. Otro inconveniente
de EI-MS es que la muestra debe ser relativamente volátil para que pueda entrar en contacto con
el haz de electrones en la cámara de ionización. Este hecho, junto con el problema de la
fragmentación, dificulta el análisis de compuestos de alto peso molecular (MW) y la mayoría de las
biomoléculas usando EI-MS.
El uso de isobutano como gas reactivo produce cationes terc-butilo (ecuaciones 8.10 y 8.11), que
fácilmente protonan sitios básicos en la molécula de muestra (ecuación 8.12). La formación de
aductos también es posible usando isobutano en CI-MS (Ecuación 8.l3).
La variación del gas reactivo en CI-MS permite variar la selectividad de la ionización y el grado de
fragmentación iónica. La elección del gas reactivo debe hacerse con cuidado para que coincida
mejor con la afinidad protónica del gas reactivo con la de la muestra para garantizar una ionización
eficiente de la muestra sin fragmentación excesiva. Cuanto mayor sea la diferencia entre la
afinidad protónica de la muestra y la del gas reactivo, más energía se transfiere a la muestra
durante la ionización. El exceso de energía produce un ion analito en un estado vibratorio
altamente excitado. Si se transfiere suficiente energía cinética en exceso, el ion de la muestra se
fragmentará a través de la división de los enlaces covalentes. Por lo tanto, el uso de un gas
reactivo con una afinidad de protones muy similar al de la muestra dará como resultado un mayor
número de iones moleculares intactos y un menor número de iones de fragmentos. Por supuesto,
es poco probable que se conozca la afinidad precisa de protones de la muestra, pero se puede
estimar el valor mirando las tablas de valores determinados para compuestos simples con grupos
funcionales similares a la muestra en cuestión. Un resumen de los gases reactivos CI comunes y
sus iones / propiedades se presenta en la Tabla 8.l. Como se puede ver en la Figura 8.3, la CI-MS
del acetato de lavandulilo (MW 196) proporciona espectros de masas con aspectos muy diferentes
dependiendo del gas regente utilizado para ionizar la muestra. En el espectro superior,
el ion molecular protonado del acetato de lavandulilo [(M + H) +, m / z = 197] es apenas visible, y
el pico más grande en el espectro pertenece al fragmento en m / z = 137. En el espectro medio,
adquirido usando isobutano como gas reactivo, el ion molecular protonado a m / z = 197 es mucho
más prominente y hay menos fragmentación general. Sin embargo, la fragmentación sigue siendo
significativa en este caso, ya que el ion a m / z = 137 sigue siendo el más abundante en el espectro.
Finalmente, cuando el acetato de lavandulilo se ioniza con amoníaco, el ion molecular protonado
es el ion más abundante (el pico base), y casi no se observa fragmentación. Tenga en cuenta la
presencia de un ión aducto [(M + NH4) +, m / z = 214] presente en este espectro.
Los métodos EI y CI requieren una muestra relativamente volátil (bajo peso molecular). Las
técnicas de ionización desarrolladas más recientemente permiten el análisis de moléculas grandes
no volátiles por espectrometría de masas.
La matriz debe ser no volátil, relativamente inerte y un electrolito razonable para permitir la
formación de iones. Si el compuesto de la matriz es más ácido que el analito, entonces se
formarán predominantemente iones (M + H) +, mientras que la mayoría de los iones (M - H) se
producirán cuando la matriz sea menos ácida que el analito. La matriz absorbe gran parte del
exceso de energía impartida por el haz de iones / átomos y produce iones que contribuyen con
una gran cantidad de iones de fondo al espectro de masas. De hecho, las reacciones químicas
dentro de la matriz durante la ionización pueden contribuir con iones de fondo en la mayoría de
las regiones de masa por debajo de aproximadamente 600 m / z. Los compuestos de matriz
comunes para SIMS y FAB incluyen glicerol, tioglicerol, alcohol 3-nitrobencílico, di- y
trietanolamina y mezclas de ditiotreitol (DTT) y ditioeritritol (Fig. 8.6) Los compuestos de matriz
utilizados en MALDI se eligen por su capacidad para absorber el luz ultravioleta (UV) de un pulso
láser (337 nm para láser N2). Los derivados de ácido nicotínico, picolínico y cinámico sustituidos a
menudo se usan en las técnicas MALDI (Fig. 8.7). La matriz absorbe la mayor parte de la energía
del pulso láser, lo que permite la creación de iones de muestra intactos que se expulsan de la
matriz. La espectrometría de masas MALDI es útil para analitos que abarcan una amplia gama de
pesos moleculares, desde pequeños polímeros con pesos moleculares promedio de unos pocos
miles de unidades de masa atómica (uma) hasta oligosacáridos, oligonucleótidos y polipéptidos,
anticuerpos y pequeñas proteínas con pesos moleculares que se aproximan a 300,000 uma .
¡Además, MALDI requiere solo unos pocos femtomoles (1 3 10–15 moles) de muestra!
Una técnica aún más útil para estudiar biomoléculas de alto peso molecular y otros compuestos
inestables o no volátiles es la ionización por electropulverización (ESI) y su primo ionización por
termopulverización (TSI). En ESI, una solución que contiene las moléculas de muestra se rocía por
el extremo de un capilar fino en una cámara calentada que está a presión casi atmosférica. El
capilar a través del cual pasa la solución de muestra tiene un alto potencial de voltaje a través de
su superficie, y pequeñas gotas cargadas son expulsadas a la cámara de ionización. Las gotas
cargadas se someten a un contraflujo de un gas de secado (generalmente nitrógeno) que evapora
las moléculas de disolvente de las gotas. Por lo tanto, la densidad de carga de cada gotita aumenta
hasta que las fuerzas repulsivas electrostáticas exceden la tensión superficial de la gotita (el límite
de Rayleigh), en cuyo punto las gotitas se rompen en gotitas más pequeñas. Este proceso continúa
hasta que los iones de muestra libres de solventes se dejen en la fase gaseosa (Fig. 8.8). La TSI se
produce por un mecanismo similar, pero se basa en un capilar calentado en lugar de uno con un
potencial electrostático para formar inicialmente las gotas cargadas. Los iones negativos también
se pueden formar en ESI por la pérdida de protones de la muestra a las especies básicas en
solución. ESI se ha vuelto mucho más común que TSI en la última década o dos, y debido a que
depende de una muestra en solución, ESI es el método más lógico para ser empleado en sistemas
LC-MS.
Las cargas de los iones generados usando ESI no reflejan necesariamente el estado de carga de la
muestra en solución. La carga transferida a las moléculas de muestra (generalmente en forma de
protones) surge de una combinación de concentración de carga en las gotitas durante la
evaporación del aerosol y procesos electroquímicos derivados del potencial electrostático del
capilar. Los iones de muestra pueden tener una sola carga o múltiples cargas. La figura 8.9 muestra
el ESI-MS de la lisozima de la clara de huevo de gallina en ausencia y presencia de ditiotreitol. En el
primer espectro, se observan iones que representan moléculas de proteínas con cargas 10+, 11+,
12+ y 13+. El último espectro muestra aún más iones altamente cargados, incluido un pico de
proteína con una carga de más de 20. La formación de iones con carga múltiple es particularmente
útil en el análisis MS de proteínas. Las proteínas típicas pueden transportar muchos protones
debido a la presencia de cadenas laterales de aminoácidos básicos, lo que resulta en picos en m / z
= 600–2000 para proteínas con un peso molecular que se aproxima a 200,000 amu.
Los datos que se muestran en la figura 8.9 se pueden usar para calcular la masa molecular de la
lisozima. La masa se calcula multiplicando la carga en la lisozima por el valor m / z que se muestra
en el cromatograma.
Por ejemplo:
Sin embargo, ESI-MS no se limita al estudio de biomoléculas grandes. ESI-MS puede estudiar
muchas moléculas pequeñas con peso molecular en el rango de 100-1500. Los compuestos que
son demasiado no volátiles para ser introducidos por métodos de sonda directa o son demasiado
polares o térmicamente lábiles para ser introducidos por métodos GC-MS son ideales para el
estudio por LC-MS utilizando técnicas ESI.
donde m es la masa del ion, v es la velocidad del ion, z es la carga sobre el ion y V es la diferencia
de potencial de las placas aceleradoras de iones. En el analizador de masa del sector magnético
(Fig. 8.10), los iones pasan entre los polos de un imán. En presencia de un campo magnético, una
partícula cargada describe una trayectoria de vuelo curva. La ecuación que produce el radio de
curvatura de este camino es
donde r es el radio de curvatura de la ruta, y B es la fuerza del campo magnético. Si estas dos
ecuaciones se combinan para eliminar el término de velocidad, el resultado es
Como se puede ver en la ecuación 8.16, cuanto mayor es el valor de m / z, mayor es el radio de la
trayectoria curva. El tubo analizador del instrumento está construido para tener un radio de
curvatura fijo. Una partícula
FIGURA 8.10 Esquema de un analizador de masas del sector magnético. (De Smith, R. M.,
Understanding Mass Spectra, A Basic Approach, 2nd ed., John Wiley and Sons, Nueva York, 2004.
Reimpreso con permiso).
Con la relación m / z correcta puede negociar el tubo analizador curvo y llegar al detector. Las
partículas con relaciones m / z que son demasiado grandes o demasiado pequeñas golpean los
lados del tubo del analizador y no alcanzan el detector. El método no sería muy interesante si se
pudieran detectar iones de una sola masa. Por lo tanto, la intensidad del campo magnético varía
continuamente (llamada exploración de campo magnético) para poder detectar todos los iones
producidos en la cámara de ionización. El registro producido a partir del sistema detector tiene la
forma de una gráfica de los números de iones versus sus valores m / z.
Para muchas aplicaciones, se necesita una resolución mucho mayor y se puede lograr mediante
modificaciones de este diseño básico del sector magnético. De hecho, los analizadores del sector
magnético se utilizan actualmente solo en espectrómetros de masas de doble enfoque. No todas
las partículas que salen de la cámara de ionización tienen exactamente la misma velocidad, por lo
que el haz de iones pasa a través de una región de campo eléctrico antes o después del sector
magnético (Fig. 8.11). En presencia de un campo eléctrico, todas las partículas viajan a la misma
velocidad. Las partículas describen un camino curvo en cada una de estas regiones, y la resolución
del analizador de masa mejora, en un factor de 10 o más sobre el sector magnético solo.
En un analizador de masas cuadrupolo (Fig. 8.12), un conjunto de cuatro barras sólidas está
dispuesto paralelo a la dirección del haz de iones. Las barras deben ser hiperbólicas en sección
transversal, aunque se pueden usar barras cilíndricas. Se aplica un voltaje de corriente continua
(CC) y una radiofrecuencia (RF) a las barras, generando un campo electrostático oscilante en la
región entre las barras. Dependiendo de la relación entre la amplitud de RF y el voltaje de CC, los
iones adquieren una oscilación en este campo electrostático. Los iones de una relación m / z
incorrecta (demasiado pequeña o demasiado grande) sufren una oscilación inestable. La amplitud
de la oscilación continúa aumentando hasta que la partícula golpea una de las barras. Los iones de
la relación masa-carga correcta experimentan una oscilación estable de amplitud constante y
viajan por el eje cuadrupolo con una trayectoria de tipo "sacacorchos". Estos iones no golpean las
barras cuadrupolo sino que pasan a través del analizador para alcanzar el detector. Al igual que el
analizador de sector magnético, el cuadrupolo puede escanearse de valores altos a bajos de m / z.
Un analizador de masas cuadrupolo se encuentra en la mayoría de los "benchtop" sistemas GC-MS
y típicamente tiene am / z gama de 0 a 1000, aunque analizadores de cuadrupolo están
disponibles en algunos sistemas de CL-EM con rangos de m / z que se acercan a 2000.
espectrómetros de masas de cuadrupolo son instrumentos de baja resolución (R ~ 3000) incapaz
de proporcionar la composición elemental exacta de la muestra.
Estas colisiones resultan en eventos de ionización de tipo ionización química (Ecuación 8.18). Esto
a veces se conoce como auto-CI.
y la velocidad del ion es la longitud de la ruta de vuelo L dividida por el tiempo t que tarda el ion en
recorrer esa distancia:
Los espectrómetros de masas de tiempo de vuelo son relativamente simples, lo que hace posible
usarlos en el campo. Durante la Guerra del Golfo de 1991, surgió la preocupación de que las tropas
iraquíes pudieran estar liberando agentes de guerra química contra las tropas estadounidenses.
Para protegerse contra esa posibilidad, el Ejército de los EE. UU. Desplegó varios vehículos
rastreados, cada uno equipado con un espectrómetro de masas. El espectrómetro de masas se usó
para tomar muestras del aire y proporcionar una advertencia anticipada en caso de que se liberen
gases venenosos al aire. Los espectrómetros de masas TOF básicos también se utilizan para
detectar residuos de explosivos y drogas ilegales en las estaciones de control de seguridad en los
aeropuertos. Debido a su valor para estudiar especies de vida corta, los espectrómetros de masas
TOF son particularmente útiles en estudios cinéticos, especialmente con aplicaciones a reacciones
muy rápidas. Con esta técnica se pueden investigar reacciones muy rápidas, como la combustión y
las explosiones.
Mediante el uso de circuitos multiplicadores de electrones, esta corriente se puede medir con
tanta precisión que se puede medir la corriente causada por un solo ion que golpea el detector.
Cuando un ion golpea la superficie del multiplicador de electrones (vidrio dopado con plomo
recubierto con óxido de plomo), se expulsan dos electrones. La diferencia de potencial de
aproximadamente 2 kV entre la apertura y el extremo del detector atrae a los electrones hacia el
multiplicador de electrones, donde cada electrón golpea la superficie nuevamente, causando la
expulsión de dos electrones más. Este proceso continúa hasta que se alcanza el final del
multiplicador de electrones, y el sistema de datos analiza y registra la corriente eléctrica. La
amplificación de la señal que se acaba de describir será 2n, donde n es el número de colisiones con
la superficie del multiplicador de electrones. Los multiplicadores de electrones típicos
proporcionan un aumento de señal de 105-106. En la figura 8.16 se muestran dos configuraciones
de multiplicadores de electrones. Un multiplicador de electrones curvado acorta el camino de
iones y da como resultado una señal con menos ruido. Los detectores de fotomultiplicador
funcionan según un principio similar al multiplicador de electrones, excepto que las colisiones de
iones con la pantalla fluorescente en el fotomultiplicador producen una emisión de fotones
proporcional al número de colisiones de iones. El sistema de datos analiza y registra la intensidad
de la luz (en lugar de la corriente eléctrica). La señal del detector se alimenta a un registrador, que
produce el espectro de masas. En los instrumentos modernos, la salida del detector se alimenta a
través de una interfaz a una computadora. La computadora puede almacenar los datos,
proporcionar la salida en forma de tabla y gráfica, y comparar los datos con los espectros estándar,
que están contenidos en bibliotecas de espectros que también se almacenan en la computadora.
La figura 8.17 es una porción de un espectro de masa típico: el de la dopamina, una sustancia que
actúa como neurotransmisor en el sistema nervioso central. El eje x del espectro de masas es la
relación m / z, y el eje y es la abundancia de iones. Los resultados espectrales de masas también se
pueden presentar en forma de tabla, como en la Tabla 8.2. El ion más abundante formado en la
cámara de ionización da lugar al pico más alto en el espectro de masas, llamado pico base. En el
espectro de masas de la dopamina, el pico base se indica con un valor m / z de 124. Las
intensidades espectrales se normalizan al establecer el pico base en una abundancia relativa de
100, y el resto de los iones se informan como porcentajes del pico base. intensidad.
El extremo inferior del rango m / z es típicamente 35 o 40 para eliminar los picos muy grandes de
fragmentos de baja masa de iones de fondo que surgen de gases y pequeños fragmentos de
alquilo. Al adquirir datos en condiciones de CI, el extremo inferior del rango m / z se establece más
alto para eliminar los picos grandes de los iones de gas reactivo.
Muy a menudo, los isótopos ocurren una o dos unidades de masa por encima de la masa del
átomo "normal". Por lo tanto, además de buscar el pico de iones moleculares (M +), también se
intentaría localizar los picos M + 1 y M + 2. Como demostrará la Sección 8.6, las abundancias
relativas de los picos M + 1 y M + 2 se pueden usar para determinar la fórmula molecular de la
sustancia que se está estudiando. En la figura 8.17, los picos isotópicos son los picos de baja
intensidad a valores de m / z (154 y 155) más altos que los de el pico de iones moleculares (ver
también la Tabla 8.2).
Hemos visto que el haz de electrones en la cámara de ionización puede producir el ion molecular.
Este haz también es lo suficientemente potente como para romper algunos de los enlaces en la
molécula, produciendo una serie de fragmentos moleculares. Los fragmentos cargados
positivamente también se aceleran en la cámara de ionización, se envían a través del analizador,
se detectan y se registran en el espectro de masas. Estos iones de fragmentos aparecen en valores
m / z correspondientes a sus masas individuales. Muy a menudo, un ión fragmento, en lugar del
ión padre, es el ión más abundante producido en el espectro de masas. Existe un segundo medio
para producir iones fragmentarios si el ion molecular, una vez que se forma, es tan inestable que
se desintegra antes de que pueda pasar a la región de aceleración de la cámara de ionización. Las
vidas de menos de 10 a 6 segundos son típicas en este tipo de fragmentación. Los fragmentos que
se cargan aparecen entonces como iones de fragmentos en el espectro de masas. Una gran
cantidad de información estructural sobre una sustancia puede ser determinada a partir de un
examen del patrón de fragmentación en el espectro de masas. La Sección 8.8 examinará algunos
patrones de fragmentación para clases comunes de compuestos. Los iones con vidas del orden de
10 a 6 segundos se aceleran en la cámara de ionización antes de que tengan la oportunidad de
desintegrarse. Estos iones pueden desintegrarse en fragmentos mientras pasan a la región del
analizador del espectrómetro de masas. Los iones de fragmentos formados en ese punto tienen
una energía considerablemente más baja que los iones normales, ya que la porción no cargada del
ion original se lleva parte de la energía cinética que el ion recibió cuando se aceleró. Como
resultado, el
El ión fragmento producido en el analizador sigue una trayectoria de vuelo anormal en su camino
hacia el detector. Este ion aparece en una relación m / z que depende de su propia masa, así como
de la masa del ion original a partir del cual se formó. Tal ion da lugar a lo que se denomina un pico
de ion metaestable en el espectro de masas. Los picos de iones metaestables son generalmente
picos amplios, y con frecuencia aparecen en valores no integrales de m / z. La ecuación que
relaciona la posición del pico de ion metaestable en el espectro de masas con la masa del ion
original es
donde m * es la masa aparente del ion metaestable en el espectro de masas, m1 es la masa del ion
original a partir del cual se formó el fragmento, y m2 es la masa del ion del nuevo fragmento.
La sección 8.3 mostró que cuando un haz de electrones de alta energía incide en una corriente de
moléculas de muestra, se produce la ionización de los electrones de las moléculas. Los iones
resultantes, llamados iones moleculares, se aceleran, se envían a través de un campo magnético y
se detectan. Si estos iones moleculares tienen vidas de al menos 10-5 segundos, llegan al detector
sin romperse en fragmentos. Luego, el usuario observa la relación m / z que corresponde al ion
molecular para determinar el peso molecular de la molécula de muestra.
En la práctica, la determinación del peso molecular no es tan fácil como sugiere el párrafo
anterior. Primero, debe comprender que el valor de la masa de cualquier ion acelerado en un
espectrómetro de masas es su verdadera masa, la suma de las masas de cada átomo en ese único
ion, y no su peso molecular calculado a partir de pesos atómicos químicos. La escala química de los
pesos atómicos se basa en promedios ponderados de los pesos de todos los isótopos de un
elemento dado. El espectrómetro de masas puede distinguir entre masas de partículas con los
isótopos más comunes de los elementos y partículas con isótopos más pesados. En consecuencia,
las masas que se observan para los iones moleculares son las masas de las moléculas en las que
cada átomo está presente como su isótopo más común. En segundo lugar, las moléculas
sometidas a bombardeo por electrones pueden romperse en iones fragmentados. Como resultado
de esta fragmentación, los espectros de masas pueden ser bastante complejos, con picos que
aparecen en una variedad de relaciones m / z. Debe tener mucho cuidado para asegurarse de que
el pico sospechado sea, en efecto, el del ion molecular y no el de un ión fragmento. Esta distinción
se vuelve particularmente crucial cuando la abundancia del ion molecular es baja, como cuando el
ion molecular es bastante inestable y se fragmenta fácilmente. Las masas de los iones detectados
en el espectro de masas deben medirse con precisión. Un error de solo una unidad de masa en la
asignación de picos espectrales de masa puede imposibilitar la determinación de la estructura.
Un método para confirmar que un pico particular corresponde a un ion molecular es variar la
energía del haz de electrones ionizantes. Si se baja la energía del haz, disminuye la tendencia del
ion molecular a fragmentarse. Como resultado, la intensidad del pico de iones moleculares debería
aumentar al disminuir el potencial de electrones, mientras que las intensidades de los picos de
iones de fragmentos deberían disminuir. Ciertos hechos deben aplicarse a un pico de iones
moleculares:
1. El pico debe corresponder al ion de mayor masa en el espectro, excluyendo los picos isotópicos
que ocurren en las masas más altas. Los picos isotópicos suelen ser de mucha menor intensidad
que el
pico de iones moleculares. A las presiones de muestra utilizadas en la mayoría de los estudios
espectrales, la probabilidad de que los iones y las moléculas colisionen para formar partículas más
pesadas es bastante baja. Se debe tener cuidado, especialmente con los espectros GC-MS, para
reconocer los iones de fondo que son el resultado del sangrado de la columna, pequeños trozos de
la fase estacionaria a base de silicona de la columna capilar GC.
2. El ion debe tener un número impar de electrones. Cuando una molécula es ionizada por un haz
de electrones, pierde un electrón para convertirse en un catión radical. La carga en dicho ion es 1,
lo que lo convierte en un ion con un número impar de electrones.
3. El ion debe ser capaz de formar los iones de fragmentos importantes en el espectro,
particularmente los fragmentos de masa relativamente alta, por pérdida de fragmentos lógicos
neutros. Los iones de fragmentos en el rango de (M - 3) a (M - 14) y (M - 21) a (M - 25) no son
pérdidas razonables. Del mismo modo, ningún fragmento de ión puede contener un mayor
número de átomos de un elemento en particular que el ion molecular. La Sección 8.8 explicará los
procesos de fragmentación en detalle.
La abundancia observada del ión molecular sospechoso debe corresponder a las expectativas
basadas en la estructura molecular asumida. Las sustancias altamente ramificadas se fragmentan
muy fácilmente. Por lo tanto, la observación de un pico de iones moleculares intensos para una
molécula altamente ramificada sería poco probable. La vida útil de los iones moleculares varía
según la secuencia generalizada que se muestra en la página 440.
Otra regla que a veces se usa para verificar que un pico dado corresponde al ion molecular es la
llamada Regla de Nitrógeno. Esta regla establece que si un compuesto tiene un número par de
átomos de nitrógeno (cero es un número par), su ion molecular aparecerá en un valor de masa
par. Por otro lado, una molécula con un número impar de átomos de nitrógeno formará un ion
molecular con una masa impar. La regla del nitrógeno se deriva del hecho de que el nitrógeno,
aunque tiene una masa par, tiene una valencia impar. En consecuencia, se incluye un átomo de
hidrógeno adicional como parte de la molécula, dándole una masa extraña. Para imaginar este
efecto, considere la etilamina, CH3CH2NH2. Esta sustancia tiene un átomo de nitrógeno, y su masa
es un número impar (45), mientras que la etilendiamina, H2NCH2CH2NH2, tiene dos átomos de
nitrógeno, y su masa es un número par (60).
Debe tener cuidado al estudiar las moléculas que contienen átomos de cloro o bromo, ya que
estos elementos tienen dos isótopos comunes. El cloro tiene isótopos de 35 (abundancia relativa =
75.77%) y 37 (abundancia relativa = 24.23%); el bromo tiene isótopos de 79 (abundancia relativa =
50.5%) y 81 (abundancia relativa = 49.5%). Cuando estos elementos están presentes, tenga
especial cuidado de no confundir el pico de iones moleculares con un pico correspondiente al ion
molecular con un isótopo halógeno más pesado presente. Esto se discute más a fondo en la
Sección 8.7B. En muchos de los casos que es probable que encuentre en la espectrometría de
masas, el ion molecular se puede observar en el espectro de masas. Una vez que haya identificado
ese pico en el espectro, se resuelve el problema de la determinación del peso molecular. Sin
embargo, con las moléculas que forman iones moleculares inestables, es posible que no observe el
pico de iones moleculares. Iones moleculares con vidas inferiores a
10–5 segundos se dividen en fragmentos antes de que puedan acelerarse. Los únicos picos que se
observan en tales casos son los debidos a fragmentos de iones. En muchos de estos casos, el uso
de un método de CI leve permitirá la detección del ion pseudomolecular (M + H) +, y se puede
determinar el peso molecular del compuesto simplemente restando una unidad de masa para el
átomo de H adicional presente. Si este método no puede detectar un ion molecular, entonces
usted estará obligado a deducir el peso molecular de la sustancia a partir del patrón de
fragmentación sobre la base de patrones conocidos de fragmentación para ciertas clases de
compuestos. Por ejemplo, los alcoholes sufren deshidratación muy fácilmente. En consecuencia, el
ion molecular formado inicialmente pierde agua (masa = 18) como un fragmento neutro antes de
que pueda acelerarse hacia el analizador de masa. Para determinar la masa de un ion molecular de
alcohol, debe localizar el fragmento más pesado y tenga en cuenta que puede ser necesario
agregar 18 a su masa. Del mismo modo, los ésteres de acetato sufren fácilmente la pérdida de
ácido acético (masa = 60). Si se pierde ácido acético, el peso del ion molecular es 60 unidades de
masa más alto que la masa del fragmento más pesado. Como los compuestos de oxígeno forman
iones de oxonio bastante estables y los compuestos de nitrógeno forman iones de amonio, las
colisiones de iones y moléculas forman picos en el espectro de masas que aparecen una unidad de
masa más alta que la masa del ion molecular. Esto se denominó auto-CI en la discusión del
analizador de masas con trampa de iones en la Sección 8.4. A veces, la formación de productos de
moléculas de iones puede ser útil en la determinación del peso molecular de un compuesto de
oxígeno o nitrógeno, pero este auto-IC a veces puede ser confuso cuando uno está tratando de
determinar el verdadero ion molecular en un espectro de Una muestra desconocida.
Los métodos químicos dan resultados que son exactos a solo dos o tres cifras significativas (± 0.1%
a 1%). Los pesos moleculares determinados por espectrometría de masas tienen una precisión de
aproximadamente ± 0,005%. Claramente, la espectrometría de masas es mucho más precisa que
los métodos químicos para determinar el peso molecular. Los valores de masa precisos para
algunos elementos comúnmente encontrados se pueden encontrar en la Tabla 8.4.
La sección anterior describe un método para determinar fórmulas moleculares utilizando datos de
espectrómetros de masas de alta resolución. Otro método para determinar fórmulas moleculares
es examinar las intensidades relativas de los picos debido al ion molecular y los iones relacionados
que llevan uno o más isótopos pesados (el grupo de iones moleculares). Este método no sería
utilizado comúnmente por investigadores que tienen un espectrómetro de masas de alta
resolución a su disposición o pueden enviar sus muestras a un laboratorio de servicio para un
análisis de masa exacto. Sin embargo, el uso del grupo de iones moleculares puede ser útil para
una determinación relativamente rápida de la fórmula molecular que no requiere el instrumento
de alta resolución mucho más costoso. Este método es inútil, por supuesto, cuando el pico de
iones moleculares es muy débil o no aparece. A veces, los picos isotópicos que rodean el ion
molecular son difíciles de localizar en el espectro de masas, y los resultados obtenidos por este
método a veces pueden ser ambiguos.
El ejemplo de etano (C2H6) puede ilustrar la determinación de una fórmula molecular a partir de
una comparación de las intensidades de los picos espectrales de masas del ion molecular y los
iones que llevan isótopos más pesados. El etano tiene un peso molecular de 30 cuando contiene
los isótopos más comunes de carbono e hidrógeno. Su pico de iones moleculares debería aparecer
en una posición en el espectro correspondiente a m / z = 30. Sin embargo, ocasionalmente, una
muestra de etano produce una molécula en la que uno de los átomos de carbono es un isótopo
pesado de carbono, 13C. Esta molécula aparecería en el espectro de masas en m / z = 31.
Un pico que aparece dos unidades de masa más alto que la masa del pico de iones moleculares se
llama pico M + 2. La intensidad del pico M + 2 de etano es solo el 0.01% de la intensidad del pico
de iones moleculares. La contribución debida a dos átomos de deuterio que reemplazan a los
átomos de hidrógeno sería (0.016 × 0.016) / 100 = 0.00000256%, una cantidad insignificante. Para
ayudar en la determinación de las proporciones de los picos de iones moleculares, M + 1 y M + 2,
la Tabla 8.5 enumera las abundancias naturales de algunos elementos comunes y sus isótopos. En
esta tabla, las abundancias relativas de los isótopos de cada elemento se calculan estableciendo
las abundancias de los isótopos más comunes en 100. Para demostrar cómo las intensidades de los
picos M + 1 y M + 2 proporcionan un valor único para un determinado fórmula molecular,
considere dos moléculas de masa 42, propeno (C3H6) y diazometano (CH2N2). Para el propeno, la
intensidad del pico M + 1 debe ser (3 × 1.08) + (6 × 0.016) = 3.34%, y la intensidad del pico M + 2
debe ser 0.05%. La abundancia natural de isótopos de nitrógeno 15N es del 0,38% de la
abundancia de átomos de 14N. En diazometano, esperamos que la intensidad relativa del pico M +
1 sea 1.08 + (2 × 0.016) + (2 × 0.38) = 1.87% de la intensidad del pico de iones moleculares y la
intensidad del pico M + 2 sería 0.01% de la intensidad del pico de iones moleculares. La Tabla 8.6
resume estas relaciones de intensidad. Muestra que las dos moléculas tienen casi el mismo peso
molecular, pero las intensidades relativas de los picos M + 1 y M + 2 que producen son bastante
diferentes.
Como ilustración adicional, la Tabla 8.7 compara las relaciones de los picos de iones moleculares,
M + 1 y M + 2 para tres sustancias de masa 28: monóxido de carbono, nitrógeno y eteno.
Nuevamente, observe que las intensidades relativas de los picos M + 1 y M + 2 proporcionan un
medio para distinguir entre estas moléculas.
A medida que las moléculas se vuelven más grandes y complejas, aumenta el número de
combinaciones posibles que producen picos M + 1 y M + 2. Para una combinación particular de
átomos, las intensidades de estos picos en relación con la intensidad del pico de iones moleculares
son únicas. Por lo tanto, el método de relación de isótopos puede usarse para establecer la
fórmula molecular de un compuesto. El examen de la intensidad del pico M + 2 también es útil
para obtener información sobre los elementos que pueden estar presentes en la fórmula
molecular. Un pico de M + 2 inusualmente intenso puede indicar que hay azufre o silicio en la
sustancia desconocida. Las abundancias relativas de 33S y 34S son 0.78 y 4.40, respectivamente, y
la abundancia relativa de 30Si es 3.35. Un químico entrenado sabe que un pico de M + 2 mayor de
lo normal puede ser el primer indicio de que hay azufre o silicio. El cloro y el bromo también
tienen importantes isótopos M + 2, y se analizan por separado a continuación.
Ecuación 8.26.
Cuando hay cloro o bromo, el pico M + 2 se vuelve muy significativo. El isótopo pesado de cada
uno de estos elementos es dos unidades de masa más pesado que el isótopo más ligero. La
abundancia natural de 37Cl es 32.5% la de 35Cl, y la abundancia natural de 81Br es 98.0% la de
79Br. Cuando cualquiera de estos elementos está presente, el pico M + 2 se vuelve bastante
intenso. Si un compuesto contiene dos átomos de cloro o bromo, se debe observar un pico M + 4
distinto, así como un pico M + 2 intenso. En tal caso, es importante tener cuidado al identificar el
pico de iones moleculares en el espectro de masas. La Sección 8.8V discutirá las propiedades
espectrales de masas de los compuestos de halógeno orgánicos en mayor detalle. La Tabla 8.8
proporciona las intensidades relativas de los picos de isótopos para varias combinaciones de
átomos de bromo y cloro, y la Figura 8.18 los ilustra.
8.8 ANÁLISIS ESTRUCTURAL Y PATRONES DE FRAGMENTACIÓN
No se puede llegar muy lejos en la discusión sobre la fragmentación de iones sin considerar
primero qué electrón se pierde en el evento de ionización inicial para formar M • +. Los electrones
que tienen más probabilidades de ser expulsados durante el evento de ionización son los que se
encuentran en los orbitales moleculares de energía de mayor potencial, es decir, los electrones
menos apretados por la molécula. Por lo tanto, es más fácil eliminar un electrón de un orbital n no
enlazante que quitar un electrón de un orbital π. Del mismo modo, es mucho más fácil expulsar un
electrón de un orbital π en comparación con un orbital σ. El ion molecular se puede representar
con un sitio de carga localizado o no localizado. A continuación se muestran algunos ejemplos de
pérdida de un electrón y la notación para el ion molecular.
Los anillos de seis miembros no saturados pueden sufrir una fragmentación retro de Diels-Alder
para producir el catión radical de un dieno y un alqueno neutro, los hipotéticos precursores del
derivado de ciclohexeno si se hubiera preparado en dirección directa a través del dieno [4π + 2π] +
cicloadición dienophile conocida por cada químico orgánico como la reacción Diels-Alder. En la
Figura 8.22 se muestra una representación esquemática de la fragmentación retro de Diels-Alder.
Observe que el electrón y la carga no apareados permanecen con el fragmento de dieno de
acuerdo con la Regla de Stevenson.
G. Reorganizaciones de McLafferty
Otra fragmentación muy común que puede ocurrir con muchos sustratos es el reordenamiento de
McLafferty (Fig. 8.23). Esta fragmentación fue descrita por primera vez por Fred McLafferty en
1956 y es una de las fragmentaciones más predecibles, junto a la simple escisión α. En la
reorganización de McLafferty, un átomo de hidrógeno en un átomo de carbono 3 alejado del
catión radical de un alqueno, areno, carbonilo o imina (un denominado γ-hidrógeno) se transfiere
al sitio de carga a través de un estado de transición de seis miembros , con división simultánea del
enlace sigma entre las posiciones α y β de la correa. Esto forma un nuevo catión radical y un
alqueno con un enlace π entre lo que
Además de estos procesos, también son posibles procesos de fragmentación que implican
reordenamientos, migraciones de grupos y fragmentaciones secundarias de iones de fragmentos.
Estos modos de fragmentación ocurren con menos frecuencia que los dos casos ya descritos, y la
discusión adicional de ellos se reservará para los compuestos en los que son importantes. Para
ayudarlo a identificar posibles iones de fragmentos, el Apéndice 12 proporciona una tabla que
enumera las fórmulas moleculares para fragmentos comunes con m / z menor que 105. Se pueden
encontrar tablas más completas en los libros enumerados en las referencias al final de este
capítulo.
I. alcanos
Para los hidrocarburos saturados y las estructuras orgánicas que contienen grandes esqueletos de
hidrocarburos saturados, los métodos de fragmentación son bastante predecibles. Lo que se sabe
sobre la estabilidad de los carbocationes en solución puede usarse para ayudarnos a comprender
los patrones de fragmentación de los alcanos. Los espectros de masas de los alcanos se
caracterizan por fuertes picos de iones moleculares y una serie regular de picos de iones
fragmentados separados por 14 amu. Para un alcano de cadena lineal o "normal", se puede
observar un pico correspondiente al ion molecular como en los espectros de masas de butano (Fig.
8.24) y octano (Fig. 8.25). A medida que el esqueleto de carbono se ramifica más, la intensidad del
pico de iones moleculares disminuye. Los alcanos de cadena recta tienen fragmentos que siempre
son carbocationes primarios. Como estos iones son bastante inestables, no se favorece la
fragmentación.
Un número significativo de las moléculas originales sobrevive al bombardeo electrónico sin
fragmentarse. En consecuencia, se observa un pico de iones moleculares de intensidad
significativa. Verá este efecto fácilmente si compara el espectro de masa del butano con el del
isobutano (Fig. 8.26). El pico de iones moleculares en isobutano es mucho menos intenso que el
del butano. La comparación de los espectros de masas de octano y 2,2,4-trimetilpentano (Fig.
8.27) proporciona una ilustración más dramática del efecto de la ramificación de la cadena sobre
la intensidad del pico de iones moleculares.
El pico de iones moleculares en el 2,2,4-trimetilpentano es demasiado débil para ser observado,
mientras que el pico de iones moleculares en su isómero de cadena lineal se observa con bastante
facilidad. El efecto de la ramificación de la cadena sobre la intensidad del pico de iones
moleculares puede entenderse examinando el método por el cual los hidrocarburos sufren
fragmentación.
Los hidrocarburos de cadena recta sufren fragmentación al romper los enlaces carbono-carbono,
lo que resulta en una serie homóloga de productos de fragmentación. Por ejemplo, en el caso del
butano, la escisión del enlace C1IC2 da como resultado la pérdida de un radical metilo y la
formación del carbocatión propilo (m / z = 43). La escisión del enlace C2IC3 da como resultado la
pérdida de un radical etilo y la formación del carbocatión etílico (m / z = 29). En el caso del octano,
los picos de fragmentos se deben al ion hexilo (m / z = 85), el ion pentilo (m / z = 71), el ion butilo
(m / z = 57), el ion propilo (m / z = 43), y se observa el ion etilo (m / z = 29). Observe que los
alcanos se fragmentan para formar grupos de picos que son 14 unidades de masa
(correspondientes a un grupo CH2) separadas entre sí. Otros fragmentos dentro de cada grupo
corresponden a pérdidas adicionales de uno o dos átomos de hidrógeno. Como es evidente en el
espectro de masas de octano, los iones de tres carbonos parecen ser los más abundantes, con las
intensidades de cada grupo disminuyendo uniformemente al aumentar el peso del fragmento.
Curiosamente, para los alcanos de cadena larga, el fragmento correspondiente a la pérdida de un
átomo de carbono generalmente está ausente. En el espectro de masas de octano, un fragmento
de siete carbonos debe ocurrir a una masa de 99, pero no es observado. La escisión de los enlaces
carbono-carbono de los alcanos de cadena ramificada puede conducir a carbohidratos secundarios
o terciarios. Estos iones son más estables que los iones primarios, por supuesto, por lo que la
fragmentación se convierte en un proceso más favorable. Una mayor proporción de las moléculas
originales sufre fragmentación, por lo que los picos de iones moleculares de los alcanos de cadena
ramificada son considerablemente más débiles o incluso ausentes. En el isobutano, la escisión de
un enlace carbono-carbono produce un carbocatión isopropílico, que es más estable que un ion
propilo normal. El isobutano se fragmenta más fácilmente que el butano debido a la mayor
estabilidad de sus productos de fragmentación. Con el 2,2,4-trimetilpentano, el evento de escisión
dominante es la ruptura del enlace C2-C3, lo que conduce a la formación de un carbocatión terc-
butílico. Dado que los carbocationes terciarios son los carbohidratos de alquilo saturados más
estables, esta división es particularmente favorable y explica el pico de fragmento intenso a m / z =
57.
J. cicloalcanos
Aplicando estos datos al espectro de masas del biciclo [2.2.l] heptano (Fig. 8.30), podemos
identificar picos de fragmentos debido a la pérdida de la cadena lateral (el puente de un carbono,
más un átomo de hidrógeno adicional) en m / z = 81 y la pérdida de eteno en m / z = 68. El pico de
ión fragmento en m / z = 67 se debe a la pérdida de eteno más un átomo de hidrógeno adicional.
K. Alquenos
Los espectros de masas de la mayoría de los alquenos muestran picos de iones moleculares
distintos. Naturalmente, la masa del ion molecular debe corresponder a una fórmula molecular
con un índice de deficiencia de hidrógeno igual a al menos uno (ver Capítulo 1). Aparentemente, el
bombardeo de electrones elimina uno de los electrones en el enlace π, dejando el esqueleto de
carbono relativamente intacto. Cuando los alquenos se someten a procesos de fragmentación, los
iones de fragmentos resultantes tienen fórmulas correspondientes a CnH2n + y CnH2n − 1 +. A
veces es difícil localizar dobles enlaces en los alquenos, ya que migran fácilmente. La similitud de
los espectros de masas de los isómeros de alquenos se ve fácilmente en los espectros de masas de
tres isómeros de la fórmula C5H10 (figuras 8.31, 8.32 y 8.33). Los espectros de masas son casi
idénticos, con la única diferencia de ser un fragmento grande a m / z = 42 en el espectro de 1-
penteno. Es probable que este ion se forme a través de la pérdida de etileno a través de una
reordenación del tipo molecular del ion McLafferty.
El carbocatión alílico (m / z = 41) es un fragmento importante en el espectro de masas de los
alquenos terminales y se forma a través de una escisión α alílica como se muestra en la Figura
8.19. El fragmento en m / z = 55 proviene de la pérdida de un radical metilo. Este fragmento es el
pico base en los espectros de los isómeros de penteno diastereoméricos, ya que la pérdida del
grupo metilo distal al alqueno crea un catión alílico estabilizado por resonancia.
Los espectros de masas de los cicloalquenos muestran picos de iones moleculares bastante
distintos. Para muchos cicloalquenos, la migración de enlaces proporciona espectros de masas
prácticamente idénticos. En consecuencia, puede ser imposible localizar la posición del doble
enlace en un cicloalqueno, particularmente un ciclopenteno o un ciclohepteno. Los ciclohexenos
tienen un patrón de fragmentación característico que corresponde a una reacción retro de Diels-
Alder (Fig. 8.22). En el espectro de masa del monoterpeno limoneno (Fig. 8.34), el pico intenso a m
/ z = 68 corresponde al fragmento de dieno que surge de la fragmentación retro de Diels-Alder. La
mera presencia de un resto ciclohexeno no garantiza que se observe una fragmentación retro de
Diels-Alder en el espectro de masas. Considere los espectros de masas de la ionona α y β (figura
8.35). El espectro de la α-ionona muestra mucha más fragmentación en general y un pico a m / z =
136 en particular, creado por una fragmentación retro de Diels-Alder del anillo de ciclohexeno y la
pérdida de isobuteno. La fragmentación de Retro Diels-Alder de β-ionona debería dar un pico a
m / z = 164 por pérdida de eteno, pero el pico en esa posición es minúsculo. En el caso de la β-
ionona, la pérdida de un radical metilo a través de la escisión α adyacente al doble enlace del
anillo produce un catión alílico terciario relativamente estable. Esta fragmentación no está
disponible para la α-ionona.
El carbocatión alílico (m / z = 41) es un fragmento importante en el espectro de masas de los
alquenos terminales y se forma a través de una escisión α alílica como se muestra en la Figura
8.19. El fragmento en m / z = 55 proviene de la pérdida de un radical metilo. Este fragmento es el
pico base en los espectros de los isómeros de penteno diastereoméricos, ya que la pérdida del
grupo metilo distal al alqueno crea un catión alílico estabilizado por resonancia.
L. Alquinos
Los espectros de masas de los alquinos son muy similares a los de los alquenos. Los picos de iones
moleculares tienden a ser bastante intensos, y los patrones de fragmentación son paralelos a los
de los alquenos. Como puede verse en el espectro de masas de 1-pentino (Fig. 8.36), una
fragmentación importante es la pérdida de un radical etilo a través de una escisión α para producir
el ion propargilo (m / z = 39). De manera similar, la pérdida de radicales metilo en una escisión α
de 2-pentino produce un catión propargílico estabilizado por resonancia en (m / z = 53) (Fig. 8.37).
Otro modo importante de fragmentación para los alquinos terminales es la pérdida del hidrógeno
terminal, produciendo un fuerte pico M - 1. Este pico aparece como el pico base (m / z = 67) en el
espectro de 1-pentino.
M. hidrocarburos aromáticos
Los espectros de masas de la mayoría de los hidrocarburos aromáticos muestran picos de iones
moleculares muy intensos. Como es evidente por el espectro de masas del benceno (Fig. 8.38), la
fragmentación del anillo de benceno requiere una gran cantidad de energía. Tal fragmentación no
se observa en ningún grado significativo. En el espectro de masas de tolueno (Fig. 8.39), la pérdida
de un átomo de hidrógeno del ion molecular da un pico fuerte a m / z = 91. Aunque podría
esperarse que este pico de iones de fragmentos se deba a la carbonato de bencilo (C6H5CH2 +) ,
los experimentos de etiquetado de isótopos sugieren que el carbocatión bencílico realmente se
reorganiza para formar el ión de tropilo desocalizado aromático (C7H7 +, Figura 8.43). Cuando un
anillo de benceno contiene cadenas laterales más grandes, un modo preferido de fragmentación
es la escisión de la cadena lateral para formar inicialmente un catión bencilo, que se reorganiza
espontáneamente al ion tropylium. Cuando la cadena lateral unida a un anillo de benceno
contiene tres o más carbonos, se pueden observar iones formados por un reordenamiento de
McLafferty.
Los espectros de masas de los isómeros de xileno (Figs. 8.40 y 8.41, por ejemplo) muestran un pico
medio a m / z = 105, que se debe a la pérdida de un átomo de hidrógeno y la formación del ion
metiltropilio. Más importante aún, el xileno pierde un grupo metilo para formar el tropylium (m / z
= 91). Los espectros de masas de los anillos aromáticos orto, meta y para disustituidos son
esencialmente idénticos. Como resultado, el patrón de sustitución de los bencenos polialquilados
no puede determinarse por espectrometría de masas.
La formación de un ion tropylium sustituido es típica para los bencenos sustituidos con alquilo. En
el espectro de masas del isopropilbenceno (Fig. 8.42), aparece un pico fuerte a m / z = 105. Este
pico corresponde a la pérdida de un grupo metilo para formar un ión de tropylium sustituido con
metilo. El ion tropylium tiene fragmentaciones características propias. El ion tropylium puede
fragmentarse para formar el catión ciclopentadienil aromático (m / z = 65) más etino (acetileno). El
catión ciclopentadienilo a su vez puede fragmentarse para formar otro equivalente de etino y el
catión ciclopropenilo aromático (m / z = 39) (Fig. 8.43).
En el espectro de masas de butilbenceno (Fig. 8.44), aparece un pico fuerte debido al ion
tropylium en m / z = 91. Cuando el grupo alquilo unido al anillo de benceno es un grupo propilo o
más grande, es probable que una reordenación de McLafferty ocurren, produciendo un pico a m /
z = 92. De hecho, todos los alquilbencenos que llevan una cadena lateral de tres o más carbonos y
al menos un hidrógeno en el carbono γ exhibirán un pico a m / z = 92 en sus espectros de masas de
El reordenamiento de McLafferty.
Usando butilbenceno como ejemplo, esta reorganización se muestra a continuación.
N. Alcoholes y fenoles
El espectro de masas de los isómeros de pentanol de cadena lineal, 1-pentanol (Fig. 8.45), 2-
pentanol (Figura 8.46) y 3-pentanol (Fig. 8.47) exhiben picos de iones moleculares muy débiles a m
/ z = 88, mientras que el ion molecular en el espectro de masas del alcohol terciario 2-metil-2-
butanol (Fig. 8.48) está completamente ausente. La reacción de fragmentación más importante
para los alcoholes es la pérdida de un grupo alquilo a través de la escisión α. Como se discutió
anteriormente, el grupo alquilo más grande se pierde más fácilmente. En el espectro de 1-
pentanol (Fig. 8.45), el pico a m / z = 31 se debe a la pérdida de un grupo butilo para formar un ion
H2CJOH +. El 2-Pentanol (Fig. 8.46) pierde un grupo propilo para formar el fragmento CH3CHJOH +
en m / z = 45 o un radical metilo para formar el pico relativamente pequeño en m / z = 73
correspondiente a CH3CH2CH2CHJOH +. El 3-Pentanol pierde un radical etilo para formar el ion
CH3CH2CHJOH + en m / z = 59. La simetría del 3-pentanol significa que hay dos caminos idénticos
de escisión α, lo que hace que el pico correspondiente a ese ion sea aún más frecuente. El 2-metil-
2-butanol (Fig. 8.48) sufre una escisión α para perder un radical metilo de dos maneras diferentes,
creando un pico de tamaño considerable en m / z = 73 además del pico en m / z = 59
correspondiente a la (CH3) 2CJOH + ion formado por la pérdida de un radical etilo.
Un segundo modo común de fragmentación implica la deshidratación. La importancia de la
deshidratación aumenta a medida que aumenta la longitud de la cadena del alcohol. Si bien el pico
de iones de fragmentos resultante de la deshidratación (m / z = 70) es muy intenso en el espectro
de masas de 1-pentanol, es bastante débil en los otros isómeros de pentanol. La deshidratación
puede ocurrir por deshidratación térmica antes de la ionización o por fragmentación del ion
molecular. La deshidratación térmica es especialmente problemática para las muestras de alcohol
analizadas por GC-MS. El puerto de inyección del cromatógrafo de gases generalmente se
mantiene a más de 200 ° C, y muchos alcoholes, especialmente terciarios o alílicos / bencílicos, se
deshidratarán antes de que las moléculas de la muestra lleguen incluso a la columna GC y
ciertamente antes de que las moléculas lleguen a la fuente de iones del espectrómetro de masas.
La deshidratación térmica es una eliminación de agua 1,2. Sin embargo, si las moléculas de alcohol
alcanzan la fuente de iones intacta, la deshidratación del ión molecular aún puede ocurrir, pero en
este caso es una eliminación de agua por 1,4 mediante un mecanismo cíclico:
Los alcoholes que contienen cuatro o más carbonos pueden sufrir la pérdida simultánea de agua y
etileno. Este tipo de fragmentación no es prominente para el 1-butanol, pero es responsable del
pico base en m / z = 42 en el espectro de masas del 1-pentanol (Fig. 8.45).
Los alcoholes cíclicos pueden sufrir fragmentación por al menos tres vías diferentes, y estos se
ilustran para el caso del ciclohexanol en la figura 8.49. La primera fragmentación es simplemente
una escisión α y la pérdida de un átomo de hidrógeno para producir un ion fragmento M - 1. La
segunda ruta de fragmentación comienza con una escisión α inicial de un enlace de anillo
adyacente al carbono que contiene hidroxilo, seguido de una migración de 1,5-hidrógeno. Esto
mueve el sitio radical nuevamente a una posición estabilizada por resonancia adyacente al ion
oxonio. Una segunda división α da como resultado la pérdida de un radical propilo y la formación
de un ión acroleína protonado con m / z = 57. Esta ruta de fragmentación es casi idéntica a la que
funciona con derivados de ciclohexanona (Sección 8.8Q).
Los éteres alifáticos tienden a presentar picos de iones moleculares que son más fuertes que los
de los alcoholes con los mismos pesos moleculares. Sin embargo, los picos de iones moleculares
de los éteres siguen siendo bastante débiles.
Los modos principales de fragmentación incluyen la escisión α, la formación de fragmentos de
carbocatión a través de la escisión inductiva (escisión β) y la pérdida de radicales alcoxi.
La fragmentación de los éteres es algo similar a la de los alcoholes. En el espectro de masas del
diisopropil éter (Fig. 8.54), una escisión α da lugar a un pico a m / z = 87 debido a la pérdida de un
radical metilo Un segundo modo de fragmentación implica la escisión del enlace carbono-oxígeno
de un éter para producir un radical isopropoxilo y un carbocatión isopropílico. La escisión de este
tipo en diisopropil éter es responsable del fragmento C3H7 + en m / z = 43. Un tercer tipo de
fragmentación se produce como una reacción de reordenamiento de uno de los iones del
fragmento en lugar del ion molecular en sí. La reorganización implica la transferencia de un
hidrógeno β al ion oxonio con la formación concurrente de un alqueno. Este tipo de
reordenamiento se ve particularmente favorecido cuando el carbono α del éter está ramificado.
En el caso del diisopropil éter, este reordenamiento da lugar a un fragmento (HOJCHCH3) + a m / z
= 45.
El espectro de masas del di-sec-butil éter (Fig. 8.55) muestra las mismas fragmentaciones. Sin
embargo, hay dos posibles divisiones α en este compuesto. La pérdida de un radical metilo da el
pico M-15 muy pequeño a m / z = 115, pero la pérdida del radical etilo más grande da el pico
sustancialmente más grande a m / z = 101. La escisión inductiva del enlace CIO crea un sec-butilo
catión en m / z = 57. El reordenamiento adicional de los productos de escisión α produce iones en
m / z = 45 y 59, correspondientes a (HOJCHCH3) + y (HOJCHCH2CH3) +, respectivamente.
Los acetales y los cetales se comportan de manera muy similar a los éteres. Sin embargo, la
fragmentación es aún más favorable en acetales y cetales que en éteres, por lo que el pico de
iones moleculares de un acetal o cetal puede ser extremadamente débil o totalmente ausente. Por
ejemplo, en el espectro de masas de 2-etil-2-metil-1, 3-dioxolano (el etileno cetal de metil etil
cetona), el ion molecular no es visible (Fig. 8.56).
El pico de masa más alto está en m / z = 101 por la pérdida de un radical metilo a través de la
escisión α, y una escisión α alternativa produce el pico grande en m / z = 87 formado por la
pérdida de un radical etilo. El pico base en el espectro se encuentra en m / z = 43, típico de 2-
metil-1,3-dioxolanos.
Los éteres aromáticos pueden sufrir reacciones de escisión que implican la pérdida del grupo
alquilo para formar iones C6H5O +. Estos iones fragmentarios pierden monóxido de carbono para
formar cationes ciclopentadienilo (C5H5 +). Además, un éter aromático puede perder todo el
grupo alcoxi para producir cationes fenilo (C6H5 +). El espectro de masas del etil 4-metilfenil éter
(p-metilfenetol) exhibe un ión molecular fuerte a m / z = 136, así como un fragmento a m / z = 107
por la pérdida de un radical etilo (Fig. 8.57). El pico base en m / z = 108 surge de la pérdida de
eteno a través de un reordenamiento de McLafferty.
P. Aldehídos
Los aldehídos aromáticos también exhiben picos de iones moleculares intensos, y la pérdida de un
átomo de hidrógeno a través de la escisión α es un proceso muy favorable. El pico M - 1 resultante
puede en algunos casos ser más intenso que el pico de iones moleculares. En el espectro de masas
de benzaldehído (Fig. 8.59), el pico M - 1 aparece en m / z = 105. Observe también el pico en m / z
= 77, que corresponde al catión fenilo formado por la pérdida del radical formilo.
Q. Cetonas
Los espectros de masas de las cetonas muestran un pico de iones moleculares intenso. La pérdida
de los grupos alquilo unidos al grupo carbonilo es uno de los procesos de fragmentación más
importantes. El patrón de fragmentación es similar al de los aldehídos. La pérdida de grupos
alquilo por medio de la escisión α es un modo importante de fragmentación, y el mayor de los dos
grupos alquilo unidos al grupo carbonilo parece más probable que se pierda, de acuerdo con la
Regla de Stevenson.
El ion formado a partir de este tipo de escisión α en cetonas (y aldehídos) es el ion acilio (RCKO +).
En el espectro de masas de 2-butanona (Fig. 8.60), el pico a m / z = 43 es más intenso que el pico a
m / z = 57, lo que se debe a la pérdida del grupo metilo. De manera similar, en el espectro de
masas de 2-octanona (Fig. 8.61) la pérdida del grupo hexilo, que da un pico en m / z = 43, es más
probable que la pérdida del grupo metilo, que da el pico débil en m / z = 113.
Cuando el grupo carbonilo de una cetona le ha unido al menos un grupo alquilo que tiene una
longitud de tres o más átomos de carbono, es posible un reordenamiento de McLafferty. El pico a
m / z = 58 en el espectro de masas de 2-octanona se debe al fragmento de ion que resulta de esta
reorganización.
Las cetonas cíclicas pueden sufrir una variedad de procesos de fragmentación y reordenamiento. A
continuación se resumen los procesos para el caso de la ciclohexanona. En el espectro de masas
de ciclohexanona aparece un pico de iones de fragmentos correspondiente a cada proceso (figura
8.62).
Las cetonas aromáticas se someten a la escisión α para perder el grupo alquilo y formar el ion
fenilacilo (C6H5CO +, m / z = 105). Este ion puede sufrir fragmentación secundaria para perder
monóxido de carbono, formando el ion C6H5 + (m / z = 77). Estos picos aparecen
prominentemente en el espectro de masas de acetofenona (Fig. 8.63). Con grupos alquilo más
grandes unidos al grupo carbonilo de una cetona aromática, es probable un reordenamiento del
tipo McLafferty, y el reordenamiento puede ocurrir al carbonilo y al anillo aromático. En el caso de
la butirofenona, la reordenación de McLafferty en el anillo aromático produce el fragmento visto
en m / z = 106, y la reordenación en el carbonilo da el fragmento en m / z = 120 (Fig. 8.64). El ion
fragmento m / z = 120 puede sufrir una escisión α adicional para producir el ion C6H5CO + a m / z
= 105.
R. Esters
Los ésteres de bencilo se reorganizan para eliminar una molécula de queteno neutro y el catión
radical del alcohol bencílico a m / z = 108. El ión resultante es a menudo el pico más intenso en el
espectro de masas de dicho compuesto. Esta fragmentación es dominante en el espectro de masas
del laurato de bencilo, junto con el catión de bencilo / ión de tropylium a m / z = 91 (Fig. 8.67).
Otros fragmentos de alta masa en el espectro de laurato de bencilo incluyen un pico a m / z = 199
por pérdida de un radical bencilo y el pico a m / z = 183 por pérdida de radical benciloxi por
escisión α.