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PROTEÍNA: LA HEMOGLOBINA

1. ¿Por cuantas cadenas polipeptídicas esta formada la hemoglobina? Presente una


grafica en la que cada cadena polipeptídica este coloreada de un color distinto Indicar
que pasos siguió

La hemoglobina consta de 4 cadenas polipeptídicas por cual es una estructura


tetrámera esta tiene dos subunidades alfa y 2 subunidades beta.
Primero se tiene que buscar la proteína en Protein Data Bank en este caso es la
Hemoglobina humana para ser más específicos es el 1A3N luego se le descarga en el
botón Download Files en la opción PDB Format , luego de haberlo guardado se abre el
programa (Swiss -Pdb 4.1) que antes habíamos descargado entonces una vez la
proteína en el programa, en la parte superior de las barras poner la opción Wind
donde aparecerán varias opciones de la cual se buscara la opción Control Panel, en
esa herramienta de acuerdo a la pregunta nos piden las cadenas polipeptídicas
entonces hay 4 grupos que aparecerán como A,B,C,D , entonces para colorear primero
seleccionar en el grupo A donde nos seleccionara todo ese grupo, luego ponemos la
opción Col que es para escoger el color que se pintara el grupo en este caso fue de
color celeste el Grupo A, después se pone solo la opción Show (+) para agregar solo
cadenas polipeptídicas y poder distinguirlas con los colores que escojamos y así
sucesivamente con los demás grupos, en el grupo B se coloreo de amarillo, el grupo C
de verde y por último el grupo D de rosado.
2.El grupo Hem está presente en la estructura, ¿Cuántas puede visualizar?

Hay 4 grupos Hem en este caso el grupo Hem esta de color rojo

4.

Cada grupo HEM interactúa con dos residuos de Histidina: una distal y otra proximal.
Indique y muestre con un gráfico claro la histidina distal y proximal, indicando el
número de aminoácido que este representa, el tipo de interacción y con qué átomo del
grupo HEM sucede dicha interacción.
Primero se sabe que la hemoglobina cuenta con 4 cadenas polipeptídicas de las cuales se tiene
también 4 grupos hem este tiene al Fe +2 este está dentro del plano del grupo hem por lo cual
va a formar cuatro enlaces coordinados con el nitrógeno del anillo pirrólico , el Fe +2 también va
a formar enlaces coordinados con una molécula de oxígeno, el ultimo o sexto enlace
coordinado que forma el Fe+2 lo hace con el nitrógeno de la cadena lateral de la histidina
proximal, la histidina distal no forma enlace con el Fe +2 pues como su nombre lo dice está más
alejada del ion.
A continuación se colorearon a los grupos hem de cada cadena polipetidica:
La cadena A (color celeste) y la cadena C (verde) la histidina proximal de estas dos es la HIS87 y
la histidina distal es HIS 58.
La cadena B (amarillo) y la cadena D (rosado) la histidina proximal de estas dos es la HIS92 y la
histidina distal es la HIS63