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Genética de poblaciones

Antecedentes

Darwin-Wallace + redescubrimiento de la
herencia de caracteres de Mendel =
La variación genética es la base de la
evolución.

Enlace del concepto de genes y alelos con


la teoría de la evolución
Antecedentes

s. XX: G. Hardy, W. Weinberg, W. Castle,


G. Yule: estudio de patrones de variación
heredables, estructura genética

Principios básicos de la Genética de


Poblaciones
Antecedentes

1930-1931: R. Fisher y S. Wright: modelo


matemático para describir la relación
teórica entre frecuencias alélicas y
genotípicas

1932: J. Haldane: causas del cambio de


frecuencias genotípicas, interacción de la
selección natural, mutación y migración
Acervo genético

Conjunto de genes compartidos por los


individuos de una población
Genética de poblaciones

Objetivos:
- conocer la dotación genética (acervo
genético) de la población
- predecir los cambios que puede sufrir el
acervo genético y, consecuentemente, la
población
Población mendeliana
Grupo de individuos de reproducción
sexual que comparten un conjunto de
genes, viven en una misma área
geográfica y se cruzan entre sí
Para describir una población real

- se toma una muestra de la población,


- se describe su composición genotípica,
- su composición alélica o génica,
- se evalúa la relación entre ambas
Composición genotípica de una
población
Frecuencias genotípicas:
- proporciones (f) de los genotipos hallados
- cálculo a partir de una muestra de la población
f(AA) = n° individuos AA
n° total de individuos

f(Aa) = n° individuos Aa
n° total de individuos

f(aa) = n° individuos aa
n° total de individuos
Composición genotípica de una
población
Frecuencias genotípicas:
AA =8/25=0,32
Aa=11/25=0,44 Aa
aa=6/25=0,24 AA aa Aa
Aa AA AA
aa AA Aa aa
Aa AA Aa
AA Aa Aa aa
aa Aa AA
Aa AA Aa
aa
Composición alélica de una
población

Individuos AA : sólo alelos A


Individuos Aa : ½ alelos A, ½ alelos a
Individuos aa : sólo alelos a
Composición alélica de una
población
Frecuencias alélicas:
A=27/50=0,54
a=23/50=0,46 Aa
AA aa Aa
Aa AA AA
aa AA Aa aa
Aa AA Aa
AA Aa Aa aa
aa Aa AA
Aa AA Aa
aa
Composición alélica de una
población
Frecuencias alélicas o génicas:
- proporciones (f) de los alelos hallados contando la
cantidad de alelos en la muestra

f(A) = 2 x n° individuos AA + n° individuos Aa


2 x n° total de individuos

f(a) = 2 x n° individuos aa + n° individuos Aa


2 x total de individuos
Composición alélica de una
población
Frecuencias alélicas o génicas:
- proporciones (f) de los alelos hallados contando la
cantidad de individuos (por genotipo) en la muestra

f(A) = n° individuos AA + ½ n° individuos Aa


n° total de individuos

f(a) = n° individuos aa + ½ n° individuos Aa


n° total de individuos
Composición alélica de una
población
Frecuencias alélicas o génicas:
- proporciones (f) de los alelos hallados a partir de
las frecuencias genotípicas

f(A) = f (AA) + ½ f (Aa)

f(a) = f (aa) + ½ f (Aa)


Ley de Hardy-Weinberg

Godfrey H. Hardy Wilhelm Weinberg

Modelo matemático que describe en forma


simplificada la relación entre las
frecuencias alélicas y las genotípicas en
una población ideal.
Pero…

… ¿qué es una población ideal?


Supuestos de la ley de Hardy-
Weinberg

Una población ideal se asume:

- infinitamente grande
- con panmixia
- no está sujeta a fuerzas evolutivas:
mutación, migración, , deriva génica,
selección
Supuestos de la ley de Hardy-
Weinberg

Válido únicamente para:

- organismos diploides con reprod. sexual


- igual distribución de alelos en machos y
hembras
- generaciones discretas
Supuestos de la ley de Hardy-
Weinberg

Los supuestos de la ley de Hardy-


Weinberg se aplican a un locus a la vez.
Predicciones de la ley de
Hardy-Weinberg

Bajo esos supuestos:


- las frecuencias alélicas y genotípicas de
los genes de la población no cambian en
el tiempo, la reproducción por sí sola no
las altera
- pueden predecirse las frecuencias
genotípicas para un gen en la próxima
generación en forma de una ecuación.
Ley de Hardy-Weinberg

Para un gen bialélico:


A=p, a=q
Distribución de p q
frecuencias
p 2
p pq
genotípicas
en la próxima
generación q pq q2
Distribución de frecuencias
genotípicas (H-W)

Distribución de fr. genotípicas en la próxima


generación:

p2 + 2pq + q2
Cálculo de frecuencias genotípicas
de la siguiente generación

Gametas que darán la siguiente


generación:
A=0,5 a=0,5

f(A) = p = 0,5 A=0,5 0,25 0,25


f(a) = q = 0,5
a=0,5 0,25 0,25
Ley de Hardy-Weinberg

Partiendo de:
fA=p = 0,5 0,5 0,5
fa=q = 0,5

En la sig. generación 0,5 0,25 0,25


espero tener:
0,5 0,25 0,25
f(AA) = p2 = 0,25
f(Aa) = 2pq = 0,50
f(aa) = q2 = 0,25
En el equilibrio H-W

Relación entre las frecuencias alélicas y


genotípicas
Ejemplo:
3 poblaciones diferentes

AA Aa aa
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40
Cálculo de frecuencias alélicas
AA Aa aa
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40
AA Aa aa
1 40 40 20

A=(2x40+40)/2x100=0,6
a= (2x20+40)/2x100=0,4
Cálculo de frecuencias alélicas
AA Aa aa
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40

AA Aa aa
2 50 20 30

A=(2x50+20)/2x100=0,6
a= (2x30+20)/2x100=0,4
Cálculo de frecuencias alélicas
AA Aa aa
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40

AA Aa aa
3 60 0 40

A=(2x60+0)/2x100=0,6
a= (2x40+0)/2x100=0,4
Cálculo de frecuencias genotípicas
AA Aa aa
observadas
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40
AA Aa aa total
P1 40 40 20 100

f 0,4 0,4 0,2


Cálculo de frecuencias genotípicas
AA Aa aa
observadas
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40
AA Aa aa total
P2 50 20 30 100

f 0,5 0,2 0,3


Cálculo de frecuencias genotípicas
AA Aa aa
observadas
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40
AA Aa aa total
P3 60 0 40 100

f 0,6 0 0,4
Frecuencias genotípicas observadas
AA Aa aa
P1 40 40 20
P2 50 20 30
P3 60 0 40
AA Aa aa
P1 0,4 0,4 0,2
P2 0,5 0,2 0,3
P3 0,6 0 0,4
Frecuencias genotípicas esperadas
en el equilibrio H-W

f (AA) = p2

f (Aa) = 2pq

f (aa) = q2
Frecuencias genotípicas esperadas
en el equilibrio H-W

f (AA) = 0,6 x 0,6 = 0,36

f (Aa) =2 x 0,4 x 0,6 = 0,48

f (aa) = 0,4 x 0,4 = 0,16


Cálculo de ajuste al
equilibrio de H-W
Cálculo de ajuste al
equilibrio de H-W

P1 Obs Esp (O-E)2 / E


AA 40 0,36x100=36 0,4444
Aa 40 0,48x100=48 1,3333
aa 20 0,16x100=16 1,0000
100 100 2,7777

Grados de libertad:
n° de genotipos – n° de alelos
Valor de tabla (1 g.l.): 3,84
Cálculo de ajuste al
equilibrio de H-W

P2 Obs Esp (O-E)2 / E


AA 50 0,36x100=36 5,4444
Aa 20 0,48x100=48 16,3333
aa 30 0,16x100=16 12,2500
100 100 34,0277

Grados de libertad:
n° de genotipos – n° de alelos
Valor de tabla (1 g.l.): 3,84
Cálculo de ajuste al
equilibrio de H-W

P3 Obs Esp (O-E)2 / E


AA 60 0,36x100=36 16,0000
Aa 0 0,48x100=48 48,0000
aa 40 0,16x100=16 36,0000
100 100 100

Grados de libertad:
n° de genotipos – n° de alelos
Valor de tabla (1 g.l.): 3,84
Modelo o ley de H-W

Establece la relación entre fr. alélicas y fr.


Genotípicas.
Estas frecuencias no cambian con el tiempo
bajo los supuestos antes mencionados.
Si cambian (porque no se mantienen las
condiciones del equilibrio), en una generación
de apareamiento al azar se restablece el
equilibrio (se restablece el ajuste al modelo)
Alelos múltiples

Ej. grupos sanguíneos del sistema ABO

f (IA) = p
f (IB) = q
f (i) = r
Alelos múltiples

Cálculo de frecuencias genotípicas:


trinomio cuadrado

(p + q + r)2 =
p2 + q2 + r2 + 2pq + 2pr + 2qr
Genes ligados al
cromosoma X
Genes ligados al cr. X
• Los machos reciben 1 cr. X de las hembras de la
generación n-1
Frec. alélicas = frec. hembras generación
anterior.
• Las hembras reciben 1 cr. X de los machos y 1 cr. X
de las hembras.
Frec. alélicas
= media de las frecuencias
de los 2 sexos en la
generación previa.
Cálculo de frecuencias alélicas de
loci ligados al X
Individuo genotipo/haplotipo
1 Aa f (A)=7/16=0,4375
2 a f (a)=9/16=0,5625
3 Aa
4 A
5 aa
6 AA
7 a
8 aa
9 Aa
10 A
Cálculo de frecuencias genotípicas

Hembras genotipo f (AA) f (Aa) f(aa)


1 Aa 2/6 2/6 2/6
3 Aa 0,33 0,33 0,33
5 aa
6 AA
8 aa
9 Aa
Cálculo de frecuencias haplotípicas

Individuo genotipo/haplotipo f (A) f (a)


2 a =0,5 =0,5
4 A
7 a
10 A
Eq. de Hardy-Weinberg

• Para un locus ligado al sexo, el equilibrio de


Hardy Weinberg se calcula utilizando los datos
genotípicos femeninos
Eq. de Hardy-Weinberg

• Para un locus ligado al sexo, el equilibrio de


Hardy Weinberg se alcanza después de varias
generaciones,
mientras que se
alcanza tras una
generación si el
locus es
autosómico
Alteraciones del equilibrio H-W
No cumplimiento de
la panmixia
Panmixia = apareamiento al azar

Todo individuo de la
población tiene igual
probabilidad de
aparearse con cualquier
otro individuo.
Alteraciones del estado panmíctico

Apareamiento clasificado = selección de pareja


- Clasificado positivo: entre individuos más
parecidos que la media poblacional
- Clasificado negativo: entre individuos más
diferentes que la media poblacional.
Alteraciones del estado panmíctico

Endogamia
= apareamiento entre individuos
emparentados (= individuos con un
ancestro común)
Endogamia

Causas:
- apareamientos dirigidos o clasificados:
criadores de animales domésticos
- tamaño poblacional pequeño: inevitable
que los individuos que se aparean estén
emparentados
Consanguinidad en un individuo

Individuo no consanguíneo Individuo consanguíneo


Consanguinidad de un individuo

Coeficiente de consanguinidad = probabilidad de


que un indiv. sea homocigota idéntico para un
locus dado (= que ambos alelos sean idénticos
por ascendencia, por duplicación meiótica)
Consanguinidad en un individuo

F (X) = Σ (1/2)n (1+FAnt)

Σ: sumatoria de todos los caminos


que conectan a los padres de X a
través de antepasados comunes
n: número de individuos en el camino
F Ant : coef. de consanguinidad del
antepasado común
Consanguinidad en un individuo

F (X) = Σ (1/2)n (1+FAnt)

Camino: F – B – G
F (J) = (1/2)3 * (1+0) = 1/8
Cálculo de endogamia en la
población

F = (2pq – H) a menor Het.


obs., mayor
2pq
valor de F

H= 2pq (1 – F)

F= 1 – ( H )
2pq
Cálculo de frecuencias genotípicas
en una población endogámica

f (AA) = p2 + Fpq

f (Aa) = 2pq – 2Fpq

f (aa)= q2 + Fpq
a mayor valor de F, menor frec. de heterocigotas y
mayor frec. de genotipos homocigotas
Endogamia

Efecto:
- aumento de la homocigosis en todo el
genoma por consanguinidad: plantas
autógamas, especies en reducción
numérica, matrimonios entre primos.
- aumenta la probabilidad de que dos
alelos deletéreos se combinen.
Endogamia

Efecto:
- depresión endogámica: efecto negativo
en caracteres reproductivos y de
producción: importancia en especies en
peligro y en mejoramiento animal.
- población humana: aumento de la tasa de
mortalidad infantil: 40% más en hijos de
primos hermanos.
Depresión por endogamia
Endogamia

Plantas autógamas:
- Se pierde la mitad de la heterocigosis en cada
generación

G1 1/4 AA 1/2 Aa 1/4 aa


G2 1/4 +1/8 AA 1/4 Aa ¼+1/8 aa
G3 3/8+1/16 AA 1/8 Aa 3/8+1/16 aa
Gn 1-(1/2)n (1/2)n 1-(1/2)n
2 2
Población humana

Algunas técnicas
de
reproducción
asistida
pueden
generar con el
tiempo, mayor
endogamia y
reducción del
fitness
Reducción numérica en los nativos americanos

Nativos Americanos:
- matanza durante la
colonización: entre 40
y 100 millones de
amerindios
asesinados en todo el
continente
Reducción numérica en los nativos americanos

- muerte por
enfermedades
introducidas desde
Europa: viruela, tifus,
paludismo, varicela,
tos convulsa, sífilis,
escarlatina,
poliomielitis, etc...
Nativos americanos del Gran Chaco

- colonización: 5.000 años


a.p.
- 16 familias lingüísticas,
hábito cazador-recolector-
pescador
Pérdida de variación genética

- fijación alélica
-variación intrapoblacional mucho menor
- gran variación entre etnias, debido a gran
reducción numérica y aislamiento genético
Reducción numérica + aislamiento genético =
Deriva genética

- pérdida de variabilidad, aumento de


homocigosis
- divergencia observada en marcadores
autosómicos y de cromosoma X
Deriva genética

Cambio en las frecuencias alélicas de la


población por error de muestreo gamético

Una fracción no representativa del pool de


alelos se transmite a la siguiente generación
Deriva genética
El cambio es aleatorio
Deriva genética

Efecto:
- pérdida de variación intra poblacional
- pérdida de algunos alelos
- fijación de algunos alelos
- reducción de la heterocigosis
- aumento de la diferenciación entre
poblaciones
Deriva genética
El “error ” de muestreo gamético produce
diferenciación entre las poblaciones

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