ORGANIZACIÓN GENÓMICA

EN PROCARIOTAS
 Cromosomas procariotas

Concepto tradicional: Escherichia coli

En un nucleoide de tinción clara se ubica una molécula

de ADN circular.
 Cromosoma de Escherichia coli

Superenrollamiento organizado en dominios: de un

núcleo de proteínas irradian de 40 a 50 bucles
superenrollados de 100kb cada uno.
Una rotura provoca rotación y desenrollamiento de un
segmento de 100 kb.

Bucle
desenrollado

Núcleo
proteic
o Bucles superenrollados
 Proteínas de empaquetamiento del cromosoma
de Escherichia coli

- Proteínas HU: forman un tetrámero alrededor del cual

se enrolla el ADN. Evitan el desenrollamiento total ante
una rotura.

- ADN topoisomerasa I: cortes doble hebra para liberar

tensión en la molécula de ADN.
 Distintos tipos de organización genómica

Cromosomas circulares:

Escherichia coli: 1 cromosoma circular, diversos

plásmidos

Vibrio cholerae: 1 cromosoma circular y 1

megaplásmido
 Distintos tipos de organización genómica

Cromosomas lineales:

Borrelia burgdorferi B31: 1 cromosoma lineal,

diversos plásmidos circulares y lineales.
 Distintos tipos de organización genómica

Genoma multipartito:

Deinococcus radiodurans R1: 2 cromosomas, 1

megaplásmido, 1 plásmido (todos circulares)
 Distintos tipos de organización genómica

Especies de vida libre:

Exposición a un espectro amplio de condiciones

ambientales, tienden a tener genomas más grandes.

Parásitos estrictos: genomas más pequeños, obtienen

nutrientes de su hospedador.
 Cromosomas de Archaea

Arqueobacterias:

Una molécula de ADN circular

Tetrámero de proteínas muy similares a histonas

alrededor del cual se asocian 80pb
 Plásmidos

ADN extracromosómico generalmente circular

tamaño pequeño (pocas kilobases)

sin proteínas asociadas

Origen de replicación

1, 2, o muchas copias por célula

pueden contener genes adicionales

Algunos pueden transferirse a otras bacterias e

integrarse al cromosoma = episomas
 Plásmidos

Plásmido función Ej. sp.

de resistencia rcia. a ATB Rbk Escherichia coli

de fertilidad conjug. y transf. F “ “

lítico toxinas contra bact. Col “ “

degradador enzs. Metabólicas TOL Pseudomonas putida

de virulencia patogenicidad Ti Agrobacterium tumefaciens

 Organización genética del cromosoma en
procariotas

Organización compacta:
Cromosoma de E. coli

Escasas regiones no codificantes

Escaso ADN repetitivo

Genomas pequeños = replicación rápida

Generalmente < 5 Mb, en relación con modo de vida

Ausencia de intrones (salvo arqueobacterias)

Organización en operones
 Organización genética del cromosoma en
procariotas

Operones:

agrupamiento de genes que se expresan como una

unidad: ARN policistrónico

Casi siempre genes involucrados en una misma ruta

bioquímica

Op. treonina

Op. triptofano
 Procesos de transferencia génica en bacterias

Incorporación de material genético que puede

integrarse o no al cromosoma bacteriano

No tienen relación con la reproducción bacteriana

 Conjugación

Transferencia de genes de una bacteria donante a otra

receptora.

Entrecruzamiento entre el material transferido y el

cromosoma
 Conjugación: comprobación experimental

1946: J. Lederberg
y E. Tatum

Cepas auxótrofas
de E. coli =
Siembra en agar-medio mínimo
Existe un
intercambio entre
las cepas
Sin crecimiento Colonias capaces sin crecimiento
de sintetizar los
4 nutrientes
 Conjugación: comprobación experimental

1946: B. Davis

Tubo en U, cepas
separadas por un filtro =

El intercambio genético
requiere el contacto
entre las células
bacterianas

Filtro de poro fino

 Conjugación
Donante F+
Receptora F-
Factor de fertilidad F: plásmido de
intecambio génico (episoma)

Contacto - puente citoplasmático

Transferencia y replicación

Replicación de la hebra

transferida

F+ F+
 Conjugación

La transferencia del Factor F tiene una dirección:

El primero en ingresar es el sitio oriT

Si se transfiere el plásmido completo, la célula

receptora se convierte en F+
 Conjugación

Factor de fertilidad F:
- genes para formación del pilus y relaxosoma para
transferencia
- durante la conjugación una bacteria donante F+
transfiere ADN a una receptora F-
- pasa una hebra (que es sustituida por replicación)
- en la célula receptora, se replica la hebra y se
restablece un plásmido doble cadena
 Conjugación
Donante F+
Receptora F-
Factor de fertilidad F: plásmido de
intecambio génico (episoma)

Contacto - puente citoplasmático

Replicación y transferencia

Recombinación con el cromosoma

y degradación del material sobrante

F+ Hfr
 Conjugación: células Hfr

- si el factor F se integra al cromosoma bacteriano =

célula Hfr = high frequency of recombination luego en la
conjugación se transfieren genes cromosómicos

- explica lo observado por Lederberg y Tatum

- la cantidad de genes transferidos depende del tiempo

de conjugación (en ocasiones, cromosoma completo)
 Conjugación: células F´

- el factor F integrado al cromosoma bacteriano se

escinde

- lleva consigo genes cromosómicos

- al producirse la conjugación, se generan diploides

parciales = sexducción
 Factor de fertilidad F

- plásmido F
Donantes

- Integrado al cromosoma = Hfr

- plásmido con genes cr. = F´

Receptoras: F- (ausente)
 Mapeo de genes bacterianos en E. coli

Conjugación interrumpida de células Hfr con células F-

- el primero en ingresar es el sitio oriT

- interrupción en distintos tiempos antes de la

transferencia total del cromosoma

- relación directa entre el tiempo de transferencia y la

distancia relativa al oriT

- unidad de distancia relativa: minuto

 Transformación

Incorporación de material genético desde el medio por

una bacteria competente (recordar experimentos de
Griffith y de Avery-Mac Leod-Mc Carty)

Competencia bacteriana: natural o inducida en

laboratorio
 Transformación

Entrecruzamiento entre el material incorporado y el

propio (cromosoma o plásmido)

Origen: generalmente ADN de organismos muertos

 Transducción

Transferencia de material genético desde una bacteria

a otra a través de virus bacteriófagos.

Entrecruzamiento entre el material transferido y el

cromosoma.

Espectro limitado: entre especies relacionadas o dentro

de la misma sp bacteriana

La cubierta proteica viral protege el material a transferir,

no es afectado por nucleasas ambientales
 Transducción

Fragmentación del ADN y empaquetamiento erróneo de

material

bacteriano
 Consecuencias evolutivas de la transferencia
horizontal de material genético

El concepto de barrera interespecífica al flujo de genes

pierde validez

La mayoría de las bacterias tienen ADN adquirido de

otras especies

Procariotas de un nicho ecológico intercambian material

para aumentar su aptitud de supervivencia

Ej.: plásmidos R: resistencia a antibióticos

multirresistencia en ambientes hospitalarios

 Consecuencias evolutivas de la transferencia
horizontal de material genético

Metagenómica:

Análisis de secuencias de todos los genomas

bacterianos de un ambiente particular. Ej.: suelo, lago

No requiere cultivar y aislar cada especie

Secuenciación y ensamblado de genomas microbianos

a partir de las muestras ambientales
GENOMAS
DE VIRUS
 Genomas virales

- ADN o ARN
- monohebra o doble hebra
- lineal o circular
- 1 sola molécula o genoma segmentado (varias
moléculas de ARN)
- recubierto de una envoltura proteica
 Bacteriófagos

1930 M. Delbrück
Infectan a las bacterias.
3 tipos de cubiertas proteicas

Exclusivo de bacteriófagos
 Genomas de Bacteriófagos

- tamaño de genoma entre 1,6 y 150 kb

- de 3 a más de 200 genes (más genes en fagos
más grandes)
- puede haber superposición de genes y
agrupamiento de genes por función
 Bacteriófagos

Genes superpuestos. Comparten secuencias con distinto

marco de lectura.

ADN monohebra
 Bacteriófagos

Genes superpuestos.
Ej: IDBV (enf. infecciosa de la bursa) en aves
 Bacteriófagos

Unidades de Transcripción Complejas (UTC): se

transcribe un ARNm policistrónico.
Ej: Adenovirus que causan infecciones en las vías
respiratorias, conjuntivitis, cistitis hemorrágica y
gastroenteritis: UTC con 5 sitios de poliadenilación y
varios empalmes diferentes, pueden producir 12
ARNm distintos.
 Estrategias de replicación de bacteriófagos

Ciclo lítico o virulento:

1939, E. Ellis y M. Delbrück, estudios en cultivos
bacterianos.
Ej.: fago T4

Período latente breve: fase inicial de

la infección, reproducción dentro de ADN doble hebra

la bacteria.
 Estrategias de replicación de bacteriófagos

Ciclo lítico o virulento:

Ej.: fago T4 (serie T)

Lisis celular poco

después de la
infección.

Infección de nuevas
células.
 Ciclo lítico o virulento del fago T4

1- Fijación del fago a una proteína

receptora (porina OmpC)

2- Inyección del genoma viral (ADN)

3- transcripción, despolimerización del

genoma bacteriano y replicación del viral

4- síntesis de proteínas virales y

ensamblado de partículas virales

5- estallido celular y liberación de fagos,

infección de nuevas células
 Estrategias de replicación de bacteriófagos
Ciclo lisogénico:
Ej.: fago λ

el genoma del fago se integra al genoma del

hospedador por recombinación
Se genera una forma latente del fago: profago
Puede permanecer latente muchas generaciones
 Ciclo lisogénico
Fago λ

1- Ingreso del ADN viral

2- integración por recombinación

de secuencias idénticas

3- replicación junto con el

cromosoma bacteriano

4- eventual cambio al modo lítico:

recombinación, replicación y
síntesis proteica
 Transducción

Transferencia de genes
entre bacterias a través de
virus
1952: Lederberg y Zinder,
experimento del tubo con
filtro.
Intercambio de genes sin
contacto entre las bacterias.
 Transducción

Generalizada:
1- Fragmentación del cromosoma bacteriano
2- empaquetamiento erróneo = fago transductor.
3- inyección e integración al cromosoma de la
bacteria receptora por recombinación
 Transducción

Especializada:
En ciclos lisogénicos, por escisión errónea del genoma
viral
Se transducen genes cercanos al sitio de integración
 Virus de eucariotas

2 tipos de cubiertas proteicas

 Virus de eucariotas

Algunos virus de animales pueden tener una

membrana lipoproteica adicional
 Virus de eucariotas

- genomas de tamaño similar a fagos o más grandes

(ej. 240kb)
- generalmente cumplen el ciclo lítico
- unos pocos se integran = lisogénicos, ej. retrovirus
 Genomas de virus de eucariotas

Gran variedad de genomas

- circular o lineal,
- 1 hebra, 2 hebras, o parte monohebra y parte doble,
- segmentado o no
- virus de plantas: la gran mayoría ARN
- virus de animales: ADN o ARN
- el genoma puede ser más grande que el de los
fagos
 Retroelementos virales

Son virus de eucariotas integrados. Genoma de ARN

monohebra, 600 a 9 kb. Una retrotranscriptasa copia
el ARN a ADN doble hebra.

- Retrovirus: la cápside envuelve el genoma de ARN

- Pararretrovirus: la cápside envuelve el genoma de

ADN
 Virus de eucariotas

Retrovirus: virus eucariotas integrados

 Virusoides

- ARN circular monohebra

- menos de 400 nt
- se alojan en la cápside de virus
- serían parásitos de los virus
- frecuentes en plantas
 Viroides

- ARN circular monohebra

- menos de 400 nt
- no se recubren de una cápside
- se propagan como ARN desnudo
- frecuentes en plantas
 Priones

- no contienen ácidos nucleicos

- proteína resistente a las proteasas
- no tienen relación con los virus
- ej. Encefalopatía espongiforme de ovinos y bovinos