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Enzimas

Introducción Las enzimas se caracterizan por 3


propiedades fundamentales :
Las sustancias que aceleran la
velocidad de reacción de las (a) están presentes en pequeñas
reacciones químicas se denominan cantidades,
catalizadores. En el mundo vivo, los
catalizadores se denominan enzimas (b) aumentan la velocidad de las
las cuales son proteínas de aspecto reacciones químicas sin que se
globular. El mundo mineral (no vivo) consuman o alteren por la reacción,
carece de enzimas, pero posee
catalizadores inorgánicos, los cuales (c) aumentan la velocidad de las
también actuan en el mundo vivo. reacciones químicas sin alterar el
equilibrio químico entre los
Las reacciones químicas reactantes y los productos.
orgánicas en una célula son lentas
en condiciones de temperatura y
presión normales, por ende, las Nomenclatura y clasificación de
enzimas ayudan acelerando las las enzimas
velocidades de dichas reacciones
químicas. El sufijo asa identifica a la mayoría
de las enzimas con excepción de
Las características propias de la algunas, como la tripsina,
química de diferentes células o de amilopsina, quimiotripsina, etc; que
diferentes compartimentos de una por tradición siguen manteniendo su
célula, pueden derivar del contenido nomenclatura. Se han asignado, por
y actividad enzimática diferentes. la Comisión Internacional de
Estas características enzimáticas Enzimas, 6 clases :
propias son el producto de la
actividad genética, tanto para su 1. Oxido-reductasas : participan en
síntesis como para su regulación. reacciones de óxido-reducción. En
estas reacciones se transfiere un
Como decíamos en el capítulo electrón (ó un H+) de un donante a
anterior de ácidos nucleicos, una un receptor. Caso del NADH+ que
mutación puede provocar la entrega electrones a complejo I en
aparición de una enzima (proteína) la membrana interna de la
que no actúe correctamente. mitocondria.
Enzimas

2. Transferasas : transfieren grupos Actividad enzimática


de un donante a un aceptor. Los
grupos transferidos con más La primera enzima aislada en forma
frecuencia son el metilo, glucosídico cristalina fue la ureasa (J.B.
y fosfato. Caso de la glucosil- Summer, 1926) que cataliza la
transferasa (transfiere un hidrólisis de la urea.
monosacárido) y proteín quinasa
(transfiere un fosfato). ureasa

(NH2)2–CO + H2O CO2 + 2NH3


3. Hidrolasas : participan en
reacciones de hidrólisis, es decir,
La hidrólisis de la urea puede
rompimiento de enlaces como C-O,
C-N y C-C por adición de agua. ocurrir espontáneamente en
Caso de los enlaces glucosídicos presencia o ausencia de un
catalizador, originando los mismos
(entre monosacáridos) y peptídicos
(entre aminoácidos). productos y la misma energía.

La velocidad de reacción
4. Liasas : producen dobles enlaces espontánea puede ser acelerada si
al romper uniones C-O, C-C y C-N. se añaden iones H+ como
También pueden romper dobles catalizador y puede ser acelerada
enlaces agregando grupos. Caso de aún más cuando se añade la ureasa
la piruvato descarboxilasa que en lugar de los iones H+.
elimina un CO2 al piruvato.

5. Isomerasas : catalizan una


redistribución de átomos de los
grupos químicos dentro de la misma
molécula. Caso de la alanina
racemasa que convierte L-alanina en
D-alanina. Ambos son isómeros.

6. Ligasas : catalizan la unión de 2


moléculas por hidrólisis de ATP u
otro trifosfato (GTP, por ejemplo). El gráfico muestra las relaciones energéticas
de la reacción entre urea y agua (reactantes),
el logro del estado de transición [ES] y la
obtención de los productos (CO2 y NH3). Note
la magnitud de la energía de activación.
Enzimas

El complejo activado enzima–


sustrato [ES] tiene menor necesidad
de energía de activación; así, habrá
más cantidad de moléculas de
sustrato que puedan pasar la barrera
por unidad de tiempo. Un número
pequeño de moléculas de enzima
pueden manejar millones de
moléculas de sustrato por segundo.

Para que la urea pueda reaccionar


con el agua debe haber suficiente Sustrato Enzima
energía, para que la molécula de
urea y el agua lleguen a formar un
complejo activado y entren a un
estado de transición (estado de +
alta energía). La energía necesaria
para llegar a dicho estado se llama
energía de activación, la cual
constituye una barrera para que la
Complejo enzima
reacción prosiga. Por tanto, la Sustrato
disminución de la barrera de la
energía de activación es mayor en
un sistema de reacción catalizada
por una enzima; de esta manera, la Estado de
transición
reacción procede más rápidamente
en presencia de ureasa que en
presencia de H+ o sin catalizador.
En conclusión, la función principal de
una enzima es disminuir la barrera
de la energía de activación.

Las enzimas aumentan la Producto


probabilidad de que las moléculas
reaccionantes crucen la barrera y
prosigan a la consumación de la
reacción. Una enzima (E) hace esto
al unirse con el sustrato (S), en una
asociación temporal (estado de
transición [ES] ).
Enzimas

La mayor parte de las enzimas Considerando que las enzimas


opera dentro de un margen estrecho son proteínas, están expuestas a
de pH : es el pH óptimo. La gran una desnaturalización (cambio en la
mayoría de las enzimas tiene su pH estructura terciaria) por acción de
óptimo dentro del rango fisiológico altas temperaturas. Así, puede
de la célula (pH 6.5 a 7.2). Algunas producirse una inactivación a causa
enzimas, como la pepsina del del rompimiento de varios enlaces
estómago, posee un pH óptimo en el débiles. Muchas enzimas se
rango ácido (pH 1.0 a 2.0). Enzimas inactivan a 45 ºC y la mayoría se
intestinales como la tripsina y desnaturalizan rápidamente desde
lipasas, poseen un pH óptimo en los 55 ºC.
rangos alcalinos, cercano a 10.

Como cosa curiosa, hay bacterias


Velocidad termófilas que viven en aguas
de reacción termales calientes, alrededor de los
pepsina amilasa 80 ºC. Sus sistemas enzimáticos
tripsina
resisten la desnaturalización a altas
temperaturas.

Velocidad
de reacción

pH
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14

Como en cualquier reacción


química, el aumento de temperatura
de los reaccionantes produce un T ºC
aumento en la velocidad de 34 35 36 37 38 39 40

reacción, pero en el caso de los


sistemas catalizados por enzimas,
esto es válido hasta cierto grado de
temperatura.
Enzimas

Especificidad del sustrato Las enzimas aceleran las


reacciones alterando la
La especificidad está determinada conformación de sus sustratos para
por el sitio activo de la enzima, es que logren llegar al estado de
decir, un sector de la molécula que transición. El modelo más simple
contiene los grupos funcionales para entender esta interacción
particulares que le permiten unirse enzima–sustrato es el modelo de la
específicamente con el sustrato. Por llave y la cerradura, en el cual el
ejemplo, la quimiotripsina posee una sustrato encaja perfectamente en el
cadena polipeptídica conformada por sitio activo de la enzima (ver dibujo)
245 aminoácidos de los cuales los
números 57 (histidina), 102 (ácido
aspártico) y 195 (serina) constituyen Sustrato
el sitio activo. El plegamiento
(estructura terciaria) de la cadena
provoca el acercamiento de estos 3
aminoácidos en una estrecha región:
este es el sitio activo de la enzima. Enzima

Del ejemplo expuesto, el sitio activo


ocupa un área relativamente
pequeña de la superficie de la
molécula de enzima. Esto significa
que una pequeña porción de la
molécula de enzima participa
realmente en la catálisis. Las otras
regiones de la superficie de la
enzima pueden permitir la unión con
Esquema molecular de la quimiotripsina, otras moléculas involucradas en la
mostrando el sitio activo de esta enzima. regulación de la actividad enzimática

En muchos casos, las


Generalmente el sitio activo se conformaciones tanto de la enzima
encuentra en una grieta, en una leve
como del sustrato son modificadas
depresión en la superficie de la
cuando logran unirse : es el llamado
molécula proteica. La geometría del modelo de encaje inducido. Esta
sitio activo está estrechamente
alteración de las conformaciones
relacionada con la conformación
hace que logren llegar más rápido al
tridimensional de la molécula del estado de transición (ver dibujo).
sustrato.
Enzimas

Cinética enzimática
Sustrato El análisis cuantitativo de la
actividad enzimática se denomina
cinética enzimática. Este análisis
puede aportar información útil
acerca del modo de acción de una
enzima y establecer comparaciones
Enzima con otras enzimas o de la misma
enzima bajo condiciones diferentes.

En muchas enzimas la velocidad


La desnaturalización de una de catálisis o velocidad de
proteína enzimática provoca un reacción (V) varía de acuerdo a la
desplazamiento de los aminoácidos, concentración molar del sustrato.
alejándolos, con lo cual desaparece Cuando la concentración del
el sitio activo. La inactivación sustrato [S] es baja, la velocidad es
enzimática puede explicarse por el linealmente proporcional a la
desplazamiento de solo un concentración. Pero cuando [S] es
aminoácido. alta, V es independiente de [S].

El ó los sitios activos de la


molécula de enzima permite,
primeramente, orientar a la molécula
de sustrato; luego, establecer los
enlaces químicos necesarios para la
formación del complejo enzima-
sustrato y, finalmente, romper (o
formar) los enlaces químicos
necesarios para formar el o los
productos. Una vez ocurrida la
reacción química, los productos de
la reacción catalizada se separan y
la enzima queda nuevamente
disponible para una nueva catálisis.
Así, la ecuación mostrada ejempli-
fica la generalidad de la reacción :

E + S [ES] P + E
Enzimas

En donde Vmax es la velocidad Ahora bien, Km indica la afinidad


máxima de la reacción y Km es la de la enzima por el sustrato : menor
concentración del sustrato a la que Km mayor afinidad, lo que significa
la velocidad de reacción es igual a la que hay una unión muy fuerte entre
mitad de su valor máximo. Es decir, la enzima y el sustrato en la
cuando la [S] sea igual a Km formación del intermediario [ES] en
entonces la velocidad de la reacción la catálisis.
será igual a la mitad de Vmax.
La velocidad máxima (Vmax) puede
Observando el gráfico de la página revelar el número de recambio de
anterior, a concentraciones bajas del una enzima, es decir, el número de
sustrato, cuando [S] es menor que moléculas de sustrato convertidas a
Km , la velocidad de reacción es producto por unidad de tiempo,
directamente proporcional a [S]. cuando la enzima se encuentre
completamente saturada con
sustrato.
Leonor Michaelis y Maud Menten
Normalmente, se expresa como el
(en 1913) propusieron un modelo
número de moléculas de sustrato
sencillo para describir la cinética
que pueden ser convertidas a
enzimática : es la ecuación de
producto por una molécula de
Michaelis-Menten.
enzima por segundo. Algunos
valores ilustrativos :

S
V Vmax
S Km Enzimas Nºrecamb/seg

Anhidrasa carbónica 600.000


Catalasa 93.000
A concentraciones más altas del
Acetilcolinesterasa 25.000
sustrato, cuando [S] es mayor que
Km, la velocidad viene a ser Quimiotripsina 100
independiente de [S]. ADN polimerasa I 15
Enzimas

Inhibición de la actividad Un inhibidor no-competitivo es


enzimática el que puede unirse a la enzima en
un sitio diferente al sitio activo . Así,
La inhibición de la actividad tanto el sustrato como el inhibidor
enzimática es el medio importante pueden unirse simultáneamente a la
en el control de los sistemas molécula de enzima. La acción del
biológicos. La inhibición puede ser inhibidor no-competitivo es disminuir
reversible o irreversible. En el el número de recambio de una
primer caso, el inhibidor no modifica enzima.
las regiones funcionales de la
enzima; en el segundo caso, el
inhibidor modifica la molécula de
enzima y se une tan fuertemente a
ella que la disociación de ambas es
muy lenta o nula. Varios venenos Coenzimas
que actúan sobre el sistema
nervioso, incluyendo insecticidas, lo Además de unir a sus sustratos, los
hacen como inhibidores irreversibles sitios activos de muchas enzimas,
de la actividad enzimática. pueden unir otras moléculas que
participan en la catálisis. Los
La inhibición reversible puede llamados grupos prostéticos son
lograrse mediante 2 mecanismos : pequeñas moléculas que se unen a
competitivo y no-competitivo. Un las proteínas en las cuales juegan
inhibidor competitivo es el que un papel muy importante. Por
compite con el sustrato por el mismo ejemplo, el oxígeno transportado por
sitio activo de la enzima, ya que el la hemoglobina se encuentra unido
inhibidor y el sustrato poseen una al grupo hem, que viene a ser el
estructura química similar. La grupo prostético.
velocidad de catálisis del sustrato se
reduce dado que la cantidad de
sustrato que se une a la enzima es
menor.
Inhibidor
sustrato sustrato
competitivo

Inhibidor
no-competitivo
Enzimas

Además, varias moléculas (2) si un individuo es “mordido” por


orgánicas de bajo peso molecular en una serpiente venenosa, ésta le
tipos específicos de reacciones inocula al paciente múltiples
enzimáticas. Estas moléculas se enzimas que tienen la capacidad de
llaman coenzimas debido a que destruir glóbulos rojos, factores de
trabajan junto con las enzimas para coagulación, nervios, músculos, etc.;
favorecer a las reacciones catalíticas por lo que el paciente presenta
También, ellas pueden participar en dolor, edema, hemorragias, necrosis
múltiples reacciones enzimáticas. y hasta neuropatías. El tratamiento
se basa en tratar de destruir estas
enzimas nocivas con sueros
antiofídicos.

(3) la coloración de la piel y el pelo


depende de un pigmento llamado
melanina. Este pigmento, se
produce en una célula de la piel
llamada melanocito. Para que este
Aplicación médica melanocito produzca melanina,
requiere de la presencia de una
Todas las enzimas son proteínas y enzima llamada tirosinasa, la cual
están distribuídas ampliamente en el degrada la tirosina en precursores
organismo cumpliendo funciones del pigmento. La falta de actividad
múltiples. Se darán de ejemplo sólo de esta enzima tirosinasa, por un
algunos casos : defecto genético, causa hipopig-
mentación de la piel, como en el
(1) el páncreas es una glándula que caso del albinismo.
cumple la función de secretar
múltiples enzimas que intervienen en
la digestión normal : tripsina,
quimiotripsina, elastasas, lipasas,
amilasas,etc. Cuando el páncreas no
secreta estas enzimas conduce a
una mala digestión de los alimentos,
transtorno llamado dispepsia. En
estos casos el paciente presenta
náuseas, llenura, distensión
abdominal, diarreas, entre otras.
Enzimas

1. ¿Cuáles son las principales funciones de una enzima?

2. ¿Siempre se necesita una molécula de enzima por cada molécula de sustrato?

3. Mencione y explique dos factores que influyen directamente sobre las moléculas
de enzimas.

4. ¿Qué explicación molecular tiene la desnaturalización?

5. Molecularmente hablando, ¿qué es el sitio activo de una enzima?

6. ¿Cuáles son las 3 acciones de los aminoácidos que constituyen el sitio activo
de la quimiotripsina?

7. ¿Qué indica el Km de una enzima

8. ¿A qué se refiere el número de recambio en las enzimas?

9. ¿Cuándo una inhibición enzimática es competitiva? ¿y no-competitiva?

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