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Clase de microbiología del ambiente o ecología microbiana.

Ecología microbiana
En general E.M. es la
parte de la ecología de la
población, se estudia las
interrelaciones entre los
microorganismos, entre
ellos mismos con otros
organismos en los que
habitan y con el ambiente
que los rodea.
Formándose una triada
ecológica agente
ambiente Hospedador.
(Hospedador agente)
General características
ecosistema Microbiano:
capacidad del
microorganismo de
transformar el ambiente, adaptación y mutación de los microorganismos para subsistir
en estos ambientes (resistentes), tamaño del hábitat, suministro de alimento (el mas
importante), diversidad de especies microbianas (mientras mas hay mas competencia
habrá), por consiguiente todos los microorganismos pelean por su espacio.
Dinámica de la s poblaciones: lo que los microorganismos producen hacia otros,
sistemas de comunicación (quórum sensing)

Capacidad de M.O para transformar el ambiente


Cambios en el ambiente ejemplo transformar sustrato donde habitan si agotan el
sustrato se agota el alimento y elabora producto final contaminante (dañino)

 Característica para desarrollar su actividad de transformación ambiental:


Volumen v/s Área: Área grande de contacto (con sustrato que facilita la acción
enzimática).
 Que sean mas competitivas (agente tuberculosis tiempo generacional alto vs
E. coli. No hay competencia bacteria que se reproduce mas rápido tiene mas
chance) Rápido índice de desarrollo.

Adaptación – mutación de los M.O


Para que ocurra debe tener capacidad de adaptarse a los cambios ambientales eje Ph.
Se acomodan a cambios temporales (ambientales) mediante adaptación FENOTIPICA
(en presencia de Inductor) que es limitado por el GENOTIPO. (Hay ciertos genes que se
despiertan de acuerdo al sustrato que este lo necesitan para activarse antes ya visto)

Condiciones ambientales determinan diferentes tipos genéticos de M.O puedan


competir con otros Los mejor ADAPTADOS sobreviven. (Los que tengan la carga
genética apropiada ejemplo hongo que tenga la capacidad de degradar materia
Orgánica)
M.O pueden crecer a lo largo de una amplia gama de temperatura (neisseria
monocytogenes puede generar distintos cuadros clínicos a distintas temperaturas), pero
su efectividad metabólica no será la misma a cambios de temperaturas extremos.
(Cambios físicos o químicos cuando se acaba el alimento y ahí los genes paran la
generación de ciertos tipos de enzimas etc. lo que es adverso para un M.O puede ser
favorable para otro).
CAPCIDAD ADAPTATIVA esta entre los limites del genotipo y M.O siempre tiene la
temperatura optima (características fenotípica no necesariamente tiene que ser heredada,
pero las características de autoperpetuación es heredable)
Fenotípica del momento; Genotípica que perdure en el tiempo para su
sobrevivencia.

Adaptación evolutiva
Cambio genotípico, debe haber cambio en el genoma y puede ser por mutación o por
intercambio genético (transducción, transformación, conjugación implica cambio
evolutivo). Es el paso de cierta resistencia entre los mismos microorganismos.

Adaptación fisiológica fenotípica


Cambio temporal, bajo ciertas circunstancias se expresa algo que antes no había m
genotipo debe permitir cambiar ciertos genes delimitado por GENOTIPO
Ocurre en todos los individuos expuestos a un cambio (altas temperaturas) listeria
monocytogenes a 37 °C inmóvil y a 25 °C móvil.

Dinamia de la población
M.O prospera Solo si hay nutrientes y agua, lo mínimo, que la temperatura sea
apropiada presión hidrostática apropiada.

Tamaño del hábitat


Laguna o estanque no es lo mismo, general el estanque es condición mas restringida no
hay intercambio de agua no hay mucho nutriente agotamiento de nutrientemuerte
de algunos M.O crecimientos de otros M.O (algas)
Rizosfera: condición que se establece intercambio entre la tierra y atmosfera
Microhabitat: boca, dientes de animales, tronco caído, intestino faringe, nariz.

Diversidad de especies microbianas


1 gramo de suelo contiene 1x10¨9 M.O, se conoce solo el 1% de las especies de M.O
que se conocen. (De total que hay en el planeta) 4200 descritas.

Asociación microbiana en ecosistemas


Siempre se establecen relaciones entre M.O, pero estas se producen también con otros
organismos mayores.
Relación de simbiosis vivir juntos
 Comensalismo se beneficia del M.O de lo que hace y no le causa
daño(microbiota)
 MutualismoBeneficio mutuo( E. coli sintetiza vit.K)
 Parasitismo no ayuda en nada y causa daño.
ANTAGONISMO
 Dos seres de distintas especies se relacionan y uno de ellos se perjudica.
Ejemplo Pseudomonas aeruginosa produce pigmento e inhibe germinación de
Aspergillus terreus (bacteria v/s hongo).
 Staphylococcus aureus produce sustancias antifúngicas contra aspergillus
terreus (contras sus hifas las atrofia)
 Penicillium produciendo ATB contra staphylococcus.
 Garnedela vaginalis se controla por la acides de la vagina que es producida por
el lactobacillus.

NEUTRALISMO
Nadie se ve afectado, no compiten ni por espacio ni por nutriente.

Simbiosis mutualista
 Estresptococcus cremosis y Estreptococcus lactis cuando crecen junta producen
mayor cantidad de acido láctico que cuando crecen separadas.
 E.coli y enterococcus faecalis juntas producen putrecina(ornitina putrecina)
 Liquen (hongo con alga) no puede crecer hombro sin alga y viceversa.
 Planta-microbio: rhizobium convierte nitrógeno gaseoso(atmosférico) en una
forma que puede ser utilizado por las plantas
 Animal-microbio: microbiota beneficia el tracto intestinal producción
vit.K.(E.coli)

PARASITISMO
Especie que vive a expensas de otro microorganismo produciendo daño.
Ejemplo los fagos.
En el suelo M.O ocurre que contribuye a formación de materia orgánica
(ac. carbónico ac. orgánico disuelven rocas.)

Controla disponibilidad de muchos nutrientes importantes para las plantas, porque


los M.O del suelo comandan esa posibilidad y todo lo que sea M.O suele hacen que
la tierra sea fértil o no.

Pueden existir varios cientos metros bajo tierra y se pueden extender( ejemplo: se a
establecido cuando hay un caudal y la vivienda esta cerca del río la letrina nunca se
pone río arriba sino que río abajo(flujo abajo) asumiendo que la casa saca agua del
río, puesto que los M.O se filtran en la tierra.).

Materia orgánica en el suelo


Su origen bacterias hongos liquen musgos y plantas que crecen sobre los minerales
y rocas erosivas.
Donde no se encuentra en el DESIERTOmateria Orgánica no hay M.O no hay.
Ciclo de los elementos
Ciclos de la materia y flujote energía en los ecosistemas
Energía solar es la vital para poder comandar todos los procesos metabólicos y esta
comanda:
Ciclo del agua, ciclo del oxigeno, ciclo del nitrógeno, ciclo del carbono, ciclo del
fósforo

Ecosistemas

1. Organismos productor elaboran compuesto orgánicos plantas árboles


(C.H)
2. Descomponedores materia orgánica cae degradan (bacteria hongo)
3. Consumidores consumen materia orgánica o productos de los
productores(animales)
4. Factores físicos interfieren luz agua gases
5. Factores bióticos  tiene que ver con la vida, plantas animales bacterias y
hongos actúan como productores consumidores o Descomponedores
(plantas productores C.H, animales grandes consumidores.)

Descomponedores saprofitos
Se alimentan de materia orgánica (hongos principalmente), agentes necesarios para
el retorno al ciclo (componentes principales azufre, cobre, nitrógeno) lo logran
por los M.O Descomponedores. SaprofitosCierra ciclo de los elementos.
Planta producen animal consume hongos descomponen y se vuelve al ciclo.

Ciclos biogeoquímicos
Describen las interrelaciones del microorganismo con el medio ambiente.
Ciclos de la materia:
Tenemos por un lado los autótrofos, que tienen la capacidad de producir sus propios
materiales (como las bacterias fotosintéticas) y por otro lado tenemos los
heterótrofos que se alimentan de los autótrofos (aquí estamos nosotros los animales,
las bacterias, los descomponedores)

Ciclo del nitrógeno

El nitrógeno forma parte de las macromoléculas más importantes en el organismo


vivo, porque forma parte de las proteínas. Por ello es tan relevante para la vida de
los organismos.
Actividades que se deben llevar a cabo para que se utilice el nitrógeno:
1) Que se fije
2) Que se amonifique
3) Que se nitrifique
4) Luego que se desnitrifique
5) Luego se asimila.

El nitrógeno se encuentra en la atmosfera como gas (N2) que es demasiado estable, por
ello es muy difícil que un organismo por medio de la respiración lo pueda convertir en
proteína. También hay nitrógeno en la tierra orgánica (como en la tierra de hoja) donde
se encuentra de manera utilizable por la planta, no así el de la atmosfera, como amonio.
Las formas utilizables del nitrógeno es como amonio, nitrito y nitrato que son solubles
en agua.
Y eso es lo que hacen las bacterias fijadoras de nitrógeno: llevan el nitrógeno
atmosférico a formas como amonio, nitrito o nitrato.
El 78% del nitrógeno se encuentra en la atmosfera, pero lamentablemente no es
utilizable en su totalidad, por ello hay desnutrición, porque hay escasez de proteínas por
poca disponibilidad de nitrógeno (África).
Algunos ejemplos de bacterias que son capaces de fijar el nitrógeno son el Rhizobium,
Azotobacter, hongos y algunas cianobacterias, que lo fijan y lo convierten en amoniaco
por ejemplo. Luego las Nitrosomonas lo convierten en nitritos, posteriormente a esto
viene el proceso de nitrificación, en donde actúa una bacteria llamada Nitrobacter, que
transforma los nitritos en nitrato. Finalmente por un proceso de asimilación lo adquieren
los M.O. e incluso ese nitrato puedo ser descompuesto de nuevo por desnitrificación
bacteriana por Bacillus y Pseudomonas que retornan el Nitrógeno a la atmosfera.
En el paso donde se asimila, es donde los organismos que necesitan ese nitrógeno lo
adquieren, como por ejemplo las plantas y lo liberan cuando se descompone o cuando
los animales la consumen.
Los mismos animales pueden estar de cierta forma liberando nitrógeno y por un proceso
de amonificación lo devuelven a la tierra.

Ejemplo de bacterias que producen la fijación de nitrógeno


Ciclo del Fósforo
El fosforo activo se encuentra en el suelo y agua en forma de fosfato. El fosfato es una
molécula inorgánica insoluble, por lo tanto los organismos deben transformarla a alguna
forma que sea soluble y asimilable.
El fosfato es importante en el metabolismo porque forma parte de compuestos de muy
alta energía como el ATP.

El fosforo en general solo está presente en el suelo, por la minería, en animales por la
alimentación ingresa y luego vuelve a la tierra por la excreción. Es un ciclo que se
genera de manera terrestre.

Ciclo del carbono


El carbono por una parte lo adquieren las plantas como CO2 del agua o del aire y luego
por fotosíntesis lo convierten en otros productos (azucares).
El segundo proceso, cuando los animales se alimentan de esos mismos vegetales y por
lo tanto transforman esos azucares en CO2. Por lo tanto retornan el CO2 a la atmosfera.
En tercer lugar, las bacterias se encargan de desintegrar los vegetales y devuelven a la
atmosfera el carbono. O sea, alguien produce carbono y el otro lo degrada.
Ciclo del Azufre
Es importante por el tema de las lluvias ácidas, por la generación de productos
sulfurados, por la contaminación, por la quema de madera, que por lo general tiene alto
contenido de azufre. Lo que hace es generar sulfatos y estos en contacto con el agua
forma ácido sulfúrico, que es el que le da la acidez a la lluvia. Por ello se genera un
cambio de pH en el suelo, y al cambiar este pH cambia la microbiota del suelo y hace
que algunos microorganismos ya no estén, y al no estar hay poca producción de
nitrógeno, etc.

Los volcanes en general también producen mucho azufre.

Aquí está el tema de la lluvia acida. Revisar!!


Ciclo del oxigeno
El oxígeno, es obviamente elemental para vida de los organismos. Se adquiere
directamente por respiración y se genera por el proceso de fotosíntesis.

RELACION ENTRE PARASITO Y HOSPEDERO

Patógeno oportunista  Es un MO que puede formar parte de la microbiota pero que


bajo det. Circunstancias se vuelve patógeno.
Por ejemplo, E. coli puede estar produciendo vitamina K en el intestino pero otra
variedad de E.coli puede producir cuadros diarreicos, o infección urinaria e incluso
meningitis. Esto es muy común en inmunodeprimidos.
Patógeno obligado (primario)  siempre está en contra de su hospedador. Por ejemplo
Salmonella Tiphi o pestis.
Su presencia en el humano va a generar un cuadro clínico si o sí. No forman parte de la
microbiota.
Patogenicidad  capacidad de producir un daño. Por ejemplo enfermedad.
Virulencia  grado de patogenicidad. Indica cuan dañino es el patógeno.
Infectividad  es la capacidad de entrar, sobrevivir y multiplicarse por parte de ese
microorganismo. Va produciendo un cuadro clínico
Toxigenicidad  capacidad de producir toxina (endo o exo).

Hospedador  cualquier organismo que permite el crecimiento de otro organismo.


(Planta, animal, humano)
Enfermedad  el hospedador es dañado de alguna forma u otra por un microorganismo
Infección  cualquier situación en que el MO se establece y crece produciendo un
daño. Produce signos y síntomas

¿De qué va a depender que un microorganismo produzca una enfermedad?

1) De la virulencia de ese parasito


2) Del número de gérmenes ( si yo como 10 Vibrio colerae no me va a producir
enfermedad, pero si como millones, sí)
3) Resistencia del hospedador (sistema inmune)

Etapas de la enfermedad infecciosa

1) Periodo de incubación (toda enfermedad tiene un periodo de incubación, que es


aquel que va entre el ingreso del MO hasta que se empiezan a producir los
primeros síntomas). Por ej.: Vibrio colerae tiene un periodo de incubación de 1-
3 días. Es tremendamente relevante para diferenciar las bacterias de las
patologías. Todos los agentes tienen periodos de incubación específicos.
2) Periodo prodrómico. Es un periodo bastante corto, donde aparecen los
síntomas iniciales como malestar y dolor general. Como “decaimiento”.
3) Periodo de estado clínico (estado) Puede ser subclínico, donde se ven signos y
síntomas evidentes. Como tos, estornudo, fiebre, etc. Leucocitos aumentan o
disminuyen. Hay transmisión de enfermedad.
4) Periodo de convalecencia (recuperación). Signos y síntomas cesan. Pero paciente
se vuelve vulnerable a infección por agente secundario.
5) Periodo de latencia
La enfermedad transmisible es causada por un agente específico, conocido, o alguno de
sus productos tóxicos (toxinas) que se producen por transmisión de una fuente (o
reservorio) a un hospedador susceptible.
Una fuente o reservorio puede ser agua, alimento o animales y pájaros.
Todas las enfermedades transmisibles son infecciosas pero no al revés. Es decir, hay
enfermedades que no se transmiten de persona a persona.

La enfermedad infecciosa es un conjunto de manifestaciones clínicas producidas por


una infección. Esto supone que la bacteria este invadiendo y/o multiplicándose e un
hospedador susceptible.

Las enfermedades infecto-contagiosas son las infecciones que se transmiten por


contacto directo de persona a persona. Por ejemplo, SIDA, hepatitis B.

El tétano no es una enfermedad contagiosa, porque lo va a producir solo la persona que


contrajo el tétano.

Infección  se refiere al proceso en el cual hay invasión y/o multiplicación de ese Mo


en ese hospedador.

Colonización  presencia de un agente en la superficie pero que no hay respuesta


tisular inmunitaria frente a él. Por ejemplo, la microbiota.

El conjunto de estos tres sistemas va a producir enfermedad.


El agente  Cualquier MO capaz de producir una enfermedad infecciosa.
Características: (intrínsecas) tamaño, forma, composición química, comportamiento en
el hospedador, comportamiento frente al medio (resistencia, adaptación).

Fuente de infección  cualquier persona, animal u objeto donde se ubica el agente y


puede pasar al hospedador. Puede ser reservorio (hombre, animales) o ambiente (es una
fuente pero no un reservorio porque no se puede multiplicar).

Reservorio humano: tenemos un humano enfermo que está estornudando. Entonces se


sabe que el posee el agente causante de la enfermedad.

Humano portador: estando el agente en el hospedador no produce cuadro clínico. Por


ejemplo los portadores del VIH.
Puede ser temporal o crónico.

Reservorio animal: animales enfermos o portadores. Cuando se transmite a humanos es


una zoonosis.

Puerta de salida: el aparato respiratorio, aparato digestivo, piel (herpes), placenta, tracto
genitourinario.

Mecanismo de transmisión: mecanismo por el cual el agente se transmite desde la


puerta de salida del reservorio a la puerta de entrada del hospedador.

Transmisión directa: directa desde la fuente hay pasaje del agente y se produce el
cuadro clínico. (La mayoría).

Transmisión indirecta: tiene que haber un eslabón intermediario para que llegue al
hospedador. Por ejemplo, fomites (materiales e implementos)

Contacto directo: tacto, beso, relaciones sexuales, laceraciones en piel permiten la


entrada de hongos, mordeduras.

Vectores: pueden ser mecánicos o biológicos. Moscas, aire, agua, leche.

Puerta de entrada: conjuntivas, ap. Respiratorio, ap. Digestivo, genitourinario, heridas,


mordeduras.

Hospedador: individuo blanco del agente donde se desarrolla la enfermedad. Edad,


estado nutricional, condiciones de vida y trabajo, susceptibilidad genética, estado
inmunitario.

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