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Presentación

El Curso de Biología Molecular se ubica dentro de la Ingeniería en Nanotecnología en el área


básica particular obligatoria y fue diseñado para que el alumno de Nanotecnología comprenda los
mecanismos moleculares de las patologías y la posible intervención de la nanotecnología en los
métodos de diagnóstico moleculares y los tratamientos novedosos del área de la nanomedicina, todo
esto mediante el estudio de las bases moleculares del funcionamiento celular, los procesos celulares
básicos que regulan la expresión génica, las alteraciones presentes en los mecanismos moleculares
asociados a una patología y las técnicas moleculares que le servirán en un momento dado para
realizar un adecuado uso de la tecnología para la creación de nuevos métodos diagnósticos y
terapéuticos.

Competencias genéricas de la educación superior


Comprender la relación que existe entre el DNA y los procesos celulares para entender los
mecanismos que rigen el funcionamiento celular y los fundamentos de la tecnología del DNA
recombinante mediante la comprensión de los elementos básicos que participan en el
mantenimiento de la expresión y regulación génica.

Contenidos conceptuales de la asignatura


El alumno utilizará el lenguaje técnico y científico de la biología molecular para comprender las
bases moleculares del funcionamiento celular, los mecanismos que pueden estar alterados para dar
lugar a una patología y los fundamentos de las técnicas moleculares aplicables en la nanomedicina.

PROGRAMA DE ESTUDIOS
Departamento:
Ingenierías
Academia
Química
Nombre de la unidad de aprendizaje
Biología Molecular
Clave de la materia: Prerrequisitos Co- Tipo de Tipo de
requisitos asignatura curso:
Bioquímica, Ninguno C= curso
química básica
Hrs. /semestre Horas Horas de teoría: Horas de Total de Valor de
semana práctica: horas: créditos:
80 4 50 30 80

Vigencia del plan Vigencia del programa

Área de formación:
Básico particular obligatoria
Objetivo de la asignatura
Que el alumno conozca la composición, estructura, función y organización de las biomoléculas y su
relación con los procesos biológicos; así como la transformación de estas en los diferentes procesos
biológicos que mantienen el equilibrio en el ser humano y la aplicación de estos conocimientos en
la nanotecnología.
Aportación de la asignatura al perfil de egreso
Los estudiantes de la Ingeniería en Nanotecnología, al cursar la materia de biología molecular
adquieren los conocimientos teóricos suficientes para comprende la importancia de la biología
molecular en su práctica profesional y en el avance de la nanotecnología. Los conocimientos
adquiridos en esta materia se aplicaran inmediatamente a lo largo del curso en cuanto a que el
alumno será capaz de introducirse a bancos de información para actualizarse, comprenderá artículos
científicos que involucren biología molecular y su relación con la nanotecnología. Los estudiantes
de biología molecular realizan sus actividades con un alto sentido de responsabilidad, disciplina y
respeto a sus compañeros. Desarrollan habilidades autogestoras mostrando disposición para el
trabajo en equipo con capacidad de análisis, síntesis y juicio crítico.

Competencias previas del alumno


El conjunto de conocimientos y práctica adquiridos al inicio del curso, irán dotando al estudiante de
las habilidades y la teoría necesarias para su adecuada aplicación en el desarrollo de nuevas
tecnologías involucradas en las ciencias de la salud.

Perfil deseable del docente para impartir la asignatura


El profesor deberá tener el dominio en el proceso de enseñanza aprendizaje de la biología molecular
en el aspecto teórico, especialmente en el área de la salud. Deberá mantener una actitud positiva
para participar en las actividades de educación continua en la disciplina.

Unidad 1: Introducción a la biología molecular


Objetivo
Introducir al alumno en los aspectos históricos y en los conceptos de a biología molecular de
mayor trascendencia en la aplicación de la nanomedicina.

Temas
1. Introducción a la biología molecular

1.1 Desarrollo histórico de la Biología molecular

1.1.1 Experimentos sobre: como se descubrió la naturaleza de los ácidos nucleicos, que el DNA
contiene el material genético y que el gen es una unidad de función: Griffith, Avery,
Hershey, Watson y Crick, Rosalind Franklin, Jacob, Monod, Termin, Baltimore.

1.2 Definición de conceptos básicos

1.2.1 DNA, gen, nucleótido, cromatina, RNA, flujo de la información genética, replicación,
transcripción, traducción, todas las células de un organismo poseen la misma información
genética, la transcripción es la base de la diferenciación celular, presencia y expresión de
genes.

1.3 Objeto de estudio, áreas afines e importancia en nanotecnología y medicina

1.3.1 Definir su objeto de estudio, dar ejemplos de aplicaciones de la biología molecular en


general y en nanotecnología en particular: base molecular de enfermedades, diagnóstico
molecular, medicamentos, etc.

1.4 Proyecto del genoma humano: qué es, número de genes en el genoma humano, aportaciones e
implicaciones médicas

Unidad 2: Organización del genoma humano


Objetivo
Que el alumno entienda los diferentes niveles de organización del DNA en las diferentes fases del
ciclo celular mencionando las principales proteínas involucradas en el mecanismo de
empaquetamiento del DNA.
Temas
2. Organización del genoma humano

2.1.1 Estructura celular

2.1.2. Diferencias entre células eucariotas y procariotas

2.2 Componentes fundamentales de los ácidos nucleicos

2.2.1 Componente ácido: Estructura de fosfatos


2.2.2 Componente neutro: Estructura de azucares
2.2.3 Componente Básico: Estructura de bases nitrogenadas
2.2.4 Estructura de Nucleósidos
2.2.5 Estructura de nucleótidos
2.3.1 Estructura primaria de ácidos nucleicos
2.3.1.1 Dos tipos de ácidos nucleicos según su composición: DNA y RNA

2.3.1.2 Representaciones esquemáticas

2.3.1.3 Representaciones abreviadas (A, C, T y G)

2.3.2 Estructura secundaria del DNA

2.3.2.1 Estructura secundaria del B-DNA


2.3.2.2 Proporción de bases nitrogenadas: Reglas de Chargaff
2.3.2.3 Relación entre purinas y pirimidinas
2.3.2.4 Modelo de Watson y Crick
2.3.2.5 Complementariedad de las bases nitrogenadas
2.3.2.6 Antiparalelismo de las dos hebras
2.3.2.7 Desnaturalización y renaturalización
2.3.3 Variantes en doble hebra: formas A, B y Z
2.3.4 Condensación del DNA y cromosomas
2.3.4.1 Condensación del DNA en eucariotes
2.3.4.2 Proteínas componentes de la cromatina (Histonas y no Histonas)
2.3.4.3 Disposición en nucleosomas y fibra de 10 nm
2.3.4.4 Formación de la fibra de 30 nm
2.3.4.5 Cromatina: Heterocromatina y eucromatina
2.3.4.6 Cromosoma metafásico: centrómero y Telómeros
2.4 Estructura del RNA
2.4.1 Estructura secundaria del RNA
2.4.2 Tipos de RNA: RNA mensajero (mRNA), RNA de transferencia (tRNA) y RNA
ribosómico.

2.5 Ciclo celular

2.5.1 Etapas del ciclo celular: G1,G0,S,G2 y M) con énfasis en comportamiento del DNA.
2.5.2 Fase de descompactación (G1)
2.5.3 Fase de duplicación (S)
2.5.4 Fase de preparación para la división de la cromatina (G2)
2.5.5 Fase de compactación o división (M).

Unidad 3: Replicación del DNA


Objetivo
Que el alumno entienda a la replicación como el principal mecanismo para la división celular, las
diferencias entre células procariotas y eucariotas, sus fases y los componentes que participan en el
proceso.
Temas

3.1 Definición y función de la replicación del DNA.


3.1.1 Características de la replicación: semiconservativa, bidireccional, simultánea y secuencial.
Inicio monofocal o multifocal.

3.1.2 Diferencias en la replicación entre células eucariotas y procariotas.


3.1.3 Dirección de la síntesis de DNA.
3.2 Elementos que participan en la replicación del DNA:
3.2.1 Descripción del complejo primosoma y replisoma.
3.2.2 Función y características de primasa, RNA cebador, helicasa, proteínas de unión a DNA
de cadena sencilla (SSB), topoisomerasas, ligasas y DNA’s polimerasas.

3.3 Etapas de la replicación:


3.3.1 Inicio: Concepto del sitio ORI, horquilla de replicación.
3.3.2 Extensión: Asimetría de la replicación en ambas hebras, síntesis continua y discontinua,
fragmentos de Okazaki y su maduración
Terminación: Final de la elongación, replicación de los telómeros, función, componentes
y acción de la telomerasa.

Unidad 4: Trasncripción
Objetivo
Que el alumno integre el conocimiento de la expresión de genes como un mecanismo del flujo de
la información genética que participa en la diferenciación celular, entendiendo desde la estructura
de un gen, hasta los principales mecanismos responsables de la regulación de la expresión génica.
Temas
4. Transcripción

4.1 Estructura del gen


4.1.1 Gen eucarionte (elementos estructurales: exones, intrones, sitio de inicio de la
transcripción, elementos funcionales: promotores y secuencias consenso, región río arriba
(negativo) y río abajo (positivo)
4.1.2 Elementos de expresión: Definición, ubicación, estructura e interrelación (RNAhn. RNAm,
RNAr y RNAt, polipéptido o proteína).
4.2 Transcripción
4.2.1 Inicio, elongación y terminación: Elementos que conforman el reconocimiento del
promotor: sitio de inicio, regiones consenso, RNA polimerasa (clasificación).
4.2.2 Definición, función y clasificación de factores transcripcionales (generales y tejido
específico).
4.3 Procesamiento del RNA
4.3.1 caperuza 5’, cola poli A., corte y empalme, edición.

4.4 Regulación

4.4.1 Pretranscripcional: Acetilación, metilación.


4.4.2 Transcripcional; Factores de transcripción y secuencias consenso.
4.4.1 Postranscripcional: vida media del RNA (cola poli A).

Unidad 5: Traducción
Objetivo
Que el alumno entienda a la traducción como el mecanismo para la síntesis de proteínas, las
diferencias entre células procariotas y eucariotas, sus fases y los componentes que participan en el
proceso.
Temas
5.1. Definición de la traducción

5.2 Código genético:


5.2.1 Codón, anticodón, degeneración, bamboleo.

5.3 Etapas de la traducción:


5.3.1 Iniciación, elongación y terminación.

5.3.2 Ejemplo de moléculas que pueden inhibir la síntesis de proteínas: antibióticos como
estreptomicina, neomicina, tetraciclinas, puromicina, eritromicina, etc.

5.3.3 Componentes: RNAt (estructura del RNAt: asa D, región variable, anticodón, aminoacil
sintetasas, ribosomas (subunidades pequeña y grande), ribonucleoproteína, sitio A, sitio
P), RNAm y factores de la traducción.

5.4 Modificaciones postraduccionales

5.4.1 Maduración de la proteína: glicosilación, fosforilación, hidroxilación, proteólisis.


Ejemplos: Procesamiento de la insulina (pre-pro-insulina). Hiperproinsulinemia familiar.

Unidad 6: Técnicas de DNA recombinante


Objetivo
Que el alumno sea capaz de entender los fundamentos, aplicaciones e interpretación de las técnicas
de la biología molecular con aplicación al pronóstico, diagnóstico, tratamiento de enfermedades y
en la biotecnología.

Temas
6.1 Manejo de muestras

6.1.1. Selección de muestras según se trate de la detección de un virus, bacteria, enfermedad


genética o adquirida: ejemplos; para tuberculosis pulmonar (expectoración), para hepatitis B
(suero), para distrofia muscular de Duchëne (leucocitos de sangre periférica).

6.2 Extracción de ácidos nucleicos:

6.2.1 Fundamento de la técnica de extracción de DNA y RNA: ruptura de membranas,


desnaturalización de lípidos y proteínas, purificación de ácidos nucleicos, precipitación de
ácidos nucleicos, disolución, cuantificación y preservación.

6.3 Enzimas que modifican ácidos nucleicos

6.3.1 Enzimas de restricción: definición, descubrimiento, nomenclatura, secuencias


palindrómicas, clasificación, tipos de extremos que generan: romo, cohesivo; mapas de
restricción.

6.3.2 Nucleasas: exonucleasas, endonucleasas. Polimerasas,

6.3.3 Desnaturalización, renaturalización, hibridación, obtención y utilidad de las sondas.

6.4 Electroforesis y Técnicas de Hibridación


6.4.1 Electroforesis, principios básicos.

6.4.2 Técnicas de hibridación: dot blot, slot blot, Northern, Southern, con ejemplos de
aplicaciones, hibridación in situ.

6.5 Vectores de clonación y expresión

6.5.1 Definición,

6.5.2 Clonación: fundamentos y aplicaciones (proteínas recombinantes)

6.6 Reacción en cadena de la polimerasa

6.6.1 Fundamento y características: replicación in vitro, requerimientos, ciclos de PCR


(desnaturalización, alineamiento, extensión), diseño de iniciadores por complementariedad
de bases, tamaño del fragmento amplificado, número de copias por cada ciclo según la
expresión 2n, especificidad y sensibilidad.

6.6.2. Análisis por electroforesis de fragmentos amplificados e interpretación de resultados.

6.6.3. Tipos de PCR: simple, RT-PCR, cuantitativo (tiempo real).

6.6.4. Aplicación de la PCR en el diagnóstico de enfermedades genéticas, adquiridas, virales,


bacterianas,

6.6.5. Ejercicios de integración: diseño de iniciadores, tamaño de fragmentos, elección de


muestra, interpretación de resultados.

Unidad 7: Estabilidad y diversidad genética


Objetivo
El alumno será capaz de entender la organización del genoma; los cambios en el DNA que
conducen a polimorfismos o diferentes tipos de mutación en asociación con alternativas
terapéuticas que involucran la nanotecnología, así como los mecanismos de reparación del DNA.

Temas
7.1 Clases de DNA

Complejidad del genoma eucariótico


DNA de copia única o no repetitivo
DNA repetitivo
DNA repetitivo codificante
DNA repetitivo no codificante

7.2 Polimorfismos, SNPs, RFLPs, VNTR`s: Satélites, Minisatélites y microsatélites

7.3 Mutaciones y su definición. Clasificación de las mutaciones: Por el tipo de célula: germinal y
somática por el tipo de daño: químicos, físicos y biológicos Por el tamaño: cromosómicas,
puntuales y pequeña escala (medianas). Por el tipo de cambio: sustitución, deleciones,
inserciones, secuencia invertida (transiciones o transversión). Por el efecto en el marco de
lectura: Silenciosa y no silenciosa, sin sentido o de paro, con sentido equivocado, cambio en el
marco de lectura

Agentes mutagénicos, mutación espontánea, teratógenos, carcinógenos ejemplos más frecuentes

7.4 Mecanismos de reparación: reparación por escisión (sistemas BER y NER, Fotoreparación,
antioxidantes, alquilotransferasas, sistemas SOS, RecA, recombinación homóloga y pos-
replicación, reparación por mal apareamiento, no-homólogos End joining (reparación por el
sistema recombinación no-homólogo del extremo terminal especial para rompimientos de doble
cadena.

Unidad 8: Tecnologías emergentes


Objetivo
El alumno será capaz de comprender la importancia del impacto de la nanotecnología en el
diagnóstico y tratamiento médico
Temas
8.1 Nanotecnología en las nuevas estrategias diagnósticas.

8.2. Nanodispositivos farmacológicos

8.3. Nanotecnología y Cáncer

8.4. Ingeniería de Tejidos

8.5. Medicina regenerativa

8.6. Nanotecnología en ciencias de la salud

8.6.1. Nutrición
8.6.2. Inmunología
8.6.3. Odontología

Competencias genéricas Competencias disciplinares y/o profesionales


Dominio de saberes prácticos, teóricos y Adecuada utilización del conocimiento técnico
formativos. y científico.
Alcance de la excelencia educativa en salud y Comprender la importancia de la biología
tecnología. molecular en su práctica profesional y en el
avance de la nanotecnología. Integrar el
conocimiento teórico y práctico Actuar con
responsabilidad, respeto, disciplina y ética.

Operación del programa


La materia de biología molecular utiliza un libro de texto y se apoya de equipo y materiales
audiovisuales y diversas técnicas didácticas:
Exposiciones magistrales, exposiciones del alumno, realización de resúmenes, esquemas, mapas
conceptuales y ensayos.
Utilización de dinámicas grupales como lluvia de ideas, mesas redondas, lecturas comentadas y
aprendizaje basado en problemas.
Encuadre del curso
Exámenes parciales 60% (2 exámenes)
Actividades en clase, reportes escritos 10%
Participación y tareas 20% (didácticas)
Presentación oral 10%
Actividades de aprendizaje
Resúmenes
Lluvia de ideas
Mapas conceptuales
Presentación oral
Exámenes teóricos escritos
Prácticas de laboratorio
Juegos didácticos
Material y ambiente del aprendizaje
Equipo utilizado:
Cañón y laptop para presentaciones de clase
Apuntador laser
Pintarron y plumones
Material didáctico:
Programas de computo (Word, excel, power point)
Bases de datos de la UDG (wdg.biblio.udg.mx)
Base de datos de presentaciones en power point de los temas del curso avaladas por la academia.
Base de datos de artículos de revisión avalados por la academia.
Actividades de aprendizaje
Software de mapas metabólicos
Casos clínicos integradores
Libro de texto elaborado por la academia de biología molecular para la documentación de los
temas.

Evaluación del aprendizaje


Criterios a evaluar en el aprovechamiento del alumno: exámenes, presentación oral, elaboración de
análisis y resúmenes de artículos científicos
Evaluación sumativa y criterios para su aplicación
Se realizarán 3 exámenes parciales, con un valor del 70%, a esto se le suman 20% de tareas,
participación, reportes escritos y actividades en clase y 10% de una presentación oral; con esto se
genera un gran total del 100%.
Criterio Rango de ponderación Indicadores Instrumentos
Saber 100% El alumno utilizará el Conjunto de
lenguaje técnico y indicadores teóricos y
científico de la biología prácticos.
molecular para
comprender la
importancia de la biología
molecular en su práctica
profesional y en el avance
de la nanotecnología en la
medicina. El alumno será
capaz de introducirse a
bancos de información
para actualizarse,
comprenderá artículos
científicos que involucren
biología molecular, y
conocerá la forma
adecuada de elegir y tratar
las muestras para estudios
moleculares, así como la
interpretación de
resultados.

Saber hacer 100% El alumno conocerá la Libros de texto,


forma adecuada de elegir artículos científicos.
y tratar las muestras para
estudios moleculares, así
como la interpretación de
resultados.
Saber ser 100% El alumno utilizará el Material didáctico,
lenguaje técnico y bases de datos, libros
científico de la biología de texto y manual de
prácticas.
molecular para
comprender la
importancia de la biología
molecular en su práctica
profesional y en el avance
de la nanotecnología en la
medicina.

Suma 100%
Cierre del curso del alumno
15 de Junio 2013
Cierre del curso por el docente (acciones de recuperación de información, juicios de valor y toma de
decisiones)
09 de Junio 2013
Fuentes de información para este curso
No. Autor(es) Título Editorial Año de No. de
edición páginas
1 José Luque & Texto Harcourt 2001
Ángel Ilustrado de
Herráez. Biología
Molecular e
Ingeniería
Genética:
Conceptos,
Técnicas y
Aplicaciones
en Ciencias
de la Salud.
2 Bruce Alberts Introducción Panamericana 2011
y col a la Biología
Celular
3 Benjamin GENES XI Oxford University 2012
Lewin Press
4 Nalini Biología Wolters 2011
Chandar y Molecular y Kluwer/Lippincott
Susan Viselli celular Williams &
Wilkins.
5 Vasudevan Texto de Cuéllar-Ayala 2011
DM, Bioquímica
Sreekumari
S, Kanna V.
6 Gerald Karp. Biología 2011
cellular y
molecular,
conceptos y
experimentos.
Participantes en la elaboración del programa
Código Nombre completo Academia
2702576 Mayra Guadalupe Ciencias Biomédicas
Mena Enriquez
2951401 David Alejandro Ciencias Biomédicas
López de la Mora
208506981 Cibeles M. Ciboney
Sánchez Roque

Fecha

Elaboración Aprobación por Academia Próxima revisión

15 de Diciembre del 13 de enero 2015 junio 2015


2014