7.1 Descripción general de la replicación del ge-
Los retrovirus y pararetrovirus son casos especia-
noma del virus
En este capítulo consideramos el quinto paso de nues-
tro ciclo de replicación generalizado: la replicación del
genoma. El genoma del virus infectante se replica para
que la transcripción viral se pueda amplificar y para
proporcionar copias del genoma para los viriones de la
progenie.
En general, los virus de ADN copian sus geno-
mas directamente al ADN y los virus de ARN copian sus
genomas directamente al ARN. Sin embargo, hay algu-
nos virus de ADN que replican sus genomas a través de
un intermedio de ARN y algunos virus de ARN que re-
plican sus genomas a través de un intermedio de ADN.
Los diversos modos de replicación de los genomas de
virus se resumen en la Figura 7.1.
Los genomas monocatenarios se designan
como más o menos según su relación con el ARNm del
virus. Los genomas de cadena positiva tienen la misma
secuencia que el ARNm (excepto que en el ADN la ti-
mina reemplaza al uracilo), mientras que los genomas
de cadena negativa tienen la secuencia complementa-
ria al ARNm. El ADN monocatenario se convierte en
ADNds antes de la copia.
Hay dos clases de virus con genomas de ARN
(+) (Figura 7.1). Los virus de clase IV copian sus geno-
mas de ARN (+) a través de un intermedio de ARN (-),
mientras que los virus de clase VI se replican a través
de un intermedio de ADN. La síntesis de ADN a partir
de una plantilla de ARN (transcripción inversa) también
es una característica de los virus de Clase VII.
En este capítulo veremos algunos aspectos ge-
nerales de la replicación del genoma del virus, y luego
prestaremos atención individual a la replicación de los
genomas de los virus de ADN, los virus de ARN y los vi-
rus de transcripción inversa.
7.2 Ubicaciones de la replicación del genoma del
virus en células eucariotas
Como vimos en el Capítulo 5, cuando los virus infectan
las células eucariotas, algunos genomas se envían al ci-
toplasma y otros se transportan al núcleo. El destino de
un genoma de virus y, por lo tanto, la ubicación en la
que se replica, varía según el tipo de genoma (Tabla
7.1).
Los genomas de la mayoría de los virus de ADN
se replican en el núcleo, pero los de algunos virus de
ADNds se replican en el citoplasma. Los genomas de la
mayoría de los virus de ARN se replican en el cito-
plasma, pero los de los virus de ARN de cadena nega-
tiva con genomas segmentados se replican en el nú-
cleo.
les: cada uno replica ARN a ADN en el citoplasma y ADN
a ARN en el núcleo.
7.3 Iniciación de la replicación del genoma.
Cada genoma de virus tiene una secuencia específica
donde se inicia la replicación de ácido nucleico. Esta se-
cuencia es reconocida por las proteínas que inician la
replicación.
La replicación de ácido nucleico requiere ceba-
dores, que es la primera reacción de un nucleótido con
un grupo –OH en una molécula en el sitio de iniciación.
La replicación de los genomas de muchos virus de ARN
(incluidos rotavirus y rabdovirus) se inicia cuando el pri-
mer nucleótido de la nueva base de la cadena se empa-
reja con un nucleótido en el ARN viral. El nucleótido ini-
cial actúa efectivamente como un cebador para la re-
plicación de ARN cuando su grupo 3-OH se une al se-
gundo nucleótido.
Algunos virus ssDNA, como los parvovirus, usan
autocebadores. En el extremo 3’ del ADN hay regiones
con secuencias complementarias que pueden formar
pares de bases (Figura 7.2). El grupo –OH del nucleó-
tido en el extremo 3’ forma un enlace con el primer nu-
cleótido, luego la síntesis de ADN procede por un pro-
ceso bastante complejo para garantizar que se copia
todo el genoma.
Para iniciar la replicación de muchos genomas
de ADN y algunos genomas de ARN, se requiere una
molécula de ARN o proteína para actuar como cebador.
7.3.1 ARN y cebadores de proteínas
La síntesis del ADN celular comienza después de que
una región de la doble hélice ha sido desenrollada por
una helicasa y después de que una primasa ha sinteti-
zado secuencias cortas de ARN complementarias a las
regiones del ADN. Estos ARN actúan como cebadores;
se requiere uno para la cadena principal, mientras que
se deben sintetizar múltiples cebadores para los frag-
mentos de Okazaki de la cadena retrasada. El primer
nucleótido de una nueva secuencia de ADN está unido
al grupo 3-OH del cebador de ARN.
Algunos virus de ADN también usan cebadores
de ARN durante la replicación de sus genomas. Algunos
virus, como los poliomavirus, utilizan la primasa celular
para sintetizar sus cebadores de ARN, mientras que
otros, como los herpesvirus y el fago T7, codifican sus
propias primasas.
Durante su ciclo de replicación, los retrovirus
sintetizan ADN a partir de una plantilla de ARN (+) (Sec-
ción 16.3.2). Usan un ARN de transferencia celular para
cebar la síntesis de ADN (-), luego usan el grupo 3 –OH
en un tracto de polipurina del molde de ARN (+) par-
cialmente degradado para cebar la síntesis de ADN (+).
El ADN del retrovirus se integra en un cromosoma ce-
lular. Si la infección está latente y la célula se divide
posteriormente (Sección 9.3.1), el ADN del virus se co-
pia junto con el ADN celular, utilizando cebadores de
ARN sintetizados por la célula primasa.
Para algunos virus, el cebador para el inicio de
la replicación de ácido nucleico es el grupo –OH en un
residuo de serina o tirosina en una proteína. Los virus
de ADN que usan cebadores de proteínas incluyen al-
gunos virus animales (por ejemplo, adenovirus) y algu-
nos fagos (por ejemplo, tectivirus). Los virus de ARN
que usan cebadores de proteínas incluyen algunos vi-
rus animales (por ejemplo, picornavirus) y algunos vi-
rus vegetales (por ejemplo, luteovirus).
Los hepadnavirus son virus de ADN que usan
un cebador de proteínas para iniciar la síntesis de ADN
(-) y un cebador de ARN para iniciar la síntesis de ADN
(+) (Sección 18.8.6).
Los cebadores de proteínas (y los cebadores de
ARN de los hepadnavirus) no se eliminan una vez que
se realiza su función y se encuentran vinculados a los 5
extremos de los genomas en los viriones (Sección
3.2.3).
7.4 Polimerasas
Las enzimas clave involucradas en la replicación del ge-
noma del virus son las ADN polimerasas y las ARN poli-
merasas. Muchos virus codifican su propia polimerasa,
pero algunos usan una enzima de la célula huésped (Fi-
gura 7.3).
Un virus de ADN requiere una ADN polimerasa
dependiente de ADN. Entre los virus de ADN que se re-
plican en los núcleos de las células eucariotas, los virus
con genomas pequeños (por ejemplo, los virus del pa-
piloma) usan la enzima celular, mientras que los virus
con genomas grandes (por ejemplo, los virus del her-
pes) codifican su propia enzima. Esos virus de ADN que
se replican en el citoplasma deben codificar su propia
enzima.
La enzima que replica el genoma de un virus de
ARN a menudo se denomina replicasa; para muchos vi-
rus ARN, esta es la misma enzima que la utilizada para
la transcripción (Sección 6.3.3). Los retrovirus y los pa-
raretrovirus codifican transcriptasas inversas para
transcribir de ARN a ADN, y usan la ARN polimerasa II
de la célula huésped para transcribir de ADN a ARN.
Muchas polimerasas virales forman complejos con
otras proteínas virales y/o celulares para producir la
enzima activa. Algunas de estas proteínas adicionales
son factores de procesividad, por ejemplo, una molé-
cula de tiorredoxina de Escherichia coli funciona como
un factor de procesividad para el ADN polimerasa del
fago T7.
7.5 Replicación de ADN
Los virus de Clase I (ADNds) y Clase II (ADNss) replican
sus genomas a través de ADNds. Los virus ssDNA pri-
mero sintetizan una cadena complementaria para con-
vertir el genoma en dsDNA.
Cada ADN viral tiene al menos una secuencia
específica (ori; origen de replicación) donde se inicia la
replicación. Las proteínas que inician la replicación del
ADN se unen a este sitio, y entre estas proteínas están
• una helicasa (desenrolla la doble hélice en ese sitio);
• una proteína de unión a ADNss (mantiene las dos cade-
nas separadas);
• una ADN polimerasa.
El dsDNA viral generalmente se replica me-
diante un proceso similar al utilizado por las células
para copiar sus genomas. El proceso básico y las enzi-
mas involucradas se resumen en la Figura 7.4. Hay me-
nos proteínas involucradas en los sistemas bacterianos
que en los sistemas eucariotas; por ejemplo, la heli-
casa-primasa del fago T7 es una molécula de proteína
única, mientras que la del virus del herpes simple es un
complejo de tres especies de proteínas.
La síntesis de ADN tiene lugar cerca de una bi-
furcación de replicación. Una de las cadenas hijas es la
cadena principal y la otra es la cadena retrasada, sinte-
tizada como fragmentos de Okazaki, que se unen me-
diante una ADN ligasa. Después de que se ha copiado
una molécula de ADNds, cada una de las moléculas hi-
jas contiene una cadena de la molécula original. Este
modo de replicación se conoce como semiconserva-
tivo, en contraste con la replicación conservadora de
algunos virus dsRNA (Sección 7.6).
Algunos genomas de ADN son moléculas linea-
les, mientras que otros son círculos cerrados covalen-
temente (Sección 3.2). Algunas de las moléculas linea-
les se circulan antes de la replicación del ADN, por lo
tanto, muchos genomas de ADN se replican como mo-
léculas circulares, para las cuales hay dos modos de re-
plicación, conocidos como theta y sigma (Figura 7.5).
Estos términos se refieren a las formas representadas
en los diagramas de las moléculas de replicación, que
se parecen a las letras griegas θ (theta) y σ (sigma). El
modo de replicación sigma también se conoce como
modo de círculo rodante. Los genomas de algunos virus
de ADN pueden ser replicados por el modo theta de re-
plicación temprano en la infección y el modo sigma
tarde en la infección.
 La replicación del ADN de algunos virus, como
los herpesvirus (Sección 11.5.3) y el fago T4, da como
resultado la formación de moléculas de ADN muy gran-
des llamadas concatémeros. Cada concatémero está
compuesto de múltiples copias del genoma del virus y
los concatémeros de algunos virus están ramificados.
Cuando se empaqueta el ADN durante el ensamblaje
de un virión, una endonucleasa corta la longitud del ge-
noma de un concatador.
7.6 Replicación de ARN bicatenario
El ARN bicatenario, como el ADNds, debe desenrollarse
con una helicasa para que la molécula se replique.
Algunos virus dsRNA, por ejemplo, el fago de
Pseudomonas ϕ6 (ϕ = letra griega phi), replica sus ge-
nomas mediante un mecanismo semiconservador, si-
milar a la replicación de dsDNA (Sección 7.5); cada una
de las moléculas de progenie de doble cadena está for-
mada por una cadena parental y una cadena hija. Otros
virus dsRNA, incluidos los miembros de la familia Reo-
viridae (Capítulo 13), se replican mediante un meca-
nismo designado como conservador porque la molé-
cula bicatenaria del genoma infectante se conserva (Fi-
gura 7.6).
7.8 Transcripción inversa
Algunos virus de ARN replican sus genomas a través de
un intermedio de ADN, mientras que algunos virus de
ADN replican sus genomas a través de un intermedio
de ARN (Figura 7.1). Ambos modos de replicación del
genoma implican la transcripción inversa, que tiene
dos pasos principales: síntesis de ADN (-) a partir de
una plantilla de ARN (+) seguido de síntesis de una se-
gunda cadena de ADN (Figura 7.7). Ambos pasos están
catalizados por una transcriptasa inversa codificada
por el virus.
La transcripción inversa tiene lugar dentro de
una estructura viral en el citoplasma de la célula infec-
tada. En capítulos posteriores, el proceso se considera
con más detalle para los retrovirus (Sección 16.3.2) y
para el virus de la hepatitis B (Sección 18.8.6). No se
sabe que los virus de los procariotas realicen la trans-
cripción inversa.

7.7 Replicación de ARN monocatenario

Los genomas de virus ssRNA de las clases IV y V se re-
plican mediante la síntesis de cadenas complementa-
rias de ARN que luego se utilizan como plantillas para
la síntesis de nuevas copias del genoma (Figura 7.1). La
síntesis de cada molécula de ARN requiere el recluta-
miento de una ARN polimerasa dependiente de ARN en
el extremo 3’ de la plantilla, por lo tanto, el ARN de ca-
dena positiva y negativa debe tener un sitio de unión
para la enzima en el extremo 3’.
Un punto interesante a tener en cuenta aquí es
que todos los virus de eucariotas clase IV replican su
ARN en asociación con las membranas citoplasmáticas.
Para muchos grupos de virus, incluidos los picornavirus
(Sección 14.4.4), estas membranas se derivan princi-
palmente del retículo endoplásmico, pero se utilizan
otras estructuras membranosas, incluidos endosomas
(por togavirus) y cloroplastos (por tombusvirus). Las
proteínas virales, incluidas las ARN polimerasas, están
unidas a las membranas.
Durante la replicación de ssRNA, ambas cade-
nas (+) y (-) de ARN se acumulan en la célula infectada,
pero no en cantidades iguales. Los virus de ARN de ca-
dena positiva acumulan un exceso de ARN (+) sobre
ARN (-), y para los virus de ARN de cadena negativa,
ocurre lo contrario.