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Tema 7 → NUCLEÓTIDOS Y ÁCIDOS NUCLEICOS.

Los nucleótidos están formados por 3 partes fundamentales:

• Base nitrogenada
• Azúcar → PENTOSA.
• Grupo fosfato.

Falta rellenar hasta las bases nitrogenadas.

Bases nitrogenadas.
Las bases nitrogenadas son anillos generalmente planos, rígidos, aromáticos y que contienen
varios grupos de nitrógeno. Tenemos 2 tipos de bases nitrogenadas:

• Bases púricas:
― Derivadas de la purina, tiene 2 anillos.
― Adenina (6-aminopurina)
― Guanina (2-amino-6-oxo-purina)

• Bases pirimidínicas:
― Derivadas de la pirimidina, es un anillo más simple, pero también aromático y
plano.
― Citosina (4-amino-2-oxo-pirimidina).
― Timina (5-metil-2,4-dioxopirimidina).
― Uracilo (2,3-dioxopirimidina). Es igual que la timina sin el grupo metil en el C5.

Tanto ADN como ARN


contiene dos bases
púricas y dos
pirimidínicas, pero:

En el ADN encontraremos citosina (C), adenina (A), guanina (G) y timina (T). NO URACILO.

En el ARN encontraremos citosina (C), adenina (A), guanina (G) y uracilo (U). NO TIMINA.

• Existen otras bases llamadas bases raras o menores.


― Aparecen en pequeñas cantidades.
― fundamentalmente las modificaciones que tienen estas bases derivadas de las
principales son: adicciones de grupos metilo, hidroxilo o glicosiladas.
― En el ADN son fundamentalmente son metiladas (bases con grupos metilo), esto
se usa para regular o proteger la información genética.
Son bases metiladas las 5-metilcitidina que esta en los animales y en plantas superiores, la N6-
metiladenosina, que está en las bacterias.

Azúcar → Pentosa
Nos vamos a encontrar 2 tipos de azúcares:

• ADN (desoxirribonucleótidos) que contiene 2´- desoxi-D-ribosa.


• ARN (ribonucleótidos) que contiene D-ribosa.
• La ribosa en su estructura lineal esta siempre en equilibrio con la β-furanosa,
el anillo esta ciclado. Siempre en los nucleótidos la forma en la que lo contiene es
la forma del anillo pentagonal cerrado que es la β-furanosa.
• Cuando esta ciclada, los azúcares pueden adquirir distintas conformaciones
distorsionadas, las imágenes de abajo se ven dos conformaciones que se les
denomina formas “ahuecadas” donde los distintos átomos generalmente están
en un mismo plano, pero podemos tener 2 conformaciones que derivan del
carbono 2´ o del 3´.

Conformación endo cuando el C2´


esta en el mismo plano que el C5´
y la exo, cuando el 2´ está en
distinto plano que el 5´. Lo mismo
ocurre con el C3´, que también
puede adquirir las dos
conformaciones.

Base + azúcar Base + azúcar + fosfato (P)


ADN

Nucleótidos: Forma larga donde describe un poco


más donde están los diferentes compuestos y el Los 4 nucleótidos que forman parte del ADN
grupo fosfato.

Símbolos: Nombres abreviados. Normalmente se


abrevian con la letra de G, A, C, U, T, por que el
esqueleto del azúcar y el fosfato es siempre el
mismo porque la diferencial es la base
nitrogenada.

ARN

Además del azúcar y la base nitrogenada también hay un grupo fosfato. Este fosfato
normalmente lo tenemos unido en el C5´ de la pentosa, sin embrago en determinadas células
hay también nucleótidos con grupos fosfato en posiciones diferentes al 5´de
la ribosa, es decir, son modificaciones de los azúcares que forman parte de
estos nucleósidos.

• Hay los ribonucleósidos que tienen el fosfato unido al C2´o C3´y son
cíclicos.
• O los que los tienen en formato sin ciclar y también tiene el fosfato
en 2´- monofosfato o 3´- monofosfato.

Ambos tipos de compuestos son productos finales de la hidrólisis del ARN, lo


podemos encontrar cuando se hidroliza el ARN, cuando se está degradando
y se obtienen este tipo de compuestos que además se pueden aislar en el
laboratorio.


• Otro ejemplo es el 3´, 5- monofosfato cíclico (cAMP) →
metabolismo. Es un derivado del nucleótido de la adenosina que es
monofosfato también y es cíclico (unido el fosfato con el C5´y C3´).
ORIENTACIÓN 5´→ 3´
Unión de nucleótidos por enlaces fosfodiéster.
Tenemos la estructura que va a formar parte de las
macromoléculas, que es el nucleótido, como todo el resto de las
macromoléculas, los nucleótidos se a unir a otro tipo de
nucleótidos para formar compuestos más sólidos.

- En el ADN y en el ARN, los nucleótidos se van a unir


covalentemente mediante “puentes” de grupos fosfato, este
fosfato va a servir de unión para unir los distintos nucleótidos
mediante un enlace de tipo fosfodiéster

- Tenemos un esqueleto que esta formado por los fosfatos y las


pentosas, las bases nitrogenadas serán como radicales que
estarán unidas al esqueleto. Estos esqueletos son hidrófilos ya
que tienen muchos grupos -OH que están formando enlaces de
hidrógeno. A un pH 7, las cargas en los grupos fosfatos están
ionizados, al estar ionizados estas cargas negativas se estabilizan
por interacciones iónicas con otras cargas positivas de proteínas,
iones metálicos o poliaminas.

Tanto ADN como ARN, los enlaces fosfodiéster tienen una orientación y una polaridad
determinada, es decir, siempre se van juntando de la misma manera entre 5´y 3´. El
extremo 3´de la pentosa esta libre y el 5´del grupo fosfato también.

Forma esquemática de representar el esqueleto de fosfatos (P 5´), pentosas (línea


vertical 3´) y base nitrogenada (1´A, C, G, T)

• Hay diferentes tipos de representaciones. Ej: p A-C-G-T-A / pApCpGpTpA / PACGTA

Muy importante saber que la secuencia de una cadena sencilla de ácidos nucleico se escribe
siempre con el extremo 5´a la izquierda y el 3´a la derecha, es decir, direccion 5´→ 3´.

- Oligonucleótido: Hasta 50 nucleótidos. - Polinucleótidos: Ácidos nucleicos de mayor longuitud.

Análogos de bases o nucleósidos como agentes terapéuticos (Se puede enlazar con actividad
cinética)

Hay estructuras que son similares a los sustratos de determiandas enzimas y por lo tanto
podian inhibir una determinada enzima. En este caso también hay análogos estructurales
específicos de enzimas implicadas en el metabolismo de nucleótidfos y se emplean para el
tratmiento de diferentes patologías, es decir, se ha creado de forma natural o sintetizados en
farmacias determinados compuestos análogos a estas bases y van a inhibir enzimas implicadas
en la replicación del ADN, o en la transcripción de la célula. por ejemplo.

• Aciclovir y AZT (3´- oxido- 3´- desoxitimidina). Análogo de base púrica y análogo de
base pirimidinica respectivamente. y al ser análogos pero no iguales del todo, lo que
haces es permitir controlar determiandas infecciones de virus como del herpesvirus
(HSV) o virus de la inmunodeficiencia humana (VIH), respectivamente.

Lo que ocurre es que estos compuestos cuando se activan energeticamente añadiendoles


fosfato, las polimerasas (enzimas de replicación de virus) no es capaza de distinguir entre un
nucleótido o un análogo y lo que hace es unirse a la ADN-plimerasa e impide que el virus de
duplique. La plimerasa divide el ADN del virus, replicarlo para que crezca. Controla así la
infección.

ADN, ÁCIDOS DESOXIRIBONUCLEICOS


Raglas de Chargaff: En 1940, Erwin Chargaff y colaboradores empezaron a describir las
caracterisricas del ADN, vieron que habia cantidades relativas de ciertas bases
nitrogenadas que varian según el organismo y que las cantidades relativas de estas
bases estaban muy relacionadas. Emitio unas reglas que sientas las bases de ADN

En 1950 Rosalin Franklin y Mauri Wilkins mediante difracción de rayos X descubrieron


la estructura que tenia el ADN (estructura helicoidal), y finalmente Waton y Crick en el
53 postularon un modelo tridimensional para el ADN basado en 4 reglas:
2.- Ambas cadenas de ADN son dextrógiras y antiparalelas, tiene direcciones opuestas.

3.- El apareamiento de las dos cadenas forma un surco mayor y otro menor.

4.- Estas dobles cadenas se aparean de forma complementaria, cada una esta en una
dirección una en 5´→ 3´y la otra en 3´→ 5´.

- Se aparean porque la composición de las bases es complementaria, se va


complementando una base con la otra, por lo tanto las cadenas no son identicas sino
complementarias.

- Estos pares de bases nitrogenadas, que son las que se quedan en el interior, estan unidas
por enlaces de hidrógeno con su base complementaria.

- G Ξ C → Se unen mediante 3 enlaces de hidrógeno. Púrica con pirimidínica.

- A = T → Se unen mediante 2 enlaces de hidrógeno. Púrica con pirimidínca.

- Cuantas más cantidades haya de uniones G Ξ C mayor dificultad habra para separar las
hebras que si hay uniones de A = T.

- Otros apareamientos difernetes tienden, en mayor o menor medida a desestabilizar la


estructura de doble hélice.
Además, con estas 4 bases también crean las bases de la replicación del ADN, dicen que la
complementariedad de las hebras permite deducir como se replicaba este ADN, esta
replicación se basaría un poco desenrollar las 2 hebras con lo que una de ella servía de
molde para poder replicar el ADN, para que una célula pueda convertirse en 2 con el
mismo material genético.

Fusión reversible del ADN.


A nivel experimental, esta separación se puede producir mediante la
escisión de estos enlaces de hidrógeno o bien por aumento de la
temperatura o añadiendo ácidos o bases para romper los puentes de
H2.

La temperatura a la que se desenrolla el ADN se llama temperatura de


fusión (melting). Lo que ocurre es que cuando hay una alta
composición de bases de guanina y citosina, la temperatura de fusión
va a ser más alta porque hay que romper más enlaces y cuando
tenemos adeninas y timinas, la Tm de fusión será más baja.

Cuando volvemos a la temperatura normal, las hebras de ADN se


vuelven a enrollar

ARN, ÁCIDO RIBONUCLEICO


El ADN se transcribe a ARN, y la secuencia de ARN se traduce a la secuencia de
aminoácidos correspondientes, formando una proteína, es decir, el ARN es un el
mensajero que nos traduce la información que tenemos escrita en el ADN a la proteína
que tiene que codificar.

Esta transferencia de información biológica se resume en el llamado dogma central de la


biología, formulado por Crick en el 58, (el ADN tenía capacidad de replicarse, después de
transcribía a una molécula de ARN y este ARN servia de molde para traducir la proteína
que estaba codificada en el ADN) y modificado posteriormente, porque se vio que algunos
virus también eran capaces de replicar su ARN y de hacer una transcripción inversa y pasar
el ARN del virus a ADN
ARN RIBOSÓMICO (ARNr)

- Es el componente fundamental de los ribosomas, estos estan en el citosol y son los


encargados de traducir/fabricar las proteínas.

- Constituye hasta un 65% del peso de los ribosomas.

- Tiene función catalítica (ribozimas) y estructural en la síntesis de proteínas.

- Todos los ribosomas, tanto procariotas como eucariotas constan de dos subunidades, una
grande y otra pequeña. En ambas subunidades habra ARN y proteínas que seran los
encargados de trasnformar el ARN mensajero en la proteína que estan codificando.

Estas dos subunidades se van a diferenciar mediante unidades de Sverdberg (S), se basan en
una técnica llamada centrifugación analítica. Cuando cogemos un ribosoma y lo sometemos a
esta centrifugación analítica, ocurre que al centrifugar veremos la sedimentación que tiene
cada subunidad.
- Las unidades S se basan no solamente en el tamaño que tiene cada una de las partículas de
los RNA sino también en la forma que tienen, no sera proporcional

- Van a diferenciar las partes de los ribosomas. Los ribosomas eucariotas tienen un coeficiente
de sedimentación de 80 S y estas formado por:

- Unidad menor: 40 S (1 ARNr de 18 S ± 33 proteínas).

- Unidad mayor: 60 S (3 ARNr de 5 S, 28 S y 5,8 S ± 49 proteínas).

En procariotas es
importante conocer que
la unidad menor
contiene 1 ARNr de 16
S. Sirve para diferenciar
ej: la microbiota: Su usa
para saber la
composición de
bacterias que hay en un
intestino y relacionarlo
con salud

ARN DE TRANFERENCIA (ARNt) necesario para llevar al ribosoma y que el ARNm vaya codificando las proteínas.

Es un ARN muy pequeñito de una sola cadena que contiene 75


nucleótidos.

• Función: Transportar aminoácidos en forma activada al


ribosoma para la formación de enlaces peptídicos a partir de la
secuencia codificada por el ARNm molde.

El ARNt es un mediador entre el ARNm que se va a unir al


“anticodón”, tiene 3 nucleótidos que van a codificar para un
aminoácido que es el que va a llevar en el “brazo aminoácido
3´” y los aminoácidos.

Tiene una estructura de tipo trébol donde hay partes que están
formando enlaces de H2 de forma complementaria con otros
nucleótidos denominadas tallos y las partes que no forman
enlaces de H2 llamados bucles.
Va a haber al menos un ARNt por cada uno de los
aminoácidos que tenemos, que son 20 ya que cada uno de
• va aEstructura
ellos de trébol:
ir codificando un aminoácido por un “anticodón”

del ARNm.
• Estructura en forma de trébol
― Tiene un residuo de guanilato (pG) en el extremo 5´ y secuencias CCA en
extremo 3´.
― Brazo del aminoácido: aminoácido específico unido por su grupo carboxilo al
grupo hidroxilo 2´o 3´del residuo A del extremo 3´. Es el extremo donde va a ir
unido el aminoácido que va a estar codificado por un anticodón que se va a unir
específicamente a 3 nucleótidos del ARNm que van a formar el aminoácido que
van a incorporado a la proteína.
― Brazo anticodón
― Brazo D: Contiene dihidrouridina (D). Mantienen la estructura
― Brazo T¥C: Contiene ribotimina (T) y pseudouridina (¥). en forma de trébol

ARN MENSAJERO (ARNm)

Es el menos abundante de todos los ARN, constituye el 5-10% del ARN celular y su

- Función es servir de molde para la síntesis de proteínas o traducción.

- Cuando solamente contiene información para la síntesis de un solo polipéptido se le


denomina ARNm monocistrónico.

- Cuando codifica a dos o más polipéptidos diferentes: ARNm policistónico.

Esta secuencia de nucleótidos del ARNm es complementaria al mensaje genético de ADN, a


un segmento, gen específico del ADN.

El ADN esta en el núcleo y que los ribosomas donde se forman las proteínas están en el
citoplasma, entonces lo que ocurre es que el ARNm se forma inicialmente en el núcleo, se hace
complementario a la molécula de ADN que es el gen que queremos codificar y se forma una
molécula grande llamada ARN nuclear heterogénea que contiene porciones de secuencia
intermedias llamadas intrones que no codifican para proteínas, después hay que modificarlas
para que formen la proteína (Extones).

ARN NUCLEAR PEQUEÑO (ARNsn)

En la parte de eliminación de intrones está implicado el ARNsn (nuclear pequeño) que se


encuentra en el núcleo de las células y contiene entre 100-200 nucleótidos.

Se une a proteínas en el núcleo de las células para formar partículas nucleares pequeñas de
ribonucleoproteínas (PRNsn) → ARN con proteínas.
Aquí vemos un gen (ADN) que tiene regios codificantes
(exones) y regiones que no codifican para proteínas
(intrones). El ARNsn se une a estas proteínas formando el
complejo snRNP y se une a la parte intrónica, la pliega y
la elimina del ARN inmaduro formando un ARN maduro
formado solamente por las regiones codificantes (exones)
codificados por los exones de nuestra proteína. A este
complejo se le llama esplicesoma, es la forma de eliminar
estos intrones.

Una vez que este solo con exones puede transportarse al


citosol para ser codificado mediante el ARN de
transferencia, por los ribosomas y formar las proteínas

ATP: Moneda de intercambio energético en las células

El ATP es un ribonucleico construido por una ribosa + adenosina + 3 grupos fosfato, el


primero unido por un enlace fosfoéster y los otros por un enlace fosfoanhídrido.

La importancia del ATP radica en la gran cantidad de energía libre que acompaña a la
hidrólisis de los enlaces fosfoanhídrido, cuando se rompe uno de estos enlaces para
formar ADP + Pi o AMP, genera/libera grandes cantidades de energía
AMPc: Actúa como segundo mensajero

A partir de un ATP, una ciclasa, nos cicla el fosfato en las posiciones 5´ y 3´. Este
compuesto también es muy importante para transducir señales de la célula, es decir,
cuando hay respuestas a determinadas hormonas, cuando comemos mucho, cuando
tenemos estrés se producen hormonas y en respuesta a estas hormonas empiezan a
secretar determinados segundos mensajeros que van a servir para traducir señales de
las células.
Es indispensable también para actividades de proteinasas, activan o fosforilan residuos
de serina o treonina que son proteínas celulares y producir que las señales vayan del
exterior al interior de la célula para que responda de una manera u otra.

NAD+ y NADP+ → son coenzimas de enzimas que transportan electrones.

Hay otros nucleótidos que forman parte de coenzimas.


Los anillos se unen a enzimas transportadoras de electrones y van a estar implicadas
tanto en el catabolismo como en el anabolismo.
- NAD+: implicado en el catabolismo - NADP+: implicado en el anabolismo
Ambos son dinucleótidos forman parte de la nicotinamida y la adeninia y el NADP
además tiene un grupo fosfato. Ambos derivan de la vitamina niacina que se sintetiza a
partir del triptófano. Cuando hay una carencia de esta Vitamina, provoca la pelagra, es
una enfermedad que viene dada por la falta de vitaminas, provocaba diarrea, mareos…
FAD y FMN

También son coenzimas de enzimas que son transportadoras


de electrones y provienen también de una vitamina, la
vitamina B2.

COENZIMA A (CoA)

Es importante en la activación de los ácidos grasos tanto para el catabolismo como el


anabolismo.

• Función: Transportar grupos acilo


- Transporta estos grupos acilo uniéndose mediante enlaces tióester,
uniéndose a su parte final que tiene un grupo sulfhidrilo con un grupo hidroxilo
del grupo acilo, se unen juntos y los va transportando
- Los grupos acilos se unen a los CoA mediante un enlace tióester, formándose
un derivado denominado acil-CoA.

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