1 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

Planeamiento de latices cuadrados con AGROBASE.

Es posible planear experimentos de latice balanceados o parcialmente balanceados 3x3 hasta 16x16
tratamientos.

Los latices parcialmente balanceados son conocidos como: Latice simple (2 cuadrados) latice triple (3
cuadrados), latice cuadruple (4 cuadros), etc. si el numero de cuadrados es igual al orden del latice más una
unidad, el latice es completamente balanceado.

Por ejemplo:

Latice balanceado 3x3 con una sola repetición del diseño básico. El primer cuadrado se randomiza.

Cuadros Rdto.
1 4 3 48.76 14.46 19.68
8 6 7 10.83 30.69 31.00
5 9 2 12.54 42.01 23.00

5 8 1 11.07 22.00 41.00

2 7 3 22.00 42.80 12.90
9 6 4 47.43 28.28 49.95

2 1 6 27.67 50.00 25.00

7 5 4 30.00 24.00 45.57
3 8 9 13.78 24.00 30.00

6 3 5 37.00 15.42 20.00

4 2 8 42.37 30.00 18.00
9 7 1 39.00 23.80 43.81

En este caso del latice 3x3, se tiene 4 cuadrados distintos, lo que forma un latice balanceado. Se dice
balanceado, porque un tratamiento se llega a combinar con todos los demas, así:

Tratamiento 1: 4, 3; 5, 8; 2, 6; 9, 7

Si solo se utilizaría latice simple, el tratamiento 1 sólo tendría oportunidad de combinarse con 4, 3 y 5, 8.

Realice su propio planeamiento de un diseño latice balanceado 3x3

Pasos a seguir:
1. Ingrese a la opción Design randomize de AGROBASE
2. Seleccione en {Select an experimental design} ‘Completely or partially balance lattice’.
3. Presione el botón [Design parameters] e ingrese los datos:
4. Treatments per incomplete block = 3
5. Complete blocks = 4
6. Repetitions of the basic design = 1
7. Total number of complete block = 4
8. Randomize the first block = X
9. Presione el boton [Accept]
10. Seleccione el archivo donde tiene los tratamientos o crearlos con la opcion [create] de esta ventana.
11. Seleccione 9 tratamientos.
12. En el botón [Design option], tome nota de la semilla de randomización ó ingrese otro valor para la
semilla. Y registre estos valores, botón [Accept].
2 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

13. En el boton [Fields], seleccione el campo ENTRY.

14. De un nombre de archivo para almacenar el planeamiento generado, para esto presione el botón
[Design File]
15. Ahora, esta listo para generar el planeamiento, presione el botón [Generate]

Analisis de latice cuadrado con AGROBASE.

Agrobase realiza el analisis de todos los diseños planeados en latices, balanceados y parcialmente
balanceados, para latices 3x3 hasta 16x16.
Considere el siguiente archivo planeado en AGROBASE: Latice3b.dbf, Copiar en el folder AGROBASE
de su computadora.

Ingrese al sistema AGROBASE y ejecute [Analysis of Variance] luego [ALS] para análisis de datos del
diseño de latices. Ingrese la siguiente información:

Database : C:\AGROBASE\LATICE3B.DBF
Data Fields: RDTO
Load Model: ENTRY SQR BLOC
Load Options: MEANS ENTRY

Luego presione el boton Analize de la ventana AGROBASE

El resultado será:
A N A L Y S I S O F V A R I A N C E

Dependent variable: RDTO

Source df SS MS F-value Pr> F

------------------------------------------------------------------------------
Total 35 5286.740
Replication 3 133.231 44.410
ENTRY [unadj.] 8 3749.434 468.679
Block [adj.] 8 368.170 46.021
Intrablock error 16 1035.905 64.744
ENTRY [adj.] 8 468.679 7.24 0.0004
Effective error 16 64.744
------------------------------------------------------------------------------
Grand mean = 29.162 R-squared = 0.8041 C.V. = 27.59%
------------------------------------------------------------------------------
Relative efficiency to a RCBD = 100.0%
Analyzed as a RCBD, mu=0.000

LSD for ENTRY [adj.] = 9.9335 S.E.D. = 5.6896

t (1-sided a=0.050, 16 df) = 1.7459 MSE = 64.74404

ENTRY
Averages
Level --- Y --- Cv

1 45.89 9.2
2 25.67 14.8
3 15.45 19.5
4 38.09 42.2
5 16.90 36.3
6 30.24 16.8
7 31.90 24.9
8 18.71 31.1
9 39.61 18.4
------------------------------------------------------------------------------
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Analisis de latice con SAS.

SAS dispone de un procedimiento para el analisis estadistico de latices cuadrado y rectangular, denominado
PROC LATTICE

En latices cuadrados, el número de tratamientos es igual a un cuadrado perfecto (9, 16, 25, 36,.. ) del
número de unidades de un bloque. Los bloques incompletos se agrupan para formar el cuadrado. Los
latices balanceados comprende un número de cuadrados igual a uno más el número de unidades por el
bloque, un latices 3x3 balanceado tiene 4 cuadros.

Los latices cuadrados parcialmente balanceados es similar a los latices balanceados, aunque el número de
cuadrados puede variar (simple, trimple,..). Pero es posible planear con más de una repetición del diseño
básico.

En latices rectangulares, hay k unidades por el bloque y k+1 bloques. En total el rectangulo tiene k(k+1)
tratamientos. Como en latices cuadrados, se agrupan bloques para formar repeticiones mutuamente
ortogonal del plan básico. El Procedimiento de SAS puede manejar latice rectangular simple y triple. El
experimento puede incluir varias repeticiones del plan básico.

Del conjunto de datos, el PROC LATTICE determina qué tipo de plan se esta usando. También verifica si
el plan es válido e imprime un mensaje apropiado si existe error en el planeamiento

PROC LATTICE options;

VAR variable-list;
BY variable-list;

PROC LATTICE options;

Las siguientes opciones son validas.

DATA= SAS-data-set
COVARIANCE

DATA= SAS-data-set
El DATA= nombra la entrada de datos de SAS para ser usados por PROC LATTICE. Si usted omite la
opción DATA, SAS utiliza los datos recientemente creados.

COVARIANCE
La opción COVARIANCIA produce un análisis de la covariancia para cada par de variables numéricas.
Para cada par, la que aparece en segundo lugar es la covariable

VAR variable-list;
La variable respuesta es especificado en la opcion VAR. Si Usted no incluye, todas las variables de la data
es utilizado.

Variables requeridas en el conjunto de datos

SAS requiere nombres específicos para las variables de clase: GROUP, BLOCK, y TREATMNT y una
cuarta variable REP si el plan basico es repetido.

GROUP

Especifica los cuadros o rectangulos que forman el plan latice. Los valores de GRUPO deben ser 1, 2..., n.

BLOCK
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Especifica el bloque en el que la unidad experimental está presente. Los valores de BLOQUE deben ser 1,
2. . . , m, donde m es el número de bloques en cada repetición.

TREATMNT

Especifica qué tratamiento se aplicó a la unidad experimental. TREATMNT debe tener un valor de 1,2.., i.

REP

Especifica qué repetición del plan básico incluye la unidad experimental. REP debe tener un valor de 1,
2. . . , p. Así, el experimento tendrá un total de copias igual a np.

Cada variable numérica distinta a GROUP, BLOCK, TREATMNT o REP en la entrada de datos a SAS, es
considerado una variable respuesta. Una declaración de VAR indica a PROC LATTICE que variables
serán utilizadas como respuesta.

Programa en SAS

/* Datos del ejemplo latices3b */

DM 'log;clear;output;clear';
FILENAME base 'c:\agrobase\Latice3b.DBF';
PROC DBF DB5=base OUT=lectura;
DATA datos;
SET lectura;
/*********************************/
TREATMNT = entry;
GROUP=sqr-4*int(sqr/4.0001);
BLOCK=bloc-3*INT(bloc/3.0001);
/*********************************/
PROC LATTICE;
VAR rdto;
RUN;

Resultado:

Analysis of Variance for Variable RDTO

Source DF SS MS

Replications 3 133.230900 44.410300

Blocks within Replications (Adj.) 8 368.170050 46.021256
Component B 8 368.170050 46.021256
Treatments (Unadj.) 8 3749.434150 468.679269
Intra Block Error 16 1035.904600 64.744038
Randomized Complete Block Error 24 1404.074650 58.503110
Total 35 5286.739700 151.049706

Variance of Difference 32.372019

LSD at .01 Level 15.913583
LSD at .05 Level 11.742843

The Efficiency of the Experiment Relative to Randomized Complete Block is 90.36.

Treatment Means
1 45.8925 4 38.0875 6 30.2425 8 18.7075
2 25.6675 5 16.9025 7 31.9000 9 39.6100
3 15.4450
5 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

Comparacion entre ambos analisis del latice 3x3 balanceado.

Gran parte de los resultados son coincidentes, con algunas diferencias de presentación.

SAS provee información sobre la COMPONENTE (b), que es coincidente con los bloques ajustados
(eliminando el efecto de tratamientos (ENTRY) que proporciona AGROBASE.

Agrobase estima la suma de cuadrados de tratamientos ajustados, lo que le permite hacer la prueba de F
para tratamientos. SAS no estima este valor.

Pero, para el análisis de tratamientos, es suficiente con las medias ajustadas y sus variancias para
proceder la comparación, que ambos programas proveen.

Con R

Para el planeamiento se tiene la funcion design.lattice() y el analisis

con la funcion PBIB.test() de la librería agricolae.

Por ejemplo un latice simple de 9 tratamientos, corresponde a tres

cuadros de 3x3.

> library(agricolae)
> design.lattice(3,type="triple")

Lattice design, triple 3 x 3

$square1
[,1] [,2] [,3]
[1,] 3 1 7
[2,] 2 5 4
[3,] 9 6 8

$square2
[,1] [,2] [,3]
[1,] 7 4 8
[2,] 3 2 9
[3,] 1 5 6

$square3
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 4 9
[2,] 7 2 6
[3,] 3 5 8

$plan
plots sqr block trt
1 1 1 1 3
2 2 1 1 1
3 3 1 1 7
4 4 1 2 2
5 5 1 2 5
6 6 1 2 4
7 7 1 3 9
8 8 1 3 6
9 9 1 3 8
10 10 2 4 7
11 11 2 4 4
12 12 2 4 8
13 13 2 5 3
6 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

14 14 2 5 2
15 15 2 5 9
16 16 2 6 1
17 17 2 6 5
18 18 2 6 6
19 19 3 7 1
20 20 3 7 4
21 21 3 7 9
22 22 3 8 7
23 23 3 8 2
24 24 3 8 6
25 25 3 9 3
26 26 3 9 5
27 27 3 9 8

Se puede observar que los tratamientos se comparan con otros en el

mismo bloque una sola vez, asi:

Trt 1: 3,7,5,6,4,9
Trt 2: 5,4,3,9,7,6
Trt 3: 1,7,2,9,5,8
...
Trt 9: 6,8,3,2,1,4

Si se desea completar para un latice balanceado, se agregaria el cuadro

faltante que seria:
Trt 1: 2,8
Trt 3: 4,6
Trt 9: 5,7

$square4
[,1] [,2] [,3]
[1,] 1 2 8
[2,] 3 4 6
[3,] 9 5 7

Para el analisis de los datos correspondiente al lattice 3x3 balanceado

se tiene los siguientes datos:

> A
sqr block trt yield
1 1 1 1 48.76
2 1 2 8 10.83
3 1 3 5 12.54
4 2 4 5 11.07
5 2 5 2 22.00
6 2 6 9 47.43
7 3 7 2 27.67
8 3 8 7 30.00
9 3 9 3 13.78
10 4 10 6 37.00
11 4 11 4 42.37
12 4 12 9 39.00
13 1 1 4 14.46
14 1 2 6 30.69
15 1 3 9 42.01
16 2 4 8 22.00
7 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

17 2 5 7 42.80
18 2 6 6 28.28
19 3 7 1 50.00
20 3 8 5 24.00
21 3 9 8 24.00
22 4 10 3 15.42
23 4 11 2 30.00
24 4 12 7 23.80
25 1 1 3 19.68
26 1 2 7 31.00
27 1 3 2 23.00
28 2 4 1 41.00
29 2 5 3 12.90
30 2 6 4 49.95
31 3 7 6 25.00
32 3 8 4 45.57
33 3 9 9 30.00
34 4 10 5 20.00
35 4 11 8 18.00
36 4 12 1 43.81

> library(agricolae)
> library(corpcor)
> A<-read.table("latice3x3.txt",header=T)
> str(A)
'data.frame': 36 obs. of 4 variables:
$ sqr : int 1 1 1 2 2 2 3 3 3 4 ...
$ block: int 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
$ trt : int 1 8 5 5 2 9 2 7 3 6 ...
$ yield: num 48.8 10.8 12.5 11.1 22 ...
> attach(A)
> str(PBIB.test)
function (block, trt, replication, y, k, method = "lsd", alpha = 0.05)
> PBIB.test(block,trt,sqr,yield,k=3)

ANALYSIS PBIB: yield

Class level information

Blocks: 12
Trts : 9

Number of observations: 36

Analysis of Variance Table

Response: yield
Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
replication 3 133.2 44.4 0.6859 0.57361
trt.unadj 8 3749.4 468.7 7.2390 0.00042 ***
replication:block.adj 8 368.2 46.0 0.7108 0.67917
Residuals 16 1035.9 64.7
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

coefficient of variation: 27.6 %

yield Means: 29.16167
8 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

Treatments

Parameters PBIB
treatmeans : 9
Block size : 3
Blocks/rep : 3
Replication: 4

Efficiency factor 0.75

Comparison between treatments means

<<< to see the objects: comparison and means >>>

$comparison
tr.i tr.j diff stderr pvalue
1 1 2 18.2941444 5.289807 0.0032
2 1 3 29.2770756 5.289807 0.0000
3 1 4 5.2887627 5.289807 0.3322
4 1 5 26.9861412 5.289807 0.0002
5 1 6 13.2103821 5.289807 0.0238
6 1 7 12.5402335 5.289807 0.0306
7 1 8 26.2789014 5.289807 0.0002
8 1 9 4.9174757 5.289807 0.3664
9 2 3 10.9829312 5.289807 0.0544
10 2 4 13.0053817 5.289807 0.0258
11 2 5 8.6919968 5.289807 0.1198
12 2 6 5.0837623 5.289807 0.3508
13 2 7 5.7539109 5.289807 0.2928
14 2 8 7.9847570 5.289807 0.1506
15 2 9 13.3766687 5.289807 0.0224
16 3 4 23.9883129 5.289807 0.0004
17 3 5 2.2909344 5.289807 0.6708
18 3 6 16.0666934 5.289807 0.0078
19 3 7 16.7368421 5.289807 0.0060
20 3 8 2.9981742 5.289807 0.5788
21 3 9 24.3595999 5.289807 0.0002
22 4 5 21.6973785 5.289807 0.0008
23 4 6 7.9216195 5.289807 0.1538
24 4 7 7.2514708 5.289807 0.1894
25 4 8 20.9901387 5.289807 0.0012
26 4 9 0.3712870 5.289807 0.9450
27 5 6 13.7757591 5.289807 0.0192
28 5 7 14.4459077 5.289807 0.0148
29 5 8 0.7072398 5.289807 0.8954
30 5 9 22.0686655 5.289807 0.0008
31 6 7 0.6701486 5.289807 0.9008
32 6 8 13.0685193 5.289807 0.0252
33 6 9 8.2929064 5.289807 0.1366
34 7 8 13.7386679 5.289807 0.0194
35 7 9 7.6227578 5.289807 0.1688
36 8 9 21.3614257 5.289807 0.0010

$means
trt means mean.adj N std.err
1 1 45.8925 44.36090 4 3.641342
9 Diseño Latice en Agrobase y SAS Felipe de Mendiburu D

2 2 25.6675 26.06676 4 3.641342

3 3 15.4450 15.08383 4 3.641342
4 4 38.0875 39.07214 4 3.641342
5 5 16.9025 17.37476 4 3.641342
6 6 30.2425 31.15052 4 3.641342
7 7 31.9000 31.82067 4 3.641342
8 8 18.7075 18.08200 4 3.641342
9 9 39.6100 39.44343 4 3.641342

$vartau
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
[1,] 13.2593703 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[2,] -0.7316598 13.2593703 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[3,] -0.7316598 -0.7316598 13.2593703 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[4,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 13.2593703 -0.7316598 -0.7316598
[5,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 13.2593703 -0.7316598
[6,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 13.2593703
[7,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[8,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[9,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[,7] [,8] [,9]
[1,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[2,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[3,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[4,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[5,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[6,] -0.7316598 -0.7316598 -0.7316598
[7,] 13.2593703 -0.7316598 -0.7316598
[8,] -0.7316598 13.2593703 -0.7316598
[9,] -0.7316598 -0.7316598 13.259370