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3. Replicación del material genético viral: El material genético viral que ingresa
en una célula contiene bases modificadas que evitan la degradación por
nucleasas bacterianas. Esta modificación consiste en la glicosilación y/o
metilación de algunas determinadas bases. En el caso del fago T4 se glucosila
la base 5'-hidroximetilcitosina. Para lograr una efectiva replicación del genoma
viral se deben sintetizar algunas proteínas. Estas proteínas tempranas reparan
el poro de la membrana citoplasmática por donde ingresó el genoma viral,
degradan el DNA bacteriano lo que proporciona una fuente de precursores,
evita la síntesis de RNA y proteínas bacterianas, y proporciona ribosomas para
la síntesis de proteínas del fago. Además algunas de estas proteínas
tempranas participan en la síntesis de las bases inusuales. La forma de
replicación del genoma viral es dependiente del tipo de material genético (si es
RNA o DNA, si es simple o doble cadena). En el caso del fago T4, las moléculas
replicadas se aparean en los extremos y formando una molécula de DNA más
larga denominada concatámero. Después una enzima corta esta larga
molécula lineal en moléculas más pequeñas de igual longitud. Las moléculas
de DNA del T4 se caracterizan por estar permutadas circularmente (el DNA del
T4 es lineal) de esta forma todas las moléculas de DNA resultantes contienen
genes completos y funcionales.
Ciclo lisogénico
Poco tiempo después de que fueron descubiertos los fagos, se aislaron cepas
bacterianas que parecían ser portadoras silenciosas de ciertos tipos de bacteriófagos,
se encontró que producían viriones espontáneamente durante su crecimiento, pero la
mayoría de las células en el cultivo no se vieron afectadas por dichos viriones. A los
bacteriófagos producidos por cepas lisogénicas se les conoce como fagos
atemperados.
En el ciclo lisogénico, los primeros dos pasos (fijación e inyección del material
genético) ocurren tal como sucede en el ciclo lítico. Sin embargo, una vez que el
material genético del fago está dentro de la célula, no se copia ni se expresa
inmediatamente para hacer las proteínas. En cambio, se recombina con una región
particular del cromosoma bacteriano. Esto hace que se integre al cromosoma.