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Introducción.
Dentro de los procesos que se llevan a cabo en el cuerpo humano, la mayoría de las
reacciones se producen por la catalización de enzimas, donde la primera características que
contribuyen estas, son la aceleración de las reacciones, la primera sustancia involucrada se le
llama sustrato, en la que la enzima actúa sobre este uniéndose en un lugar específico, llamado
sitio activo. Después de que se termina de catalizar esta reacción, se libera la enzima y se
vuelve a unir con otro sustrato y así sucesivamente en un sin fin de reacciones. La razón de
que la enzima involucrada sea la que aumente la velocidad de una reacción, está ligada a la
expresión de la inversa de la energía de activación y la velocidad de la reacción, a medida que
que la energía de activación aumenta, la velocidad de esta es menor. (Garrido, A. Teijón J.
2006).
La cinética enzimática es la encargada de explicar la velocidad de reacción de enzimas, los
principales interventores en este proceso son las concentraciones de sustrato y enzima, esto
obedece a la ley de Michaelis y Menten, donde proponen dos etapas, en la primera se forma un
complejo enzima-sustrato y en la segunda, se analiza el producto resultante del complejo
enzima-sustrato liberando la enzima. (Daniel, L. R, Donald. 2000).
Otro de los factores que intervienen en la cinética enzimática es el pH del medio en el que se
encuentran dichas reacciones. Existen condiciones óptimas para que la reacción se lleve a
cabo de manera que el producto sea máximo, la ionización del sitio activo de la enzima,
incrementa gradualmente conforme aumenta el pH, esto sucede porque se encuentra más
grupos de ácidos carboxílicos ya ionizados y hace que para la enzima, sea mucho más fácil
enlazarse con los sustratos, existen puntos máximos para cada enzima respectiva donde se
encuentra la mayor cantidad de hidronios para protonar la sustancia. (Roosdiana A.
Prasetyawan, S. Mahdi, C. Sutrisno. (2013).
Otro factor que influye en la reacción de una enzima es la temperatura, a medida que
incrementa esta variable, aumenta consigo la energía cinética de las moléculas reaccionantes,
y por consecuencia, es mayor la probabilidad de que se den colisiones efectivas para que
dichas reacciones se lleven a cabo. Conforme aumenta la temperatura, aumenta la velocidad
de reacción también, pero cuando alcanza un valor determinado, dependiendo de la enzima,
esta empieza a desnaturalizarse y la velocidad de reacción comienza a verse perjudicada, por
lo tanto, la temperatura óptima de reacción es aquella en donde la velocidad de reacción es
máxima. (Peña, A. Arroyo, A. Gómez, A. Tapia, R. 2004).
Por último, el factor que tampoco se puede dejar de lado dentro de los que interfieren en las
reacciones enzimáticas, son los productos de estas, se supone que en una reacción, la
sustancia que se necesita son generalmente los productos de dichas reacciones, sin embargo,
en un proceso metabólico existe lo que se llama una retroalimentación negativa, esto quiere
decir que el exceso de productos no será favorable, sino que la reacción será bloqueada por
estos, impidiendo a la enzima a volver a unirse con sustratos, actuando como un inhibidor, este
es uno de los mecanismos más importantes de regulación metabólica. (N. Campbell. 2001).
Metodología.
Antes de que se procediera a llevar a cabo los distintos procedimientos, era necesario extraer
la fosfatasa ácida, la cual consistía en pesar 10 gramos de germen de trigo y agregarlos a 50
ml de agua fría, después de esto, se agitó la mezcla hasta que se obtuvo una suspensión
uniforme. Se dejó en reposo por 30 minutos y luego se decantó por otros 15 minutos. La
solución requerida es sin residuos, ni precipitado, este fue entonces el extracto crudo de
fosfatasa ácida.
B – 4.0 0.5
Se agitaron bien los tubos y se dejaron reposar durante 3 minutos, después de esto se
adicionaron 0,5ml de la solución de ácido ascórbico a cada tubo expuesto en la figura 1. Con
ayuda del vortex, se mezclaron muy bien y se dejaron reposar otros 10 minutos, para permitirle
a la reacción que desarrollara el calor. Se determinó la absorbancia a 660nm.
Se agitó bien y se dejó reposar por 3 minutos; después se adicionaron 0,5 ml de ácido
ascórbico. Se agitó bien con ayuda del vortex y se dejó reposar por 10 minutos. Se hizo la
lectura de absorbancia a 660nm en todos los casos que se emplearon este procedimiento,
esto, con el fin de hallar la cantidad en forma de concentración de fosfato.
Se mezclaron muy bien y se dejó incubar a temperatura ambiente; el blanco de buffer (BB) y el
blanco de sustrato (BS) se dejaron reaccionar por 30 minutos, pasado el tiempo se tomaron
pequeños volúmenes de 1ml y se virtieron sobre ácido tricloroacético al 10%.
Buffer 2.0 1.6 1.8 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4
(ml)
pH del 5.3 5.3 5.3 3.0 4.0 5.0 5.3 5.6 6.2
buffer
Se mezcló todo muy bien e inmediatamente se agregó la enzima, esta vez con intervalos de 30
segundos. Se le agregaron 0,2 ml de enzima a los tubos desde el BE hasta el tubo 6 y con
ayuda del vortex, otra vez se aseguró que se homogeneizara bien y se dejó incubando durante
10 minutos a temperatura ambiente, después de este tiempo se le agregaron 2 ml de ATA al
10% de concentración. Se mezcló, se centrifugó a 4000 rpm durante 3 minutos.
Se descartó el precipitado y sobre el sobrenadante de todos los tubos, se determina la
concentración por medio del procedimiento A1.
Buffer (ml) 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4
Temperatura° 18 18 18 0 18 37 60 92
C
De acuerdo a la figura 5, la solución buffer fue de citrato 0,1M, ph 5,3. El sustrato fue una
solución de b-glicerofosfato de sodio 0,1M, la enzima fue el extracto preparado al inicio del
procedimiento, el tiempo de reacción fue de 10 minutos y la temperatura de incubación fueron
diferentes, dependiendo a la que corresponda, tal como se muestra en la figura 6 a
continuación.
0 Agua – Hielo
18 Temperatura ambiente
37 Termostato
60 Termostato
98 Agua en ebullición
Con ayuda del vortex, se agitaron nuevamente y se dejaron todos los tubos en incubación por
10 minutos. Pasado este tiempo, se adicionó 2 ml de ATA a todos los tubos al 10% y se
centrifuga a 4000 rpm durante 3 minutos. Después de esto, se descartó el precipitado y se
determinó la concentración de fosfato inorgánico, por medio del procedimiento A1.
De acuerdo a la figura anterior, la solución buffer se indicó que era de citrato, 0,1M pH 5,3, el
sustrato era una solución de b-glicerofosfato de sodio 0,1M, la enzima fue el extracto preparado
al inicio del procedimiento, el tiempo de reacción es de 10 minutos y la temperatura de reacción
fue ambiente. Se mezcló bien y se adicionó la enzima de acuerdo a la siguiente figura,
Con ayuda del vortex, se agitaron bien y se dejaron en incubación por el tiempo mencionado
anteriormente, pasado este tiempo, se adicionaron a todos los tubos 2 ml de ATA al 10% y se
centrifugaron a 4000 rpm durante 3 minutos. En el sobrenadante de todos los tubos se
determina la concentración de fosfato inorgánico, mediante el procedimiento A1.
Se prepararon las siguientes soluciones con el fin de determinar el efecto que tiene el sustrato
en la velocidad de reacción de acuerdo a la constante Km.
Buffer (ml) 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4
Sustrato (ml) – 0.4 – 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.8
Agua (ml) 1.0 0.6 0.8 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 –
La solución buffer fue de citrato 0,1M y pH 5,3, el sustrato fue una solución de b-glicerofosfato
de sodio de diversas concentraciones, en el rango de 5 - 100mM, esto se ve en la figura
número 9 en la casilla de “concentración*” donde indica la concentración a adicionar en cada
tubo distinto, esta fila se debe mirar en conjunto con la casilla que dice “sustrato”, pues ambas,
complementariamente, indican la cantidad y concentración a adicionar. La enzima utilizada fue
la misma que en los otros procedimientos, el extracto crudo del procedimiento primero, el
tiempo de duración de la reacción es de 10 minutos y la temperatura fue la ambiente.
Se mezcla todo bien y se agrega la enzima 0,2 ml a los tubos desde el BE hasta el 8, en
intervalos de 30 segundos. Después de esto, con ayuda del vortex se agita muy bien y se deja
incubar, pasado este tiempo se adicionaron 2 ml de ATA al 10% a todos los tubos y se
centrifugaron a 4000 rpm durante 3 minutos. En el sobrenadante de todos los tubos se
determinó la concentración de fosfato inorgánico, siguiendo los pasos del procedimiento A1.
Figura 10. Volúmenes utilizados para la determinación del efecto de la concentración del
sustrato con inhibidor en la velocidad de reacción.
Tubo BB BS BE 1 2 3 4 5 6 7 8
Buffer (ml) 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2
Sustrato (ml) – 0.4 – 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.8
Agua (ml) 1.2 0.6 0.8 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 –
Inhibidor (ml) – 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2
De acuerdo a la figura 11, la solución de buffer fue de citrato 0,2 M con pH de 5,3, en cuanto al
sustrato es una solución de b-glicerofosfato de sodio de diversas concentraciones, en la casilla
de sustrato se indica los mililitros a adicionar y en la de concentración* [S] se indica la
respectiva concentración a la que debe estar el sustrato de acuerdo al tubo que corresponda, la
enzima fue la del extracto preparada en el primer procedimiento, el tiempo de reacción fue de
10 minutos, la temperatura fue la de ambiente y el inhibidor correspondiente fueron 5mg/ml de
HgCl2.
Se mezcló todo muy bien e inmediatamente se agregó 0,2ml de la enzima con intervalos de 30
segundos a todos los tubos excepto a los de BB y BS, con ayuda del vortex se
homogeneizaron mejor las soluciones y se dejaron en incubación. Después de este tiempo, se
adicionaron 2ml de ATA a todos los tubos al 10% y se centrifugaron a 4000 rpm durante 3
minutos, en el sobrenadante resultante de todos los tubos, se determina la concentración de
fosfato inorgánico, de acuerdo al procedimiento A1.
Análisis y resultados.
De acuerdo con la tabla anterior, se logra determinar cada concentración de fósforo inorgánico
diluido en cada uno de los tubos de ensayos, utilizando la fórmula mostrada a continuación.
V1C1 = V2C2
Ecuación 1. Concentración de fósforo en diferentes volúmenes.
Se realiza una gráfica para analizar el comportamiento de la absorbancia vs la concentración hallado en
expresado en la tabla (11) anterior.
De esta gráfica, se puede usar la ecuación de la recta (𝐴𝑏𝑠=463 [s] + 0,3118) para conocer las
contracciones iniciales de la enzima y del sustrato, respectivamente.
2 0,218 0,165
5 0,391 0,262
10 0,48 0,348
15 0,441 0,321
20 0,42 0,31
30 0,382 0,321
Como se puede ver en la tabla anterior, el tiempo óptimo de reacción es de 10 minutos ya que
se para este tiempo se obtuvo una concentración de fósforo inorgánico mayor a todas las
demás. Esto al parecer es un tiempo bajo, pero es adecuado ya que al tener presencia de un
inhibidor, este no tendrá el tiempo suficiente para actuar sobre la enzima, por lo tanto la
reacción será más óptima. Además, se tuvo en cuenta el tiempo de reacción a 10 min y no a 5
debido a que se considera que 5 minutos es posible que la enzima no esté en su actividad
cinética aun.
BS 0,006 - 0
BE 0,736 - 0
BS 5,3 -
BE 5,3 -
1 3 0,000590066
2 4 0,000317538
3 5 0,000412484
4 5,3 0,000539956
5 5,6 0,00055578
6 6,2 0,000511824
BS 0,003 - - - 0
BE 0,305 - - - 0
A cada concentración obtenida, fue necesario dividirla sobre el tiempo (el cual es 10min para
todos los tubos), para así, conseguir los datos de velocidad a cada concentración a distintas
temperaturas.
Figura 22. Velocidad inicial de reacción vs temperaturas distintas.
Para esta parte de la práctica, se preparan varias soluciones con distintas concentraciones de
sustratos, la idea de esto, es determinar de una manera experimental la ecuación de Michaelis.
Se les mide la absorbancia a los respectivos tubos y se calcula la concentración de cada uno
usando la ecuación de la recta que se obtiene en la correspondiente curva de calibración.
BS - 0,025 0 0
BE 100 0,767 0 0
Ahora graficamos los inversos de la velocidad y concentración de sustrato, con el fin de lograr
linealizar la gráfica para determinar el Km ya con las unidades corregidas.
En esta experiencia se utiliza el inhibidor de MgCl2. Para esta parte, tal como se hizo en la
parte de concentración de sustrato, es necesario restar los blancos a las absorbancias de cada
muestra con inhibidor. Con esta absorbancia resultante, se logra calcular la concentración del
fósforo inorgánico, utilizando la ecuación que siempre hemos venido usando para darle valor a
esta variable, la de la recta de la gráfica y posteriormente, las concentraciones obtenidas se
dividen en el tiempo óptimo para obtener las velocidades de reacción.
Se logra hacer una gráfica con los datos obtenidos de la parte anterior, entre
contracción de sustrato con inhibidor y velocidades de reacción, con el fin de calcular el Km y el
Vmax y determinar qué clase de inhibición es, ya sea de carácter competitivo, no competitivo o
mixto.
BB 0 0 0
BS 0,001 0 0
BE 0,372 0 0
1 0,376 0,003 -1,5824E-05
Para analizar el efecto que causa el MgCl2 con concentración de 5mg/mL como inhibidor de la
actividad enzimática se halla la absorbancia en cada tubo con misma cantidad de inhibidor,
pero distinta concentración de sustrato, posterior a esto, a partir de la ecuación de la recta
obtenida de la curva patrón, se determina la concentración contenida en cada tubo.
Por otro lado para hallar el valor de la velocidad para cada tubo se divide la concentración del
sustrato sobre el tiempo (siendo 10 min para cada uno) y se grafican los inversos de la
concentración vs velocidad.
Los datos de la tabla anterior, se hallan con el fin de generar una gráfica linealizada, que nos
permita analizarla desde un punto de vista un poco más teórico y tenemos más herramientas
para obtener el análisis correspondiente,
Esta gráfica, se adapta a un modelo que estudia este comportamiento en cuanto a las
velocidades y concentraciones de sustrato, este se llama Michaelis-Menten. (Daniel L, R.
Donald. 2000). Donde por medio de una ecuación, se linealiza la figura anterior y queda de la
siguiente manera,
Conclusiones.
● Se logran identificar algunos de los factores que interfieren con la velocidad y actividad
enzimática que existen en la vida, en cuanto a la concentración de la enzima, la
desnaturalización o el deterioro de la misma.
● Se establecen algunos de los factores óptimos para que se den las distintas reacciones
en las que la enzima está involucrada, a nivel de pH, temperatura, tiempo de reacción e
incubación, presencia de inhibidores y concentraciones de las especies involucradas.
● De manera más específica, el pH óptimo para este tipo de reacción es de carácter
ácido, al momento en que aumenta el pH y se convierte en un medio alcalino, la
reacción tiende a inhibirse y el producto no es el deseado.
● Por otra parte, la elevación de la temperatura del medio en el que se encuentra, tiene
como consecuencia la desnaturalización de la enzima, esto es muy importante ya que
pierde sus funciones biológicas y no cumplen con los parámetros para que el sustrato
se una al sitio activo de esta.
● Por último, el tiempo de reacción para que esta sea óptima, no puede ser muy elevado,
ya que la sobresaturación de productos, hace que ellos mismos se conviertan en
inhibidores, ya sea modificando el sitio activo de la enzima o impidiendo que los
sustratos se unan a la misma.
BIBLIOGRAFÍA.
- Garrido, A. Teijón, J. Blanco, D. Villaverde, C. Mendoza, C. Ramirez, J. (2006).
“Fundamentos de bioquimica estructural”. Editorial Tébar, S. L. Madrid, España.