La contaminación del agua por tuberías de desechos debe ser controlada de
alguna manera. El déficit local y regional de agua es debido, sobre todo, al aumento de las necesidades surgidas del desarrollo económico y de la explosión demográfica. Los contaminantes en el agua pueden causar incontables daños a la salud humana y el equilibrio de los ecosistemas. La presencia de diferentes metales pesados en el agua potable, en algunos casos, puede conducir a la muerte no solo de especies marinas sino también de personas que usan esas aguas para sus cultivos o su propio consumo.
Las aguas residuales urbanas e industriales representan una fuente importante
de contaminación del agua. Hasta ahora, el objetivo principal de los programas de eliminación de los vertidos urbanos ha sido reducir la concentración de sustancias sólidas, materiales orgánicos, compuestos inorgánicos y bacterias dañinas.
Los residuos industriales contienen una gran variedad de contaminantes y su
composición varía de acuerdo con el tipo de proceso de producción. Su impacto sobre el medio ambiente es complejo: las sustancias tóxicas contenidas a menudo en las aguas del Rio Chili generan un daño mayor al ecosistema.
En unos años si no se trata estas aguas la concentración de contaminantes
aumentara y el daño será perjudicial para la ciudad de Arequipa. Se puede reducirse la contaminación mediante la limitación de la fuente de producción, someter al material a un tratamiento preventivo antes de la descarga en el alcantarillado o eliminar por completo los vertidos en la misma fábrica.