Tema N°2 (Unidad 3)

NUCLEÓTIDOS Y ÁCIDOS NUCLÉICOS.

1. Introducción.

Entre las biomoléculas más importantes, por su papel en el almacenamiento y

transmisión de la información genética, se encuentran los ácidos nucleicos. Los ácidos
nucleicos son macromoléculas formadas por la unión de unidades básicas denominadas
nucleótidos. Dicha unión se realiza mediante un tipo de enlace conocido como puente
fosfodiéster. Se puede considerar que los nucleótidos son los sillares estructurales de los
ácidos nucleicos, del mismo modo que los aminoácidos lo son de las proteínas o los
monosacáridos de los polisacáridos. Además de desempeñar este importante papel, los
nucleótidos como tales tienen otras funciones biológicas de naturaleza energética o
coenzimática.
Cuando se somete a los ácidos nucleicos a hidrólisis en condiciones suaves liberan
sus unidades monoméricas constitutivas: los nucleótidos. Los sillares estructurales de otras
macromoléculas, como los aminoácidos o los monosacáridos, no son susceptibles de
descomponerse a su vez en unidades más simples; sin embargo los nucleótidos sí pueden
sufrir hidrólisis dando lugar a una mezcla de pentosas, ácido fosfórico y bases
nitrogenadas. Cada nucleótido está compuesto por una pentosa, una molécula de ácido
fosfórico y una base nitrogenada enlazados de un modo característico.
Las pentosas que aparecen formando parte de los nucleótidos son la β-D-ribosa y su
derivado, el desoxiazúcar 2'-β-D-desoxirribosa, en el que el grupo hidroxilo unido al carbono
2' fue sustituido por un átomo de hidrógeno. Ambas se encuentran en forma de anillos de
furanosa. Las posiciones del anillo de furanosa se numeran convencionalmente añadiendo
el signo (') al número de cada átomo de carbono para distinguirlas de las de los anillos de las
bases nitrogenadas.
El tipo de ácido fosfórico que se encuentra en los nucleótidos es concretamente el
ácido ortofosfórico .

2. Bases nitrogenadas y su clasificación.

Son compuestos heterocíclicos o moléculas cicladas que, gracias al sistema de dobles

enlaces conjugados que poseen en sus anillos, poseen un acusado carácter aromático,
siendo su conformación espacial planar o casi planar. Sus átomos de nitrógeno poseen pares
electrónicos no compartidos que tienen tendencia a captar protones, lo que explica su
carácter débilmente básico. Los compuestos originarios de los que derivan estas bases
nitrogenadas son la purina y la pirimidina. Existen formando parte de los nucleótidos 2
derivados de la purina (bases púricas), que son la adenina y la guanina, y 3 derivados de
la pirimidina (bases pirimídicas), que son la citosina, la timina y el uracilo. Todas ellas se
obtienen por adición de diferentes grupos funcionales en distintas posiciones de los anillos de
la purina o de la pirimidina (por ejemplo la adenina es la 6-amino-purina, y el uracilo la 2,4-
dioxipirimidina). Las características químicas de estos grupos funcionales les permiten
participar en la formación de puentes de hidrógeno, lo que resulta crucial para la función
biológica de los ácidos nucleicos.
Las bases descritas corresponden a las bases principales y mayoritarias presentes en
los ácidos nucleicos, pero con menor frecuencia también aparecen un tipo de bases
derivadas de las anteriores o secundarias como son, la metiladenina, metilguanina o
hidroximetilcitosina.
De esta manera, las bases nitrogenadas se clasifican en:
• Bases púricas: Están basadas en el Anillo Purínico. Puede observarse que se trata
de un sistema plano de nueve átomos, cinco carbonos y cuatro nitrógenos. El anillo
purínico puede considerarse como la fusión de un anillo pirimidínico con uno
imidazólico. La forma degradativa final de las purinas en los primates es el Ácido
Úrico, 2,6,8-trioxo purina.
• Bases pirimidínicas: Están basadas en el Anillo Pirimidínico. Es un sistema plano de
seis átomos, cuatro carbonos y dos nitrógenos. Las distintas bases pirimidínicas se
obtienen por sustitución de este anillo con grupos oxo (=O), grupos amino (-NH2) o
grupos metilo (-CH3). Las pirimidinas son degradadas completamente a agua,
anhídrido carbónico y urea.
• Bases modificadas: Entre las más abundantes encontramos la 5-metilcitosina, la 5-
hidroximetilcitosina y la 6-Metiladenina que se han relacionado con la regulación de la
expresión del DNA, la 7-metilguanina y el dihidrouracilo que forman parte de la
estructura de los RNA, Hipoxantina y Xantina como intermediarios metabólicos y
productos de reacción del DNA con sustancias mutagénicas.

3. Nucleósidos y su estructura.

Las pentosas se unen a las bases nitrogenadas dando lugar a unos compuestos
denominados nucleósidos definiéndose entonces como la unión de una base nitrogenada a
un azúcar (pentosa) a través de un enlace covalente C1' enlace N-glucosídico con la azúcar.
La unión también se realiza con uno de los átomos de nitrógeno de la base nitrogenada: el
de la posición 1 si es pirimídica o el de la posición 9 si es púrica.
Los nucleósidos en estado libre sólo se encuentran en cantidades
mínimas en las células, generalmente como productos
intermediarios en el metabolismo de los nucleótidos. Existen dos
tipos de nucleósidos: los ribonucleósidos, que contienen β-D-
ribosa como componente glucídico, y los desoxirribonucleósidos,
que contienen β-D-desoxirribosa. En la naturaleza se encuentran
ribonucleósidos de adenina, guanina, citosina y uracilo, y
desoxirribonucleósidos de adenina, guanina, citosina y timina.
Dependiendo de la base nitrogenada que se le una a la pentosa
se le dará la nomenclatura. El nombre o la raíz, la base, depende
de la base nitrogenada pero varia en el sufijo según el tipo de base
que sea, sí la base nitrogenada es púrica (Adenina y Guanina) tendrá la terminación osina,
y si es pirimidinica (Timina, Citosina y Uracilo) tendrá la terminación idina. Si la pentosa es
desoxirribosa se añade el prefijo desoxi.

BASE NITROGENADA AZÚCAR RIBOSA AZÚCAR DESOXIRRIBOSA

ADENINA Adenosina Desoxiadenosina
GUANINA Guanosina Desoxiguanosina
TIMINA --- Timidina
CITOSINA Citidina Desoxicitidina
URACILO Uridina ---
 4. Nucleótidos, estructura y funciones.

Los nucleótidos resultan de la unión mediante enlace éster de la pentosa de un

nucleósido con una molécula de ácido fosfórico. Esta unión, en la que se libera una molécula
de agua, puede producirse en cualquiera de los grupos hidroxilo libres de la pentosa, pero
como regla general tiene lugar en el que ocupa la posición 5'; es decir, los nucleótidos son
los 5' fosfatos de los correspondientes nucleósidos .
Son moléculas ácidas, debido a que el ácido fosfórico
conserva dos grupos funcionales ácidos libres. Los grupos
fosfato pueden también ocupar posiciones diferentes al
carbono 5', una de las posiciones en las que puede situarse el
fosfato es sobre el carbono 3', incluyendo esta posición en la
denominación del nucleótido. Además, una característica del
ácido fosfórico es la capacidad de combinarse consigo
mismo, de forma que cuando uno se ha fijado al nucleósido,
puede fijarse un segundo y un tercero dando lugar a los
nucleótidos mono, di y trifosfatados, abreviadamente NMP o
dNMP, si es uno el fosfato, NDP o dNDP, si son dos, o NTP o
dNTP, si son tres los grupos fosfato incorporados. Cada uno de estos grupos fosfato se
denominan α, β y γ según se sitúan de la posición más próxima a más lejana al C 5'.
Al igual que los nucleósidos, los nucleótidos pueden clasificarse en ribonucleótidos y
desoxirribonucleótidos según contengan ribosa o desoxirribosa respectivamente. Existen
diversas maneras de nombrar los nucleótidos, una de ellas es identificarlos
mediante tres letras mayúsculas, la primera de ellas es la inicial de la base nitrogenada, la
segunda indica si el nucleótido es Mono~, Di~, o Trifosfato, y la tercera es la inicial del grupo
fosfato ; en el caso de los desoxirribonucleótidos se antepone una "d" minúscula a estas tres
siglas. Otra forma de nombrarlos consiste en anteponer la palabra ácido y añadir la
terminación -ílico al nombre de la base nitrogenada correspondiente; así, por ejemplo, el
AMP se puede denominar también como ácido adenílico, este sistema de nomenclatura
resulta un tanto ambiguo ya que no especifica el número de grupos fosfato.
También es habitual nombrar a los nucleótidos como fosfatos de los correspondientes
nucleósidos; por ejemplo, el ATP es el trifosfato de adenosina o adenosín-trifosfato.

BASE NITROGENADA RIBOSA DESOXIRRIBOSA

MONO DI TRI MONO DI TRI
ADENINA AMP ADP ATP dAMP dADP dATP
GUANINA GMP GDP GTP dGMP dGDP dGTP
CITOSINA CMP CDP CTP dCMP dCDP dCTP
URACILO UMP UDP UTP ---
TIMINA --- dTMP dTDP dTTP

Los nucleótidos cumplen las siguientes funciones:

• Los ribonucleótidos deridados de la adenosina (ATP, ADP y AMP), intervienen en
todos los intercambios de energía metabólica que se desarrollan en el interior de la
célula, ya que la rotura de los enlaces de los grupos fosfato (especialmente el del
 grupo γ) proporciona un gran desprendimiento energético. En algunas reacciones del
metabolismo, otros nucleótidos trifosfato como el GTP, CTP y UTP, pueden sustituir al
ATP en este papel.
• En algunos ribonucleótidos el grupo fosfato establece un enlace no sólo con el
carbono 5' sino también con el 3', formando un anillo, y dando lugar a una serie de
ribonucleótidos cíclicos, que desarrollan importantes funciones de segundo mensajero
para la acción de las hormonas, participando en la regulación del metabolismo celular.
Los más comunes son el AMPc (AMP cíclico), y el GMPc (GMPcíclico).
• Existen nucleótidos que forman parte de la estructura de otras moléculas más
complejas, como los coenzimas NAD (nicotinamida adenina dinucleótido), FAD (flavina
adenina dinucleótido) y coenzima A, con importantes funciones en la catalización
enzimática.
• Son unidades monoméricas para formar los ácidos nucleicos (ADN y ARN).
• Son mediadores fisiológicos.

5. Ácidos nucléicos.

Los ácidos nucleicos son polímeros de nucleótidos. En ellos la unión entre las
sucesivas unidades nucleotídicas se realiza mediante enlaces tipo éster-fosfato que resultan
de la reacción entre el ácido fosfórico unido al carbono 5' de la pentosa de un nucleótido y el
hidroxilo del carbono 3' de la pentosa de otro nucleótido. Este tipo de unión, en la que un
grupo fosfato queda unido por dos enlaces éster a dos nucleótidos sucesivos, se conoce
también como puente fosfodiéster.
Cuando dos nucleótidos se unen mediante un puente fosfodiéster el dinucleótido que
resulta conserva un grupo 5' fosfato libre en un extremo que puede reaccionar con el grupo
hidroxilo 3' de otro nucleótido, y un grupo hidroxilo 3' libre que puede reaccionar con el grupo
5' fosfato de otro nucleótido. Esta circunstancia permite que mediante puentes fosfodiéster se
puedan enlazar un número elevado de nucleótidos para formar largas cadenas lineales que
siempre tendrán en un extremo un grupo 5' fosfato libre y en el otro un grupo hidroxilo 3' libre.
De manera análoga a lo establecido para otros tipos de biomoléculas, el compuesto formado
por una cadena de hasta 10 nucleótidos se denomina oligonucleótido , mientras que si el
número de unidades nucleotídicas es superior a 10 se dice que es un polinucleótido.
Los niveles de estructura reciben el mismo nombre que en el caso de las proteínas, y
son:
• Estructura primaria o secuencia de nucleótidos (o bases) que forman la molécula del
ácido nucleico. Por convenio, se comienza por el carbono 5' libre de la cadena hasta
alcanzar el extremo 3' libre.
• Estructura secundaria o disposición espacial de los nucleótidos consecutivos.
• Estructura terciaria o conformación global de la molécula.

Existen dos tipos principales de ácidos nucleicos: el ácido ribonucleico (RNA), que es
un polímero de ribonucleótidos, y el ácido desoxirribonucleico (DNA), que es un polímero de
desoxirribonucleótidos.

6. Funciones de los ácidos nucléicos.

• Son portadores de Información Genética (esto depende de la secuencia de sus bases

nitrogenadas).
 • Sirven para almacenamiento, replicación y transmisión de la información genética, es
lo que se llama Dogma Central de la Biología Molecular.
• Sirven para síntesis de proteínas.
• La función principal del ARN es servir de intermediario para transportar información
que va desde el ADN hasta el producto final que es la proteína, todo codificado a un
gen formando histonas dentro del núcleo.

7. ADN y ARN en base a su composición y función.

ADN: es un polinucleótido compuesto por desoxirribonucleótidos de adenina, guanina,

citosina y timina, tratándose de la molécula depositaria de la información genética. Son
estructuras filamentosas muy largas pero flexibles. En las células eucariotas se localiza
básicamente en el núcleo, aunque hay también una cantidad bastante más inferior a nivel de
las mitocondrias (1%).

ARN: es un polinucleótido compuesto por ribonucleótidos de adenina, guanina,

citosina y uracilo. el ADN no proporciona directamente de inmediato la información para el
ordenamiento de los aminoácidos y su polimerización, sino que lo hace a través de los ARN.

8. Diferencias estructurales entre ADN y ARN.

ADN ARN
AZÚCAR PENTOSA Desoxirribosa Ribosa
BASES NITROGENADAS Sin Uracilo Sin Timina
Cadenas generalmente más Cadenas generalmente más
LONGITUD DE LA CADENA
largas, y de mayor peso cortas, y de menor peso
Y MASA MOLECULAR
molecular. molecular.
Generalmente cadena simple,
Generalmente cadena doble aunque puede sufrir
TIPO DE MOLÉCULA con bases nitrogenadas plegamientos que hagan que
enfrentadas A=T/C≡G en algún tramo se enfreten
sus bases A=U/C≡G
EUCARIOTAS: En el núcleo
celular, siendo el componente En el núcleo, disperso en el
principal de los cromosomas. nucleoplasma o concentrado
LOCALIZACIÓN EN LA En mitocondrias y en los nucleolos. En el
CÉLULA cloroplastos citoplasma, disperso en el
citosol o concentrado en los
PROCARIOTAS: disperso en ribosomas
el citosol.
Menos estable, pues sus
moléculas no alcanzan
Más estable debido al
ESTABIILIDAD grados de organización tan
enrollamiento en doble hélice
compactos como la doble
hélice
 9. Estructuras del ADN.

ESTRUCTURA PRIMARIA: Es la secuencia de nucleótidos de una cadena de ADN.

Presenta un esqueleto de fosfatos y pentosas del que parten las bases nitrogenadas (A, G,
C, T). Estas bases se encuentran en igual porcentaje en todos los seres vivos de una misma
especie, por lo que su mensaje genético es semejante. En la estructura primaria reside la
información necesaria para la síntesis de proteínas.

ESTRUCTURA SECUNDARIA: Es la disposición espacial que adoptan dos cadenas

de polinucleótidos (hebras) dispuestas en doble hélice y con las bases enfrentadas y unidas
mediante puentes de hidrógeno. En 1953, James Watson y Francis Crick propusieron la
estructura de doble hélice del ADN:
• Las moléculas de ADN están formadas por dos cadenas helicoidales de nucleótidos
enrolladas alrededor del mismo eje y formando una doble hélice. Las dos cadenas,
cordones o hebras son antiparalelas, esto es, sus puentes fosfodiéster 3 -5 están en
dirección opuesta.
• Las unidades de fosfato y desoxirribosa se encuentran en el exterior de la hélice,
mientras que en el interior se encuentran las bases.
• El diámetro de la hélice es constante: las bases están siempre separadas a una
distancia determinada, y cada 10 residuos nucleótidos se completa una vuelta de la
hélice.
• Debido a impedimentos estéricos el emparejamiento de las bases es adenina-timina y
guanina-citosina. Estos pares de bases, unidos por puentes de hidrógeno mantienen
las cadenas unidas.
• El orden de las bases define el mensaje genético. Una cadena es complemento de la
otra.

ESTRUCTURA TERCIARIA: Consiste en la asociación de ADN con proteínas. Se

encuentra en el núcleo de la célula eucariota formando la cromatina. Existen dos modelos:

1-Collar de perlas (Fibra de cromatina de 100 Å): Se encuentra cuando la célula

está en interfase (reposo). Consiste en una sucesión de partículas llamadas nucleosomas
formadas por: Partícula nuclear, que consta de 1) Octámero de proteínas Histonas, 2)
Fragmento de ADN (20 Å): 1.75 vueltas y 146 pares de bases. ADN ligador o espaciador
(linker) que une las partículas nucleares y es un fragmento de ADN de 54 pares de bases.

2-Estructura cristalina: Resulta de la asociación de ADN con protaminas, que son

proteínas básicas, más afines que las histonas, por lo que la estructura aparece más
empaquetada. Aparece en el núcleo de los espermatozoides. Las protaminas, a diferencia de
las histonas, son más pequeñas y diferentes en cada especie.

ESTRUCTURA CUATERNARIA o segundo nivel de empaquetamiento: Constituye

la fibra de cromatina de 300 Å. El modelo más aceptado es la hipótesis de Solenoide: La fibra
de 100 Å se enrolla helicoidalmente presentando 6 nucleosomas por vuelta y las H1 se
disponen formando el eje de la hélice. En el núcleo de la célula toda la cromatina se
encuentra como fibra de 100 Å y de 300 Å.Los dominios estructurales en forma de bucles
constituyen el tercer nivel de empaquetamiento. Se encuentran arrollados sobre sí
mismos, formando prominencias de unos 600 Å de diámetro. Seis bucles formarían una
roseta, y treinta rosetas seguidas, dispuestas en espiral formarían un rodillo, que constituye
el cuarto nivel de empaquetamiento. En el quinto y último nivel, el cromosoma, estaría
formado por la sucesión de rodillos.

10. Propiedades del ADN.

• Estabilidad: En condiciones normales la molécula de ADN es muy estable. Pero para

que se produzca la duplicación es necesaria la separación de las dos cadenas, y lo
mismo para la transcripción (formación de ARN mensajero).
• Desnaturalización: Si el ADN se somete a temperaturas superiores a los 100 oC se
rompen los puentes de hidrógeno que unen las bases, separándose las dos cadenas.
Ocurre lo mismo con variaciones de pH. Los enlaces fosfato-pentosa-base no se
rompen.
• Renaturalización: Si se restablecen las condiciones iniciales, el ADN recupera su
estructura.
• Hibridación: Si se desnaturaliza una mezcla de ADN de distintas especies, en la
renaturalización aparecerán formas híbridas. Esto se llama hibridación del ADN.

11. Tipos de ARN.

ARN mensajero (ARNm): Es una molécula corta y lineal de hasta 5000 nucleótidos,
de vida corta y estructura primaria. Se origina a partir del ARN hetereogéneo nuclear, que es
complementario de un fragmento de ADN, por lo que contiene su información genética. El
ARN hetereogéneo nuclear (ARNhn) tiene unos segmentos con información llamados exones
y otros sin información llamados intrones. Tras un proceso de maduración, elimina los
intrones y forma ARNm, que tiene en su inicio una caperuza, que constituye la señal de inicio
de la síntesis proteica, y al final una cola de poli A (muchas adeninas), que tiene función
estabilizadora. Se forma en el núcleo y viaja hasta el citoplasma. El ARNm es el portador de
la información genética del ADN. Se forma con intervención de una ARN polimerasa II y
atraviesa los poros nucleares para asociarse a los ribosomas en el citoplasma y dirigir la
síntesis de proteínas.

ARN transferente (ARNt): Está formado por moléculas pequeñas. Tiene forma de
hoja de trébol, con 4 brazos con estructura primaria y secundaria. Tres de los brazos tienen
un asa o bucle, son los brazos D, T y uno llamado Anticodón. El cuarto es un brazo aceptor
de aminoácidos, con un extremo (3’) más largo que otro que termina siempre en el triplete
CCA y es por la A por la que se unirá a un aminoácido.Existen unos 50 tipos diferentes que
se sintetizan en el nucleoplasma por acción de una ARN polimerasa III y viaja hasta el
citoplasma. En el Anticodón hay diferentes tripletes, que son complementarios de los
diferentes aminoácidos que capta el codón del ARNm.Su función es captar aminoácidos
específicos en el citoplasma y transportarlos hasta los ribosomas, donde, siguiendo la
secuencia dictada por el ARNm, se sintetizan las proteínas.

ARN ribosómico (ARNr): Es el más abundante y se encuentra asociado a proteínas

formando los ribosomas. Está formado por un filamento con estructura primaria, secundaria y
terciaria. Su función e formar los ribosomas donde se realizará la síntesis de proteínas. Los
ribosomas se diferencian por su velocidad de sedimentación, que se mide en Svedberg (1S =
10-13 s) s = segundos. Los ARNr 18S, 5.8S y 28S so forman en el nucleolo a partir del ARN
nucleolar y se transcribe mediante una ARN polimerasa I. El ARNr 5s se forma en el
nucleoplasma y lo transcribe una ARN polimerasa III.

ARN nucleolar (ARNn): Se forma en el núcleo a partir de ciertos segmentos del ADN
llamados organizadores nucleolares o región organizadora nucleolar. Se asocia a proteínas y
forma el nucléolo. Una vez formado, se fragmenta y da origen a los diferentes tipos de ARNr.

12. ADN y ARN según Watson y Crick.

En 1953 J. Watson y F. Crick postularon que la estructura del ADN era una doble
hélice con las bases en el interior y los azúcares y fosfatos en el exterior. Con este modelo no
solo explicaban las propiedades y características de la molécula de ADN como portadora de
la información genética, sino también sugerían un simple mecanismo por el que dicha
información pasaba de los padres a los hijos. La hipótesis resultó pronto una confluencia
extraordinaria de ideas, teorías y proyectos de naturaleza bioquímica, genética y de física
molecular de la que surgió el denominado dogma central de la genética molecular. Este
dogma establece que la información genética en las células fluye según “ADN -ARN -
proteína” y definen tres procesos en la conservación y transmisión de la información
genética. El primero es la replicación donde el ADN forma moléculas de ADN hijas idénticas.
El segundo es la transcripción en el cual el mensaje genético del ADN se transcribe en la
forma de ARN. El tercero es la traducción en el que el mensaje es descodificado y utilizado
en la síntesis de proteínas.