Está en la página 1de 13

Guía Bioquímica

1. De acuerdo con el diagrama, responder:


a. Explique ¿Cuáles son las fases del metabolismo?

El metabolismo es una serie de reacciones fisicoquímicas de carácter biológico que


ocurren dentro de un organismo, estos procesos tan complejos componen la base
de la vida. El metabolismo se divide en dos procesos conjugados, uno es el
catabolismo y el otro es el anabolismo:

- Anabolismo: como se puede observar en el diagrama, el anabolismo


corresponde a la producción de moléculas más complejas a partir de
moléculas sencillas, este es un proceso que necesita de energía. Un claro
ejemplo de anabolismo es la glucogénesis, puesto que en este proceso las
células producen glucógeno a partir de moléculas de glucosa.
- Catabolismo: por otra parte, el catabolismo corresponde a la degradación de
las moléculas grandes, en moléculas más sencillas, este proceso libera
energía. Un ejemplo de este es la glucolisis, en donde se transforma en
piruvato, con la obtención de 2 NADH y 2 ATP.

b. ¿Qué sustratos son degradados a lactato o piruvato?

La fermentación láctica es una ruta metabólica anaerobia, la cual consiste en la


catabolisis de la glucosa, es decir, la glucosa es degradada mediante reacciones de
hidrolisis en ausencia de oxígeno, el producto de esta ruta metabólica es el ácido
láctico o en su forma iónica, también conocido como lactato. Por otro lado, la
glucolisis es la ruta metabólica análoga en condiciones aeróbicas, consiste en la
catabolisis de la glucosa, es decir la degradación de la glucosa en condiciones
aeróbicas, en este proceso se genera piruvato.

c. ¿Qué etapa del metabolismo sucede cuando se sintetizan proteínas a partir


de aminoácidos?

La síntesis de proteínas es un proceso anabólico por el cual, se unen aminoácidos


mediante el enlace peptídico para formar moléculas más complejas como péptidos
y proteínas. Este es un proceso que sucede en los ribosomas. Después del proceso
de transcripción genética, se forma una hebra de ARNm, el cual se transporta a los
ribosomas, es ahí cuando inicia el proceso de traducción, en donde el ARNt
transcribe las secuencias de aminoácidos en la cadena peptídica.
Gráfico 1. El metabolismo

2. El Gráfico 2 muestra cómo se integran las rutas metabólicas en la célula.


De acuerdo a ello, realice los siguientes ejercicios:
a. Explique en un diagrama de flujo las transformaciones de monosacáridos a
piruvato. ¿Cómo se llama esta ruta?

La ruta que degrada los monosacáridos en piruvato se llama la glucolisis, esta es la


ruta metabólica encargada de oxidar glucosa para producir energía. Consta de 10
reacciones consecutivas que transforman la glucosa en piruvato. A continuación, se
presentará el diagrama simplificado del proceso:
b. ¿Cuál es la principal función del ciclo de Krebs?

El ciclo de Krebs es una ruta metabólica, está hace parte de la respiración celular,
es decir, se presenta en todas las células aerobias. Esta ruta metabólica sucede
dentro de la matriz mitocondrial, el principal objetivo de esta es la producción de
energía a partir de la degradación del acetil-coA. La energía se obtiene en forma de
ATP, además de la formación de algunos precursores de aminoácidos y de uno de
los agentes reductores mas importantes el NADH.

c. ¿Qué ocurre en la ruta de piruvato a ciclo de Krebs?

Como se ha mencionado anteriormente, el ciclo de Krebs inicial con el acetil-coA,


pero por otro lado la glucolisis finaliza con piruvato, es por esto que, para pasar de
una ruta a otra, se deben realizar ciertas transformaciones, para poder pasar de
piruvato a la acetil-coA. La descarboxilación oxidativa del piruvato sucede en la
matriz mitocondrial de las células, en donde el complejo enzimático piruvato-
deshidrogenasa elimina una molécula de CO2 y a la molécula de acetil une el
complejo enzimático coenzima A. Como se puede observar a continuación:
d. ¿En qué organelo de la célula se da este proceso?

La descarboxilacion oxidativa del piruvato a acetil-coA, es un proceso enzimático


que sucede dentro de la matriz mitocondrial, es de decir, el piruvato debe
transportarse del medio citoplasmático a la mitocondria.

e. ¿Cómo se da la transformación energética del ciclo de Krebs al transporte de


electrones y fosforilación oxidativa?

Como hemos visto en los temas tratados, después del ciclo de Krebs la célula solo
ha obtenido 4 moléculas de ATP, 2 durante la glucolisis y dos durante el ciclo de
Krebs, sin embargo, cabe destacar que ha capturado electrones energéticos en 10
moléculas de NADH2 y 2 en FADH2. Estos transportadores depositan sus
electrones en el sistema de transporte de electrones localizado en la membrana
interna de la mitocondria.

De aquí pasamos a la cadena transportadora de electrones, esta es una serie de


transportadores de electrones que se encuentran en la membrana interna, en la
membrana interna mitocondrial1 o en las membranas tilacoidales, que mediante
reacciones bioquímicas producen ATP.
Gráfico 2. Las rutas metabólicas en la célula.

3. El metabolismo del glucógeno en el hígado regula los niveles de glucosa en


la sangre. Teniendo en cuenta esta información realice los siguientes ejercicios y
establezca la relación entre estos dos procesos metabólicos glucogénesis y
glucogenólisis:

a. ¿Cómo se da la ruta anabólica del glucógeno a glucogénesis?

En la ruta anabólica, se producen moléculas de mayor tamaño, en el caso de la


glucogénesis, se produce glucógeno a partir de la glucosa 6 fosfato. El proceso se
explica al detalle a continuación:

- Primero la glucosa en sangre se convierte en glucosa-6-fosfato mediante una


reacción catalizada por la glucoquinasa o hexoquinasa.
- Posteriormente, la glucosa-6-fosfato se convierte en glucosa-1-fosfato por
la acción de la Fosfoglucomutasa.
- Ahora la glucosa-1-fosfato se convierte en UDP-glucosa por la acción de la
UDP-glucosa pirofosforilasa.
- Es en este punto que las UDP-glucosa se acoplan a la cadena de glucosas
con la glucógeno sintasa y las ramificaciones se generan por la por la enzima
ramificadora del glucógeno (amilo (1,4 ->1,6)-transglucosidasa).

b. ¿Cuáles son las etapas de la ruta catabólica del glucógeno o glucogenólisis?


Se tiene que la glucogenólisis es un proceso catabólico que consiste en la
degradación del glucógeno en glucosa-6-fosfato, este proceso se presenta cuando
el cuerpo requiere un aumento de glucosa, es el proceso inverso de la glucogénesis.
Este proceso se lleva a cabo en 3 pasos:

- Inicialmente, la glucogeno fosforilasa segmenta secuencialmente los enlaces


glucosidicos para generar la glucosa-1-fostao.
- Luego la Fosfoglucomutasa, transforma la glucosa-1-fosfato en glucosa-6-
fosfato.
- Finalmente, la glucosil transferasa α(1,4)→α(1,4) y la amilo-α-1,6-
glucosidasa, también llamada enzima desramificadora, que contiene dos
sitios catalíticos en una única subunidad de 160,000 D que cataliza dos
reacciones sucesivas.

4. La degradación de los ácidos grasos se da básicamente a través de la beta


oxidación (β-oxidación). En el siguiente ejercicio se plantea:
Describa el proceso mediante el cual se da el fraccionamiento de moléculas grandes
de los ácidos grasos a través de los cuatro pasos mencionados a continuación:

a. Deshidrogenación por la enzima acil-CoA deshidrogenasa.

El primer paso de la β-oxidación es la oxidación por FAD, este corresponde a la


oxidación del ácido graso por la acil-CoA desidrogenasa. En esta reacción la enzima
cataliza la formación de un enlace doble entre el carbono 2 y el carbono 3. A
continuación se presenta la reacción descrita:

b. Hidratación.

Este es el siguiente paso, en ella reacciona el enlace doble de la trans-Δ2-enoil-CoA,


esta es una reacción estereospecifica, con lo cual solo se forma el isómero L:
c. Deshidrogenación por la enzima hidroxiacilo-CoA deshidrogenasa.

El siguiente paso es la oxidación por NAD+, en esta reacción se oxida el L-3-


hidroxiacil CoA gracias a una molécula de NAD+, esto convierte el grupo hidroxilo
en una cetona:

d. La escisión tiolítica.

Finalmente, la escisión tiolítica o tiólisis es el paso final, en esta se separa el 3-


cetoacil CoA por el grupo tiol de otra molécula de CoA:

e. ¿Cuál es el papel de la carnitina y la relación con la Acil coenzima A?

Es sabido que la beta oxidación de los ácidos grasos sucede dentro de la


mitocondria, es por esto que deben atravesar la membrana mitocondrial, como los
ácidos grasos de más de diez carbonos son de gran tamaño, necesitan un
transportador que los lleve desde el citosol a la parte interior de la matriz
mitocondrial. La carnitina aciltransferasa I cataliza la transferencia del residuo
aciloglosario del acil graso-CoA a la carnitina; la acil-carnitina entra en la mitocondria
intercambiándose con una molécula de carnitina y en la matriz mitocondrial, la
carnitina aciltransferasa II cataliza la reacción inversa para tener dentro de la
mitocondria el acil graso-CoA.

5. Los fosfolípidos son una clase de lípidos importantes, ya que son un


componente principal de la membrana celular animal que influyen en la
conformación y función de los receptores unidos a la membrana y los canales
iónicos. Debido a su importancia, es necesario el estudio de su composición y
función, por ello se presentan las siguientes preguntas:

a. ¿Cómo está conformada una molécula de fosfolípido?

Los fosfolípidos son biomoléculas anfipáticas, las interacciones hidrofóbicas que tienen
les permite formar bicapas lipídicas como la membrana celular. Esto se debe a que
presentan 2 colas apolares compuestas por esteres de ácido graso y una cabeza polar
compuesta por un residuo de ácido fosfórico. Estas moléculas se forman por la fosforilacion
de un diacilglicerol. A continuación, se presenta un esquema de estas moléculas:

b. ¿Cuál es la función de la fosfatidilcolina y la fosfatidilserina?

La fosfatidilcolina es un fosfolípido que compone la bicapa lipídica de las


membranas celulares, por otro lado, la fosfatidilserina se encuentra únicamente en
la parte interior de la bicapa lipídica, es decir, este se encuentra del lado del citosol
en las células. Estos fosfolípidos cumplen funciones importantes en el metabolismo,
al ser moléculas anfipáticas, ayudan a la solubilización de los ácidos biliares en la
bilis. Adicionalmente, se encargan de emulsionar los lípidos que son ingeridos en la
dieta.

c. ¿Cuál es la función de los fosfoglicéridos y esfingolípidos?

Los fosfoglicéridos son moléculas lipídicas del grupo de los fosfolípidos, estos
adicionalmente en el grupo fosfato se les une un alcohol o un amino alcohol,
cumplen función estructural en la membrana lipídica. Estos tienen un carácter
antipático aún más marcado por la adición del grupo alcohol. Por su parte los
esfingolípidos son lípidos complejos que derivan del aminoalcohol insaturado de 18
carbonos esfingosina. Estos también son moléculas anfipáticas, con lo cual
constituyen un componente fundamental en las membranas biológicas, además de
la membrana celular, también se encuentran en la membrana de los glóbulos rojos,
adicionalmente, cumplen un papel de señalización celular.

d. ¿Describa el metabolismo de los fosfolípidos?


El catabolismo de los fosfolípidos se da gracias a las fosfolipasas, estas hidrolasas
cortan el grupo polar del glicerol de la molécula de fosfolípidos, con lo cual se libera
la molécula polar, el glicerol y los dos ácidos grasos. Por un lado, los ácidos grasos
se envían a la beta-oxidación para producción de energía, la cual fue descrita en el
punto anterior. Por otro lado, la glicerina va para gluconeogénesis, es decir, para
producción de glucosa.

6. En los mamíferos, el colesterol se adquiere ya sea por absorción de la dieta


o por síntesis en los diversos órganos. El hígado y el intestino son generalmente los
órganos más importantes para la síntesis de colesterol. De acuerdo a su
importancia, es de interés estudiar los procesos involucrados con el colesterol, por
ello se presentan las siguientes preguntas:

a. ¿Cómo se adquiere el colesterol a través de la captación de lipoproteínas de


baja densidad (LDL)?

A través de la sangre, el colesterol es transportado por medio de unas cavidades


proteicas denominadas lipoproteínas. Cuando la célula necesita colesterol para la
síntesis de membrana, produce proteínas receptoras de LDL y las inserta en su
membrana plasmática. Cuando el colesterol es captado pasa a los lisosomas donde
se hidrolizan los ésteres de colesterol dando lugar a colesterol libre, que de esta
forma queda a disposición de la célula para la biosíntesis de las membranas.

b. ¿Cómo se da la síntesis de colesterol en el hígado y, en cierta medida, en el


intestino?

La síntesis del colesterol se presenta en el retículo endoplasmatico de todas las


células del cuerpo, pero principalmente en las células del hígado, este es un proceso
bastante complejo el cual podemos resumir en los siguiente 4 pasos:

- El acetil-CoA se convierte en mevalonato. (a partir de la reductasa de 3-


Hidroxi-3-metilglutaril-coenzima A (HMG Co A- reductasa) )
- El mevalonato se convierte en escualeno mediante reacciones sucesivas de
transferencia de grupos prenilo.
- El escualeno se transforma en lanosterol.
- El lanosterol se convierte en colesterol después de otras 21 reacciones
sucesivas, enzimáticamente catalizadas.

c. ¿Cuál es la importancia del metabolismo del colesterol?

Una de las funciones más importantes del metabolismo del colesterol es que es
precursor de muchas hormonas esteroideas, una vez el colesterol está disponible
en su forma libre, este pasa a la matriz mitocondrial. Las hormonas esteroides
naturales son generalmente sintetizadas a partir del colesterol en las gónadas y
glándulas suprarrenales. Estas formas de hormonas son lipídicas. Pueden pasar a
través de la membrana celular1 ya que son solubles en grasa, y luego unirse a
receptores de hormonas esteroides que pueden ser nuclear o citosólica
dependiendo de la hormona esteroide, para provocar cambios dentro de la célula.
A continuación, se presentan algunos ejemplos de estas:

7. Cuando los niveles de glucosa son abundantes, el exceso de acetil CoA


generado por la glucólisis puede convertirse en ácidos grasos, triglicéridos,
colesterol, esteroides y sales biliares.

a. De las dietas alimenticias de los mamíferos ¿Qué precursores


lipídicos se toman como reserva?

Como ya se mencionó antes, la beta oxidación de los lípidos forma acetil coenzima
A, la cual se utiliza en diferentes procesos metabólicos. Cuando se tiene un exceso
de acetil CoA, se produce un proceso a la inversa, se construyen ácidos grasos a
partir del acetil CoA. Este exceso de ácido graso se une a moléculas de glicerol
producto de la glucolisis, formando las moléculas de acilglicéridos, en su mayoría
triglicéridos pasan a ser almacenados por el cuerpo en células adiposas.

b. ¿Cómo se da la síntesis de los ácidos grasos en los mamíferos?

En la síntesis de los ácidos grasos interviene un intermediario que no participa en


la degradación, el malonil-CoA. El malonil-CoA se forma a partir de acetil-CoA y de
bicarbonato, reacción que consume ATP y que está catalizada por la acetil-CoA
carboxilasa, enzima que requiere biotina como cofactor. La elongación de los ácidos
grasos se da por un proceso inverso a la beta oxidación, este se presenta a
continuación en 4 pasos:
- Condensación. El primer paso es la condensación del acetil-ACP y el malonil-
ACP, lo que conduce a la formación de acetoacetil-ACP con liberación de
CO2.

- Reducción del acetoacetil-ACP: En este paso, el acetoacetil-ACP es reducido


por el NADPH a D-3-hidroxibutiril-ACP. El doble enlace se reduce a un grupo
hidroxilo. Solo se forma el isómero D.

- Deshidratación: En esta reacción, el D-3-hidroxibutiril-ACP es deshidratado


a crotonil-ACP.

- Reducción del crotonil-ACP: finalmente el crotonil-ACP es reducido por el


NADPH a butiril-ACP.

8. La fotosíntesis es el proceso mediante el cual las plantas, algunas bacterias


y algunos protistas, utilizan la energía de la luz solar para producir azúcar,
posteriormente esa energía retenida es utilizada, la respiración celular para obtener
ATP, el "combustible" utilizado por todos los seres vivos. La conversión de energía
solar en energía química, está asociada con las acciones de la clorofila que es un
pigmento verde.
Gráfico 3. La fotosíntesis

a. En las hojas de las plantas organelos llamados cloroplastos, que se


especializan en llevar a cabo las reacciones de la fotosíntesis ¿Qué
reacciones bioquímicas se llevan a cabo en esta estructura?

Como se mencionó antes, la fotosíntesis es el proceso en el cual la energía de la


luz se convierte en energía química, está en forma de azucares. Esto se da en los
cloroplastos, En un proceso llamado fotofosforilación no cíclica, se toman electrones
del agua y pasan a través del PSII y PSI antes de terminar en NADPH. Este proceso
requiere que se absorba luz dos veces, una vez en cada fotosistema, y crea ATP.
Los pasos básicos de este proceso son:

- Absorción de la luz en PSII. Cuando uno de los muchos pigmentos del


fotosistema II absorbe luz, la energía pasa de un pigmento a otro hacia el
interior hasta alcanzar el centro de reacción. Allí, la energía se transfiere a
P680, lo cual impulsa un electrón a un alto nivel de energía. El electrón de
alta energía pasa a una molécula aceptora y es reemplazado por un electrón
del agua. Esta división del agua libera el oxígeno, que respiramos.
- Síntesis de ATP. El electrón de alta energía recorre una cadena de transporte
de electrones y pierde energía a medida que avanza. Parte de la energía
liberada impulsa el bombeo de iones hidronio del estroma hacia el interior de
los tilacoides y forma un gradiente. A medida que los iones hidronio fluyen a
favor de su gradiente hacia el estroma, pasan a través de la ATP sintasa, que
estimula la producción de ATP en un proceso conocido como quimiosmosis.
- Absorción de la luz en PSI. El electrón llega al fotosistema I y se une al par
especial de clorofilas P700 en el centro de reacción. Cuando los pigmentos
absorben la energía lumínica y esta pasa hacia el centro de reacción, el
electrón en P700 es impulsado hacia un nivel muy alto de energía y se
transfiere a una molécula aceptora. El electrón que falta del par especial es
reemplazado por un nuevo electrón de PSII (que llega a través de la cadena
de transporte de electrones).
- Formación de NADPH. El electrón de alta energía recorre un segundo tramo
breve de la cadena de transporte de electrones. Al final de la cadena, el
electrón pasa al NADP+ para formar NADPH.

b. Del ciclo de Calvin explique ¿qué productos sintetiza en las reacciones


dependientes de la luz? ¿qué reacciones independientes de la luz se da en la
formación de azúcares?
Las reacciones dependientes de la luz usan la energía lumínica para formar dos
moléculas necesarias para la siguiente etapa de la fotosíntesis: la molécula de
almacenamiento de energía ATP y el portador de electrones reducido NADPH. En
las plantas, las reacciones de la luz ocurren en la membrana de los tilacoides de los
cloroplastos.

Por otro lado, las reacciones independientes de la luz se llevan a cabo en el estroma
del cloroplasto. En esta etapa se utilizan las moléculas de NADPH y ATP, generadas
en la fase dependiente de la luz, para sintetizar glucosa y otras moléculas orgánicas
a partir de la fijación de carbono y agua.

Bibliografía.

d. Feduchi, E. (2014). Bioquímica: Conceptos esenciales (2ª edición).


Madrid. Médica Panamericana, S.A.
e. Torres, G. (2011). Módulo de bioquímica. Universidad Nacional
Abierta y a distancia UNAD.