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Cuando el virus infecta a una bacteria, este actúa como un parásito intracelular
que busca tomar el control de la maquinaria celular de la bacteria en este caso,
para poder reproducirse ya que el virus carece de mecanismos que le permitan
hacerlo por sí mismo. En este momento, el ADN del virus interactúa con la
maquinaria de CRISPR/Cas y Cas corta un pequeño fragmento del ADN del virus,
este corte lo inactiva, pero el fragmento queda incluido en forma de espaciador
en las regiones de CRISPR que más adelante se transcribirán para dar lugar a
proteínas Cas modificadas con una secuencia de ARN que le va a guiar
específicamente a identificar y destruir el virus al cual pertenece esa secuencia
complementaria. Es como si ahora las nucleasas Cas tuvieran una orden de
búsqueda y captura.