IDENTIFIKASI GEN blaNDM PADA CARBAPENEM-RESISTANT Enterobacteriaceae

YANG DIISOLASI DARI PASIEN INFEKSI YANG DIRAWAT DI RSUP

DR. MOHAMMAD HOESIN PALEMBANG

Deasy Nataliani1, Tia Sabrina2, Yuwono3, Ella Amalia4

1
Program Studi Pendidikan Dokter, Fakultas Kedokteran, Universitas Sriwijaya, Palembang, Indonesia
2,3,4
Bagian Mikrobiologi, Fakultas Kedokteran, Universitas Sriwijaya, Palembang, Indonesia
Jl. Dr. Mohd. Ali, Kompleks RSMH, KM. 3,5, Palembang, 30126, Indonesia

Email: deaanataa@gmail.com

Abstrak
Gen blaNDM memainkan peran penting dalam meningkatkan kejadian resistensi Enterobacteriaceae terhadap antibiotik
golongan karbapenem melalui produksi enzim karbapenemase NDM di berbagai rumah sakit di seluruh dunia.
Penyebaran gen blaNDM dari satu organisme ke organisme bakteri lain dapat terjadi begitu cepat karena gen ini terletak
pada plasmid. Saat ini, infeksi Enterobacteriaceae yang membawa gen blaNDM telah menyebar ke berbagai negara di
Asia, termasuk Indonesia. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi gen blaNDM pada CRE di RSUP Dr.
Mohammad Hoesin Palembang. Penelitian ini merupakan penelitian observasional deskriptif di laboratorium dengan
menggunakan 730 sampel Enterobacteriaceae dari pasien infeksi yang terkumpul di Laboratorium Mikrobiologi RSUP
Dr. Mohammad Hoesin Palembang selama periode September hingga November 2017. Deteksi karbapenemase
dilakukan melalui uji dilusi menggunakan Vitek 2 Compact bioMerieux, sedangkan deteksi gen blaNDM dilakukan
dengan metode polymerase chain reaction (PCR) yang menghasilkan satu pita DNA sepanjang 621 bp. Produk PCR
divisualisasi melalui elektroforesis gel agarosa 2%. Dari 730 isolat Enterobacteriaceae, isolat CRE teridentifikasi
sebanyak 35(4,8%). Dari 35 isolat CRE, PCR mengonfirmasi sebanyak 12(34,3%) isolat membawa gen blaNDM dengan
distribusi isolat 11(91,7%) pada Klebsiella pneumoniae dan 1(8,3%) pada Enterobacter cloacae. Berdasarkan asal
sampel, isolat dengan gen blaNDM positif terbanyak ditemukan pada sampel sputum (n=5; 41,8%). Semua isolat yang
memiliki gen blaNDM bersifat resisten terhadap antibiotik meropenem. Pada penelitian ini, gen blaNDM teridentifikasi
pada 12(34,3%) isolat CRE dengan distribusi pada Klebsiella pneumoniae (91,7%) dan Enterobacter cloacae (8,3%).

Kata kunci: Enterobacteriaceae, Karbapenemase, Gen blaNDM, PCR.

Abstract
Identification of blaNDM Gene in Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Isolated from Patients with Infection
Hospitalized in RSUP Dr. Mohammad Hoesin Palembang. The blaNDM gene plays the important role in increasing
the resistance cases of Enterobacteriaceae to carbapenem by producing NDM carbapenemase enzyme in many
hospitals in the whole world. The spread of blaNDM gene from one bacteria organism to another can be happened so fast
because this gene is located in plasmid. Nowadays, the infections of Enterobacteriaceae that carried blaNDM gene have
been spreaded to many countries in Asia, included Indonesia. Thus, this study was undertaken to identify the blaNDM
gene in Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae (CRE) in RSUP Dr. Mohammad Hoesin Palembang. This study was
a descriptive observational study in laboratory using 730 Enterobacteriaceae samples from infection patients collected
in Microbiology Laboratory RSUP Dr. Mohammad Hoesin Palembang from September to November 2017. The
detection of carbapenemase was conducted by dilution test using Vitek 2 Compact bioMerieux, whereas the detection of
blaNDM gene was conducted by polymerase chain reaction (PCR) method that will produce one DNA band with length
621 bp. PCR product then visualized by 2% agarose gel electrophoresis. Out of 730 Enterobacteriaceae isolates,
35(4,8%) CRE isolates were identified. Out of 35 CRE isolates, PCR confirmed that 12(34,3%) isolates carried blaNDM
gene with the isolates distribution 11(91,7%) in Klebsiella pneumoniae and 1(8,3%) in Enterobacter cloacae. Based on
the sample origin, the isolates with positive blaNDM gene mostly found in sputum samples (n=5; 41,8%). All of the
positive blaNDM gene isolates were resistant to meropenem. In this study, blaNDM gene was identified in 12(34,3%) CRE
isolates with the distribution in Klebsiella pneumoniae (91,7%) and Enterobacter cloacae (8,3%).

Keyword: Enterobacteriaceae, Carbapenemase, blaNDM Gene, PCR.

1. Pendahuluan
Angka kesakitan dan kematian akibat
penyakit infeksi masih tinggi di seluruh dunia.
World Health Organization (WHO) (2015)
melaporkan bahwa dari 56,4 juta jiwa yang
mengalami kematian di dunia pada tahun
2015, 10% kematian disebabkan oleh
penyakit infeksi.1 Enterobacteriaceae
merupakan salah satu famili dari berbagai
spesies bakteri yang dapat menyebabkan
berbagai penyakit infeksi, baik infeksi
nosokomial yang dikenal dengan Healthcare
Associated Infections (HAIs) maupun infeksi
yang berasal dari komunitas atau Community
Acquired Infections (CAIs).2
Sejak berbagai isolat Enterobacteriaceae
teridentifikasi membawa enzim Extended-
Spectrum β-Lactamases (ESBLs) pada tahun
1990, antibiotik karbapenem menjadi obat
terpenting yang digunakan secara luas dalam
mengatasi infeksi akibat bakteri ini karena
ketahanannya terhadap kerja enzim tersebut.3
Namun hal ini memberikan konsekuensi
semakin mudahnya Enterobacteriaceae
menjadi resisten terhadap antibiotik
karbapenem hingga dikenal sebutan
Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae
(CRE).3
Indonesia merupakan negara dengan
angka kejadian resistensi Enterobacteriaceae
terhadap karbapenem tertinggi di Asia
Tenggara yaitu sebesar 5,8%.4 Data pola
kuman dan kepekaan terhadap antibiotik di
RSUP Dr. Mohammad Hoesin Palembang
menunjukkan bahwa sensitivitas Klebsiella
pneumoniae terhadap meropenem hanya
sebesar 50%.5
CRE dapat menjadi resisten terhadap
antibiotik golongan karbapenem terutama
akibat terekspresinya suatu gen beta
laktamase spesifik atau yang disebut dengan
gen bla menjadi enzim karbapenemase
dengan tipe tertentu yang dapat merusak
cincin beta laktam pada antibiotik
karbapenem.6 Beberapa tahun belakangan ini,
gen blaNDM yang menyandi karbapenemase
NDM menjadi penyebab resistensi yang
paling mencemaskan didunia terutama karena
dapat menyebabkan suatu bakteri menjadi
multi-drug resistant dan gen ini dilaporkan
paling banyak ditemukan pada bakteri
penyebab infeksi komunitas serta
distribusinya telah meluas ke berbagai negara
di Asia, Afrika, Australia, Amerika, dan
Eropa, dengan endemisitas terletak di benua
Asia.7 Angka kesakitan dan kematian akibat
Enterobacteriaceae penghasil karbapenemase
di dunia mencapai 40-50% tergantung jenis
penyakit pasien, spesies bakteri dan pilihan
terapi.4
2. Metode Penelitian
Penelitian ini merupakan penelitian
observasional deskriptif di laboratorium
menggunakan 730 isolat Enterobacteriaceae
dari berbagai jenis spesimen klinis yang telah
terkumpul di Laboratorium Mikrobiologi
RSUP Dr. Mohammad Hoesin Palembang
selama periode September-November 2017.
Deteksi karbapenemase dan uji kepekaan
antibiotik karbapenem dilakukan dengan
menggunakan Vitek 2 Compact bioMerieux®.
Antibiotik golongan karbapenem yang diuji
adalah ertapenem dan meropenem. Bakteri
berumur 18-24 jam yang akan diuji dibuat
menjadi suspensi dengan larutan NaCl 0,45%
pH 4,5 dan kekeruhannya disesuaikan pada
standar 0,5 Mc.Farland menggunakan
DensiCheck. Isolasi DNA dilakukan terhadap
semua isolat yang telah teridentifikasi sebagai
CRE. Bahan-bahan yang digunakan dalam
proses isolasi DNA antara lain phospate
buffer saline (PBS) pH 7,4, saponin 0,5%
dalam PBS, dan chelex 20% dalam ddH2O.
Diakhir proses ini, supernatan dipisahkan ke
dalam tabung eppendorf 1,5 ml steril dan
disimpan dalam suhu -20oC sebelum
dilakukan amplifikasi PCR.
Identifikasi gen blaNDM dengan PCR
menggunakan 2 primer spesifik yang merujuk
pada studi Poirel dkk (2011) seperti yang
ditunjukkan pada Tabel 1.8 Volume campuran
reaksi PCR sebanyak 23 µl yang terdiri dari 5
µl cetakan DNA, 0,5 µl masing-masing
primer, 10 µl 2 U GoTaq Green DNA
polymerase, dan 7 µl ddH2O.
 Tabel 1. Urutan Basa, Panjang Primer, dan Produk PCR dari Primer8
Primer Urutan Basa
Forward 5’-GGTTTGGCGATCTGGTTTTC-3’
Reverse 5’-CGGAATGGCTCATCACGATC-3’
DNA diamplifikasi dengan menggunakan
Bio-Rad Thermo Cycler®. Proses amplifikasi
DNA dimulai dengan tahap denaturasi awal
selama 5 menit pada suhu 95oC, dilanjutkan
dengan 32 siklus PCR yang terdiri dari 30
detik tahap denaturasi pada suhu 95oC, 1
menit tahap penempelan pada suhu 60oC, dan
1 menit tahap ekstensi pada suhu 72oC, serta
diakhiri dengan tahap ekstensi akhir selama 5
menit pada suhu 72oC.
Sebanyak 5 µl produk PCR dimasukkan
ke dalam sumuran gel agarosa 2% dalam
buffer TAE (Tris-Acetate-EDTA). Pemisahan
fragmen DNA dilakukan dengan
elektroforesis pada tegangan listrik 100 V
selama 30 menit. DNA marker 100 bp
digunakan sebagai penanda ukuran pita-pita
DNA hasil elektroforesis. Produk amplifikasi
selanjutnya divisualisasi dibawah sinar UV.
3. Hasil
Deteksi CRE
Dari 730 isolat Enterobacteriaceae,
isolat CRE teridentifikasi sebanyak 35(4,8%)
dengan distribusi isolat paling banyak adalah
Klebsiella pneumoniae (n=17; 48,5%) yang
secara berurutan diikuti oleh Escherichia coli
(n=8; 22,9%), Enterobacter cloacae (n=7;
20%), dan Serratia marcescens (n=3; 8,6%)
(Gambar 1).
Gambar 1. Distribusi CRE pada Isolat
Enterobacteriaceae (%)
Panjang Produk PCR
Primer (nt) (bp)
20
621
20
Semua isolat CRE ditemukan tersebar pada
spesimen sputum (n=12; 34,4%), urin (n=8;
22,9%), pus (n=5; 14,4%), dan darah (n=4;
11,5%), serta pada cairan pleura, feses,
jaringan, swab lidah, swab luka, dan swab
orofaring yang masing-masing hanya satu
isolat (2,8%).
Deteksi Molekular Gen blaNDM
PCR dilakukan terhadap 35 isolat CRE
dengan menggunakan primer forward dan
reverse spesifik yang menghasilkan produk
pita DNA sepanjang 621 bp (Gambar 2).
Sebanyak 12(34,3%) isolat CRE
teridentifikasi gen blaNDM positif.
Gambar 2. Hasil Visualisasi Amplikon Gen blaNDM
Keterangan: K- =Kontrol Negatif,
M=DNA Marker, 1-4=Nomor Sampel,
621 bp = Positif Gen blaNDM
Seperti yang ditunjukkan pada Tabel 2,
11(91,7%) dari 12 isolat dengan gen blaNDM
positif merupakan Klebsiella pneumoniae dan
1(8,3%) isolat lainnya merupakan
Enterobacter cloacae. Isolat CRE dengan gen
blaNDM positif paling banyak ditemukan pada
spesimen sputum yaitu 5(41,8%), yang diikuti
oleh spesimen urin sebanyak 3(25%). Empat
isolat lainnya ditemukan masing-masing
1(8,3%) pada spesimen cairan pleura, darah,
jaringan, dan pus (Gambar 3).
 Tabel 2. Distribusi Gen blaNDM pada Isolat CRE sedangkan yang paling rendah terhadap
antibiotik sefepim (n=16; 45,7%).
Gen blaNDM
Bakteri n(%) Positif Negatif Tabel 4. Pola Resistensi CRE terhadap Antibiotik
n % n % Golongan Beta Laktam Selain Karbapenem
Klebsiella
17(48,5) 11 91,7 6 26,1
pneumoniae
Enterobacter Resisten Intermediate Sensitif
7(20) 1 8,3 6 26,1 Antibiotik
cloacae N % N % N %
Escherichia Ampisilin 35 100 0 0 0 0
8(22,9) 0 0 8 34,8 Aztreonam 21 60 2 5,7 12 34,3
coli
Serratia Sefepim 16 45,7 2 5,7 17 48,6
3(8,6) 0 0 3 13 Seftriakson 22 62,9 0 0 13 37,1
marcescens
Total 35(100) 12 100 23 100 Sefazolin 28 80 0 0 7 20
Seftazidim 20 57,2 2 5,7 13 37,1

4. Pembahasan

Distribusi Fenotip Karbapenemase pada

Gambar 3. Distribusi CRE dengan Gen blaNDM
positif Berdasarkan Jenis Spesimen (%)
Kepekaan CRE dengan Gen blaNDM Positif
terhadap Berbagai Antibiotik Beta Laktam
Seperti yang disajikan dalam Tabel 3,
semua isolat CRE dengan gen blaNDM positif
menunjukkan sifat resisten terhadap
meropenem (n=12; 100%) sedangkan
terhadap ertapenem, 11(91,7%) isolat bersifat
resisten dan 1(8,3%) isolat bersifat sensitif.
Tabel 3. Pola Resistensi CRE dengan gen blaNDM
positif terhadap Antibiotik Ertapenem dan
Meropenem
Gen blaNDM Positif
Antibiotik n (%)
R I
Ertapenem 11(91,7) 0 1(8,3)
Meropenem 12(100) 0 0
Angka resistensi CRE terhadap
antibiotik beta laktam lain cukup bervariasi
seperti yang ditampilkan pada Tabel 4.
Resistensi CRE terhadap antibiotik ampisilin
merupakan yang paling tinggi (n=35; 100%),
Isolat Enterobacteriaceae
Asia Tenggara memang bukan
merupakan daerah endemik CRE, namun
prevalensi penyakit infeksi oleh CRE
meningkat sebesar 0,5% pada tahun 2012.9
Melalui Vitek 2 Compact pada penelitian ini,
dari 730 isolat Enterobacteriaceae terdapat
35(4,8%) isolat yang teridentifikasi secara
fenotip resisten terhadap antibiotik golongan
karbapenem atau yang disebut juga dengan
Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae
(CRE). Angka tersebut cukup jauh jika
dibandingkan dengan prevalensi CRE di
daerah endemis yang mencapai 29,8%, namun
relevan jika dibandingkan dengan prevalensi
CRE di Indonesia yaitu 5,8% yang
menjadikan Indonesia sebagai negara dengan
prevalensi CRE tertinggi di Asia.4
Beberapa studi terdahulu melaporkan
bahwa Enterobacteriaceae yang paling sering
teridentifikasi sebagai CRE adalah Klebsiella
pneumoniae. Persentase resistensi isolat
Klebsiella pneumoniae terhadap ertapenem
sangat tinggi yaitu mencapai 100% pada
S
penelitian yang dilakukan oleh Ukropina dkk
pada tahun 2016.10 Begitupun dengan
penelitian yang dilakukan oleh El-Ghazzawy
dkk (2016) bahwa hampir semua isolat CRE
pada penelitiannya merupakan Klebsiella
pneumoniae (93,8%) sedangkan sisanya
adalah Eschericia coli (3,7%) dan
Enterobacter cloacae (2,5%).11 Pada
penelitian ini pun ditemukan bahwa hampir tersebut dapat dengan sangat mudah
setengah dari total CRE berasal dari spesies ditransmisikan ke organisme lain.18
Klebsiella pneumoniae (48,5%) sedangkan Pada penelitian ini, sebanyak 65,7%
yang lainnya berasal dari Escherichia coli, CRE tidak teridentifikasi memiliki gen
Enterobacter cloacae, dan Serratia blaNDM namun tetap bersifat resisten terhadap
marcescens. antibiotik golongan karbapenem. Hal ini
menunjukkan bahwa resistensi CRE yang
Distribusi Gen blaNDM pada CRE tidak memiliki gen blaNDM dapat terjadi
Resistensi Enterobacteriaceae melalui mekanisme lain baik itu melalui
terhadap antibiotik karbapenem terutama ekspresi gen beta laktamase lain yang
diperankan oleh perubahan berbagai elemen menghasilkan enzim resistensi lain pula
genetik seperti mutasi yang bersifat difusi dari seperti gen blaIMP, blaVIM, dan gen bla lainnya
berbagai gen resistensi antibiotik lain ataupun ataupun melalui mekanisme non-enzim
delesi segmen genetik yang memungkinkan seperti mutasi yang menyebabkan gangguan
terjadinya perubahan susunan asam amino ekspresi dan fungsi dari porin, PBPs, ataupun
sehingga terbentuk gen penyandi pompa efflux.7,19 Sebagai perbandingan,
12,13
karbapenemase. Bakteri penghasil distribusi gen blaNDM dari beberapa hasil
karbapenemase kelas metallo-beta laktamase penelitian di beberapa negara dirangkum
(MBL) dapat membawa gen resistensi dalam Tabel 5.
blaNDM, blaVIM, dan blaIMP. Namun, gen
blaNDM merupakan gen penyandi Tabel 5. Hasil penelitian gen blaNDM pada isolat
karbapenemase MBL yang paling banyak CRE di berbagai negara
berperan dalam menyebabkan resistensi CRE Gen
di seluruh dunia. 14 Hingga saat ini, telah Jumlah
Peneliti blaNDM
Populasi Sampel
ditemukan 8 tipe gen blaNDM dengan (Tahun)
CRE
Positif
distribusi terbanyak adalah di Asia.15 (%)
Karuniawati Jakarta,
Penelitian di Malaysia menemukan 22 1(4,5%)
dkk. (2011) Indonesia
prevalensi CRE yang membawa gen blaNDM Hongping
positif sebesar 29%.16 Angka tersebut sedikit dkk. (2015)
China 114 3(2,6%)
lebih rendah namun relevan jika dibandingkan Abidin dkk.
Malaysia 63 18(29%)
dengan hasil penelitian ini yaitu sebanyak (2015)
34,3% CRE teridentifikasi membawa gen El-Ghazzawy
Mesir 80 54(67,5%)
dkk. (2016)
blaNDM. Namun, prevalensi CRE dengan gen Khan dkk.
blaNDM positif pada penelitian ini cukup tinggi Pakistan 114 107(94%)
(2016)
jika dibandingkan dengan penelitian yang Penelitian ini Palembang,
35 12(34,3%)
dilakukan oleh Karuniawati dkk (2011) di RS. (2017) Indonesia
Cipto Mangunkusumo Jakarta yang hanya
menemukan 4,5% CRE dengan gen blaNDM Perbedaan yang cukup signifikan
positif.17 dengan hasil studi di Jakarta dan China
Peningkatan distribusi gen blaNDM terletak pada perbedaan asal sampel yaitu,
pada penelitian ini menunjukkan bahwa pada penelitian yang dilakukan oleh
transmisi gen tersebut pada isolat CRE terjadi Karuniawati dkk (2011), sampel hanya
dengan sangat mudah dan cepat. Hal ini dapat diambil dari pasien ICU.17 Sedangkan pada
disebabkan karena plasmid penelitian yang dilakukan oleh Hongping dkk
Enterobacteriaceae secara khas teridentifikasi (2015), sampel yang diambil hanya berasal
memiliki sekuens gen yang bertanggungjawab dari pasien dengan riwayat sering bepergian
terhadap ekspresi gen blaNDM yaitu sekuens lintas negara.20 Namun, jika penelitian ini
insersi ISAba125 dan mutasi dari sekuens dibandingkan dengan penelitian Abidin dkk
(2015), hasil penelitian ini tidak jauh berbeda.
Hal ini dikarenakan selain isolat CRE pada
kedua penelitian tersebut berasal dari jenis
spesimen klinik yang sama seperti sputum,
pus, dan urin, pola penyebaran gen ini secara
letak geografis antara Malaysia dan Indonesia
juga hampir sama.16 Lain hal dengan
penelitian di Mesir yang dilakukan oleh El-
Ghazzawy dkk (2016) dan di Pakistan yang
dilakukan oleh Khan dkk (2016) dengan hasil
persentase gen blaNDM pada CRE yang jauh
lebih tinggi dibandingkan hasil penelitian ini.
Letak geografis secara umum menjelaskan
perbedaan hasil beberapa studi tersebut.
Berdasarkan peta distribusi CRE, Mesir
merupakan wilayah dengan prevalensi wabah
CRE yang tinggi.11 Sedangkan Pakistan
merupakan daerah endemis gen blaNDM selain
India.21
Enterobacteriaceae merupakan
patogen penting dalam menyebabkan
penyakit infeksi HAIs dan CAIs di seluruh
dunia. Bakteri ini berperan penting dalam
menyebabkan bakteremia, pneumonia, infeksi
luka, dan infeksi saluran kemih.2 Isolat CRE
dengan gen blaNDM positif pada penelitian ini
terbanyak berasal dari sampel sputum
(41,8%). Hal ini disebabkan karena pada
penelitian ini, Klebsiella pneumoniae yang
merupakan bakteri penyebab infeksi saluran
pernapasan dan konsolidasi jaringan paru
paling banyak teridentifikasi gen blaNDM
positif (91,7%).2 Hal serupa ditunjukkan pada
penelitian di Jakarta bahwa satu-satunya isolat
Enterobacteriaceae yang teridentifikasi gen
blaNDM positif berasal dari Klebsiella
pneumoniae.17
Hasil uji dilusi dengan Vitek 2
Compact menunjukkan bahwa semua isolat
CRE positif gen blaNDM bersifat resisten
terhadap meropenem (100%), sedangkan
terhadap ertapenem hanya 91,7% isolat
bersifat resisten dan 8,3% isolat lainnya
bersifat sensitif. Hasil penelitian ini sedikit
berbeda jika dibandingkan dengan penelitian
Abidin dkk (2015) yang menemukan bahwa
semua CRE yang membawa gen blaNDM
terdeteksi resisten terhadap ertapenem
(100%), sedangkan terhadap meropenem
mencapai 89% dan hanya 11% isolat yang
sensitif.16 Sensitivitas terhadap doripenem dan
meropenem juga diuji pada penelitian oleh
Abidin dkk (2015) dengan hasil isolat CRE
yang resisten terhadap doripenem dan
imipenem secara berurutan adalah 94% dan
89%.16 Penggunaan antibiotik meropenem
dan ertapenem secara luas berkontribusi
dalam peningkatan kasus resistensi
Enterobacteriaceae terhadap antibiotik
tersebut.
Selain bersifat resisten terhadap
antibiotik golongan karbapenem, CRE juga
dapat bersifat resisten terhadap beberapa
antibiotik golongan beta laktam lainnya akibat
adanya gen-gen penyandi enzim resistensi
lain seperti gen penyandi ESBL, AmpC
sefalosporin, serta karbapenemase lain tipe
oksasilinase.7,22 Pada penelitian ini didapatkan
bahwa CRE dengan gen blaNDM positif juga
bersifat resisten terhadap antibiotik beta
laktam lain, seperti ampisilin, aztreonam,
sefepim, seftriakson, sefazolin, dan
seftazidim. Hasil penelitian ini sesuai dengan
penelitian yang dilakukan oleh Nordmann dkk
(2012) yang menyatakan bahwa CRE dengan
gen blaNDM juga dapat bersifat resisten
terhadap antibiotik beta laktam lain
setidaknya golongan sefalosporin.23
Peningkatan distribusi gen blaNDM
pada CRE dapat meningkatkan risiko
terjadinya kegagalan terapi antibiotik
golongan karbapenem. Penggunaan antibiotik
tersebut secara bijak dengan berbagai
pertimbangan penting untuk selalu diterapkan
sehingga angka resistensi bakteri ini tidak
semakin meningkat dan angka morbiditas dan
mortalitas pasien dengan penyakit infeksi
CRE dapat diturunkan. Penggunaan kolistin,
tigesiklin, dan fosfomisin dapat
dipertimbangkan untuk pengobatan pasien
infeksi CRE.24 Program pencegahan infeksi
dan pengendalian antibiotik di rumah sakit
serta pelaporan uji kuman secara berkala juga
perlu selalu diperhatikan untuk mencegah
peningkatan angka resistensi bakteri di
kemudian hari.
5. Kesimpulan
1. Gen blaNDM teridentifikasi pada
12(34,3%) isolat CRE dengan
distribusi pada Klebsiella pneumoniae
(91,7%) dan Enterobacter cloacae
(8,3%).
2. Semua isolat yang memiliki gen
blaNDM bersifat resisten terhadap
antibiotik meropenem.
Ucapan Terimakasih
Kami mengucapkan terima kasih kepada
Laboratorium Mikrobiologi RSUP Dr.
Mohammad Hoesin Palembang dan
Laboratorium Biologi Molekuler Fakultas
Kedokteran Universitas Sriwijaya atas
perizinan pengambilan sampel dan
penggunaan laboratorium beserta alat-alatnya
untuk pelaksanaan penelitian ini.
Daftar Acuan
1. World Health Organization. 2015. Global
Health Estimates 2015 Summary Table:
Global Deaths by Cause, Age, and Sex,
2000-2015. Geneva, Switzerland.
2. Brooks, G. F., J. S. Butel, dan S. A.
Morse. 2014. Mikrobiologi Kedokteran
Jawetz, Melnick & Adelberg (Edisi ke-
25). Terjemahan oleh: H. Hartanto, dkk.
EGC, Jakarta, Indonesia, hal. 227-234.
3. Deen, R. dan D. Debbie. 2014.
Carbapenem-Resistant
Enterobacteriaceae : Deadly Superbugs
on the Rise. Prevention Strategist-Fall
2014 (Majalah Kedokteran dan
Kesehatan APIC), 1 Oktober 2014, hal.
44-46.
4. Yinling X., Bing G., Mao H., Haiyan L.,
Ting X., Wenying X., dan Tong W.
2014. Epidemiology of Carbapenem
Resistant Enterobacteriaceae (CRE)
During 2000-2012 in Asia. J Thorac Dis.
7(3): 376-385.
5. Liana, P. dan V. Patricia. 2015. Pola
Kuman dan Kepekaan terhadap
Antibiotika RSUP Dr. Mohammad
Hoesin Palembang. Instalasi Patologi
Klinik dan Mikrobiologi RSUP Dr.
Mohammad Hoesin, Palembang,
Indonesia.
6. Jeong H. J., Jung H. L., Jae J. L., Kwang
S. P., A. M. Karim, Chang-Ro L.,
Byeong C. J., dan Sang H. L. 2015.
Structural Basis for Carbapenem-
Hydrolyzing Mechanisms of
Carbapenemases Conferring Antibiotic
Resistance. Int J Mol Sci. 16: 9654-9692.
7. Nordmann, P., T. Naas dan L. Poirel.
2011. Global Spread of Carbapenemase-
Producing Enterobacteriaceae. Emerg
Infect Dis. 17(10): 1791-1798.
8. Poirel, L., T. R. Walsh, V. Cuvillier, dan
P. Nordmann. 2011. Multiplex PCR for
Detection of Acquired Carbapenemase
Genes. Diagn Microbiol Infect Dis.
70(1): 119-123.
9. Christiansen, K. J., M. Ip, H. B. Ker, M.
Mendoza, L. Hsu, P. Kiratisin, A.
Chongthaleong, I. S. Redjeki, A.
Quintana, R. Flamm, J. Garcia, M.
Cassettari, D. Cooper, P. Okolo, dan I.
Morrissey. 2010. In Vitro Activity of
Doripenem and Other Carbapenems
Againts Contemporary Gram-Negative
Pathogens Isolated from Hospitalized
Patients in the Asia-Pacific Region:
Results of the COMPACT Asia-Pacific
Study. Int J Antimicrob Agents. 36(6),
pp.501.
10. Ukropina-Mihajlovic, M., A. Trudic, Z.
Jelesic, D. Medic, B. Milosavljevic, dan
B. Zivlak. 2016. Detection of
Carbapenemase Genes in Klebsiella
pneumoniae Isolates. Srp Arh Celok Lek.
144(5-6): 307-311.
11. El-Ghazzawy, M. A. Meheissen, dan D.
A. Younis. 2016. Phenotypic and
Genotypic Methods for Detection of
Metallo Beta Lactamases Among
Carbapenem Resistant
Enterobacteriaceae Clinical Isolates in
Alexandria Main University Hospital.
Afr. J. Microbiol. Res. 10(1): 32-40.
12. Toleman, M. A., J. Spencer, L. Jones,
dan T. R. Walsh. 2012. BlaNDM is a
Chimera Likely Constructed in
 Acinetobacter baumannii. Antimicrob
Agents Chemother. 56(5): 2773-2776.
13. Poirel, L., R. A. Bonnin, dan P.
Nordmann. 2011. Analysis of the
Resistome of Multidrug-Resistant NDM-
1-Producing Escherichia coli Strain by
High-Throughput Genome Sequencing.
Antimicrob Agents Chemother. 55(9):
4224-4229.
14. Nordmann, P. 2014. Carbapenemase-
Producing Enterobacteriaceae: Overview
of Major Public Health Challenge.
Médicine et Maladies Infectieuses. 44(2):
51-56.
15. Nordmann, P. dan L. Poirel. 2014. The
Difficult-to-control Spread of
Carbapenemase Producers Among
Enterobacteriaceae Worldwide. Clin
Microbiol Infect. 20: 821-830.
16. Abidin, N. Z. Z., A. Sulong, H. Alfizah,
N. A. S. Muttaqillah, dan C. H. Ding.
2015. Molecular Detection of the New
Delhi Metallo-β-Lactamase-1 Gene in
Enterobacteriaceae Isolates in a Tertiary
Medical Centre. The Malaysian J Pathol.
37(3): 227-232.
17. Karuniawati, A., Y. R. Saharman, dan D.
C. Lestari. 2013. Detection of
Carbapenemase Encoding Genes in
Enterobacteriaceae, Pseudomonas
aeruginosa, dan Acinetobacter baumanii
Isolated from Patients at Intensive Care
Unit Cipto Mangunkusumo Hospital in
2011. Acta Med Indones-Indones J Intern
Med. 45(2): 101-106.
18. Poirel, L., L. Dortet, S. Bernabeu, dan P.
Nordmann. 2011. Genetic Features of
blaNDM-1-Positive Enterobacteriaceae.
Antimicrob Agents Chemother. 55(11):
5403-5407.
19. Papp-Wallace, K. M., A. Endimiani, M.
A. Taracila, dan R. A. Bonomo. 2011.
Carbapenems: Past, Present, and Future.
Antimicrob Agents Chemother. 55(11):
4943-4960.
20. Hongping Q., Xiaoli W., Yuxing N.,
Jialin L., Ruoming T., Jie H., Lei L., dan
Jingyong S. 2015. NDM-1 Producing
Enterobacteriaceae in a Teaching
Hospital in Shanghai, China: IncX3-type
Plasmids May Contribute to the
Dissemination of blaNDM-1. Int J Infect
Dis. 34: 8-13.
21. Khan, E., S Irfan, B. A. Sultan, A. Nasir,
dan R. Hasan. 2016. Dissemination and
Spread of New Delhi Metallo-beta-
lactamases-1 Superbugs in Hospital
Settings. J Pak Med Assoc. 66(8): 999-
1004.
22. Wailan, A. M., A. L. Sartor, H. M.
Zowawi, J. D. Perry, D. L. Paterson, dan
H. E. Sidjabat. 2015. Genetic Contexts of
blaNDM in Patients Carrying Multiple
NDM-Producing Strains. Antimicrob
Agents Chemother. 59: 7405-7410.
23. Nordmann, P., M. Gniadkowski, C. G.
Giske, L. Poirel, N. Woodford, V.
Miriagou, dan the European Network on
Carbapenemases. 2012. Identification
and Screening of Carbapenemase-
Producing Enterobacteriaceae. Clin
Microbiol Infect. 18(5): 432-438.
24. Dortet, L., L. Poirel, dan P. Nordmann.
2013. Worldwide Dissemination of the
NDM-Type Carbapenemases in Gram-
Negative Bacteria. BioMed Research
International. 2014: 249856.