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VII Congreso de la Sociedad Cubana de Bioingeniería

Habana 2007

ADQUSICION Y ANALISIS DE BIOPOTENCIALES MEDIANTE


EL MATLAB Y UNA TARJETA DE SONIDO

J. Benítez, W. Almaguer, R. Muños

CIREN
Ave. 25 No: 15805 Cubanacán, C. Habana, Cuba, jbenitez@neuro.ciren.cu

entre las que destacan, la forma, la frecuencia, duración del


RESUMEN estímulo etc. Lo cual ha permitido la utilización práctica de
En la actualidad el uso del MATLAB se ha generalizado estos conocimientos, como es el caso de la rehabilitación
para la adquisición y procesamiento de bioseñales, física, o la interpretación de los biopotenciales ya sean
mediante su uso y una tarjeta de sonido se puede generados por el organismo en su funcionamiento normal,
implementar un proyecto y obtener resultados en un corto EEG para el tratamiento de la epilepsia; o provocado por
período de tiempo. De esta manera una señal analógica estímulos externos: Potenciales Evocados Auditivos (PEA),
puede ser digitalizada, permitiéndonos realizar un Potenciales Evocados Visuales (PEV)[1], los cuales
procesamiento y análisis de la señal de acuerdo con las brindan información para la valoración del funcionamiento
necesidades específicas para nuestro experimento. En los de las áreas del cerebro relacionados con los procesos
experimentos para la investigación de la neuroplasticidad auditivos y visuales respectivamente e incluso para un
en nuestro centro se usa un equipo cuya frecuencia de correcto posicionamiento de los electrodos al realizar el
muestreo(fs) máxima es de aproximadamente 20 kHz, el abordaje del cerebro en operaciones de Parkinson.
incremento de fs está vinculado a la adquisición de
equipamiento más moderno, con todas las dificultades 2. METODOLOGÍA
propias de este tipo operación comercial para nuestro país;
por lo que como vía alternativa se propone desarrollar lo En las investigaciones sobre la neuroplasticidad, al
que es tema de este artículo, dirigido a satisfacer esta obtener los potenciales evocados se observan dos
necesidad del proyecto de investigación sobre la componentes. Una primera deflexión negativa corresponde
neuroplasticidad, no solo con el objetivo de resolver un al potencial postsináptico excitatorio poblacional de las
problema de equipamiento sino de dotar a los neuronas granulares del giro dentado Fig. 1, el cual es
investigadores de una herramienta de análisis matemático
con la cual puedan desarrollar e implementar algoritmos
personalizados.

Palabras clave: MATLABl ,tarjeta de sonido,


biopotencial, neuroplasticidad ,espiga .

1. INTRODUCCIÓN
El análisis de las bioseñales es de gran importancia para
las ciencias de la vida, ellas son usadas de forma rutinaria Fig. 1 Potencial evocado en giro dentado al estimular la vía perforante. Es
en la práctica clínica, mediante el uso de la tecnología un potencial bifásico, cuyo primer componente es producido por la
adecuada. Ejemplo de esto lo constituyen: los generación de potenciales postsinápticos excitatorios sumados (S, se mide
electrocardiogramas (ECG), los electroencefalogramas su pendiente). El segundo componente es producido por la descarga
poblacional de potenciales de acción (P, se mide su amplitud). A. artefacto
(EEG), los electromiogramas (EMG) y otros[1]. de estímulo.
Los biopotenciales son el resultado de la actividad
electroquímica de cierta clase de células, conocidas como
células excitables. Teniendo en cuenta lo antes expuesto, interrumpido abruptamente por un segundo componente
para los investigadores, las características técnicas del positivo en forma de espiga. La espiga es producida por la
equipamiento utilizado es de gran importancia para poder descarga poblacional de potenciales de acción. La duración
determinar los parámetros, en un segmento determinado de del potencial postsináptico excitatorio poblacional es
la señal. Se ha estudiado el comportamiento de estas células superior al de la generación de potenciales de acción, por lo
a los estímulos eléctricos, de diferentes características; que tal fenómeno se continúa después de haber cesado la

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descarga de potenciales de acción. Los estudios clásicos En todos los estudios electrofisiológicos la variable
que establecieron el modelo, mostraron que la espiga medida fue la amplitud de la espiga poblacional, la cual se
poblacional es producida por la descarga de potenciales de expresó en porcentaje respecto a los valores basales
acción en la población de neuronas estudiados (potencial de (%PSA). El objetivo de esta transformación es destacar el
acción multitunidarios) [1]. En general las variables cambio operado en la variable de estudio luego de las
estudiadas en los trabajos de plasticidad sináptica son, la manipulaciones experimentales a que fueron sometidos los
pendiente del potencial postsináptico excitatorio y la animales. El cambio porcentual con relación a los valores
amplitud de la espiga poblacional (PSA). basales se consideró como un indicador de las
Registros basales modificaciones operadas en la eficacia de la transmisión
Cada registro basal es el promedio de cinco respuestas sináptica de esa población como resultado de las
consecutivas, las cuales se inducen con pulsos aislados manipulaciones a que son sometidas.
cuadrados de corriente de una duración de 0.1ms. La Las señales bioeléctricas obtenidas fueron amplificadas
frecuencia de estímulos es de 0.1 Hz. La intensidad se y filtradas (1Hz-3000Hz) utilizando las gavetas
determinó por la curva estímulo/respuesta. Se realizaron amplificadoras (AB-621G) de un polígrafo Nihon Kohden
hasta 12 registros con intervalo de cinco minutos en cada (Japón), digitalizadas (frecuencia de muestreo de 10 000
animal. La amplitud de la espiga poblacional P de los Hz) por medio de un convertidor analógico-digital CED
registros basales fue promediada y todos los valores fueron 1401plus (Cambridge Scientific Instruments, Gran Bretaña)
expresaron como valores porcentuales respecto a este valor y transferidas a una computadora personal donde fueron
promedio (%PSA). visualizadas, promediadas y medidas con ayuda del
Estímulos de alta frecuencia de repetición (EAFR) programa IntraCell for Windows (no registrado
Cinco minutos después del último registro basal, se comercialmente; Instituto Leibniz de Neurobiología,
aplicó un EAFR, para inducir una potenciación duradera Alemania). La estimulación de la vía perforante fue
(Fig. 9). La E-LTP se indujo aplicando 3 trenes de 15 controlada con el mismo programa a través de un
pulsos a 200 Hz, con un intervalo entre trenes de 10 seg. La estimulador de pulsos con sistema de aislamiento (AM-
intensidad es la misma de los registros basales, determinada Systems mod. 2100, USA). La configuración se refleja en
por la curva estímulo/respuesta. La duración de los pulsos la Fig.3
aislados cuadrados de corriente fue de 0.1ms. Los estímulos
aplicados en la porción basolateral de la amígdala fueron
similares. Este estímulo eléctrico inductor puede ser
considerado relativamente débil y es capaz de inducir una
E-LTP (< 4 h)(Frey et al., 2001), lo cual permite estudiar el
efecto reforzador de diferentes manipulaciones.

Fig. 2Potenciales evocados en giro dentado antes (línea continua) y 5


minutos después (discontinua) del EAFR de la vía perforante. Nótese Fig. 3 Equipamiento usado hasta el momento para realizar los
como se modifica el potencial después del EAFR, en especial la amplitud experimentos (no se ha mostrado el equipamiento relacionado a la
de la espiga poblacional.. estimulación)

Registros de prueba Vale la pena resaltar que los estudios electrofisiológicos


Tienen las características de los registros basales. El se hicieron en animales despiertos, con libre movimiento,
primer registro se realizó siempre después de transcurridos de modo que se elimina el efecto de los anestésicos y se
cinco minutos después de la inducción de la E-LTP. A trabaja en condiciones fisiológicas.
partir de los 30 minutos de la inducción del fenómeno Análisis estadístico
plástico, se hicieron registros cada 15 minutos hasta las 6 Se comprobó que los datos seguían una distribución
horas de inducida la LTP. normal mediante la prueba
En una serie de animales no se indujo la E-LTP, sino
que solamente se aplicaron estímulos simples para estudiar
la transmisión sináptica en condiciones basales durante 6
horas. Este es un grupo control de la transmisión sináptica
basal.
Variables estudiadas

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3. IMPLEMENTACION A continuación se ilustra un archivo M para realizar la
captura y representación gráfica de los biopotenciales desde
En la Fig. 4 se observa que la mayor parte de los la ventana de comandos :
dispositivos y equipamiento se mantienen, por lo cual la
inversión se centra fundamentalmente en una PC con las >>clc
prestaciones comunes en el mercado. >>N=input('Teclee el número de muestras: ')
>>Fs=input('Teclee la frecuencia: ')
>>x=wavrecord (N,Fs,1,16)
>>WAVEFILE=input('Teclee el nombre del archivo:
','s')
>>WAVWRITE(x,WAVEFILE)
>>plot(x)

El fragmento anterior
Estos comandos variaran de acuerdo a las intenciones
del programador, además MATLAB nos ofrece la
posibilidad de crear un Interfase Gráfico de Usuario, el cual
es muy importante para todo tipo de usuarios
independientemente de sus habilidades ya que nos permite
darle el acabado final al programa Fig .5 y Fig.6.
En esta ventana podemos introducir datos como: la
frecuencia de muestreo, número de muestras, el gráfico
resultante de la adquisición e incluso los datos del análisis
de los datos obtenidos.
Fig. 4 Equipamiento propuesto para realizar los experimentos (no se ha
mostrado el equipamiento relacionado a la estimulación)

El uso de la tarjeta de audio convencional de una PC,


nos brinda las ventajas de la casi inmediata
implementación, al poder usar una PC existente cuya tarjeta
de audio puede muestrear a una frecuencia fs=44500 Hz , la
cual es mucho mayor que los 20000 Hz del CED 1401plus
en nuestro poder, con una mayor flexibilidad a la hora de
manejar el número de muestra que también está limitado en
el CED 1401plus, de esta forma tendremos una señal con
mayor cantidad de muestras que nos permitirá de forma Fig. 5 Ejemplo de ventana para el análisis de un biopotencial cargado a
través de la ventana de dialogo del Menú “Cargar”
casuística comprobar la suficiencia o no del número de
muestras a la hora del cálculo de la pendiente de S en la
Fig.1, además abre la posibilidad de introducir parámetros El siguiente algoritmo a modo de ejemplo, ilustra el
de análisis no implementados que corroboren la caso del análisis de una señal real:
proporcionalidad de S con otras partes de este
biopotencial.Lo anteriormente expuesto además de la clc
adquisición de los biopotenciales será realizado con el [filename, pathname] = uigetfile('*.xls', 'Pick an xls file')
programa matemático Matlab el cual nos provee de las excelDates=xlsread(filename)
herramientas: matemáticas, de programación de matlabDates=excelDates
procedimientos y de interfase gráfica, necesarias para de excelDates1=xlsread(filename,'Hoja2')
forma rápida y con un mínimo de conocimientos poder matlabDates1=excelDates1
implementar soluciones alternativas, o potenciar una a=matlabDates(61:106)
actividad mediante el uso de equipos existentes. b=matlabDates1(61:106)
El trabajo con MATLAB se comenzó con la elaboración plot(a,b)
de una Interfase Gráfica de Usuario, con la cual se puede [Y,I] = max(b)
realizar tanto la adquisición de nuevos potenciales como el bporc=0.1*b(I) % 10/90
análisis de lo ya existentes. bmaxmax=b(I)-bporc
Para la adquisición de los biopotenciales usando la n=b(1:I)-bmaxmax
tarjeta de audio de una PC convencional se puede usar tanto [W,J] = min(abs(n))
el procedimiento que se explica en Launch Pad m=b(1:I)-bporc
DataAdquisition Toolbox Tutorials (daqschool) o el [Z,K] = min(abs(m))
comando wavrecord. pendabs=a(J-1)-a(K+1)
pendabschar=num2str(pendabs,3)

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angabs=((asin((Y/(sqrt(Y^2+(pendabs)^2))))*180)/pi)
angabschar=num2str(angabs,3) REFERENCIAS
H=findobj(gcbf,'Tag','text22') [1] Clark J. W. (1978). Medical Instrumentation, Application and
Design. Edited by J.W.Webster, Boston: Houghton Mifflin
set(H,'String',angabschar)
814:150-286.
H=findobj(gcbf,'Tag','text2') [2] Andersen P, Bliss TV, Skrede KK (1971) Unit Analysis of
set(H,'String',pendabschar) hyppocampal polulation spikes. Exp Brain Res 13 208-221
[3] http://www.mathworks.com

Fig.6 Ejemplo de la misma ventana durante la adquisición de una señal con


los parámetros indicados en la misma.

A continuación se ilustra con el siguiente algoritmo a


modo de ejemplo el caso de la adquisición de una señal
desde una ventana gráfica diseñada con la herramienta
guide de MATLAB:

H=findobj(gcbf,'Tag','edit10')
Nstr=get(H,'String')
N=str2double(Nstr)
H1=findobj(gcbf,'Tag','edit13')
fsstr=get(H1,'String')
fs=str2double(fsstr)
x=wavrecord (N,fs,1,16)
plot(x)
grid on
title(fsstr)
d=datestr(now)
WAVWRITE(x,d)

4. CONCLUSIONES

Al realizar la adquisición y análisis de los


biopotenciales se ha demostrado que esta tendencia es una
solución viable tanto desde el punto de vista económico, al
usar un hardware estandarizado de uso común, trasladando
el know-how al desarrollo de aplicaciones informáticas esto
se puede ver en los códigos que sirven de ejemplo donde
para simplificar se tomaron atajos al momento de realizar
el análisis, en aras de ganar claridad, para una serie
específica de datos.
La inclusión de las herramientas estadísticas para
realizar el cálculo basal (curvas promedios), así como la
lectura de la totalidad de la señal sin intervención del
usuario, la opción de leer los datos en varios formatos y
disparar la estimulación desde la aplicación son los pasos
futuros para un mejor aprovechamiento de esta
herramienta.

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