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Taller de Bioquímica

1. ¿Qué es y qué estudia la bioenergética? ¿por qué se basa en las leyes de la


termodinámica? ¿qué relación tiene con la ley de Lavoisier? Analiza y explica.

La bioenergética, o termodinámica bioquímica, es el estudio de los cambios de


energía que acompañan a reacciones bioquímicas. Los sistemas biológicos son en
esencia isotérmicos y usan energía química para impulsar procesos vivos. La
bioenergética nos ayuda a entender las complejidades del metabolismo; un objetivo
y logro de la bioenergética es predecir si puede ocurrir un proceso bioquímico.
Algunos intercambios de energía que se presentan en el metabolismo son:

 Las células necesitan de energía para poder realizar sus actividades metabólicas,
de crecimiento, renovación de su estructura, síntesis de moléculas, etc.

 La energía química que utiliza una célula animal para realiza trabajo proviene
principalmente de la oxidación de sustancias incorporadas como alimentos
(carbohidratos, lípidos).

 Al producirse una transformación química, generalmente se rompen y/o se generan


enlaces con un cambio de energía de las moléculas.

 El ATP que proporciona energía para innumerables reacciones de transferencia de


grupos en el anabolismo y catabolismo.

Pese a las transformaciones de energía que tienen lugar en la naturaleza,


específicamente en la célula, estas siguen las leyes de la termodinámica:

1. La energía total de un sistema, incluso sus alrededores, permanece constante, lo


cual implica que dentro del sistema total, la energía no se pierde ni se gana
durante cambio alguno; sin embargo, sí se puede transferir de una porción del
sistema a otra, o transformarse en otra forma de energía. En sistemas vivos, la
energía química se transforma hacia calor o hacia energías eléctrica, radiante o
mecánica.

2. Para que un proceso ocurra de manera espontánea, es necesario que la entropía


total de un sistema aumente. La entropía es la extensión de trastorno o de
aleatoriedad del sistema y alcanza su punto máximo conforme alcanza el
equilibrio.
3. En condiciones de temperatura y presión constantes, el vínculo entre el cambio
de energía libre (ΔG) de un sistema que está reaccionando y el cambio de entropía
(ΔS) se expresa por medio de la ecuación que sigue, que combina las dos leyes de
la termodinámica: ΔG = ΔH - TΔS donde ΔH es el cambio de la entalpía (calor) y T
es la temperatura absoluta. En reacciones bioquímicas, dado que ΔH es
aproximadamente igual a ΔE, el cambio total de energía interna de la reacción, la
relación anterior puede expresarse como sigue: ΔG = ΔE – TΔS.
(Robert K. Murray, 2010)
(Robert Roskoski, 1998)
(Beltrán, 2015)
2. ¿De dónde proviene la energía que necesitan las células para crecer?¿Es la apófisis
una forma de obtención de energía celular? .Explica y analiza.

La energía adquirida por las células se conserva en ellas para ser utilizada
principalmente cuando se requiera en forma de adenosín trifosfato (ATP). Tanto si
proviene de la luz solar o de la oxidación de compuestos orgánicos, se invierte en la
formación de ATP, en una proporción muy alta. El ATP es entonces el "fluido
energético" que pondrá en marcha las demás funciones de la célula.
Todos los seres vivos necesitan un aporte continuo de materia y energía, aunque
existen grandes diferencias en la forma de obtenerlas y de su utilización. Los
vegetales son seres autótrofos, utilizan la energía solar como fuente de energía y
como materia usan el agua, el dióxido de carbono (CO2) y los iones orgánicos. En la
fotosíntesis los cloroplastos captan la energía solar y tienen la maquinaria para
convertirla en energía química (ATP); además extraen los iones de hidrógeno del
agua para convertirlos en equivalentes de reducción (NADPH + H). Como producto
de esta reacción se libera oxígeno molecular.
Con el ATP, los NAPDH + H y el CO2 en un proceso cíclico forman la glucosa y a partir
de esta, con fuentes inorgánicas de nitrógeno, los vegetales tiene la capacidad de
sintetizar todas las biomoléculas orgánicas (azúcares, lípidos, proteínas y ácidos
nucleicos).
El hombre y los animales, seres heterótrofos utilizan como fuente de energía y
materia las biomoléculas sintetizadas por los vegetales, ingeridas en los alimentos
directamente. Las biomoléculas ingeridas por el hombre se degradan
metabólicamente hasta convertirse en CO2 y H2O, y derivados nitrogenados, que
liberan energía química (ATP). Esta energía se utiliza para la realización de trabajo y
la síntesis proteica.
La materia sufre una serie de transformaciones cíclicas, pues pasa de los vegetales
al hombre y de estos a través del suelo y la atmósfera de nuevo a los primeros. El
flujo de energía solar es unidireccional: se inicia como energía solar y se degrada
como energía térmica (calor) pero sin destruirse1.
El conjunto de intercambios y transformaciones de materia y energía que tiene lugar
en el ser vivo recibe el nombre de metabolismo. La oxidación de las moléculas
complejas, con eliminación de productos de desecho y liberación de energía, se
llama catabolismo; y la biosíntesis de sustancia propia a partir de moléculas
sencillas, con gasto de energía, se denomina anabolismo.
Los alimentos ingeridos en la dieta son macromoléculas de almidón, proteínas y
triglicéridos que en la digestión se hidrolizan a monómeros, como monosacáridos,
aminoácidos, ácidos grasos y glicerol. Estos monómeros en las células se absorben
y se incorporan o entran para ser oxidados con producción de energía o se derivan
a la biosíntesis de nuevo material celular con consumo de energía.

La apoptosis es una forma ordenada y programada de la muerte de las células, ayuda


a mantener el constante número de células, defensa ante agentes patógenos y el
desarrollo de órganos y sistemas, para mantener la homeostasis celular la célula
programada destruye los organelos en pequeños pedazos donde actuaran celulas
blanco como las del sistema inmunológico para degradar estos restos por el proceso
conocido como fagocitosis
Existen dos tipos de vías para la apoptosis: intrínseca y extrínseca
Por lo tanto no se puede considerar la apoptosis como un tipo de obtención de
energía de la célula ya que al haberse consultado todo sobre este no se da una
obtención si no un gasto de energía al realizar el proceso de degradación de las
partículas solidas que restan de la celula destruida conocido como fagocitosis.

(Ordoñez, 2002)

3. ¿Qué es ΔG y cuáles son las moléculas portadoras o donadoras de energía en el


metabolismo? (Dibujalas)

En termodinámica, la energía de Gibbs (antiguamente denominada "energía libre de


Gibbs", "energía libre" o "entalpía libre") es un potencial termodinámico, es decir,
una función de estado extensiva con unidades de energía, que da la condición de
equilibrio y de espontaneidad para una reacción química (a presión y temperatura
constantes).Se simboliza con la letra G mayúscula. Los cambios de entalpía (ΔH)
como entropía (ΔS) combinados determinan cuán favorable es una reacción. Por
ejemplo, quemar un pedazo de madera libera energía (exotérmico, favorable) y
resulta en una sustancia con menos estructura (se liberan gases de CO2 y H2O los
cuales resultan menos 'ordenados' que la madera sólida). De esta manera se puede
predecir que si un pedazo de madera fue encendido, continuará quemádose hasta
en final. El hecho que esto ocurra así se adjudica al en su Energía libre de Gibbs El
grado en que una reacción es favorable fue descrito por el destacado químico Josiah
Willard Gibbs, quien definió la energía libre de una reacción como ΔG = ΔH - T ΔS
donde T es la temperatura en la escala de Kelvin. Dicha fórmula asume que la
presión y la temperatura se mantienen constantes durante la reacción, lo cual
ocurre casi siempre en las reacciones bioquímicas Las unidades de ΔG (por Gibbs)
son los "joules" en sistema SI. A menudo se utilizan las "calorías" debido a la relación
que tienen con las propiedades del agua.

Las moleculas portadoras y donadoras de energia son:

1) Como una de las principales fuentes de energia de las celulas se encuentra el atp
el cual es una moleculas donadora

2) La molecula NAD (nicotín adenín dinucleótido) participa en las transformacion de


la energia en los seres vivos haciendo el proceso de oxidoreduccion y
transformandose en NADH la cual es una fuente fundamental de energia.
4. ¿Qué diferencia hay entre procesos endotérmicos y endergónicos y procesos
exotérmicos y exergónicos? Analiza y explica.

Se le denomina proceso o reacción exotérmica a cualquier reacción química que


desprenda energía en forma de calor, esta se libera al momento de convertir
reactivos en productos, se conoce como variación negativa de la entalpía es decir
ΔH< 0.
Un ejemplo de estos procesos es la combustión.
En condiciones de temperatura y presión constantes, el vínculo entre el cambio de
energía libre (ΔG) de un sistema que está reaccionando y el cambio de entropía (ΔS)
se expresa por medio de la ecuación que sigue, que combina las dos leyes de la
termodinámica:
G=H T S
Donde H es el cambio de la entalpía (calor) y T es la temperatura absoluta.
En reacciones bioquímicas, dado que H es aproximadamente igual a E, el cambio
total de la energía interna de la reacción, la relación anterior puede expresarse como
sigue:
G= E –T S

Si G es negativa, la reacción procede de modo espontáneo con pérdida de la energía


libre; esto es lo que se conoce como exergónica, estas reacciones exergónicas
reciben el nombre de catabolismo (en general, la desintegración u oxidación de
moléculas de combustible) a diferencia de los procesos endotérmicos estos liberan
energía pero no solo en forma de calor sino también en forma de trabajo. Si además
G es de gran magnitud, la reacción avanza casi hasta completarse y es, en esencia,
irreversible.
Se le denomina proceso o reacción endotérmica a cualquier reacción química que
gane o reciba energía en forma de calor, esta reacción es la que tiene una variación
en la entalpía ΔH> 0 es decir que los productos tienen mayor energía que los
reactivos contrariamente a la reacción exotérmica que los reactivos tienen mayor
energía que los productos.

Utilizando la ecuación anterior: G=H T S


Donde H es el cambio de la entalpía (calor) y T es la temperatura absoluta.
En reacciones bioquímicas, dado que H es aproximadamente igual a E, el cambio
total de la energía interna de la reacción, la relación anterior puede expresarse como
sigue:
G= E –T S

Si G es positiva la reacción solo procede si es factible ganar energía libre; de modo


que es lo que se conoce como reacción endergónica. Si además G es de gran
magnitud, el sistema es estable, con poca o ninguna tendencia a que ocurra una
reacción. Si G es cero, el sistema se encuentra en equilibrio y no tiene lugar un
cambio neto.

Los términos exergónicos y endergónicos, en lugar de los términos exotérmicos y


endotérmicos indican que un proceso esta acompañado de una perdida o ganancia
respectivamente, de energía libre no siempre en forma de calor. En la practica un
proceso endergónico no puede existir de manera independiente si no que debe ser
un componente de un sistema exergónico-endergónico acoplado donde el cambio
neto general es exergónico. Las reacciones exergónicas reciben el nombre de
catabolismo y las reacciones endergonicas reciben el nombre de anabolismo
(biosíntesis) que combinados forman el llamado metabolismo. Un ejemplo de este
acoplamiento exergónico-endergónico es la contracción muscular, las reacciones
sintéticas, conducción de impulsos nerviosos, transporte activo.
(Robert K. Murray, 2010)

5. ¿Qué información nos proporciona los valores de ΔG en una reacción química?


Analiza y explica cada gráfica.
SON VARIAS RESPUESTAS QUE ENCONTRE, LA QUE MEJOR SE ENTIENDA Y SE FORMULE ES
LA QUE ESCRIBIRAS
1)
2) Si ΔG < 0 entonces los reactivos deberían, eventualmente, convertirse en los
productos (lo que significa una reacción en sentido directo). (La energía libre de
Gibbs no dice nada acerca de la tasa de la reacción, menciona solamente la
probabilidad de que dicha reacción ocurra) De manera análoga si ΔG > 0 entonces
se entiende que la reacción reversa resulta favorecida. El estado donde ΔG = 0 se
denomina equilibrio y es el estado donde las reacciones directa y reversa ocurre a
la misma tasa y, por tanto, no modifican el resultado neto de la reacción. El valor de
ΔG varía de acuerdo con la concentración de los reactivos y los productos. Cuando
el ΔG alcanza 0 la reacción no produce ningún resultado neto en el sistema; este
estado es el llamado punto de equilibrio químico. Un ΔG pequeño (quiere decir un
valor de ΔG cercano a 0) indica que una reacción es de alguna forma reversible; la
reacción puede realmente funcionar en sentido inverso, convirtiendo los productos
nuevamente en reactivos. Un ΔG muy grande (ΔG >> 0 o ΔG << 0) significa
precisamente lo contrario, indicando que la reacción dada es irreversible, es decir,
una vez que los reactivos se convirtieron en productos solo unas pocas moléculas se
reconvierten en reactivos de nuevo.

6. ¿Qué son reacciones enérgicamente acopladas? Explica.

Las reacciones acopladas son aquellas donde la energía libre de una reacción
(exergónica) es utilizada para conducir/dirigir una segunda reacción (endergónica).
Por lo tanto, las reacciones acopladas representan reacciones liberadoras de energía
acopladas a reacciones que requieren energía.
En la célula, la energía liberada o que se hace disponible en una reacción exergónica
(que libera energía), es utilizada para mover otras reacciones endergónicas (que
consumen energía), en otras palabras, la energía es utilizada para realizar trabajo.
(Cruz, 2001)
En otras palabras, en la mayoría de los casos, las células utilizan una estrategia
denominada acoplamiento de reacciones, en la que una reacción energéticamente
favorable (como la hidrólisis de ATP) se vincula directamente con una reacción
energéticamente desfavorable (endergónica). La vinculación suele ocurrir mediante
un compuesto intermedio compartido, lo que significa que el producto de una
reacción es "tomado" y utilizado como reactivo en la segunda reacción.

Cuando dos reacciones se acoplan, estas pueden sumarse para dar una reacción ge
neral y la ΔG de esta reacción será la suma de los valores de ΔG de las reacciones
individuales. Mientras el ΔG global sea negativo, ambas reacciones pueden ocurrir.
Incluso puede ocurrir una reacción muy endergónica si se acopla a una muy
exergónica (como la hidrólisis de ATP). Por ejemplo, podemos sumar un par de
reacciones genéricas acopladas por un intermedio común, B, de la siguiente manera:

De esta forma, el intermediario B, no aparece en la reacción acoplada general. Esto


se debe a que aparece como producto y como reactivo, así que los dos Bs se
cancelan entre sí al sumar las reacciones.
(Khan Academy, 2016)
7. Explica el proceso de hidrólisis del ATP y su relación con el ΔG liberado.

La energía liberada por la hidrólisis (degradación) del ATP se utiliza para impulsar
muchas reacciones celulares que requieren energía. Estructuralmente , el ATP es un
nucleótido de ARN que lleva una cadena de tres fosfatos. En el centro de la molécula
se encuentra un azúcar de cinco carbonos, una ribosa, que se une a la base
nitrogenada adenina y a la cadena de tres fosfatos.

Los enlaces entre los grupos fosfato se llaman enlaces fosfoanhídridos y puedes
encontrar que se conocen como enlaces de "alta energía"; es decir, que libera una
cantidad apreciable de energía cuando uno de estos enlaces se rompe en una
reacción de hidrólisis (ruptura mediada por agua). El ATP se hidroliza a ADP en la
siguiente reacción:

Como la mayoría de las reacciones químicas, la hidrólisis de ATP en ADP es


reversible. La reacción inversa, que regenera ATP a partir de ADP y Pi, requiere
energía. La regeneración de ATP es importante porque las células tienden a usar
(hidrolizar) las moléculas de ATP muy rápidamente y dependen de que el ATP sea
reemplazado constantemente.
Puedes considerar al ATP y al ADP como una especie de batería recargable, en sus
formas cargada y descargada (como se muestra anteriormente). El ATP, la batería
cargada, tiene energía que puede ser utilizada para alimentar reacciones celulares.
Una vez que la energía ha sido utilizada, la batería descargada (ADP) debe recargarse
antes poder usarla de nuevo como fuente de poder. La reacción de regeneración del
ATP es la reacción inversa de la hidrólisis:

Al liberarse una gran cantidad de energía libre durante la hidrólisis de ATP, pero
¿exactamente de cuánto estamos hablando? La ∆G para la hidrólisis de un mol de
ATP en ADP y Pi −7.3 kcal/mol (−30.5 kJ/mol) en condiciones estándar
(concentración 1M). No está mal, pero las cosas se ponen más impresionantes bajo
condiciones no estándar: ∆G para la hidrólisis de un mol de ATP en una célula viva
es casi el doble del valor observado en condiciones normales, cerca de −14kcal/mol
(−57 kJ/mol).

(Khan Academy, 2016)

Bibliografía
Beltrán, E. D. (15 de Diciembre de 2015). Principios de la termodinámica. Obtenido de Principios
de la termodinámica:
fcm.ens.uabc.mx/~edurazo/Docencia/Licenciatura/bioquimica/Unidad%203.1
Cruz, M. C. (1 de Febrero de 2001). Reacciones acopladas . Obtenido de Reacciones acopladas :
https://sites.google.com/site/bq2014iruizcruzmariaconcepcion/ii-bioenergetica/2-4-
reacciones-acopladas

Khan Academy. (26 de Agosto de 2016). El ATP y las reacciones acopladas. Obtenido de El ATP y las
reacciones acopladas: https://es.khanacademy.org/science/biology/energy-and-
enzymes/atp-reaction-coupling/a/atp-and-reaction-coupling

Ordoñez, C. A. (1 de Febrero de 2002). Cómo producen energía las células. Obtenido de Cómo
producen energía las células:
http://colombiamedica.univalle.edu.co/index.php/comedica/article/view/1787/2825

Robert K. Murray, D. A. (2010). Harper Bioquímica. México, D.F.: McGraw Hill Interamericana.

Robert Roskoski, J. (1998). Bioquímica. México, D.F.: McGraw- Hill Interamericana .