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Por favor: todos las observaciones por parte del tutor, deben ajustadas en
el trabajo final. Al momento dela entrega, por favor borrar los comentarios
del tutor.
Grupo del curso
201103_48
Presentado a
GOLDA MEYER TORRES VARGAS
FECHA
6 de noviembre de 2018
FORMATO PARA LA ENTREGA DE APORTES INDIVIDUALES Y
CONSOLIDADCIÓN DEL TRABAJO FINAL
Fase 4 - Actividad colaborativa ABP de Ácidos nucleicos
Aportes Individuales
Señor estudiante: no modifique el formato, no le suprima ni anexe tablas o
filas. Solamente adjunta la información solicitada.
Cada molécula de ADN está constituida por dos cadenas o bandas formadas por un
elevado número de compuestos químicos llamados nucleótidos. Estas cadenas
forman una especie de escalera retorcida que se llama doble hélice.
nucleótido está formado por tres unidades: una molécula de azúcar llamada
desoxirribosa, un grupo fosfato y uno de cuatro posibles compuestos nitrogenados
llamados bases: Adenina (A), Guanina (G), Timina (T) y Citosina (C).
Los nucleótidos de cada una de las dos cadenas que forman el ADN establecen una
asociación específica con los correspondientes de la otra cadena. Debido a la
afinidad química entre las bases, los nucleótidos que contienen adenina se acoplan
siempre con los que contienen timina, y los que contienen citosina con los que
contienen guanina. Las bases complementarias se unen entre sí por enlaces
químicos débiles llamados enlaces de hidrógeno.
entre.org/purinas-y-pirimidinas/
a.wordpress.com/tag/enlace-n-glucosidico/
Las bases nitrogenadas que forman parte de los ácidos nucleicos son de dos tipos,
púricas y pirimidínicas. Las bases púricas derivadas de la purina (fusión de un anillo
pirimidínico y uno de imidazol) son la Adenina (6-aminopurina) y la Guanina (2-
amino-6-hidroxipurina). Las bases pirimidínicas (derivadas de la pirimidina) son la
Timina (2,6-dihidroxi-5-metilpirimidina o también llamada 5-metiluracilo), Citosina
(2-hidroxi-6-aminopirimidina) y Uracilo (2,6-dihidroxipirimidina). Las bases
nitrogenadas que forman normalmente parte del ADN son: Adenina (A), Guanina
(G), Citosina y Timina (T). Las bases nitrogenadas que forman parte de el ARN son:
Adenina (A), Guanina (G), Citosina (C) y Uracilo (U). Por tanto, la Timina es
específica del ADN y el Uracilo es específico del ARN.
De esta manera en el ADN las BN se organizan uniéndose las Purinas con las
Pirimidinas formando una secuencia de 4 letras (AT-CG) que se repiten a lo largo
de la molécula de ADN. En el ARN la complementariedad de las BN obedece a las
que se cumplen en el ADN, con la diferencia que en el ARN no hay Timina sino
Uracilo(U), por ende, la complementariedad en el ARN es A-U; CG.
Estructura.
El "esqueleto" de adenina, hipoxantina, xantina, etc. es la purina, por lo que
toman el nombre de bases púricas o bases purínicas.
El "esqueleto" de citosina, uracilo y timina es la pirimidina; son bases
pirimídicas.
Purinas
Adenina Adenosina
A
Guanina Guanosina
G
Obtenido de: http://www.wikiwand.com/es/Base_nitrogenada
Pirimidinas
Base nitrogenada Nucleósido
Timina Timidina
T
Citosina Citidina
C
Uracilo Uridina
U
wand.com/es/Base_nitrogenada
Todos los organismos vivientes, desde la más minúscula bacteria hasta las plantas
y el humano están construidas por microscópicas células (en el caso de la bacteria,
el organismo entero es una única célula). En el núcleo mismo de estas células está
el ADN o Acido Desoxirribonucleico; el plano molecular de casi todo aspecto de la
existencia. Las mutaciones son cambios que ocurren en la secuencia de nucleótidos
del ADN. “Estos pueden ocurrir espontáneamente cuando el ADN está siendo
replicado durante la división celular, aunque también pueden ser inducidas por
factores ambientales, como químicos o radiación ionizante.
Obtenido de:
https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid
Tipos de Mutaciones
En este tipo de mutación hay un cambio en una de las bases del DNA de forma que
el triplete de nucleótidos se modifica, pero sigue codificando para el mismo
aminoácido. Esto es así porque el código genético tiene cierto margen de seguridad
y para cada aminoácido hay varias combinaciones de tripletes que lo determinan.
2. Polimosfirmos
En este tipo de mutaciones hay un cambio de una de las bases de ADN, de tal
manera que el triplete de nucleótidos que es una parte se cambia, pero incluso si
se necesita un cambio de aminoácido, el aminoácido que entra en el lugar en
cuestión resulta tener poco o ningún impacto en la función de la proteína.
3. Missense mutation
En este tipo de mutación hay un cambio en una de las bases del DNA de forma que
el triplete codifica para un aminoácido diferente del que debería, es decir, en esa
posición de la proteína habrá un aminoácido incorrecto, lo que puede alterar más o
menos la función de la proteína dependiendo de su localización e importancia.
4. Nonsense mutation
En este tipo de mutación hay un cambio en una de las bases del DNA de forma que
el nuevo triplete que se forma determina la señal de fin de la cadena de
aminoácidos. Esto es, se trunca la proteína, no se continúa formando a partir de ahí.
Según dónde quede truncada la proteína será capaz de preservar algo de función
o no.
5. Deleción
En este tipo de mutación se pierden una o más bases, es decir, se pierde un trozo
de DNA alterando la cadena proteica que debería formarse y su función. De esta
forma se puede alterar el marco de lectura (ver punto 8) para formar la proteína o
eliminar aminoácidos que son propios de la cadena proteica. En ocasiones las
deleciones son tan largas que pueden comprometer un gen entero o varios genes
contiguos.
6. Duplicación
En este tipo de mutación hay un fragmento de DNA que está copiado una o varias
veces, lo que altera la formación de la cadena de aminoácidos y la función de la
proteína. De esta forma se puede alterar el marco de lectura (ver punto 8) para
formar la proteína o insertar aminoácidos extra que son inadecuados.
Causas
Entre las causas que pueden provocar las mutaciones podemos mencionar las
sustancias químicas y los agentes físicos. Sustancias químicas. El gas mostaza, el
ácido nitroso, la hidroxilamina, el uretano y otras sustancias químicas pueden
provocar mutaciones. Mutaciones inducidas por agentes físicos. Entre los agentes
físicos que provocan mutaciones podemos señalar: la radiación ultravioleta, los
rayos X y los rayos gamma.
Los virus no solo evolucionan, sino que además tienden a evolucionar más rápido
que sus hospederos, como los seres humanos. Eso convierte a la evolución viral en
un tema importante, no solo para los biólogos que estudian los virus, sino también
para médicos, enfermeros y trabajadores de salud pública, así como para cualquiera
que se pudiera exponer a un virus.
La variación en los virus
La selección natural solo se puede dar cuando tiene la materia prima adecuada: la
variación genética. Variación genética significa que hay alguna diferencia
(heredables) en una población. En los virus, la variación proviene de dos fuentes
principales.
Mutaciones virales
Hemos visto cómo la recombinación puede afectar la evolución viral, pero ¿qué hay
de la mutación? Una mutación es un cambio permanente en el material genético
(ADN o ARN) de un virus. Una mutación puede suceder si hay un error durante el
copiado del ADN o ARN de un virus.
Algunos virus tienen una tasa de mutación muy alta, pero esto no es así en todos
los casos. En general, los virus de ARN tienden a tener tasas altas de mutación,
mientras que los virus de ADN tienden a tener tasas bajas de mutación.
Dado que los virus de ARN como el VIH tienen una tasa de mutación alta, habrá
una gran variación genética en la población de virus de VIH en el cuerpo de un
paciente. Muchas de las mutaciones serán dañinas, y los virus mutantes
simplemente "morirán" (no podrán reproducirse). Sin embargo, algunas mutaciones
ayudan a que los virus se reproduzcan bajo condiciones específicas. Por ejemplo,
una mutación podría proporcionar resistencia a un medicamento.
Ciertos fármacos pueden bloquear la replicación del VIH al inhibir enzimas virales
clave. El tomar uno de estos medicamentos inicialmente reducirá los niveles de virus
en un paciente. Después de un tiempo, sin embargo, los virus típicamente "rebotan"
y vuelven a los niveles altos, aunque el medicamento siga presente. Es decir,
emerge una forma del virus que es resistente al medicamento.
Para ver por qué sucedió esto, usemos un ejemplo de un tipo específico de fármaco
antiviral, un inhibidor de la transcriptasa inversa. Los inhibidores de la transcriptasa
inversa, como la molécula de nevirapina que se muestra en el siguiente diagrama,
se unen a una enzima viral llamada transcriptasa inversa (la estructura roja y
marrón). El medicamento impide que la enzima haga su trabajo de copiar el genoma
de ARN del VIH en ADN. Si esta enzima es inactiva, el VIH no puede infectar
permanentemente una célula.
Modelo molecular de barras y
esferas de la enzima transcriptasa
inversa del VIH unida a la nevirapina
molécula transcriptasa inversa.
Imagen modificada de "Exploración
de la estructura," por David S.
Goodsell, RCSB PDB Molecule of
the Month, CC BY 4.0.
Los virus evolucionan más rápido que los seres humanos. ¿Por qué es esto?
Como vimos en el caso del VIH, algunos virus tienen una tasa de mutación alta, que
les ayuda a evolucionar rápidamente al proporcionar más variación como material
de inicio. Otros dos factores que contribuyen a la rápida evolución de los virus son
una población de gran tamaño y un ciclo de vida rápido.
Entre más grande la población, más probable es que tenga un virus con una
mutación al azar en particular (p. ej., una para la resistencia a medicamentos o de
alta infectividad) sobre la que pueda actuar la selección natural. Además, los virus
se reproducen rápidamente, por lo que sus poblaciones evolucionan en plazos de
tiempo más cortos que los de sus hospederos. Por ejemplo, ¡el virus del VIH
atraviesa su ciclo de vida en solo 525252 horas, comparado con los cerca
de 202020 años de un ciclo de vida humano.
¿Qué herramientas tenemos para combatir los virus que evolucionan rápidamente?
El tomar medidas para evitar la transmisión, identificar nuevos medicamentos para
el tratamiento y desarrollar y utilizar vacunas son estrategias importantes.
Cada Estudiante del grupo entregará aportes en relación a:
Identifique cual el a función principal del desoxirribonucleico ADN, ¿Por qué se dice que contiene la información
de los seres vivos? Aclare los siguientes términos. Cromatina, cromosoma, gen y ADN, cual es la diferencia entre
ellos.
Solangel Infante: tutor: la información en verde no se presenta de esta forma, no es correcto, por
favor, esto debe ir sintetizado en 100 palabras dentro de la tabla anterior, pro favor ajustar!!!
Analice:
En términos bioquímicos que implica la mutación del ácido desoxirribonucleico.
Consulte sobre las mutaciones y que estructura afecta en la molécula del ácido desoxirribonucleico ADN.
Las mutaciones pueden ser cambios muy pequeños que solo afectan a unos pocos
nucleótidos o pueden ser muy grandes, creando cambios mayores en la estructura de
los cromosomas.
Rigoberto Vergara
Tanto las mutaciones chicas como las grandes pueden afectar el comportamiento de
las células. Las combinaciones de mutaciones en genes importantes pueden conducir
al desarrollo del cáncer. El material cubierto en estas secciones describen la relación
entre la mutación y el cáncer, los diferentes tipos de mutaciones y lo que las causan
Las implicaciones que tiene la mutación del ácido desoxirribonucleico se relacionan
Kelly Susana Diaz con los cambios en las propiedades de las proteínas de las células, las cuales afectan
de forma radical los rasgos bioquímicos de los genes en los seres vivos
Anyela Gamboa Mercado Las mutaciones son alteraciones de la secuencia de ADN. Si uno piensa en la
información del ADN como una serie de oraciones, las mutaciones son fallos
ortográficos en las palabras que conforman la oración. A veces las mutaciones no
tienen consecuencias, como una palabra con ciertos fallos ortográficos cuyo
significado aun es aún entendible. En otros casos las mutaciones tienen ramificaciones
más fuertes, como una oración cuyo significado ha cambiado por completo.
Las mutaciones son cambios que ocurren en la secuencia de nucleótidos del ADN.
Estos pueden ocurrir espontáneamente cuando el ADN está siendo replicado durante
la división celular, aunque también pueden ser inducidas por factores ambientales,
como químicos o radiación ionizante.
Consolidado grupal No exceda las 250 palabras
Espacio para las
observaciones del tutor
tutor: la información en verde no se presenta de esta forma, no es correcto, por favor, esto debe ir sintetizado en
100 palabras dentro de la tabla anterior, pro favor ajustar!!!
Analice.
Por qué es importante la mutación del ácido desoxirribonucleico ADN en los seres vivos.
De los procesos endógenos describa como pueden influir en las alteraciones bioquímica del ácido desoxirribonucleico
ADN, e igual consulte sobre los factores externos tanto físicos, químicos o de otro tipo.
Kelly Susana Diaz La mutación del ácido desoxirribonucleico es importante porque favorece la diversidad
genética, es decir, ocurre una evolución que favorece al desarrollo de nuevas
características en los genes de los seres vivos.
Anyela Gamboa Mercado Las mutaciones también son el método fundamental por el cual se desarrolló la gran
diversidad de especies que podemos observar ahora mismo a lo largo del tiempo. Se
producen cuando ocurre un cambio en el ADN de un individuo. Cuando el ADN de un
organismo cambia al azar, las mutaciones que se producen pueden ser dañinas, pero
también proporcionarle una ventaja a ese individuo; Por ejemplo: Generan especies
nuevas, les dan una ventaja a las especies sexuales, Permiten la aparición de especies
más complejas, Otorgan ventajas a las especies a la hora de sobrevivir, etc.
tutor: la información en verde no se presenta de esta forma, no es correcto, por favor, esto debe ir sintetizado en
100 palabras dentro de la tabla anterior, pro favor ajustar!!!
Analice. Qué pasa con los virus, ¿qué información tienen y por qué se afirma que son entidades biológicas No vivas,
capaces de alterar el ácido desoxirribonucleico ADN?
Están constituidos por macromoléculas, las cuales se organizan de tal manera que le
confieren sus propiedades biológicas y fisicoquímicas. Estos componentes moleculares
son los siguientes: - Ácido nucleico: DNA o RNA. - Proteínas.- Lípidos.- Hidratos de
Solangel Infante carbono. Estos componentes se organizan constituyendo las partículas virales. El
conjunto de ácido nucleico y proteínas es altamente organizado y recibe el nombre de
núcleo cápsula. Esta estructura se ordena de acuerdo con ciertas simetrías, adoptando
las siguientes formas
EI icosaedro: consiste en un poliedro regular de 20 caras planas triangulares.
Helicoide: la organización corresponde a una estructura en espiral o hélice.
Compleja: en este tipo de nucelocápsula no hay una simetría regular. La estructura de
la nucelocápsula le confiere a las partículas virales diversas propiedades, como
estabilidad termodinámica y capacidad de almacenar un máximo de masa en el menor
volumen.
Los virus tienen fragmentos de ADN, irregulares, que al introducirse al organismo son
Verena Candelaria Fernández
capaces de acoplarse con el ADN de nuestro cuerpo produciendo mutaciones.
Los virus están constituidos por macromoléculas, las cuales se organizan de tal manera
que le confieren sus propiedades biológicas y físico-químicas. Estos componentes
moleculares son los siguientes:- Ácido nucleico: DNA o RNA.- Proteínas.- Lípidos.-
Hidratos de carbono. Estos componentes se organizan constituyendo las partículas
Rigoberto Vergara García virales. El conjunto de ácido nucleico y proteínas es altamente organizado y recibe el
nombre de núcleo cápsula. Esta estructura se ordena de acuerdo a ciertas simetrías,
adoptando las siguientes formas
a) EI icosaedro: consiste en un poliedro regular de 20 caras planas triangulares.
b) Helicoide: la organización corresponde a una estructura en espiral o hélice.
c) Compleja: en este tipo de nucelocápsula no hay una simetría regular.
Kelly Susana Diaz Se puede afirmar que los virus son entidades biológicas no vivas, porque no se nutren
como tampoco se relacionan para tener una copia de sí mismo, por lo cual,
obligatoriamente necesitan de una célula para realizar sus funciones. Como también
pueden alterar las proteínas del ADN.
Anyela Gamboa Mercado Los virus han evolucionado para reproducirse dentro de la célula que infectan, ya que
por sí solos no son capaces de hacerlo porque carecen de la maquinaria molecular
necesaria. su material genético, que porta la información hereditaria, que puede
ser ADN o de ARN, los virus son un medio importante de transferencia horizontal de
genes, la cual incrementa la diversidad genética. los virus no se consideran organismos
(seres vivos) porque no tienen vida; son formas acelulares constituidas por un ácido
nucleico rodeado de una cápsida y no poseen metabolismo propio.
Los virus como van de huésped en huésped llevan consigo ADN que, al introducirlo,
este se puede combinar generando así mutaciones que donde pueden o no beneficiar
al huésped.
Señor estudiante: seleccione uno de los siguientes temas y realice una revisión bibliográfica ( usar normas
APA, para citas como para referencias) y un mapa conceptual en donde se resuman los aspectos más
importantes:
Una enzima es una proteína que actúa como catalizador de una reacción química acelerándola. Las enzimas son
protagonistas fundamentales en los procesos del metabolismo celular. Las enzimas unen su sustrato en el centro reactivo
o catalítico, que suele estar protegido del agua para evitar interacciones no deseadas. En el centro reactivo la disposición
espacial y los tipos de cadenas laterales de aminoácidos son fundamentales para orientar correctamente el sustrato y poder
interaccionar de la forma deseada para llevar a cabo la catálisis de la reacción. Las enzimas son muy selectivas en relación
a los sustratos que modifican. Las enzimas suelen ser mucho más grandes que sus sustratos y en muchas ocasiones
requieren de la participación de otras moléculas más pequeñas no polipeptídicas como las coenzimas (biotina, NADH entre
otros) o los iones metálicos llamados cofactores.
Como todos los catalizadores, las enzimas funcionan disminuyendo la energía de activación (ΔG‡) de una reacción, de
forma que la presencia de la enzima acelera sustancialmente la tasa de reacción. Las enzimas no alteran el balance
energético de las reacciones en que intervienen, ni modifican, por lo tanto, el equilibrio de la reacción, pero consiguen
acelerar el proceso incluso en escalas de millones de veces. Una reacción que se produce bajo el control de una enzima,
o de un catalizador en general, alcanza el equilibrio mucho más deprisa que la correspondiente reacción no catalizada.
Al igual que ocurre con otros catalizadores, las enzimas no son consumidas en las reacciones que catalizan, ni alteran su
equilibrio químico. Sin embargo, las enzimas difieren de otros catalizadores por ser más específicas. La gran diversidad de
enzimas existentes cataliza alrededor de 4000 reacciones bioquímicas distintas.6 No todos los catalizadores bioquímicos
son proteínas, pues algunas moléculas de ARN son capaces de catalizar reacciones (como la subunidad 16S de los
ribosomas en la que reside la actividad peptidil transferasa).78 También cabe nombrar unas moléculas sintéticas
denominadas enzimas artificiales capaces de catalizar reacciones químicas como las enzimas clásicas.9
La actividad de las enzimas puede ser afectada por otras moléculas. Los inhibidores enzimáticos son moléculas que
disminuyen o impiden la actividad de las enzimas, mientras que los activadores son moléculas que incrementan dicha
actividad. Asimismo, gran cantidad de enzimas requieren de cofactores para su actividad. Muchas drogas o fármacos son
moléculas inhibidoras. Igualmente, la actividad es afectada por la temperatura, el pH, la concentración de la propia enzima
y del sustrato, y otros factores fisicoquímicos.
Muchas enzimas son usadas comercialmente, por ejemplo, en la síntesis de antibióticos o de productos domésticos de
limpieza. Además, son ampliamente utilizadas en diversos procesos industriales, como son la fabricación de alimentos,
distinción de vaqueros o producción de biocombustibles.
Clasificación y nomenclatura de enzimas
El nombre de una enzima suele derivarse del sustrato o de la reacción química que cataliza, con la palabra terminada en -
asa. Por ejemplo, lactasa proviene de su sustrato lactosa; alcohol deshidrogenasa proviene de la reacción que cataliza que
consiste en "deshidrogenar" el alcohol; ADN polimerasa proviene también de la reacción que cataliza que consiste en
polimerizar el ADN.
La Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular ha desarrollado una nomenclatura para identificar a las enzimas
basada en los denominados Números EC. De este modo, cada enzima queda registrada por una secuencia de cuatro
números precedidos por las letras "EC". El primer número clasifica a la enzima según su mecanismo de acción. A
continuación, se indican las seis grandes clases de enzimas existentes en la actualidad:
EC1 Oxidorreductasas: catalizan reacciones de oxidorreducción o redox. Precisan la colaboración de las
coenzimas de oxidorreducción (NAD+, NADP+, FAD) que aceptan o ceden los electrones correspondientes. Tras la
acción catalítica, estas coenzimas quedan modificadas en su grado de oxidación, por lo que deben ser recicladas
antes de volver a efectuar una nueva reacción catalítica. Ejemplos: deshidrogenasas, peroxidasas.
EC2 Transferasas: transfieren grupos activos (obtenidos de la ruptura de ciertas moléculas) a otras sustancias
receptoras. Suelen actuar en procesos de interconversión de monosacáridos, aminoácidos, etc. Ejemplos:
transaminasas, quinasas.
EC3 Hidrolasas: catalizan reacciones de hidrólisis con la consiguiente obtención de monómeros a partir de
polímeros. Actúan en la digestión de los alimentos, previamente a otras fases de su degradación. La palabra hidrólisis
se deriva de hidro → 'agua' y lisis → 'disolución'. Ejemplos: glucosidasas, lipasas, esterasas.
EC4 Liasas: catalizan reacciones en las que se eliminan grupos H2O, CO2 y NH3 para formar un doble enlace o
añadirse a un doble enlace. Ejemplos: descarboxilasas, liasas.
EC5 Isomerasas: actúan sobre determinadas moléculas obteniendo o cambiando de ellas sus isómeros funcionales
o de posición, es decir, catalizan la racemización y cambios de posición de un grupo en determinada molécula
obteniendo formas isoméricas. Suelen actuar en procesos de interconversión. Ejemplo: epimerasas (mutasa).
EC6 Ligasas: catalizan la degradación o síntesis de los enlaces denominados "fuertes" mediante el acoplamiento a
moléculas de alto valor energético como el ATP. Ejemplos: sintetasas, carboxilasas.
Cinética enzimática: generalidades y factores
La cinética enzimática es la disciplina que estudia la velocidad en las reacciones químicas en las que intervienen enzimas. El estudio
de esta velocidad y de la dinámica de la enzima, nos permite conocer a fondo el mecanismo de acción de dicha enzima, el rol que
cumple en el metabolismo, y la regulación de su actividad por inhibidores naturales, fármacos, venenos u otro tipo de sustancias.
En la cinética enzimática, las dos propiedades de mayor importancia son: el tiempo que tarda una enzima en llegar a su
punto de saturación y la velocidad máxima que puede alcanzar la reacción catalizada por dicha enzima.
La velocidad de una reacción enzimática puede ser medida en el laboratorio. Como la enzima no se consume en el proceso
de catálisis de la reacción, se suele medir la disminución de la concentración de sustrato en el tiempo, o el aumento de
concentración del producto. Estas concentraciones se pueden medir por espectrofotometría o radiometría.
La velocidad de una reacción catalizada por un enzima depende de
1. la concentración de moléculas de sustrato [S]
2. la temperatura
3. la presencia de ninhibidores
4. pH del medio, que afecta a la conformación (estructura espacial) de la molécula enzimática
Temperatura: las enzimas son sensibles a la temperatura pudiendo verse modificada su actividad por este factor. Los
rangos de temperaturas óptimos pueden llegar a variar sustancialmente de unas enzimas a otras. Normalmente, a medida
que aumente la temperatura, una enzima verá incrementada su actividad hasta el momento en que comience la
desnaturalización de la misma, que dará lugar a una reducción progresiva de dicha actividad.
pH: el rango de pH óptimo también es muy variable entre diferentes enzimas. Si el pH del medio se aleja del óptimo de la
enzima, esta verá modificada su carga eléctrica al aceptar o donar protones, lo que modificará la estructura de los
aminoácidos y por tanto la actividad enzimática.
Concentración salina: al igual que en los casos anteriormente mencionados, la concentración de sales del medio es
crucial para una óptima actividad enzimática. Una elevada concentración o una ausencia de sales en el medio pueden
impedir la actividad enzimática, ya que las enzimas precisan de una adecuada concentración de iones para mantener su
carga y su estructura.
Cinética enzimática: Vmax. Km: significado e interpretación
Recordemos que las reacciones catalizadas por enzimas pueden ser expresadas como:
k1 k2
E + S [ES] (1) [ES] E + P (2)
k-1 k-2
De acuerdo a la ecuación (2) la velocidad inicial (Vo) de una reacción catalizada por enzimas estaría determinada por la desaparición
del ES y, por lo tanto, es proporcional a su concentración:
Sin embargo, k2 y [ES] son difíciles de determinar directamente por lo que Michaelis y Menten derivaron la ecuación (3) en términos de
V
o=k
2[
ES] (
3)
otras variables que pueden ser medidas experimentalmente:
V ma x [ S ]
Vo = ( 4)
K m + [S ]
El efecto de la velocidad al variar la concentración de sustrato [S], mientras se mantiene constante la concentración de enzima [E], se
observa en la siguiente gráfica:
Vo
Vmáx
-K m
1
[S]
En la Figura 1 observamos que a bajas [S], V0 incrementa casi linealmente con el incremento de la [S] (1). A concentraciones mayores
de sustrato, los incrementos de velocidad inicial en respuesta a los incrementos de la concentración de sustrato son cada vez menores
(2). Finalmente alcanzamos un punto donde los aumentos de velocidad son despreciables frente a los incrementos de S. En este
momento decimos que la reacción enzimática tiende a velocidad máxima (3). La curva es una hipérbola rectangular que pasa por el
origen y, cuyas asíntotas son [S] = -Km y Vo = Vmáx.
Las constantes en la ecuación (4) son Vmáx y Km. La Vmáx depende únicamente de la concentración de enzima y Km es independiente
de la concentración de enzima y de la concentración de sustrato.
Km se define (en la deducción de la ecuación 1 y 2) como el cociente entre la suma de las constantes de disociación del complejo [ES]
y las constantes de formación de dicho complejo.
k
-1+k2
K
m= (5
)
k
1
Si consideramos en la ecuación de Michaelis-Menten que Vo es igual a 1/2 Vmáx (ecuación 6), se deduce que Km es numéricamente
igual a la concentración de sustrato necesaria para alcanzar la mitad de la velocidad máxima (ecuación 7) y por eso se expresa en
unidades de sustrato.
V max V m ax [S]
= K m + [S] = 2 [S] K m = 2 [S] - [S] (6)
2 K m + [S]
El conocimiento de Km nos indica la afinidad de la enzima por un determinado sustrato. Cuanto menor es Km mayor es la afinidad
de la enzima por el sustrato. El cálculo de Km se utiliza, por ejemplo, para comparar la afinidad de una misma enzima por sustratos
diferentes o de enzimas diferentes por un mismo sustrato (Figura 2).
(A) (B)
Vo V max Vo V max
S us trato 1 E nz i ma 1
ato 2
S ustr
V máx V máx
2 2 Enzima 1 : Hexoquinasa
a 2 Enzima 2 : Glucoquinasa
E nz im
Enzima: Hexoquinasa Sustrat : glucosa
Sustrato glucosa oK =m10,1 mM
Sustrato
1: K =m210 mM
2: fructosa
Km K m2 [S] Km [S]
1 1
Figura 2: Curvas de sustrato. (A)Una enzima con dos sustratos. (B)Dos enzimas con el mismo
sustrato.
El conocimiento de Vmáx nos da información sobre la cantidad de enzima presente ya que la Vmáx
es directamente proporcional a la concentración de enzima.
Vo
[Enzima]
Teniendo en cuenta estas consideraciones, cuando se necesita conocer la cantidad de enzima presente en una muestra se recurre a la
velocidad de la reacción enzimática que cataliza, en condiciones saturantes de sustrato (Vmáx). Cabe aclarar que los kits comerciales están
diseñados para medir actividad enzimática dentro de un rango de concentración de enzima. Si la concentración de enzima es demasiado
alta, puede suceder que la concentración de sustrato deje de ser saturante y en esos casos lo correcto es diluir la muestra problema y luego
repetir la medición.
FORMAS DE EXPRESAR LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
La actividad de una enzima se puede expresar en términos de unidades de enzima o unidades internacionales (UI). La UI
(recomendada por la Unión Internacional de Bioquímica) de cualquier enzima es la cantidad de enzima que cataliza la conversión de
un micromol de sustrato en un minuto (µmol/min). La actividad específica es el número de unidades internacionales de enzima por
miligramo de proteína (UI/mg de proteína).
Asimismo, es útil definir una constante de velocidad general, kcat, para describir la velocidad limitante de cualquier reacción enzimática
a saturación. En una reacción michaeliana kcat= Vmáx/[Et]. La kcat, denominada también número de recambio, es una constante de
velocidad de primer orden con unidades de tiempos inversos y es equivalente al número de moléculas de sustrato convertidas en
producto en una unidad de tiempo, por una sola molécula de enzima, cuando la misma está saturada de sustrato.
Vmáx es proporcional a la [Et]. Entonces, Vmáx = cte. x [Et]. Dicha cte. es kcat = Vmáx / [Et]
Diversos métodos han sido propuestos para determinar Km y Vmáx en forma gráfica: Hanes- Woolf, Eadie-Hofstee, Lineweaver-Burk, etc.
Todos ellos se basan en modificaciones de la ecuación de Michaelis-Menten para que responda a la ecuación de una recta.
1 1 Km 1
= + x ( 8)
Vo V m ax V m ax [ S]
Al graficar 1/Vo en función de 1/[S] se obtiene la Figura 4B. De la intersección de la recta con la ordenada se obtiene 1/Vmáx y de la
intersección de la recta con la abscisa se obtiene –1/Km.
Km
V max Pendiente
V max
2 =
1
V max
Km [S] 1 1
Km [S]
La ventaja del uso del método de la doble recíproca respecto a los otros métodos gráficos radica en la determinación más precisa de
Vmáx y como veremos más adelante será de utilidad en el análisis de la inhibición enzimática.
En la actualidad se usan métodos de regresión no lineal que están disponibles en diversos programas para PC, los que por
aproximaciones matemáticas sucesivas (iteraciones) encuentran los valores de los parámetros cinéticos. Cabe aclarar que todas las
técnicas de cálculo por métodos gráficos son menos precisas que los métodos de regresión no lineal.
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Los inhibidores de enzimas son moléculas que interfieren con la catálisis disminuyendo la velocidad de las reacciones. Varias sustancias
pueden inhibir la actividad enzimática, tales como: análogos de sustratos, toxinas, drogas, complejos metálicos, anticoagulantes, etc.
Los estudios sobre inhibición enzimática nos dan información sobre las vías metabólicas, una visión acerca de los mecanismos de
acción de drogas y toxinas, y una mejor comprensión de los mecanismos de las reacciones enzimáticas. La determinación de Km y Vmáx
tiene gran importancia y utilidad al trabajar con inhibidores, pues en base a los valores obtenidos se puede determinar la presencia y
tipo de inhibidor.
INHIBIDORES REVERSIBLES
1- INHIBICIÓN COMPETITIVA
Un inhibidor competitivo, compite con el sustrato por el sitio activo de la enzima e impide la unión del sustrato.
Los inhibidores competitivos son, frecuentemente, compuestos que se parecen estructuralmente al sustrato y que se combinan con la
enzima formando el complejo [EI]. Debido a que el inhibidor se une de manera reversible a la enzima, se puede cambiar el sentido de
la competición en favor del sustrato simplemente añadiendo más sustrato. Cuando hay suficiente sustrato se minimiza la probabilidad
de que se fije una molécula de inhibidor por lo que la reacción muestra la misma Vmáx que la reacción sin inhibidor, pero Km aumenta
en presencia del inhibidor (K´m) (Figura 5).
Vo Vmax (A) (B)
1
r
ido
Vo
hib
r
ido
n in
or idor ib
ibid inhib
h
Co
h in
n i n Con Si
n
Si
Vmax
2
1
Vmax
Km K´m [S] 1 1 1
Km K´m [S]
Figura 5:
Figura 9: Efecto de un inhibidor competitivo en una reacción enzimática. (A) Curva de sustrato en presencia
y en ausencia del inhibidor. (B) Doble recíproca en presencia y en ausencia del inhibidor.
2- INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
Un inhibidor no competitivo es el que se fija a un sitio distinto del que se fija el sustrato. La fijación del inhibidor puede o no bloquear
la fijación del sustrato, pero si este último se une al sitio activo no se puede transformar a P o lo hace a menor velocidad. El inhibidor
disminuye de manera efectiva la concentración de enzima activa por lo que disminuye la Vmáx aparente (V´máx). Frecuentemente el
efecto sobre Km es nulo (Figura 6).
r
do
Vo
ibi
nh
r
bidor ido
ni
inhi ib
Co
Si n inh
n
Vḿax
1 Si
r
hibido Vḿax
Vmax on in
C
2
1
V´max Vmax
2
Km [S] 1 1
Km [S]
6: Efecto de un inhibidor no competitivo en una reacción enzimática. ( A) Curva de sustrato en presencia
Figura 10:
y en ausencia del inhibidor. (B) Doble recíproca en presencia y en ausencia del inhibidor.
3- INHIBICIÓN ACOMPETITIVA
En este caso el inhibidor se une al complejo [ES], con lo cual el valor de Km disminuye (como si la enzima tuviera más afinidad por el
S). También disminuye la Vmáx ya que el complejo [SEI] es inactivo (Figura 7).
Vo Vmax (A) (B)
1
Vo
r
idor do
n inhib h ibi r
i n
S ni ido
Vḿax Co nhib
i
inh ibidor Si
n
Vmax Con 1
Vḿax
2
Vḿax
2 1
Vmax
Km [S] 1 1 1
K´m Kḿ Km [S]
Figura
Figura7:11: Efecto de un inhibidor acompetitivo en una reacción enzimática. (A) Curva de sustrato en presencia
y en ausencia del inhibidor. (B) Doble recíproca en presencia y en ausencia del inhibidor.
INHIBIDORES IRREVERSIBLES
Con el uso de inhibidores irreversibles es frecuente la formación de un enlace covalente entre un inhibidor y la enzima. Los
inhibidores irreversibles son muy útiles para estudiar los mecanismos de reacción. Estos juegan un papel central en los métodos
modernos para obtener nuevos agentes farmacéuticos, proceso que se denomina diseño racional de fármacos. Debido a que el
inhibidor se ha diseñado para una enzima específica y no es reactivo hasta que se encuentre en el sitio activo de la enzima, los
fármacos basados en este método son con frecuencia muy efectivos y tienen pocos efectos secundarios.
En la mayoría de los casos las reacciones enzimáticas se acoplan a una segunda reacción en la que interviene una enzima que tiene
como cofactor al NAD+ o al NADH. Como resultado de estas reacciones acopladas la concentración de NADH irá disminuyendo o
aumentando en función del tiempo, en forma proporcional a la aparición del producto de la primera reacción.
NADH + H+ NAD+ + 2H+ + 2 e-
El cofactor tiene un espectro de absorción diferente en su forma oxidada (NAD+) o en su forma reducida (NADH) (ver Figura
8). La concentración de NADH se puede determinar espectrofotométricamente siguiendo el cambio de absorbancia a 340 nm.
Figura 8. Espectro de absorción del NAD+ y NADH.
100
80
Abs
60
NADH + H+
40
20
NAD
+
En cada respuesta, revise que se hable de: La fosfofructocinasa-1 (PFK-1) es una enzima reguladora principal de la
glucólisis. Su actividad se inhibe alexitéricamente por concentraciones elevadas de ATP y de citrato, que son indicadores
de que la carga energética de la célula es elevada y de que el ciclo del ácido cítrico, un componente fundamental de la
capacidad generadora de energía de la célula, se ha hecho más lento.
Anyela Gamboa Mercado Si una persona se encuentra generando energía en forma aeróbica submáxima y de
pronto aumenta la intensidad del ejercicio (aumenta los requerimientos de ATP
instantáneos), la célula se verá obligada a recurrir a la vía glucolítica y lo hace
fácilmente ya que la caída momentánea de concentración de ATP produce un
aumento de la concentración de ADP y AMP y estos son activadores de la PFK-1 lo
cual aumenta inmediatamente el flujo glucolítico (no debemos olvidar que la
demanda metabólica la produce la intensidad del ejercicio).
Consolidado grupal No exceda las 250 palabras
Espacio para las
observaciones del tutor
Analice: Como se puede interpretar que se considere fosfofructocinasa (PFK) en una enzima de regulación Alostericas.
Analice: La enzima fosfofructoquinasa (PFK) es una enzima alostérica y su actividad se halla regulada por un gran número
de efectores negativos como ATP, citrato, Ca2+, fosfoenolpiruvato, 1,3- difosfoglicerato y palmitato, y de moduladores
positivos como fructosa-2,6-difosfato, AMP, ADP y fructosa-1,6-difosfato.
Ilustre las reacciones implicadas en el fragmento anterior.
La enzima fosfofructoquinasa (PFK) utiliza el ion Mg2+ como cofactor y cataliza el paso del glucolisis que da lugar a la
formación de fructosa-1,6-difosfato a partir de la fructosa-6-fosfato y consumo de una molécula de ATP.
Ilustre las reacciones implicadas en el fragmento anterior.
ATP ADP
Pi H2O
Fructosa-1,6-
bisfosfatasa
VERENA CANDELARIA
FERNANDEZ Fructosa 6-fosfsto Fosfofructoquinasa 1 Fructosa 1 6 bisfosfato
Analice: Explique en que consiste el déficit de fosfofructocinasa muscular (PFK) y que patología produce, consulte sobre
o patologías o alteraciones metabólicas.
Ejemplo: enfermedad de Tauri.
Universidad de Ciencias Médicas de La Habana
Iecienia Espinosa SantistebanI, Adina Pérez MejíasII, Aydelín Pérez RamosIII, María Ofelia Barber FoxIV
http://www.bvs.sld.cu/revistas/rhab/vol_11_3_12/rhcm04312.htm
Trastornos del metabolismo energético del músculo: bases genéticas y bioquímicas de las miopatías que cursan con
intolerancia al ejercicio físico.
Margarita Pérez Ruiz Alejandro Lucía Mulas Universidad Europea de Madrid
http://archivosdemedicinadeldeporte.com/articulos/upload/Revision_Trastornos_451_122.pdf
Enzima A Enzima A
[S] Vo [S] Vo
50 27 44 29
100 28 96 32
160 33 154 33
190 35 185 36
210 42 210 40
240 43 238 43
290 45 290 46
300 49 300 51
400 52 400 58
500 60 500 63
720 73 720 73
800 80 800 81
1000 87 980 87
Para hallar los valores de Vmax y Km, se utiliza el método de Lineweaver – Burk,
Calcule los recíprocos de la actividad enzimática y concentración de sustrato y
grafique 1/v como función de 1/ [S].
De esta gráfica, determine los valores para Vmax y Km, determinando los
recíprocos de los interceptos en Y y X de la gráfica. Consulte el documento:
Aplicación de las herramientas informáticas en el tratamiento de la
información científico de Mauricio Restrepo Gallego:
http://www.lasallista.edu.co/fxcul/media/pdf/Revista/vol2n1/herramientas_informati
cas.pdf
Analice: las principales características estructurales de las enzimas, sitio activo, la formación de complejos y la cinética
enzimática Modelo de Michaelis y Menten (Dependencia de la concentración de sustrato).
Es decir: Explicar con sus propias palabras, cuales son las principales características estructurales de las enzimas, sitio
activo, la formación de complejos y la cinética enzimática desde el Modelo de Michaels y Menten cuando hay una
dependencia de la concentración de sustrato.
Solangel Infante Los enzimas, en cuanto que proteínas, presentan todos los rasgos estructurales y
propiedades químicas que caracterizan a esta notable clase de biomoléculas. El
centro activo es una cavidad existente en la superficie del enzima que está forrada
interiormente por una serie de restos de aminoácidos.
Los enzimas actúan de acuerdo con los mismos principios generales que los demás
catalizadores: aumentan la velocidad de las reacciones químicas combinándose
transitoriamente con los reactivos de manera que estos alcanzan un estado de
transición con una energía de activación menor que el de la reacción no catalizada.
VERENA CANDELARIA Las características de las enzimas es que son catalizadores orgánicos, que no son
FERNANDEZ afectados por la reacción que catalizan, además de ser muy potentes y eficaces,
No sufren modificaciones durante la reacción; su composición y forma no son
transformadas en ninguna parte de la reacción, se recuperan intactas, Son Proteínas
Globulares que regulan la mayor parte de las reacciones metabólicas de los seres
vivos, debido a esto las enzimas sufren desnaturalización, no dializan y sufren
saturación, Lo sintetizan tanto los seres Autótrofos como Heterótrofos, Pueden actuar
a nivel intracelular o extracelular, dependiendo de la reacción.
Estudiante 3 No exceda las 100 palabras
Estudiante 4 No exceda las 100 palabras
Anyela Gamboa las reacciones catalizadas enzimáticamente ocurren en dos etapas: la primera etapa
se forma el complejo enzimá-sustrato y en la segunda, el complejo enzima-sustrato da
lugar a la formación del producto, liberando el enzima libre. Este modelo cinético
adopta la hipótesis del estado estacionario, según la cual la concentración del
complejo enzima-sustrato es pequeña y constante a lo largo de la reacción. Por tanto,
la velocidad de formación del complejo enzima-sustrato es igual a la de su disociación.
Consolidado grupal No exceda las 250 palabras
Espacio para las
observaciones del tutor
Analice Significado biológico de Km. En términos prácticos la Km, como una medida de la afinidad de la enzima por su
sustrato, más pequeño es su valor mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato.
Nota Aclaratoria: Explicar con sus propias palabras, que indica el valor de Km para una enzima en relación con la
afinidad de la enzima por el sustrato.
Analice Las enzimas con una Km muy baja (10-6-10-8M) son importantes en el metabolismo.
Nota Aclaratoria: Explicar con sus propias palabras, sí las enzimas con una Km muy bajo (10-6-10-8 M) representan una
importancia en al reacciones metabólicas?
Entonces podemos decir que las enzimas con Km muy bajos permiten una mayor
afinidad por el sustrato y una mayor velocidad de reacción catalítica, lo que es de
importancia en el desarrollo óptimo de las reacciones metabólicas.