UNIVERSIDAD PRIVADA DE TACNA

FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD

ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA
HUMANA

MONOGRAFÍA:
PANDORA VIRUS

CURSO: PEDIATRÍA II
DOCENTE: MÉD. VICTOR MARTINEZ BRAVO
ALUMNA: Nicole Guadalupe Manya Pari
CÓDIGO: 2013000687
CICLO: 9º
Tacna – Perú

2018
ÍNDICE

Prólogo .......................................................................................................................................... 3

Introducción .................................................................................................................................. 4

Marco teórico ................................................................................................................................ 5

A. Perspectiva histórica ......................................................................................................... 5

B. Estructura y morfología ..................................................................................................... 6

C. Tamaño del genoma y contenido genético ....................................................................... 7

D. Replicación ........................................................................................................................ 8

E. Relación con otros virus DNA gigantes ............................................................................. 9

Conclusiones ............................................................................................................................... 10

Anexos ......................................................................................................................................... 11

Bibliografía .................................................................................................................................. 14

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Prólogo

Con el descubrimiento de Mimivirus hace diez años y, más recientemente, Megavirus chilensis,
los investigadores pensaron que habían llegado a los rincones más lejanos del mundo viral en
términos de tamaño y complejidad genética. Con un diámetro en la región de un micrómetro y
un genoma que incorpora más de 1.100 genes, estos virus gigantes, que infectan las amebas del
género Acanthamoeba, ya habían invadido zonas que antes se consideraban exclusivas de las
bacterias. En aras de la comparación, los virus comunes como la gripe o los virus del SIDA solo
contienen alrededor de diez genes cada uno.

En el artículo publicado en Science, los investigadores anunciaron que habían descubierto dos
nuevos virus gigantes: Pandoravirus salinus, en la costa de Chile; Pandoravirus dulcis, en un
estanque de agua dulce en Melbourne, Australia. El análisis detallado ha demostrado que estos
dos primeros Pandoravirus prácticamente no tienen nada en común con los virus gigantes
previamente caracterizados. Además, solo un porcentaje muy pequeño (6%) de proteínas
codificadas por Pandoravirus salinus son similares a las ya identificadas en otros virus u
organismos celulares. Con un genoma de este tamaño, Pandoravirus salinus acaba de demostrar
que los virus pueden ser más complejos que algunas células eucariotas. Otra característica
inusual de Pandoraviruses es que no tienen ningún gen que les permita construir una proteína
como la proteína de la cápside, que es el componente básico de los virus tradicionales. A pesar
de todas estas propiedades novedosas, los Pandoravirus exhiben las características esenciales
de otros virus ya que no contienen ribosomas, no producen energía y no se dividen.

Los pandoravirus contiene así el código genético universal compartido por todos los organismos
vivos en el planeta. Esto muestra cuánto más hay para aprender sobre la biodiversidad
microscópica tan pronto como se consideren nuevos entornos. El descubrimiento simultáneo
de dos especímenes de esta nueva familia de virus en sedimentos localizados a 15,000 km de
distancia indica que los Pandoravirus, que eran completamente desconocidos hasta ahora, muy
probablemente no sean raros. Definitivamente cierra la brecha entre virus y células. También
sugiere que la vida celular podría haber surgido con una variedad mucho mayor de formas
precelulares que las consideradas convencionalmente, ya que el nuevo virus gigante casi no
tiene equivalente entre los tres dominios reconocidos de la vida celular, a saber, eucariota (o
eucariotas), eubacteria y arqueas.

3
Introducción

Hace más de un siglo, el término 'virus' se introdujo para describir agentes infecciosos que son
invisibles mediante microscopía óptica y capaces de pasar a través de filtros esterilizadores.
Además de su tamaño extremadamente pequeño, la mayoría de los virus tienen genomas y
contenidos genéticos mínimos, y dependen casi por completo de las funciones codificadas por
la célula huésped para multiplicar.

Los virus se describieron por primera vez a fines del siglo XIX como agentes infecciosos
ultrafiltrables y submicroscópicos. En ese momento, se consideraban entidades más pequeñas
que los microbios, y se definieron principalmente sobre la base de criterios negativos, incluida
la ausencia de ADN o ARN o componentes del aparato de traducción.

El descubrimiento de Mimivirus en 2003 desafió este paradigma y fomentó nuevos debates

sobre la definición y clasificación de virus. Posteriormente, en los últimos 12 años, los virus
gigantes fueron cazados utilizando métodos de cocultivo amoebal.

Inesperadamente, se han descubierto cuatro familias diferentes de "virus gigantes" eucarióticos

en los últimos 10 años, con tamaños del genoma, contenidos de genes y dimensiones de
partículas que se superponen con los de los microbios celulares. Sus análisis en curso desafían
las ideas aceptadas sobre la diversidad, la evolución y el origen de los virus de ADN.

A partir de 2015, se describieron cinco nuevas o supuestas familias de virus que infectan amebas,
que abarcan miembros de familias virales gigantes Mimiviridae y Marseilleviridae, pandoravirus,
faustovirus y mimivirus virófagos, y Pithoviruss ibericum y Molliviruss ibericum representan
cepas de nuevas familias de virus gigantes putativos.

Con genomas de ADN que alcanzan 2.5 Mb empaquetados en partículas de forma y dimensión
similar a la bacteria, los dos primeros pandoravirus que infectan a Acanthamoeba
permanecieron hasta ahora como los virus más complejos desde su descubrimiento en 2013.

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Marco teórico

A. Perspectiva histórica

La naturaleza viral del primer virus gigante, llamado Mimivirus, se descubrió en 2003 en
Marsella, Francia, después de ser aislado por primera vez en 1992 en Bradford, Reino Unido.
Sin embargo, fue confundido con una bacteria por 10 años. Mimivirus, como todos los otros
virus gigantes conocidos, infecta un género especial de amebas, llamado Acanthamoeba,
que es ubicuo en ambientes húmedos.

La partícula completa del virus icosaédrico (virión) tenía aproximadamente 0,7 micrómetros
(μm) de diámetro (que es aproximadamente siete veces más grande que los virus típicos)
(figura 01) y contenía un genoma de ADN bicatenario de 1,18 millones de nucleótidos que
codificaba 979 proteínas. Esta fue la primera aparición conocida de un virus que posee más
genes que pequeñas bacterias, lo que lleva a una paradoja evolutiva porque muchos virus
solo portan una docena de genes que son suficientes para infectar células y multiplicarse,
causando enfermedades.

El muestreo sistemático de una variedad de ambientes acuáticos (y sus sedimentos) en

busca de Acanthamoeba adicional que infecta a Mimiviridae condujo recientemente al
descubrimiento inesperado de la familia Pandoraviridae de virus gigantes, de los cuales dos
representantes han sido estudiados en detalle. Al igual que para Mimivirus, se identificaron
en muestras que muestran una fuerte actividad lítica durante el cocultivo con
Acanthamoeba. El primero llamado Pandoravirus salinus se originó a partir de una muestra
de capa superficial de sedimentos marinos de la costa central de Chile, mientras que P. dulcis
se aisló del lodo en el fondo de un estanque de agua dulce cerca de Melbourne, Australia.

En 2010, otro pariente gigante del virus, llamado Megavirus chilensis, fue descubierto frente
a las costas de Chile. Se descubrió que este nuevo virus gigante portaba un genoma que
codifica 1120 proteínas. Sus partículas ovoides de tamaño micrométrico contienen genomas
de ADN de al menos 2.5 y 1.9 megabases, respectivamente. Estos virus son los primeros
miembros del género propuesto "Pandoravirus", un término que refleja su falta de similitud
con los microorganismos descritos anteriormente. A medida que se encontraban
posteriormente parientes adicionales de Mimivirus y Megavirus de dimensiones similares
en varios entornos, hubo un consenso creciente de que nunca se encontraría un virus mucho
más grande que el Megavirus.

5
B. Estructura y morfología

Un tipo completamente nuevo de virus gigante fue revelado en 2013, cuando los dos
primeros representantes del género Pandoravirus, llamados P. salinus y P. dulcis, fueron
descritos simultáneamente en la misma publicación. Pandoravirus salinus se aisló en el
Océano Pacífico a partir de una muestra de sedimento tomada en la desembocadura del río
Tunquen, Chile, mientras que P. dulcis se aisló de un estanque de agua dulce poco profundo
ubicado en el medio del campus de la Universidad La Trobe en Melbourne, Australia. Los
dos viriones (partículas virales completas) son morfológicamente idénticos, exhiben una
forma distintiva de ánfora de 1,2 μm de longitud y 0,5 μm de diámetro, lo que los hace
fáciles de ver bajo un microscopio óptico. En un ápice, la partícula está cerrada por una
estructura similar a un tapón que se elimina en el momento de la infección para permitir
que el interior de la partícula (incluido el genoma del ADN) se libere en la célula ameba.

Después de varias rondas de amplificación en Acanthamoeba, los dos Pandoravirus se

observaron fácilmente mediante microscopía óptica como un césped de partículas ovoides
de 0,8-1,2 μm de longitud y 0,5 μm de diámetro. Otro Pandoravirus que comparte la
morfología de Pandoravirions (viriones de Pandoravirus), P. inopinatum, se aisló de un
paciente infectado por la queratitis de Acanthamoeba y se secuenció recientemente. La
obtención de imágenes mediante microscopía electrónica reveló características
ultraestructurales únicas entre los virus descritos previamente. Las secciones delgadas de
viriones maduros revelaron un compartimento vacío mirando hacia la membrana
encapsulado en una envoltura similar a un tegumento de ∼70 nm de espesor que consta de
tres capas: una capa interna de densidad de luz (∼20 nm), una capa oscura compuesta de
una malla densa de fibrillas paralelas (∼25 nm) y una capa externa de densidad media (∼25
nm). Una extremidad de la partícula exhibe un poro apical, cuya apertura permite que el
contenido interno no caracterizado de la partícula sea entregado en el citoplasma del
huésped, a través de un canal formado por la fusión de la membrana interna con la de la
vacuola.

Los pandoravirus llevan el nombre de Pandora, a quien los dioses le dieron una "caja" llena
de misterios según la mitología griega. (Aunque mal traducido como una caja, el contenedor
en el mito original era, de hecho, una gran ánfora de tamaño humano). Un análisis
proteómico de las partículas de virus ha indicado que están hechas de más de 200 productos
genéticos, como las partículas de Mimivirus.

6
C. Tamaño del genoma y contenido genético

Además de su forma única tipo ánfora (tenga en cuenta que la mayoría de los virus grandes
de ADN son de forma pseudo-icosaédrica o casi esférica), los pandoravirus han
proporcionado una serie de otras sorpresas. Los genomas de P. salinus, P. dulcis y P.
inopinatum resultaron ser moléculas de ADN de doble cadena lineales de 2,77 millones de
pares de bases, 1,95 millones de pares de bases y 2,24 millones de pares de bases,
respectivamente. Se pronosticó que estos genomas codificarían 2556 proteínas para P.
salinus y 1502 proteínas para P. dulcis.

Cuatro grandes fragmentos genómicos son específicos de P. salinus en comparación con P.

dulcis. El tamaño del genoma de P. inopinatum (2.24 Mbp) es intermedio entre los de las
otras dos cepas de virus pandora, y muestra una identidad de nucleótidos de 85 y 89% con
los genomas de P. salinus y P. dulcis, respectivamente.

El genoma de P. salinus tiene una densidad de codificación del 80%. Se demostró que un
total de 401 genes (16% del contenido del gen) tenían homólogos conocidos en la base de
datos de secuencias de proteínas no redundantes de Gen Bank, con una similitud media del
38%. Entre estos genes, el 54% contiene firmas de ankirin, MORN o F-box. Las mejores
coincidencias para los genes existentes fueron de eucariotas, en casi la mitad de los casos,
luego de bacterias y virus en proporciones iguales. Solo 17 y 92 genes tuvieron el Mimivirus
y amebozoa, respectivamente. Por lo tanto, sorprendentemente, la gran mayoría del gran
contenido de genes de P. salinus no tiene homólogos en las bases de datos de secuencia. El
contenido del gen de P. salinus incluye 14 de los 31 genes centrales de la clase I-III definidos
inicialmente para el NCLDV. Anteriormente, solo un puñado de virus más pequeños habían
sido identificados como carentes de una cápside. Aproximadamente el 10% de los genes de
P. salinus con homólogos en la base de datos de secuencias de proteínas no redundantes de
GenBank contienen intrones espliceosomales, que se describieron como diferentes de los
intrones de autoempalme del grupo I o II que se encuentran en otros virus amoebales
gigantes.

Otra característica sorprendente de los pandoravirus es la proporción extremadamente baja

de sus proteínas (16%) que comparten una similitud de secuencia significativa con las
proteínas de cualquier otro organismo, incluidos otros virus. Junto con su forma y tamaño
de partícula únicos y su enorme contenido de genes, esta falta de similitud de secuencia
hace que los pandoravirus se conviertan en uno de los microorganismos más extraños jamás
descubiertos.

7
D. Replicación

En contraste con los virus gigantes previamente descubiertos de la familia Mimivirus y

Megavirus, en los que la replicación ocurre completamente en el citoplasma de
Acanthamoeba, dejando el núcleo celular intacto, los pandoravirus parecen ser altamente
dependientes de las funciones nucleares del huésped para su replicación. (figura 02)

El ciclo de replicación de Pandoravirus en Acanthamoeba castellanii dura de 10 a 15 horas y

se inicia mediante la internalización de partículas individuales a través de vacuolas
fagocíticas. Las partículas luego vacían el contenido de su compartimento interno en el
citoplasma de Acanthamoeba a través de su poro apical. La membrana lipídica interna que
delimita el núcleo de la partícula se fusiona con la membrana de la vacuola, creando un canal
a través del cual se pueden suministrar las proteínas de partículas y el contenido de ADN,
un proceso que recuerda al utilizado por Mimivirus. Este proceso de fusión conduce a una
fase de "eclipse" de buena fe por la cual el contenido de la partícula se vuelve invisible una
vez entregada al citoplasma. Dos a cuatro horas más tarde, el núcleo del huésped
experimenta una reorganización importante iniciada por la pérdida de su aspecto esférico.
Mientras que el nucleolo denso en electrones se vuelve más pálido y se desvanece
progresivamente, la membrana nuclear desarrolla múltiples invaginaciones, lo que resulta
en la formación de numerosas vesículas. Las estructuras cristalinas similares a peroxisomas
aparecen en la periferia del núcleo delicuescente y desaparecen progresivamente durante
el proceso de maduración de las partículas.

Ocho a 10 horas después de la infección, las células se redondean y pierden su adherencia,

y aparecen nuevas partículas en la periferia de la región anteriormente ocupada por el
núcleo. A diferencia de los virus y fagos de ADN eucariotas, que primero sintetizan y luego
llenan sus cápsidas, el tegumento y el compartimento interno de las partículas de
Pandoravirus se sintetizan simultáneamente, de manera sugestiva se unen, hasta que las
partículas se forman por completo y se cierran. Curiosamente, se inicia la síntesis de
partículas y procede del ápex de tipo ostiole. El ciclo de replicación finaliza cuando las células
se lisan para liberar aproximadamente cien partículas. Los ciclos de replicación de P. salinus
y P. dulcis muestran las mismas etapas y características.

La importación del genoma de Pandoravirus dentro del núcleo de la célula es por lo tanto
probable que sea un paso obligatorio para su expresión exitosa. Los pandoravirus conocidos
no son patógenos para animales o humanos y no pueden replicarse en macrófagos de
animales in vitro. (figura 03)

8
E. Relación con otros virus DNA gigantes

Como ya lo sugiere el pequeño número de genes que codifican proteínas con homólogos
reconocibles en otros organismos, el árbol filogenético calculado a partir de ADN polimerasas
(enzimas que unen nucleótidos para formar cadenas de polinucleótidos) coloca a los
pandoravirus en su propio clado, fuera de todo lo previamente definido familias de virus de ADN
grandes que infectan eucariotas. El uso de un puñado de proteínas víricas menos ubicuamente
conservadas que también se encuentran en los pandoravirus genera una débil señal filogenética,
lo que sugiere una leve afinidad con un grupo aislado de virus grandes que infectan un tipo
específico de algas unicelulares, llamados coccolitóforos. El análisis de más parientes de
Pandoravirus arrojará más luz sobre su origen evolutivo y su relación con el resto del árbol de la
vida (árbol filogenético). (figura 04)

9
Conclusiones

 Pandoravirus salinus se originó a partir de una muestra de capa superficial de sedimentos

marinos de la costa central de Chile.
 Pandoravirus dulcis se aisló del lodo en el fondo de un estanque de agua dulce cerca de
Melbourne, Australia.
 Los genomas de P. salinus, P. dulcis y P. inopinatum resultaron ser moléculas de ADN de
doble cadena lineales de 2,77 millones de pares de bases, 1,95 millones de pares de bases y
2,24 millones de pares de bases, respectivamente.
 Otra característica inusual de Pandoraviruses es que no tienen ningún gen que les permita
construir una proteína como la proteína de la cápside, que es el componente básico de los
virus tradicionales.
 Otra característica sorprendente de los Pandoravirus es la proporción extremadamente baja
de sus proteínas (16%) que comparten una similitud de secuencia significativa con las
proteínas de cualquier otro organismo, incluidos otros virus.
 Los Pandoravirus parecen ser altamente dependientes de las funciones nucleares del
huésped para su replicación.
 La importación del genoma de Pandoravirus dentro del núcleo de la célula es por lo tanto
probable que sea un paso obligatorio para su expresión exitosa.
 Los pandoravirus conocidos no son patógenos para animales o humanos y no pueden
replicarse en macrófagos de animales in vitro.
 El análisis de más parientes de Pandoravirus arrojará más luz sobre su origen evolutivo y su
relación con el resto del árbol de la vida (árbol filogenético).

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Anexos

 Figura 01: Cuatro viriones distintos. Imágenes de microscopía óptica (barra de escala = 2
μm) y escanear imágenes EM (barra de escala = 100 nm) de Mimivirus (A, C), Mollivirus (B,
D), Pandoravirus (E, G) y Pithovirus (F, H).

 Figura 02: Representación esquemática del ciclo infeccioso del Pandoravirus

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 Figura 03: Imágenes de partículas de Pandoravirus y sus perfiles proteómicos.
Microscopía óptica (A) e imágenes de microscopía electrónica (B) de partículas purificadas
de P. salinus (1) y P. dulcis (2). (C) Perfiles de electroforesis de proteínas extraídas de P.
salinus (banda 1) y P. dulcis (banda 2). (D) Partícula de P. salinus internalizada en la vacuola
del huésped. Una vez fusionada con la membrana de la vacuola (flecha), la membrana
interna del virión crea un continuo con el citoplasma del huésped. Las partículas se
envuelven en una envoltura similar a un tegumento de 70nm de espesor que consta de tres
capas. (E) Imagen ampliada del ápice abierto con forma de ostión: desde el interior hacia
afuera, una capa de densidad de luz de composición desconocida (20nm, marcada con "b"),
una capa oscura intermedia que comprende una densa malla de fibrillas (25nm, marcado
"a"), y una capa externa de densidad media (25nm, marcada "c"). Esta envoltura similar a
un tegumento se ve interrumpida por un poro en forma de ostiolo que mide 70nm de
diámetro. Como se muestra en (B1) y (B2), la membrana lipídica interna de la partícula
encierra un interior difuso desprovisto de subestructura visible., a excepción de una zona
esférica de material denso en electrones (50nm de diámetro, punta de flecha) visto
episódicamente pero de una manera reproducible. (F) Sección ultrafina de una célula de
Acanthamoeba llena de P. salinus en diversas etapas de maduración.

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 Figura 04: Agrupamiento cladístico de contenido génico de los virus de ADN grandes y
gigantes que infectan eucariotas

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Bibliografía

1. Aherfi S, Colson P, La Scola B, Raoult D. Giant Viruses of Amoebas: An Update. Front

Microbiol. 22 de marzo de 2016;7:349.

2. Legendre M, Fabre E, Poirot O, Jeudy S, Lartigue A, Alempic J-M, et al. Diversity and
evolution of the emerging Pandoraviridae family. Nat Commun. 11 de junio de
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3. Abergel C, Legendre M, Claverie J-M. The rapidly expanding universe of giant viruses:
Mimivirus, Pandoravirus, Pithovirus and Mollivirus. FEMS Microbiol Rev. noviembre de
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4. Philippe N, Legendre M, Doutre G, Couté Y, Poirot O, Lescot M, et al. Pandoraviruses:

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5. Claverie J-M, Abergel C. Pandoravirus. AccessScience. 2014;1-4.

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