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Microbiologia 3
Microbiologia 3
Pueden ser:
¿Cómo se realizan todas las actividades celulares?
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Son moléculas muy grandes, su peso molecular
oscila entre 10.000 y 1´000.000. Muchas están
integradas a otra molécula orgánica de menor
tamaño llamada coenzima, algunas coenzimas
están integradas por una vitamina ejemplo las del
grupo B, la parte proteíca se denomina apoenzima ,
unidas forman una haloenzima. A veces el grupo no
proteico de un enzima es un metal, ejemplo el hierro
de la catalasa, requiere de su adición para que se
active. Estos iones constituyen coenzimas
inorgánicas o cofactores. A veces se requiere de un
cofactor y una coenzima para que actué un enzima.
Se han extraído de la célula un buen número, son
de eficiencia extrema al acelerar la transformación
del sustrato en producto final, ver figuras 2,3,4 y 5.
Figura 5. Catálisis (1)
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diferentes condiciones físico-químicas, algunas se
inactivan por pequeños cambios como la exposición
a temperatura ambiente por corto tiempo.
Características
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rapidez constante. Este incremento constante en la
concentración del producto, dP/dt, se designa Si se evalúa ES en términos de E0,S y las
como v0, la “velocidad inicial en estado estacionario” constantes cinéticas, la ecuación (6) dará el
. Se considera que v0 es una velocidad inicial resultado esperado por Briggs y Haldane.
porque solo se consume una proporción muy
pequeña del sustrato mientras se están haciendo
las mediciones, laS prácticamente es constante y
la v0 que se mide corresponde al valor inicial de la
S.
K1 K3
E S ES E P (4)
K2
k ESk k ES
v0 en estado estacionario. Por lo general se ignora
en la cinética de estado estacionario. 1 2 3
La concentración total de E se define como E0, Despejando las variables de las constantes y
antes de que se añada el S E0=E, una vez se ha combinando estas últimas se tiene que:
añadido E0=E +ES.ES durante la breve fase
de inducción aumenta hasta alcanzar su valor de
estado estacionario y permanece constante, ES k k k
2 3 m (7)
durante esta etapa de la reacción, cuando v0 se ES k 1
mide y es constante. Briggs y Haldane utilizaron la
condición de estado estacionario deES constante
y la condición de concentración inicial deS Donde km se designa como la constante de
constante para formular ecuaciones que relacionan Michaelis, en honor a quién desarrollo las primeras
v0 con las constantes cinéticas y las formas de la ecuación simple de cinética
concentraciones de enzima y de sustrato. enzimática.
Debido a que el P solo puede formarse por Este modelo cinético adopta la hipótesis del
desdoblamiento de ES, gobernado por la constante estado estacionario, según la cual la
de velocidad K3, puede concluirse que la velocidad concentración del complejo enzima-sustrato es
en las condiciones de velocidad inicial es: pequeña y constante a lo largo de la reacción
(Figura 8)
V 0 k ES
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máxima se alcanzará cuando esencialmente toda la
enzima este es forma es decir, cuando
ES ≅ E0. Cuando laS=Km en la ecuación (10) el
denominador de la ecuación será 2S y el
numeradorSVmáx. Esto significa que la V0 será
igual a 1/2Vmáx. cuandoS=km.
Figura 9 Maud Menten, Leonor Michahelis ConformeS aumenta hasta varias veces el valor
de Km, se aproxima a un valor de saturación, el cual
es indicado por V0 que se aproxima a Vmáx. Dicha
Dado que en la ecuación (6) apareceES y noE, concentración de sustrato 20 ó 100 veces Km, se
se sustituye E0 -ES por E en la ecuación (7) para dice que es la concentración de saturación del
obtener sustrato debido a que virtualmente toda la enzima
debe estar en la formaES. En la velocidad de la
EESS k
reacción no es posible obtener ningún incremento
0
adicional debido a que la concentración de E libre
ES m
en estado estacionario,E, es bastante pequeña.
Resolviendo la ecuación paraES se tiene que: A las concentraciones de saturación del sustrato, la
ecuación (6) se convierte en:
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orden cero en el caso de una granS, como se
indica en la figura 10.
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La base de la clasificación y nomenclatura esta en se incluso el monitoreo continuo de algunos
el tipo de reacción química que catalizan. De compuestos biológicamente importantes. Se ha
acuerdo con la clasificación Internacional, los desarrollado el electrodo de glucosa.
enzimas se agrupan en seis clases principales, ver Puesto que una molécula de enzima convierte
tabla 1. muchas moléculas de sustrato en producto, es
posible detectar cantidades muy pequeñas del
enzima utilizando una prueba sensible para el
producto. Por lo general muchos métodos para
análisis cualitativos y cuantitativos sensibles para
sustancias biológicamente importantes depende de
agentes acoplados químicamente. El acoplamiento
químico de enzimas a matrices insolubles es la
base de procedimientos preparatorios y analíticos
de laboratorio. Con dichas enzimas inmovilizadas
puede lograrse producción a escala industrial. Ver
figura 12.
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.
1)Mecanismo ordenado
Figura 15. Efecto del pH sobre la actividad Se dice que este tipo de reacción tiene un
enzimática, la actividad máxima se da a un pH mecanismo ordenado Bi, Bi, que indica dos
determinado y las desviaciones de este determinan sustratos, dos productos, ejemplo, la
menor actividad (4) deshidrogenasa alcohólica, los dos sustratos son
+
etanol y NAD y los dos productos son acetaldehído
y NADH.
Deshidrogenasa alcohólica
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Pueden ser fármacos, antibióticos, tóxinas y
+ +
CH3CH2OH + NAD CH3CHO + NADH + H antimetabolitos. Se reconocen dos grupos de
inhibidores, de acuerdo a su acción inhibitoria son
reversible e irreversible.
Los sustratos siempre se desinan: A, B, C y D, los
productos como P, Q y R y las enzimas como E, F y Inhibidores Irreversibles
G.
La inhibición irreversible implica la modificación de
uno o más grupos funcionales del enzima. Se une
2) Mecanismo aleatorio
en otro punto del sitio activo y evitan el
funcionamiento de la enzima. Su efecto no se
Cuando dos sustratos A y B se añaden a una
enzima en forma aleatoria y los dos productos P y Q revierte al aumentar la concentración del S,S,
comparable con los inhibidores reversibles o
se liberan de la misma forma, dicha secuencia se
competitivos, ejemplo la tosil-fenilalanil-clorometil-
libera como un mecanismo aleatorio Bi, Bi, la
cetona TPCK de la quimiotripsina, a muy bajas
reacción general sería:
concentraciones la inactiva, la amida o ester usual
del ácido carboxílico es sustituido por el grupo
clorometil.
Inhibidores Reversibles
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este tipo de inhibición. En la tabla 2 se resumen los
parámetros de inhibición.
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disminuido de Vmáx y el valor sin cambios de Km, los Enzimas constitutivos: producidos por las células en
cuales son característicos de la inhibición no todo momento.
competitiva y que se observan tanto en la gráfica
directa (a) como en la gráfica de Lineweaver y Burk
(b) (4).
Por tanto difiere de la competitiva en que el inhibidor
puede combinarse con ES y S con EI, en ambos
casos para formar el complejo EIS. Dado que el
sitio de unión del inhibidor no es idéntico al sitio
activo, ni modifica a este directamente, la Km no se
altera, en la tabla 2 se observa la ecuación que
define la inhibición no competitiva, y la figura 18,
muestra los gráficas directa y reciproca para este
tipo de inhibición enzimática. Las ecuaciones que
predicen estos resultados aparecen en la tabla 2.
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3. Concentraciones necesarias de sustrato y Propiedades de fijación de enzimas
de cofactor o coenzima regulatorios: los enzimas regulatorios estan
4. pH óptimo sujetos a la acción del metabolito regulador
5. Temperatura óptima que puede ser activador o inhibidor.
6. Un procedimiento analítico sencillo para Disminuye la actividad enzimática,
medir desaparición de sustrato o aparición disminuye la afinidad de la enzima por el
de productos de la reacción. sustrato que se fija a un sitio diferente del
sitio catalítico, estos enzimas tienen dos o
La concentración del sustrato ha de estar por más sitios de reconocimiento, se les llama
encima del nivel de saturación al objeto de que la enzimas alostéricos ya que donde actúa el
velocidad inicial de la reacción sea proporcional efector es diferente del sitio catalítico por
únicamente a la concentración de enzima. Los tanto el sitio alostérico regula la actividad
cofactores y coenzimas deben añadirse en exceso. enzimática.
Todo esto asegura que el verdadero factor limitante
sea la concentración de enzima (a su pH Cuando la célula se adapta a un ambiente diferente
temperatura óptimos). Generalmente es más exacto los mecanismos de inducción y represión entran en
medir formación de producto de reacción que juego.
desaparición de sustrato.
2) Control genético de inducción y represión
Naturaleza y mecanismos de la regulación enzimática: Se lleva a cabo por la inducción y la
enzimática represión de la síntesis de enzimas. Cuando se
requiere una sustancia inductora el proceso recibe
La actividad enzimática se puede regular de dos el nombre de inducción. Cuando otras sustancias
maneras: 1) control directo de la acción catalítica, actúan como correpresores el fenómeno recibe el
puede realizarse sobre el mecanismo catalítico nombre de represión. Los correpresores se unen a
como tal, o bien a través de su acoplamiento con el represor, formamdo un complejo activo capaz de
otros procesos y 2) control genético, incluye los actuar sobre el gen operador y bloquear la síntesis
procesos de inducción y represión enzimática. del RNAm o unirse al inductor y formar un complejo
inactivo incapaz de unirse al gen operador y se lleva
1) Control directo de la acción catalítica: Se ejerce a cabo la síntesis de RNAm. La secuencia de
por alteración de las concentraciones de sustrato o aminoácidos la determinan los genes estructurales
de sustancias que reaccionan, por ejemplo al y la velocidad de síntesis de los genes reguladores.
aumentar un sustrato aumenta la velocidad hasta Jacob-Monod, denominaron operon a un grupo de
alcanzar un valor límite. genes consecutivos, que forman una unidad
operacional. Cuando se añaden inductores como la
Control directo por acoplamiento con otros lactosa, se produce un incremento en la velocidad
procesos: Implica la regulación por ligandos de síntesis de la-galactosidasa (hidroliza la
(moléculas capaces de fijarse a la enzima) lactosa a glucosa y galactosa), la-galactósido
permeasa (transporta la lactosa al interior de la
Retroinhibición: El ligando que ejerce la célula) y la tiogalactósido transacetilasa (de función
regulación es el producto final de una ruta fisiológica desconocida), los genes se designan
metabólica, puede bloquear su propia como z, y y a respectivamente. La velocidad de
síntesis inhibiendo la actividad de los síntesis esta regulada por los genes reguladores,
primeros o de enzimas que actúan en dicha que se denominan i, p y o, tal como muestra la
ruta. figura 20, i es el gen represor, p el gen promotor y o
el gen operador. En el gen promotor p, donde se fija
Activación por precursores: El ligando la RNA polimerasa, que cataliza la síntesis de
regulatorio es el precursor del primer RNAm.
metabolito de una ruta, activa o estimula la
actividad del último enzima de la secuencia El control negativo lo ejerce el represor lac, en union
de reacción. del correpresor, forma un complejo represor-
correpresor (puede ser glucosa o galactosa), el cual
Control dependiente de energía: Los se fija al gen o y bloquea la transcripción. Los
adenilatos son los ligandos de reacción inductores estimulan la síntesis de RNAm lac,
dependientes de energía, ATP, ADP y AMP. fijándose al represor y disminuyendo la afinidad
para el operador. Tanto la represión como la
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inducción representan sistemas de control negativo,
ya que la síntesis de enzima solo puede tener lugar
cuando el represor se separa del operador. Se dice
que tiene lugar un control positivo de la síntesis de
enzima cuando se requiere una asociación entre
una proteína y una parte de la región regulatoria de
un operón, para la expresión de genes estructurales
asociados.
Bibliografía
3. En línea
http://www.bgu.ac.il/~aflaloc/BioHTML/Goodies/Deri
veMMEqn.html. Consultada en Mayo de 2002.
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