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UNIVERSIDAD NACIONAL ABIERTA Y A DISTANCIA – UNAD

Escuela de Ciencias Básicas, Tecnología e Ingeniería


Guía Trabajo Colaborativo No 1 Curso Bioquímica 201103

Temáticas que se revisarán:

Unidad 1: Biomoléculas
Capítulo 1. Aminoácidos
Capítulo 2: péptidos y proteínas

Aspectos generales del trabajo:

Se profundizarán las temáticas generales de la Unidad 1, en relación a la estructura general


de los aminoácidos y la clasificación de éstos en función de la cadena lateral. Se reconocerá
las propiedades ácido básicas de aminoácidos y cómo estas influyen cuando hacen parte de
péptidos y proteínas al realizar ejercicios de cálculo de punto isoeléctrico (pI). Se analizarán
los niveles de estructuración de proteínas y las fuerzas de enlace que mantiene estables la
estructura primaria, secundaria y terciaria.

Este trabajo se desarrollará de la siguiente forma:

Todos los integrantes del grupo deben ayudar a la construcción con aportes para el
desarrollo del trabajo colaborativo 1. Cada estudiante debe tener como mínimo, dos
participaciones en el foro, en cada participación deben presentar:

• Aportes en formato Word:

Para la presentación de los aportes tenga en cuenta:

1. Hacerlos en el formato para la presentación de aportes, que lo encuentra al fina de ésta guía.
2. No consulte páginas de internet que no ameriten seriedad y análisis.
3. No tome información de páginas de poca seriedad como El rincón del vago, monografías,
Wikipedia.
4. Redacte cada pregunta con sus propias palabras, así comprobará el nivel de redacción,
comprensión y análisis que posee.
5. Evite realizar actividades poco profesionales como cortar y pegar de páginas de internet. Si lo
hace, al menos organice el tipo de letra y elimine los hipervínculos y de la correspondiente cita
bibliográfica.
6. Observe la rúbrica de evaluación para el desarrollo de cada punto.
7. No presente texto extensos, sea concreto y conciso, así demostrará que le dedica tiempo al
desarrollo de las actividades del trabajo.
8. El o los aportes deben estar acompañados de un texto relevante, análisis o conclusión que
relaciones el contenido del aporte que esta entregando o de la investigación realizada.
9. Estudiante que no muestre su desarrollo de la actividad dentro de foro, esto es, que no presente
aportes en el foro del grupo de manera pertinente y articulada tendrá una nota total de CERO (0).
10. El hurto, semejanzas, plagios de aportes y trabajos entre grupos serán penalizados con 0.0 puntos
de la calificación en el aporte.
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• Número y calidad de las participaciones en el foro:

Para la participación en el foro tenga en cuenta:

1. No hacer intervenciones cerca a la fecha de cierre del trabajo: esto hace que el estudiante no
desarrolle un verdadero trabajo en grupo y no interactúe en la construcción del conocimiento.
2. No dejar en el foro, mensajes o textos poco relevantes y sin enfoque académico , que no
relacionan ni aportan a la temática que se esta trabajando, por ejemplo, no sea de los
estudiantes que presentan frases como:
“¡Hola a todos, ahí les dejo mi aporte, espero les sirva!”
“¡Envió aporte al trabajo, hasta luego!”
“¡He tenido muchos problemas, mañana seguro presento mi aporte”!
“¡Me encuentro trabajando en el aporte, pronto lo enviare………………”!
“! Ya he revisado sus aportes y me parecen muy interesantes.
“! Veo que el trabajo ya esta listo, entonces aporto la introducción y conclusiones.”!
3. Sea frecuente en sus intervenciones, así estará al tanto de lo que sucede en el foro y no tendrá
sorpresas una vez el tutor entrega la calificación del trabajo.
4. El ó los aportes deben estar acompañados de un texto relevante, análisis o conclusión que
relaciones el contenido del aporte que esta entregando o de la investigación realizada, por
ejemplo:
“Cordial saludo: presento mi aporte al trabajo, el cual relaciona que la función biológica de una
proteína depende de su conformación y composición de aminoácidos. Entiendo por conformación,
la forma cómo los átomos de los aminoácidos están ubicados en el espacio, por lo tanto, una
pérdida de esta forma tridimensional puede llegar a perder la función de la proteína, así se
mantenga la composición química en aminoácidos?

Espero sus comentarios a este planteamiento.

5. Los textos del foro deben conducir a un debate entre todos los miembros del grupo: No es
necesario que en todas las participaciones presentar aportes, con dos aportes basta, es
importante, que en las intervenciones, se de el respectivo debate a lo que los demás
compañeros presentan o exponen.
Para el desarrollo de este trabajo, el tutor abrirá los siguientes temas de foro llamados así:

1. Foro para la entrega de aportes y debates: Tenga en cuenta que la participación en el


foro tiene valoración en la rúbrica de evaluación del trabajo.

En esta parte también se debe ayudar a organizar los elementos estructurales del trabajo
(introducción, objetivos, conclusiones, etc.), los cuales se deben tomar de los aportes
entregados.
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Los envíos de aportes por otros foros, enlaces o al correo personal del tutor no serán
tomados en cuenta.

2. Foro para la Recopilación de aportes y entrega del trabajo final: en este foro, todos los
estudiantes del grupo deben seleccionar los mejores aportes, deben nombrar a un Utilero y
a dos relatores para:

Los estudiantes que tienen el rol de utilero deben dejar en una carpeta todos los aportes
seleccionados por el grupo. En este mismo foro los estudiantes que tiene el rol de Relatores,
deben organizar el trabajo final.

Los envió individuales no están permitidos en el trabajo colaborativo #1.

En este foro no se entregan aportes individuales, solo debe aparecer la consolidación de


los mismos y el trabajo final.

En caso de una baja o nula participación de los integrantes del grupo, se deberá hacer la
entrega del desarrollo de todas las actividades entre los estudiantes participantes.

Estrategia de aprendizaje propuesta: Trabajo en grupo colaborativo.

Peso evaluativo: 17/300 puntos.

Producto(s) esperado(s):

Entrega trabajo escrito en pdf o Word con el desarrollo de las actividades de ésta guía. Portada,
Introducción, Objetivos, Desarrollo de actividades, Conclusiones Bibliografía. El archivo enviado
debe tener un tamaño máximo de 2 MB.

Máximo de páginas: 9, tamaño carta.


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Guía de actividades:

Objetivo del Trabajo Colaborativo:


Analizar la estructura general de los aminoácidos.
Conocer la clasificación general de lso aminoácidos en relación a las propiedades de la cadena
lateral R.
Reconocer la composición química o grupos de átomos de algunas de las cadenas laterales de
los amonácidos.
Calcular el punto isoeléctrico de un péptido
Identificar las fuerzas de enlace de los niveles de estructuración de proteínas.

ACTIVIDAD No. 1: Clasificación e Identificación de algunas cadenas


laterales de aminoácidos.
Las proteínas son polímeros constituidos por aminoácidos; estos amonácidos, que en
número son 20, se encuentran en todos los organismos sobre la tierra. Cada proteína esta
compuesta por la unión de dos monómeros de amonácidos y estos contiene un grupo
amino y otro grupo carboxilo separado entre sí por un solo átomo de carbono, el carbono α
(alfa). Al carbono (α), se encuentra unidos el grupo amino, el grupo carboxilo0, un átomo
de hidrógeno y una cadena lateral R. los 20 aminoácidos se diferencian por las propiedades
que presentan sus cadenas laterales.

Actividad Previa:

Consulte el módulo del curso, las lecciones 1, 2, 3, 4 y 5.

Consulte el Objeto de aprendizaje Virtual (OVA) titulado: Estructura general


y clasificación de aminoácidos.
Ubicación: Aula Virtual del curso, Tópico de contenidos, “Ovas: Unidad 1”.
Consulte además:

Baynes, J. Dominiczak, M (2011). Bioquímica Médica. Tercera Edición.. Barcelona, España.:


Elsevier, Mosby. Página: desde la 5.
Ubicación: Google libros.
Campbell, M. Farrell, S. (2003). Bioquímica. México. Thomson Editores. Cuarta Edición.
Página: desde la 62.
Ubicación: Google libros.

Problema Planteado:
En un cuadro, bien explícito, presente el aminoácido o los aminoácidos para cada una de
las siguientes propiedades descritas, además de esto, dibuje la estructura y señale la
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característica dada y diga a que grupo pertenece y el porqué. Elija sus respuestas de los
20 aminoácidos que se encuentran en las proteínas:

• Cadenas laterales con grupos tioles.


• Tres grupos ionizables
• Una cadena con más de un grupo amida.
• Una cadena lateral imidazol
• Un anillo indol
• Una cadena lateral fenólica.

ACTIVIDAD No. 2: Propiedades ácido básicas de aminoácidos péptidos:


Determinación del Punto Isoeléctrico (pI).
Todos los aminoácidos tiene al menos dos grupos ionizables (pueden quedar con carga
positiva o negativa), y por este motivo su carga eléctrica depende del pH. Los grupos
carboxilo (COOH) unidos al carbono alfa (α), son ácidos débiles y tiene un pKa entre 1.8-2.8.
El grupo amina unido al carbono alfa (α), son bases débiles y tiene un Pka entre 8.8-10.6.
Los aminoácidos que se clasifican como ácidos y básicos tienen grupos ionizables en sus
cadenas laterales. Los aminoácidos polares, también dan grupos ionizables a cambios de pH.
La carga eléctrica de los péptidos y las proteínas está determinada fundamentalmente por
la presencia de los grupos ionizables de los aminoácidos, específicamente por los grupos
ionizables de las cadenas laterales y los grupos N- COOH y N- amina. La mayor parte de los
COOH y aminas que están unidos al carbono alfa, están unidos por un enlace peptídico, lo
que les impide ser ionizados.

Un aminoácidos en su punto Isoeléctrico es un ión dipolar ( Zwitterion) porque su carga es


igual a cero, es decir, el balance de cargas eléctricas es cero, presenta propiedades aniónica
y catiónicas a la vez con un mismo número de cargas.

Los péptidos tienen puntos isoeléctricos característicos que dependen de los aminoácidos
presentes en ellos (aminoácidos con capacidad de disociación). Los grupos carboxilo y amino
que forman parte de los enlaces peptídicos no poseen propiedades ácidas o básicas, por lo
que la únicamente se puede ionizar el grupo amino N-terminal, el grupo carboxilo (COOH)
N-terminal y cualquier grupo ácido, básico presente en las cadenas laterales del péptido.

Actividad Previa:
Consulte el módulo del curso, las lecciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, y 9.

Consulte el Objeto de aprendizaje Virtual (OVA) titulado: Estructura


general y clasificación de aminoácidos. Ubicación: Aula Virtual del curso,
Tópico de contenidos, “Ovas: Unidad 1”.
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Consulte el Objeto de aprendizaje Virtual (OVA) titulado: Propiedades ácido-básicas de los


aminoácidos. Ubicación: Aula Virtual del curso, Tópico de contenidos, “Ovas: Unidad 1”.

Consulte el Objeto de aprendizaje Virtual (OVA) titulado: Péptidos. Ubicación: Aula Virtual del
curso, Tópico de contenidos, “Ovas: Unidad 1”.

Consulte además:

Baynes, J. Dominiczak, M (2011). Bioquímica Médica. Tercera Edición.. Barcelona, España.:


Elsevier, Mosby. Página: desde la 8.
Ubicación: Google libros.

Voet, V. (2004). Bioquímica, tercera edición. Montevideo, Uruguay.: Editorial Médica


panamericana. Páginas: desde la 76.
Ubicación: Google libros.

Problema Planteado:
Para cada uno de los siguientes péptidos prediga e identifique:

• Estructura
• N-terminal, C-terminal.
• Punto Isoeléctrico (pI).
• Presentar la secuencia de pasos para hallar la pI de cada péptido con una pequeña
explicación (presentar el desarrollo).

Péptido 1: Phe-Lys-Leu-Trp-Try-Gly
Péptido 2: Glu-His-Gly-Ala-Lys-Val

Sugerencia: para los valores del pI, es importante ver los OVAS
recomendados y la tabla 8 del módulo del curso, página 28.

ACTIVIDAD No. 3. Estructuración de proteínas.


Cada tipo de molécula proteica que se encuentra en su ambiente natural se pliega en
una estructura tridimensional única denominada conformación nativa que está definida por
los niveles de organización secundario, terciarios y quizás, cuaternario. La mayoría de las
proteínas no son biológicamente funcionales hasta cuando adoptan su conformación
nativa.
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Actividad Previa:
Consulte el módulo del curso, las lecciones 7,8, y 9.
Consulte además

Macarulla, J. Goñi, F. (2002). Biomoléculas, tercera edición. Editorial


Reverté S.A. Página: 85
Ubicación: Google libros.

Peña, Arroyo, Gómez (2004). Bioquímica. México: Limusa, Noriega Editores. Página: 77
Ubicación: Google libros.

Problema Planteado:
Abajo se muestra la estructura de una proteína hipotética. Identifique sobre la gráfica:

• Niveles de estructuración (primaria, secundaria, terciaria, etc.).


• Si existe estructura secundaria, explicar si es alfa-hélice o beta-lámina.
• Describir las fuerzas de enlaces que mantienen las estructuras identificadas
(interacciones covalentes (cuales) y no covalentes (cuales).

Si para la respuesta, requiere presentar un texto explicativo, este no


debe superar las 150 palabras.

Los aportes de este trabajo se deben entregar en


el formato del anexo 1, tenga en cuenta esta
recomendación, ya que está relacionada en la
rúbrica de evaluación.
Revise la rubrica de evaluación.
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Rúbrica de Evaluación

Ítem Evaluado Valoración Baja Valoración Media Valoración Alta Máximo


Puntaje
Participación individual del estudiante en El estudiante Nunca El estudiante ingresó dos El estudiante ingreso más de dos veces al 2
el Foro: Ingresó al foro veces o menos al foro. foro.
Número de participaciones. (Puntos = 0) (Puntos = 1.0) (Puntos = 2.0)
Participación individual del estudiante en El estudiante no presento El estudiante presento El estudiante en sus aportes presenta 3
el Foro: Calidad de los aportes. aportes. aportes, pero estos carecen información de análisis y se evidencia
(Puntos = 0) de análisis, selección de la criterio propio para la selección de la
Entrega de aporte en el formato información, se evidencia la información.
solicitado. acción cortar y pegar, la El estudiante entrega el aporte en el
información es tácita a la formato solicitado.
fuente bibliográfica. (Puntos = 3.0)
El estudiante entrega el
aporte pero no en el
formato solicitado.
(Puntos = 1.0)
El estudiante, solo entrego el El estudiante, entrego el aporte o los 3
Participación individual del estudiante en aporte o los aportes, pero el aportes, y el mensaje refleja pertinencia
el Foro: Calidad del texto o mensaje en el mensaje no refleja pertinencia académica que conduce a un verdadero
foro. académica. debate dentro del foro.
(Puntos = 0) (Puntos = 3)

Especificaciones del trabajo (incluye El equipo no tuvo en cuenta las Aunque el documento El documento presenta una excelente 2
Redacción y ortografía) como también las normas básicas para construcción presenta una estructura estructura. La redacción es excelente, las
especificaciones técnicas y referencias. Se de informes. El documento base, la misma carece de ideas están correlacionadas, y el cuerpo del
evalúa que el trabajo tenga las
presenta deficiencias en algunos elementos del texto es coherente en su totalidad (Puntos
referencias en Normas APA.
redacción y errores ortográficos cuerpo solicitado. (Puntos = 2.0)
(Puntos 0.0) 1.0

ACTIVIDAD No. 1: Clasificación e No presenta lo solicitado o Presenta lo solicitado pero Presenta lo solicitado sin exceder el 2
Identificación de algunas cadenas Adjuntan información que no es exceden el número de número de palabras solicitadas. Se
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laterales de aminoácidos. la solicitada. La información es palabras solicitadas. La identifica que hay análisis de tema.
copia tácita de Internet.(Puntos información es copia tácita (Puntos 2.0)
0.0) de Internet. No hay un
verdadero análisis de
tema. (Puntos 1.0).

ACTIVIDAD No. 2: Propiedades ácido No presenta lo solicitado o Presenta lo solicitado pero Presenta lo solicitado sin exceder el 2
básicas de aminoácidos péptidos: Adjuntan información que no es exceden el número de número de palabras solicitadas. Se
Determinación del Punto Isoeléctrico la solicitada. La información es palabras solicitadas. La identifica que hay análisis de tema.
(pI). copia tácita de Internet.(Puntos información es copia tácita (Puntos 2.0)
0.0) de Internet. No hay un
verdadero análisis de
tema. (Puntos 1.0).

No presenta lo solicitado o Presenta lo solicitado pero Presenta lo solicitado sin exceder el 2


ACTIVIDAD No. 3. Estructuración de
proteínas. Adjuntan información que no es exceden el número de número de palabras solicitadas. Se
la solicitada. La información es palabras solicitadas. La identifica que hay análisis de tema.
copia tácita de Internet. información es copia tácita (Puntos 2.0)
de Internet. No hay un
(Puntos 0.0) verdadero análisis de
tema.(Puntos 1.0).

Total de Punto Posibles 16


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ANEXO 1: FORMATO PARA LA PRESENTACIÓN DE APORTES

Trabajo:

Nombre:

Actividad a desarrollar:

Objetivo:

Contenido del aporte:

Conclusión:

Referencia bibliográfica (Formato APA).

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