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A química do nitrogênio é complexa devido aos diversos estados de oxidação que ele pode
assumir que é influenciada pelos organismos vivos presentes. As alterações no estado de
oxidação causadas por bactérias podem ser positivas e negativas, dependendo da prevalência
de condições anaeróbias e aeróbias.
-3 0 +1 +2 +3 +4 +5
NH₃ N₂ N₂O NO N₂O₃ NO₂ N₂O₅
NH₃/NH₄⁺ N₂ N₂O NO NO₂¯ NO₂ NO₃¯
*O estado de oxidação da maioria dos compostos de nitrogênio é o tri-negativo.
O nitrogênio total abrange o nitrogênio orgânico, amoniacal, nitrito e nitrato. A fração orgânica
é constituída de uma série complexa de orgânicos, incluindo aminoácidos, açúcares aminados e
proteínas (polímeros de aminoácidos); e podem ser encontrados na forma solúvel ou
particulada. É rapidamente desses compostos orgânicos é rapidamente convertido em amônia
pela ação dos micro-organismos dos meios aquático e terrestres. A ureia (CH₄N₂O) raramente
é encontrada em esgotos brutos devido a sua rápida conversão em carbonato de amônia
(NH₄)₂CO₃ que, por ser instável, desassocia-se em gás amônia e dióxido de carbono na presença
de água.