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Glosario Bioquímica

ácidos nucléicos
polinucleotidos biológicos en las cuales los residuos nucleotidicos están unidos en una
secuencia especifica por enlaces fosfodiester, DNA y RNA.
actina
una proteína que forma parte de (?make upA) los filamentos delgados de un músculo;
también un componente importante del citoesqueleto de muchas células eucariotas.
actividad óptica
capacidad de una sustancia de rotar el plano de luz plano-polarizado.
-helice
una conformación helicoidal de una cadena polipeptidica, usualmente ?right handedA (a
la derecha, con un máximo de puentes de hidrogeno dentro de la cadena; una de las
conformaciones de estructura secundaria más comunes en proteínas.
aminoácidos esenciales

que ser obtenidos con la dieta.


aminoácidos no-esenciales
e l
aminoácidos que no pueden ser sintetizados por humanos (o otros vertebrados) y tienen

aminoácidos que pueden ser producidos por humanos y otro vertebrados a partir de

anfolito
s
precursores más simples y que por eso no se requieren dentro de la dieta.
anfipático
molécula que contiene a la vez dominios polares y no-polares

una sustancia que puede actuar como base o acido.u


anticuerpo

anticuerpos monoclonales

K a
una proteína de defensa sintetizada por el sistema inmune de vertebrados.

anticuerpos producidos de una célula hibridoma clonada que por eso son idénticos y se
dirigen contra el mismo epitope del antigeno.
anticuerpos policlonales

.
un ?poolA conjunto heterogéneo de anticuerpos producidos en un animal por un numero
diferente de linfocitos B en respuesta a un antígeno. Anticuerpos diferentes en el
?poolA reconocen partes diferentes del antígeno.
antígeno

G
una molécula capaz de provocar la síntesis de un anticuerpo específico en un
vertebrado.
apoenzima
la porción proteica de una enzima excluyente cualquier cofactor orgánico o inorgánico o
grupo prostetico que podría ser necesario por su actividad catalitica.
apoptosis
muerte celular programada, en la cual una célula programa (?brings aboutA) su propio
muerte y lisis; señalado de afuera y programado en sus genes, sistemáticamente
degradando sus propios macromoléculas.
apoproteina
la porción proteica de una proteína, excluyendo cualquier cofactor orgánico o inorgánico
o grupo prostetico que podría ser necesario por su actividad.
cambio conformacional (?induced fit@)
un cambio de la conformación de una enzima en respuesta a la unión de un sustrato que
proporciona la enzima activa cataliticamente; también se usa para denotar cambios en
la conformación de cualquier macromolécula en respuesta a union con su ligando de tal
manera que el sitio de unión de la macromolécula ensamble mejor a la forma del ligando
?conforms to"
cambio de energía libre ( G)
el componente de la energía total de un sistema que puede hacer trabajo a una
temperatura y presión constante
cambio de energía libre estándar
el cambio de energía libre de una reacción que ocurre baja una serie de condiciones
estándar: temperatura 298K; presión 1 atm y todos los solutos a una concentración 1M.
centro quiral
un átomo con sustituyentes localizados/ubicado (?arrangedA) de tal manera que la
molécula no se puede superponer sobre su imagen especular.
citoplasma

citosol
plasmatica; incluye organelos como mitocondrias.
e l
la porción del contenido de la célula fuera del núcleo pero dentro de la membrana

clones

coenzima
descendientes de una (1) célula única.
u s
la fase acuosa continua del citoplasma con los solutos disueltos; excluye organelos como
mitocondrias.

un factor orgánico requerido para la acción de algunos enzimas; muchas veces contiene

cofactor
una vitamina como componente.
a
un ion inorgánico o coenzima necesario para la actividad de la enzima.
configuración
K
arreglo espacial en una molécula orgánica que se confiere por presencia de

.
(1) enlaces dobles, que no permiten libre rotación,
(2) centros quirales, alrededor de los cuales los grupos sustituyentes están W
ordenadas/ubicados - en una secuencia específica
isomeros configuracionales no se pueden inter-convertir sin romper uno o más enlaces
covalentes.
conformación G
arreglo (?arrangementA) espacial de grupos sustituyentes que están libres para asumir
diferentes posiciones en el espacio, sin romper cualquier enlace, porque tienen la
libertad de rotar sus enlaces.
conformación (hoja plegada)
arreglo extendido (?arrangementA) en zig-zag de una cadena polipeptidica; una
estructura secundaria también muy común en proteínas.
conformación nativa
conformación biológicamente activa de una macromolécula
constante de equilibrio
una constante característica para cada reacción química; relaciona las concentraciones
específicas de cada uno de las reactantes y productos al equilibrio a una temperatura y
presión dada.
constante de velocidad (?rate constant@)
la constante de proporcionalidad que relaciona la velocidad de una reacción química con
las concentraciones de los reactantes
cromosoma
una molécula DNA larga única (?singleA) y sus proteínas asociadas, contiene muchos
genes, almacena y transmite información genética.
denaturación
desplegamiento (?unfoldingA) parcial o completo de una conformación nativa especifica
de una cadena polipeptídica, proteína o ácido nucleico.
dehidrogenasa
enzima que cataliza la separación de un par de átomos de hidrogeno de su sustrato.
desolvatación

DNA
e l
en solución acuosa. la liberación de agua unida que está envolviendo un soluto.

un polinucleotido con una secuencia específica de unidades desoxirribonucleotidos

dominio

u s
unidos covalentemente por enlaces 3Y-5Y-fosfodiester; sirve como molécula central de la
información genética.

una unidad estructural de un polipeptido, que constituye dominios distinguibles que


pueden tener funciones separadas y pueden plegarse como unidades independientes y
compactas.
Ecuación de Henderson-Hasselbalch
a
una ecuación que relaciona el pH, el pKa y la razón de las concentraciones de las
especies de un aceptor de protones (A-) y un donador de protones (HA) en una solución.
energía de activación
K
la cantidad de energía (en Joules) necesaria para convertir todas las moléculas en 1 mol

.
de sustancia reactiva del estado basal (?groundA) al estado de transición.
energía de unión G{B} (?binding energy@)
la energía derivada de interacciones no-covalentes entre enzima y sustrato o receptor
y ligando
enlace peptídico

enzima
G
la unión entre el grupo -amino de un aminoacido y el grupo -carboxilo del otro
aminoácido con la eliminación de los elementos del agua.

una biomolécula, o proteína o RNA, que cataliza una reacción química específica. No
afecta el equilibrio de la reacción catalizada; realza/aumenta (?enhanceA) la velocidad
(?rateA) de la reacción por proveer una vía de reacción con una energía de activación
más baja.
epitopo
un determinante antigénico, el grupo o los grupos químicos particulares de una
macromolécula (antígeno) que unen un anticuerpo específico.
especificidad
la capacidad de una enzima o un receptor para discriminar entre sustratos o ligandos
similares y capaces de competir por el mismo sitio.
estado basal (?ground state@)
la forma normal, estable de un átomo o una molécula; distinto de estado excitado.
estado de transición
la forma activada de una molécula en la cual la molécula sufrió una reacción química
parcial; el punto más alto en la coordínate de reacción.
equilibrio
el estado de un sistema en el cual no ocurre más un cambio neto; la energía libre está
en su mínimo.
estructura secundaria
la conformación de residuo-a-residuo en la ?columna vertebralA (?backboneA) de un
polímero.
estructura terciaria

estructura cuarternaria
e l
la conformación tridimensional de un polímero plegado en su estado nativo.

estructura tridimensional de una proteína de múltiples subunidades (más de una cadena

eucariota

u s
polipeptidica); en particular la manera del ajustamiento o ensamble (?fit togetherA) de
las subunidades.

un organismo unicelular o multicelular con células que contienen un núcleo con


membrana, múltiples cromosomas y organelos internos.
fenotipo

gen
a
características observables de un organismo.

un segmento de DNA, en general cromosomal, que codifica una singular cadena

K
polipeptidica o una molécula de RNA funcional.
gen supresor de tumor

genoma
.
genes regulatorios del ciclo celular, que en caso de presentar defectos, pueden llevar al
cáncer. Debido a que codifican proteínas que tienen la función normal de restringir la
división celular.

G
toda la información genética codificada en una célula o virus.
glicoproteína
una proteína que contiene uno o más grupos carbohidrato.
grupo funcional
el átomo o grupo de átomos específicos que confiere una propiedad química especial a
una biomolécula.
grupo prostético
un ion metálico o un compuesto orgánico (diferente a un aminoácido) que está unido
covalentemente a una proteína y que es esencial para su actividad.
grupo R
(1) formalmente una abreviación que indica cualquier grupo alquilico.
(2) ocasionalmente se usa en un sentido más general para indicar virtualmente cualquier
sustituyente orgánico (e.j. grupo R de aminoacidos).
hem
el grupo prostetico ferro-porfirina de proteínas hem.
hidrofílico
polar o cargado, describe moléculas o grupos que se asocian con agua (es decir se
disuelven fácilmente)
hidrofóbico
no-polar, describe moléculas o grupos que son insoluble en agua.
hidrolasa
enzimas (e.j. proteasa, lipasa, fosfatasa, nucleasa) que catalizan reacciones de
hidrólisis.
heterotropico

holoenzima

e l
describe un modulador alostérico que es diferente del ligando normal.

una enzima cataliticamente activa incluyendo todos los subunidades, grupos prosteticos
y cofactores.
homotropico

inhibición por retroalimentación (?feed back inhibition@)

u s
describe un modulador alostérico que es idéntico al ligando normal.

inhibición de una enzima alosterica en el comienzo de una serie de pasos metabólicos


secuenciales por el producto final de dicha serie de paso o etapas; también llamado
inhibición por producto final.
inmunoglobulina

específicamente a este.
interacciones hidrofóbicas
K a
un anticuerpo, una proteína, generado contra un antígeno y que es capaz de unir

la asociación entre ellos de grupos o componentes no-polares en un sistema acuoso,

.
forzado por la tendencia de las moléculas de agua que las rodean, en búsqueda de su
estado desordenado más estable.
intermediario de reacción
cualquier especie químico en una vía de reacción que tiene un tiempo de vida química

ligando

linfocitos
finito.
G
una molécula pequeña que se une específicamente a una más grande; e.j. una hormona es
el ligando de su receptor proteico específico.

una subclase de leucocitos involucrado en la respuesta inmune. Linfocitos B sintetizan y


secretan anticuerpos; linfocitos T: o juegan un rol regulatorio en inmunidad o matan
células foráneas infectadas con virus.
lipido
una pequeña biomolecula insoluble en agua generalmente contiene ácidos grasosos,
esteroles o componentes isoprenoides.
lipoproteína
un agregado lipoproteico que sirve para transportar lípidos, que son insolubles en agua,
en la sangre; la apolipoproteína es la componente proteica .
macromolécula
una molécula con un peso molecular en el rango de unos miles a millones
membrana plasmatica
la membrana exterior que envuelve el citoplasma de una célula.
metabolito
un intermediario químico en la reacción catalizada por enzimas del metabolismo.
miofibrila
una unidad de filamento delgados y gruesos en una fibra muscular.
miosina
una proteína contractil; el componente mayoritario de los filamentos gruesos de un
músculo y otras sistemas actina W miosina.
motivo ("motif")

mRNA e l
un patrón de plegamiento distinguible de elementos de estructura secundaria,
observado en una o más proteínas; también llamado estructura super-secundaria.

núcleo

u s
una clase de moléculas RNA cada uno es complementario a una hebra de DNA;
transporta el mensaje genético de las cromosomas a las ribosomas.

en eucariotas, él organelo con membrana que contiene cromosomas.


nucleosido
un compuesto que consiste de una purina o pirimidina unida covalentemente a una
pentosa.
nucleotido
a
un nucleosido fosforilado en una de los grupos hidroxilicos de la pentosa.
oligómero
K
un polímero corto, usualmente de ácidos nucleicos, azucares o nucleotidos, donde la

oligopeptido

oncogene
.
definición de ?cortoA es algo arbitrario, pero generalmente menos que 50 unidades.

algunos aminoácidos unidos por enlaces peptidicos.

oxidasa
G
un gen que causa cáncer; cualquiera de varios genes mutados que generan crecimiento
celular rápido y descontrolado.

enzimas que catalizan una reacción de oxidación en la cual el oxigeno sirve de aceptor
de electrones, pero ninguno de los dos átomos de oxigeno se incorpora en el producto.
oxigenasa
enzimas que catalizan reacciones en las cuales átomos de oxigeno están directamente
incorporados en el producto, formando un grupo hidroxilo o carboxilo.
paso limitante (?rate-limiting step@)
(1) generalmente el paso en una reacción enzimática con la mayor energía de activación o
del estadio de transición con la más alta energía libre
(2) el paso más lento en una vía metabólica.
péptido
dos o más aminoácidos unidos covalentemente por enlaces peptídicos
pH
el logaritmo negativo de la concentración de iones hidrogeno de una solución acuosa.
pirimidina
base nitrogenada heterociclica que se encuentra en nucleótidos y ácidos nucleicos.
polipeptido
cadena larga de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos; el peso molecular en general
es menor que 10000.
polisacárido
un polimero lineal o ramificado de unidades monosaccaridos unidos por enlaces
glicosidicos.
procariota
una bacteria; un organismo unicelular con un solo cromosoma, sin membrana nuclear y
sin organelos con membranas.
proteína

e
secuencia de aminoácidos característicos unidas por enlaces peptídicos
proteína alostérica
l
una macromolécula, compuesta de una o más cadenas polipeptidicas, cada una con una

proteína conjugada
una proteína con una o más grupos prostéticos.
proteína fibrilar u s
una proteína (generalmente con múltiples subunidades) con multiples sitios de unión del
ligando, tal que, la unión del ligando en un sitio afecta la unión del ligando en otro sitio.

proteínas insolubles que cumplen un ról estructural o de protección; contienen cadenas

a
polipeptidicas que generalmente comparten estructuras secundarias comunes.
proteína globular
proteína soluble de forma globular (redondeado).
proteína oligomérica
K
proteína de múltiples subunidades que tiene dos o más cadenas polipeptídicas idénticas.
puente de hidrogeno
.
atracción electrostática débil entre un átomo electronegativo (como oxigeno o
nitrogeno) y un átomo hidrogeno que está unido covalentemente con un segundo átomo
electronegativo.
punto isoelectrico

purina
G
el pH en el cual un soluto no tiene una carga neta eléctrica y por lo tanto no se moviliza
en un campo eléctrico.

base nitrogenada heterociclica que se encuentra en nucleotidos y ácidos nucleicos,


contiene anillos unidos piriminina e imidazol.
reacción de condensación
formación de un enlace acompañado por la liberación de los elementos del agua en los
átomos que se unen.
reacción de hidrólisis
rompimiento de un enlace con agua como especie que ataca y los elementos del agua
aparecen en los dos productos.
reacción de oxidación O reducción
una reacción en la cual electrones son transferidos de una molécula donadora a una
molécula aceptora; también llamada reacción redox.
reacción endergónica
una reacción química que consume energía (es decir G > 0 )
reacción exergónica
una reacción química que procede con la liberación de energía libre (es decir G < 0)
renaturación
re-plegamiento de una proteína globular denaturada para restaurar la estructura nativa
y la función de la proteína.
residuo amino-terminal
el único residuo aminoacidico en una cadena polipeptidica con un grupo -amino libre;
define el amino-terminal de un polipeptido.
residuo carboxilo-terminal
el único residuo en una cadena polipeptidica con un grupo alfa-carboxilo libre; define el

ribosoma
termino carboxilo de un polipéptido.
respiración

e l
cualquier proceso metabólico que lleva al consumo de oxigeno y liberación de CO2.

RNA

u s
un complejo supramolecular de rRNAs y proteínas, aproximadamente 18 W 22nm
diámetro, sitio de la síntesis de proteínas.

un polinucleotido de una secuencia específica de unidades ribonucleotidos unidos


covalentemente por sucesivos enlaces 3Y-5Y-fosfodiesteres.
rRNA

a
una clase de moléculas RNA que sirven de componente de ribosomas.
sarcomero
unidad funcional y estructural del sistema contractil del músculo.
sistema abierto
K
un sistema que intercambia materia y energía con su medio ambiente o entorno
sistema aislado
.
sistema que no intercambia ni materia ni energía con su entorno o medio ambiente.
sitio activo
la región en la superficie de una enzima que une la molécula sustrato y lo transforma

sustrato
G
cataliticamente; también llamado sitio catalítico.
sitio de unión
el bolsillo (?cerviceA) de una proteína en la cual se une el ligando

un compuesto específico sobre el que actúa una enzima.


tampón
un sistema que es capaz de resistir cambios de pH, consiste en un par de acido-base
conjugado en el cual la razón del aceptor de proton y donador de proton es cercano a la
igualdad
tRNA
una clase de moléculas de RNA (Mr 25000 W 30000) cada una puede combinar
covalentemente con un aminoácido específico.
vía de salvataje (?salvage pathway@)
síntesis de una biomolecula como por ejemplo un nucleotido, a partir de intermediarios
de una vía degradativa de esa biomolecula; una vía de reciclaje y por tanto distinta de
la vía de síntesis de novo.
vía de novo
vía de síntesis de una biomolecula, como por ejemplo un nucleotido, a partir de
precursores simples; por tanto distinto del vía de salvataje.
vitamina
una sustancia orgánica necesaria en cantidades pequeñas en la dieta de algunas
especies, generalmente funciona como componente de una coenzima.
zwitterion
un ion dipolar, con carga positiva y negativa espacialmente separada

e l
u s
K a
.
G